Biologa I. Ciencias Ambientales.

UNED Madrid Sur

Tema 1. Molculas biolgicas

1. Introduccin a la base qumica de la vida

2. Estructura y funcin de las protenas
3. Estructura y funcin de los cidos
nucleicos
4. Introduccin a los hidratos de carbono
Pingino papa. Andrs Ajo. Pennsula Antrtica

5. Introduccin a los lpidos.

Andrs Ajo Lzaro

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Tema 1. Molculas biolgicas

1. Introduccin a la base qumica de la vida

Bioelementos
- Bielementos primarios (99% materia viva): Carbono (C), hidrgeno (H), oxgeno (O),
nitrgono (N), fsforo (P) y azufre (S): bioelementos primarios, 99 % de la materia viva.
- Otros, muy importantes aunque en muy baja proporcin: NA, K, Ca, Fe, Mg, Cu, Cl, I, F,
tomos y molculas
Enlaces
- Covalente (fuerte, se comparten electrones; sencillos, dobles o triples)
H 1, O2, N 3, C 4, S 2, P 5
- Inico (dbil),
- Puente de hidrgeno (dbil)
- Fuerzas de Van der Waals (muy dbil)
- Interaccin hidrofbica (muy dbil)
La importancia del Carbono: Versatilidad,
Molculas orgnicas con esqueletos de C,
grupos funcionales
Andrs Ajo Lzaro
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Tema 1. Molculas biolgicas

1. Introduccin a la base qumica de la vida

Grupos funcionales

Andrs Ajo Lzaro

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Tema 1. Molculas biolgicas

1. Introduccin a la base qumica de la vida

Biomolculas:
Biomolculas inorgnicas: agua y sales minerales
Biomolculas orgnicas: carbohidratos, lpidos, protenas y cidos nucleicos
Agua. El agua es la molcula esencial de la vida: la ms abundante de los seres vivos (60-90%), en
agua se origin la vida, no hay actividad biolgica sin agua. Es el medio (solvente) en el que ocurren
la mayora de las reacciones bioqumicas. Estructura singular y propiedades especiales: slida es
menos densa que lquida (el hielo flota), elevada cohesin molecular (turgencia, esqueleto
hidrosttico), elevada tensin superficial (se resiste a ser traspasada: desplazamiento), elevada fuerza
de adhesin, ..
Water is polar

Hydrogen bonds form

between water molecules

Molculas orgnicas:
- pequeas (glucosa, aminocido)
- grandes: macromolculas, son polmeros (

Consecuencias de la tensin
superficial del agua

monmeros)

Andrs Ajo Lzaro

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Tema 1. Molculas biolgicas

2. Estructura y funcin de las protenas

Biomolculas muy abundantes en los seres vivos. Formadas por C, H, O, N (S, P, Fe, ..).
Fundamentales para la mayora de la actividad celular.
2.1. Funciones de las protenas.
- Defensa: anticuerpos, protenas del
complemento
(cascadas
bioqcas
en
respuesta inmunitarias)
- Movimiento (contrctil): actina y miosina
del msculo.
- Enzimtica o cataltica: las enzimas
catalizan las reacciones bioqumicas, es decir,
aumentan la velocidad de reaccin
- Estructurales: soporte mecnico de la
clula, colgeno del tejido conjuntivo,
queratina de pelo, uas, ..
- Transportadora: hemoglobina de la sangre,
hormonas peptdicas a travs de la
membrana celular
- Hormonal: insulina, glucagn, hormonas
peptdicas, ..
Andrs Ajo Lzaro
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Tema 1. Molculas biolgicas

2. Estructura y funcin de las protenas

2.2. Aminocidos
Las protenas son macromolculas, polmeros monmeros: aminocidos.
20 aminocidos distintos (21 si contamos al aa selenocistena descubierto en 1986,
similar a la Cys pero con Selenio en lugar de S).
Todos los aminocidos tienen una parte comn con un grupo amino NH2 (NH3+, forma
ionizada) y un grupo carboxilo COOH (COO-, forma ionizada) de carcter cido y otra
variable -R .

