estados de agregacin.
Concepto de cuerpo: Para definir un cuerpo es fundamental indicar su forma,
porque si sta desaparece origina otro u otros cuerpos. Ej.: si destrozo una
botella, los fragmentos sern cualquier otro cuerpo menos una botella.
O sea que: CUERPO es una porcin limitada de materia.
Concepto de sustancia: Existen diferentes clases de materia que le dan a los
cuerpos propiedades particulares. Ej.: si tengo tres cuerpos esfricos; uno de
vidrio, otro de cobre, otro de plomo; tienen en comn su forma pero se
diferencian por su color y su peso. Estas distintas clases de materia se llaman:
SUSTANCIA: Para definirla no es necesario indicar su forma porque si
destruyo, por ejemplo, el cuerpo esfrico de vidrio, cada uno de los trozos sigue
teniendo las propiedades del vidrio. Es decir que se ha destruido el cuerpo pero
no la sustancia.
Luego:
SUSTANCIA es la calidad de materia que constituye un cuerpo.
Sustancias simples y compuestas: Existen dos clases de sustancias.
a.- las que se descomponen en otras ms sencillas;
b.- las que no se descomponen.
Las primeras se conocen como:
sustancias compuestas
compuestos qumicos o combinaciones
O2
Ca
- un polvoblanco de xido de calcio
O2
SIMBOLO
Hidrgeno
Hydrogenium
Potasio
Kalium
Azufre
Sulphur
En los casos de elementos qumicos con la misma letra inicial se utiliza una
segunda letra diferencial que no siempre es la segunda de su nombre. La
primera se escribe con mayscula y la segunda con minscula.
Ejemplos:
carbono
carbonium
cobre
cuprum
Cu
cadmio
cadmiun
Cd
NH 3 amonaco
O
H
H Amonaco
H
Valencia
Es el poder o capacidad de combinacin de un elemento qumico con respecto
a otro, tomado como unidad.
Se dice que el elemento cloro, por ejemplo, tiene una valencia o capacidad de
combinacin igual a uno, porque con el elemento hidrgeno (tomado como
referencia) se combina tomo a tomo. HCl
5
M
E
T
A
L
E
S
II
N
O
M
E
T
A
L
E
S
Litio (Li)
Plata (Ag)
Potasio (K)
Sodio (Na)
Bario (Ba)
Berilio (Be)
Cadmio (Cd)
Calcio (Ca)
Estroncio (Sr)
Magnesio (Mg)
Zinc (Zn)
Antimonio (Sb)
Arsnico (As)
Fsforo (P)
Nitrgeno (N)
III . V
II . IV.
VI
- Azufre (S)
- Selenio (Se)
- Telurio (Te)
- Cobalto (Co)
- Hierro (Fe)
- Niquel (Ni)
I I. III
- Fluor (F)
- Hidrgeno (H)
- Cobre (Cu)
- Mercurio (Hg)
I . II
I . III
- Oro (Au)
III
- Aluminio (Al)
- Boro (B)
III, V
I . III
V . VII
-Bismuto
- Bromo (Br)
- Cloro (Cl)
- Iodo (I)
-
II
- Oxgeno (O)
IV
- Carbono (C)
- Silicio (Si)
Existen ciertos compuestos que pueden actuar como metal y como no metal,
estos compuestos se denominan Anfteros, ejemplos:
Cromo: Valencia II, III (Metal), VI (No Metal).
Manganeso: Valencia II, IV (Metal), V, VI (No metal).
Molibdeno: Valencia III, IV (Metal), V, VI (No metal).
6
1
de la
1836
masa del protn. Es decir que 1836 electrones juntos poseen una masa
igual a la del protn.
La carga del electrn es negativa. Como el tomo es neutro, cada tomo
posee tantos electrones como protones. El nmero de cargas positivas
nucleares corresponden al nmero de orden en la tabla peridica que a
su vez corresponde al nmero de electrones.
K
L
x
23
Na
N atmico
11
n de rbitas
rbita externa o de
valencia n de e
Siempre en orbita
externa
n del periodo
n del grupo
octeto
GRUPO I
ORBITAS DE
ELECTRONES
Li
2-1
Na
2-8-1
2-8-8-1
Rb
2-8-18-8-1
Cs
2-8-18-18-8-1
Fr
2-8-18-32-18-8-1
GRUPO VII
ORBITAS DE
ELECTRONES
2-7
Cl
2-8-7
Br
2-8-18-7
2-8-18-18-7
GASES
ORBITAS DE
RAROS
ELECTRONES
Ne
2-8
Ar
2-8-8
Kr
2-8-18-8
Xe
2-8-18-18-8
Rn
2-8-18-32-18-8
1.- A todos los elementos del grupo I les es ms fcil perder el nico electrn de
su capa externa que ganar siete.
-1 e
Na
Na
2.- Anlogamente, a los elementos ubicados en los grupos II y III de la tabla les
resulta ms factible ceder 2 o 3 electrones para quedar con una rbita externa
de 8 electrones que adquirir 6 o 5. As el Mg (2-8-2) si cede 2 electrones se
asemeja al Nen (2-8).
-2 e
Mg
Mg
(catin electropositivo)
10
CapaK
1s
2 electrones
Capa L (2 subcapas)
2 s 2 electrones
2 p 6 electrones
8 electrones
3 s 2 electrones
Capa M (3 subcapas) 3 p 6 electrones
18 electrones
3 d 10 electrones
4 s 2 electrones
Capa N (4 subcapas)
4 p 6 electrones
4 d 10 electrones
32 electrones
4 f 14 electrones
Configuracin
elctrica
2
1S 2S 2 p
Representacin grfica
1s
1S 2S 2 p
1S 2 2 S 2 2 p 4
1S 2S 2 p
2p
2s
2p
1s
2s
1s
8O
2p
1s
5B
2s
2s
2p
11
UNIONES QUMICAS
Unin electrovalente inica o hteropolar
Todos los elementos que tienen un nmero de electrones vecinos a ocho,
tienden a adquirir otros, para formar un octeto ms estable.
Ejemplo:
Un tomo de flor (F)
N atmico = 9
K= 2e
L=7e
L=8
Nen
Na
Cl
Na Cl
Ca
-2e
Ca
12
Son precisos dos tomos de cloro para adquirir esos dos electrones, uno cada
uno, y formar dos iones cloro restableciendo el equilibrio.
Ca
Cl
Cl
Ca
2 Cl
H H
Adquiere as cada tomo la configuracin del helio. Ninguno de los dos tomos
logra posesin completa de ambos electrones.
En el caso del cloro cuando dos tomos, al encontrarse, forman una molcula,
cada uno de ellos comparte los dos electrones del doblete, de manera que los
tomos completan su octeto
Cl
Cl
Cl Cl
Las cruces indican los electrones del par o doblete electrnico. Cada uno de los
electrones del doblete poseen spin o giro electrnico opuesto y ello origina
momentos magnticos contrarios que con su atraccin mantienen unidos a los
tomos. Para formar un enlace covalente un tomo debe poseer un orbital
desapareado, es decir, con un slo electrn. Los dos electrones del doblete se
13
xx
S
x
x
x
SO2
O
O
x
x
xx x
SO3
O
Uniones intermoleculares
Los mecanismos de las posibles uniones entre molculas adquieren un gran
inters, principalmente cuando se trata de molculas de gran tamao, como es
el caso de las protenas. Estas interuniones explican, por una parte, la
estructura tridimensional de la propia macromolcula, y por otra parte, la
posibilidad de su interaccin con otras formas altamente especficas, como
ocurre en los anticuerpos y en las enzimas.
14
15
TEMA II - SOLUCIONES
Definicin. Soluto y solvente. Solucin diluida, concentrada, saturada,
sobresaturada. Peso atmico absoluto y relativo. Peso molecular absoluto y
relativo. tomo/gramo. Molcula gramo o mol. Soluciones valoradas:
molaridad, normalidad.
Para hablar de soluciones daremos un concepto bastante somero de sistemas
homogneos y heterogneos.
Sistema: Definimos como sistema al objeto de que est directamente bajo
nuestra atencin, aquello que es motivo de nuestro estudio. Cuando
estudiamos un sistema y lo observamos, podemos distinguir dos grandes
clases de sistemas:
Sistemas homogneos
Sistemas heterogneos
Molculas
de agua
Solucin
Molculas
de azcar
16
Cmo se lo determina?
a). Se pesa un volumen determinado de gas, por ej. un litro, cuyo peso
molecular (M) queremos determinar:
Peso 1 lt gas = peso 1 molcula gas x N de molculas que hay en 1 lt. de gas.
M*
N*
M n
M ' n'
d). Existe un principio que dice que es igual el nmero de molculas que
hay en volmenes iguales de diferentes gases.
M n
M ' n'
32
M
32
de donde
1.251 grs
M 28.01
1.429 grs
O sea que el peso molecular relativo de una sustancia es 32 veces la relacin
entre el peso de la sustancia y el peso de un volumen igual de O2 .
M
32
18
PESO
MOL
MOLECULAR RELATIVO
Oxgeno
32
32 grs
Hidrgeno
2,016
2,016 grs
Agua
18,016
18,016 grs
19
OH
O = As
OH
O = Sb
OH
OH
OH
Na
Na
O
Na2O
Na
O
Na
Un mtodo que se emplea corrientemente para escribir las frmulas globales
es intercambiar los nmeros que corresponden a sus valencias. Ejemplo:
Na 2 O1
xidos de metales bivalentes: En estos xidos el metal posee la misma
valencia que el 02, por eso se combinan tomo a tomo.
Ca
Ca 2 O2
Ca O
En igual forma se obtienen las frmulas de todos los xidos de los elementos
metlicos bivalentes: Zn, Mg, Cd, etc.
xidos de metales trivalentes: Como queda libre una valencia del aluminio,
es decir, que tiene una valencia impar, se escribe otro tomo de aluminio y con
un tomo de O2 como puente completamos la frmula desarrolladas.
O
Al
O
Al 2 O3
Al
O
21
O
O
Bi
Bi 2 O5
O
O
Sn O2
Sn
O
Nomenclatura
a.- Metal que acta con una sola valencia: el xido se nombra con la palabra
xido seguida del nombre del metal. O bien anteponiendo la palabra
monxido al nombre del metal.
Ejemplo: Na 2 O xido de sodio o monxido de sodio
b.- Metal que acta con dos valencias: el menos oxigenado se nombra con el
nombre del metal terminado con el sufijo oso y el ms oxigenado con el
sufijo ico.
Ejemplo: Fe (valencia 2 y 3) FeO xido ferroso ; Fe 2 O3 xido frrico
c.- Bixidos: cuando el xido est constituido por un tomo de metal y dos de
oxgeno.
Ejemplo: PbO2 bixido de plomo
d.- Perxidos: en la molcula del xido hay dos tomos de oxgeno y uno de
metal, pero los dos tomos de oxgeno intercambia valencias entre s.
Ejemplo:
H
H 2 O2
H
perxido de hidrgeno
e.- Sesquixidos: La molcula est constituida por dos tomos de metal y tres
de oxgeno.
Ejemplo: Al 2 O3 sesquixido de aluminio
Sesqui es un sufijo que significa uno y medio o sea: el xido tiene por cada
tomo de metal uno y medio tomo de oxgeno.
xidos cidos o anhdridos: Se llaman as a los compuestos que resultan de
combinar un no metal con el oxgeno.
Ejemplos:
22
No
metal
monovalente
Cl 2 O
cloro
No metal trivalente = P2 O3
anhdrido
carbnico
dixido
de
pentxido
de
carbono
No
metal
pentavalente
= anhdrido
ntrico
N 2 O5
nitrgeno
No
metal
heptavalente
= anhdrido perclrico
Cl 2 O7
Nomenclatura:
a.- Si el no metal posee una sola valencia el compuesto se denomina
anhdrido y a continuacin se coloca el nombre del no metal con el sufijo
ico.
Ejemplo: CO2 anhdrido carbnico o dixido de carbono
b.- Cuando el no metal posee dos valencias diferentes uno de los anhdridos (el
menos oxigenado) se nombra haciendo terminar el nombre del no metal con
el sufijo oso, el otro anhdrido (el ms oxigenado) se nombra haciendo
terminar al no metal en el sufijo ico.
Ejemplo:
N 2 O3 anhdrido nitroso (N con valencia 3) o trixido de
nitrgeno
N 2 O5 anhdrido ntrico (N valencia 5) o pentxido de nitrgeno
c.- Cuando el no metal posee cuatro valencias diferentes, por ejemplo el cloro
(1-3-5-7) sus anhdridos se nombran segn se indica en los ejemplos.
1: Cl 2 O
3: Cl 2 O3
5: Cl 2 O5
7: Cl 2 O7
23
elementos que
formanel xido
Na2 O
frmula correcta
del xido
Na 2 O
Otros ejemplos:
4 Na
O2
2 Na 2 O
Ca
II
2 Ca
Divalentes:
O2
2 Mg
O2
Mg O
2 Mg O
III
Al
O2
2 Al
3O 2
Al2 O3
4 Al
3O2
2 Al2 O3
Cl
Heptavalentes:
O2 2 Ca O
Mg
II
Trivalentes:
O2 Ca O
Al2 O3
O 2 Cl 2 O7
2Cl
7O2
Cl 2 O7
4Cl
7O2
2Cl 2 O7
Reacciones de los xidos con el agua: Los xidos cidos y los xidos
bsicos reaccionan con el agua. Los xidos al reaccionar con el agua dan
cidos oxigenados o simplemente cidos. Los xidos bsicos al reaccionar con
el agua dan hidrxidos o bases.
24
HCl
= cido clorhdrico
HF = cido fluorhdrico
H2 S
= cido sulfhdrico
CO2
H 2O
anhdrido
carbnico
H 2 CO3
cido
carbnico
SO3
H 2O
anhdrido
sulfrico
H 2 SO4
cido
sulfrico
SO2
H 2O
anhdrido
sulfuroso
Cl2O3
H 2O
anhdrido
cloroso
2 HClO2
cido
Cl2O
H 2O
anhdrido
hipocloroso
Cl2O7
H 2O
anhdrido
perclrico
2 HClO4
cido
perclrico
N O5
H 2O
2
anhdrido
ntrico
2 HNO3
cido
cloroso
ntrico
Cl2O5
H 2O
anhdrido
clrico
N O3
H 2O
2
anhdrido
nitroso
H SO
23
cido
sulfuroso
2
HClO
cido
hipocloroso
2 HClO3
cido
clrico
2 HNO2
cido
nitroso
Los oxcidos se nombran con la palabra cido seguida por la misma palabra
que designa al anhdrido que lo gener.
25
H
O
O
H
Agua
radical oxidrilo
Vamos a desarrollar la frmula del cido nitroso ( HNO 2 ). Pero antes debemos
decir que:
En todo cido inorgnico hay tantos radicales oxidrilos como tomos de
hidrgeno tenga la molcula del cido".
En el caso del cido nitroso hay un tomo de hidrgeno, por consiguiente, hay
un radical oxidrilo.
O
OH
HNO 3
OH
Otros ejemplos:
O
H2SO 3
HO
cido sulfuroso
OH
O
H2SO 4
HO
OH
cido sulfrico
26
cido carbnico
H2CO3
HO
HClO
Cl
HClO2
Cl
OH
OH
cido hipocloroso
OH
cido cloroso
cido clrico
O
HClO 3
Cl
OH
HClO 4
Cl
OH
cido perclrico
RADICALES
OH oxidrilo
O 2 perxido
NH 4 amonio
NO-3 nitrato
NO-2 nitrito
HCO -3 bicarbonato
CO 3 carbonato
PO 4 fosfato
SO 4 sulfato
HSO -4 bisulfato
SO-3 sulfito
HSO -3 bisulfito
B. Hidrxidos/Bases:
Oxido bsico + agua hidrxido o base
En la frmula de hidrxido debemos recordar que hay tantos radicales
oxidrilos como valencia tenga el metal
27
Ejemplo:
K
OH (hidrxido de potasio)
el potasio es
monovalent e
Fe O (xido ferroso)
Fe (OH)
(hidrxido ferroso)
No Metal
+
Oxgeno
xido bsico
xido cido
+
Agua
+
Agua
xido bsico
cido
(anhdrido)
SAL + H2O
Sales
Hidrxido + cido sal + agua
a.- Sales de hidrcidos:
1.- Se designan cambiando la terminacin hdrico del cido por uro y
aadiendo luego el nombre del metal.
HCl
Na OH
cido clorhdrico
Na Cl
H 2O
clorurode sodio
28
2 HCl
cido
clorhdrico
Ca OH
2
hidrxido
de calcio
Ca Cl2
2 H 2O
clorurode calcio
Al (OH ) 3
Al Cl 3
3H 2 O
KNO2
H 2O
nitrito de potasio
HNO2
K OH
cido nitroso
2.-
2 H Cl O
Ca (OH )
2
cido hipocloroso
H 2 CO3
Ca ClO 2
2H 2O
hipoclorito de calcio
Mg (OH ) 2
MgCO3
cido carbonico
2H 2O
carbonato de magnesio
3.-
3H 2 SO4
2 Al (OH ) 3
cido sulfrico
Al2 ( SO4 ) 3
6H O
2
sulfatode aluminio
cidos poliprtico
Se emplea esta expresin y tambin la de cidos policidos para designar
aquellos cidos que pueden reemplazar ms de un tomo de hidrgeno por
tomos de metal cuando forman sales. El cido sulfrico, por ejemplo, es un
cido diprtico pues es capaz de separar dos tomos de hidrgeno para
sustituirlos por tomos de metal.
