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Clase N19

Prof. Pedro Pieruzzini


Nombre del Autor

ADN, Organizacin De La Cromatina


La cadena de aminocidos, una estructura secundaria en la cual los grupos R o las cadenas laterales de
esos aminocidos comenzaban a interactuar entre s sobre todo por puentes de hidrgeno y conformaban
las alfa hlices y las lminas plegadas Beta. Adems de esos grupos laterales Acota los tipos de
aminocidos segn su clasificacin qumica: cadenas alifticas, cadenas aromticas, aminocidos cidos,
aminocidos bsicos, aminocidos con grupos sulfhidrilo
Entonces para la estructura terciaria esos grupos funcionales que tienen los aminocidos van a empezar a
tener diferentes tipos de interacciones:
1. El efecto Hidrfobo
2. Las fuerzas de Van Der Waals
3. Los enlaces Covalentes
4. Los puentes de Hidrgeno
Todo eso va a construir la estructura terciaria de la protena, la cual va a albergar por ejemplo:
Si agarrsemos y le entregsemos una molcula subunidad de metaglobina veramos que tiene una
conjugacin tridimensional que es capaz de albergar a este grupo en el grupo E, sin esa configuracin
tridimensional esa molcula de globina no estuviera funcionando puesto que no podra albergar al grupo
E; la estructura cuaternaria la vemos cundo tres o varias estructuras terciarias se unen y forman un
complejo macromolecular mucho ms grande, es decir est formado por dos o ms estructuras de
protenas de estructuras terciarias.
El msculo es rojo porque est formado de una cadena llamada Mioglobina (una protena similar a una
cadena de hemoglobina la cual posee una estructura cuaternaria).
Los aminocidos tienen entonces:
-Un grupo Carboxilo (COOH)
-Un grupo Amino (NH2)
-Una Cadena Lateral
Pueden clasificarse en esenciales y no esenciales, de 2 a 9 puede decirse que son oligopptidos pero es
un dato que vara segn libros o investigaciones de 10 en adelante polipptidos y ms de 100 son
protenas, en esa configuracin tenemos:
1. La estructura primaria que viene dada por la secuencia de aminocidos
2. La estructura secundaria que son dos: las alfa hlice y las lminas plegadas Beta; all utilizaramos
la primera variedad de enlaces que son los puentes de hidrgeno.
3. Estructura terciaria: en esta estructura ya empezamos a observar los otros tipos de fuerzas.
4. Estructura cuaternaria: tambin se observan otros tipos de fuerzas.
Es por ello que veremos protenas fibrosas y protenas globulares con (No logra distinguirse lo que el
prof. Dice en ese segmento) del comportamiento qumico de cada una. Para culminar este tema
concluimos que los bloques de construccin que para cada caso era: Nucletido, aminocido y
nuclesido, forman complejos macromoleculares que finalmente se van a expresar en complejos

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funcionales, en este caso podemos unir aminocidos, nucletidos y azcares y formar otras
estructuras.
Tenemos protones, neutrones y electrones y forman atomos, mientras que el Nitrgeno,
Hidrgeno, Carbono y Oxgeno forman las biomolculas, despus de esas biomolculas estn los
aminocidos, el glicerol, los cidos grasos y los nucletidos, todos esos constituyentes al final
forman
Vamos a empezar por la organizacin de la cromatina para conocer cmo los genes pueden generar
distintos tipos de rasgos e incluso enfermedades -como por ejemplo la Neurofribromatosis que
produce tumores de los trayectos nerviosos y produce todas estas formas (fig 1)- si todos tenemos la
misma cantidad de genes y la misma cantidad de cromosomas.

Fig.1 Caso Grave de Neurofibromatosis.


Los primeros trminos que debemos definir son: qu significa el genoma? Qu significa un gen? Para
definicin:
Genoma es la totalidad de distribucin gentica que tenemos, y est comprendida en el ADN, el cual
dirige todo, es el manual ya que especifica todas las molculas de ARN y protenas que el organismo
puede sintetizar. Dnde est contenido el genoma? En el ncleo y el ADN mitocondrial de la clula; se
encuentra dividido fsicamente en cromosomas y funcionalmente en genes.
Gen: (antes se deca que es la cadena o el conjunto de polinucletidos capaz de generar una protena)
pero se han descubierto una gran cantidad de genes que fabrican protenas por lo que la definicin
actual nos dice que es un segmento del ADN especfico que contiene la informacin necesaria para la
produccin de ARN (que hay varios tipos) entonces un gen no es una protena ni fabrica una protena
sino molculas de ARN funcionales.

