Resumen
Las betana aldehido deshidrogenasas (BADHs) son un grupo de aldehdo
deshidrogenasas capaces de oxidar con diferente eficiencia a la betana aldehdo (BA) en una
reaccin irreversible que tiene como coenzimas a los nicotinamn adenn dinucletidos,
NAD(P)+. Hasta donde se conoce, su mecanismo de reaccin y su estructura tridimensional son
esencialmente iguales a los descritos para otras aldehdo deshidrogenasas (ALDHs). Sin
embargo, las propiedades cinticas de aquellas BADHs que han sido caracterizadas a la fecha
presentan diferenciasimportantes por sus posibles implicaciones fisiolgicascon las de otras
+
ALDHs. Una de estas diferencias es la inhibicin mixta del NADH frente al NAD encontrada en
las BADHs de plantas, bacterianas y animales, mientras que esta inhibicin es competitiva en la
+
gran mayora de las deshidrogenasas dependientes de NAD(P) , incluyendo a las ALDHs. Otra
peculiaridad es que se inactivan reversiblemente si se preincuban con el nucletido reducido o
durante el curso de la reaccin, inactivacin esta ltima que es ms rpida cuanto mayor sea la
concentracin de sustrato. La estructura tridimensional de la BADH de Pseudomonas aeruginosa
en complejo con NADPH mostr la formacin de un aducto entre la nicotinamida del nucletido y
el grupo tiol de la cistena cataltica. Pensamos que este aducto, que no ha sido encontrado con
anterioridad en ninguna enzima, es la forma inactiva de la PaBADH observada bajo condiciones
catalticascomo el componente incompetitivo de la inhibicin y como la inactivacin durante la
reacciny no catalticas. La existencia de dos conformaciones de la Cys cataltica, una que
permite que se lleve a cabo la reaccin y otra que permite la formacin de un aducto no activo
con el NAD(P)H, explica el que la inactivacin por NAD(P)H ocurra an a concentraciones
+
saturantes de NAD(P) . Este mecanismo novedoso permite que un inhibidor como el NAD(P)H
que por razones estructurales debera ser exclusivamente competitivo con respecto al
+
NAD(P) posea un componente incompetitivo en su inhibicin, es decir no slo disminuya la
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afinidad aparente de la enzima por NAD(P) sino que tambin disminuya la Vmax. Tanto el
componente incompetitivo como la formacin del aducto durante la reaccin proveen de vlvulas
de seguridad que evitan que una alta velocidad de la reaccin lleve rpidamente al agotamiento
+
del NAD . In vivo, la inactivacin transitoria de la enzima por cualquiera de estos dos
+
mecanismos permitira que el NAD consumido en la reaccin de la BADH se regenere por las
reacciones ms lentas que lo reciclan. En el caso de la BADH de plantas ocurre adems el
establecimiento de una ruta alterna de liberacin del NADH cuando la BA est a alta
concentracin, lo que lleva a que la inhibicin por NADH sea parcial y por tanto se evite no slo
+
el agotamiento del NAD sino tambin que el aldehdo pueda llegar a acumularse y producir
efectos txicos. En conclusin, ciertas propiedades estructurales de las BADHs les permiten
tener mecanismos efectivos de control a corto plazo por el nucletido reducido, los cuales
probablemente tambin operen en otras ALDHs que los requieran.
Palabras clave: Inhibicin competitiva versus incompetitiva; bases estructurales de la inhibicin
por NAD(P)H; inactivacin por NAD(P)H; aducto tiol-nicotinamida; consecuencias fisiolgicas de
la regulacin por NAD(P)H.
Abstract
The betaine aldehyde dehydrogenases (BADHs) are a group of aldehyde
dehydrogenases able of oxidizing betaine aldehyde (BA) with different efficiency in an irreversible
+
reaction that uses nicotinamide adenine dinucleotides, NAD(P) , as coenzymes. As far as it is
known, their reaction mechanism and three-dimensional structure are essentially the same as
those described for other aldehyde dehydrogenases (ALDHs). However, the kinetic properties of
the BADHs so far characterized present several differenceswhich may be physiologically
relevantwith respect to other ALDHs. One of these differences is the mixed inhibition of NADH
+
against NAD found in the BADHs from plants, bacteria and animals, while this inhibition is
+
competitive in the majority of the NAD(P) -dependent dehydrogenases, including the ALDHs.