O
O
H2SO 4
HO
S
O
OH
H--- O
O---H
El cido fosfrico es
un cido triprtico pues es capaz de separar tres tomos de hidrgeno.
29
OH
O =
H3PO 4
OH
O =
OH
O
HNO 3
OH
H 2 SO4
2 Na OH
Na 2 SO4
2H 2O
En este caso los H del cido fueron todos sustituidos por tomos de
metal. La sal es neutra.
b.- Pero la reaccin puede ser parcial:
H 2 SO4
K OH
KHSO
H 2O
4
sulfato cido o
bisulfato de potasio
Mg (OH ) 2
Mg Cl 2
2H 2O
30
clorurobsicode magnesio
La sal obtenida es bsica.
Otros ejemplos:
OH
Bi
OH
NO 3
Cl
Fe
OH
OH
31
H C H
H
Frmula
electrnica
CH4
Metano
Frmula
molecular
Frmula
estructural
H
H
Cl 2
Cl
H
Cl
C
H
Cl
H
C
H
H
H
Cl
32
C
Lineal
Ramificada
primario
secundario
primario
carbono terciario
C
C
C
carbono cuaternario
C
33
b.
C
C
C
C
C
c.
d.
C
C
C
C
34
CH 3
CH 2 OH
CH 2 OH
CH 2
|
CH 2 OH
metanol
etanol
propanol
Funcin hidrocarburo
1.-
metano
C 2 H6
etano
35
C n H 2n
2.-
acetilnicos o alquinos.
H3C
CH2
eteno
CH
CH2
H3C
propeno
CH2
CH
CH2
buteno
propeno
butano
buteno
pentano
penteno
Los segundos, o sea los acetilnicos o alquinos, son aquellos en los que dos
tomos de carbono se hallan unidos por triple ligadura.
HC
CH
H3C
CH
H3C
CH
butino
propino
etino
CH2
Alquenos
Alquinos
etano
eteno
etino
propano
propeno
propino
butano
buteno
butino
pentano
penteno
pentino
hexano
hexeno
hexino
36
CH2
H2C
CH2
H2C
CH2
ciclo butano
ciclo propano
CH2
H2C
CH2
HC
CH
HC
CH
O
furano
(heterocclico)
ciclo propano
(isocclico)
CH
HC
CH
C
H
37
Resumiendo:
Saturados
Hidrocarburos
acclicos o alifticos
(cadena abierta)
Serie alclica
(simple ligadura)
Sustancia tipo:
metano CH 4
(ano)
Serie etilnica
(doble ligadura)
Sustancia tipo:
etileno HC CH
(eno)
Serie acetilnica
(triple ligadura)
Sustancia tipo:
acetileno HC CH
o etino (ino)
No Saturados
Ejemplo:
CH2
Ciclnicos o
alicclicos
(simple ligadura)
H2C
CH2
ciclo propano
Isocclicos
(nudos ocupados
por tomos de C)
H
C
HC
Bencnicos
(doble ligadura)
CH
HC
CH
C
H
benceno
Hidrocarburos
cclicos
(cadena cerrada)
Heterocclicos
(nudos ocupados
por tomos de C y
otros elementos)
HC
CH
HC
CH
HC
CH
HC
CH
NH
pirrol
CH2
HC
CH
HC
CH
O
furano
O
pirano
38
H
C
H
C
H
H
CH3
H
C
H2C
OH
H
OH
etano
etanol
CH2
OH
etanol
propano
propanol
butano
butanol
pentano
pentanol
H
C
H
H
H
H
H
H
OH
H
H
propano
CH3
HC
OH
CH3
H
propanol
secundario
HC
OH
H2C
OH
H2C
OH
HC
OH
HC
OH
H2C
OH
CH3
1-2 propanodiol
1-2-3 propanotriol
Recordar
H2C
HC
OH
OH
grupo funcional
alcohol secundario
grupo funcional
alcohol primario
H
H
obtenemos
H
H
por prdida
de agua
OH
H
H
aldehdo
O
H
H
H
OH
H
C
H
H
H
C
CH3
H
C
OH
+ [O]
CH3
obtenemos
OH
por prdida
de agua
OH
H
O
40
Ejemplos:
H
CH3
O
C
H
metanal
CH3
CH3
CH2
CH2
H
etanal
CH2
propanal
O
C
butanal
CH3
CH3
H
C
H
OH
+ 2 OH
H
C
OH
obtenemos
por prdida
de agua
CH3
CH3
CH3
CH3
H
+ O
OH
CH3
propanol -2
OH
obtenemos
OH
por prdida
de agua
CH3
CH3
propanona
Ejemplos:
CH3
CH3
CH3
CH3
CH2
CH2
CH2
CH2
CH3
CH3
propanona
CH2
butanona
CH3
CH3
pentanona 3
pentanona 2
H
grupo funcional aldehdo
(en un carbono primario)
ona
CH3
CH2
CH2
H
CH3
CH2
- H2O
OH
H
propano
OH
OH
cido
propanoico
OH
+ [O]
H
O
C
OH
metanal
metanoico
42
CO.OH
Ejemplos:
H
CH3
O
CH3
CH3
CH2
C
OH
OH
metanoico
etanoico
CH2
O
CH2
OH
C
propanoico
OH
butanoico
Nomenclatura:
Se cambia la terminacin al del aldehdo respectivo por el sufijo oico.
Recordar:
a. El grupo funcional alcohol puede ubicarse en un carbono primario.
secundario, terciario o cuaternario
b. El grupo cetnico slo va ubicado en un carbono secundario, mientras que
los grupos aldehdos y cidos van ubicados, solamente en un tomo de
carbono primario.
En tomo de carbono primario
CH 2OH
CO.H
COOH
alcohol primario
aldehido
cido
CH.OH
CO
alcohol secundario
cetona
43
- Funcin sal: Las sales orgnicas al igual que las inorgnicas, se pueden
obtener combinando un cido orgnico con un hidrxido.
H
O
C
- H2O
Na OH
OH
H2O
ONa
H3C
metano
metilo
CH3
CH3
H2C
etano
etilo
O
OH
cido metanoico
H
C
O
O
radical metanoico
44
H
H2C
H2C
OH
H
H2C
H2O
OH
metano-oxi-metano
H2C
H
CH3
ter metlico o
metano-oxi-metano
H3C
C2H5
metano-oxi-etano
CH3
CO.O H
- H2O
C
O
CO.O H
C
O
CH3
cido etanoico
CH3
anhdrido etanoico
C
- H2O
CH2
CH2
CH2
CO.O H
OH
CH2
CH3
cido etanoico
etanoato de propilo
CH3
H
H2O
Cl
CH2
OH
CH2
Cl
cloruro de etilo
H
H
amonaco
CH3
CH3
+
H2O
CH2
OH
etanol
+
CH2
NH2
H
C2H5
etilamina
46
CH2
CH3
CH2
CH3
CH2
CH3
CH2
CH3
CH2
CH3
amina terciaria
amina secundaria
H
N
CH3
H2O
etanamida
OH
NH 2
H
CO
CH3
como si un tomo de
hidrgeno del amonaco fuera
reemplazado por radical cido.
CH3
O
C
NH2
etano nitrilo
etanamida
CH3
H
H
C
H
H
47
CH3
CH OH
CH2 OH
O
C
H
CO OH
etanol-al
propanol-2-oico
CO OH
propanoico-ona
Nomenclatura:
a.- Se nombra en primer lugar el alcano originario. Ej. etano-propano,
etc.
b.- Luego se aade las terminaciones de cada grupo funcional en
este orden: alcohol, aldehdo, cetona y cido
c.- En caso de duda sobre la ubicacin de una funcin se indica sta
con un nmero que seala el tomo de carbono respectivo.
48
CH3
CH2
CH2
CH2
COOH
CH 2OH
cido butanoico
butanol 1-ona 2
CH3
CH2
H
propanal
CH3
propanona
La palabra ismero deriva del griego: isos = igual; meros = partes; quiere decir
que las partes de las molculas son las mismas; pero la distribucin de los
tomos en la molculas es la que cambia.
Ismeros: Son todos aquellos compuestos que teniendo igual frmula global
pueden diferir en sus propiedades fsicas y qumicas.
Propiedades fsicas: Punto de fusin, ebullicin, densidad, etc.
49
CH3
CH3
OH 3
CH3
metil-propanol-2
CH3
CH3
CH2
CH2
CH2
CH
CH2 OH
CH3
butanol
butanol-2
OH
2.- C 5 H 12
CH3
CH3
CH2
CH3
CH2
CH3
CH3
CH2
tetrametil metano
o
dimetil propano
CH3
pentano
CH3
CH2
CH3
H
propanal
propanona
50
2.- C 3 H 6 O2
CH3
CH 3
CH2
COO
CO OH
CH 3
cido propanoico
etanoato de Metilo
C 4 H 10 O
CH3
CH3
CH2
CH2
CH2
CH3-COO-CH2-CH3
CH2
CH2 OH
CH3
butanol-1
etano oxi-etano
51
Teora del tomo de carbono asimtrico: Cuando las cuatro valencias del
tomo de carbono se hallan ocuparlas por tomos o grupos atmicos
diferentes, el tetraedro se hace asimtrico. Ej.
HO
H
COOH
52
CH3
H
OH
COOH
OH
COOH
53
CH3
CH3
forma cis ( I)
HC
HOOC
COOH
CH
forma trans ( II)
54
TEMA V. AGUA
Propiedades fsicas y estructura del agua. Enlace de hidrgeno. Propiedades
disolventes del agua. Interacciones hidrofbicas. Efecto de los solutos sobre la
estructura del agua. Ionizacin del agua. Electrolitos fuertes y dbiles. Producto
inico del agua. Concepto de pH. cidos y bases. Tampones. Indicadores.
AGUA
El agua es considerada con frecuencia, un lquido inerte, meramente destinado
a llenar espacios en los organismos vivos. Pero, en realidad el agua es una
sustancia de gran reaccionabilidad, con propiedades poco frecuentes, que la
diferencian mucho, tanto fsica como qumicamente, de la mayora de los
lquidos corrientes.
Las primeras clulas que surgieron en el mar primitivo tuvieron que aprender a
hacer frente a las propiedades singulares del agua, y al fin los organismos
vivos desarrollaron mtodos para la explotacin de ests propiedades.
Sabemos ahora que el agua y los productos de su ionizacin, los iones
hidrgeno e hidrxilo, son factores importantes en la determinacin de la
estructura y las propiedades biolgicas de las protenas, de los cidos
nucleicos, de los lpidos, de las membranas y de otros componentes celulares.
Propiedades fsicas y estructura del agua: Cuando se compara con otros
lquidos corrientes, el agua posee elevadas propiedades fsicas: punto de
fusin, punto de ebullicin, calor especfico, calor de fusin y tensin
superficial. Estas propiedades indican que en el agua, las fuerzas de atraccin
entre sus molculas, son relativamente elevadas. Por ejemplo, en la tabla,
vemos que el calor de vaporizacin del agua es considerablemente mayor que
el de cualquier otro lquido anotado en la lista.
Calores de vaporizacin de algunos lquidos:
AH vap. (calgm 1 )
Agua
540
Metanol
263
Etanol
204
n-propanol
164
Acetona
125
Benceno
94
Cloroformo
59
H
O
H
O
H
O
H
H
H
O
H
O
H
H
O
R'
H
N
C
O
R
C
H
O
H
O
H
H
O
H
O
H
Entre un grupo
carbonilo y el agua
57
e1 e 2
D r2
80
33
24
21.4
2.3
1.9
Interacciones hidrofbicas
Existen compuestos que contienen simultneamente grupos hidrofbicos y
grupos polares fuertes. Dichos compuestos se denominan anfipticos. El agua
tambin la dispersa formando micelas. Este tipo de "solubilizacin" resulta
posible por el establecimiento de enlaces de hidrgeno, que en este caso no se
establecen entre las molculas del soluto y del solvente, sino entre las
molculas del disolvente. Las biomolculas anfipticas ms corrientes que
tienden a formar micelas son cidos grasos y lpidos polares. Veamos un
ejemplo: un cido graso de cadena larga como el oleato de sodio (18 tomos
de carbono).
O
C
Na
Oleato de sodio
O
Na O
O
C
cabeza
CH2
CH2
CH2
cadena
CH2
CH2
2 H 2O
H3O
OH -
H
H
O
H
OH -
O
H
OH
H
H
O
H
+
O
O
H
H
O
H
61
Agua: pH
CONCEPTOS PRELIMINARES
Electrlitos: son sustancias que en solucin (o fundidas) conducen la corriente
elctrica con transporte de materia. Tienen la virtud de disociarse en iones,
partculas con carga elctrica que surgen como consecuencia de un
desplazamiento electrnico. Por ejemplo, el cloruro de potasio es un electrolito
cuya disociacin en iones puede representarse por la siguiente ecuacin:
Cl
Cl K
A-
V1
K1 AB
donde:
K 1 : valor constante, caracterstico para cada electrolito a temperatura
determinada.
V2
K2 A
K1
K2
B
AB
=k
K1
es un cociente entre dos constantes, por lo tanto es constante.
K2
En el caso particular de una reaccin de ionizacin como la que consideramos,
la constante de equilibrio se denomina constante de disociacin ( K dis ). De
acuerdo al valor de su constante de disociacin, los electrlitos pueden
dividirse en dos grupos: fuertes y dbiles.
1.- Electrlitos fuertes: al disolverse se disocian en alto grado. Su
constante de disociacin tendr un valor grande, pues es muy
pequea la tendencia de sus iones a reconstituir las molculas
enteras. Cuanto mayor sea el valor de su K dis ms fuerte ser el
electrolito. Pertenecen a este grupo ciertos cidos inorgnicos ( ClH ,
BrH , IH , NO 3 H , SO 4 H 2 ,.), los hidrxidos alcalinos y alcalinotrreos
y la mayora de las sales inorgnicas. Su disociacin en solucin
acuosa es virtualmente completa y puede considerarse que todas sus
molculas estn ionizadas. Por esta razn la concentracin de los
iones se puede calcular a partir de la concentracin molecular de la
solucin. Por ejemplo, una solucin 0,01 M de ClK tendr una
concentracin prcticamente nula de molculas sin disociar; todo el
ClK presente en la solucin se habr ionizado en cloruro y catin
potasio segn la reaccin que dimos al comienzo. Como en la
disociacin se originan cantidades iguales de ambos iones, sus
concentraciones sern idnticas y correspondern a la concentracin
inicial de la sal.
Cl
0,01 M 10
2 NO 3-
Ca
++
63
OH
K dis
Un litro de agua pura contiene
H OH
H 2O
1000
moles de agua, de los cuales. slo
18
1
10 7 estn disociados. Puede calcularse que de cada 555
10000000
millones de molculas de agua, una sola est disociada. Estos datos
corresponden a una temperatura de 25 C. La constante de disociacin
del agua tiene entonces un valor muy reducido. Cuando un electrolito
puede originar ms de dos iones, la disociacin ocurre en varias
etapas y para cada una de ellas existe una constante de disociacin.
Ej.: Acido fosfrico
1. PO4H3
PO4H2-
H+
2. PO4H2
PO4H-
H+
3. PO4H-
PO4-
H+
64
ACIDOS Y BASES
Segn Arrhenius, cidos son aquellas sustancias que en solucin acuosa
liberan iones hidrgeno ( H ). Bases son los compuestos que liberan iones
oxhidrilos ( OH ). Ejemplos:
Cl
ClH
SO 4H2
SO 4H
Ca (OH)
SO 4H
Na
OH
NaOH
Ca (OH)
SO 4
OH
+
Ca (OH)
OH
Ca
++
NH4
K dis
OH
H 2O
= -7
-log [H+] = 7
AcH
Ac
(1)
Ki
Ac H
AcH
1,8 x 10
(2)
AcNa
Ac
Na
y por ende:
Ac
AcNa
sal
sal H
cido
Ki
1,8 x 10
despejando H+ :
cido
Ki
sal
y tomando logaritmos:
log H
log cido
log K i
log sal
log H
log cido
log K i
log sal
log
sal
cido
log K i
fuerte (por ej. ClH), el in acetato proveniente de la sal captura los protones y
se convierte en cido actico, poco disociado; de este modo, el efecto de un
cido fuerte ha sido amortiguado por la sal que se convierte en un electrolito
cido poco ionizado.
Por el contrario, si se adiciona una base, el componente cido de la mezcla
(AcH) impide el cambio de pH neutralizndolo para formar acetato de sodio:
Ach
H2O
OHNa
AcNa
pH
pK i
log
sal
cido
pK i
log 1 pK i
In
(color B)
68
pK in
Indicador
Acido
Alcalino
Lmites de
pH
Azul de timol
Rojo
Amarillo
1,51
1,2 - 2,8
Azul de bromofenol
Amarillo
Azul
3,98
3,0 - 4,6
Rojo de clorofenol
Amarillo
Rojo
5,98
4,8 - 6,4
Azul de bromotimol
Amarillo
Azul
7,0
6,0 - 7,6
Rojo de crexol
Amarillo
Rojo
8,3
7,2 - 8,8
Amarillo
Prpura
8,9
8,0 - 9,6
Anaranjado de metilo
Rojo
Amarillo
3,7
3,1 - 4,4
Rojo de metilo
Rojo
Amarillo
5,1
4,2 - 6,3
Fenolftale/na
Incoloro
Rojo
9,4
8,3 -10,0
69
C
H
2. H CHO
3.