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Hay unos tipos de ARN llamados micro ARN que regulan la expresin de un gen.
Conocemos entonces que el ADN es una molcula de polinucletidos que tiene una polaridad dada por los
carbonos a los que est unido en el grupo fosfato (los carbonos de la ribosa: 3 y 5) que son cadenas anti
paralelas y complementarias en las que vara slo el orden de las bases nitrogenadas (en la fig. 2 veremos
una molcula de ADN que forma un segmento de ARN funcional por lo tanto en ese segmento de ADN debe
haber un gen; esa molcula ARN va a producir una secuencia de aminocidos que en primera instancia
viene dada por la cadena primaria).

(Fig.2 Molcula de ADN formando un segmento de ARN funcional)


El genoma es quien ordena en donde debe colocarse cada aminocido, pero intrnsecamente las
propiedades qumicas de esos aminocidos hacen otra funcin que equivale al proteoma (totalidad de las
protenas codificadas por un genoma) ya que el ADN no da la orden de interactuar un grupo fosfato de un
aminocido con el grupo hidroxilo de otro sino que la formacin de la protena es un hecho intrnseco, esa
instruccin que da el ADN tambin influye en el plegamiento de las protenas porque la ubicacin de esos
grupos funcionales va a generar la formacin de estructuras secundarias, terciarias y cuaternarias.
El dogma central de la biologa molecular dice que una molcula de ADN es capaz de replicarse y
formar otra molcula de ADN porque si el ADN no fuese capaz de replicarse entonces cmo podramos
crecer? Si necesitamos para todas las clulas el genoma, Cmo nos reproducimos?; el ADN es
intrnsecamente capaz de replicarse y ese proceso se llama Replicacin, a su vez ese ADN es capaz de
formar una molcula que es muy similar (casi idntica) a excepcin de dos cosas: el carbono 2 de la
ribosa es diferente y una base nitrogenada pirimdica que en vez de Timina es Uracilo, entonces el ADN es
capaz de reproducir una molcula similar pero diferente a ella. La diferencia entre la transcripcin y la
replicacin fundamentalmente desde el punto de vista qumico es que producimos una molcula casi igual
pero tiene dos fundamentales menos, y a esto le llamamos transcripcin. Luego de dicha transcripcin va
un mensaje y se transforma en un idioma totalmente distinto, (ejemplo: estar hablando en espaol y
hacer la traduccin al ingls) es decir que cambian de una cadena de poli nucletidos a una de poli
pptidos, y a esto se le conoce como traduccin.

