_________________________________________________

UNIVERSIDAD AUTNOMA CHAPINGO

DEPARTAMENTO DE PARASITOLOGA AGRCOLA

DIAGNSTICO MOLECULAR DE
FITOPATGENOS

SPTIMO AO

_____________________________________________________
2010

DATOS GENERALES

Unidad Acadmica:

Departamento de Parasitologa Agrcola

Programa Educativo:

Ingeniero Agrnomo Especialista en Parasitologa

Agrcola

Nivel Educativo:

Licenciatura

Disciplina:

Sanidad Vegetal

Asignatura:

Deteccin Molecular de Fitopatgenos

Carcter:

Optativa

Tipo:

Terico-Prctico

Prerrequisitos:

Bioqumica, Gentica Aplicada, Virologa Agrcola,

Nematologa Agrcola y Bacteriologa Agrcola

Profesor:

M.C. Dimas Meja Snchez

M.C. Camilo Hernndez Juarz

Ciclo Escolar:

2010-2011

Ao:

Sptimo

Semestre:

Primero

Ao de Registro:

2004

Ao de Modificacin:
Horas Teora/Semana:

1.5

Horas Prctica/Semana:

Horas Totales del Curso:

150

RESUMEN DIDCTICO
La materia se impartir en el Primer Semestre de 7 ao de esta Especialidad. Es una
materia optativa terico-prctica que pertenece a la disciplina de sanidad vegetal. Tiene
relacin de forma horizontal con las materias de entomologa agrcola, horticultura,
micologa agrcola, parasitologa forestal y tecnologa de granos y semillas, de forma
vertical se relaciona con las materias virologa agrcola, bacteriologa agrcola,
nematologa agrcola y entomologa agrcola.
El contenido del curso est diseado para que los estudiantes puedan analizar y aplicar,
los conceptos y principios fundamentales de la biologa molecular en la fitopatologa. A
partir de datos obtenidos en laboratorio, el estudiante ser capaz de utilizar y disear
modelos moleculares que le permitan resolver problemas en la identificacin de virus,
bacterias, hongos, nematodos, fitoplasmas y organismos modificados genticamente,
mediante la comparacin con bases de datos internacionales va internet en una
computadora personal y literatura especfica.
La metodologa de aprendizaje se desarrollar en un aula mediante clases programadas y
en el laboratorio de Bacteriologa Agrcola del Departamento de Parasitologa Agrcola,
as como laboratorios del Centro Nacional de Referencia Fitosanitaria, Facultad de
Estudios Superiores de Iztacala dependiente de la UNAM y CIMMYT mediante prcticas.
Se har uso de material impreso, audiovisual, calculadora, material y equipo de
laboratorio y computadora personal como recursos didcticos.
La evaluacin se realiza a partir de tres exmenes, uno relacionados con el aspecto
terico y dos con elementos prcticos, cuya estructura y contenido medir las habilidades
adquiridas por el alumno, tambin se toma en cuenta la participacin productiva que el
alumno desarrolle en clases y tareas extra clase.

PRESENTACIN
La asignatura es fundamental para el desarrollo del futuro profesional fitosanitario ya que
le proporciona habilidades que le permiten la deteccin e identificacin de plagas y
organismos genticamente modificados. El estudiante tendr la capacidad de aplicar y
modificar estas metodologas moleculares mediante el uso de equipo sofisticado,
computadora personal y bases de datos genticas internacionales. Los conocimientos
adquiridos le permitirn desarrollarse en aspectos como signatario de laboratorio,
inocuidad alimentaria y elaboracin de estrategias integradas de manejo.

PROBLEMA: La deteccin de plagas.

