rotenas so formadas por sequncias de amino cidos.

Conforme o tempo passa, os genes das protenas se duplicam. A partir de uma protena
ento, podem surgir vrias outras. Sequncias de protenas tambm sofrem mudanas, a partir
de alteraes nas sequncias de nucleotdeos nas clulas, de forma aleatria.
Para uma dada sequncia de amino cidos, h uma dada estrutura. Essa estrutura pode as
sumir diferentes conformaes, ou seja, redes de interaes entre os amino cidos de sua s
equncia definindo por padres de pontes de hidrognio ou de interferncias estricas estr
uturas locais (secundrias) helicoidais ou linearmente alternadas (fitas e folhas)
.
Dentro desta estrutura, e logo dessa sequncia, a seleo natural age de forma a possi
bilitar uma ou mais
funes para uma determinada protena, dentro de uma via ou rede metablica da qual a me
sma participa.
Protenas que vieram de uma mesma sequncia ancestral so chamadas de homlogas, e abrig
am um certo nvel de similaridade a nvel sequencial. Quanto maior o tempo de divergn
cia entre estas protenas, ou maiores as presses seletivas que algumas funes podem ex
igir das mesmas, mais diferentes so as sequncias de um grupo de protenas homlogas (f
amlias de protenas).

-> Eventos de duplicao associados mudanas so capazes de gerar novas funes para membro
de uma famlia de protenas.
A funo de uma protena depende de um determinado gradiente de estados conformacionai
s para sua dada estrutura. E de um nmero determinado das molculas de protenas capaz
es de assumir estes estados nas clulas. A ocorrncia de uma determinada funo pode dep
ender da presena de molculas parceiras protena (substratos, coenzimas, ons, DNA, out
ras protenas, etc - parceiros de interao).
Funes podem ser reguladas por molculas parceiras, tanto possibilitando novas funes, n
ovos parceiros quanto os coibindo.
-> Logo, h correspondncia entre uma dada sequncia de amino cidos e a funo efetuada pel
a protena decorrente da mesma em um dado contexto celular.
-> Nota-se tambm uma presso do uso de cdons de um determinado organismo sobre as se
quncias proteicas, de forma a regular sua expresso.

Os estados conformacionais que uma dada estrutura capaz de assumir, depende das
propriedades termodinmicas e qunticas da transmisso de informao na rede de interaes fo
mada entre os amino cidos de uma protena, seus parceiros de interao e o solvente.
Para diferentes protenas vindas de uma mesma famlia, certos conjuntos de amino cido
s podem ser responsveis para uma funo conservada durante sua histria evolutiva. Um d
eterminado conjunto de amino cidos pode ento ser selecionado positivamente em prot
enas homlogas para o qual esta funo herdada.

Substituies neste conjunto (mutaes) podem ou no perturbar significativamente a termod

inmica ou as propriedades qunticas da transmisso de informao na rede de interaes respo
svel por uma determinada funo proteica. Tanto a robustez desta rede, sua plasticida
de quanto a capacidade de uma substituio causar um efeito significativo sobre a me
sma (tanto relativo sua posio, quanto substituio efetuada) determinam o efeito desta
substituio.

-> COMENTAR AQUI A QUESTO DE "SUBSTITUIES SINNIMAS", DA QUESTO DE SUBSTITUIES EM LOOPS

VS EST. SECUNDRIAS

Espera-se tambm que substituies possam causar o surgimento de novas funes proticas com
o passar do tempo.