queseinicianen biologacelularalgunas
Los estudiantes
-ocasionalmenteinclusoconsvecesseven sorprendidos
ternados- al encontrar que todos los cursosy libros de
texto relacionadoscon la biologa celular implican una
y
de qulmica.Labiologaen general,
cantidadconsiderable
gran
en
particula
fundamentan
se
celular
en
la biologa
medidatanto en Ia qumicacomo en la fsica.Despusde
sefundamentanen lasletodo,lasclulasy losorganismos
yes del universo fsico,de forma que la biologa es realvivos.De hecho,
menteel estudiodela qumicaen sistemas
todo Io quelasclulassony hacentieneuna basmolecular y qumica.Porlo tanto,nicamentepodremosapreciar
y entenderla estructuray la funcincelularcuandopodamos describirlaen trminosmolecularesy expresarsu funy eventosqumicos.
cin en trminosde reacciones
Intentarapreciarla biologacelularsin conocimientos
de qumicaseracomointentarapreciaruna traduccinde
enGoethesin conocimientodel alemn.Probablemente
gran
parpero
parte
del
significado,
tenderamosla mayor
te de la bellezaylaprofundidadde la apreciacinseperderia en la traduccin. Por esta tazn consideraremosel
parael bilogocelular.Estecasustratoqulmiconecesario
en variosprincipiosque
ptulo se centraespecficamente
en granpartede la biologacelular,comoprepasubyacen
racinparael captulosiguientequesecentraen lasprincipalesclasesde constituyentesqumicosen lasclulas.
Los principalespuntos de estecaptulosepuedenesalrededorde cincoprincipios:
tructurarconvenientemente
7.. La importanciadelcarbono.La qumicadelasclulas
que
la qumicade los compuestos
esesencialmente
contienencarbono,ya que el tomo de carbonotienicasque hacenque seaesne variaspropiedades
l9
car la configuracin espacialde la molcula es inherente en el orden de monmeros presenteen el polmero. El auto-ensamblajees,sin embargo, en muchos
casoscontrolado por protenas denominadas (chaperonas moleculares> que participan en el proceso
de ensamblajeinhibiendo las interacciones incorrectas que podran dar lugar a estructuras inactivas.
Dados estos cinco principios, debemos familiarizarnos
con los principales temas de qumica celular antes de aventurarnos en la exploracin de lo que significa ser una clula.
20
Captulo
2
Laqumica
delaclula
.0.
.H
':
..
Carbono
Oxgeno
Hidrgeno Nitrgeno
(valencia:4) (valencia:2) (valencia:1) (valencia:3)
(a) Algunostomoscon importancia
biolgicay sus valencias
H !l ..
t1
H:C.:H
H
Metano
(cHt
H:C.:C.:O:H
HH
Etanol
(cH3-cH2oH)
J.l..
H:C.:N.:H
HH
Metilamina
(OH3-NH2)
(b) Algunas
molculas
orgnicas
simples
conenlaces
simples
H.
H.
.H
.H
Etileno
Dixidode carbono
(cH2:cH2)
(coz)
:N::N:
H:C!il:
Nitrgeno
molecular
Cianuro
dehidrgeno
( N 2)
(HCN)
(d) Algunas
molculas
simples
conenlaces
triples
Figwa2.7 Configuracin
electrnica
dealgunos
tomosy molculas
importantes
biolgicamente,
Semuestranlasconfiguraciones
electrnicas
delostomosdecarbono,
oxgeno,
hidrgeno
y
nitrgeno(a)y demolculas
orgnicas
simplesconenlaces
(b),doblesenlaces
(c)y triplesenlaces
(d).nicamente
sencillos
se
loselectrones
muestran
delorbitalelectrnico
msexterno.
En
cadacaso,loselectrones
localizados
entretomosadyacentes
representan
un pardeelectrones
compartido,
cadauno deellos
perteneciente
a tomo.Loselectrones
delcarbono,
oxgeno,
hidrgeno
y nitrgenosonnegros,
rosas,
azules
y grises,
(Todosloseiectrones
respectivamente.
sonequivalentes,
por
supuesto,
el cdigodecoloressimplemente
parailustrarqu
proceden
electrones
decadatomo.)
que estn unidos por un enlace covalente. Los tomos de
carbono tienen mucha probabilidad de formar enlacescovalentesentre s y con tomos de ogeno (O), hidrgeno
(H), nitrgeno (N) y azufre(S).
Las configuracioneselectrnicasde varios de estostomos se muestran en la Figura 2.1a.Obsrveseque, en cada
caso,uno o ms electronesson necesariospara completar
el orbital externo. El nmero de electrones(ausentes)corresponde en cada caso con la valencia del tomo e indica
el nmero de enlacescovalentesque puede formar el tomo. El carbono, el oxgeno y el nitrgeno son los elementos ms ligeros que forman enlacescovalentescompartiendo pares de electrones.El bajo peso atmico hace a los
compuestos resultantes especialmenteestablesporque la
quecontienen
carbono
sonestables
Lasmolculas
estabilidad
delasmolculas
orComoyasehasugerido,la
propiedad
electrnica
gnicas
una
de
la
configuracin
es
favorablede cada tomo de carbono en la molcula. La estabilidad se expresa en trminos de energa de enlace -la
cantidad energarequeridapara romper un mol (alrededor
de 6 X 1023)de sus enlaces-. (El trmino energade enlace
esuna fuente frecuente de confusin. Tengaprecaucin para
no pensar en ella como la energa que est de alguna forma
<almacenada, en el enlace, sino como la cantidad energa
que esnecesarapararomper el enlace).Las energasdel enlace se expresannormalmente en caloraspor mol (cal/mol),
siendo una calora la cantidad energanecesariapara elevar
la temperaturade I gramo de agua I grado centgradol.
Romper un enlace covalente requiere una gran cantidad energa. Por ejemplo, el enlace carbono-carbono
(C-C) tiene una energade enlacede 83 kilocaloras por
mol (kcal/mol). La energade enlacede los enlacescarbono-nitrgeno (C-N), carbono-oxgeno (C-O) y carbono-hidrgeno (C-H) esten el mismo rango:70,84y
99 kcal/mol, respectivamente.Se requiere incluso ms
energa para romper un doble enlace carbono-carbono
(C:C; 146 kcal/mol) o un triple enlacecarbono-carbono
(C:C; 2I2 kcallmol), por lo que estos compuestos son
an ms estables.
