A origem de novos genes

Resumo:
A origem de novos genes um importante processo durante a evoluo dos organismos,
pois fornecem fontes crticas para a inovao evolutiva. As abordagens que mostram
como esses novos genes surgem e adquirem novas funes, no decorrer da evoluo,
so de fundamental importncia. Entretanto, mesmo existindo vrias fontes de
informao sobre a arquitetura de domnios, no h ainda uma base de dados que
relacione os genes e suas possveis filogenias, levando em conta as arquiteturas. Alm
disso, as metodologias utilizadas nas atuais bases de dados ortlogos falham em agrupar
genes homlogos de grupos distantes quando a similaridade entre os genes
insuficiente. Este projeto consiste na implementao de metodologias e recursos
computacionais que nos permitir modelar a origem de protenas mais recentes, com
base em dois aspectos: 1 detectando-se sua origem a partir de em baralhamento de
xons (como mecanismo molecular, manifestado pela formao de novas arquiteturas a
partir de domnios pr-existentes) e 2 detectando a origem a partir de genes ancestrais,
evidenciada por matrizes PSSM criadas pelo software PSI-BLAST, e corroborada por
anlise de sobreposio estrutural com topologias em comum.
Referencia:
Pesquisador responsvel: Sergio Russo Matioli
rea do conhecimento: Cincias Biolgicas- Gentica

Evoluo regulatria
Resumo:
A evoluo das regies de regulao gnica, em especial nos genes expressos durante o
desenvolvimento embrionrio, parece estar diretamente relacionada com processos
evolutivos que resultam na origem de novas morfologias, dado que variaes em
regies regulatrias determinam mudanas nos padres de expresso de genes durante a
formao de estruturas especficas. A presente proposta de pesquisa objetiva investigar
associaes entre a sequncia de nucleotdeos da regio regulatria CsB, que controla a
expresso dos genes mais prximos da extremidade durante a formao do broto dos
apndices pareados nos vertebrados. As sequncias sero analisadas quanto presena
tanto de regies conservadas quanto de regies com altas taxas de substituio de
nucleotdeos, para posterior inferncia sobre presena de stios de ligao para fatores
de transcrio especficos. Sero analisadas espcies de condrictes que representem a
maior parte da variao morfolgica das nadadeiras dos principais dados e comparados
com representantes dos grandes grupos. Os fragmentos da referida regio regulatria
sero obtidos a partir de reaes de PCR com posterior clonagem e sequenciamento.
Para tanto, sero utilizados primeiros degenerados desenvolvidos no laboratrio
colaborador deste projeto (FFCLRP-USP) os quais foram previamente testados, com
sucesso, em estudo preliminar presente proposta. O grupo escolhido visa mostrar
como a variao morfolgica das nadadeiras dos peixes resultante da evoluo
molecular desta regio regulatria. Este estudo tambm contribuir para o entendimento
da evoluo genotpica em espcies no-modelos nos estudos de biologia evolutiva do
desenvolvimento.

Referencia:
Publicaes Cientificas ( Referencias obtidas automaticamente do web of Science e do
Google Scholar)
Carvalho, Murilo, Bockmann, Flavio Alicino, De Carvalho, Mercelo Rodrigues.
Aluna:
Jenifer Fagundes dos Santos