e
Melhoramento de Plantas
Universidade de vora
2005
Estrutura de um gene:
Promotor: Regio do DNA qual se liga a enzima RNA polymerase antes de iniciar a
transcrio do DNA em RNA.
Determina: regio de incio da transcrio; a cadeia de DNA que servir como template; nmero de
transcritos; frequncia da transcrio.
Gene: Segmento de DNA constitudo por um conjunto de intres e exes que ser transcrito em
mRNA, codificando os exes a sntese proteica.
Terminador: Regio terminal que bloqueia a enzima RNA polimerase e induz a sua dissociao.
5 Promoter
UTR Exon1
Intron1
GENE
Transcription
Poly A
Modificaes ps-transcrio:
5 capping: ligao de uma molcula de 7-metilguanilato
extremidade 5 do mRNA durante a transcrio, tendo como
objectivo a proteco da nova cadeia.
Splicing:
clivagem dos intres no inteior da
cadeia de mRNA e simultnea
ligao dos exes,
correspondendo ltima fase do
processamento das molculas de
mRNA no ncleo.
Genoma
Total conjunto de genes
de um organismo
Transcritoma
Conjunto de sequncias
transcritas (mRNA)
Proteoma
Conjunto de proteinas
codificado pelo genoma
Cdigo gentico:
envolve o reconhecimento de tripletos
(conjunto de trs nucletidos) do
mRNA denominados codes pelos
complementares anticodes do tRNA.
Codo de iniciao: AUG (Met)
Codes stop: UAA; UAG; UGA
O cdigo gentico universal e
degenerado (61 codes codificam para
a sntese de apenas 20 aa):
vrios codes = 1 aa
1 codo vrios aa
Incio da traduo:
o
reconhecimento do
codo de iniciao
(mRNA) AUG pelo
anticodo (tRNA)
UAC transportando
o aminocido inicial
Meteonina.
O ribossoma
(rRNA+proteina)
movendo-se ao
longo da cadeia de
mRNA (de trs em
trs nucleotidos)
cataliza a sntese
proteica.
Final da traduo:
o
reconhecimento do
codo de terminao
(mRNA) UAG pelo
anticodo (tRNA)
AUC com a
consequente
separao das duas
subunidades que
constituem o
ribossoma.
Melhoramento gentico:
Consiste na adio ou subtraco de um ou mais genes de um
organismo, introduzindo ou silenciado uma determinada caracterstica.
Vantagem:
Ultrapassar a barreira da espcie: um gene que codifica uma
caracterstica numa determinada espcie pode ser introduzido numa
outra espcie mesmo que filogenticamente muito afastada recorrendo a
tcnicas de biologia molecular.
Interesse:
Criar plantas tolerantes ou resistentes a determinadas condies de stress
bitico e/ou abitico.
Exemplo:
Introduo de Resistncia ao Fungo Uncinula necator (Odio) em
Videira (Vitis vinifera)
O fungo em questo possui parede de quitina pelo que as protenas com
capacidade de a hidrolizar quitinases podem conferir planta
potencialidade para resistir a esse stress bitico.
1 PASSO:
Pesquisar na bibliografia a existncia de espcies vegetais resistentes a este fungo.
Ex.: Vitis rupestris
2 PASSO:
Pesquisar na base de dados se o gene est descrito para a espcie classificada como
resistente. Caso no esteja, ser objectivo isolar este gene na espcie
resistente para introduzir na espcie sensvel (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/).
28S
18S
Purificao do mRNA
DNA
mRNA
Transcrio Reversa
Enzimas denominadas Transcriptases Reversas, descobertas por Temin e
Baltimore (1960) em retrovrus, catalizam a sntese de cDNA a partir de
RNA.O cDNA mais estvel e apresenta a vantagem de poder ser
amplificado por tcnica de PCR.