Podemos apreciar la importancia de estasenergasde
enlace comparndolas con otros valores de energa relevantes,como semuestra en la Figura 2.2.La mayora de los
c-H l
c-N,
Energiasde enlaces
covalentes
o
E
(
O
.(
Fosfocreatina
ATP
-l
-f
Eneroade hidrlisis
de inlaces fosfato
q)
C
c)
Enlacesno covalentes
LJJ
Energiavlbracional
(trmica)
en lastransiciones
con
Figwa2.2 Ener$ade losenlaces
quela energa
esten escala
impoltancia
biolgica,Observe
ampliosrangosdevalores.
logartmicapararepresentar
enlacesno covalentespresentesen molculas biolgicas
importantes tienen energasde slo unas pocaskilocaloras por mol, y \a energade la vibracin trmica es incluso
ms baia -alrededor de 0,6 kcal/mol-. Los enlacescovalentes tienen una energamucho ms alta que los enlaces
no covalentesy por lo tanto son estables.
La idoneidad del enlacecarbono-carbono para la qumica biolgica de la tierra esespecialmenteclara cuando se
compara su energacon la de la radiacin solar. Como se
indica en la Figura 2.3 existeuna relacin inversa entre la
longitud de onda de la radiacin electromagnticay su
contenido energtico.La energa de Ia radiacin electromagntica est relacionada especficamentecon la longitud de onda a travs de la ecuacin E: 28.60017,donde ,t
esla longitud de onda en nm, E esla energaen kilocaloras
por einstein y 28.600 es una constante con las unidades
kcal-nm/einstein. (Un einsteines igual a un mol de fotones). Usando esta ecuacin se puede calcular que la parte
visible de la luz solar (longitud de onda de 400-700 nm)
tiene una energams baja que el enlacecarbono-carbono.
Por ejemplo, la luz verde con una longitud de onda de 500
nm tiene un contenido de energa de alrededor de 57,2
kcal/einstein. Por lo tanto, Ia energa de la luz verde est
muy por debajo de la energa de los enlaces covalentes
(vaseFigura2.2). Si steno fueseel caso,la luz visible podra romper espontneamentelos enlacescovalentes,y la
vida tal y como Ia conocemosno existira.
La Figura 2.3 ilustra otro punto importante: el peligro
que poseela radiacin ultravioleta para las molculasbiolgicas.Con una longitud de onda de,por ejemplo,300 nm,
la luz ultravioleta tiene un contenido de energade alrededor de 95,3 kcal/einstein,claramente suficientepara romper espontneamenteenlacescarbono-carbono.Estaamenaza subyacea la preocupacin actual de las poblaciones
ms que destruyenla capade ozono en la parte superior de
Laimportancia
delcarbono 21
l. (en nm)
^
c
'o
l^^
rvv
6
.c
0)
(U
Y
.(
o)
C-C
cH3- cH3
Etano
n
!
vl
-nu
t2-vt
t2
Etileno
Acetileno
obu
C
c)
LLI
lnfrarrojo-->
400
600
800
200
de onda (nm)
I = longitud
1,000
(E) y longitud
entreenerEfa
deonda(,i)dela
Figura2.3 Relacin
marcanla
radiacn
electromagntica.Laslneasdiscontinuas
C-H, C-C y C-N.
energade losenlaces
sencillos.Los
hidlocautos
compuestos
Figwa2.4 Algunos
sencillos
de la fila superiortienennicamenteenlaces
compuestos
mientrasquelosdela segundafila tienendobleso triplesenlaces.
mostradaenla partederechaparael
La estructuracondensada
queusan
simplificadas
bencenoesun ejemplodelasestructuras
losqumicosParaestoscomPuestos.
frecuentemente
22
2 Laqumica
de laclula
Gaptulo
Planode
simetra
Manolzqulerda
ffi
Manoderecha
tereoismerosllamadosr-alanina y D-alanina.(Ninguno
de los otros dos tomosde carbonode la alaninaesasimtrico, ya que uno tienetres sustituyentes
idnticosy el otro
tiene dos enlacescon un tomo de oxlgeno.)Los dos estereoismerosde la alaninaestnpresentesen la nataraleza,
pero slo la r-alanina esun componentede las protenas.
Como ejemplode un compuestocon mltiples tomos
de carbono asimtricos,consideremosel azricar de seis
tomosde carbonoglucosade Ia Figura2.7b.De los seis
tomos de carbono de la glucosalos cuatro sealadosen
(Puede
negritasonasimtricos.
decirnospor qulos otros
dos tomos de carbono no son asimtricos?)Con cuatro
tomosde carbonoasimtricos,la estructuraque semuestra parala n-glucosaesslouna de los 24,o 16,estereoismerosposiblesde la molculaCuHrrOu.En estecaso,no
posiblesexistenen la natutodoslos otros estereoismeros
raleza,principalmenteporque algunosson mucho menos
que otros.
favorablesenergticamente
23
Planode
simetra
'w--w
I
I
ffi-lI
cHt
^ ^t^^i^^
u-dtdl
ilt to
L-alanlna
(a)
o
c-H
H-
C -OH
HO- C -H
H-C-OH
H-
C-OH
I
cH20H
(b)
\R
Figura2.7 Estereoismeros
de molculasbiolgicas. (a) EI
aminocido alanina tiene un nico tomo de carbono asimtrico
(representadoen negrita) y puede por lo tanto existir en dos formas
espacialesdiferentes,designadascomo t-alanina y o-alanina. (La
Ilnea discontinua del centro de la figura representael plano del
espejo.) (b) La glucosaesun azcade seiscarbonos que tiene
cuatro tomos de carbono asimtricos (representadosen negrita),
de forma que la o-glucosaesnicamenteuno de los 16(24)posibles
estereoismerosposiblesde la molcula C6H1206(aunque nos
todas las formas posiblesexistenen la naturaleza).
