BACTERIAS
3.3. Clasificacin
3.3.1. Definicin sistemtica
Denominacin de especies
Clasificacin taxonmica: una especie se agrupa en categoras
taxonmicas de orden superior clasificacin jerrquica:
jerrquica
especie gnero familia orden clase divisin reino dominio
(phylum)
Categoras taxonmicas
Categora
Taxn
Dominio
Bacteria
Reino
Proteobacteria
Phylum
Gamma proteobacteria
Clase
Zymobacteria
Orden
Enterobacteriales
Familia
Enterobacteriaceae
Gneros
Escherichia
Especies
coli
Sistema binomial
binomial::
SIEMPRE en cursivas
Subespecies
3. BACTERIAS
3.3. Clasificacin
3.3.2. Sistemas de clasificacin
Sistemas de clasificacin
No consideran relacin evolutiva
Taxonoma clsica
(fentica)
Taxonoma
numrica
Taxonoma
molecular
Similitud entre
caractersticas
fenotpicas
Similitud entre
caractersticas
fenotpicas
Similitud entre
caractersticas
genotpicas (ADN)
Agrupa mediante el
uso de mtodos num
numricos (comparacin)
Comparacin: morfologa,
fisiologa, metabolismo
(caract. visibles)
Semejanzas y
diferencias: coef.
asociacin la similitud
depende de la proporcin
de caracteres comunes
Comparacin entre
composicin del
ADN/ARNr:
%GC
hibridacin de ADN,
secuenciacin de ARNr
Taxonoma molecular
1. Contenido de guanina y citosina (%GC): tcnica ms simple
% GC la secuencia de bases vara con los cambios en la secuencia
completa (bacterias: % GC 24 - 76%)
Variacin: < 3% misma especie; > 10% diferente gnero
2. Hibridacin de ADN
ADN: tcnica ms directa
Desnaturalizacin de ADNbc mezcla de ADNmc enfriamiento
reasociacin de cadenas complementarias ADNbc hbrido
70% de similitud y <5% de diferencia en Tm misma especie
Manual de Bergey
Sistema ms usado y aceptado para la identificacin y
clasificacin de clulas procariotas
Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (19231984):
identificacin
Bergey's Manual of Systematic Bacteriology (1984 y 2001) 2
ediciones: clasificacin relacin entre microorganismos
1984: 1 Ed. clasificacin fenotpica
1984
fenotpica: Gram 4 volmenes
2001: 2 Ed. clasificacin filogentica
2001
filogentica: ARNr 5 volmenes
Cambios desde 1984 DOS Dominios, 2200 especies y 390 gneros
Edicin con arreglos y cambios en nomenclatura:
26 filos o divisiones
2 Archaea
26 Bacteria
Volumen I
Introduccin (taxonoma)
Clasificacin de Archaea (165 gneros) y bacterias fottrofas
Volumen II
Proteobacterias (Gram [-]): 538 gneros
Parte B: g -proteobacteria (Enterobacteriaceae)
Parte C: a - b - d - e -proteobacterias (Agrobacterium, Rhizobium)
Volumen III
Firmicutes (Gram [+] con %GC): 250 gneros en 40 familias
(Staphylococcus, Streptococcus, Clostridium, Bacillus)
Volumen IV
Bacterias Gram (-) sin caractersticas comunes: 153 gneros en 29 familias
(planctomicetes, espiroquetas, bacteroides, fibro- y fuso-bacterias)
Volumen V
Clasificacin de actinobacterias
actinobacterias: 200 gneros en 49 familias
Actualmente (2009) en revisin
3. BACTERIAS
3.3. Clasificacin
3.3.3. Grupos ms importantes
en Biotecnologa
Enterobacterias:: caractersticas
Enterobacterias
Clasificacin
Phylum: g -proteobacteria
Orden: Enterobacteriaceae
Gram
Negativo
Forma
Bacilos
Hbitat
Movilidad
Esporulacin
No
Req. O2
Anaerobios facultativos
Req. nutricionales
Simples
T ptima
22 - 37 C
Caracterstica
distintiva:
fermentan lactosa y
viven en el intestino
Importancia
Algunas causan intoxicaciones alimentarias
Patgenos para humanos y para plantas:
Escherichia coli:
Phylum: Firmicutes
Orden: Lactobacillales
Gram
Forma
Cocos y bacilos
Hbitat
Movilidad
Inmviles
Esporulacin
No
Req. O2
Anaerobias aerotolerantes
Gneros ms importantes:
Streptococcus y Lactobacillus
Algunas especies flora normal de la boca (placa y caries)
Algunos estreptococos
patgenos
22 - 37 C
Caracterstica distintiva:
fermentacin lctica
Sabores y aromas
aromas: c. lctico sabor; acetaldehdo aroma/sabor
Conservadores: cido lctico pH
Conservadores
Producto
Bacteria lctica
Lactococcus lactis
Queso azul
Lactococcus lactis
Queso mozzarella,
parmesano
Yogurt
S. thermophilus, L. delbrueckii
Mantequilla
Lactococcus lactis
Otros microorg
microorg..
Penicillium roqueforti
Leuconostoc + L. lactis
Formadoras de endosporas
endosporas::
caractersticas
Clasificacin
Phylum: Firmicutes
Clase: Bacilli, Clostridia, Mollicutes
Gram
Forma
Bacilos
Hbitat
Movilidad
Mviles e inmviles
Esporulacin
Si
Req. O2
Caracterstica
distintiva: produccin
de endosporas
Gneros ms importantes:
Bacillus (aerobios obligados y facultativos) y Clostridium (anaerobios estrictos)
Otros gneros importantes: Sporosarcina, Saccharopolyspora
Algunas especies son patgenas para animales exotoxinas
Importancia
Bacillus anthracis (aerobio, inmvil) exotoxina
exotoxina: ntrax
En productos derivados de animales (lana)
Actinomicetos:: caractersticas
Actinomicetos
Clasificacin
Phylum: Actinobacteria
Clase: Actinomycetales
Gram
Forma
Bacilos y cocos
Hbitat
Movilidad
Mviles e inmviles
Esporulacin
La mayora
Req. O2
Req. nutricionales
T ptima
Caracterstica
distintiva: formacin
de filamentos
ramificados (micelio)
Gneros ms importantes:
Streptomyces: producen el mayor nmero de antibiticos: bactericidas (neomicina,
estreptomicina) y fungicidas (nistatina), muchos metabolitos secundarios
Frankia: bacterias fijadoras de N2 viven en simbiosis con plantas
Algunos patgenos: Mycobacterium, Corynebacterium, Nocardia, Rhodococcus
Importancia
Descomposicin de residuos animales y vegetales
Participan en procesos de humificacin liberan molculas tiles
para la nutricin de las plantas
En ecologa descomponen materia orgnica en el suelo
Enzimas que degradan material vegetal, lignina y quitina
Importantes para la produccin de composta
Producen el olor a tierra mojada (geosmina)