QUMICA Y
ESTRUCTURA
DEL ADN
FRIEDRICH MIESCHER
(1844-1895)
SUIZA
FRIEDRICH MIESCHER EN
1871 AISL DEL NCLEO DE
LAS CLULAS DE PUS
(GLOBULOS BLANCOS) UNA
SUSTANCIA CIDA RICA EN
FSFORO QUE LLAM
"NUCLENA".
EL NOMBRE DE CIDO
NUCLEICO PROCEDE DEL DE
"NUCLENA" PROPUESTO
POR MIESCHER.
Albrecht Kossel y
Phoebus Levene
De los aos 1885 a
1901 aislaron y
nombraron los cinco
componentes orgnicos
de los cidos
nucleicos Adenina.
Timina, Guanina,
Citocina y Uracilo.
GRUPO OH EN
EL CARBONO
2 DE LA
PENTOSA
ADN
ARN
CIDOS FOSFRICO
BASES NITROGENADAS
1) LAS BASES PRICAS
DERIVADAS DE LA PURINA
(FUSIN DE UN ANILLO
PIRIMIDNICO Y UNO DE
IMIDAZOL) SON LA ADENINA
(6-AMINOPURINA) Y LA
GUANINA (2-AMINO-6HIDROXIPURINA).
2) LAS PURINAS SE UNEN AL C1
DEL AZCAR MEDIANTE UN
ENLACE N-GLUCOSDICO A
TRAVS DEL N9 DEL ANILLO
IMIDAZOL
BASES NITROGENADAS
1) LAS BASES PIRIMIDNICAS
(DERIVADAS DE LA
PIRIMIDINA) SON LA
TIMINA (2,6-DIHIDROXI5-METILPIRIMIDINA O
TAMBIN LLAMADA 5METILURACILO), CITOSINA
(2-HIDROXI-6AMINOPIRIMIDINA) Y
URACILO (2,6DIHIDROXIPIRIMIDINA)
2) LAS PIRIMIDINAS SE
UNEN AL C1 DEL AZCAR
MEDIANTE UN ENLACE NGLUCOSDICO A TRAVS
DEL N3 DEL ANILLO
BASES NITROGENADAS
1) LAS BASES NITROGENADAS QUE FORMAN
NORMALMENTE PARTE DEL ADN SON:
ADENINA (A), GUANINA (G), CITOSINA Y
TIMINA (T)
2) LAS BASES NITROGENADAS QUE FORMAN
PARTE DE EL ARN SON: ADENINA (A),
GUANINA (G), CITOSINA (C) Y URACILO (U).
POR TANTO, LA TIMINA ES ESPECFICA DEL
ADN Y EL URACILO ES ESPECFICO DEL ARN
Nuclesido
Nucletido
Adenina
Adenosina
cido Adenlico
Guanina
Citosina
Timina
Uracilo
Guanidina
Citidina
Timidina
Uridina
cido Guanlico
cido Citidlico
cido Timidlico
cido Uridlico
James D. Watson
Francis H. C. Crick
Maurice H. F. Wilkins
DNA-B
ALTERNATIVAS
AL MODELO DE
LA DOBLE
HLICE
LA TRIPLE
HLICE DEDE
ADN
POSIBLES
TRIADAS
BASES
N9
Me
Me
O
R
N3
N1
H
N
O
H
H N
1
N3
N7
N1 R
R
O H
N9
N3
N3 H
N1
H
N
H
N
H
N7
N1
N3
H
N
N1 R
N3
N1
O
N9
R
N3
d(C+-GC)
d(T-AT)
N7 R
O
N1
N3
N H
N7
N1
N
H
N3
N9
R
d(G-GC)
H
N
R
N3
N1
O
H
H
N
H
H
N
H
N7
N1
N3
N9
R
d(G-G-C)*
N3
R
N9
N3
Me
O
N7
N1
O
N3
N1
O
N1
H
H
H
N7
N1
N3
d(A-AT)
N9
R
R
N7
N9
Me
N H
R
N3
N1
O
R
N1
H
H
N7
N1
N3
d(T-AT)*
Me
N3
N9
R
LA PRESENCIA DE LA
TERCERA CADENA ROMPE
EL SURCO MAYOR EN 2
PARTES
Me
MM groove
Me
O
R
N3
N1
O
O
H
H
N7
N1
N3
m groove
N9
R
N3
N1 R
O
mM groove
Human Genome
Promoters
UpStreams
DownStreams
Introns
Exons
Coding
0.35
Probability (%)
0.30
0.25
0.20
0.15
0.10
0.05
0.00
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
SE FORMAN FUNDAMENTALMENTE
EN SECUENCIAS RICAS EN
POLIGUANINAS
CLAVES PARA LA ESTABILIZACIN
DE LOS TELMEROS
UNA DE LAS DIANAS MS
PROMETEDORAS EN TRATAMIENTO
ANTINEOPLSICO
ESTRUCTURA
CRISTALINA
DEL ADN-G
EL GENOMA
BACTERIANO ES
UN NUCLEOIDE
SUPERENROLLAMIENTO
DEL ADN
COMO SE PUEDE
ENPAQUETAR TANTO ADN
EN TAN POCO ESPACIO ?