Captulo
2
Laqumica
de laclula
.'
-(A
f"'41
o-glucosa
Eu-
t)::T:?:n""
G*
6+
(a) Polaridadde la
molculade agua
^-o
(b) Puentes
de hidrgeno
entre
mnlnnles dc anrr
hidrgenoentremolculasadyacentes.
Calor especficoes
la cantidadde calor que una sustanciadebeabsorberpor
gramo,paraincrementarsu temperatura1 "C. El calorespecficodel aguaesde una calorapor gramo.
El calor del especficodel aguaesmucho ms alto que
el de la mayorade los lquidos debido a la abundanciade
puentesde hidrgeno.En otros lquidos,gran parte de
energacontribuira directamentea incrementarel movimiento de las molculasde solventey por lo tanto a una
elevacinde la temperatura.En el agua,se empleapor el
contrariopararomper los puentesde hidrgenoentrelas
molculasde aguaadyacentes.
En efecto,mediantela absorcin de calor que de otra forma incrementarala
temperaturadel agua ms rpidamente,los puentesde
hidrgenotamponanlas solucionesacuosas
contrade las
variaciones
grandesde temperatura.
Estacapacidad
esimportante para el bilogo celularya que las clulasliberan
grandescantidades
de.energa
durantelas reacciones
metablicas.
Estaliberacinde energapodracausarun serio
problemade sobrecalentamiento
paralasclulas,si no fuera por la abundanciade los puentesde hidrgenoy el alto
calor especficoresultantede lasmolculasde agua.
El aguatiene tambin un calor de vaporizacin elevado, que se define como la cantidad de energanecesaria
para convertir 1 g de lquido en vapor. Estevalor es alto
parael aguadebidoa quelos puentesde hidrgenotienen
que ser destruidosen el proceso.Estapropiedadhacedel
agua un refrigeranteexcelentey explicapor qu suda la
gente,por qujadeanlos perrosy por qulasplantaspierden aguaa travsde la transpiracin.En cadacaso,el calor
requeridopara eyaporaraguaes disipadopor el organismo, el cual por lo tanto seenfraen esteproceso.
A la vista de la elevadacapacidadestabilizadorade la
temperaturaque el aguatiene,graciasa la abundanciade
Laimportancia
delagua
25
(a) Hidratacin
del ion sodio
(b) Hidratacin
del ion cloro
Figura2,10 Solubilizacindel cloruro sdico, El cloruro sdico (NaCI) se disuelveen agua debido a la formacin de esferasde hidratacin
alrededor de los iones de sodio (a) y de los iones de cloro (b). EI tomo de ogeno en los iones de sodio y cloro estrepresentadoa escala.
26
2
Captulo
Laqumica
dela clula
Ms frecuentemente,las molculasorgnrcascarecen
de carganeta,esdecir,no han ganadoni perdido protones
y sonpor lo tanto molculasneutras.Sin embargo,muchas
molculasorgnicasson hidroflicaspor tener algunasregiones cargadaspositivamentey otras regionescargadas
Lasmolculasde aguatienen a reunirsealnegativamente.
rededorde estasregiones,y las interaccioneselectroestticasresultantesentre soluto y las molculasde aguaevitan
que las molculasdel soluto se asocien.Los compuestos
que contienengruposhidroxilo, sulfidrilo, carbonilo o aldehdo,como semuestranen la Figura2.5,seincluyenhabitualmenteen estacategora.
Las molculashidrofbicas,por otro lado, no tienen
estetipo de regionespolaresy por lo tanto no muestran
con las motendenciaa interaccionarelectrostticamente
lculasde agua.De hecho, rompen la estructura de los
puentesde hidrgenodel aguay por estarazntiendena
serexcluidasde lasmolculasde agua.Por tanto,lasmolen un medio acuoso'
culashidrofbicastiendena coalescer
entre ellasms que con el agua.Estaasociaasocindose
cin sedebems a la fuerte tendenciade las molculasde
agJa panaformar puentesde hidrgeno y excluir a las
molculasque rompen dichos puentes,que a la afinidad
especficade las molculashidrofbicasentre ellas.Como
veremosms tarde en el capltulo, estasasociacionesde
molculashidrofbicas(o partesde molculas)constituyen una fuerzamuy importante en el plegamientode
molculas,el ensamblajede estructurascelularesy la organizacinde lasmembranas.
protenasde membrana.Enlamayoriade organismos,salvo las bacterias,las membranastambin contienenesteroen el casode clulasanimalesy fitosterolesen
les-colesterol
(No sepreocupesi
lasmembranasde las clulasvegetales.
no seha encontradoanteriormentecon estostipos de molculas;lasveremosen el Captulo3).
Lamayorla de los lpidos y protenasde membranano
son simplementehidrofbicos,tienen regionestanto hidrofflicas como hidrofbicasy se denominan molculas
anfipticas(el prefijo griegoanfi significa<dedosclases>
).
La naturalezaanfipticade los fosfblpidosde membrana
seilustraen la Figura2.11,quemuestrala estructurade la
E,"r"|".i."
{
Grupo
fosfato
o
I
CH,
CH,
),,
)c',
CH"
Cabezaspolares
(grupos
cargados
l'
)r"
CH,
)*,
CH,
)',
CH,
)',
CH,
)",
CH,
)*,
cH.
CH,
\*
/-"2
CH,
\i,
((
./""2
CHo
\i,
'/",
CHo
qI
'2
\,
./""2
CHo
\i,
./""2
CH,
\^,
/""2
cH-
(a) Estructura
de los
fosfolpidos
-':1::"-t t
(giTff.I I
hidrocarbonad*,
f t
((
((
(b) Smbolode
fosfolpido
selectiva
conpermeabilidad
delasmembranas
Laimportancia
,,"*"
I
^^h^-^
vduva
^^t^putdl
(hidroflica)
rerdica
Colasno polares
(hidrofbicas)
Cabezapolar
(hidroflica)
Agua
Figwa2.L2 Labicapalipdica
comobasede la estructura
de la
anfiptica,
losfosfolpidos
membrana,Debidoa sunaturaleza
en
un medioacuososeorientanformandouna doblecapaconlas
colashidrofbicas(grises)ocultasen la parteinterior,y lascabezas
hidroflicas(naranja)orientadashaciael medioacuosode ambas
carasdela membrana.
adentro, formando la estructura interior hidrofbica de la
membrana.