CH2
OH
Gliceraldehdo
aldosa
1.
CH2
OH
2.
3.
CH2
OH
Dihidroxiacetona
cetosa
70
Ejemplos:
Triosas:
O
C
CH2 OH
H
CHOH
CH2 OH
CH2 OH
Gliceraldehdo
Dihidroxiacetona
Treosas:
O
CH2 OH
C
H
HO CH
HCOH
HC HO
CH2 OH
CH2 OH
Eritrosa
Treosa
Pentosas:
O
C
C
H
HC OH
HCOH
CH2
Xilosa
OH
CH2 OH
C
HO CH
HC OH
OH CH
HC OH
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
CH2
OH
Ribosa
OH
CH2 OH
Arabinosa
Ribulosa
CH2
71
Hexosas:
O
C
HCOH
OHCH
O
C
HCOH
HO CH
HO CH
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
CH2 OH
HO CH
HCOH
HCOH
Manosa
HOCH
HOCH
CH2 OH
Glucosa
CH2 OH
HCOH
CH2 OH
CH2 OH
Galactosa
Fructosa
HO
OH
H
C
CH2
HCOH
HO CH
HCOH
O
HO CH
HCOH
HCOH
HC
HC
CH 2OH
- Glucopiranosa
HC
CH
HC
CH
CH 2OH
- Glucopiranosa
72
Anillo de Haworth
CH2 OH
CH2 OH
O
OH
OH
HO
OH
H
OH
OH
OH
H
OH
- Glucopiranosa
- Glucopiranosa
La formacin del anillo representa una reaccin entre el grupo aldehdo y uno
de los alcoholes, dando lugar a un hemiacetal en cuya formacin no se libera
agua. En qumica orgnica si se libera H 2 O :
H O CH3
H O CH3
O CH3
R
HC
OCH3
H2O
73
Ejemplo: Fructosa
CH2 OH
C
HO CH
HCOH
HCOH
CH2 OH
HO
CH2 OH
HO H2C
OH
C
HO CH
HC
CH
HC
CH
HO CH
O
HC OH
HC OH
HC
HC
CH2 OH
H2C OH
Fructofuranosa
Fructofuranosa
Anillo de Haworth
O
OH
HO H2C
C
H
OH
C
OH
CH2 OH
OH
OH
CH2 OH
C
HO H2C
OH
CH2
HO CH
O
HCOH
HCOH
HCOH
HC
HC
Fructopiranosa
OH
Fructofuranosa
HO CH
HCOH
C
H
Fructofuranosa
HO
CH2 OH
HO H2C
HC
CH
HC
CH
Fructopiranosa
74
Anillo de Haworth
H
H
O
OH
CH2 OH
OH
HO
CH2 OH
HO
OH
HO
OH
OH
Fructopiranosa
Fructopiranosa
HCOH
HCOH
HCOH
H
C
HC OH
HC
O
HC
H
3 H 2O
HC
furfural
HC
OHCH
CH2 OH
pentosa
3 H 2O
HC
HC OH
HC OH
CH2 OH
CH2 OH
5 - Hidroximetil
furfural
Hexosa:
glucosa
O
C
HCOH
HOCH
CH 2OH
C
HOCH
HOCH
HOCH
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
CH2 OH
Glucosa
CH2 OH
Fructosa
CH2 OH
Manosa
75
HO
H
C
C O
HC OH
HO CH
CH3OCH
HCOH
+ CH 3 O H
- H2O
HO CH
HC OH
HCOH
HC OH
HC
CH2 OH
CH2 OH
Glucosa + Metanol
metil - glicosido
HCOH
HOCH
O
CH2 OH
HCOH
HOCH
CH2 OH
HOCH
HO CH
HOCH
HOCH
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
CH2 OH
CH2 OH
CH2 OH
CH2 OH
Glucosa
Sorbitol
Manosa
Manitol
76
CH2 OH
CH2 OH
HCOH
CH2 OH
HOCH
HOCH
HOCH
HOCH
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
CH2 OH
CH2 OH
Sorbitol
Fructosa
CH2 OH
Manitol
CO OH
HCOH
HO CH
HCOH
oxidantes
HO CH
dbiles
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
CH2 OH
CH2 OH
cido glucnico
Glucosa
O
C
HCOH
HO CH
HCOH
HCOH
CH2 OH
Glucosa
HCOH
oxidantes
fuertes
HO CH
CO OH
HCOH
HO CH
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
CO OH
CO OH
cido glucornico
cido glucosacrico
77
CH 2OPO 3H2
C
HO CH
HO CH
HCOH
HCOH
HCOH
HCOH
CH2 OH
Glucosa 1 fosfato
CH 2OPO 3H2
Fructosa 1 - 6 difosfato
HCNH2
HOCH
HCOH
HCOH
CH2 OH
Glucosamina
O
C
HCNH2
HOCH
HO CH
HCOH
CH2 OH
Galactosamina
78
CH2 OH
O
OH
H
OH
OH
OH
O
H
OH
OH
LACTOSA
CH2 OH
CH2 OH
O
OH
H
OH
H
O
OH
H
OH
H
H
OH
OH
SACAROSA
CH2 OH
O
H
H
OH
CH 2OH
OH
H
OH
O
H
OH
CH2 OH
OH
4
O
O
CH2
6
O
O
cadena
1-4
80
81
CH2
(CH 2)
cadena
hidrocarbonada
CH2
COOH
carboxilo
CH2
CH2
CH2
CH2
COOH
CH2
82
CH
CH2
CH
CH
linoleico
linolnico
araquidnico
R'
R'
C
H
trans
cis
Clasificacin:
A. Lpidos simples: Resultan de la esterificacin de un cido graso con un
alcohol que puede ser el glicerol (o propanotriol) o el colesterol.
Comprenden:
Grasas neutras o acilgliceroles
ceras
a. Grasas neutras o acilgliceroles: Son los componente principales de
los depsitos grasos. Qumicamente son steres de cidos grasos con el
glicerol (o propanotriol)
CH2 OH
CHOH
CH2 OH
C
OH
CH2 OH
CHOH
- H2 O
CH2
monoacilglicerol
cido graso
glicerol
CH2
O
CH
O
DAG
R''
O
R'
CH
O
CH2
R'
O
R
CH2
TAG
84
Los TAG constituyen la mayor parte de las grasas neutras naturales, sin
embargo en la naturaleza se encuentran tambin MAG y DAG.
Hay diferentes tipos de TAG:
1. Los que contienen una sola clase de cidos grasos que se
denominan TAG sencillos. Se nombran segn el cido graso
que contienen. Ejemplo: tripalmitina, triolena, etc.
2. Cuando contienen dos o ms cidos grasos diferentes que se
denominan TAG mixtos.
Propiedades:
Punto de fusin: Depende de los cidos grasos constituyentes. En
general, aumenta con el nmero y longitud de los cidos grasos saturados
componentes. Ejemplo: el punto de fusin es ms elevado si predomina el
cido esterico (saturado) sobre el oleico (no saturado).
Propiedades qumicas: Entre las propiedades qumicas de las grasas
tiene importancia:
1. Saponificacin: Haciendo hervir las grasas con cidos o lcalis se
logra su hidrlisis, es decir separacin de cidos grasos ms
glicerol con introduccin de tres molculas de agua. Cuando el
proceso se realiza en presencia de lcalis se denomina
saponificacin porque se forman jabones con las sales alcalinas de
los cidos grasos.
O
H2C
CH2 OH
R1
R1 COOK
O
HC
R2
KOH
CH OH
R2 COOK
O
H2C
CH2 OH
R3
R3 COOK
CH
CHI
CHI
3. Oxidacin: Por accin del aire, humedad, luz, oxgeno, etc. los cidos grasos no saturados se oxidan a nivel de las dobles ligaduras.
85
CH3
CH3
(CH 2)n
(CH 2)n
(CH 2)n
COOH
(CH 2)n
COOH
cera de abeja;
I. Fosfolpidos:
Fosfoglicridos
(ol = glicerol)
Fosfoesfingsidos
(ol = esfingosina)
cido fosfatdico
lecitinas
cefalinas
inositol fosftidos
esfingomielina
II. Glucolpidos:
1.- Cerebrsidos
2.- Ganglisidos
86
HOOC
H2C
O
CH OH
HOOC
CH2 OH
HO
HO
HO
HC
O
H2C
OH
OH
HO
CH2
CH2
CH3
CH3
CH2
CH2
NH2
HO
CH2
CH
COOH
NH2
etanol amina
serina
87
Resumiendo:
HO
CH2
CH2
N (CH 3)3
lecitinas
colina
HO
CH2
O
CH2
CH2
R'
HO
CH2
CH
COOH
NH2
R''
O
CH2
cefalinas
etanolamina
O
CH
NH 2
O X
OH
OH
OH
OH
C
H
C
OH
OH
fosfatidil
inositol
inositol
HO
CH2
CH
OH
fosfatil
glicerina
CH2 OH
glicerina
o glicerol
azcar
fosfatidil azucares
88
(CH 2)12
CH
CH
CH OH
CH
CH2
OH
NH2
Lo representaremos as:
Ac
Esfingosina
OH
NH2
OH
Ac. graso
89
Ac
Esfingosina
OH
NH2
Ejemplo:
H2
H2
H2
H2
H2
H2
CH
HC
CH
CH
III
I
naftaleno
II
fenantreno
antraceno
CH 3
12
11
1
2
10
HO
CH 3
16
14
15
5
4
17
13
7
6
Tiene C 3 un OH.
C 5 C 6 doble enlace.
CH
CH2
91
Irregularmente
cola
cola
cabeza
cola
Vitaminas liposolubles:
Las vitaminas son sustancias vitales que en pequeas cantidades se necesitan
para la funcin celular, y que algunas especies son incapaces de sintetizar y
deben obtenerla de fuentes exgenas.
Se dividen en dos clases: hidrosolubles y liposolubles.
Las vitaminas liposolubles son: A, E, K y D
Las tres primeras derivan de unidades isoprenoides; la ltima es un derivado
esteroide.
Vitamina A
Se encuentra solamente en los tejidos animales. Aunque las plantas carecen
de vitamina A tienen un grupo de sustancias llamadas carotenos que actan
como precursores de la vitamina A. Se encuentra en dos formas qumicas
principales: A 1 y A 2 ( retinol1 y retinol 2 ). Qumicamente son alcoholes que
contienen anillos alicclicos de seis tomos de carbono con cadenas laterales
constituidas por dos unidades de isopreno.
A 1 difiere de A 2 en que tiene un doble enlace ms.
A1
A2
H2
C
H2C
C
CH2
H3C C
C
H3C
C
CH
H3C C
C
H3C
C
CH3
CH
CH
CH
CH
A1
H2C
CH3
A2
CH
CH
CH
CH
CH3
CH3
CH
CH
CH3
CH3
CH
CH
CH2 OH
CH2 OH
H2
HO
H2
CH3
CH3
CH2
CH3
(CH 2
CH2
CH
CH2
)3
CH3
K1
CH3
CH2
CH
CH3
CH2
(CH 2
CH2
CH
CH2
)3
CH3
CH3
CH
CH3
CH
CH3
CH3
CH
CH3
HO
Ergosterol
Irradiacin
CH3
H
CH3
CH
CH3
CH
CH
H3C
CH
CH3
CH2
HO
95
CH3
C
NH 3
CH
CH3
COO
NH 3
H3C
CH
Leucina
CH3
Valina
COO
CH2
H3C
COO
NH 3
Hidrocarburos
alifticos
H
CH3
Isoleucina
CH2 CH
C
NH 3
CH 3
COO
+
H2
C
H2C
C
Prolina
H2C
COO
N
H
H
CH2
Fenilalanina
COO
NH 3
Anillo aromtico
H
C
Triptfano
CH2
CH
C
NH 3
COO
NH
H
Metionina
H3C
CH2
CH2
C
NH 3
COO
contiene azufre
96
H
Glicocola o glicina
COO
NH 3
H
HO
Serina
CH2
COO
NH 3
H
H3C
Treonina
CH
OH
COO
NH 3
H
Cistena
HS
CH2
COO
NH 3
H
Tirosina
HO
CH2
COO
NH 3
CH2
COO
NH 3
NH2
Glutamina
NH2
Asparagina
H
CH2
CH2
COO
NH 3
H
C
CH2
C
NH 3
COO
aminocidos cidos
O
Acido glutmico
H
C
CH2
CH2
C
NH 3
COO
97
H
+
NH3
Lisina
CH2
CH2
CH2 CH2
C
NH 3
COO
aminocidos bsicos
H
Arginina
NH2
NH
CH2
CH2 CH2
NH2
C
NH 3
COO
NH3
R
COO
98
Lo que ocurre es que el grupo amino cercano con carga positiva tiende a
repeler el protn del carboxilo (-COOH) de este modo aumenta su
tendencia a la disociacin. El grupo amino es una base ms dbil que el
grupo amino (- NH2 ) de los aminos alifticos.
- Propiedades pticas: Todos con excepcin de la glicocola hacen virar el
plano de la luz polarizada.
- Reacciones qumicas: Las reacciones caractersticas de los aminocidos
son los de sus grupos funcionales, es decir, las de los grupos alfa
(-COOH) y alfa (- NH2 ), as, como la de los grupos funcionales presentes
en las cadenas laterales. Los grupos alfa (-COOH) de los alfa (- NH2 )
experimentan reacciones orgnicas bien conocidas como por ej.:
formacin de sales con los metales, steres con los alcoholes y por
calentamiento con Ba OH 2 , se descarboxila dando aminas.
- Reacciones del grupo amino (- NH2 ): Este grupo puede reaccionar con
haluros o anhdridos de cidos. Una de las reacciones del grupo (- NH2 )
ms caractersticas es la reaccin de la ninhidrina que puede utilizarse
para valorar cuantitativamente los aminocidos. Los grupos alfa (- NH2 )
reaccionan reversiblemente con los aldehdos formando compuestos
llamados "bases de Schiff" que son muy dbiles.
H
R'
H
O
H2N
H
R
H2O +
R'
H
N
COOH
COOH
Bases de Schiff
O
+
OH
COOH
NH 2 O
H2O + R'
COOH
NH
Enlace peptdico
HO
H2C
NH2
Serina
H2 O
OH SERIL-glicil-tirosina
COOH
Glicina
Tirosima
C
-
NH3
C
H
O
R2
R'
H3N
NH3
COOH
CH2
CH2
Acido glutmico
C
O
O
R=
CH2
Acido Asprtico
O
R=
CH2
CH2
CH2
CH2
NH3
Lisina
Se tiene una larga cadena que sirve como eje alrededor del cual van
apareciendo distintas cadenas laterales con grupos funcionales distintos. Si
predomina el cido asprtico en las cadenas laterales aparecern numerosos
grupos carboxlicos y la cadena eje resultar rica en cargas negativas. Si
predomina la lisina la cadena eje resultar rica en cargas positivas.
Propiedades pticas de los pptidos
Se dijo que todos los aminocidos muestran actividad ptica, es decir, que
pueden desviar el plano de la luz polarizada al ser examinados en un
polarmetro. En el caso de los pptidos relativamente cortos la actividad ptica
total observada es una funcin aditiva aproximada de las actividades pticas de
los aminocidos componentes de ese pptido. En el caso de cadenas
peptdicas largas la rotacin total del plano de la luz polarizada no es ya una
funcin aditiva. La importancia de la actividad ptica se la ver luego al estudiar
las protenas. Para que una sustancia sea pticamente activa debe tener por lo
menos en su constitucin un C asimtrico, es decir, un C cuyas valencias estn
saturadas por tomos o grupos distintos.
Reacciones qumicas de los pptidos
Los grupos aminoterminales de los pptidos experimentan idnticas clases de
reacciones qumicas que los grupos alfa (- NH2 ) de los aminocidos libres tales
como la acilacin y las reacciones con el 2,4-dinitrofenilfluorobenzeno o con el
fenilisotiosianato. De modo similar el grupo (-COOH) terminal de un pptido
puede ser esterificado o reducido. Los diversos grupos R de los diferentes
restos aminocidos encontrados en pptidos dan visualmente las mismas
reacciones caractersticas y pruebas coloreadas que las descriptas para los
aminocidos libres. El resto amino cido terminal de los pptidos reaccionan
tambin cuantitativamente con la ninhidrina para formar derivados coloreados;
101
Albmina
PM 60.000
Hemoglobina
PM 68.000
Betaglobulina
PM 90.000
Otro factor que dificulta la determinacin del peso molecular es el hecho de que
existen protenas en forma de complejos de PM y estabilidad muy elevados,
por ej. la insulina, su unidad elemental est constituida por dos unidades de PM
6.000, pero en muchas circunstancias se presenta como una molcula de PM
36.000 por asociacin de unidades ms pequeas. A pesar de estos
inconvenientes hay buenas concordancias entre los distintos procedimientos.
Conformacin de las protenas: Cada tipo de molcula proteica, en su estado
nativo, posee una forma tridimensional caracterstica que es conocida como su
conformacin. Las protenas pueden clasificarse en dos clases principales
segn su conformacin: protenas fibrosas y protenas globulares.
