Sistemas biolgicos e a

qumica de biomolculas

Nelson, D.L. & Cox, M.M.. Lehninger Principles of Biochemistry, 4th Ed.

Nelson, D.L. & Cox, M.M.. Lehninger Principles of Biochemistry, 4th Ed.

O que a bioqumica estuda?

A bioqumica descreve, em termos moleculares, as estruturas, mecanismos e

processos qumicos compartilhados por todos os organismos vivos, e prope
princpios organizatrios que so comuns a todas as distintas formas de vida....

Nelson, D.L. & Cox, M.M.. Lehninger Principles of Biochemistry, 4th Ed.

Mas se ns estamos interessados em sistemas vivos, como definimos esses sistemas?

Organismos vivos (obrigatoriamente) apresentam:

1. Alto grau de complexidade qumica e organizao estrutural
2. Sistemas para extrair e converter energia do ambiente
3. Capacidade para auto-replicao e auto-montagem
4. Mecanismos para perceber e responder a alteraes no ambiente
5. Funes definidas para cada componente e interaes reguladas entre
eles
6. Historia de mudana evolutiva

A maioria dos organismos vivos so organismos celulares, que apresentam estruturas distintas

eucariotos

procariotos

Todos os organismos celulares so classificados em filos, de acordo com caractersticas comuns

As clulas so compostas de estruturas complexas......mas

Quimicamente, os componentes bsicos so

molculas pequenas e simples

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Nelson, D.L. & Cox, M.M.. Lehninger Principles of Biochemistry, 4th Ed.

Biomolculas so constitudas essencialmente de C, H, O e N

99% da massa da maioria das clulas

O elemento carbono representa mais da metade do peso seco de organismos vivos

A ligao de grupamentos com outros tomos ao carbono cria grupos funcionais, com
propriedades qumicas distintas

Mas uma mesma biomolcula pode ter vrios grupos funcionais distintos

Do ponto de vista de interaes moleculares, qual o resultado desta

diversidade de grupos funcionais?

A conformao espacial das biomolculas tambm essencial para sua funo

em um sistema biolgico

Estereoismeros (geomtricos):

Ismeros ticos: enantiomeros e diastereomeros:

A maior parte das biomolculas so polmeros formados pela ligao de unidades monomricas simples

Esses poucos blocos essenciais criam uma diversidade molecular infinito

1. Genoma humano: 3 x 109 nucleotdeos, que codificam cerca de 3 x 105 genes
distintos e mais um numero ainda no quantificado de RNAs no codificadores

2. Proteoma humano: s uma organela, como a mitocndria, contem

entre 800-1200 protenas distintas

Fig. 2 Functional classification of the mitochondrial proteome from S. cerevisiae (851 independent
hits) (modified from Sickmann et al., PNAS 2003)

3. Analises de metaboloma permitem identificar mais de 20.000

compostos de baixo peso molecular

Quais interaes mantm as estruturas das biomolculas?

1. Os monmeros so ligados por ligaes covalentes

Ou seja, ligaes muito fortes,

que para serem quebradas
necessitam de muita energia

2. Interaes entre macromolculas so, na grande maioria, no covalentes:

a)
b)
c)
d)

Interaes inicas
Ligaes de hidrognio
Interaes hidrofbicas
Ligaes de van der Walls

Ou seja, ligaes mais fracas do

que as covalentes, e que portanto
necessitam de menos energia para
serem quebradas

Resultado: maior plasticidade molecular

Manter essa alta organizao molecular dos sistemas biolgicos requer energia

Mas o que permite e executa todas essas caractersticas nicas?

Funo do complemento molecular de cada clula e de todas

as interaes entre as molculas do sistema, e da

compartimetalizao espacial de cada conjunto de molculas.

BIOQUMICA

Sistemas biolgicos so altamente organizadas.....isso requer energia para manter

essa organizao

Organismos vivos so sistemas abertos; trocam energia e matria com o ambiente

As reaes qumicas que armazenam e removem energia em organismos vivos

so altamente conservadas

o fluxo de eltrons, da gua a glicose, e de glicose a O2, que faz com

que a energia captada do sol fique disponvel aos organismos

Alguns princpios de Bioenergtica:

G = a quantidade de energia necessria para uma reao em temperatura e presso constantes

H = entalpia, funo do numero e tipo de ligaes qumicas envolvidas na reao
S = entropia, ou grau de desorganizao da energia em um sistema reacional

G = variao de energia livre de um sistema reacional

G0 = G de uma reao acontecendo em condies standard

(T 298K = 25C; [ ] substratos e produto = 1 M
G0 = G0 em pH 7 [H+] = 10-7 M

Muitas reao biolgicas so endergnicas....como elas acontecem in vivo?

Acoplamento energtico

Adenosina trifosfato a grande moeda energtica da clula

Mais recursos:
Chapter 1: The foundations of Biochemistry
Nelson & Cox, Lehninger Principles of Biochemistry, 4th ed.
Sobre a termodinmica da vida: http://www.intothecool.com/