UNIVERSIDAD NACIONAL PEDRO RUIZ GALLO

Facultad de Medicina Humana

ENZIMAS
Integrantes:

Robles Marcelino Leslie Sollange

Saavedra Serrano Juliette Andrea

Saldaa Vargas Roy

Sampertegui Salazar Sheyla Melissa

Snchez Snchez Karoline Kristel

Segura Segura Camila Lorena

Sosa Curo Maricielo

Tarrillo Castillo Oscar Frankis

Tenorio Maldonado Sofia Yamill

Vsquez Navarro Hristo Oswald Antonio

Vsquez Surez Luz Anglica

Vsquez Surez Nataly Esther

Vsquez Vsquez Nury Liseth

Ynga Ruiz Neiser

Yrigoin Oblitas Ronaldo

Zorrilla Pereyra Thala Kimberly

ENZIMAS Seminario 1

NDICE
1.

INTRODUCCIN.........

......pg. 03
2.

OBJETIVOS

...........

..............pg. 03
3. MARCO TERICO
3.1.
DEFINICION
ENZIMA.pg. 04

DE

3.2.
CINTICA
ENZIMTICA...pg. 05
3.3.
REACCIONES
ENZIMTICAS....pg. 10
3.4.
COMPETICIN
ENZIMTICA...pg. 17
3.5.
ENZIMAS
LISOSOMALES....pg. 22
3.6.
ENZIMAS
...pg. 24

CITOPLASMTICAS..

3.7.
ENZIMAS
....pg. 31

Medicina Humana

Pgina 2

NUCLEARES.

ENZIMAS Seminario 1
4.
CONCLUSIONES
..pg. 38
5.

BIBLIOGRAFA...

..pg. 39

INTRODUCCIN
La vida de diferentes seres unicelulares o pluricelulares dependen de una
serie compleja de reacciones qumicas perfectamente ordenadas, este
orden es debido a que esas reacciones qumicas estn catalizadas
por protenas denominadas enzimas, cuyas propiedades permiten
modular las velocidades de estas reacciones.

Las enzimas son polmeros biolgicos que catalizan las reacciones

qumicas que hacen la vida posible como se conoce. La presencia y
conservacin de un conjunto completo y equilibrado de enzimas son
esenciales para la desintegracin de los nutrientes a fin de proporcionar
la energa y las unidades qumicas de construccin; para el ensamble de
esas unidades de construccin en protenas, ADN, membranas, clulas,
tejidos, y para el aprovechamiento de la energa para impulsar la
motilidad celular y la contraccin del musculo. Con excepcin de unas
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ENZIMAS Seminario 1
molculas de ARN catalizadoras, o ribozimas, la mayora de enzimas son
protenas.

En mayor parte estas reacciones no se daran en ausencia de las enzimas

o procederan a velocidades despreciables, cada ser vivo tiene ms de un
millar de enzimas diferentes y de la accin enzimtica de una
determinada clula condiciona
sus
posibilidades
y
determinar
sus funciones biolgicas.

ENZIMAS
Uno de los primeros nombres aplicados a lo que ahora llamamos enzimas fue
fermento; sin embargo, hubo que esperar hasta 1926 para obtener la primera
enzima cristalizada, la ureasa, demostrndose que era una protena cataltica.
En los primeros aos de 1980 los bilogos descubrieron que, adems de las
protenas ciertas molculas de ARN, llamadas ribozimas, tienen tambin
actividad cataltica.
Como sucede con todos los catalizadores, las enzimas tienen las siguientes
propiedades:

Incrementa la velocidad de una reaccin disminuyendo el requerimiento

de la energa de activacin y el tiempo de la reaccin.

Funciona formando complejos transitorios con las molculas de sustrato,

facilitando su interaccin

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ENZIMAS Seminario 1

No sufren cambios irreversibles durante la reaccin, por lo que cada

molcula de enzima puede participar de manera repetida en reacciones
individuales.

No tienen efecto en la termodinmica de la reaccin endergnica.

Estas protenas globulares contienen dentro de su estructura terciaria un grupo

caracterstico de aminocidos que forman el sitio activo, donde ocurre el
evento cataltico al unirse al sustrato para poder dar origen al producto. El
nmero de moles de sustrato convertidos a producto por minuto y por mol de
enzima reciben el nombre de nmero de recambio.