Globulares
Fibrosas
conocen, casi todas son globulares, como lo son los anticuerpos, algunas
hormonas y muchas protenas que desempean una funcin de transporte
tales como la seroalbmina y la hemoglobina. Algunas protenas se hallan
situadas entre los tipos fibrosos y globulares, como las protenas fibrosas,
estn constituidas por largas estructuras y a semejanza de las protenas
globulares son solubles en las disoluciones acuosas salinas.
Funcin de las protenas: Las protenas pueden clasificarse tambin de
acuerdo a la funcin que desempean. Daremos a continuacin un esquema
reducido de clasificacin de las protenas segn su funcin:
a. Enzimas: ribonucleasa, tripsina, etc.
b. Protenas de reserva: ovoalbmina, casena, etc.
c. Protena transportadora: hemoglobina, seroalbmina, mioglobina, etc
d. Protenas contrctiles: miosina, actina, etc.
e. Protenas protectoras en la sangre de los vertebrados: anticuerpos,
complemento, fibringeno, etc.
f. Toxinas: toxina diftrica, veneno de serpientes, etc.
g. Hormonas: insulina, hormona del crecimiento, etc.
h. Protenas estructurales: colgeno, alfa-queratina, etc.
i. Mucoprotenas: secreciones mucosas.
Comportamiento en solucin de las protenas
Daremos una breve descripcin de los principios fsicos en que se basa el
comportamiento de las protenas en solucin. En estos principios se basan la
mayora de los mtodos destinados a determinar la forma y peso molecular de
las protenas y las tcnicas empleadas en su separacin y purificacin.
Propiedades cido, bsicas de las protenas: El comportamiento cidobsico de las protenas globulares nativas e intactas en disolucin est
determinado, en gran medida, por el nmero, relativamente grande del grupo
R ionizables de los diversos aminocidos; los grupos alfa amino y alfacarboxilo, situados en los extremos de las cadenas peptdicas, aportan una
contribucin muy pequea. De acuerdo a su composicin, las protenas pueden
comportarse como molculas anfteras es decir que pueden reaccionar como
cido o como base segn el pH del medio en que se encuentran disueltas. Es
as que si una protena est disuelta en un medio con un pH tal que sus cargas
positivas y negativas estn equilibradas, decimos que estamos en el punto
isoelctrico que es el pH en el cual no hay migracin de partculas proticas
hacia ninguno de los polos de una cuba electroltica. Ahora, si el pH es superior
que el punto isoelctrico una protena poseer una carga neta negativa y
migrar hacia el nodo de la cuba electroltica y esa carga negativa aumentar
en magnitud a medida que aumente el pH. Anlogamente a cualquier pH por
debajo del punto isoelctrico, la protena poseer una carga neta positiva y se
mover hacia el ctodo. Tanto la curva de valoracin como el pH isoelctrico
de la protena pueden cambiar significativamente en presencia de sales
104
en que se encuentran.
Efecto de la temperatura: Dentro de un intervalo limitado, entre 0 C y 40 C,
la mayor parte de las protenas son ms solubles que al aumentar la
temperatura pero con algunas excepciones. Por encima de 40 C a 50 C, la
mayor parte de las protenas son ms inestables cada vez y comienzan a
desnaturalizarse, por lo comn con prdida de solubilidad en la zona de pH
neutro.
Estructura de las protenas: Cada protena se caracteriza por tener no solo
una proporcin definida de aminocidos sino tambin una secuencia u orden
definido y caracterstico. Esta secuencia de aminocidos en orden definido y
caracterstico para cada protena se denomina estructura primaria de la
protena y est regulada genticamente. O sea que resumiendo diremos que la
estructura primaria de una protena est dada por la secuencia y proporcin
caracterstica de sus aminocidos constituyentes.
Estructura secundaria: Cada cadena polipeptdica se encuentra como
enrollada sobre s misma, formando un espiral, denominada alfa-hlice. Esta
estructura se denomina estructura secundaria de las protenas.
Para estudiar la posicin de los tomos de una molcula en el espacio se utiliza
el mtodo de difraccin de rayos X. La difraccin consiste en hacer incidir un
haz de rayos X sobre un cristal, es este caso de una protena y recoger los
haces difractados sobre una placa fotogrfica. Cada mancha que se observa
en la placa corresponde a la difraccin de los planos del cristal. Con este
estudio se dedujo la estructura tridimensional de la molcula y en particular la
estructura del enlace peptdico.
A qu conclusin llegaron?
a. Que la unin C-N del enlace peptdico es ms corta que la mayor parte
de los enlaces C-N sencillos y que posee algn carcter de doble
enlace y no puede girar libremente.
R
O
R
H
C
C
H
enlace
peptdico
H
C
C
R
H
C
Lugares de giro
106
R
C
H
O
C
N
trans
trans
C
O
H
R
C
lugares
de giro
C
N
C
H
R
C
C
R
Enlace
peptdico
cadena.
Por ejemplo cuando:
R. es pequeo y no tiene carga, la cadena tiende a formar
espontneamente hlice alfa.
R. est cargado positivamente, al hallarse muy prximos se repelen
con tanta fuerza que superan la tendencia a formar enlace hidrgeno
intracatenario y existen como arrollamiento al azar, es decir sin orden.
Lo mismo ocurre cuando el grupo R se encuentra cargado negativamente. Si el
grupo R es voluminoso ofrece un impedimento estrico para la formacin de la
hlice.
Propiedades pticas de los enrollamientos helicoidales
Cuando la longitud de la cadena polipeptdica es hasta 7 aminocidos, su
rotacin ptica es una funcin aditiva de las rotaciones de los aminocidos
constituyentes. En cambio en los polipeptdicos largos la rotacin ptica es ms
dextrorotatoria que la suma de las rotaciones individuales. Por qu? Porque
se suman las rotaciones individuales ms la del enrollamiento helicoidal que
puede existir en dos sentidos, enrollado hacia la derecha o hacia la izquierda.
Estructura terciaria de las protenas
En las protenas globulares las cadenas peptdicas se encuentran plegadas
sobre s mismas, a modo de un ovillo constituyendo la estructura terciaria, de
las protenas. Fuerzas que estabilizan la estructura terciaria:
a). Puentes hidrgenos:
1.- intracadena, en las alfa hlices;
2.- enlaces hidrgeno intercadena como ocurre en la conformacin
beta.
b). Uniones hidrofbicas: en las protenas existen con frecuencia
aminocidos, con cadenas laterales (grupos R) no polares, es decir,
con mnima afinidad por el H2O , por lo que tienden a ser repelidas de la
fase acuosa y a agruparse y adherirse unos con otros. Se piensa que
las fuerzas hidrofbicas inducen en buena medida los plegamientos de
las cadenas que son mantenidas por los enlaces H2
c). Enlaces disulfuros - S - S - : Las uniones disulfuro se producen entre
residuos de cistena, que al oxidarse dejan unidos los S entre s. Las
uniones S - S - S desempean un papel importante en la estructura
terciaria, tanto en la unin de cadenas polipeptdicas distintas, como de
zonas separadas de una misma cadena y que forma plegamiento
108
repliegue
desnaturalizacin
Forma nativa
110
TEMA X: Enzimas
Definicin: Las enzimas son protenas con actividad biolgica que actan
como catalizadores con respecto al sustrato y a la reaccin que catalizan en
forma especfica. Pertenecen a la clase de molculas proteicas ms numerosas
y especializadas.
Protenas:
1.- Enzimas
2.- Hormonas
O sea que las enzimas son protenas de accin cataltica con un elevado grado
de especificidad. La primera enzima aislada en forma cristalina fue la "ureasa"
por Summer en el ao 1926, quin demostr que los cristales se hallaban
constituidos por protenas. En la actualidad se han identificado un millar de
enzimas diferentes. De todas stas, unas se aislaron en forma pura y
homognea y otras 150 se aislaron en forma cristalina.
Clasificacin
Muchas enzimas han sido designadas aadiendo al nombre del sustrato el
sufijo asa.
Sustrato: Es la molcula sobre la cual la enzima ejerce su accin cataltica.
Ejemplo:
UREA
sustrato
ureasa
AMONIACO
ANHIDRIDO CARBONICO
arginasa
ARGININA
UREA
E
ORNITINA
productos
111
GLUCOSA
GLUCOSA-6-FOSFATO
ADP
Cofactores enzimticos:
A semejanza de otras protenas, las enzimas pueden clasificarse basndose en
su composicin qumica, as:
Enzima simple: Que por hidrlisis dan aminocidos
Enzimas conjugadas: Que por hidrlisis dan aminocidos y otros
compuestos no proteicos
Desde el punto de vista funcional algunas enzimas dependen para su actividad
solamente de su estructura proteica, mientras que otras necesitan adems para
ser activas estructuras no proteicas o COFACTORES. El cofactor puede ser:
1. Ion metlico
2. Molculas orgnicas complejas (coenzimas)
Los cofactores son generalmente estables al calor mientras que muchas
protenas enzimticas son termolbiles.
El complejo ENZIMA COFACTOR se llama HOLOENZIMA.
Cuando el cofactor se separa, la protena restante que es inactiva se llama
APOENZIMA.
Las coenzimas unidas estrechamente a la enzima se llaman GRUPOS
PROSTETICOS.
Cintica Qumica
Antes de estudiar en detalle la catlisis enzimtica vamos a ver algunos
trminos que se deben conocer en cuanto a reacciones qumicas. Si en una
reaccin nos basamos en el nmero de molculas que deben reaccionar para
formar los productos de la reaccin hablaremos de reacciones:
a. Monomoleculares
b. Bimoleculares
112
c. Trimoleculares
Si clasificamos a la reaccin qumica sobre una base cintica o sea por el
orden de reaccin tendremos:
a. Reacciones de orden cero
b. Reacciones de primer orden
c. Reacciones de segundo orden
d. Reacciones de tercer orden
De esto depende la influencia que tengan sobre la velocidad de la reaccin, la
concentracin de las sustancias reaccionantes en un conjunto determinado de
condiciones como por ejemplo: pH, temperatura, etc.
Reacciones de primer orden: Son aquellas que ocurren a una velocidad
exactamente proporcional a la concentracin de un reaccionante. Ej.
A
P (monomolecular)
P (bimolecular)
B +
P (trimolecular)
P
Estado de Transicin
Estado Libre
No catalizada
Catalizada
Estado inicial
Curso de la reaccin
113
ES
K2
Km
114
S . E total
ES
Km
Km
E libre
E total
S . E total
ES
ES
ES
ES
ES
Se distribuye:
Km
E total
ES
Km
ES
ES
E total
ES
ES
ES
E total
2
Entonces
Km
Km = S
E total
E total
2
o sea
Km
E total 1
1
E total
2
cuando V max es 1 .
2
1
En sntesis Km = S si la
de la E est libre y la otra 1 forma complejo. Si
2
2
graficamos:
115
II
Vmax
E + S
ES
K3
P + E
V/2
S
La fase II se origina:
1. Si el S se termina
2. Si se forman productos que inhiben la reaccin
3. Por desnaturalizacin de la E
Ecuacin de Michaelis Menten: partiendo de la relacin (1) que es la
siguiente:
S . E total
ES
Km
Km
Km
S . E total
ES
S
ES
S ES
ES
S . E total
ES
y luego
Km
S . E total
ES
ES
S . E total
Km S
ES
K3
P + E
[ES]
v K 3 ES
si despejo el valor de ES ES
v
K3
Reemplazo en (2):
v
K3
S . E total
Km S
v K3
S . E total
Km S
O sea:
v K3 E
V S
Km S
1
v
1
v
V S
Km S
Km
V S
S
V S
1
v
Km S
V S
Km
V
1
S
1
V
S
S
1
v
Km 1
V S
1
V
1
v
Km
v
Km 1
V S
Km 1
V S
1
S
1
v
-
1
V
1
V
1
Km
1
S
Km
Vmax.
Segundo, indica cul es el sustrato preferente de una enzima cuya
especificidad se amplia.
117
E2
E3
D
118
10
11
12
13
pH
40 C
orden cero
1 orden
[S]
En las reacciones enzimticas llegamos a una Vmax donde a pesar de aumentar la concentracin de sustrato la velocidad no aumenta , es constante. O
sea que se transforma en una reaccin de orden cero donde la velocidad es
independiente de la concentracin del sustrato. En una palabra, la enzima se
satura de sustrato.
Mecanismo de las reacciones enzimticas: En la formacin del complejo E-S
intervienen diversas clases de uniones. A veces seran fuerzas inicas, otros
enlaces hidrfobos o a veces puentes hidrgeno. Cuando el complejo E-S da
origen a los productos y se regenera la enzima libre, quiere decir que algunos
de estos enlaces se han roto.
E + S
ES
E + P
A
E1
C
E2
D
E3
E
E4
P
En
E2
E5
E3
E4
E6
E7
membrana
E1
E2
E3
como
coenzima
al
NAD
(nicotinamida-adenina-
B4
(1)
A)
B3
(2)
A)
B2
(3)
A)
B1
(4)
A)
B0
(5)
122
protenas
(mononucletidos)n
123
CH
4
5 CH
N 3
CH
6
5C
N 1
CH
HC
N
7
8 CH
+
HC 2
6 CH
HC 2
HC
4C
3
9
N
H
N
H
pirimidina
purina
imidazol
CH
4
HC
CH
HC
CH
HC
CH
CH
CH
NH2
HN
CH
CH
HN
CH
CH
CH
CH3
O
N
H
N
H
N
H
Uracilo
Citosina
Timina
124
NH2
C
HN
C
CH
CH
HC
H2N
N
N
H
Adenina
N
H
Guanina
O
C
H
CH2
C OH
C OH
C OH
C OH
C OH
CH2 OH
CH2 OH
D-desoxiribosa
D-ribosa
Azcar
cido fosfrico
Nucletido
Nuclesido
125
NH2
N1
N1
adenina
HC
CH
HC
2
3
CH
H
O
HOH2C
ribosa
OH
OH
OH
HOH2C
C
OH
OH
C
4
HN 3
CH
C2
CH
HN 3
CH
C2
CH
uracilo
N
H
O
HOH2C
ribosa
OH
OH
OH
O
HOH2C
C
OH
OH
126
DESOXIBONUCLEOSIDOS
adenosina
Desoxiadenosina
guanosina
Desoxiguanosina
citidina
Desoxicitidina
Uridina
Desoxitimidina
H2C
OH
Base nitrogenada
Base
OH
OH
Azcar
H3PO4
nucletido
127
cido uridin
DESOXIRIBONUCLEOTIDOS
cido desoxiuridin
O
O
HO
P
OH
P
OH
P
OH
H2C
Base
OH
OH
128
HO
O
-
O
O
H2C
Base
OH
OH
estructura
general
Ribonucletidos
Base
Abreviaturas
Adenina
AMP
ADP
ATP
Guanina
GMP
GDP
GTP
Citosina
CMP
CDP
CTP
Uracilo
UMP
UDP
UTP
Desoxiribonucletidos:
Base
Abreviaturas
Adenina
dAMP dADP
Guanina
Citosina
Timina
dTMP
dTDP
dATP
dTTP
Los grupos fosfato de los nucletidos difosfato y trifosfato (NDP y NTP) forman
complejos con cationes divalentes tales como Mg
y Ca . El segundo y
tercer grupo fosfato puede ser hidrolizado selectivamente por enzimas
especficas que no escinden otros enlaces
129
Funciones
Desempean importantes funciones:
a. El ATP es el portador primario de energa en la clula; transfiere
grupos fosfato de contenido energtico elevado desde los lugares
que producen energa hacia los que la necesitan. Despus de la
defosforilacin del ATP, el ADP y el AMP que se forman son
refosforilados a ATP durante la respiracin.
b. La segunda funcin principal de los NTP y NDP es servir de
coenzimas transportadoras de molculas. As el difosfato de uridina
(UDP) es un transportador especfico de los restos de azcar en la
sntesis de polisacridos. El CDP colina es un dador de colina en la
biosntesis de fosfoglicridos que contienen colina.
c. La tercera funcin importante de los NTP es actuar como precursores
ricos en energa de las unidades mononucletidas, en la sntesis del
ADN y ARN.
Otros mononucletidos
Existe cierto nmero de otros mononucletidos importantes que contienen a
veces, bases nitrogenadas distintas de las que se encuentran en los cidos
nucleicos. La nicotinamida mononucletido (NMN); la flavin-mononucletido
(FMN) y la coenzima A (CoA) poseen una base nitrogenada unida, mediante
enlace beta glucosdica a la posicin 1 de la ribosa y estn fosforiladas en
posicin 5.
Coenzima A
Contiene:
Adenina unida mediante enlace Beta-glicosdico;
En posicin 5 de la ribosa hay un grupo pirofosfato que se halla
esterificado al cido pantotnico (que es vitamina del complejo B);
El cido pantotnico esta a su vez unido a un Beta-amino etanotiol.
Funcin: Transportadora de grupos acetilo y acilo graso que esterifican al
grupo tiol.