Cada membrana biolgica conocida tiene una bicapa
Iipdica como estructura bsica. Cada uno de los lpidos
tienealrededorde 3-4 nm de grosor, de forma que la bicapa tiene una anchura de alrededor de 7-8 nm. La bicapa lipdica confiere a las membranas su aparienciacaracterstica de <va de tren> cuando se observa con el microscopio
electrnicode transmisin(TEM; Figura2.I3 a). El osmio
que se emplea para preparar el tejido para microscopa
Espaciointercelular
Membrana
cetutar
r \
Clula
Clula2
Protenas
Bicapa
lipdica
Regiones
hidroflicas
25 nm
(a) Micrografa
electrnicade
las membranasde dos
lrrlac
rdrraontoc
hidroflico
(b) Modelode una membrana
como una bicapalipdica
con protenasembebidas
Figura2,L3 Membranasy esttuctuta de membtana, (a) Las membranas celularesque rodean dos clulasadyacentesparecenun par de
bandasoscurasen el microscopio electrnico.Esta apariencia caractersticatrilaminar, o en <va de treno, se cree que es debida a la
asociacindel osmio con las cabezashidroflicas de las molculasde fosfolpidos y no con las colashidrofbicas como semuestra en esta
micrografa electrnica (TEM). (b) Las membranas biolgicas consistenen protenas anfipticasembebidasen una bicapa lipdica. Las
protenas seposicionan en la membrana de forma que las regioneshidrofbicas (rosa claro) estnlocalizadasen el interior hidrofbico de la
bicapa de fosfolpidos y sus regioneshidrofflicas (rosa oscuro) estnexpuestasal medio acuosoen cualquier superficie de la membrana. Las
cadenascortas unidas a la superficie superior a algunasde las protenas de membrana representancadenaslateralesde carbohidratos.
28
Capitulo
2
Laquimica
de laclula
electrnicareaccionaaparentementecon las cabezashidroflicasde lasmolculasde fosfolpidosen ambassuperficiesde la membrana,pero no con las colashidrofobicas
en el interior de la membrana,lo que da a la membranasu
aparienciatrilaminqr(trescapas).
En la Figura 2.13bseilustra la estructurade las membranasbiolgicas.Diversasprotenasde membranaseena la membranalicuentranembebidasdentro o asociadas
pdica. Estasprotenasson casi siempre anfipticasy se
orientan en la bicapalipdica de acuerdocon esto:las regioneshidrofbicasdela protelnaseasociancon el interior
de la membrana,mientrasque las regioneshidrofilicassobresalenhaciael medio acuosoen cualquierade las superficiesde la membrana.Algunasprotenasde la membrana
plasmticatienen cadenaslateralesde carbohidratosunidasa sussuperficiesexternas.
Dependiendode la membranaen particula lasprotenas de membranapuedendesempearuna o variasfunciones.Algunas son protenastransportadora$responsaa travsde
bles del movimiento de sustanciasespecficas
que catalienzimas
son
membranasimpermeables.Otras
especfica.
la
membrana
zan reaccionesasociadascon
de
Otras son receptoresde la superficieexterna la memde
brana celular,intermediariosdel transportede electrones
cloa
la
la membranamitocondrial, o protenasde unin
rofila en los cloroplastos.En captulossucesivosnos encontraremoscon cadauno de esostipos de protenasde
membrana, comenzandoen el Capltulo 4 (vasecomo
ejemplola Figura4.9).
Nivelf Molculasorgnicaspequeas
, f9,ou
L/.i...-..o\oH
"\K4
Hp
Glucosa
Nvel 2 Macromolculas
Nivel3 Estructurassupramoleculares
Membrana
Paredcelular
Cromosoma
Nivel4 Orgnulos
y otras estructuras
Nivel 5 La clula
Paredcelular
P a r e dc e l u l a r
Mitocondria
M e m b r a n ac e l u l a r
ni^,^^l^^+^
v,u uPrdrru
30
Captulo
2
Laqumrca
de laclula
electrnicareaccionaaparentementecon las cabezashidroflicasde lasmolculasde fosfolpidosen ambassuperficiesde la membrana,pero no con las colashidrofobicas
en el interior de la membrana,lo que da a la membranasu
aparienciatrilaminar(trescapas).
En la Figura 2.13bseilustra la estructurade las membranasbiolgicas.Diversasprotenasde membranaseencuentranembebidasdentro o asociadasa la membranalipdica. Estasprotenasson casi siempre anfipticasy se
orientan en la bicapalipdica de acuerdocon esto:las regioneshidrofbicasdela protenaseasociancon el interior
de la membrana,mientrasque lasregioneshidrofilicassobresalenhaciael medio acuosoen cualquierade lassuperficiesde la membrana.Algunasprotenasde la membrana
plasmticatienen cadenaslateralesde carbohidratosunidu, u tnt superficiesexternas.
Dependiendode la membranaen particula lasprotenas de membranapuedendesempearuna o variasfunresponsaciones.Algunas son protenastransportadoras,
a
travsde
especficas
de
sustancias
bles del movimiento
que
catalison
enzimas
Otras
membranasimpermeables.
especfica.
membrana
con
la
zan reaccionesasociadas
Otras son receptoresde la superficieexternade la memde
brana celular,intermediariosdel transportede electrones
la
cloa
protenas
de
unin
la membranamitocondrial, o
rofila en los cloroplastos.En captulossucesivosnos encontraremoscon cadauno de esostipos de protenasde
membrana, comenzandoen el Capltulo 4 (vasecomo
ejemplola Figura4.9).