Another peculiarity is their reversible inactivation after being pre-incubated with the reduced
nucleotide, or during the course of the reaction, the latter being faster as the concentration of
substrates increases. The Pseudomonas aeruginosa BADH three-dimensional structure in
complex with NADPH showed the formation of an adduct between the nicotinamide of the
nucleotide and the thiol group of the catalytic cysteine. We propose that this adductwhich so far
has not been detected in any other enzymeis the PaBADH inactive form observed under
catalytic and non-catalytic conditions. The existence of two conformations of the catalytic
cysteine, one that allows the reaction and another that allows the formation of the inactive
+
NAD(P)H-adduct, explains that inactivation by NAD(P)H takes place even at saturating NAD(P)
concentrations. This novel mechanism adds an uncompetitive component in the inhibition of
+
NAD(P)H against NAD(P) , an inhibition that should be strictly competitive for structural reasons.
+
In other words, NAD(P)H not only decreases the apparent affinity of the enzyme for NAD(P) but
also decreases Vmax. Both the uncompetitive component of the inhibition and the enzyme
inactivation during the reaction provides the enzyme with a security valve that prevents the
+
exhaustion of NAD(P) when the reaction velocity is high. In vivo the transitory inhibition of the
+
enzyme for any of these two mechanisms would allow the recycling of the NAD(P) consumed
during the BADH reaction. In the case of the chloroplastic BADH, a new route of NADH release is
established at high concentrations of BA. As a consequence, the inhibition by the reduced
+
nucleotide is partial, and thus not only the exhaustion is prevented of NAD but also the build up
of the toxic betaine aldehyde. In conclusion, our results show that certain structural features of
the BADHs are the base for effective short-term regulation mechanisms, which are likely shared
by other ALDHs that needs them.
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Las chBADHs son enzimas dimricas [5,7] que usan exclusivamente al NAD [5,7] y
participan en la respuesta al estrs osmticoproducido ste ya sea por dficit de agua (sequa)
o por exposicin a suelos hipersalinosque consiste en la sntesis y acumulacin de glicina
betana en los cloroplastos. Las plantas que poseen esta capacidad de respuesta son mucho
ms resistentes a estas condiciones adversas que aquellas plantas que no acumulan glicina
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36
Esquema 3. Mecanismo qumico de la reaccin catalizada por las BADHs. Paso (1)
+
Acilacin: Despus de que se han unido el NAD(P) y la betana aldehdo (BA) al sitio
activo de la enzima, ocurre un ataque nucleoflico del grupo tiolato de la cistena cataltica
sobre el carbono carbonlico del aldehdo, formndose un intermediario tetradrico
covalente (tiohemiacetal). (2) Transferencia del hidruro: en este paso se produce la
+
oxidacin del sustrato por la transferencia del hidruro del tiohemiacetal al C4 del NAD(P) ,
formndose un intermediario tetradrico trigonal (tioster). (3) Desacilacin: una molcula
de agua realiza un ataque nucleoflico sobre el tioster formando un nuevo intermediario
tetrahdrico (tioacetal). (4) Liberacin de los productos: La ruptura del enlace S-C permite
la liberacin de la glicina betana (GB) seguida de la del NAD(P)H.
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Figura 2. Inhibicin mixta del NADH frente al NAD en las BADHs. (A) Patrn de
inhibicin obtenido con la PaBADH. (B) Esquema del mecanismo Iso Bi Bi ordenado en
estado estacionario propuesto para las BADHs de cloroplasto [27] y de rin [19]. La
forma de la enzima libre que resulta despus de liberarse el nucletido reducido (E) se
isomeriza a la forma de la enzima libre que une al nucletido oxidado (E) antes de que
empiece un nuevo ciclo cataltico.
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Figura 3. Inactivacin de la PaBADH por incubacin con NADPH. (A) Cintica bifsica de
inactivacin observada por la preincubacin de la enzima en presencia de NADPH a 60
(), 120 () y 200 M (). (B) Fase rpida de la inactivacin observada a los tiempos
cortos. (C) Inhibicin por el NADH determinada como la actividad al tiempo cero de
incubacin en presencia de las concentraciones del nucletido indicadas. Este valor es el
considerado como 100% en la grfica de la inactivacin. Las determinaciones de
actividad se hicieron en presencia de la misma concentracin de NADPH que se us en
la preincubacin. Las lneas son tericas, resultado del mejor ajuste a una doble
exponencial (A y B) o a una hiprbola (C).
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41
Figura 6. Aductos cistena cataltica-NADP(H) en las ALDHs. (A) Estructura del aducto
encontrado en el cristal de la PABADH en complejo con NADPH [A.G. Daz-Snchez, L.
