Se despliega una ventana con informacin relevante sobre el nombre la protena para la
cual codifica el gen, la funcin de la protena, la reaccin en la cual est inmiscuida la
protena, etc. Dar click en Nucleotide Sequence, que se encuentra en la columna derecha
dentro del men de operations.
https://www.dna.utah.edu/umelt/um.php
Introducir la secuencia de los genes asignados en cdigo FASTA, indicar 20 a 150C como
rango de temperatura a predecir y dar click en Run uMelt.
TAREA:
Dados los genes indicados en la tabla, obtener la siguiente informacin.
Nombre del gen
Nombre de la
protena
Funcin de la
protena
Longitud en
pares de bases
aroK
fruK
(pb)
Peso molecular
del gen
%GC
%AT
TM (C) Basic
Coeficiente de
extincin molar
NOTA: el coeficiente de extincin molar no se puede calcular directamente con los programas
enlistados pero se puede inferir con los datos arrojados en OligoCalc, considerar un paso de la luz
de 1cm.
1.- Para cada gen mostrar la impresin de pantalla en miniatura desde pgina de Wittwer Lab de la
curva de desnaturalizacin de la secuencia en funcin de la helicidad.
2.- Compare y discuta como cambia y por qu cambia la T M en funcin del %GC, de qu otra cosa
depende la TM?
3.- La desnaturalizacin del DNA estara asociada a un efecto hipercrmico o hipocrmico?