Transcrio Reversa
mRNA template
AAAAAAA () Poly(A)
VTTTTTTTTTTTTTTTTCAGCTGTAGCTATGCGCACCAG (V=A,C ou G) VIAL 8
AAAAAAA () Poly(A)
VTTTTTTTTTTTTTTTTCAGCTGTAGCTATGCGCACCAG (V=A,C ou G)
AAAAAAA () Poly(A)
Degradao da cadeia
de mRNA com RNase
VTTTTTTTTTTTTTTTTCAGCTGTAGCTATGCGCACCAG (V=A,C ou G)
VTTTTTTTTTTTTTTTTCAGCTGTAGCTATGCGCACCAG (V=A,C ou G)
GTCGACATCGATACGCGTGGTC
VIAL 9
VTTTTTTTTTTTTTTTTCAGCTGTAGCTATGCGCACCAG (V=A,C ou G)
Pefw
PeRev
AAAAAAAAAAAAAAAGTCGACATCGATACGCGTGGTC
A transcrio (reversa) do cDNA tem a vantagem de permitir posterior amplificao de um gene de interesse
limpo de intres. O conhecimento da sequncia das extremidades do cDNA permite a posterior amplificao
das extremidades de um gene. Para tal dever utilizar-se um primer especfico que emparelhe com uma das
extremidades e um outro primer que emparelhe com uma zona especfica da nossa sequncia.
Forward (5)
Reverse (3)
AGGCTA()
AGGCTA()
GGCAAT()
CCGTTA()
Fw
Rv
5 AGGCTA()
5 ()ATTGCC
Reverse complement
Mix de PCR:
1. cDNA .. 1l
2. PCR Buffer (10x) .... 5l
3. MgCl (50mM) .. 2l
4. dNTPs (10mM) ... 1l
5. Primer forward (10mM) .. 1l
6. Primer reverse (10mM) 1l
7. H2O Milli-Q estril . 38.5l
8. Taq DNA polimerase .. 0.5l
50l
Programa de PCR:
35 ciclos
330 pb
800 pb
Rv
MM
1000 pb
Fw
PCR 1
500 pb
A utilizao de primers degenerados permitenos amplificar fragmentos especficos da
espcie em estudo ( 500pb);
1500pb
600pb
500pb
100pb
Ta=(4x15)+(2x9)-10=78-10= 68
Ta=(4x17)+(2x8)-10=84-10= 74
500pb
cDNA
5
3
GGG
5PCR primer
CCC
Rv
Fw
700pb
Poly(A)
AAAAAA
Poly(T)
5AATGGGGTTGTGGGCATTGGTAGCTTTCTGTCTGTTGTCATTAATACTGGTTGGCTCAGCAGAGCAATGTGGAGGGCAAGCTGG
GGGTAGAGTTTGCCCAGGGGGGGCATGCTGCAGCAAGTTTGGTTGGTGTGGCAACACTGCTGATTACTGTGGCAGTGGCTGCCA
AAGCCAGTGCAGTTCCACTGGTGACATTGGCCAGCTTATTACCAGGTCCATGTTCAATGATATGCTTAAGCATAGAAATGAGGGG
AGTTGCCCTGGCAAGGGCTTCTACACCTATGACGCTTTCATAGCTGCTGCTAAGGCCTTTCCTGGCTTTGGAACAACTGGTGATAC
CACTACTCGTAAAAGGGAAATCGCAGCCTTCTTGGCTCAAACTTCTCATGAAACCACTGGGGGGTGGGCTAGTGCACCTGATGGC
CCATACGCTTGGGGATACTGCTACCTCAGGGAACAAGGCAGCCCCGGAGCTTACTGTGTTCCTAGTGCACAGTGGCCTTGTGCCG
CTGGTAGGAAATACTATGGCCGAGGCCCCATACAGATTTCCTACAACTACAACTATGGGCAAGCTGGGAAAGCCATAGGGGTAG
ACCTGGTAAACAACCCTGATCTAGTAGCAACAGATGCAGTCATATCATTCAAGACAGCCTTCTGGTTCTGGATGACACCCCAGTC
ACCCAAGCCTTCCTGCCATAATGTCATCACAGGAGGATGGACCCCATCAGGTGCAGATAGGTCAGCAGGGCGGCTTCCCGGTTTT
GGTGTTATCACAAACATCATCAATGGAGGTGTTGAATGTGGGAAAGGGGTAGTTCCTCAGGTCCAGGACCGCATAGGTTTCTATA
AGAGGTACTGTGATATACTTAGGGTTAGCTATGGCAATAACCTGGACTGCAACAACCAAAGGCCTTTCGGGTCTGGCCTCCTGCT
GGACACCATCTAAA3
Vector de Clonagem
Gene LacZ
Ampicilina
Permite a seleco de
bactrias transformadas.