Gonzlez-Segura, E. Rudio-Piera, A. Martnez-Vzquez y R.A. Muoz-Clares,
resultados no publicados]. El enlace covalente entre la cistena cataltica en la
conformacin de descanso y el C2 del anillo reducido de la nicotinamida est indicado
con una flecha. (B) Esquema de la estructura del aducto PaBADH-NADPH. (C) Cambios
en los espectros de absorcin UV de la PaBADH por la unin del NADPH indicativos de la
formacin del aducto. (D) Estructura del aducto encontrado en el cristal de la 10+
formiltetrahidrofolato deshidrogenasa de humano en complejo con NADP [54] El enlace
covalente entre la cistena cataltica en la conformacin de ataque y el C4 del anillo
oxidado de la nicotinamida est indicado con una flecha. (E) Esquema de la estructura del
aducto PaBADH-NADH. (F) Cambios en los espectros de absorcin UV de la por la unin
+
del NADP indicativos de la formacin del aducto. Las figuras A y D se hicieron con
PyMOL [67] usando las coordenadas cristalogrficas de la PaBADH en complejo con
NADPH y 2o2q.pdb, respectivamente.
Este hallazgo es de gran inters porque constituye la primera demostracin de que los
adenn nicotinamn dinucletidos reducidos pueden formar aductos con el grupo tiol de cistenas
de las protenas, pero, sobre todo, porque sugiere las bases moleculares del mecanismo de la
inactivacin reversible por el NAD(P)Hque habamos observado cuando incubbamos a las
BADHs estudiadas en nuestro laboratorio con estos nucletidos reducidosy el de la
inactivacin durante el curso de la reaccin. Esto es porque encontramos que el aducto con el
NADPH se forma cuando la cistena est en la conformacin que hemos llamado de descanso
(Fig. 6A), mientras que est en la conformacin que llamamos de ataque en el aducto
+
encontrado por otro grupo de investigacin con NADP [54] (Fig. 6D). La BA una vez que se une
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al sito activo es capaz de romper el aducto formado por el NAD(P) con la cistena en la posicin
de ataque [54]. Probablemente ste sea un paso obligatorio de la reaccin, dado que el
mecanismo cintico consiste en la unin ordenada del nucletido oxidado seguido de la unin del
aldehdo y el aducto se forma muy rpidamente, en un tiempo inferior a 3 ms. Pero la BA no
puede romper el enlace del aducto formado por el NAD(P)H con la cistena en la posicin de
+
descanso, ya que este enlace est alejado de su sitio de unin. En cuanto al NAD(P) , aunque
pudiera romperlo formara otro aducto que tambin sera inactivo porque mantendra a la cistena
cataltica en la posicin de descanso impidiendo as la formacin del tiohemiacetal con el BA.
Por medio de la formacin de este aducto el NAD(P)H disminuye la concentracin de
sitios activos de la enzima y produce el efecto inhibitorio sobre la Vmax observado como el
componente incompetitivo de la inhibicin por estos nucletidos. En los estudios de inhibicin
realizados in vitro esta disminucin de sitios activos puede ocurrir rpidamente al inicio de la
reaccin en el momento en que el NAD(P)H aadido se une a la enzima. En los ensayos de
actividad realizados en ausencia de NAD(P)H aadido en los que observamos inactivacin
durante el curso de la reaccin, la disminucin de sitios activos, es decir la inactivacin, ocurrira
a medida que la reaccin transcurre y se va produciendo NAD(P)H, lo que llevara a la
progresiva acumulacin del aductola especie que hemos nombrado como E*NAD(P)Hy a la
completa inactivacin de la enzima cuando toda ella se encuentre como esta especie.
De esta forma se convierte un inhibidor que debe ser competitivo por razones
estructurales en uno mixto que posee un importante componente incompetitivo; es decir, en un
inhibidor que no slo disminuye la afinidad aparente de la enzima por su sustrato (aumenta la
Km) sino que tambin disminuye la Vmax. Sin embargo, es importante resaltar que aunque el
efecto de la formacin del aducto se percibe en los estudios cinticos de velocidad inicial como el
componente incompetitivo de la inhibicin mixta, no es ni mecanstica ni cinticamente
equivalente. A diferencia de los inhibidores incompetitivos clsicos que son muy efectivos slo a
altas concentraciones de sustratolo que no permitira disminuir significativamente la velocidad
+
de la reaccin cuando el NAD se est agotandoeste mecanismo es tambin efectivo a bajas
+
concentraciones de NAD , puesto que se basa en la inactivacin de una parte de la enzima, lo
que depende solamente de la concentracin del inhibidor y de la proporcin de enzima libre que
exista en la conformacin correcta para formar el aducto con l.