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Tema 1. Molculas biolgicas

2. Estructura y funcin de las protenas

Tipos de aminocidos. La cadena lateral R distingue los 20 (21) tipos de aminocidos
distintos ( estructura tridimensional y funcin de la protena)
Cadenas laterales no polares (no solubles en agua; es decir son hidrfobos, tienden a
concentrarse en una solucin acuosa):
Glicina (Gly), Alanina (Ala), Valina (Val), Leucina (Leu), Isoleucina (Ile), Metionina
(Met), Fenilalanina (Phe), Triptfano (Trp), Prolina (Pro)
Cadenas laterales polares (cargas parciales que pueden formar enlaces de hidrgeno:
solubles en agua; hidrfilos):
Serina (Ser), Treonina (Thr), Cistena (Cys), Tirosina (Tyr), Asparragina (Asp),
Glutamina (Gln)
Cadenas laterales con carga elctrica (forman enlaces de hidrgeno: muy solubles en
agua; hidrfilos)
Aspartato (Asp), Glutamato (Glu), Lisina (Lys), Arginina (Arg), Histidina (His)

Andrs Ajo Lzaro

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Tema 1. Molculas biolgicas

2. Estructura y funcin de las protenas

2.3. El enlace peptdico
Une los aminocidos entre s. Se forma entre el grupo carboxilo de un aminocido y el
grupo amino de otro liberndose una molcula de agua (reaccin de condensacin).

El enlace C-N muy estable (carcter de doble enlace) y plano, no permitiendo el giro alrededor de l,
aunque s pueden hacerlo los enlaces simples de cada lado estructura globalmente flexible
Electrons shared between carbonyl group and
peptide bond offer some characteristics of
double bonds

Carboxyl
group

Amino
group

Peptide
bond

2 aas dipptido, 3 aas tripptido, .. <50 aas oligopptido .. polipptido.

>50 aas (en gral) y con estructrua y funcin determinada protena
Cadena polipeptdica, numeracin: H2N-Gly(1)-Ala(2)-Ser(3) -COOH
Andrs Ajo Lzaro
Grupo amino-terminal (N terminal) en un extremo . Grupo carboxilo terminal (C terminal)Biologa
en elI. Ciencias
otro
Ambientales

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Tema 1. Molculas biolgicas

2. Estructura y funcin de las protenas

2.4. Cmo son las protenas? Estructura
Enorme diversidad en tamao, forma y funcin. Se distinguen 4 niveles estructurales:
estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria.
Estructura primaria. Es la secuencia nica de aminocidos que componen la protena. El
cambio de uno solo de los aas cambia la secuencia y puede cambiar la funcionalidad:
Hb humana (146 aas x4): Hb (6) Glu
Hb(6)Val: anemia falciforme: la protena cristaliza .. glbulos
rojos con forma de hoz que no atraviesan capilares .. clulas afectadas sin oxgeno

Con los 20 aas distintos pueden construirse 20n (n: n de aas de la protena)
La estructura primaria condiciona las estructuras superiores
Estructura secundaria. Son secciones proteicas con una forma determinada estabilizadas
mediante ptes de H entre COHN de aas distintos. Dos tipos:
- Hlice . El esqueleto del polipptido forma una espiral con grupos R hacia fuera. Los
grupos R pueden distorsionar la hlice, por lo que no todos los aas la permiten. Estructura
muy evidente en protenas estructurales fibrosas insolubles (queratinas). (Al estirar el pelo
rompemos ptes de H, que al soltar se reconstruyen)

- Lmina plegada . Los segmentos giran 180 y a continuacin se pliegan en el mismo

plano formndose una lmina estabilizada por ptes H COHN. Se forma entre diferentes
regiones de la misma cadena o entre cadenas separadas (seda araa).
Andrs Ajo Lzaro
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Tema 1. Molculas biolgicas

Hydrogen bonds form between peptide chains.

2. Estructura y funcin de las protenas

Estructura secundaria

Secondary structures of proteins result.

-helix

-pleated
sheet

Ribbon diagrams of secondary structure.