EL SUPERENRROLLAMIENTO
R
L
C
Electroforesis en gel de
agarosa 0.8% del plsmido
pUC18 sometido a diferentes
dosis de radiacin gamma.
Lneas 1-7, dosis de 0, 50, 100,
150, 200, 300, 400 Gy
respectivamente.
R:
Forma
relajada
o
covalentemente abierta
L: forma lineal
C: forma superenrrollada o
covalentemente cerrada
DEFINICIN
MOLECULAR DEL
GEN
ESTRUCTURA DEL
OPERON BACTERIANO
ORGANIZACIN
CROMOSMICA DE
LOS GENES Y DEL
ADN NO
CODIFICADOR
1984
1986
1990
1991
Dominio
Reinos
Filo
o
Divisiones
Clases
Ordenes
Familias
Gneros
Especies
rbol de la Vida
EL ALTO NIVEL DE
POLIMORFISMO
EXISTENTE EN LAS
SECUENCIAS
MICROSATLITES
PERMITE HACER ANLISIS
DE DIVERSIDAD GENTICA
DE UTILIDAD EN EL
MEJORAMIENTO
GENTICO DE PLANTAS
Patrones microsatlites obtenidos para variedades
cubanas de aguacatero usando combinacin AM8.
EL ADN
MOVIL
1) La transposicin de un
elemento IS es un evento raro
que solo tiene lugar en una de
105-107 clulas por generacin,
dependiendo del elemento IS
2) Se conocen alrededor de 20
elementos IS en bacterias
3) Los elementos IS se
trasponen ms o menos de
manera aleatoria, por lo que se
entiende que sus secuencias
dianas para la insercin pueden
encontrarse en diferentes
regiones del genoma
EL ELEMENTO P DE
DROSOPHILA MELANOGASTER,
FUNCIONA COMO UN
TRANSPOSN DE ADN, Y SE
MUEVE MEDIANTE UN
MECANISMO DE CORTE Y
PEGADO SIMILAR AL
UTILIZADO POR LAS
SECUENCIAS DE INSERCIN
BACTERIANAS.
ALGUNOS RETROTRANSPOSONES
CONTIENEN LTR Y SE COMPORTAN
COMO RETROVIRUS
INTRACELULARES
SE PIENSA QUE UN
MECANISMO SIMILAR
GENERA EL
INTERMEDIARIO DE ARN
DURANTE LA
TRANSPOSICIN DE LOS
RETROTRANSPOSONES
MODELO DE LA TRANSCRIPCIN
INVERSA DEL ARN GENMICO
RETROVIRAL A ADN.
En este modelo se genera una
copia de ADN bicatenario a partir
del genoma de ARN monocatenario
de un retrovirus.
1) El ARN genmico se empaqueta
en el virin con tRNA celular
especfico del retrovirus hibridado
con una secuencia complementaria
denominada sitio de unin del
cebador (PBS).
2) El ARN retroviral tiene una
secuencia terminal corta R de
repeticin directa en cada extremo
3) La reaccin global la lleva a
cabo la Transcriptasa reversa, la
cual cataliza la polimerizacin. La
RNasaH digiere la hebra de ARN
del hbrido ADN-ARN.
4) El proceso completo produce una
molcula de ADN de doble hebra
que es ms larga que el ARN molde
y tiene una repeticin terminal
larga (LTR) en cada extremo.
Las diferentes regiones no se
muestran a escala.
MECANISMO PROPUESTO DE LA
TRANSCRIPCIN INVERSA E
INTEGRACIN DE LOS LINE
1) Luego que ocurre la trascripcin y
modificacin (poli(A)) del ARN LINE,
los productos ORF1 y ORF2 se unen a
este ARN formando un complejo que
transporta el ARN al ncleo. ORF2
realiza cortes escalonados en el ADN
cromosmico a cada extremo una
secuencia rica en A/T.