O
CH2
O
Adenina
HO
HO
OH
OH
cido pantotnico
NH
CH2
CH2
SH
130
OH
O
HO
O CH2
OH
OH
CH2
HC
OH
Ribloflavina
HC
OH
HC
OH
Ribitol
CH2
O
HO
OH
Ribloflavina
CH2
O
Base
O
C
HO
OH
O
5' CH2
O
Base
OH
OH
CH2
O
Base
HO
OH
OH
HO
O
5' CH2
O
Base
OH
OH
132
O
Base
H
HO
H
H
3'
O
P
OH
O
O
5' CH2
O
Base
H
H
H
3'
O
HO
OH
O
O
5' CH2
O
Base
H
H
O
OH
133
Pentosa
- T ---------------------H-------------------- Adenina
Fosfato
Fosfato
Pentosa
- G ---------------------H-------------------- Citosina
- Pentosa
Fosfato
Fosfato
Pentosa
- Pentosa
- A ---------------------H-------------------- Timina
- Pentosa
cadenas
polinucletidas
135
BIBLIOGRAFIA
136
secuencias anablicas puede utilizarse esa energa del enlace fosfato. Esta fase del
metabolismo se denomina acoplamiento energtico. El metabolismo intermedio y el
acoplamiento de energa estn obligatoriamente interconectados y son
interdependientes. Por ello, cuando examinamos los esquemas metablicos deberemos
analizar:
1. Las etapas de reaccin por las que la estructura covalente del precursor se
altera para formar el producto.
2. Los cambios de energa qumica que acompaan a esta conversin.
Transformaciones catablicas, anablicas y anfiblicas
La degradacin enzimtica de cada uno de los principales elementos nutritivos (hidratos
de carbono, lpidos y protenas) tiene lugar a travs de cierto nmero de reacciones
enzimticas consecutivas que se desarrollan en tres fases:
Fase I: En esta fase las grandes molculas de los elementos nutritivos se
degradan hasta los principales componentes. Los polisacridos son
degradados a pentosas o hexosas, los lpidos a cidos grasos, glicerina y
otros componentes, y las protenas a sus veinte aminocidos constitutivos.
Fase II: Los numerosos productos distintos de la Fase I son recogidos y
convertidos en un nmero pequeo de molculas ms sencillas. As, las
hexosas, las pentosas y la glicerina se degradan en el azcar fosforilado de
tres tomos de carbono, el gliceraldehdo-3-fosfato y despus hasta un
compuesto sencillo de dos tomos de carbono, la acetil-coenzima A. Los
aminocidos diferentes son tambin degradados a: acetil-coenzima A, alfacetoglutarato, succinato, fumarato y oxalacetato.
Fase III: Los productos formados en la fase II pasan a la fase III que es el
camino comn final en el cual se oxidan a CO2.
El anabolismo tiene lugar tambin en tres fases, comenzando por las pequeas
molculas originadas en la tercera fase del catabolismo. Por ejemplo, la sntesis
proteica comienza en La Fase III, a partir de los alfa-cetocidos que son los precursores
de los aminocidos. En la Fase II los alfa-cetocidos son aminados por donadores de
grupos aminos y se forman los alfa-aminocidos y en la Fase I se renen los
aminocidos para producir cadenas peptdicas.
Aunque los caminos del catabolismo y el anabolismo no son idnticos la Fase III
constituye un camino central accesible a ambos. Esta senda central, que recibe el
nombre de anfiblica, desempea una doble funcin (amphi: ambos). La ruta anfiblica
puede utilizarse catablicamente para lograr la degradacin completa de pequeas
molculas producidas en la Fase II del catabolismo o puede utilizarse anablicamente
como precursora de molculas para la Fase II del anabolismo.
Lpidos
Polisacridos
cidos grasos
glicerina
Hexosas
Pentosas
Protenas
Fase I
Aminocidos
Gliceraldehdo
3-fosfato
Fase II
Fosfoenol
piruvato
Piruvato
Acetil - C o A
citrato
oxalacetato
Fase III
isocitrato
malato
Alfa - cetoglutarato
Fumarato
Ciclo de los
cidos tricarboxilos
succinato
CO 2
LA ENERGA EN LA CLULA
Las molculas orgnicas complejas, tales como la glucosa contienen mucha energa
potencial a causa de su elevado grado de ordenacin estructural; poseen una entropa
relativamente pequea. Cuando la molcula de glucosa se oxida y forma seis molculas
de CO 2 y seis de H2 O , sus tomos experimentan un aumento en el desorden. Como
resultado de esta transformacin, la molcula de glucosa experimenta una prdida de
energa libre que es energa til y capaz de realizar trabajo. La energa libre se conserva,
como energa qumica, especficamente como ATP. Dado que el ATP formado puede
difundirse hacia aquellos lugares en la clula en que se necesite su energa, constituye
una forma de transportar la energa. La energa qumica del ATP se libera despus,
durante la transferencia de su grupo o grupos fosfatos terminales, a determinadas
molculas de un aceptor especfico, que adquiere un nivel superior de energa y puede
realizar trabajo. Un segundo camino para transportar la energa qumica de las
reacciones de xido-reduccin del catabolismo a las reacciones anablicas, que
necesita de energa, es en forma de electrones. En las sntesis de algunas biomolculas
ricas en hidrgeno, tales como los cidos grasos y el colesterol, se requieren electrones
e hidrgeno para la reduccin de los enlaces dobles a simples. En La clula los
El ATP fue aislado por primera vez, en 1.929 por Fiske y Subbarow, de los extractos
cidos de msculo.
Su estructura se dedujo algunos aos despus, mediante experimentos de degradacin
y fue definitivamente confirmada por sntesis qumica total realizada por Todd y sus
colegas en 1948. Desde los inicios del descubrimiento, se sospech que el ATP
desempeaba un papel en la transferencia de energa celular pero recin en 1939-1941
Lipmann propuso que actuaba como medio principal de transferencia de la energa
qumica en la clula.
El ATP, el ADP y el AMP no son sustancias que existen solo en trazas; la suma de sus
concentraciones en la fase acuosa de los diversos tipos de clulas intactas oscila entre 2
y 15 mM. La concentracin de ATP es por lo comn, muy superior a la suma de las otras
dos concentraciones del AMP, habitualmente es la menor de las tres.
Estos nucletidos estn presentes no slo en el citoplasma, sino tambin en organelas
tales como mitocondrias y ncleo. La compartimentacin intracelular del sistema ATP
constituye una caracterstica importante en la regulacin celular del metabolismo.
A pH 7,0 tanto ATP como ADP son aniones muy cargados, el ATP posee cuatro
protones ionizables en su grupo de cido trifosfrico. Tres de los protones poseen
valores de pK (K = constante de disociacin) bajo entre 2 y3; por lo tanto a pH 7,0 estn
completamente disociados; el cuarto protn tiene un pK' de 6,5; por consiguiente a pH
7,0 se halla disociado en un 75%.
NH2
N
N
O
HO
O
O
OH
P
OH
ATP
O
OH 2
OH
H
H
H
OH
El ADP posee tres protones ionizables, dos de ellos estn completamente disociados a
pH 7,0 y el tercero que posee un pK' de 7,2 a pH 7,0 se halla disociado alrededor del
39%.
La elevada concentracin de cargas negativas en torno al grupo trifosfato del ATP
constituye un factor importante en su naturaleza de compuesto de alto contenido
energtico.
En la clula intacta existen muy pocas cantidades de ATP y de ADP en forma de
aniones libres, se hallan presentes en su mayor parte en forma de complejos Mg ATP y
Mg ADP a causa de la gran afinidad de los grupos pirofosfato para enlazar cationes
divalentes y de la elevada concentracin de in Mg en el fluido intracelular. La afinidad
del ATP por el Mg es unas diez veces mayor que la del ADP.
mg
O
Adenina
Ribosa
O
O
O
O
mg-ATP
mg
O
Adenina
Ribosa
O
O
mg-ADP
b. Entorno: Toda materia del universo, aparte del sistema que se considera. En
el transcurso del proceso en estudio la energa puede pasar del sistema al
entorno, o viceversa.
c. Estado inicial: Es el contenido de energa del sistema y del entorno, al iniciar
el proceso que se analiza.
d. Estado final: Contenido de energa de sistema y entorno una vez que se ha
alcanzado el equilibrio.
El contenido de energa de cada estado es una funcin de diversas magnitudes
medibles (temperatura, presin, volumen, masa, etc.) que se formulan mediante una
ecuacin de estado. A partir de las medidas de los cambios de contenido de energa del
sistema y el entorno, a medida que el sistema evoluciona desde su estado inicial hasta
su estado final, puede realizarse un balance de energa.
(Bloques de cobre)
caliente
frio
Estado inicial
Estado de equilibrio
( S) disminuye
irreversible
espontneo
exotrmico
reversible
endotrmico
S disminuye (orden)
S aumenta
H - T. S
(1)
PV
(2)
E - T. S
G T. S
reordenamos la ecuacin:
cC + dD
(3)
G RT ln
C .D
A .B
(4)
0 G RT ln
C .D
A .B
(5)
De donde:
RT ln
C .D
A .B
(6)
K' eq
C .D
A .B
(7 )
RT ln (K' eq)
O bien:
(8)
Esta ecuacin nos muestra que G , la variacin de energa libre estndar de una
reaccin qumica, puede calcularse a partir de su constante de equilibrio. La G
constituye, por lo tanto, una constante termodinmica para una reaccin qumica dada.
Puede definirse de otro modo, que indica claramente su verdadero significado. La
variacin de energa libre estndar de una reaccin constituye, en realidad, la diferencia
existente entre la energa libre estndar de los reactivos y la energa libre estndar de
los productos, hallndose cada trmino ajustado a la estequiometra de la ecuacin de
reaccin:
G
G productos
G reaccionantes
G (c G C d G D ) (a G A b G B )
La energa libre estndar de un compuesto constituye la medida de la cantidad total de
energa libre que puede proporcionar por descomposicin completa.
Es importante comprender la diferencia que hay entre G , que es la variacin de
energa libre estndar, y G que es la variacin de energa libre medida o real. Esta
diferencia puede explicarse mejor utilizando una analoga. G es un valor constante
para una determinada reaccin a una temperatura tambin determinada.
Por otra parte, G vara con las concentraciones de los reaccionantes y de los
productos.
El valor de G nicamente es igual al de G cuando todos los reactivos y todos los
productos estn presentes a concentracin 1,0M.
El valor de G es el que determina si una reaccin qumica ocurrir en la direccin
escrita, partiendo de unas concentraciones de reaccionantes determinadas.
Recurdese que una reaccin qumica solamente ocurrir si G es negativo, es decir, si
la energa libre del sistema disminuye.
Las reacciones qumicas con un G negativo reciben el nombre de exergnicas; se
realizan espontneamente en la direccin en que estn escritas. Si recordamos el
ejemplo de los bloques:
ordenado
G disminuye, es negativo
exergnica o exotrmica
espontnea
irreversible
desordenado
10
Las reacciones con un cambio de energa libre estndar positivo reciben el nombre
de endergnicas o endotrmicas, no se realizan de modo espontneo en la direccin en
que se escriben. Volviendo al ejemplo:
desordenado
G aumenta, es postivo
endergnica o endotrmica
no es espontnea
reversible
ordenado
glucosa_6_fosfato
R T ln(K' eq)
1745 cal
1.745 Kcal
H2O
ADP
fosfato
(10)
11
glucosa
ADP
glucosa_6_fosfato
K'eq = 661
G = - 4.00 kcal
(11)
H2O
glucosa
fosfato Pi
K'eq = 171
G = - 3.30 kcal
(12)
glucosa
ADP
glucosa_6_fosfato
H2O
glucosa
fosfato Pi
H2O
ADP
fosfato
fosfatasa
glucosa_6_fosfato
ATP
Puesto que los valores de G de las dos reacciones son aditivas, la G de la hidrlisis
del ATP puede calcularse a partir de ellos:
G G
G - 4.00 (-3.30) - 7.30 kcal
Es importante hacer notar que este valor est basado en que pH = 7,0; T = 37 C, en
presencia de exceso de ion Mg y concentraciones 1,0 M de los reaccionantes y de los
productos. El grupo fosfato terminal del ADP tambin posee una G de hidrlisis
relativamente grande. Es igual a -7,30 kcal.
ADP
H2O
AMP
Pi
G -7.3 kcal
Sin embargo el nico grupo fosfato del AMP tiene un valor mucho menor:
12
AMP
H2O
adenosina
G -3.40 kcal
Pi
Lo que sucede es que los enlaces entre grupos fosfatos adyacentes son enlaces del tipo
de anhdrido, mientras que el enlace entre el fosfato y la ribosa en el AMP es un enlace
ster.
COMPUESTOS CON ENLACES FOSFATO DE ALTO Y DE BAJO NIVEL
ENERGTICO
En la escala termodinmica de G , el ATP es el nico que posee un valor de G ,
intermedio.
Daremos el G de algunos compuestos fosforilados.
G (kcal)
Fosfoenol piruvato
-14.80
- 11.80
- 10.30
-10,10
- 7.70
- 7.30
ATP
Glucosa-1- fosfato
...
- 5.00
Fructosa-6-fosfato
Glucosa-6-fosfato
Gliceril-1-fosfato
...
...
- 3.80
- 3.30
- 2.20
ATP
ATP
O sea que la funcin del sistema ATP-ADP, consiste en servir como transportador
obligatorio intermedio de grupos fosfato desde los compuestos con enlaces fosfato de
elevado nivel energtico, situados por encima del ATP en la escala termodinmica,
hasta las molculas aceptoras que forman compuestos con enlaces fosfato de bajo nivel
energtico situados en la escala por debajo del ATP.
COMPUESTOS FOSFATO DE ALTO NIVEL ENERGETICO
Hay dos clases de compuestos fosforilados que poseen una G de hidrlisis ms
negativa que la del ATP:
1. Los compuestos fosfato que se forman durante la ruptura enzimtica de
molculas combustibles.
2. Los compuestos fosfato utilizados como almacenadores de la energa del enlace
13
fosfato.
Los dos miembros ms importantes de la primera clase son el 1-3 difosfoglicerato y
el fosfoenol piruvato, los cuales se forman durante la fermentacin anaerobia de la
glucosa (gluclisis).
1-3 difosfoglicerato
ADP
3 fosfoglicerato
ATP
H 2O
ADP
G -4.5 kcal
ATP
G -7.3 kcal
Pi
Total
-11.80 kcal
Los compuestos fosfato de elevado nivel energtico, que actan como reservorio de la
energa de enlaces fosfato, reciben con frecuencia el nombre de fosfgenos. Los dos
fosfgenos principales son la fosfocreatina hallada en muchos vertebrados, y la
fosfoarginina, presente en muchos invertebrados. Ambos se forman a partir de la
creatina y de la arginina por transferencia de grupos fosfato desde el ATP en reacciones
catalizadas por la creatin-fosfoquinasa y la arginin-fosfoquinasa, respectivamente.
Ambas reacciones son reversibles pero el equilibrio se halla desplazado hacia la
formacin de ATP.
fosfocreatina
ADP
creatina
ATP
glicerina
ADP
glicerol_3_fosfato
G -4.5 kcal
ATP
D-glucosa
ADP
D.glucosa_6_fosfato
G -7.3 kcal
Fosfoenol piruvato
Dadores de P de alta energa
P
Reservorio de fosfocreatina
1-3 difosfoglicerato
P
ATP
Aceptores de P
de baja energa
P
P
Glucosa_6_fosfato
Glicerol_3_fosfato
14
ADP
piruvato -
piruvato
ATP
quinasa
D-glucosa
ADP
D-glucosa_6_fosfato
D-glucosa
piruvato
D-glucosa_6_fosfato
15
UTP
ATP
GTP
ATP
CTP
ATP
CTP
GTP
UTP
Polisacridos
Protenas
Lpidos
ARN
ATP
P
d ATP
d GTP
d TTP
d CTP
ADN
16
ATP
PPi
H2O
2 Pi
Esta hidrlisis secundaria del pirofosfato constituye una etapa valiosa de liberacin de
energa, la cual se utiliza para asegurar que ciertas reacciones biosintticas se realicen
por completo.
El Pi formado se utiliza para la regeneracin del ATP a partir de ADP. La adenilatoquinasa cataliza la refosforilacin del AMP a ADP.
ATP
AMP
ADP
ADP
17
Aerobios
glucosa
sin O2
glucosa
fermentacin
productos de la fermentacin
fermentacin
sin O2
productos de la fermentacin
con CO 2
CO2 + H2O
18
2. Glucosa
C
triosas
C
triosas
C
cido
lctico
cido
lctico
CH3
CH3
CH OH
CH OH
COOH
COOH
etanol
etanol
CH3
CH3
CH2 OH
CH2 OH
CO 2
CO 2
En estas reacciones tenemos que hablar de las reacciones de xido reduccin que se
producen en todo organismo donde el agente oxidante recibe los electrones y el agente
reductor entrega electrones.
En este caso de la fermentacin alcohlica el etanol es una molcula relativamente
reducida rica en H 2 , pobre en O 2 . La molcula de CO 2 es relativamente oxidada, pobre
en H 2 .
En el caso de la fermentacin homolctica el grupo metilo se halla ms reducido que el
grupo carbonilo. Veamos la reaccin completa:
cido lctico
1. Glucosa
O
C
H
CH3
HC OH
HO C
2 Pi
+ 2 ADP
CH OH
HC OH
+ 2 ATP + 2 H2O
COOH
HC OH
CH2 OH
2. Glucosa + 2 Pi + 2 ADP
2 CH3
CH2 OH
Etanol
19
ETAPA DE LA GLUCOLISIS:
La gluclisis es catalizada por la accin de un grupo de 11 enzimas. Se cree que estn
localizadas en la porcin soluble del citoplasma. Se pueden considerar dos etapas o
fases. En la primera fase la glucosa se fosforila y se escinde pare formar gliceraldehdo
3 P; y en la segunda fase ste se convierte en cido lctico.
LA FASE I: Constituye un proceso preparativo o de congregacin en el que cierto
nmero de hexosas penetran en el esquema, despus de fosforilarse a expensas
del ATP, y dan un producto comn, el gliceraldehdo 3 P.