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En las clulas eucariotas la informacin va prcticamente en un solo sentido, pero hay unos
organismos los cuales pueden producir ADN a partir de un ARN, eso sucede con el virus del SIDA (los
retrovirus). Esto nos da a concluir que la primera molcula que apareci fue el ARN .
Hay que empezar a preguntarnos por qu el ADN tiene esa estructura?, por qu es una doble
hlice?, porque el ARN es monocatenario
Nota: -Los DNA y RNA estn formados por repeticiones de monmeros (nucletidos), formando
polmeros (monocatenarios) llamados cadenas. Debido a la complementariedad de las bases nitrogenadas
que componen a los nucletidos, se unen en dos cadenas torsadas dando un polmero bicatenario. El DNA
que componen todos los genomas celulares es bicatenario. Existen muchos virus con genoma de DNA
simple cadena (monocatenarios). Tambin hay virus de genomas de RNA bicatenarios. Y ejemplos de RNA
monocatenario stens el clsico del ARN mensajero. RNA de las subunidades ribosomales tambin est en
"doble cadena", pero es una sola hebra que se enrolla en s misma.-.
La informacin gentica tiene que estar protegida, y una forma de protegerla es crear el esqueleto o la
armazn que proteja las bases nitrogenadas que son las que llevan la informacin, y que stas
interaccionen entre s y no estn expuestas a los cambios qumicos normales del medio, sta es la razn
fundamental, a diferencia del ARN, para el que no es necesario tanta proteccin puesto que si se degrada
pues sencillamente se produce ms. Pero si el ADN se daa si se encuentran problemas, (uno de los
ejemplos ms claros de ste dao del ADN es la aparicin del cncer). El ADN codifica los caracteres
generados, como formar un ser humano, contiene la informacin para el mismo producir otra molcula de
ADN y replicarse y contiene la informacin que dar origen a las protenas.
Todo esto fue iniciado por Gregorio Mendel, nacido en 1822 a pesar de las persecuciones y
obstaculizaciones de la iglesia catlica el profesor hace una breve resea histrica de dichos obstculos
y cita a Galileo Galilei.
El ADN se transcribe a un ARN mensajero, despus dicho ARNm pasa por el poro nuclear, se va al
citoplasma y all se unen los ribosomas para fabricar una protena: ese es el flujo de la informacin
qumica y sigue el proceso.
Como se dieron cuenta de que las bases nitrogenadas se cambiaban? Eso fue propuesto por Watson, ms
antes de esa teora haba otra que deca que exista una relacin casi de 1:1 de cada base es decir, 1:1 de
guanina y citosina por ejemplo por lo que concluy que en una cadena bicatenarias (complementaria y
anti paralela) los porcentajes de ademina y timina eran iguales y en general los porcentajes de purinas y
pirimidinas eran iguales, por lo tanto podemos calcular que en una muestra de ADN tenemos el mismo
porcentaje de purinas y pirimidinas (10% guanina, 10% de citosina) gracias a todos estos descubrimientos
se fueron armando las primeras teoras del ADN.
El contenido del genoma entonces, est guardado fsicamente en cromosomas, funcionalmente en genes,
los cromosomas tienen una morfologa que permite al ADN ser repartido en la divisin celular y tambin
ser multiplicado.
El cromosoma posee:
*Telmero
*Centrmero
*Origen de Replicacin
El Telmero se encarga de proteger la informacin gentica del cromosoma en sus extremos ya que el
cromosoma es una hebra de ADN gigantesca empaquetada.

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El Centrmero es una regin en la cual, cuando la clula se divida, toda la informacin sea arrastrada
hacia las clulas diana; el citoesqueleto (los microtbulos) se asocia a los centrmeros para halar hacia
cada polo los centrmeros en la anafase.
Origenes de replicacin: donde se une una protena denominada Adeintri (No logro definir lo que el
prof. Dice) y va a permitir que el ADN contenido en el cromosoma (no logra escucharse tampoco)
Empezamos a definir trminos puesto que ya estudiamos la estructura molecular del ADN, por lo que
ahora veremos como el ADN se asocia con protenas y forman la denominada CROMATINA que es la unin
de ese ADN con unas protenas llamadas histonas y otras llamadas no histonas, la cromatina tiene su
nombre del griego cromos (color) ya que en los estudios citogenticos sta se pinta de distinto color, la
cromatina es la molcula de ADN unida a protenas que son histonas y no histonas. La organizacin de la
cromatina en la microscopa electrnica se observa como cuentas de rosario, es la organizacin del
nucleosoma en su parte ms distendida (fig 3)

Fig 3.
Pero generalmente se ve en la forma de segmentos que se forman con ttradas de nucletidos de 30nm

stos seran los constituyentes de la Eucromatina, donde la cromatina est ms condensada, el


nucleosoma est compuesto por una protena que forma una estructura similar a la de una torta,
(ejemplo vulgar para la comprensin) que a su vez es picada en ocho pedazos, luego le enrollan una cinta
y la unen a otra torta que tiene al lado, as sucesivamente; esas molculas de histonas estn formadas por
2 protenas llamadas histonas H2A, 2 H2B, 2 H3 y 2 H4 (2+2+2+2= 8) formando el octgono (fig.4),
adems el ADN da la vuelta por esas histonas formando esas cuentas de rosario que se denomina ADN
Linkers o partes de unin de la torta por lo que algunos libros definen el nucleosoma como el ADN
enrollado en esa histona ms el linker, que en conjunto aproximadamente tiene 200 nucletidos, si

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contamos los nucletidos despus de colocarle enzimas degradadoras del linker a la organizacin nuclear
de cromatina y nucleosoma veremos que esa organizacin tiene aproximadamente 147 nucletidos; ms
sin embargo el linker puede variar y tener entre pocos nucletidos hasta 80, se promedi a 200.