Las enzimas son producidas intracelularmente y son necesarias en nfimas

cantidades. Su caracterstica ms importante es la especificidad, la cual es
visible cuando intracelularmente reacciona con un sustrato y extracelularmente
con varios.
Una enzima activa recibe el nombre de HOLOENZIMA y cuando no lo est
ZIMGENO O PROENZIMA, para su activacin se necesita la presencia de HCl en
el caso del pepsingeno o de enteroquinasa en el caso del tripsingeno. Algunas
enzimas para su funcionamiento necesitan la ayuda de otra enzima o de un
cofactor que puede ser un metal o de un grupo prosttico; las enzimas que no
requieren de un cofactor reciben el nombre de ALOENZIMA.
As las enzimas que necesitan un cofactor pueden ser:

Mn: glutamina sintasa, arginasatransferasa.

Mg: fosfohidrolasas, fosfotransferasas, ATPasa.
Cu: citocromooxidasa, tirosinasa.
Zn: anhidrasa carbnica, carboxipeptidasa, fosfatasa alcalina.
K: piruvatoquinasa. ATPasa.

SEGN SU FUNCIN SE CLASIFICAN EN:

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1. Oxidorreductasa: participan en procesos de respiracin y fermentacin.

Ejemplo: deshidrogenasa, aminooxidasa, catalasas.
2. Transferasas: transfieren un grupo activo a una sustancia receptora.
Ejemplo: transaldolasas, Transcetolasas, Hexoquinasas, fosfatasas.
3. Hidrolasas: hidrlisis de polmeros.
Ejemplo: protidasas, lipasas, esterasas, carbohidrasas.
4. Liasas: rompen enlaces disociando los grupos produciendo una
redistribucin de los electrones. Ejemplo: aldolasas y descarboxilasas.
5. Isomerasas: obtencin de ismeros de funcin o posicin.
Ejemplo: isomerasas de azcar, epimerasas, mutasas.
6. Ligasas: une molculas para formar una sola.
Ejemplo: peptidosintetasas. carboxilasas.

CINTICA ENZIMTICA
La palabra cintica es de origen griego (Kinetikos, significa movimiento).
Aplicada a las reacciones qumicas, la cintica concierne a las velocidades de
reaccin y la manera en que esas velocidades estn influidas por varios
factores, pero especialmente por la concentracin del sustrato, de los productos
y de los inhibidores. Aqu nos centraremos, mayoritariamente, en los efectos de
la concentracin del sustrato en la cintica de las reacciones catalizadas
enzimticamente.
La mayora de las enzimas siguen la cintica de Michaelis-Menten

A CINTICA DE MICHAELIS-MENTEN:
Desde hace mucho tiempo se sabe que la velocidad de una reaccin catalizada
enzimticamente, aumenta con la concentracin de sustrato, pero de tal forma,
que cada incremento adicional de sustrato, da como resultado un aumento
menor de la velocidad de reaccin. De manera ms precisa, se puede observar
experimentalmente que la relacin entre la velocidad inicial de reaccin v y
la concentracin de sustrato [S] es una hiprbole.
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ENZIMAS Seminario 1

Una propiedad importante de esta relacin hiperblica es que a medida que [S]
tiende hacia el infinito, v tiende hacia un valor mximo, que depende del
nmero de molculas enzimticas y, por tanto, slo puede incrementarse
aadiendo ms enzima.
La incapacidad para aumentar la velocidad de reaccin ms all de un valor
finito mximo a concentraciones de sustrato cada vez ms altas, se llama
saturacin. sta es una caracterstica fundamental de las reacciones catalizadas
enzimticamente. Las reacciones catalizadas siempre llegan a saturacin a
concentraciones altas de sustrato, mientras que esto no ocurre en las
reacciones no catalizadas. Gran parte de nuestra comprensin de la relacin
hiperblica entre [S] y v se debe a los trabajos pioneros de dos enzimlogos
alemanes, Leonor Michaelis y Maud Menten. En 1913, postularon una teora
general de la accin enzimtica, que ha resultado ser la base para el anlisis
cuantitativo de casi todos los aspectos de la cintica enzimtica. Para entender
su enfoque, se considera una de las posibles reacciones catalizadas
enzimticamente ms simples, en la cual un nico sustrato S se convierte en un
nico producto P.
S

P
(enzima)

Michaelis y Menten llegaron a la siguiente relacin entre la velocidad de una

reaccin catalizada enzimticamente y la concentracin de sustrato:
Aqu, [S] es la concentracin inicial de sustrato, v es la velocidad
inicial de
reaccin a esa concentracin de sustrato, y Vmax y Km son parmetros
cinticos importantes que consideraremos en la prxima seccin. sta es la
ecuacin Michaelis-Menten, la principal de la cintica enzimtica.
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CUL ES EL SIGNIFICADO DE VMAX Y KM?