OBJETO DE ESTUDIO: Tcnicas moleculares aplicadas a la deteccin de plagas.
SISTEMA DE CONOCIMIENTOS: Aspectos histricos, de aplicacin y situacin actual
de las tcnicas moleculares. Sustento legal para el uso de las tcnicas moleculares: virus,
bacterias, hongos, nematodos, insectos de inters cuarentenario y organismos
genticamente modificados. Macromoleculas y Gentica Molecular: Estructura de las
protenas, Estructura de los cidos nucleicos, Transferencia de la informacin gentica en
eucariontes y procariontes, Replicacin, Trascripcin, Traduccin y Regulacin, Fuentes
de cidos nucleicos para el diagnstico molecular de fitopatgenos, Tcnicas de

laboratorio, Equipo para biologa molecular y su funcin,Reactivos para biologa

molecular, uso y precauciones, Soluciones Molares y Normales. Separacin de
molculas: Electroforsis, ADN y ARN. Tcnicas Moleculares ms frecuentes: AFLPs,
RAPS, PCR, Hibridacin y Secuenciacin.

UNIDAD I.- RELACION DE LAS TCNICAS MOLECULARES CON LA

PROTECCION FITOSANITARIA.
Horas:15 Sesiones: 10 de 1.5 hrs
Objeto de estudio: Los aspectos histricos y legales del diagnstico molecular
Objetivo especfico: Analizar la importancia de las tcnicas moleculares como
herramienta fundamental en deteccin e investigacin en la Parasitologa Agrcola, los
mbitos histricos actuales y legales.
Sistema de Conocimientos

Sistema de Habilidades

1.1. Revisin histrica.

Describir los elementos bsicos que

permitieron el desarrollo de la tecnologa
molecular

1.2. Aplicacin y evolucin de las tcnicas

moleculares.

Interpretar los usos de las tcnicas

moleculares en la proteccin fitosanitaria

1.3. Normatividad Nacional e Internacional.

Analizar los aspectos legales que justifican

el uso de tcnicas moleculares como
herramienta de diagnstico

1.4. Plagas cuarentenazas para Mxico.

Analizar las diferentes plagas de

importancia cuarentenaria para Mxico en
donde se usa frecuentemente la tecnologa
molecular para su deteccin e identificacin

1.5.
Organismos
modificados.

Analizar los aspectos legales y tcnicos

relacionados con los transgnicos.

genticamente

UNIDAD II.- PRINCIPIOS DE BIOLOGA MOLECULAR MICROBIANA.

Horas:15 Sesiones: 10 de 1.5 hrs
Objeto de estudio: Las macromolculas y la informacin gentica.
Objetivo especfico: Describir las bases bioqumicas de las tcnicas moleculares.

Sistema de Conocimientos

Sistema de Habilidades

2.1. Macromolculas.
2.1.1. Acidos nucleicos
2.1.2. Aminocidos
2.1.3. Protenas

Describir la estructura y funcin de los

molculas relacionadas con la transferencia de
la informacin gentica

2.1. Trasnferencia de la informacin

gentica,procariontes y eucariontes
2.1.1. Replicacin del ADN
2.1.2. Transcripcin del ARN
2.1.3. Sntesis de protenas
2.1.4. Regulacin de la expresin
gnica.
2.2. Fuentes de cidos nucleicos para el
diagnstico molecular de fitopatgenos.

Describir la transferencia de la informacin

gentica como base de la tecnologa molecular
aplicada en la deteccin molecular de plagas.
.

UNIDAD III.- TCNICAS MOLECULARES.

Horas:15 Sesiones: 10 de 1.5 hrs
Objeto de estudio: La metodologa molecular aplicada.
Objetivo especfico: Aplicar las tcnicas moleculares ms utilizadas para la deteccin e
identificacin molecular de plagas y organismos genticamente modificados.

Sistema de Conocimientos
3.1. AFLPs.
3.2. RAPS.
3.3. PCR.
3.4. Hibridacin de cidos nucleicos.
3.5. Secuenciacin.
3.6. Clonacin molecular

Sistema de Habilidades
Describir la estructura y funcin de los
molculas relacionadas con la transferencia de
la informacin gentica

UNIDAD IV.- SISTEMA DE CONOCIMIENTOS PRCTICOS.

Horas:15 Sesiones: 10 de 1.5 hrs
Objeto de estudio: Las tcnicas moleculares.
Objetivo especfico: Desarrollar las metodologas moleculares para la identificacin y
deteccin de plagas.