Fig.4

La organizacin de las histonas a nivel proteico bidimensional donde podemos observar las alfa hlices
unidas a travs de un look (no estoy segura del trmino puesto que no logr entender lo que dijo el
profesor) por ser cadenas polipeptdicas y van formando su tortica, alrededor de esas histonas en la
parte de afuera veremos la parte N terminal (una cadena polipeptdica tiene una parte N terminal y
una parte C terminal). Las cadenas laterales de los aminocidos cumplen la funcin de las protenas ya
que ellas poseen el grupo qumico necesario para hacer algo, en el caso de estas cadenas laterales de
histonas tenemos que estn mayormente constituidas por lisina y arginina que tienen pH de 7,35 y
son cadenas que estn cargadas positivamente, mientras que el ADN est cargado negativamente debido a
la presencia de los grupos fosfato por lo que hay interacciones electrostticas entre la cadena de ADN por
los grupos fosfato que son de alta negatividad con las cadenas laterales de las histonas que forman la
torta (razones qumicas y energticas) y eso les permite enrollarse a travs de ellos. Las histonas
representan una de las protenas ms conservadas de la evolucin, prcticamente estn relacionadas
puesto que son casi la misma cadena que la del perro, el gato, el loro, el ratn, el grillo, que la de los
parsitos, etctera. Si hay una mutacin en el gen que codifica la histona es atroz porque no se puede
configurar la clula, entonces tenemos aqu como esa molcula de ADN est enrollada sobre el octmero
de histonas, debemos colocar especial nfasis en la cola de la histona H3 para, al ver como se enrolla
observar que no es totalmente lisa pero la molcula de ADN va haciendo sus interacciones con esa
molcula; una de las cosas que tenemos claras es que el ADN es doble cadena, al agregarle la histona el
ADN esta enrollado en esa doble cadena en el peptgeno (no estoy segura de la palabra, en la
grabacin no se entiende muy bien) ; como hacemos ahora para ver el ADN si la produccin est
aglutinada dentro?. Existen otros tipos de protenas que interaccionan con el ADN y que se encuentran
dentro de las no histonas, se conocen como complejos remodeladores de la cromatina.
Qu se necesita para cumplir con el dogma central de la biologa molecular? : Tener la molcula de ADN
en su forma de doble hlice, porque es la nica manera en la cual se puede plegar en los cromosomas las
enzimas necesarias para replicarlos y tambin se puede crear ARN polimerasa que va a formar el ARN

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funcional, es necesario modificar la estructura de la cromatina para poder tener la doble cadena y eso es
lo que hace el complejo remodelador de la cromatina : se ensambla en la torta y le da vuelta, cada
vez que cumple un ciclo utiliza una molcula de ATP y al dar vuelta tras vuelta va desenrollando la
torta, la clula necesita dividirse, la fase de replicacin de ADN es la fase S1, la produccin de ARN
est en todas las fases a excepcin de la fase S1. Es Necesario remodelar la cromatina para difundir esa
molcula o esa cadena de ADN y lo hacemos de esa forma (a travs del complejo remodelador).
En la fig.5 El nucleosoma est enrollado y si agregamos el complejo remodelador est menos remodelado,
eso permite que en esas regiones se puedan unir las enzimas que lo replican y que lo transcriben, para
todo eso necesita ATP, l se desenrolla continuamente y va girando la histona en contra de las agujas del
reloj. Otra de las modificaciones que hacen esos complejos remodeladores o modificadores de la
cromatina es unirle otras protenas llamadas Histonas Chaperonas que eliminan la parte H2A y H2B y le
quitan la mitad a la torta por lo que queda ms desenrollada, las chaperonas se unen a los dmeros que
quitaron y no le permiten ensamblarse nuevamente, as adems se hace ms accesible la protena.

Fig.5

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