Para valorar las consecuencias de la relacin entre v y [S] y examinar el
significado de los parmetros Vmax y Km, podemos considerar tres casos
especiales de concentracin de sustrato: concentracin de sustrato muy baja,
concentracin de sustrato muy alta y el caso especial de [S] = Km.
Caso 1: concentracin de sustrato muy baja ([S] <Km).
A concentracin de sustrato muy baja, [S] es despreciable comparada con la
constante Km del denominador de la ecuacin de Michaelis-Menten, por lo que
podemos escribir

Por tanto, la concentracin de sustrato muy baja, la velocidad inicial de reaccin

es ms o menos proporcional
a la concentracin de sustrato. sta es, por
tanto, la regin de primer orden de la grfica de Michaelis-Menten. Mientras la
concentracin del sustrato sea mucho ms baja que el valor de Km, la velocidad
de una reaccin catalizada enzimticamente, aumenta casi linealmente con la
concentracin de sustrato.

Caso 2: Concentracin de sustrato muy alta ([S] >Km).

A concentraciones de sustrato muy altas, Km se vuelve Insignificante
comparada con [S] en el denominador de la ecuacin de Michaelis-Menten, y

podremos escribir:

Esta relacin significa que, a concentraciones de sustrato muy altas, la

velocidad de una reaccin catalizada enzimticamente, es esencialmente
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independiente de la variacin de la [S], volvindose casi constante. sta
constituye la regin de orden cero de la representacin de Michaelis-Menten
.Mientras la concentracin de sustrato sea mucho mayor que el valor de Km, la
velocidad no se ve afectada por los cambios en la concentracin de sustrato,
permaneciendo
casi constante, con valores prximos a Vmax.
Por tanto, el lmite superior de Vmax se determina por:
1) El tiempo necesario para la reaccin cataltica real ms la liberacin
subsiguiente del producto desde la superficie de cada molcula de
enzima.
2) El nmero de molculas presentes. Debido a que la velocidad real de la
reaccin es limitada, la nica manera de que la Vmax pueda aumentar es
incrementando la concentracin de la enzima. De hecho, Vmax es
linealmente proporcional a la cantidad de enzima presente, como se
muestra en la Figura :6.9

Caso 3: ([S] = Km).

El caso especial en el que [S] es exactamente igual a Km. Bajo
estas condiciones, la ecuacin de Michaelis-Menten se puede escribir
como:

Esta ecuacin nos proporciona la definicin que hemos estado buscando:

Km es la concentracin de sustrato para la cual la reaccin tiene lugar a
la mitad de su velocidad mxima. Esta concentracin es un valor fijo
para cada enzima que cataliza una reaccin determinada bajo unas
condiciones especficas y se denomina constante de Michaelis (de ah
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su abreviatura Km) en honor al enzimlogo que dilucid su significado.
La Figura 6.8 ilustra el significado deVmax y de Km.
ECUACION
DE (Limitaciones
HILL: (LIMITACIONES
DEL
MODELO DE
B) B)
ECUACION
DE HILL:
del modelo de
Michaelis-Menten)
MICHAELIS-MENTEN)
Describe la conducta de enzimas que
muestran unin cooperativa de sustrato.
Ciertas enzimas y otras protenas que
enlazan ligandos, como la hemoglobina,
no muestran la cintica clsica de
saturacin de Michaelis-Menten. Cuando
[S] se grafica contra v, la curva de
saturacin es sigmoide.
Esto indica, por lo general, el enlace
cooperativo
del
sustrato
a
sitios
mltiples. Para la cintica de saturacin
del sustrato sigmoide estn invalidados
los mtodos de graficas de la concentracin del sustrato que produce la
mitad de la velocidad mxima anteriormente descrita (no se producen
rectas). Para evaluar la curva sigmoide de la cintica de saturacin se
emplea una representacin de la ecuacin de Hill, originalmente derivada
para describir el enlace cooperativo de molculas de oxigeno de la
hemoglobina. Escrita de forma lineal la ecuacin de Hill es:

[ S ] log k '
log

Vi
=n log
Vmax Vi
Donde k: constante compleja. La
ecuacin afirma que cuando [S] es baja
comparada con k, la velocidad de
reaccin aumenta a la ensima potencia
de [S].