Sistema de Conocimientos

Sistema de Habilidades

4.1. Equipo y reactivos para biologa

molecular, su funcin y precauciones.

Analizar la funcin y los riesgos de los

equipos
y reactivos de las tcnicas
moleculares con el objeto de asegurar la
aplicacin y reducir los riesgos a la salud.

4.2. Preparacin de soluciones para Aplicar

fundamentos
de
qumica
Biologa Molecular (Molar, Normal).
matemticas para la preparacin
soluciones amortiguadoras y en general.
4.3. Mtodos de extraccin de ADN.

y
de

Separar los cidos nucleicos como base de su

manipulacin.

4.4. Mtodos de extraccin de ARN.

4.5. Electroforsis

Separar las biomoleculas para su posterior

manipulacin.

4.6. Reaccin en Cadena de la

Polimerasa (PCR).
4.6. Bacterias fitopatgenas
4.6.2. Virus fitopatgenos
4.6.3. Nematodos fitoparsitos
4.6.4. Hongos fitopatgenos
4.6.5. Insectos de inters agricola
4.6.6. Organismos Genticamente
Modificados.

Aplicar
la
metodologa
molecular
en
fitopatologa, entomologa y organismos
genticamente modificados.

4.7. Inmunocaptura-PCR.
4.8. RT-PCR
4.9. Tcnica RAPS
4.10. Secuenciacin

METODOLOGA
La metodologa a seguir para el aprendizaje consistir en la exposicin, explicacin y
demostracin en aula y en laboratorio de las diferentes herramientas moleculares
aplicables a fitopatgenos. Los alumnos implementarn las herramientas aprendidas en la
Parasitologa Agrcola.

EVALUACIN
CRITERIO
2 exmenes tericos
2 exmenes prcticos
Tareas trabajos extraclase

PORCENTAJE
40 %
50 %
10%

BIBLIOGRAFA BASICA
Mullis. K. B., and Faloona, F. 1987. Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase
catalyzed chain reaction. Method. Enzymol. 155-335. Stryer, L. 1997. Bioqumica. Tomo
II.Ed Revert, S.A Twyman, R.M.1999. Advanced Molecular Biology. Ed. Bios Scientific
Publisher Wang, K., R., Zhong, Q. H., Khadhair, A. H., and Hiruki, C. 1994. DNA
amplification based on polymerase chainreaction. Phytopathology 83:621-624.
Ausubel, F. M., R. Brent, R. E. Kingston, D.D. Moree, J.G. Seidman, J. A. Smith and K.
Struhl. 1991. Current protocolus in Molecular Biology. John Wiley y Sons. USA.

BIBLIOGRAFA COMPLEMENTARIA
Sitios de internet recomendados:
http://www.accessexcellence.org/AB/
http://www.biotech.ca/EN/what_history.html
http://students.washington.edu/radin/history.htm
http://www.woodrow.org/teachers/bi/1993/intro.html
http://www.friedli.com/herbs/phytochem/proteins.html
http://cmp.ameslab.gov/~jrmorris/protein/aminoacids.html
http://www.agsci.ubc.ca/fnh/courses/food410/protein/1_12.htm
http://esg-www.mit.edu:8001/esgbio/chapters.html
http://esg-www.mit.edu:8001/esgbio/dogma/repl.html
http://www.ultranet.com/~jkimball/BiologyPages/D/DNAReplication.html
http://www.accessexcellence.com/AB/GG/possible.html
http://www.uct.ac.za/microbiology/tutorial/RNA%20virus%20replication.htm
http://opbs.okstate.edu/~melcher/MG/MGW2/MG23.html
http://www.sparknotes.com/biology/molecular/dnatranscription/summary.html
http://www.duke.edu/web/MAT/jennifer_sohn/unit/translation_oh.htm
http://psyche.uthct.edu/shaun/SBlack/geneticd.html
http://www.ultranet.com/~jkimball/BiologyPages/C/Codons.html
http://www.microbiologia.com.ar/genetica/sintesis-proteinas.html
http://www.lafacu.com/apuntes/quimica/acsnucl/bioqui10/default.htm