Precursoresinorgnicos
Pequeasmolculasorgnicas
nn3I\J
Macromolculas
Nuclesidos
trifosfatos
Acidosnucleicos
Aminocidos
Protefnas
Nucletidos
N"
\ ^ , , ''nt
No z
,-^-*^ri^^
f l l l e -.
i l i l e u t -.:.
uS
-,
Glicerol
t
grasos
:
+Acroos
melaoollcos \Esteroides
Lpidos
l' J' 2r v\
"'2
paraformar
(izquierda)reaccionan
inorgnicos,simples
biolgicas, Losprecursores
Figura2,15 Lasintesisde lasmacromolculas
(derecha)delascualesestnhechasla mayorade
molculasorgnicas(centro),qo. ,. .-pb.t parala sintesisde macromolculas
pJquenas
celulares.
estructuras
porpolimerizacin3 l
delasntesis
Laimportancia
?",o1
?"T
?"o:
"l"j
"ET
r.,"j
@-@--@--@--@--*
'
oH
,___lL
Glucosa
oH
oH
oH
cH2oH
cH2oH
oH
(segmentode la molcula
(a) Un pollsacrido
de almacenamiento
de almidno de glucgeno)
cH2oH
cH2oH
cHzoH
GlcNAc
MurNAc
cH2oH
trSltT4>#'"q+
(segmentode un componente
(b) Un pollsacrido
estructural
de la paredcelularbacteriana)
lculas.Aunquela qumicadelasunidadesmonomricas
por tanto, de los polmeros resultantes,difiere bastante
entre macromolculascomo protenas,cidosnucleicosy
los siguientesprincipiosbsicosse aplican
polisacridos,
en todoslos casos:
meson siempresintetizadas
1. Las macromolculas
diante polimerizacingraduala partir de pequeas
moo idnticasdenominadas
molculassemejantes
nmeros.
2. La adicinde cadaunidad monomricaseproduce
mediantela eliminacinde una molculade aguay
por lo tanto sedenominauna reaccinde condensacin.
3. Lasunidadesmonomricasque sevan a unir deben
antesde
comomonmerosactivados
estarpresentes
quepuedaocurrir la condensacin.
4. Laactvacinimplica normalmenteel acoplamiento
de los monmerosa algn tipo de molcula transportadora para constituir monmerosactivados.
5. La energaparaacoplarel monmeroa la molcula
escedidapor una molculadenomitransportadora
Ia Figura3.16
trifosfato(ATP;vase
nadaadenosina
parasu estructura)o algncompuestode altaenergla relacionado.
6. Debido a la forma en que se sintetizanlas macromolculas.stastienen una direccionalidad inherenteque consisteen que los dos extremosde la cadenadel polmero son qumicamentediferentes.
Debido a que la eliminacin de aguaes esencialpara
de polimerizacinbiolgica,cadamotodaslasreacciones
nmero debe contenerun hidrgeno (H) reactivoen al
menosun grupo funcional y un grupo hidrxido reactivo
(-OH) en alguna ota zonade la molcula.Estacaracteen Ia Firstica estructuralsemuestraesquemticamente
lasunidadesmonomricas(M)
gura2.I7a,querepresenta
simplementecomo cajas pero que indica el hidrgeno
de
Figura2.16 Macromolculas
almacenamientoyestructutales.Las
macromolculasde almacenamientoy
estructuralescontienen una o pocas clasesde
unidadesrepetidasen una secuencia
estrictamenterepetida. (a) Una parte de la
secuenciade un segmentolineal en el
polisacrido de almacenamientode almidn
o glucgeno consisteen unidades de glucosa
unidas por enlacesglicosldicos.(b) Una
parte de la secuenciadel polisacrido de la
pared celular que consisteen la estricta
alternancia de los derivadosde azcares
N-acetilglucosamina(GlcNAc) y cido
N-acetilmurmico (MurNAc). (Vaseen
lasFiguras3.22,3.24y3.26para
representacionesms detalladasde Ia
glucosa,almidn, glucgeno,GlcNAc,
MurNAc, y un polisacrido de la pared
celular.)
(c) Continuacin
de la sntesisde macromolculas
(procesorepetidon vecesanteriormente)
Figwa 2.77 Sntesisde maclomolculas. Las macromolculasbiolgicas se sintetizan en un procesoy esto implica Ia activacin de
unidadesmonomricasseguidaspor su adicin secuenciala la cadenadel pollmero en crecimiento.Dependiendodel polmero,todos los
monmeros pueden ser idnticos (por ejemplo, las unidades de glucosaen el almidn y el glucgeno) o pueden ser diferentesentre ellas (los
aminocidosen lasprotenaso los nucletidosen los cidosnucleicos),pero el procesode polimerizacinesel mismo conceptualmenteen
cadacaso. (a) Los monmeros (M,, Mr, etc.) con grupos reactivosH y OH (mostrados en azul) son activadospor el acoplamiento a una
molculatransportadora(C, mostrado en prpura), empleandoenerglacedidapor el AIR un compuestosemeJante
de alta energa.
(b) El primer pasoen la sntesisde un polmero implica Ia condensacinde los monmerosactivadosacompaadao seguidapoila
Iiberacinde una de las molculastransportadoras.(c) El pasor en el procesode polimerizacinimplica la dicin del iiguiente monmero
activadosiguiente (M, * ,) a un polmero que consisteen r unidadesmonomricas, con la liberacin de la molcula traniportadora unida a
la unidad n.
Captulo
2
Laqumlca
delaclula
delautoensamblaje35
Laimportancia
Puentes
disulfuro
Puentes
disulfuro
Condiciones
desnaturalzantes;
agentereductor
Molcula
nativa
Molcula
renaturalizada
(a) Desnaturali
zaciny renaturalizacin
de la ribonucleasa
Polipptido
en crecimiento
Subunidad
ribosmica
grande
-- ,,
Polipptido
completo
Ribosoma
Puentes
disulf
uro
-t-
.-.
=-----*-.Subunidad
robosmica
pequea
(b) Sfntesis
y autoensamblaje
de la ribonucleasa
Lberacin
de subunidadesdel
ribosoma
Figura2'18 Espontaneidaddel plegamlentode un pollpptido, (a) Para demostrar que Ia informacin para la configuracin tridimensional
de un polipptido reside en su secuenciade aminocidos,sepuede exponer et polipptido intacto a.or,ii.iorr., desnaturalizantes.
@ La proteina que semuestra esla ribonucleasa,formada por urru.a.nu poiip.ptdica sencilla.En el experimento original de Anfisen
con ribonucleasase emple calor como agentedesnaturaliznte,pero ,. p,t"., .-plear tambin diversosagentesqumicos.