Un grfico de Iog v/( Vmx - v) contra log[S] da una lnea recta, donde la
pendiente de la lnea n es el coeficiente de HilI, y un parmetro emprico
cuyo valor est en funcin del nmero, la clase y la fuerza de las
interacciones de los sitios de unin a sustrato mltiples sobre la enzima.
Cuando n = 1, todos los sitios de unin se comportan de manera
independiente, y se observa conducta cintica de Michaelis-Menten
simple. Si n es de ms de 1, se dice que la enzima muestra cooperacin
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positiva. La unin de sustrato a un sitio aumenta entonces la afinidad de
los sitios restantes para unin a sulfato adicional. Mientras mayor es el
valor para n, ms alto es el grado de cooperacin, y ms sigmoideo ser
el grfico de v contra [S].
Una perpendicular trazada desde el punto donde el trmino y Iog V 1/
(Vrnlix - v) es cero interseca el eje x en una concentracin de sustrato
llamada S50, la concentracin de sustrato que da por resultado la mitad
de la velocidad mxima.

REACCIONES ENZIMTICAS
Las enzimas son sustancias con cualidades altamente catalizadoras.
Incrementan la velocidad de reaccin catalizada en 10 15 o ms veces. Para
comprender cmo funcionan los mecanismos de la catlisis enzimtica es
necesario observar el desarrollo de una reaccin no catalizada.
A. Reaccin no catalizada
A modo de ejemplo tornaremos una reaccin del tipo A + B = C + D. Los
reactivos A y B se encuentran en una solucin acuosa, rodeados por una capa
de molculas de agua (capa de hidrato), y se desplazan en sentidos aleatorios
segn el desplazamiento del calor.
Se produce una reaccin si y slo si ambos reactivos chocan en la
direccin adecuada y necesaria para generar una reaccin, algo poco probable
y, por ende, extremadamente inusual. Antes de transformarse en los productos
C + D, el complejo ternario A-B debe superar un estado Intermedio. Para que
esto se produzca es necesario, a su vez, que exista una fuerte energa de
activacin E. Esto ocurre con menor frecuencia an, ya que slo algunos
complejos ternarios A-B liberan la suficiente cantidad de energa como para
alcanzar este estado intermedio.
Dentro de una solucin lquida, la mayor parte de la energa de activacin
es utilizada para disolver la capa de hidrato entre A y B. Sin embargo, los
desplazamientos de carga y otros procesos qumicos de los reactivos,
contribuyen tambin a disminuir el efecto de dicha energa. Estas limitaciones,
junto a la falta de catalizadores, generan que la transformacin se produzca
nicamente en ocasiones excepcionales y que la velocidad de reaccin (v) sea
mnima, incluso cuando la transformacin es termodinmicamente posible.

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B. Reaccin catalizada mediante una enzima

En el mecanismo descrito anteriormente, la unin de los sustratos A y B
sigue un orden secuencial al igual que la liberacin de los productos C y D.
Las enzimas pueden unir los reactivos (especficamente sus sustratos) en el
centro activo, proceso en el cual los sustratos se orientan en una posicin que
les permite alcanzar el estado intermedio. Por lo tanto, el posicionamiento y la
orientacin de los sustratos incrementan drsticamente la probabilidad de que
se generen complejos AB productivos. Durante la unin de sustratos se
eliminan asimismo sus capas de hidrato. Al expulsar las molculas de agua se
modifican completamente las condiciones dentro del centro activo de la enzima
durante la catlisis.
Las coenzimas y otros cofactores afectan asimismo el desarrollo de la
reaccin, disminuyendo la energa de activacin necesaria para alcanzar el
estado intermedio. Durante el proceso de catlisis, muchas enzimas toman
adems grupos de los sustratos o bien los liberan. Se produce con frecuencia un
traspaso de protones. Esta catlisis cido-base a travs de las enzimas es
considerablemente ms efectiva que el intercambio de protones con cidos y
bases en una solucin.