Las puntas de flecha

sealan extremos
carboxilo

Muchas protenas contienen regiones tanto

de Hlice como de Lmina plegada en la
misma cadena polipeptdica, as como otras
que no presentan ninguna de ellas
Hlice

Lmina plegada

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Tema 1. Molculas biolgicas

2. Estructura y funcin de las protenas

Estructura terciaria. Nivel de plegamiento que se produce por interacciones entre los
grupos R o los grupos R y el esqueleto (la estructura secundaria se produce por
interacciones entre los componentes del esqueleto). Las interacciones involucradas: ptes de
H, puentes disulfuro Cys -S-S- Cys, fuerzas de Van der Waals, cadenas hidrofbicas laterales
(se sitan en el interior de la protena lejos del agua), interacciones inicas.

Interactions that determine the tertiary structure of proteins

Hydrogen bond
between side chain
and carboxyl oxygen

Hydrogen bond between

two side chains

Ionic bond
Hydrophobic
interactions
(van der Waals
interactions)
Disulfide bond

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2. Estructura y funcin de las protenas

Estructura terciaria.
Las estructuras terciarias son muy variadas

Estructura terciaria compuesta

principalmente por hlices

Estructura terciaria compuesta

principalmente por lminas
plegadas

Estructura terciaria con

abundantes ptes disulfuro

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2. Estructura y funcin de las protenas

Estructura cuaternaria. Solo en protenas con varias cadenas. La interaccin de estas
cadenas polipeptdicas determina su estructura cuaternaria.
- Dmeros: protena Cro del virus bacterifago
- Tetrmeros: Hemoglobina, con 4 subunidades unidas mediante interacciones hidrofbicas,
fuerzas de VdW, ptes de H y enlaces inicos.

Cro protein, a dimer

Hemoglobin, a tetramer

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2. Estructura y funcin de las protenas

Niveles estructurales de las protenas

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Tema 1. Molculas biolgicas

2. Estructura y funcin de las protenas

La importancia de la forma de las protenas. Las superficies de las protenas adquieren
formas especficas, lo que les permite unirse no covalentemente con otras molculas: ac
que se fijan a una cubierta viral, protenas transportadoras de membrana, enzima-sustrato, ..
La forma de una protena, su estructura tridimensional, determina su funcin. Prdida
estructura tridimensional
prdida de la funcin: desnaturalizacin (Q, cidos, urea, .. que
rompen los enlaces que mantienen la estructura tridimensional). Irreversible (hervir un
huevo) o reversible.

Chaperonas (muchas incluidas en el grupo de protenas del shock por calor) son protenas
que facilitan que las protenas se plieguen de la manera adecuada, incluso despus de
desnaturalizarse, para evitar que se plieguen errneamente y se amontonen.
Los priones son protenas mal plegadas
infecciosas. Personas: enfermedad de
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Creutzfeldt-Jakob
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Tema 1. Molculas biolgicas

2. Estructura y funcin de las protenas

2.4. Enzimas
Son protenas que catalizan las reacciones bioqumicas. Aumentan la velocidad de reaccin
disminuyendo la energa de activacin necesaria para que se alcance el estado de transicin
en una reaccin qumica. Son catalizadores biolgicos

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Tema 1. Molculas biolgicas

2. Estructura y funcin de las protenas

Enzimas. Caractersticas
1. Especificidad: respecto al sustrato sobre el que actan y respecto a la reaccin que
catalizan. Unin ntima con el sustrato a travs de su centro activo: E+S ES E+P.
a. Modelo llave (sustrato) cerradura (enzima). Fisher, 1894
b. Modelo de encaje inducido. Las ezs no son rgidas y estticas sino flexibles y
dinmicas: sufren cambios en la conformacin cuando se unen a su sustrato.
Se forman enlaces entre el sustrato y los aas del centro activo, lo que estabiliza el estado
de transicin disminuyendo la energa necesaria para que se produzca la reaccin.
2. Las enzimas no se modifican en la reaccin
3. Muy eficaces
4. Los cofactores son sustancias que facilitan la funcin
enzimtica:
a. Iones metlicos (Zn2+, Mg2+, ..)
b. Coenzimas (pequeas molculas orgnicas que
estabilizan el estado de transicin durante la reaccin).
Muchas vitaminas son necesarias para producir
cofactores (gr B)
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Tema 1. Molculas biolgicas

2. Estructura y funcin de las protenas

Enzimas. Modelo de accin enzimtica

Substrates

Transition state

Enzyme

Shape changes

Products

1. Initiation: Reactants bind to

2. Transition state facilitation:

3. Termination: Products have

the active site in a specific

orientation, forming an
enzyme-substrate complex.