Apenas as bactrias
transformadas, ou seja,
que possuam o vector
plasmdico no seu interior
apresentam resistncia a
este antibitico.
MCS
Origem de replicao
Responsvel pela iniciao da
sntese proteica.
Transformao de bactrias
Introduo de um vector plasmdico, integrando o gene de interesse,
em bactrias desprovidas de qualquer DNA desta natureza (bactrias
competentes).
O objectivo desta tcnica consiste obter milhares de cpias do vector
introduzido na bactria e assim do gene inserido neste.
MM
2.
3.
4.
cl.1
cl.2
cl.3
cl.4
Polissacridos
DNA circular com nicks
DNA linear
1500 pb
600 pb
100 pb
SacI
5
(0pb)
KpnI
3
(1000pb)
Agrobacterium
Bombardeamento de Partculas
Mecanismos de seleco de transgnicos
Melhoramento Clssico vs. Biotecnologia
Melhoramento gentico: potencialidades, benefcios e
riscos
CHITINASE
Vitis rupestris
GUS
pHKTL1
(12.020 Kb)
Agrobacterium tumefaciens
uma bactria que existe naturalmente
no solo infectando um grande nmero
de dicotiledneas.
Penetra nas razes atravs de feridas
provocando uma reaco no tecido que
se traduz numa multiplicao anormal
das clulas dando origem a tumores.
O T-DNA constitui parte do plasmdio Ti (tumour inducing) que ocorre naturalmente nas
clulas de A. tumefaciens e responsvel pela capacidade infecciosa da bactria.
Genomicc DNA
Genomic DNA
Ti plasmid
Vitis
rupestris
cells
Vitis
rupestris
cells
Plant
cell
Agrobacterium
Restriction
enzyme A
Restriction
enzyme A
+
Empty
plasmid
Gene of
interest : chitinase
Agrobacteriumtumefaciens
Ti plasmid with the newgene
cells
DNA
+
Agrobacterium
Plant cell
The new
gene
Transformation
Transgenic plant
Cell division
A regenerao de plantas
(embriognese somtica) a partir de
zonas integrando o genes GUS origina
plantas transformadas. A anlise
histoqumica realizada em plantas
permite detectar por expresso da
colorao azul as plantas que integram
este gene reprter.
Limitaes da Tcnica
9 Apesar de ser utilizado com sucesso na transformao de muitas dicotiledneas,
O aparelho utilizado:
Cmara de Bombardeamento
(2)
Suportes do Macrocarrier
Tampa
Macrocarrier
Stopping Screen
(3)
Limitaes da tcnica:
9 Elevada destruio celular: as camadas celulares mais externas so denominadas de
zona de morte por serem destrudas devido ao impacto ou fragmentao das
partculas ou rajada de ar produzida (Birch and Franks, 1991);
9 Baixa estabilidade dos transformante: apesar de ocorrer integrao de um gene no
genoma de uma clula que poder regenerar uma planta, esta integrao no estvel,
apenas 1-5% das clulas expressam integrao estvel (Finer and McMullen, 1990);
9 Limitado na dimenso das construes genticas: quanto maior o vector de expresso
menor a possibilidade de sucesso;
9 Permite repeties: existe a possibilidade de integrar vrias vezes o mesmo gene no
genoma da clula vegetal, dando origem a repeties e consequente expresso
diferencial do mesmo gene;
9 Desconhecimento do efeito que a velocidade das partculas pode causar, bem como
da composio das mesmas, partculas de tungstnio podem oxidar resultando txicas
para as clulas.
Hygromycin
(HPTII)
-glucuronidase
(GUS)