Estetratamiento produce una molcula desnaturalizad"que careie de forma fija y que ha perdido la funcin-biolgica (actividad
enzimticaen el casode la ribonucleasa).@ Mediante el retorno a las condici,onesque prmiten volver a la estruciura
original
(enfriamiento gradual o eliminacin del,agentedesnaturalizante),el polipptido ureive spontneamente
a tener la configracin nativa
(renaturalizacin) sin el requerimiento de informacin adicional. (Pra polipptidos com la ribonucleasa,
en los que la corrfigur"cin
nativa de la molcula estestabilizadaPor puentes disulfuro t-S-S-1,
h einaturalizacin completa requiere la utilizacin de un
agentereductor para reducir los puentesdisulfuro a los grupos sulfidrilo [-SH] que los componen. Cuano el polipptido
se renaturaliza
serequiere-unagenteoxidante Para recomponer los puentei disulfuro.) (b) Seconiidera que las mismas interaccionis que
aseguran
el retorno de un polipptido desnaturalizadoa su forma nativa actan durante su sntesisen un ribosoma puru
el eniollamiento
y.plegamientoprogresivo del polipptido en su configuracin tridimensional caracterstica.En estedibujo de la"r.gnrui
sniesisel polipptiJo
ribonucleasaseinicia a la izquierda de forma que los ribosomas de izquierda a derechatienen completaa una porcin
-uyo.i.
l".uo.rru
polipeptdica.
Capitulo
2
Laqumica
delaclula
molculade ribonucleasanativa tiene cuatro puentesdisulfuro que confierenestabilidada la estructurala molcula. Muchasprotenasestnestabilizadas
de estaforma por
puentesdisulfuro, tanto dentro de un nico polipptido
como entre polipptidosmonomricosde una protena
multimrica.
A pesardela importanciade los enlacescovalentes
en la
qumicacelular,la complejidadde la estructuramolecular
no sepuededescribirnicamenteen trminosde enlaces
covalentes.La mayoria de las estructurasde Ia clula se
mantienenunidaspor interacciones
mucho ms dbiles,
los enlacese interaccionesno covalentesdentro y entre
protenasy otrasmolculas.
Los enlacese interacciones
no covalentes
ms importantesen las macromolculas
biolgicasson los puentes
de hidrgeno,los puentesinicos,lasinteracciones
devan
der Waalsy las interacciones
hidrofbicas.Cadauna de
esasinteracciones
seintroduceaquperosediscutirncon
mayordetalleen el Captulo3 (vaseFigura
3.5).Comoya
hemosindicado,los puentesde hidrgenoimplican interaccionesatractivasdbilesentre un tomo de hidrgeno
que estunido covalentemente
a un tomoelectronegativo y un segundotomo electronegativo.
Lospuentesinicosson interaccioneselectrostticas
no covalentesentre
dos ionescargadosopuestamente.
En el casode las maposicromolculas
stossongruposfuncionalescargados
tiva o negativamente
como los gruposamino,carboxiloy
fosfato.
(ofuerzas)devan der Waalsson interLasinteracciones
atractivas
dbilesentredostomosquesedebena
acciones
separaciones
transitoriasde carga(llamada dipolos)en
ambostomos.Estasinteracciones
seobservannicamente si los tomosestnmuy prximosy orientadosapropiadamente.El trmino interacciones
hidrofbicasdenota la
tenenciade gruposno polaresdentrode una macromolcula a asociarseentre ellos,minimizando de estaforma su
contactocon las molculasde aguaque los rodeany con
los gruposhidroflicosde la misma(o inclusode otra) macromolcula.
que tienCadauno de estosenlacesson interacciones
den a mantenerunidas partes de una macromolcula,
pero cuandolos tomos,o los gruposde tomos,seacercan demasiadocomienzana repelersedebido al solapamiento de los orbitalesde suselectrones
msexternos.El
radio de van der Waalsde un tomo o un grupo funcional
hacereferenciaal <espacio
privado>alrededorsuyoy estableceel lmite de cuntosepuedenacercarotrostomoso
gruposantesde serrepelidos.Losradiosde van der Walls
que separanlos tomosms comunesen las molculas
biolgicas(H, O, N, C, S y P) estnen el rango de 0rI2 a
0,19nm. Los radiosde van der Wallsestablecen
lasbases
paralos modelos
de ocupacin
delespacio
de lasmacromoIculasbiolgicas,como en el casode la protenainsulina
mostradoen la Figura2.19y de la molculade DNA de la
Figura3.19b.
38
Capitulo
2
Laqumica
de laclula
El autoensamblaje
tambinocurreen otfas estructuras
celulares
que rige el plegaEl mismo principio de autoensamblaje
mientoen lasinteracciones
de los polipptidosseproduce
tambinen estructurascelularesms complejas.Muchas
de lasestructuras
caractersticas
de la clulasoncomplejos
de doso msclasesdiferentesde polmerosy por Io tanto
claramenteimplican interaccionesdiferentesqumicay la asociacin
polipepmentedel plegamiento
de cadenas
tdicas.Sinembargo,el principiode autoensamblaje
esan
vlido.Porejemplo,los ribosomas
contienenRNA y protenas,y las membranas
estnconstruidascon fosfolpidosy
protenasque ya hemosdescrito.Incluso\a paredcelular
primaria que rodeauna clulavegetal,aunqueprincipalmente estcompuestapor fibrillas de celulosa,tambin
contieneuna ampliavariedadde otros carbohidratos,
as
como un componenteproteicopequeopero aparentementecrucial.A pesardelasdiferenciasqumicasentrepoImerostan diversoscomo protenas,cidosnucleicosy
polisacridos,
que mantienenestosagrelasinteracciones
parecenseresencialmente
gadossupramoleculares
lasmismasquelasquedictanel plegamiento
de molculasindividualesde protenas.
Subunidad
de la protena
de recubrimiento
en entidadesfuncionales
den reagruparespontneamente
interesansin informacin externa.Resultaespecialmente
te el descubrimientode que el RNA de una cepade virus se
pudiese mezclarcon el contenido proteico de otra cepa
para formar un virus hbrido con capacidadinfecciosa.