2) La trascripcin inversa del ARN
LINE por medio de ORF2 se ceba
mediante la secuencia rica en T, la
cual se hibrida con la cola de poli(A)
del RNA LINE
3) ORF2 transcribe de manera inversa
el ARN LINE
MECANISMO PROPUESTO DE LA
TRANSCRIPCIN INVERSA E
INTEGRACIN DE LOS LINE
4 y 5) La trascripcin de la hebra de ADN
por la protena ORF2 contina, cambiando
a la hebra de simple cadena cromosmica
6) Luego las enzimas celulares hidrolizan el
ARN y extienden el extremo 3 de la hebra
superior de DNA cromosmico,
remplazando la hebra de ARN LINE con
ADN.
7) Por ltimo, los extremos 3 y 5 de la
hebra de ADN se ligan y se completa la
insercin.
El proceso genera una repeticin directa
corta en el sitio de insercin debido a la
escisin escalonada inicial de las dos
hebras de ADN cromosmico.
ORGANIZACIN
ESTRUCTURAL DE
LOS CROMOSOMAS
EUCARIOTES
1) CUANDO SE EXTRAE
LA CROMATINA DE LAS
CLULAS EN UN
BUFFER ISOTNICO,
LA MAYORA APARECE
COMO FIBRAS DE 30
NM DE DIMETRO
CONOCIDO COMO
SOLENOIDE.
MODELO DE EMPAQUETAMIENTO DE LA
CROMATINA Y DEL ARMAZN CROMOSMICO
EN LOS CROMOSOMAS EN METAFASE
1) En los cromosomas en interfase, largas
extensiones de cromatina de 30 nm forman
bucles hacia afuera de los armazones. En los
cromosomas metafsicos, el armazn se pliega
adicionalmente para formar una estructura muy
compacta cuya geometra precisa an no se ha
determinado.
2) En experimentos se demostr que sondas
marcadas, cuyas secuencias estn separadas por
millones de pares de bases en el ADN lineal,
aparecen muy prximas entre s en el ncleo
(Regiones Asociadas con el Armazn o SAR)
MORFOLOGA Y
ELEMENTOS
FUNCIONALES DE
LOS CROMOSOMAS
EUCARIOTES
TELMEROS
LA FIGURA MUESTRA UN LAZO
EL CUAL ES FORMADO CUANDO
EL EXTREMO PROTUBERANTE
3OH DEL TELMERO (TTAGGG)n
DESPLAZA A UNA MISMA
SECUENCIA MAS ARRIBA EN EL
TELMERO.
HA ESTA REGIN SE UNEN
PROTENAS ESPECFICAS QUE
PROTEGEN LOS EXTREMOS DE
LOS CROMOSOMAS LINEALES
DEL ATAQUE DE EXONUCLEASAS
Y ASOCIAN LOS TELMEROS
EN DOMINIOS ESPECFICOS
DENTRO DEL NCLEO.
TELMEROS
1) A MEDIDA QUE LA
ORQUILLA DE REPLICACIN
SE ACERCA AL EXTREMO DE
UN CROMOSOMA LINEAL,
LA SINTESIS DE LA HEBRA
CONDUCTORA CONTINUA
HASTA EL FINAL DE LA
HEBRA MOLDE DE ADN,
COMPLETANDO UNA DOBLE
HLICE DE ADN HIJA
2) SIN EMBARGO, COMO EL MOLDE DE LA HEBRA SEGUIDORA SE COPIA
DE MODO DISCONTINUO, NO PUEDE REPLICARSE EN SU TOTALIDAD;
DADO QUE CUANDO SE ELIMINA EL LTIMO CEBADOR DE RNA, NO HAY
UNA HEBRA EN LA DIRECCIN 5`SOBRE LA CUAL LA ADN POLIMERASA
PUEDA POSISIONARSE PARA LLENAR LA HEBRA FALTANTE.
3) SIN LA EXISTENCIA DE ALGN MECANISMO ESPECIAL, LA HEBRA DE
ADN HIJA RESULTANTE DE LA SNTESIS DE LA HEBRA CONDUCTORA SE
ACORTARIA EN CADA DIVISIN CELULAR
TELOMERASAS
EL PROBLEMA DEL
ACORTAMIENTO DE TELMERO
SE SOLUCIONA MEDIANTE UNA
ENZIMA QUE AADE
SECUENCIAS TELOMRICAS EN
LOS EXTREMOS DE CADA
CROMOSOMA.
LAS TELOMERASAS CONTIENEN
UNA MOLECULA DE ARN QUE
SIRVE DE MOLDE PARA LA
ADICIN DE
DESOXIRRIBONUCLETIDOS A
LOS EXTREMOS DE LOS
TELMEROS.