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ENZIMAS Seminario 1

Principios de la catlisis enzimtica

Si bien resulta difcil estimar cuantitativamente el impacto de cada uno
de los efectos catalticos, el poder de estabilizacin del estado intermedio de la
enzima es considerado el factor determinante por excelencia.
Lo que determina la efectividad de la catlisis no es la unin de los
sustratos (se elevara la energa de activacin de la reaccin en lugar de
disminuir) sino la del estado intermedio. La extrema afinidad de algunas
enzimas por anlogos del estado intermedio es una clara prueba de esto.

Para justificarlo basta una simple analoga mecnica: para desplazar un

grupo de esferas metlicas (reactivos) de la posicin estado del sustrato
(EA) a la posicin estado del producto (EP), pasando por un estado
intermedio a mayor altura energtica. Es necesario ordenar los imanes
(catalizador) de tal manera que la fuerza de atraccin no afecte a EA sino
al estado intermedio.

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ENZIMAS Seminario 1

CMO ACTAN LAS ENZIMAS?

A) CAMBIOS DE ENERGA QUE OCURREN DURANTE LA REACCIN
Las
enzimas
proporcionan
una
va
de reaccin
alternativa,
energticamente favorable, en comparacin con la reaccin no catalizada.
1. Energa libre de activacin:
Las reacciones qumicas tienen una barrera de energa que separa
los reactantes de los productos, esta barrera se denomina energa libre de
activacin. Es la diferencia de energa entre la energa de los reactantes y
un intermediario de energa elevada. El pico de energa es la diferencia
de energa libre entre el reactante y T* (estado de transicin) , donde el
intermediario de energa elevada se forma durante la conversin del
reactante en producto.

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2. Velocidad de reaccin:
Para que las molculas reaccionen,
deben contener suficiente energa como
para superar la barrera de energa del
estado de transicin. En ausencia de una
enzima, slo una pequea proporcin de una
poblacin de molculas puede poseer esa
energa suficiente como para alcanzar el
estado de transicin entre el reactante y el
producto. La velocidad de la reaccin viene
determinada por el nmero de dichas
molculas energizadas. En general, cuanto
menor sea la energa libre de activacin,
mayor es el nmero de molculas con
energa suficiente para atravesar el estado
de transicin y, por tanto, ms rpida es la
velocidad de la reaccin.

NOTA:
La enzima no cambia la energa libre de los reactantes ni de los
productos , por consiguiente, no cambia el equilibrio de la reaccin.
Sin embargo, acelera la velocidad con la cual se alcanza el equilibrio.

B. QUMICA DEL SITIO ACTIVO

La presencia de sustratos hace a las enzimas ms resistentes a los efectos
desnaturalizantes de las temperaturas altas. Las enzimas y sus sustratos
interactan para formar un complejo de enzimasustrato (ES) cuya estabilidad
trmica es mayor que la de la enzima en s, dicha interaccin ocurre en un lugar
llamado sitio activo.

1. Sitios activos:

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ENZIMAS Seminario 1
Las molculas enzimticas contienen
una bolsa o hendidura especial denominada
sitio activo; que viene a ser una mquina
molecular
compleja
que
emplea
mecanismos qumicos diversos para facilitar
la conversin del sustrato en producto. En el
sitio
activo ocurren la unin, activacin y
transformacin qumica del sustrato. Los
sustratos son acercados estrechamente uno a
otro en la alineacin ptima con los cofactores,
grupos prostticos y cadenas laterales de
aminocidos que se encargan de catalizar su transformacin qumica en
productos.
Adems de unirse con el sustrato, el sitio activo contiene un conjunto
particular de cadenas laterales de aminocidos que influyen en el sustrato y
disminuyen la energa de activacin de la reaccin. La catlisis es aumentada
ms por la capacidad del sitio activo para proteger sustratos contra agua y
generar un ambiente cuya polaridad, hidrofobicidad, acidez o alcalinidad puede
diferir de manera notoria de la que hay en el citoplasma circundante.

La unin del sustrato.

Una vez en el sitio activo, las molculas de sustrato se unen

temporalmente a la superficie de la enzima, con la orientacin apropiada para
interaccionar entre s y con grupos catalticos especficos de la enzima, lo cual
facilita la reaccin. La unin del sustrato suele realizarse a travs de
aminocidos cargados, por medio de puentes de hidrgeno o enlaces inicos (o
ambos). Estas uniones son, en general dbiles, por lo tanto la modificacin
qumica de la enzima es transitoria; en el momento en que se completa la
reaccin, la enzima vuelve a su estado no modificado original. De este modo, su
funcin permanece cataltica; sin embargo la suma de varias de ellas es
suficiente para mantener a la molcula en su lugar.

