INTRODUCCION A LAS
CIENCIAS BIOMEDICAS
DEPARTAMENTO DE BIOQUIMICA Y BIOLOGIA MOLECULAR
FACULTAD DE CIENCIAS BIOLOGICAS
Dr. Jos Martnez Oyanedel, jmartine@udec.cl
LABORATORIO DE BIOFSICA MOLECULAR
1ER PISO EDIFICIO BIOLOGIA MOLECULAR
INTRODUCCCION
BIOMOLECULAS:
BIOMOLECULAS
CARBOHIDRATOS
QCA.ORGANICA
LIPIDOS
QCA.ORGANICA
ACIDOS NUCLEICOS
PROTENAS
COMO ESTAN CONSTITUIDAS?
COMO SE ORGANIZAN ?
COMO FUNCIONAN ?
COMO INTERACCIONAN ?
COMO SE REGULAN ?
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BIBLIOGRAFIA
BASICA
: BIOQUIMICA STRYER
AVANZADA
: BIOQUIMICA
Pagina Web
: http://docencia.cfrd.cl/~proteinas
login: proteinas
pass: rasmolpro
instalar plugin MDLChimeSP6.exe
3,9
4,9
5,9
6,9
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ESTRUCTURA Y FUNCION DE
MACROMOLECULAS BIOLOGICAS
PROTEINAS
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AMINOACIDOS
DISOCIACION EN AMINOACIDOS
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HA
H+ + A-
TITULACION DE AMINOACIDOS
pH = pKa + 2
pH = pKa + 2
pH = pKa
pH = pKa - 2
pH = pKa
pH = pKa + 2
pH = pKa - 2
pH = pKa
pH = pKa - 2
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GRUPOS ACIDOS
CARGA NETA CERO
CARGA NETA
NEGATIVA
GRUPOS BASICOS
CARGA NETA
POSITIVA
CARGA NETA CERO
TITULACION DE AMINOACIDOS
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ACIDO ASPARTICO
pKa COOH 2.0
pKa COOH 3.6
pKa NH3+ 9.6
(+1)
(0)
HOOC-CH2-CH-COO-
HOOC-CH2-CH-COOH
NH3+
NH3+
(0)
(-1)
-OOC-CH
HOOC-CH2-CH-COO-
NH3+
NH3+
(-1)
-OOC-CH
(-2)
2-CH-COO
-OOC-CH
NH3+
2-CH-COO
2-CH-COO
NH2
Donde,
m numero de protones neutralizados desde carga neta positiva a
carga neta cero.
n numero de protones neutralizados desde carga neta cero a carga
neta negativa
pKa+ pKa del grupo cuya deprotonacin lleva la molcula
desde carga neta positiva a carga neta cero.
pKa- pKa del grupo cuya deprotonacin lleva la molcula
desde carga neta cero a carga neta negativa
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pI
carga neta positiva
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carga neta negativa
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ENLACE POLIPEPTIDICO
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CADENA POLIPEPTIDICA
CADENA POLIPEPTIDICA
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FEN-LYS-ALA-TYR-SER-GLU-ASP-VAL-MET-CYS-HIS-GLN-LEU-ASN-ARG-GLY
FEN-LYS-ALA-TYR-SER-GLU-ASP-VAL-MET-CYS-HIS-GLN-LEU-ASN-ARG-GLY
FEN-LYS-ALA-TYR-SER-GLU-ASP-VAL-MET-CYS-HIS-GLN-LEU-ASN-ARG-GLY
NH3 + -----------------------------------------------------------------------------COOH
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C-Terminal
N-Terminal
FEN-LYS-ALA-TYR-SER-GLU-VAL-ASP-MET-CYS-LEU-HIS-GLN-ASN-ARG-GLY
NH3+ NH3+
OH
COOH COOH
SH
RH +
NH COOH
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FEN-LYS-ALA-TYR-SER-GLU-VAL-ASP-MET-CYS-LEU-HIS-GLN-ASN-ARG-GLY
NH3 + NH3 +
OH
COOH
COOH
SH
RH +
NH2+ COOH
FEN-LYS-ALA-TYR-SER-GLU-VAL-ASP-MET-CYS-LEU-HIS-GLN-ASN-ARG-GLY
NH3 + NH3 +
OH
COOH
COOH
SH
RH +
NH2+ COO-
FEN-LYS-ALA-TYR-SER-GLU-VAL-ASP-MET-CYS-LEU-HIS-GLN-ASN-ARG-GLY
NH3 + NH3 +
OH
COOH
COO-
SH
RH +
NH2+ COO-
FEN-LYS-ALA-TYR-SER-GLU-VAL-ASP-MET-CYS-LEU-HIS-GLN-ASN-ARG-GLY
NH3 + NH3 +
OH
COO-
COO-
SH
RH +
NH2+ COO-
FEN-LYS-ALA-TYR-SER-GLU-VAL-ASP-MET-CYS-LEU-HIS-GLN-ASN-ARG-GLY
NH3 + NH3 +
OH
COO-
COO-
SH
NH2+ COO-
FEN-LYS-ALA-TYR-SER-GLU-VAL-ASP-MET-CYS-LEU-HIS-GLN-ASN-ARG-GLY
NH3 + NH3 +
OH
COO-
COO-
S-
NH2+ COO-
FEN-LYS-ALA-TYR-SER-GLU-VAL-ASP-MET-CYS-LEU-HIS-GLN-ASN-ARG-GLY
NH2
NH3 +
OH
COO-
COO-
S-
NH2+ COO-
POLIPEPTIDOS
Existen pptidos con importantes actividad biolgica:
Oxitocina
(9, Cys-Tyr-Ile-Gln-Asn-Cys-Pro-Leu-Gly)
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CADENA POLIPEPTIDICA
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Hidrlisis qumica:
Protena + HCl 6M, 100 C, 24 hs Aminocidos
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ANALISIS DE SECUENCIAS
1. Comparacin con otras secuencias para determinar
similitudes y establecer si dos protenas pertenecen a una
misma familia
2. Comparacin de secuencia de la misma protena de
diferentes especies para obtiene informacin sobre evolucin
3. Bsqueda de repeticiones
4. Bsqueda de secuencias de sealizacin y de
modificaciones postraduccionales
5. Anlisis para la preparacin de anticuerpos
6. Anlisis para la preparacin de sondas
ANALISIS DE SECUENCIAS
Firmas de familias:
Secuencia comn que presentan las protenas que pertenecen a
una determinada familia.
Estas familias son generalmente definidas por la funcin:
[LI]-x-[STN]-[HN]-x-H-[GSTA]-D-x(2)-G-[GP]-x(7,8)-[GS]
[H/N, H y D son los ligandos del zinc]
P-x(3)-[LIVM](2)-x-G-x-C-[LIVMF](2)-K [C ligando de zinc]
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ANALISIS DE SECUENCIAS
Sitios de modificacin :
Secuencias especficas que son el blanco de
modificaciones post-traducionales
Sitios de fosforilacin
Protein quinasa C
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