Interactions between enzyme

and substrate lower the
activation energy required.

lower affinity for active site

and are released. Enzyme is
unchanged after the reaction.

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Tema 1. Molculas biolgicas

2. Estructura y funcin de las protenas

Enzimas. Regulacin

Competitive inhibition directly blocks the active site.

Competitive
inhibitor
When the regulatory
molecule binds to the
enzymes active site, the
substrate cannot bind

Substrate

Enzyme

Allosteric regulation occurs when a regulatory molecule binds somewhere other than the active site.

Substrate

or
When the regulatory
molecule binds to a different
site on the enzyme, it
induces a shape change
that makes the active site
either available to the
substrate (left) or
unavailable (right)Andrs Ajo Lzaro

Enzyme
Regulatory
molecule
Activating the enzyme

Inactivating the enzyme

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Tema 1. Molculas biolgicas

3. Estructura qumica y funcin de los cidos nucleicos

Los cidos nucleicos son las molculas que almacenan la informacin gentica y la
transmiten entre generaciones. Dos tipos: el DNA (cido desoxirribonucleico) y el RNA
(cido ribonucleico).
Las molculas de DNA son polmeros gigantes que contienen codificada la informacin
hereditaria y la transmiten de una generacin a la siguiente; dirige el funcionamiento de la
clula. El RNA acta como intermediario temporal del DNA, de tal forma que moviliza
copias de fragmentos del DNA para la sntesis de protenas especficas. La informacin pasa
del DNA al RNA y de ah a las protenas.
3.1. Nucletidos. Los cidos nucleicos son
polmeros formados por monmeros llamados
nucletidos. Cada nucletido:
AZCAR PENTOSA: ribosa (RNA) o desoxirribosa
(DNA). Difieren en un tomo de O
BASE NITROGENADA:
o Prica: ADENINA (A) o GUANINA (G)
o Pirimidnica: CITOSINA (C), TIMINA (T, solo
en DNA) o URACILO (U, solo en RNA)
GRUPO FOSFATO (P, cido fosfrico)
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Tema 1. Molculas biolgicas

3. Estr. qca. y func. de los cidos nucleicos

The sugar-phosphate
The sequence of bases
spine of RNA
found in an RNA strand
is written in the 5 3
direction

3.2. Polimerizacin de nucletidos. Los

nucletidos se unen entre ellos por medio
de enlaces fosfodiester, entre el azcar de
un nucletido y el fosfato del siguiente.
Tras unirse los nucletidos, la cadena
tendr una columna azcar-fosfato del que
cuelga la secuencia de bases en direccin
5 3 (direccin de formacin de la
cadena: los nuevos nucletidos se aaden
a la posicin 3).

Nitrogenous
bases

3 and 5 carbons
joined by
phosphodiester
linkage
Unlinked 3 carbon:
New nucleotides
are added here
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Tema 1. Molculas biolgicas

3. Estructura qumica y funcin de los cidos nucleicos

3.3. Estructura del ADN. El DNA est formado
por dos cadenas de nucletidos, que discurren
en direcciones opuestas (5 3, 3 5), y que
se encuentran enfrentadas por las bases
nitrogenadas por las que se mantienen unidas
mediante puentes de hidrgeno.
Bases nitrogenadas: adenina (A), guanina (G),
citosina (C) y timina (T). Estas bases siempre se
encuentran emparejadas A T y C G, unidas
por los puentes de hidrgeno. Este
emparejamiento de bases es muy estable, es
universal y es la clave de la informacin
contenida en los cidos nucleicos y de su
transmisin.
La
secuencia
de
bases
nitrogenadas, es el lenguaje en el que est
escrita toda la informacin vital para la clula.
Las dos cadenas estn enrolladas entre s
formando una doble hlice: Modelo de doble
hlice de ADN, de Watson y Crick (1953,
Premio Nobel 1962)
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Tema 1. Molculas biolgicas