Como era esperable,el origen del RNA y no el de las protenasdeterminanel tipo de virus que seproducenen las
clulasinfectadas.
El procesode ensamblajese ha estudiadodetalladamente desde entoncesy resulta ser sorprendentemente
complejo.La unidad bsicade ensamblajees un disco de
dos capasde protenas,cadauna de lascualesconsisteen
comoun anillo (Figuidnticasordenadas
17subunidades
ra2.2la). Cadadiscoinicialmenteesuna estructuracilndrica pero sufre un cambio conformacionalque lo transforma en una hlice al interaccionarcon un segmento
corto (unos 102nucletidos)de Ia molculade RNA (Figwa2.2lb). Estatransicinpermite la unin del otro dissufre un
co (Figura 2.21c)y cada disco sucesivamente
que
en
una
hlice
lo
transforma
cambioconformacional
queseune a otras102basesde RNA.El procesode elongacin disco a disco contina y Ios discossucesivosalmacenadoscreanun caminohelicoidalparala hebra de RNA
(Figura2.21d).Finalmenteel procesoda lugara un virin
maduro cuyo RNA est completamentecubierto por la
protenade recubrimiento.
tiene lmites
El autoensamblaje
paraespecificar
la informacinnecesaria
En muchoscasos,
la configuracinexactade la estructuracelularpareceresidir enteramenteen los polmerosque contribuyen a esta
estructura.Estesistemade autoensamblajealcanzaconfiestables
sin informacinadi
guracionestridimensionales
cionalporqueel contenidode informacinde los polmeros es adecuadopara especificarel procesocompletode
asistido,las chaensamblaje.Incluso en el autoensamblaje
peronasno confiereninformacinadicional.
Sin embargo,algunossistemasde ensamblajeparecen
depender,ademsde la informacin facilitada,por una estructura preexistente.En estoscasos,la estructuraltima
de componentesen una
se origina no por el ensamblaje
nuevaestructurasinopor el ordenamientode componentes en la mai:iz de una estructuraexistente.Ejemplosde
estructurascelularesque son construidasrutinariamente
aadiendomaterial nuevo a las estructurasexistentesincluyenmembranas,paredescelularesy cromosomas.
Por otro lado, estasestructurasno estntodavasufipara determinarsi la presencia
cientementecaracterzadas
de una estructurapreexistentees obligatoria o si por el
puelos componentes
favorables
contrarioen condiciones
Lasevidenciasobtenide autoensamblarse.
den sercapaces
dasen estudioscon membranasartificialesy con cromatina (componentescromosmicosaislados)sugierenpor
ejemplo que Ia estructurapreexistente,aunque estpredelautoensamblaje39
Laimportancia
Protenade
recubrimiento
(17 por capa)
Molculade hebra
sencillade RNAviral
(a)
Disco
figwa2.2L
Autoensamblajede un viiln del
virus del mosaicodel tabaco (TMV). (a) La
unidad de ensamblajees un disco de doble
capa con l7 protenaspor capa.(b) El
ensamblajecomienza cuando la molcula
de RNA viral se asociacon un disco
causandola formacin de un bucle en la
molcula de RNA (implica 102 nucletidos)
y el cambio del disco de una conformacin
cilndrica a otra helicoidal. (c) Seaade otro
disco,y otra porcin de RNA se asociacon
1.Mientras tanto el disco ha cambiado de
una conformacin cilndrica a otra
helicoidal. (d) Cada disco que se incorpora
proporciona dos capasms adicionalesde
subunidadesproteicasy produce que otros
segmentosde RNA se asociecon la
estructura en un bucle espiral,el proceso
contina hasta que la molcula de RNA es
recubierta y el virin escompleto.
incorporndose
(cilndrico)
Discoprevio
(helicoidal)
Enrollamiento
delRNA
(c)
sentein vivo de forma rutinaria, puedeno serun requerimiento indispensablepara el procesode ensamblaje.Resulta necesarioprofundizar ms antesde poder decir con
seguridadsi eso no necesario,y hastaqu punto la informacinexternaesrequeridao explotadaen los procesosde
ensamblajecelular.
jerrquicoproporcona
El ensamblaje
ventaiasa la clula
Cadauno delos procesosde ensamblajequehemosexaminado ejemplificala estrategiabsicacelulardel ensamblaje jerrquico ilustrado en la Figura 2.14. Las estructuras
biolgicasestncasi siempreconstruidasde una manera
jerrquica,con intermediariosimportantes en el camino
desdelas molculassimplesinicialesa los productosfinalesde orgnulos,clulasy organismos.Considerecmo estn hechaslas estructurascelulares.En primer lugar, un
gran nmero de subunidadesmonomricassimilares,o
incluso idnticas,se unen por condensacinpara formar
polmeros.Estospolmerosse agregande maneraespon40
Captulo
2
Laqumica
delaclula
A ne x o
Problemas
Losproblemas
demayor
dificultad
estnmarcados
conun ..
(0
42
Capitulo
2
Laqumica
delaclula
EI aguaesinodorae inspida.
(g) El aguatiene un calor especficoelevado.
(h) El aguatieneun calorde vaporizacinelevado.
2.3 Verdaderoo falso.Identifiquecomo verdadero(V) o falso
(F) cadauna de lassiguientesafirmaciones.Modifique cada
afirmacinfalsaparatransformarlaen una verdadera.
(a) El oigeno, nitrgenoy carbonoson los elementosque ms
fcilmenteforman enlacesmltiplesfuertes.
(b) EI aguatiene un calor de vaporizacinms alto que la
mayorade lquidosdebido a su elevadocalor especfico.
(c) Lasgotasde aceiteseunen en el aguapara formar una fase
separadadebidoa Ia fuerteatraccinque tienenlas
molculashidrofbicasentre ellas.
(d) En un puentede hidrgeno,secompartenelectronesentre
un tomo de hidrgenoy dos tomoselectronegativos
adyacentes.
(e) La formacin de puentesinternosdisulfuro esla principal
fuerzaque dirige el tratamientode protenas.