Relevancia fisiolgica
deshidrogenasas
de
las
propiedades
cinticas
de
las
betana
aldehdo
Las inusuales propiedades cinticas de los dos tipos de BADHs estudiados por nosotros
tienen en comn dos cosas: (1) que en ambas enzimas el nucletido reducido es ms eficiente
en reducir la velocidad de la reaccinya sea por el componente incompetitivo de la inhibicin
mixta o por inactivacin reversible de la enzimaque si se tratara de un inhibidor competitivo, y
(2) que estos efectos inhibitorios o inactivantes del NAD(P)H no pueden ser revertidos por el
+
NAD(P) .
Pero qu importancia fisiolgica puede tener el que el NAD(P)H sea un buen inhibidor y
+
que NAD no pueda eliminar su inhibicin? La respuesta est probablemente en que cualquier
reaccin irreversible que use un compuesto de suma importancia para el metabolismo como es
+
+
el NAD o el NADP supone un peligro potencial para la clula y debe disponer de mecanismos
para su control efectivo a corto plazo. Todas las ALDHs no fosforilantes catalizan reacciones
irreversibles, pero en general estn participando en la destoxificacin de aldehdos que se
encuentran en pequeas cantidades, ya sean de origen endgeno, es decir producidos por el
metabolismo, o exgeno, es decir contaminantes ambientales o resultado del metabolismo de
frmacos. Por ello no representan un peligro real para la clula. Sin embargo, las funciones
fisiolgicas de las BADHs que participan en la sntesis del osmoprotector glicina betana o en la
degradacin de la colinacuando sta es la nica fuente de carbono, nitrgeno y energa para la
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En el cloroplasto la poza del par NAD /NADH no est en equilibrio con la del par
+
NADP /NADPH, por lo que los niveles de NAD no se pueden regular mediante las reacciones
fotosintticas de asimilacin del carbono. Por ello, en las BADHs de cloroplasto s tene una gran
+
importancia la regulacin a corto plazo por el NADH para evitar el agotamiento del NAD
intracloroplstico. Pero el riesgo de inhibir a la chBADH es que se acumule BAque est siendo
producido activamente bajo condiciones de estrs osmtico por la colina monooxigenasa [64]
ya que este aldehdo es altamente txico para la planta [36]. La regulacin a corto plazo de la
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+
actividad de las chBADHs debe ser tal que evite el agotamiento del NAD y al mismo tiempo
evite la acumulacin de BA. Probablemente sta es la razn por la queadems de las
peculiares propiedades cinticas de la BADH bacteriana ya mencionadasla enzima de
cloroplasto presenta una inhibicin parcial por su sustrato BA [25] que conlleva una inhibicin
parcial por el NADH. La inhibicin por BA se demostr que se debe al establecimiento de una
ruta alterna de liberacin del NADH ms lenta que la ruta que opera a bajas concentraciones del
aldehdo [25]. A concentraciones altas, la BA puede unirse al complejo Enzima-NADH formando
un complejo ternario no productivo Enzima-NADH-BA del cual puede liberarse el NADH, lo que
causa que tanto la inhibicin por sustrato como por NADH sea parcial. Creemos que tanto la
inhibicin parcial por altas concentraciones de BA como la inhibicin parcial por NADH son de
gran importancia para la enzima de cloroplasto, ya que probablemente en este organelo las
+
reacciones de regeneracin del NAD son ms lentas que las que existen en P. aeruginosa y se
puede por tanto alcanzar concentraciones tan altas de NADH que de no existir la ruta alterna de
la reaccin produciran una inhibicin total y la acumulacin de BA, con los efectos txicos que
esto conllevara.
Comentarios finales
Los mecanismos de regulacin a corto plazo aqu descritos de la actividad de las BADHs
por el nucletido reducidoen conjuncin con la regulacin por la BA en el caso de la enzima de
cloroplastono han sido descritos hasta la fecha para otras enzimas. Estos mecanismos se
basan en propiedades estructurales que probablemente comparten muchas otras ALDHs. En el
caso de las BADHs la regulacin a corto plazo responde a claras necesidades metablicas.
Agradecimientos
Los trabajos de investigacin mencionados del grupo al que pertenecen los autores fueron
realizados con el apoyo financiero de CONACYT y DGAPA-UNAM a proyectos de RAMC. Los
autores agradecen el valiosos apoyo tcnico de Carlos Mjica-Jimnez en los trabajos de
investigacin de nuestro grupo aqu descritos.
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