Existen modelos de unin enzima-sustrato:

Modelo de cerradura y llave:
Sugerida en 1894 por el bioqumico alemn Emil Fischer. Explica la
especificidad enzimtica, sin embargo, la rigidez implcita del sitio activo
de la enzima no explic los cambios dinmicos que acompaan a la
catlisis.

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Modelo de ajuste inducido:

Propuesto en 1985 por Daniel Koshland. Este modelo supone que la
unin inicial de la(s) molcula(s) de sustrato al sitio activo deforma la
enzima y el sustrato, estabilizando a las molculas de sustrato en su
estado de transicin y permitiendo que los enlaces crticos sean ms
susceptibles a ataques catalticos; una modificacin anloga a colocar
una mano (sustrato) dentro de un guante (enzima)
La distorsin de la enzima implica un cambio conformacional en la
misma y, por tanto, en la configuracin del sitio activo; adems de inducir
cambios recprocos en sus sustratos. Este cambio posiciona de forma
ptima a los grupos reactivos apropiados de la enzima, para la reaccin
cataltica en la cual intervienen, aprovechando la energa de unin para
facilitar la transformacin de sustratos en productos. Aumentando as la
probabilidad de que la reaccin se produzca. El cambio conformacional
acerca al sitio activo a las cadenas laterales de los aminocidos que son
crticos para el proceso cataltico; en muchos casos, estas cadenas
laterales son grupos cidos o bsicos, que promueven la catlisis.

- Activacin del sustrato:

El sitio activo, activa al sustrato, sumergindolo en el medio qumico
necesario para la catlisis. Una determinada reaccin
catalizada
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enzimticamente, puede involucrar a uno o ms recursos de activacin del
sustrato. Los mecanismos ms comunes son los siguientes:
1. El cambio en la conformacin enzimtica, inducida por la unin del inicial
sustrato al sitio activo, no slo causa una mejor complementariedad y un ajuste
ms estrecho enzima-sustrato, sino que tambin deforma uno o ms de sus
enlaces, debilitando as dichos enlaces, hacindolos ms susceptible al ataque
cataltico.
2. La enzima tambin puede aceptar o donar protones, formando de ese modo
enlaces covalentes temporales entre la enzima y su sustrato; incrementando,
por tanto, la reactividad qumica del sustrato. El mecanismo necesita que el
sustrato tenga una regin que sea electropositiva (deficiente en electrones) o
electronegativa (rica en electrones) y que el sitio activo de la enzima tenga uno
o ms grupos de polaridad opuesta. Esto da cuenta de la importancia de los
aminocidos cargados en la qumica del sitio activo, lo cual, a su vez, explica
por qu la actividad de la enzima suele ser tan dependiente del pH.

- El acontecimiento cataltico.
La secuencia de acontecimientos que tienen lugar en el sitio en un
tiempo lo suficientemente corto para permitir que en el sitio activo de una sola
molcula enzimtica ocurran cientos, o incluso miles, de tales reacciones por
segundo. Tomando como ejemplo a la sacarasa se siguen estos pasos:

Paso 1: La sacarasa hidroliza el disacrido sacarosa en glucosa y fructosa.

Hasta el momento, hemos visto que la colisin inicial aleatoria de una
molcula de sustrato (sacarosa, en este caso) con el sitio activo, tiene
como resultado su unin a residuos aminoaclicos que estn posicionados
estratgicamente all.

Paso 2: La unin del sustrato induce un cambio en la conformacin

enzimtica que intensifica el ajuste entre la molcula sustrato y el sitio
activo, facilitando de ese modo la conversin del sustrato en los
productos, en este caso glucosa y fructosa.

Paso 3: Despus, estos productos se liberan desde el sitio activo

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Paso 4: permitiendo que la molcula enzimtica regrese a su

conformacin original, quedando el sitio activo ahora disponible para
admitir otra molcula de sustrato.

2. Estabilizacin del estado de transicin:

El sitio activo enlaza el sustrato e inicia su conversin a un estado
de transicin, una estructura en la cual los enlaces no son como los del
sustrato o el producto. Al estabilizar el estado de transicin, la enzima
aumenta en gran medida la concentracin del intermediario reactivo que
puede convertirse en producto y, por tanto, acelera la reaccin.
3. Visualizacin del estado de transicin:
El sustrato se une a la enzima y forma un complejo enzima-sustrato
(ES). Se piensa que la unin causa un cambio conformacional en la
enzima (ajuste inducido) que permite la catlisis. El complejo ES se
convierte
en
un
complejo
enzima-producto
(EP)
que se
disocia
posteriormente en la enzima y el producto.