3. Estructura qumica y funcin de los cidos nucleicos

3.4. Funciones. La estructura de doble hlice permite explicar las funciones del DNA:
Transportar la informacin gentica. En la secuencia (el orden) de las bases del DNA
reside la informacin gentica del organismo. Con este lenguaje de 4 letras (las 4
bases), en largas cadenas se puede formar un nmero ingente de secuencias, entre
las que estarn las de cada especie y las de cada organismo.
Transmitir la informacin de una clula a sus clulas hijas en la divisin celular. Antes
de que una clula se divida, se produce la replicacin del DNA, basada en la
complementariedad de las dos cadenas.
Dirigir el funcionamiento de la clula. La expresin del DNA provoca la sntesis de las
protenas celulares necesarias, siendo el RNA un intermediario del proceso
DNA RNA Protenas
3.5. RNA. Cadena de ribonucletidos de adenina (A), guanina (G), citosina (C) y uracilo (U).
Cuando se forma el RNA a partir de la copia de parte de una hebra de las dos que forman el
DNA, los emparejamientos de bases por puentes de hidrgeno son A-U y C-G, ya que el RNA
no tiene timina sino uracilo. La cadena de RNA es nica, sencilla.
3.6. Nucletidos no nucleicos. Actan en el metabolismo celular. El principal es el ATP
(adenosn trifosfato), molcula que almacena y/o transfiere energa en muchas reacciones
bioqumicas. Otros: GTP (guanosn trifosfato) o el cAMP (adenosn monofosfato cclico).
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4. Introduccin a los hidratos de

carbono (= carbohidratos, glcidos, azcares)

Formados por C, H y O. Todos tienen grupos hidrgeno e hidroxilo (-OH) y grupos aldehdo (CHO) o cetona (-CO).
4.1. Funciones de los hidratos de carbono
Fuente de energa, que se libera en el metabolismo celular al romperse los enlaces
covalentes fuertes (C-C y C=O)
Constituir esqueletos carbonados: ladrillos moleculares a partir de los que se forman otras
molculas importantes para los seres vivos
4.2. Clasificacin.
a. Monosacridos. Monmeros de otros ms grandes. 3C triosas, 4C tetrosas, 5C pentosas
(ribosa y desoxirribosa), 6C hexosas (glucosa, fructosa, galactosa) CnH2nOn.
La glucosa es el ms comn e importante de los monosacridos.
- Hexosa (C6H12O6) presente en todas las clulas: se sintetiza en la fotosntesis
- De su degradacin qumica obtienen energa todos los seres vivos (respiracin celular).
- Abundante en frutos de vegetales y en la sangre de los animales (sangre humana: 1gr/l)

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4. Introduccin a los hidratos de

carbono (= carbohidratos, glcidos, azcares)

Glucosa

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4. Introduccin a los hidratos de

carbono (= carbohidratos, glcidos, azcares)

b. Disacridos. Monosacrido + monosacridos. Enlace O-glucosdico. Los ms conocidos son

la sacarosa (azcar de mesa, glucosa+fructosa), la lactosa (azcar de la leche,
glucosa+galactosa) y la maltosa (azucar de malta, glucosa+glucosa)

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4. Introduccin a los hidratos de

carbono (= carbohidratos, glcidos, azcares)

c. Oligosacridos. Unin de 3 a 20 monosacridos.

d. Polisacridos. Polmeros grandes formados por cientos o incluso miles de monosacridos.
Dos funciones: reserva energtica y estructural.
- Almidn. Reserva energtica en vegetales. Mezcla de amilosa (glucosas con enlaces 1-4)
y amilopectina (glucosas con enlaces 1-4 con ramificaciones en 1-6)
- Glucgeno. Reserva energtica en animales. Glucosas con enlaces 1-4 con ramificaciones
en 1-6

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4. Introduccin a los hidratos de

carbono (= carbohidratos, glcidos, azcares)

- Celulosa. Estructural en plantas: pared celular. No digerible para animales. Glucosas con
enlaces 1-4, formando fibras dispuestas linealmente con enlaces entre ellas.