LA FASE II: Es la ruta comn para todos los azcares, se produce la fosforilacin
del ADP y se llevan a cabo las reacciones de xido reduccin, obtenindose el
lactato.
En este proceso hay tres tipos de transformaciones interconectadas.
1.La ruta de los tomos de carbono: o sea degradacin de la glucosa para
formar cido lctico.
2.La ruta del fosfato: o sea que el Pi (fsforo inorgnico) se transforma en P
del ATP.
3.-
20
almidn
glucogeno
glucosa
ATP
Pi
glucosa-1-P
FASE I
Congregacin de azcares sencillos y
su
conversin
en
fosfato
ADP
galactosa
manosa
pentosa
glucosa-6-P
de
fructosa-6-P
ATP
ADP
fructosa-1-6-di P
glicealdehdo-3-P (2)
2 NAD+
Pi
1,3 difosfoglicerato (2)
FASE II
2 NADH
2 ADP
2 ATP
3 difosfoglicerato (2)
2 difosfoglicerato (2)
fosfoenolpiruvato (2)
2 ADP
2 ATP
piruvato (2)
2 NAD+
2 lactato
21
ATP
glucosa
Mg++
ADP
glucosa-6-P
4 kcal
CH2 OH
OPO 3=
O
O
H
H
+
OH
ATP
ADP
OH
OH
OH
OH
OH
H
OH
glucosa
OH
glucosa-6-fosfato
2. Conversin de glucosa-6-P
fosfoglucoisomerasa.
CH2
G -4 kcal
H
H
OPO 3=
CH2
O
H
fructosa-6-P:
H
OH
CH2
OH
OH
la
OH
H
glucosa-6-P
OH
OH
OH
por
OPO 3=
O
H
OH
Catalizada
0.4 kcal
(reaccin reversible)
OH
fructosa-6-P
OPO 3=
O
CH2
CH2
+
OH
OH
H
OH
ATP
CH2
ADP
OH
OPO 3=
G -3.4 kcal
OH
OPO 3=
O
OH
OH
OH
H
(reaccin irreversible)
OH
22
CH2
2.
OPO 3=
H
O
1. CH2
OPO 3=
4.
3. HO CH
2. C
G
O
5.73 kcal
5. H COH
4. H COH
3. CH2
6.
OH
CH2
OPO 3=
5. H COH
6.
CH2
OPO 3=
fructosa 1-6-di P
(cadena abierta)
gliceraldehdo 3-P
fosfato de
dihidroxiacetona
C
H
G 1.83 kcal
C
CH2 OH
H C OH
CH2 OPO 3=
2 gliceraldehdo-3-P + 2 NAD+ + 2 Pi
O
C
PO 3=
H
C
HC
O
+ NAD+ + Pi
2 H COH
2 CH2
OH
+
PO 3= + NADH + H
G 1.5 kcal
CH2 OPO 3=
3.
O
2. H COH
PO 3=
+ ADP
CH2 OPO 3=
2. H COH
+ ATP
4.50 kcal
(reaccin irreversible)
3. CH2
1.
OPO 3=
COO
H COPO 3=
H COH
COO
CH2 OH
3-fosfoglicerato
COO
G 1.06 kcal
2-fosfoglicerato
24
CH2 OH
CH2
enolasa
H COPO 3=
COO
COO
2-fosfoglicerato
PO 3=
+ H2O
0.44 kcal
fosfoenolpiruvato
CH3
CH2
G
C
COO
PO 3=
+ ADP
ATP +
COO
fosfoenolpiruvato
7.5 kcal
(reaccin irreversible)
piruvato
CH3
O
COO
piruvato
+ NADH + H+
+
H COH + NAD
COO
6.0 kcal
lactato
25
BALANCE GLOBAL
2 ADP
glucosa + 2 ATP + 2 NAD+ + 2 Pi + 4 ADP + 2 NADH+ + 2 H+
2 lactato + 2 ADP +
manosa-6-P + ADP
fructosa + ATP
fructosa-6-P + ADP
26
2 lactato
6 CO2 + 6 H2O
47 kcal
G
686 kcal
ORGANIGRAMA RESPIRATORIO
En la figura se muestra un diagrama de la respiracin. lkk
Los grupos acetilo procedentes de los carbohidratos, de los lpidos y de los
aminocidos en la fase II del catabolismo, en la siguiente fase III se incorporan al
ciclo de Krebs, que en las aerobias constituye la ruta comn final del catabolismo
oxidativo de todas las molculas combustibles. En este ciclo los grupos acetilo se
desintegran para formar CO 2 y tomos de hidrgeno. Estos ltimos (o sus electrones
equivalentes) posteriormente se incorporan a la cadena respiratoria constituda por
una serie de transportadores electrnicos.
El proceso subsiguiente de transporte de electrones hasta el oxgeno molecular se
realiza con un descenso muy grande de energa libre, gran parte de la cual se
conserve en forma de ATP, gracias a la fosforilacin oxidativa acoplada del ATP.
La reaccin global catalizada por el ciclo de Krebs es la siguiente:
CH3COOH + 2 H2O
2 CO2 + 8 H +
28
Carbohidrato
Aminoacidos
Movilizacin del
cidos
grasos
Piruvato
acetil CoA
2H
CO2
Acetil-CoA
oxalacetato
citrato
cis-aconitato
malato
CO2
-oxoglutarato
CO2
succinato
fumarato
2H
isocitrato
2H
2H
ATP
NAD
ADP + Pi
2H
flavoproteina
coenzima Q
Transporte electrnico
y fosforilacin
oxidativa
citocromo b
ADP + Pi
2H
ATP
citocromo c
citocromo a + a3
+
ADP A Pi
2 H+ + 1/2 O2
ATP
H2O
29
CH3
NADH2
COOH
CO2
HS-CoA
CH3
CoA + CO
Acetil-CoA
acetil-S-CoA+ NADH2 + CO 2
8.0 kcal
La oxidacin de piruvato a acetil-SCoA, catalizada por el sistema piruvatodeshidrogenasa, en realidad constituye un proceso muy complejo.
A causa del gran descenso de energa libre estndar, la reaccin es esencialmente irreversible. Aunque en si misma no forma parte del ciclo del cido
tricarboxlico, constituye una etapa obligatoria, mediante le cual los hidratos de
carbono se incorporan al ciclo.
En este proceso participan dos coenzimas importantes: CoA y cido lipoico.
CoA: Acta como transportador de grupos acilo, efectuando una funcin anloga
a la que desempea el ATP como transportador de grupos fosfato. La forma
acetilada de la coenzima A (acetil CoA) es un tioster del cido actico. El
tioster es un enlace de elevado contenido energtico, es decir, posee un G
fuertemente negativo.
acetil-S-CoA + H2O
acetato + CoA - SH
7.52 kcal
COOH
La decarboxilacin oxidante del piruvato a acetil CoA CO2 necesita tres enzimas
diferentes y 5 coenzimas que constituyen el:
enzimas
Piruvato-deshidrogenasa
dihidrolipoil-transacetilasa
dihidrolipoil-deshidrogenasa
coenzimas
Coenzima A
cido lipoico
Pirofosfato de tiamina (TPP)
NAD
FAD
Sistema de la
piruvato-deshidrogenasa
CH3
CoA
CoA
SH
COOH
COOH
C
oxalacetato
CH2
HO
citrato
COOH
CH2
CH2
COOH
COOH
En esta reaccin el grupo metilo (CH3 ) de la acetil CoA se condensa con el tomo
de carbono carbonlico del oxalacetato con la hidrlisis del enlace tioster y
formacin de la CoA SH libre.
O
C
OH
COOH
CH2
CH2
COOH
citrato
COOH
COOH
CH2
CH
COOH
COOH
cis-aconitato
31
H2O
COOH
CH2
CH
CH
COOH
OH
COOH
isocitrato
CH2
CH
CH
COOH
OH
COOH
NAD+
isocitrato
COOH
CH2
NADH2
CH2
COOH
alfa-cetoglutarato
NAD
succinato + CoA
SH
+ GTP
GDP + ATP
hidrgeno.
COOH
CH2
CH2
COOH + FAD
COOH
CH
succinato
CH
COOH + FADH2
fumarato
6. Se produce una hidratacin del fumarato dando malato, actuando coma catalizador la fumarasa.
OH
COOH
CH
CH
COOH + H2O
COOH
Fumarato
CH2
Malato
COOH
O
CH2
+
COOH + NAD
COOH
CH2
COOH + NADH2
Malato
Oxalacetato
Podemos ahora resumir los productos producidos en una vuelta del ciclo del cido
tricarboxlico.
Dos tomos de carbono aparecen en forma de CO 2 equivalentes, aunque no
idnticos, a los dos tomos de carbono del grupo acetilo que ingresa en el ciclo. Por
deshidrogenacin enzimtica se producen cuatro pares de tomos de hidrgeno,
tres pares se utilizan para reducir el NAD y uno para reducir el FAD.
En ltimo trmino, estos cuatro pares de tomos de hidrgeno y electrones se
combinan con el oxgeno, una vez realizado su transporte a lo largo de la cadena
respiratoria.
RUTA DEL FOSFOGLUCONATO O VIA DE LAS PENTOSAS
Muchas clulas disponen, adems del ciclo del cido tricarboxlico, de otra ruta de
degradacin de la glucosa cuya primera reaccin es la oxidacin de la glucosa-6fosfato a 6-fosfato gluconato.
La ruta del fosfogluconato, conocida como ruta de los fosfatos de pentosa o
desviacin del monofosfato de hexosa, no es una ruta principal de oxidacin de la
glucosa.
Su objetivo primordial, en la mayor parte de las clulas, es obtener NADP reducido
en el citoplasma extramitocondrial.
Una segunda funcin es la produccin de pentosas en especial D-ribosa, que se
emplea en la sntesis de cidos nucleicos.
Otra funcin importante consiste en participar en la formacin de glucosa, a partir del
CO 2 , en las reacciones de fotosntesis.
Las diversas etapas de la ruta del fosfogluconato tienen lugar en la porcin soluble
del citoplasma extramitocondrial de la clula.
33
OH
OH
COOH
OH
O + NADP+
HO
OH
O +NADPH
HO
OH
CH 2OPO 3=
CH 2OPO 3=
glucosa-6-fosfato
OH
HO
HC
OH
HC
OH
CH2 O PO 3=
6-fosfogluconato-lactona
6 Fosfogluconato
OH
H COH
H
HO
C
C
OH
+ NADP+
H COH
+ NADPH2 + CO2
H
CH 2OPO 3=
OH
CH 2OPO 3=
6-fosfogluconato
ribulosa-5-fosfato
34
CH2 OH
C
O
xilulosa-5-fosfato
HO C H
CH2 OH
HC
C
OH
OH
m
epi
sa
era
OH
CH 2OPO 3=
CHO
CH 2OPO 3=
iso
me
ras
a
ribulosa-5-fosfato
HC
OH
C OH
C OH
ribosa-5-fosfato
CH 2OPO 3=
HO
OH
CHO
CH2 OH
HCOH
+
CH 2OPO 3=
OH
OH
HC
OH
CH 2OPO 3=
HC
OH
HC
OH
HO
CHO
HC
OH
CH2 O PO 3=
CH2 O PO 3=
ribosa-5-P
sedoheptulosa-7-P
gliceraldehdo-3-P
35
CH2 OH
HO
HO
OH
OH
OH
OH
OH
CH2 O
CHO
+
OH
CH2 O
PO 3=
CHO
+
HC
OH
HC
OH
CH2 O
CH2 O
PO 3=
PO 3=
PO 3=
fructosa-6-P + gliceraldehdo-3-P
36
3O2
2Fe2
O3
Zn++ SO4=
+ Cu
Zn++
carga 2
Cu metalico
carga 0
37
Resumiendo:
1. La prdida de electrones se denomina oxidacin.
2. La ganancia de electrones se denomina reduccin.
c. En compuestos orgnicos el proceso de oxidacin se acompaa de prdida de
hidrgeno o ganancia de oxgeno.
H
H
H2O
H
-2H
H
OH
metano
metanol
-2H
H2O
O
-2H
cido
metanoico
metanal
-2H
CO 2
anhdrido
carbnico
gananca de oxgeno
prdida de electrones
prdida de hidrgeno
reduccin
prdida de oxgeno
ganancia de electrones
ganancia de hidrgeno
Ared. + Boxid.
Aoxid. + Bred.
2H+
+2e-
Reductor
Oxidante
E voltios
Acetaldehdo
Acetato
- 0.60
H2
2H
- 0.42
cetoglutarato +
Isocitrato
- 0.38
CO 2
NAD + H
NAD
- 0.32
Lactato
NADH
deshidrogenasa
(reducida)
Citocromo b
Piruvato
- 0.19
Oxidada
- 0.11
Fe (II)
Fe (III)
0.00
Fe (II)
Fe (III)
+ 0.26
H2 O
O2
+ 0.82
Citocromo c
H2O
2 H+
+2e-
Por dicha razn el agua muestra muy poca tendencia a perder electrones y a formar
oxgeno molecular. Dicho de otro modo, el oxgeno molecular tiene gran afinidad por
los electrones, superior que la de aceptores biolgicos de electrones tales como el
NAD , las flavoprotenas y los citocromos.
Cadena respiratoria:
Sustrato reducido
Sustrato oxidado
NAD+
FADH2
FAD+
NADH2
CoQ
CoQH2
Fe++
Fe+++
Fe++
cit. b
a+ a3
Fe+++
Fe++
ATP
ATP
H
Fe+++
2H
ATP
39
2H+ + 1/2 O2
H2O
Enzimas de xido-reduccin:
Tres son las clases principales de enzimas que participan de la corriente del
transporte electrnico desde los sustratos orgnicos hasta el oxgeno molecular.
De acuerdo al orden en que participan son los siguientes:
1. Deshidrogenasas ligadas a la piridina que requieren NAD o NADP como coenzima. Participan en la primera parte del eslabn:
Sustrato reducido
NAD+
Sustrato oxidado
NADH + H+
CoQ
CoQH + H +
FAD
Fe++
Fe+++
Fe++
cit. b
a+ a3
Fe+++
Fe++
Fe+++
2H+ + 1/2 O2
H2O
40
H2C
adenina
OH
OH
CONH 2
HO
H2C
OH
OH
H
CONH
CONH
+ H+
+ 2H
41
CH2
CH2
CH2
riboflavina
(vitamina B2)
CH2
CH2
O
HO
FDN
OH
OCH2
adenina
OH
OH
FDN: resulta de la unin pirofosfrica entre el FMN y el AMP. La parte activa del
FAD y del FMN es el anillo de isoaloxacina.
H
O
H
N
CH3
O
H
N
CH3
CH3
CH3
N
HC
CH
N
Fe
Fe
++
+++
HN
N
HC
CH
Forman quelatos (literalmente, cuatro dientes) con iones metlicos como el hierro,
por ejemplo. En los citocromos, el tomo de Fe experimenta cambios reversibles
entre las formas Fe (II) y Fe (III); su funcin real es la de desempear el papel de
transportadores electrnicos.
Potencial estndar de xido-reduccin en la cadena respiratoria
Los potenciales de reduccin de los diferentes transportadores electrnicos, se
hacen ms positivos a medida que los electrones pasan desde el sustrato el
oxgeno. Es decir, que el transportador electrnico ms prximo el extremo inicial de
la cadena, o sea el NAD es el trmino ms reducido, mientras que los
transportadores situados en el extremo del oxgeno (citocromo a + a3) estn casi por
completo en la forma oxidada. Los transportadores intermedios en estados
sucesivamente ms oxidados, segn una escala que va desde el sustrato hasta el
oxgeno.
Energtica del transporte electrnico-Fosforilacin oxidativa
Hemos visto que el G que se produce en el transcurso de cualquier reaccin
qumica es funcin de su constante de equilibrio.
RT Ink eq
43
nFT
E '0
2 23062
0.82
0.32
52.700 kcal
52.7 kcal
Se produce, por tanto, una variacin de energa libre muy grande durante el proceso
de transporte electrnico desde el NADH hasta el oxgeno molecular, a travs de la
cadena respiratoria. Este valor puede compararse con la energa libre estndar de
formacin de ATP a partir del ADP y el fosfato.
ADP + FOSFATO
ATP + H2O
7.3 kcal
44
NAD+ + H2O
52.7 kcal
y de su componente endergnico:
3 ADP + 3 Pi
3 ATP + 3 H2O
G 3 7.3
21.9 kcal
2 piruvato
2.
2 piruvato
2 acetil CoA
producen 6 ATP.
H2O
b. 2 alfa-cetoglutarato
tambin se producen 6 ATP.
c. 2 malato
H2
2 oxalacetato
6 ATP.
H2
d. 2 succinato
2 fumarato. En este caso los hidrgenos son
captados por el FAD. Se producen 4 ATP.
e. 2 succinato CoA
2 succinato, hay una fosforilacin a nivel de
sustrato de producen 2 ATP.
Resumiendo:
a ..
6 ATP
b ..
6 ATP
c ..
d ..
e ..
