El
ADN
es
un
largo polmero formado
por
unidades
repetitivas,
los nucletidos.18 19 Una doble cadena de ADN mide de 22 a 26 angstroms (2,2 a
2,6 nanmetros) de ancho, y una unidad (un nucletido) mide 3,3 (0,33 nm) de
largo.20 Aunque cada unidad individual que se repite es muy pequea, los
polmeros de ADN pueden ser molculasenormes que contienen millones
de nucletidos. Por ejemplo, el cromosoma humano ms largo, el cromosoma
nmero 1, tiene aproximadamente 220 millones de pares de bases.21
En los organismos vivos, el ADN no suele existir como una molcula individual,
sino como una pareja de molculas estrechamente asociadas. Las dos cadenas
de ADN se enroscan sobre s mismas formando una especie de escalera de
caracol, denominada doble hlice. El modelo de estructura en doble hlice fue
propuesto en 1953 porJames Watson y Francis Crick (el artculo Molecular
Structure of Nucleic Acids: A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid fue publicado
el 25 de abril de 1953 en Nature), despus de obtener una imagen de la estructura
de doble hlice gracias a la refraccin por rayos X hecha por Rosalind
Franklin.22 El xito de este modelo radicaba en su consistencia con las
propiedades fsicas y qumicas del ADN. El estudio mostraba adems que
la complementariedad de bases poda ser relevante en su replicacin, y tambin la
importancia de la secuencia de bases como portadora de informacin
gentica.23 24 25 Cada unidad que se repite, el nucletido, contiene un segmento de
la estructura de soporte (azcar + fosfato), que mantiene la cadena unida, y
una base, que interacciona con la otra cadena de ADN en la hlice. En general,
una base ligada a un azcar se denomina nuclesido y una base ligada a un
azcar y a uno o ms grupos fosfatos recibe el nombre de nucletido.
Cuando muchos nucletidos se encuentran unidos, como ocurre en el ADN, el
polmero resultante se denominapolinucletido.26
Componentes
Estructura de soporte: La estructura de soporte de una hebra de ADN est
formada por unidades alternas de grupos fosfato y azcar (desoxirribosa).27 El
azcar en el ADN es una pentosa, concretamente, la desoxirribosa.
cido fosfrico:
Bases nitrogenadas:
Las cuatro bases nitrogenadas mayoritarias que se encuentran en
el ADN son la adenina (A), la citosina (C), la guanina (G) y latimina (T).
Cada una de estas cuatro bases est unida al armazn de azcar-fosfato a
travs del azcar para formar el nucletido completo (base-azcar-fosfato).
Las bases son compuestos heterocclicos y aromticos con dos o
ms tomos denitrgeno, y, dentro de las bases mayoritarias, se clasifican
en dos grupos: las bases pricas o purinas (adenina y guanina), derivadas
de la purina y formadas por dos anillos unidos entre s, y las bases
pirimidnicas o bases pirimdicas o pirimidinas(citosina y timina), derivadas
de la pirimidina y con un solo anillo. 25 En los cidos nucleicos existe una
quinta base pirimidnica, denominada uracilo (U), que normalmente ocupa
el lugar de la timina en el ARN y difiere de sta en que carece de un grupo
metilo en su anillo. El uracilo no se encuentra habitualmente en el ADN,
slo aparece raramente como un producto residual de la degradacin de la
citosina por procesos de desaminacin oxidativa.
Adenina: 6-aminopurina.
Adenina:
En el cdigo gentico se representa con la letra A. Es un derivado de la
purina con un grupo amino en la posicin 6. Forma el
nuclesido adenosina (desoxiadenosina
en
el
ADN)
y
el
de los ngulos formados entre los azcares de ambas cadenas de cada par de
bases nitrogenadas, dos tipos de hendiduras alrededor de la superficie de la doble
hlice: una de ellas, la hendidura o surco mayor, que mide 22 (2,2 nm) de
ancho, y la otra, la hendidura o surco menor, que mide 12 (1,2 nm) de
ancho.51 Cada vuelta de hlice, que es cuando sta ha realizado un giro de 360 o
lo que es lo mismo, de principio de hendidura mayor a final de hendidura menor,
medir por tanto 34 , y en cada una de esas vueltas hay unos 10,5pb.
citosina
5-metil-citosina timina
Estructura de la citosina con y sin el grupo metilo. Tras la desaminacin, la 5-metilcitosina tiene la misma estructura que la timina.
Modificaciones de bases del ADN
La expresin de los genes est influenciada por la forma en la que el ADN est
empaquetado en cromosomas, en una estructura denominada cromatina. Las
modificaciones de bases pueden estar implicadas en el empaquetamiento del
ADN: las regiones que presentan una expresin gnica baja o nula normalmente
contienen niveles altos de metilacin de las basescitosina. Por ejemplo, la
metilacin de citosina produce 5-metil-citosina, que es importante para la
inactivacin del cromosoma X.61 El nivel medio de metilacin vara entre
organismos: el gusano Caenorhabditis elegans carece de metilacin de citosina,
mientras que los vertebrados presentan un nivel alto - hasta 1% de su ADN
contiene 5-metil-citosina.62 A pesar de la importancia de la 5-metil-citosina, sta
puede desaminarse para generar una base timina. Las citosinas metiladas son por
tanto particularmente sensibles a mutaciones.63 Otras modificaciones de bases
incluyen la metilacin de adenina en bacteriasy la glicosilacin de uracilo para
producir la "base-J" en kinetoplastos.64 65
Funciones biolgicas
Las funciones biolgicas del ADN incluyen el almacenamiento de informacin
(genes y genoma), la codificacin de protenas (transcripcin y traduccin) y su
autoduplicacin (replicacin del ADN) para asegurar la transmisin de la
informacin a las clulas hijas durante la divisin celular.