MECANISMOS PARA FACILITAR LA CATLISIS

Las enzimas usan diversas combinaciones de cuatro mecanismos
generales para lograr notorio aumento cataltico de los ndices de reacciones
qumicas.
Catlisis por proximidad
Se encuentra relacionada con la orientacin del sustrato: Para que las molculas
reaccionen, los sustratos unidos con la superficie de una enzima deben
acercarse mucho en la orientacin correcta hasta ubicarse dentro de la
distancia formadora de enlace de otra. Mientras
ms
alta
sea
su
concentracin, con mayor frecuencia se encontrarn una con otra y mayor
ser el ndice de su reaccin. Cuando una enzima se une a molculas de
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ENZIMAS Seminario 1
sustrato en su sitio activo, crea una regin de concentracin local alta de
sustrato. Este ambiente tambin orienta las molculas de sustrato de manera
espacial en una posicin ideal para que interacten, lo que origina aumentos del
ndice de al menos mil veces. Por el contrario, cuando los reactivos estn en una
solucin, son libres para tener movimientos de traslacin y rotacin, incluso los
que tienen energa suficiente no siempre llegan a una colisin que conduzca a la
formacin de un complejo en estado de transicin. Las enzimas disminuyen la
entropa de sus sustratos.

Catlisis cido-bsica
Los grupos funcionales ionizables de cadenas laterales aminoacilo y
(cuando estn presentes) de grupos prostticos, contribuyen a la catlisis al
interactuar como cidos o bases. La catlisis cido-bsica puede ser
especfica o general; por especfica se alude a protones (H 3O+) o iones (OH).
En la catlisis especfica para cido o especfica para base, el ndice de reaccin
es sensible a cambios de la concentracin de protones, pero independiente de
las concentraciones de otros cidos (donadores de protn) o bases (aceptores
de protn) presentes en solucin o en el sitio activo. Se dice que las reacciones
cuyos ndices muestran capacidad de respuesta a todos los cidos o bases
presentes, estn sujetas a catlisis por cido general o por base general.
Catlisis por tensin
Las enzimas que catalizan reacciones lticas que comprenden la rotura
de un enlace covalente tpicamente se unen a sus sustratos en una
conformacin muy desfavorable para el enlace que sufrir la divisin. En
muchos casos, la conformacin cambia tanto que mejora el ajuste
complementario entre la enzima y los reactivos (un ajuste inducido) y los grupos
reactivos apropiados de la enzima se mueven a su sitio. Conforme ocurren estos
cambios en la conformacin, se realiza un trabajo mecnico, lo que permite a la
enzima ejercer una fuerza fsica en ciertos enlaces dentro de una molcula de
sustrato. La tensin resultante estira o deforma el enlace al cual se dirige;
esto lo debilita y lo hace ms vulnerable a divisin. Esto tiene el efecto de
desestabilizar el sustrato, lo que hace que adopte el estado de transicin en el
que se alivia la tensin
Catlisis covalente
El proceso de catlisis covalente comprende la formacin de un enlace
covalente entre la enzima y uno o ms sustratos. La enzima modificada despus
se convierte en un reactivo. La catlisis covalente introduce una nueva va de
reaccin cuya energa de activacin es ms baja (y, por ende, es ms rpida)
que la va de reaccin en solucin homognea. La catlisis covalente se observa
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con particular frecuencia entre enzimas que catalizan reacciones de
transferencia de grupo. La catlisis covalente a menudo sigue un
mecanismo de pingpong: uno en donde el primer sustrato es unido y su
producto se libera antes de la unin del segundo sustrato.

COMPETENCIA ENZIMATICA
Hemos asumido que las nicas sustancias en las clulas capaces de alterar la
actividad de las enzimas son sus sustratos. Muchas de estas sustancias actan
inhibiendo la actividad enzimtica, reduciendo o incluso anulando la velocidad
de reaccin con el sustrato deseado.
La inhibicin enzimtica es importante por dos razones: la principal es que esta
inhibicin acta como un mecanismo de control en las clulas.
Es importante tambin en la accin de drogas y toxinas, dado que estas inhiben
enzimas especficas.