6 ATP
4 ATP
2 ATP
24 TP
glucosa + 6 O2 + 36 Pi + 36 ADP
6 CO2 + 36 ATP + 42 H2O
6 CO2 + 6 H2O
680 kcal
componente endergnico
36 Pi + 36 ADP
36 ATP + 36 H2O
263 kcal
46
263
100
680
39%
glicerol-3-fosfato + NAD+
glicerol-3-fosfato + FAD
NADH + H+
NAD+
DIHIDROXICETONA-P
GLICEROL-FOSFATO
NAD
FAD
ATP
ATP
MITOCONDRIA
O2
47
a. fluido extracelular
cidos grasos a
oxidarse provienen
b. fuente endgena
2. fosfoglicridos de las
membranas
A. Hidrlisis intracelular
Los cidos grasos deben hallarse en forma libre, es decir, no esterificados para que
puedan experimentar el proceso de activacin y oxidacin. Para ello, deben en
primer lugar, hidrolizarse por la accin de lipasas intracelulares para rendir cidos
grasos libres y glicerina. Se sabe relativamente poco acerca de la secuencia y
48
Las ltimas dos tioquinasas activan tanto los cidos grasos saturados como los no
saturados. Las tres se encuentran en la membrana exterior de la mitocondria. Las
propiedades y mecanismos de las tres tioquinasas, son ms o menos idnticos. La
reaccin global catalizada por las tioquinasas ligadas al ATP es la siguiente:
O
R
SH
CH
A medida que el enlace tioster se forma entre el grupo carboxilo del cido graso y el
grupo tiol de la CoA, el ATP experimenta ruptura pirofosfrica y rinde AMP PPi . A
su vez el PPi formado resulta hidrolizado por la pirofosfatasa inorgnica.
49
PPi
H2O
2 Pi
CH3
CH3
O
CH2
CH
CH3
CH2
COOH
CoA
OH
CH3
CH3
CH3
CH2
CH
CH2
COOH +
CoA
SH
O
C
SH
acil-graso-CoA + carnitina
como sustrato para el ciclo de oxidacin del cido graso, que tiene lugar en el
compartimiento interno de la matriz. Las mitocondrias contienen otro tipo de aciltioquinasas que participan en la activacin del cido graso. Esta enzima necesita
GTP en lugar de ATP y produce GDP Pi .
O
R
SCoA + GDP + Pi
O
2
CH2
CH2
SCoA
acil-graso CoA
+
E
FAD oxi.
SCoA
2,3
trans-enoil CoA + E
FAD red.
CH2
CoA
2,3
trans-enoil CoA
H
OH
R
CH2
CH2
hidroxi-acil-CoA
SCoA
CH2
O
CH2
SCoA + NAD+
H
O
R
CH2
O
CH2
+
SCoA + NADH + H
CH2
O
CH2
SCoA
CoA
O
O
R
CH2
SH
SCoA
CH3
SCoA
global de una vuelta de la secuencia de oxidacin del cido graso actuando sobre el
palmitoil-CoA es la siguiente:
palmitoil
CoA
miristoil
CoA
acetil
CoA
+ FADH2 + NADH + H+
Ahora podemos escribir la ecuacin para las siete vueltas del espiral necesarias
a fin de convertir una molcula de palmitoil-CoA en 8 molculas de acetil CoA (el
cido palmtico tiene 16 tomos de carbono). Cada molcula de FADH 2 cede un
par de equivalentes electrnicos a la cadena respiratoria a nivel de la CoA y se
generan 2 molculas de ATP. De modo anlogo, la oxidacin de cada molcula
de NADH da por resultado la formacin de 3 molculas de ATP. Por lo tanto, se
forman un total de 5 molculas de ATP por molcula de acetil-CoA escindido.
Podemos escribir ahora la ecuacin que tambin comprende las fosforilaciones:
pamitol
(1)
Las 8 molculas de acetil CoA formadas en el ciclo del cido graso pueden
incorporarse ahora al ciclo de Krebs
(2)
Puesto que se necesita una molcula de ATP ( o de GTP) para activar el cido
palmtico libre al comenzar, podemos suponer que el rendimiento neto de ATP es de
130 molculas.
Se ha resuelto este problema con el descubrimiento de una enzima auxiliar, la 3,4 cis- 2,3 -trans-enoil CoA-isomerasa que cataliza el desplazamiento del doble enlace
desde la configuracin 3,4 -cis a la 2,3 -trans que es el sustrato normal de la
siguiente enzima de la secuencia de oxidacin del cido-graso.
Cuerpos cetnicos y su oxidacin
En muchos vertebrados el hgado posee la capacidad enzimtica adecuada para
desviar algo de acetil-CoA, hacia la formacin de acetoacetato y -hidroxibutirato,
los cuales son transportados por la sangre a los tejidos perifricos, en donde pueden
ser oxidados por el ciclo del cido tricarboxilico. Estos compuestos reciben el
nombre de cuerpos cetnicos. El acetoacetato proviene de la condensacin de dos
molculas de acetil-CoA catalizado por la tiolasa.
acetil CoA + acetil CoA
CH2
O
CH2
SCoA
OH
acetoacetil CoA + acetil CoA
Beta-
Beta-hidroxibutirato + NAD+
tejidos por medio de la sangre. Al entrar en las clulas individuales tambin por
transporte activo, se incorporan a los canales metablicos. Se sabe muy poco de la
protelisis intracelular, que en algunos tejidos como el hgado, tiene lugar a un ritmo
elevado.
ESQUEMA DE LA OXIDACION DE LOS AMINOACIDOS
Para la oxidacin de los 20 aminocidos diferentes existen 20 secuencias
multienzimticas distintas. En ltimo trmino todas convergen en unas pocas rutas
terminales que conducen al ciclo de los cidos tricarboxlicos. Los esqueletos
hidrocarbonados de 10 de los A.A. son convertidos finalmente en acetil-CoA, ya sea
por la va del piruvato o por la del acetoacil-CoA, cinco se convierten en
cetoglutarato, tres en succinil-CoA y dos en oxalacetato. La fenilalanina y la tirosina
se degradan de modo que una porcin del esqueleto hidrocarbonado se incorpora
como acetil-CoA y lo otra como fumarato. Sin embargo no todos los tomos de C de
los 20 A.A. se incorporan al ciclo del cido tricarboxlico ya que algunos se pierden
por el camino de la descarboxilacin. Las rutas del catabolismo no son
necesariamente idnticas a las de la biosntesis, pero hay algunas etapas que son
comunes.
Alanina
Cistena
Glicocola
Serina
Treonina
Glutamato
Piruvato
Arginina
Histidina
Glutamina
Prolina
Oxoglutarato
Isocitrato
Isoleucina
Leucina
Triptfano
Succinil-CoA
Citrato
Isoleucina
Metionina
Valina
Succinato
Acetil-CoA
Oxalacetato
Tirosina
Fumarato
Acetoacetil-CoA
Fenilalamina
Malato
Fenilalanina
Tirosina
Leucina
Lisina
Triptfano
Aspartato
Asparagina
ahora los dos procesos principales implicados en esta reaccin, ellos son la
Transaminacin y la Desaminacin Oxidativa.
TRANSAMINACION
Por este proceso el grupo amino de por lo menos 11 aminocidos es separado
enzimticamente por transaminacin y transferido al carbono
de uno o tres
oxocidos (piruvato;
cetoglutarato o al oxalacetato). Por lo tanto el aminocido al
perder su grupo NH2 se transforma en el oxocido correspondiente y el -oxocido
que acepta el grupo NH2 se transforma en el aminocido correspondiente. Dos
transaminasas importantes son: la ALANIN-TRANSAMINASA; que cataliza la
reaccin:
oxocido alanina
oxoglutrico
Ejemplo de transaminacin:
O
R'
H
NH2
R2
COOH
R1
NH2
COOH
COOH
R2
COOH
cido
cido pirvico
oxoglutri co
cido glutmico
(aceptor final)
H3C
CH2
C
C
CH
N
O
O
P
OH
Fosfato de piridoxal
OH
CH
O
COOH
H2O +
R1
Dador de NH2
COOH
Base de Shiff I
O
R1
CH2
R1
COOH
COOH
+ E
CH2
NH2
enzima-fosfato de
piridoxamina
oxocido
Base de Shiff II
O
E
CH2
NH2 + R2
R2
COOH
oxocido
aceptor de NH2
CH2
COOH
Base de Shiff III
H
R2
NH2
H
E
COOH
H + R2
enzima-fosfato
de piridoxal
CH
COOH
aminocido
Base de Shiff IV
DESAMINACION OXIDATIVA
Este proceso ocurre en la mitocondria y los grupos NH2 recogidos de los diferentes
aminocidos por la accin de las transaminasas, aparecen en el ltimo trmino en
forma de grupos -aminos del L-glutamato.
En algunas clulas, particularmente en las bacterias, el glutamato experimenta una
58
L-glutamato + NAD+
NH4
NADH
glutamato
NAD
Glutamato deshidrogenasa
Treonina
Cistina
Cisteina
Glicocola
Serina
Alanina
cido Pirvico
Acetil-CoA
El esquema muestra los portales de entrada por los que penetran en el ciclo de los
cidos carboxlicos, los esqueletos carbonados de los diferentes aminocidos. Las
rutas de los 20 A.A. dependen del punto de entrada. El punto principal de entrada en
el ciclo es por la va del acetil-CoA, diez aminocidos penetran por esta ruta, cinco
de ellos se degradan al acetil-CoA por la va del piruvato y los restantes por la del
acetoacetil-CoA.
59
NH2
CH3
CH
CH
COOH
OH
Treonina
Glicocola
H2N
CH
CH2
O
CH3
COOH
C
H
Serinhidroximetil
tranferasa
OH
acetaldehdo
NAD+
NH 2
ATP
Serina
CH2
CH
OH
COOH
CoA
Serina
deshidrasa
O
cido Pirvico
CH3
NADH + H+
COOH
AMP; Pi
Piruvato
deshidrogenasa
O
CH3
S CoA
Acetil CoA
Prolina
Semialdehdo
glutmico
Histidina
Glutamina
cido Glutmico
cetoglutar ato
60
-cetoglutarato de los
cido
oxobutrico
Isoileucina
Propionil-CoA
Valina
Metilmalonil-CoA
Succil-CoA
cido-aspartico +
NH3
oxoglutarato
-cetoglutarato
61
Grupos
-amino
oxoglutarato
cido
asprtico
cido
glutmico
- NH2
arginina
- NH2
arginasa
H2N
citrulina
carbamilfosfato
C
NH2
C
O
ornitina
cido
Entonces el NH3 libre es utilizado junto con el CO 2 para formar fosfato de carbamilo
en una reaccin compleja, catalizada por la carbamil-fosfato sintetasa.
62
NH2
O
CO2 + NH3 + 2 ATP + H2O
H2N
O
O
+ ADP + Pi
O
Fosfato de carbamilo
cido
EXCRECION DE AMONIACO
Se cree que en los organismos amonotlicos los grupos NH2 derivados a diversos
-aminocidos, se transaminan para formar glutamato, que experimenta despus
una desaminacin oxidativa mediante la glutamato-deshidrogenasa. El NH3 as
formado se convierte despus en N 2 amdico de la glutamina, que es la forma de
transporte del NH3 en la mayor parte de organismos. La glutamina se forma por
accin de la glutamina-sintetasa, a partir de cido glutmico.
NH2
HOOC
CH2 CH2 CH
Acido Glutmico
Mg++
COOH + NH3 + ATP
H2N
NH2
CH2 CH2 CH
COOH + ADP + Pi
Glutamina
63
La glutamina rinde NH3 libre en los tbulos renales de la mayora de los vertebrados,
pero esta reaccin predomina en los organismos amonotlicos. La reaccin es:
Glutamato + NH4+
Glutamina + H2O
NH2
O2
C
C
C
N
N
H
HO
C
N
H
Xantin
oxidasa
H
Anillo de Purina
Xantina
H
N
N
C
C
C
O
C
N
Acido Urico
(forma oxo)
64
0.5 kcal
NAD+ + malato
6.7 kcal
oxalacetato + NADH2
6.7 kcal
Mg++
fosfoenol-piruvato + CO2 + GDP
oxalacetato + GTP
0.7 kcal
0.2 kcal
Esta reaccin global es reversible, puesto que su variacin de energa libre estndar
es muy pequea. Tender a desplazarse a la derecha siempre que el cociente (ATP)
/ (ADP) tenga un valor elevado y que haya presente un exceso de piruvato. Para
fosforilar una molcula de piruvato se consumen dos enlaces de alto valor
energtico. Practicando le direccin energtica de la ecuacin, se observa que el
proceso endergnico que requiere energa es:
piruvato + GTP
fosfoenol-piruvato + GDP
7.5 kcal
ADP + Pi
7.3 kcal
2-fosfoglicerato
(1)
2-fosfoglicerato
3-fosfoglicerato
(2)
ATP + 3-fosfoglicerato
ADP + 1,3-difosfoglicerato
(3)
gliceraldehido-3-fosfato + NAD+ + Pi
(4)
dihidroxiacetona-P
gliceraldehdo-3-P + dihidroxiacetona-P
(5)
fructosa-1-6-di P
(1) fosfoglicerometasa - (2) - fosfoglicerato-quinasa - (3) - gliceraldehdo-3 Pdeshidrogenasa - (4) - triosa-fosfato-isomerasa (5) - aldolasa
66
fructosa-6-P + Pi
0.4 kcal
glucosa 6-P
glucosa + ATP
4.0 kcal
glucosa + Pi
3.3 kcal
Resumiendo:
2 piruvato + 4 ATP + 2 GTP + 2 NADH2 + 6 H2O
Por cada molcula de glucosa que se forma se consumen seis enlaces fosfato de
alto valor energtico y se requiere dos molculas de NADH2 como reductor.
67
glucosa-6-P
disacridos
fructosa-6-P
Pi
monosacridos
ATP
Pi
fructosa-1-6 P
gliceraldehdo-3-P
3-P-glicerato
2-P-glicerato
fosfoenolpiruvato
GTP
CO2
oxalacetato
malato
malato
oxalacetato
piruvato
piruvato
68
COOH
Malonil transferasa
Acil transferasa
Palmitil
transferasa
Enzima condensante
( citonil sintetasa)
Deshidrogenasa
(2 reduccin)
SH (resto fosfopantotenil
con grupo SH terminal que
enlaza los intermediarios
aclicos)
Deshidrogenasa
(1 reduccin)
Deshidratasa
SH
(resto SH perteneciente a la protena
transportadora de grupos acilos)
70
O
CH3
biotina
SCoA + CO2 + ATP
HOOC
++
CH2
CoA
Mn
O
SH + CH3
SCoA
acil
SH
CH3 + HSCoA
SH
O
O
S
SH
transferasa
CH3 + COOH
CH2
C SCoA
O
malonil
S C CH3 + HSCoA
transferasa
S
C
CH2
COO H
71
SH + CO2
condensante
S
C
CH2
C
CH3
SH
SH
NADPH+ + H+
S
C
NADPH+ + H+
NADP
deshidratasa
deshidrogenasa
CH2
C
SH
S
C
H2O
CH2
O
CH3
OH
CH
CH3
crotonil-S-ACP
Hidroxibutiril - S- ACP
SH
CH
CH3
S
C
acil
transferasa
NADP
CH2
CH2
CH2
SH
CH3
CH2
CH3
butiril-S-ACP
72
SH + CH3
(CH 2)14
COOH
cido palmitico
SH
73
Acido palmitoleico (
Acido oleico (
1 par
glicerol-3-fosfato + NAD+
74
glicerol-3-fosfato + ADP
ETAPAS DE LA BIOSINTESIS
- Primera etapa: Acilacin de los grupos oxidrilos libres del glicerol-3-fosfato por
dos molculas de acil-CoA graso, produciendo un cido fosfatdico.
O
CH2 OH
CH2 O
C R
O
CH
O
+
CH OH
CH2 O
S CoA
CH2 O
PO 3H2
R'
+ 2 HSCoA
PO 3H2
- Segunda etapa: El cido fosfatdico experimenta una hidrlisis por accin de una
fosfatasa especfica formando diacilglicrido.
O
CH2 O
O
R
CH2 O
O
CH
CH2 O
O
+ H2O
R'
CH
PO 3H2
R'
+ Pi
CH2 OH
O
R
CH2 O
O
O
CH
R'
R''
R'
O
S CoA
CH
R'' + HSCoA
O
CH2 OH
CH2 O
R'''
BIOSINTESIS DE FOSFOGLICERIDOS
Los principales fosfoglicridos que sirven como componentes de las membranas y
las lipoprotenas de transporte se forman por ramificaciones de la ruta biosinttica a
partir del cido fosfatdico. Adems intervienen los nucletidos citidnicos. Todas
estas reacciones tienen lugar en el retculo endoplsmico.
1) El cido fosfatdico con el CTP se convierte en citidn-difosfato-diacilglicrido
que es el precursor comn de todos los fosfoglicridos formados por sta ruta.