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4. Introduccin a los hidratos de

carbono (= carbohidratos, glcidos, azcares)

- Quitina. Estructural en animales: exoesqueleto de artrpodos. Polmero de N-acetilglucosaminas con enlace 1-6.

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5. Introduccin a los lpidos

Molculas hidrocarbonadas (= hidrocarburos) muy variadas desde el punto de vista qumico.
Propiedad comn: insolubles en agua (hidrofbicos), aunque solubles en disolventes
apolares (ter, cloroformo, acetona).
C, H, O; en menor grado N, P, S
Hidrofobicidad causa de las ppales
propiedades biolgicas. En agua, las
molculas lipdicas se agregan entre s
e interaccionan (fzas de Van der
Waals).

1. Funciones de los lpidos:

Estructurales: los PL son componentes esenciales de las membranas celulares
Energticos: TG
Vitaminas y hormonas
2. Grupos principales de lpidos: cidos grasos, triglicridos, fosfolpidos, esteroides
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5. Introduccin a los lpidos

a. cidos grasos. Largas cadenas hidrocarbonadas (12-24C)grupo carboxilo. Pueden ser:
- Saturados, sin dobles enlaces (palmtico C16, esterico
C18, ..)
- Insaturados, con dobles enlaces (oleico abundante tb
en clulas animales- c18, linoleico c18). Muy
abundantes en vegetales y funden a temperaturas
bajas. Algunos son esenciales para el hombre
b. Grasas y aceites (glicridos). Su funcin principal es de
almacn de energa. Cuando son slidos a temperatura
ambiente se llaman grasas, y si son lquidos, aceites.
Los triglicridos (=lpidos simples) estn formados por
glicerol al que se unen 3 cidos grasos. Pueden ser slidos
cuando los cidos grasos no tienen dobles enlaces en sus
molculas (= saturados) o lquidos cuando los cidos grasos
tienen dobles y/o triples enlaces en sus moleculas (=
insaturados). El enlace que une a cada acido graso con el
glicerol es de tipo ster.
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Tema 1. Molculas biolgicas

5. Introduccin a los lpidos

c. Fosfolpidos. Formados por:
Glicerol + 2 cidos grasos + grupo fosfato + grupo polar
Anfipticos, simultneamente hidroflicos e hidrofbicos: cabeza polar y colas hidrofbicas
Funcin estructural muy importante: las membranas celulares estn formadas
fundamentalmente por una doble capa de fosfolpidos, enfrentados por sus colas
hidrofbicas.

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Tema 1. Molculas biolgicas

5. Introduccin a los lpidos

d. Esteroides. Funcin reguladora: algunas hormonas y vitaminas son esteroides. Los
esteroides son molculas seal. Qumicamente estn formados por mltiples anillos y son
derivados del colesterol (se fabrica en el hgado, aunque tambin se incorpora en la dieta,
pudiendo ocasionar ateroesclerosis): hormonas sexuales (testosterona) , vitaminas (vit D),
cidos biliares, prostaglandinas, ..

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Tema 1. Molculas biolgicas

En los exmenes se ha preguntado ..

- Explique qu es la estructura primaria, secundaria y terciaria de una protena.

- Explique brevemente: enlace peptdico, estructura cuaternaria, ..
- Explique brevemente: estructura secundaria de las protenas, enzimas, ..
- Explique brevemente: hexosa, fosfolpido, .., aminocido, base nitrogenada
- Esquema de nucletido indicando los elementos que lo componen, en qu
macromolculas se encuentran, qu funcin tienen estas macromolculas
-Defina en dos lneas: enzima, nucletido, almidn
- Dibuje el esquema de un aminocido indicando los elementos que lo caracterizan.
Cmo polimerizan?, en qu tipo de macromolculas se pueden encontrar?
- En la imagen se muestra una macromolcula, cul es?, qu propiedades tiene?

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