2,4 Energlasde enlace.La relacinentreIa cantidadde
energaque serequierepararomper los enlacesy la cantidadde
energadisponibleen la radiacinsolara la que seexponen
dichosenlacestiene una importanciaconsiderablepra
determinarel estadode los nhcesen lasmolculasorgnicas.
(a) Dado que el enlacesimplede carbono-carbonono se
modifica por la luz verde(500nm) pero sepuederomper
por la energadelaltz ultravioleta(por ejemplo,300nm),
la
dequ longitud de onda esIa luz que tiene exactamente
energanecesariapara romper un enlacesimplecarbonocarbono?
^U -^U-
^u -^v
u-"lN * - - u
H-C-CH3
I
CH,
I
CHe
(a) lsoleucina
(aminocido)
I
f
:t,
H-C-H
^UI -^U-
o
(b) Oxalacetato
t+^.^^
i^^i-^A^
\tut I il4 tut ilaua
A^
u9
un cidocarboxlico)
T1
I
f : : ( J
H-C-OH
I
H-C-OH
H-C-OH
cH2oH
(pentosa
(c) Ribosa
presente
en el DNA)
r]
I
U:U
I
H-C-H
I
H-C-OH
H-C-oH
I
cH20H
(pentosa
(d) Deoxiribosa
presente
en el DNA)
(b) Losenlaces
entrelos monmerosseforman mediantela
eliminacinde aguayserompen mediantela adicin de
agua.
.2,9 Ensamblajedel TMV. Cadauna de lassiguientes
afirmacionesconsisteen una observacinexperimental
de virionesdel virus el mosaico
relacionadacon el reensamblaje
del tabaco(TMV) a partir de TMV RNA y subunidadesde la
protenade recubrimiento.Afirme, en cadacaso,una conclusin
razonableque sepuedaextraerde la observacinexperimental.
(a) Cuandoel RNA de una cepaespecficade TMV semezcla
con una protenade recubrimientoprocedentede la misma
cepaseforman viriones infecciosos.
(b) Cuandoel RNA de la cepaA de TMV semezciacon una
protenade recubrimientode la cepaB, losvirionesquese
forman son infecciosos,dando lugar a partculasviralesde
la cepaA en lasclulasdel tabacoinfectadas.
(c) Losmonmerosaisladosde Ia protenade recubrimiento
puedenpolimerizarparaformar una estructurahelicoidal
viral en ausenciade RNA.
(d) LosvirionesTMV queseforman en clulasvegetales
infectadascontienennicamenteTMV RNA y nunca
ninguno de los otros tipos celularesde RNAspresentesen
Ia clulahusped.
(e) Independientemente
de Ia proporcin entreRNA y
protenade recubrimientode la mezclainicial, los viriones
que sereensamblancontienensiempreRNA y protenade
recubrimientoen una proporcin de tresnucletidosde
RNA por cadamonmero de protenade recubrimiento.
.2.10 Estaesla respuesta.Cuilesla pregunta?Cadauna de
indique en cada
lassiguientesafirmacioneseslna resPuesra;
casoculesla pregunta.
(a) Estecomponentede la radiacinsolaressuficientemente
pararomperlos enlaces
carbono-carbono.
energtico
(b) Estapropiedaddel aguahaceposibleel enfriamientode los
animalesterrestresmediantela evaporacinsuperficialcon
una mnimaprdidade fluidoscorporales.
(c) La siguienteunidadmonomricaqueseune a un polmero
debeestaren esteestadopara que la reaccinde
condensacinseafavorableenergticamente.
(d) Esteprincipio de la biosntesis
de macromolculas
minimiza la cantidadde energagenticanecesariay hace
posibledesecharlos componentesimperfectosen distintos
estadios.
(e) Estapropiedadde una molculahaceprobableque se
encuentreen una membrana.
Problemas 43
Bibliografa recomendada
Lasreferencias
conimoortancia
hstrica
estnmarcadas
con ..
Referenciasgeneralesy levisiones
Bhagavan,N. Y. MedicalBiochemistry.SanDiego:Harcourt/Academic
Press,2002.
Lehninger,A. L., D. L. Nelsony M. M. Cox. Principlesof Biochemistry,
3rd ed.NewYork:Worth, 1999.
Malacinski,G.M. Essentials
of MolecularBiology,4th ed.Boston:Jones
andBarletts,2003.
Mathews,C. K., K. E. van Holde y K. G. Ahen. Biochemistry,3rd.
ed.
Menlo Park,CA: Benjamin/Cummings,2000.
Thornton, R. M.. TfuChemistryof Life.Menlo Park, CA:
Benjamin/Cummings,1998.(A CD-ROM that usesinteractive
exercisesto help bridge the gap betweenchemistry and
biology.)
Wald,G. The origins of life. Proc.Nat.Acad. Sci.USA52 (1994):595.
La importanciadel agua
Bryant,R. G. The dl.namicsof water-proteininteractions.Annu. Rev.
Biophys.Biolmolec.Struct.25 (1996):29.
Mathews,R. Wackywater. NewScientist(Jtne 21, 1997).
Westof E. ed.Wateran BiologicalMacromolecules.
BocaRaton,FL:
CRCPress,1993.
Wiggins,P.M. Roleof water in somebiologicalprocesses.
Microbiol.
Rev.54(1990):432.
La impottanciade las membranas
Baldwin,S.A. MembraneTransport:A PracticalApproach.Oxford:
Oxford UniversityPress,2000.
Mellman,I., and G. Warren.The road taken:Pastand future
foundationsof membranetrafc.Cell100(2000):99.
Pett H. R. MolecularBiologyof Membranes:Structureand Function.
New York SpringerVerlag,1993.
Rees,D. C. MembraneProfeins.
Boston:AcademicPress,2003.
Tien, H. T., and A. Ottova-Leitmannova.MembraneBiophysics:
As
Viewedfrom ExperimentalBilayerLipid Membrans.
New York:
Elsevier,2000.
[a impoltanciade las macromolculas
Creighton,T. E. Proteins:Structureand MolecularProperties,2nded.
NewYork:W. H. Freeman.1993.
44
Captulo
2
Laquimica
delaclula