Acido fosfatdico + CTP
citidn-difosfato-diacilglicrido + PPi
75
O
CH
R'
CH2
O
HO
O
HO
O
CH2
citosina
OH
OH
fosfatidil-serina + CMP
fosfatidil-glicerol-fosfato +
76
Acido fosfatdico
CTP
Fos
fato
de
glice
rilo
CDP - diacilglicrido
ina
Ser
Inositol
Fosfatidil-serina
Fosfatidil-inositol
Fosfatidil-glicerol-fosfato
CO2
Pi
Fosfatidil-etanolamina
Fosfatidil-glicerina
+ CDP-diacilglicrido
3 CH3Cardiolipina
Fosfatidil-colina
BIOSINTESIS DE COLESTEROL
Comprende tres etapas:
1.- Conversin de acetato en cido mevalnico
2.- Conversin de cido mevalnico en escualeno
3.- Conversin de escualeno en colesterol.
1). Conversin de acetato en cido mevalnico:
El cido mevalnico tiene seis tomos de carbono por lo que se forma por
condensacin de tres molculas de acetil-CoA.
Acetil CoA + acetoacetil CoA
hidroxi -
hidroxi -
NADPH2
CH2 C
OH
CH2
CH2
P
O
OH
O
OH
O
HO
OH
77
OH
C
CH2
CH2
CH3
CH3
C
CH
CH2
CH3
OH
O
OH
OH
P
O
OH
OH
- PPi
farnesil pirofosfato
78
79
oxoglutrico + NADPH + H+
Glutamina + ADP + Pi
OH
CH2
OH
CH2
H
cido
glutamil-fosfrico
NH2
COOH
ATP + Acido glutmico
glutamil~fosfato
+ NH3
ADP +
glutamil~fosfato
glutamina + Pi
reaccin se requieren Fe
y cido ascrbico como cofactores. Sin embargo la
prolin-hidroxilasa no transforma la prolina libre en hidroxiprolina.
NH 2
OH-C-CH 2-CH 2-CH-COOH
O
Acido Glutmico
NADH
NH2
H
CH2 CH2 CH
semialdehdo
glutmico
COOH
inhibicin
O
H2C
CH2
H
HC
Acido 1~pirroln
5 carboxlico
C
N
COOH
NADH 2
H2C
CH2
H2C
H
N
COOH
H
Prolina
NH2
COOH + HOOC
CH2 CH2 C
COOH
NH2
CH3 C
H
Acido pirvico
COOH + HOOC
Acido glutmico
CH2 CH2 C
COOH
cetoglutarato
Alanina
ACIDO ASPARTICO
O
HOOC
CH2 C
NH2
COOH + Acido glutmico
Acido oxalactico
HOOC
CH2 C
H
Acido Asprtico
CH2 C
NH2
NH2
COOH + NH3 + ATP
C CH2
O
Acido Asprtico
COOH + ADP + Pi
H
Asparagina
TIROSINA
Aunque la Tirosina es un aminocido no indispensable, su sntesis requiere el
aminocido esencial feniIalanina, como precursor. La tirosina se forma a partir de la
fenilalanina por una reaccin de hidroxilacin catalizada por la fenil-alaninhidroxilasa. La cual como hemos visto participa de la degradacin de la fenilalanina.
Fenilalanina + NADPH + H+ + O2
2,3
SINTESIS DE TREONINA
O
COOH
CH2
H
ATP
OH
ADP
CH2
apartil
NH2 quinasa
COOH
Acido
asprtico
OH NADH
CH2
CH2
C
NH2
CH
CH2
NH2
ENZ.
NH2
COOH
COOH
Semialdehdo
asprtico
Homoserina
CH2
OH
CH2 OH
NAD+
NADH
O
CH2
COOH
aspartil
fosfato
ADP
OH
ATP
NAD+
H+
CH
- Pi
Complejo enzimtico
-homoserin-fosfato
CH
ENZ.
COOH
COOH
CH3
+
CH3
H2O
CH
C
COOH
CH
ENZ.
CH3
OH
COOH
H2O
CH
ENZ.
OH + O
NH2
CH
ENZ.
COOH
Treonina
83
O
CH2 OH
Succinil CoA
CH2
H
NH2
COOH
CH2 O
CH2
CH2
CH2
NH2 CH2
COOH
Homoserina
CH2
Cistena
H
COOH
CH
H
NH2
NH2
COOH
COOH
O succinil - homoserina
Cistationina
CH3
SH
CH2
Piruvato
CH2
+ NH2
CH2
DA ~ Cobalanina
CH2
NH2
N ~ Metil
tetrahidroflorato
COOH
Homocisteina
NH2
COOH
Metionina
D. A. ~ Cobalamina
tetrahidrofolato + metionina
Mg++
Glutamilcistena + ADP +P
Glutatin + ADP + Pi
COOH
CH2
HSCoA
CH2 NH2
COOH
COOH
CH2
CH2
+
CH2
C
COOH
S CoA
Glicina
Succinil~CoA
CH2
CH2
C O
C O
CH2
NH2
COO H
NH2
Acido amino
levulnico
Acido amino
oxoadpico
COOH
HOOC
CH2
CH2
CH2
CH2
CH2 C
2 H2O
H
C
C
CH2
NH2
CH2
C
H
CH2 COOH
O
H
H
NH2
H
Porfobilingeno
85
HOOC
CH2 COOH
CH2
CH2
CH2 C
CH
NH2
H
Porfobilingeno
CH
CH2
CH
H
CH3 C
C
N
CH3
CH3
CH
H
CH2
CH2
COOH
CH2
H
HC
CH2
CH3
CH
CH2
COOH
Protoporfirina IX
86
Aspartato
C
C
Formiato
Formiato
N
3
N
9
amida de la glutamina
glicina
aminotransferasa
PP
ADP + P
cido glutmico
P O CH2
H
H
NH 2
R
P
fosforibosilamina
O
P
ATP
OH
H
H
OH
OH
fosforibosilpirofosfato (FRPP)
87
C4 y C5
N7
C8
NH2
NH
"CHO"
CH
CH2
glutamina
CHO
CoF
cido glutamnico
NH
NH
O
R
glicinamida ribtido
N3
C6
O
N1
C
CO2
CH
NH2
N
"CHO"
CH
CH
CH
Acido asprtico
C
NH2
N
R
N
R
5 aminoimidazol ribtido
CoF
NH2
C2
N
NH
CH
CH
N
R
P
Inosina 5' - fosfato
Acido Inosnico IMP
88
N
R
NAD
aspartato
[O]
NADH2
GTP
GDP + Pi
H
HOOC
CH2 C
COOH
NH
P
N
H+ glutmico H+ Xntico
glutamina
ATP
aspartato
AMP
N
R
AMP + PP
fumarato
O
NH2
H
N
H
NH2
N
N
R
P
R
89
base prica
AMP
Ribosa 5 P
5 P Ribosil PP
Nucletido
Pi
Ribosa 1 P
base prica
Nuclesido
ATP
AMP
Nucletido
Pi
GDP + ADP
GDP + ATP
GTP + ADP
AMP + GTP
ADP + GDP
ADP + GTP
ATP + GDP
E
PRPP
AMP
ADP
ATP
GMP
GDP
GTP
H+ inosnico
5 fosforibosilamina
En este caso el exceso de ATP, ADP o AMP o de GTP, GDP o GMP producen una
inhibicin a nivel de la enzima que cataliza la reaccin entre el fosforibosilpirofosfato
y la 5 fosforibosilamina, por lo tanto se frena la secuencia metablica y se inhibe la
biosntesis. Es un caso de retroalimentacin negativa.
Biosntesis de Nucletidos de Pirimidina
Es una ruta similar a la de los nucletidos purnicos, pues las bases libres no son
productos intermedios.
Esta ruta es ms simple y se diferencia en que la D-Ribosa se acopla despus que
se ha formado el anillo pirimidnico. El precursor es el cido Ortico.
O
C
H
COOH
N
90
cido ortico
H2O
carbamil PO4
Acido Asprtico
PO4
PRPP
NAD
Acido Dihidrtico
PP
Acido Orotidlico
OMP
Acido Ortico
fosforibosil-tr
ansferasa
NADH2
CO2
Acido Uridlico
OMP
descarboxilasa
UMP
(uridin monofosfato)
UMP + ATP
UDP + ADP
UDP + ATP
UTP + ADP
NH2
C
H
ATP
+
NH3
O
N
R
ADP + Pi
N
R
En Escherichia Coli (bacteria) el que dona el grupo NH2 es el NH3 libre. En los
mamferos es el grupo amino de la glutamina.
Regulacin de la biosntesis de nucletidos de pirimidina
Cuando hay un exceso de UTP y de CTP este exceso determina la inhibicin de la
aspartato carbamil transferasa, enzima que inicia la ruta de biosntesis, por lo tanto
se produce el fenmeno de retroalimentacin negativa o feed-back.
91
Acido Asprtico
aspartato carbamil transferasa
Acido carbamil
Asprtico
UMP
UTP
CTP
C
H
N
C
C
CH
CH
N5; N10.Metilen
Tetrahidrofolato
FH2
Dihidrofolato
N
C
N
desoxi R P (dUMP)
CH3
N
desoxi R P (d-TUMP)
Reacciones fosfotransfersicas:
ATP + d ADP
ADP + d ATP
ATP + d CDP
ADP + d CTP
ATP + d TDP
ADP + d TTP
ATP + d GDP
ADP + d GTP
92
Como las propiedades de la clula estn controladas por genes los caracteres
pueden cambiar por mutacin. De esta manera se pudo conocer la secuencia de
los genes en los cromosomas y saber que los genes poseen un gran nmero de
locus que pueden experimentar mutacin; y que qumicamente estn constituidos
por cido desoxiribonuclico.
Pero el desarrollo ms importante en el campo de le gentica fue:
La enunciacin de la hiptesis de "un gen - una enzima", por Beadle y
Tatum que dice que los genes se expresan a travs de protenas, por lo
tanto, las mutaciones darn origen a protenas alteradas.
El descubrimiento de Avery y Col, que demostraron que el ADN contiene
la informacin gentica.
B. En el campo de la bioqumica, muchos avances experimentales importantes se
hicieron posibles gracias a la mejora de mtodos cromatogrficos, que hicieron
posible el anlisis cuantitativo de la composicin aminocida y de la secuencia de
las protenas y mostraron que le secuencia vara segn funcin de la protena.
Tambin se lleg a establecer la composicin y estructura covalente de los
cidos nucleicos.Uno de los desarrollos ms significativos consisti en el
descubrimiento de la equivalencia de ciertas bases del ADN que se convirti en
un elemento importante para deducir su estructura tridimensional.
C. En el campo de la fsica molecular la aplicacin de difraccin de rayos X a la
conformacin de molculas de protenas fibrosas y globulares llev al concepto
de que cada tipo de molcula proteica posee una conformacin especfica, que
determina su funcin biolgica. Pero el hecho fundamental fue la aplicacin de
los rayos X al anlisis de la estructura tridimensional del ADN. En 1953 Watson y
Crick postularon una estructura de doble hlice para el ADN que sugiri un
mecanismo sencillo por medio del cual la informacin gentica puede transferirse
de la clula progenitora a la clula hija. La hiptesis de Watson y Crick fue pronto
ampliada y extendida hasta llegar a lo que Crick denomin el dogma central de la
gentica molecular, el cual establece que la informacin gentica fluye del ADN
al ARN y de ste a las protenas; relacin frecuentemente simbolizada as:
ADN
ARN
protenas
equivalencias de bases observadas por Chargaff. Este modelo no solo explicaba las
propiedades fsicas y qumicas del ADN, sino que sugera un mecanismo por medio
del cual la informacin gentica poda replicarse con exactitud. El modelo estructural
del ADN de Watson y Crick consiste en dos cadenas polinucleotdicas dextrohelicoidales, arrolladas a un mismo eje y constituyendo una doble hlice. Las bases
pricas y pirimdicas de cada hebra se encuentran en el interior de la doble hlice.
El aparejamiento de las bases apartadas por ambas hebras es tal que solamente
ciertas bases encajan en el interior de la estructura de manera que puedan unirse
unas a otras por puentes hidrgeno. Las bases son:
A-T
G-C
ncleo de
TyC
N
N
N
T
T
C
C
A
G
G
T
C
ARN
protenas
O sea que ste dogma defini tres procesos fundamentales de los cuales el primero
es el de REPLICA, es decir la "copia" del ADN con formacin de molculas hijas.
Veremos como sucede ste proceso a nivel molecular. La caracterstica ms
sorprendente de la hiptesis de Watson y Crick, desde el punto de vista gentico, en
su postulado de que las dos hebras del ADN duplohelicoidales son complementarias.
La rplica de cada una de ellas conduce a dos molculas hijas de ADN; cada una
contiene una hebra del ADN progenitor. Este proceso se denomina rplica
semiconservadora.
Pero Cmo pueden replicarse simultneamente las dos hebras del ADN de modo
que se formen al mismo tiempo.
ste mecanismo requiere tres enzimas:
ADN - polimerasa dependiente del ADN
ADN - ligasa
Endodesoxiribonucleasa
ADN polimerasa
Cataliza la sntesis de enlaces internucletidos. Posee los siguientes requerimientos:
1). Presencia da ADN preformado
2). Presencia de los cuatro desoxiribonucletidos trifosforados, los mono y
difosforados son inactivos.
3). Mg++
Qu papel desempea el ADN preformado? Se han propuesto dos alternativas:
1. Que acta como cebador, es decir, que al proporcionar un extremo o puntos
de crecimiento, se pueden adicionar nuevos mononucletidos.
97
hebra patrn
hebra cebadora
2. O bien podra ser utilizado como patrn sobre el cual la enzima podra
construir una hebra complementaria al ADN preformado.
nd ATP
nd GTP
ADN preformado
nd CTP
Mg++
nd TTP
d
d
ADN
|
AMP
|
GMP
|
CMP
|
TMP
4 PPi
H2C
O
O
H
Base
O
HO
H
O
Base
OH
OH
OH
P
OH
P
O
PPi
H2C
OH
PPi
O
O
H2C
OH
Base
OH
Base
OH
OH
H2C
O
H
Base
OH
OH
98
Hay un ataque al tomo de fsforo alfa del nucletido trifosforado entrante y provoca
el desplazamiento de su grupo pirofosfato, con formacin de enlace internucletido.
El PPi formado es rpidamente hidrolizado por una pirofosfatasa por lo cual la
reaccin es muy exergnica. La direccin de la sntesis es por lo tanto 5 --- 3'.
ADN ligasa
1. Enlaza extremos de molculas de ADN produciendo formas circulares. Ej.:
bacterias.
2. Cataliza la reparacin de roturas de una cadena de ADN.
O
Base
CH2
NMN
OH
NAD
AMP
5'
Dinucletido
constitudo
NMN y AMP
OH
H
OH
3'
H
Base O
99
OH
O
Base O
CH2
O
O
OH
H2C
Base O
Adenina
OH
CH 2 O
HO
O
OH
Base O
Base O
Mecanismo de replicacin
Antes de hablar de la replicacin es importante acotar que la cadena de ADN
recin sintetizada se prolonga en direccin opuesta a la cadena de ADN patrn, es
decir, tiene una polaridad opuesta o antiparalela.
3'
T
T
A
5'
3'
cebadora
3'
5'
3'
5'
5'
3'
A
T
T
3'
Kornberg: postul que la rplica comienza con la produccin de una mella o una
rotura en una hebra por accin de una endonucleasa. Unidades de MN adicionadas
por la ADN polimerasa:
5'
5'
3'
3'
5'
3'
3'
endonucleasa
5'
3'
ADN polimerasa
5'
3'
5'
ADN ligasa
101
unin reversible
unin estable:
reconoce al promotor
T
A
3'
P
OH
OH
OH
5'
P
P
P
103
OH
5'
T
A
La enzima se desplaza
por la hebra del ADN
A
P
OH
104
2.
factor
de terminacin
Ro
ADN
ARN
enzima
105
UUU
UUC
UCU
UCC
UCA
UCG
106
107
30 S
A
|
C
|
C
108
Anticodn (unin al ARNm)
ATP + AA
O
H
P
R
OH +
CH2
OH
Adenina
NH2
NH2
O
O
P
OH
CH2
+
Adenina
PPi
109
AA .
30 S
LP
LA
50 S
110
30 S
30 S
30 S
50 S
AA
AA
50 S
LA
(metionina) AA
AA
2.- En la segunda fase se forma el enlace peptdico por reaccin entre el grupo
amino del nuevo aminoacil - ARN t captado con el grupo carboxilo del AA ya
existente en el LP.
111
NH
NH
R
CH
C
CH
HO
LP
LP descargado
NH
NH2
R
CH
C
H
C
LA
LA
ARNm
CH
NH
H
C O
LP
LA
112
113
Estructural
114
regulador
operador
estructural
represor
Este represor tiene un locus de unin especfico prximo al gen estructural. Este
locus se denomina operador.
Qu sucede en una induccin, es decir, cuando se agrega al medio un sustrato que
debe degradarse? El sustrato, que sera el inductor, se combina con el represor
formando un complejo inductor-represor inactivo, que no puede unirse al operador.
represor
inductor
regulador
ARNm
operador
estructural
represor
115
En este caso, la histidina se une al represor y forma un complejo represorcorrepresor que se combina al operador; el gen estructural no se transcribe y por lo
tanto no se sintetiza histidina.
Regulacin coordinada
Tambin existe un mecanismo de regulacin coordinada por el cual un grupo de
enzimas puede ser reprimida o inducida por un slo represor o por un slo inductor.
Por ejemplo, para sintetizar histidina se necesita un grupo de enzimas. Todas se
encuentran codificadas en los genes ocupando locus vecinos.
operador
116
BIBLIOGRAFIA
117