Genes y genoma
El ADN se puede considerar como un almacn cuyo contenido es la informacin
(mensaje) necesaria para construir y sostener el organismo en el que reside, la
cual se transmite de generacin en generacin. El conjunto de informacin que
cumple esta funcin en un organismo dado se denomina genoma, y el ADN que lo
constituye, ADN genmico.
El ADN genmico (que se organiza en molculas de cromatina que a su vez se
ensamblan en cromosomas) se encuentra en el ncleo celular de los eucariotas,
adems
de
pequeas
cantidades
en
las mitocondrias y cloroplastos.
En procariotas, el ADN se encuentra en un cuerpo de forma irregular
denominado nucleoide.76
El ADN codificante
Interacciones ADN-protena[editar]
Todas las funciones del ADN dependen de sus interacciones con protenas. Estas
interacciones pueden ser inespecficas, o bien la protena puede unirse de forma
especfica a una nica secuencia de ADN. Tambin pueden unirse enzimas, entre
las cuales son particularmente importantes las polimerasas, que copian las
secuencia de bases del ADN durante la transcripcin y la replicacin.
Protenas que unen ADN
Interacciones inespecficas
Las protenas estructurales que se unen al ADN son ejemplos bien conocidos de
interacciones inespecficas ADN-protenas. En los cromosomas, el ADN se
encuentra formando complejos con protenas estructurales. Estas protenas
organizan el ADN en una estructura compacta denominada cromatina.
En eucariotas esta estructura implica la unin del ADN a un complejo formado por
pequeas
protenas
bsicas
denominadas histonas,
mientras
que
82 83
en procariotas estn involucradas una gran variedad de protenas.
Las
histonas forman un complejo de forma cilndrica denominado nucleosoma, en
torno al cual se enrollan casi dos vueltas de ADN de doble hlice. Estas
interacciones inespecficas quedan determinadas por la existencia de residuos
bsicos en las histonas, que forman enlaces inicos con el esqueleto de azcarfosfato del ADN y, por tanto, son en gran parte independientes de la secuencia de
bases.84 Estos aminocidos bsicos experimentan modificaciones qumicas
de metilacin, fosforilacin yacetilacin,85 que alteran la fuerza de la interaccin
entre el ADN y las histonas, haciendo al ADN ms o menos accesible a losfactores
de transcripcin y por tanto modificando la tasa de transcripcin. 86
Otras protenas que se unen a ADN de manera inespecfica en la cromatina
incluyen las protenas del grupo de alta movilidad(HMG, High Mobility Group)
que se unen a ADN plegado o distorsionado. 87 Estas protenas son importantes
durante el plegamiento de los nucleosomas, organizndolos en estructuras ms
complejas para constituir los cromosomas88 durante el proceso decondensacin
cromosmica. Se ha propuesto que en este proceso tambin intervendran otras
protenas, formando una especie de "andamio" sobre el cual se organiza la
cromatina; los principales componentes de esta estructura seran la
enzima topoisomerasaII (topoIIalpha) y la condensina 13S.89 Sin embargo, el
papel estructural de la topoIIalpha en la organizacin de los cromosomas an es
discutido, ya que otros grupos argumentan que esta enzima se intercambia
rpidamente tanto en los brazos cromosmicos como en los cinetocoros durante
la mitosis.90
Interacciones especficas
Un grupo bien definido de protenas que unen ADN es el conformado por las
protenas que se unen especficamente a ADN monocatenario o ADN de hebra
sencilla (ssDNA). En humanos, la protena A de replicacin es la mejor conocida
de su familia y acta en procesos en los que la doble hlice se separa, como
la replicacin del ADN, larecombinacin o la reparacin del ADN.91 Estas protenas
parecen estabilizar el ADN monocatenario, protegindolo para evitar que forme
estructuras de tallo-lazo (stem-loop) o que sea degradado por nucleasas.
El factor de transcripcin represor del fago lambda unido a su ADN diana mediante
un motivo hlice-giro-hlice (helix-turn-helix).92
Sin embargo, otras protenas han evolucionado para unirse especficamente a
secuencias particulares de ADN. La especificidad de la interaccin de las
protenas con el ADN procede de los mltiples contactos con las bases de ADN, lo
que les permite "leer" la secuencia del ADN. La mayora de esas interacciones con
las bases ocurre en la hendidura mayor, donde las bases son ms accesibles.93
Las protenas especficas estudiadas con mayor detalle son las encargadas de
regular la transcripcin, denominadas por ello factores de transcripcin. Cada
factor de transcripcin se une a una secuencia concreta de ADN y activa o inhibe
la transcripcin de los genes que presentan estas secuencias prximas a sus
promotores. Los factores de transcripcin pueden efectuar esto de dos formas:
Como los ADN diana pueden encontrarse por todo el genoma del organismo, los
cambios en la actividad de un tipo de factor de transcripcin pueden afectar a
miles de genes.96 En consecuencia, estas protenas son frecuentemente las
dianas de los procesos de transduccin de seales que controlan las respuestas a
cambios ambientales o diferenciacin y desarrollo celular.