REGULACIN ENZIMTICA:
El papel de las enzimas en la funcin celular no es que acte a altas
velocidades, las velocidades de las reacciones catalizadas enzimticamente y
rutas bioqumicas deben ser regularizadas, una de la capacidad de la clula es
contralar las actividades de la enzima con especificidad y precisin.
Entre los variados mecanismos de regularizacin, como los cambios en la
concentracin de sustrato, alteracin del pH y la presencia de inhibidores. Tal
como se desprende de la ecuacin de Michaelis-Menten, los incrementos de la
concentracin de sustrato tienden a traer un aumento de velocidad en la
reaccin, por el contrario los incrementos de la concentracin de producto
reduce la velocidad a la cual el sustrato se convierte en el producto.
En la mayora de las rutas enzimticas se regulan mediante otros pasos, entre
los ms importantes tenemos la regulacin alostricay la modificacin
covalente.

INHIBIDORES ENZIMTICOS:
Son molculas que pueden unirse con una enzima y disminuir su actividad. La
clula depende de inhibidores para regular la actividad de muchas de sus
enzimas; estos pueden ser de dos tipos reversibles o irreversibles y los
reversibles a su vez en competitivos o no competitivos.

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ENZIMAS Seminario 1
Los inhibidores irreversibles son los que se unen con gran firmeza a una
enzima, a menudo mediante la formacin de un enlace covalente con alguno de
sus
residuos
de
aminocidos.
Varios
gases
nerviosos,
como
el
diisopropilfosfofluoridato y los pesticidas organofosforados, actan como
inhibidores irreversibles de la acetilcolinesterasa, una enzima que tiene un
papel crucial en la destruccin de la acetilcolina el neurotransmisor encargado
de producir la contraccin muscular.
Con la inhibicin de esta enzima, el musculo se estimula en forma continua y
permanece en estado de contraccin constante.
Un inhibidor irreversible se une a la enzima covalentemente, provocando una
perdida irrevocable de la actividad cataltica los inhibidores irreversibles se
caracterizan por ser txicos para las clulas. As tenemos a los iones de
metales pesados, los agentes alquilantes y los gases txicos nerviosos.
Estas sustancias se unen de manera irreversible ala acetilcolinesterasa (es una
enzima fundamental para la transmisin del el impulso nervioso); al momento
de inhibirse la actividad de la acetilcolinesterasa se produce la parlisis rpida
de las funciones vitales (la nutricin, reproduccin y la relacin) provocando la
muerte.
Uno de los gases nerviosos es el di-.isopropilofluorofosfato, el cual se une
covalentemente al grupo hidroxilo de una cerina del sitio activo de la enzima, a
la cual inactiva permanentemente. Muchas toxinas naturales son inhibidores
enzimticos irreversibles
Tal es el caso del alcaloide fisostigmina, un componente del haba de calabar,
esta inhibe irreversiblemente a la acetilcolinesterasa el antibitico penicilina es
un inhibidor irreversible de la serina enzimas involucradas en la sntesis de la
pared celular bacteriana; por este motivo la penicilina es eficaz contra las
infecciones bacterianas.
Los inhibidores competitivos son inhibidores reversibles que compiten con
un sustrato por el acceso a sitio activo de una enzima. Como los sustratos
tienen una estructura complementaria con el sitio activo que los unen, los
inhibidores competitivos deben parecerse al sustrato para competir por el
mismo sitio de unin, pero difieren de tal manera que les impide transformarse
en el producto. El anlisis de los tipos de molculas que pueden competir con el
sustrato por un sitio de unin en la enzima proporciona informacin sobre la
estructura del sitio activo y la naturaleza de la interaccin entre el sustrato
natural y su enzima.
Es la base de la actividad de mltiples frmacos de uso frecuente, la enzima
convertidora de angiotensina ECA es una enzima proteoltica que acta sobre
un pptido de diez residuos (angiotensina I) para producir un pptido de ocho
residuos (angiotensina II). El nivel alto de angiotensina II es un factor de riesgo
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ENZIMAS Seminario 1
mayor para la elevacin de la presin sangunea. Despus se comenz a
investigar compuestos que pudieran inhibir la ECA. Algunos estudios haban
demostrado que el veneno de un crtalo contena inhibidores de enzimas
proteolticas y se encontr que uno de estos componentes es un pptido
llamado teprtido era un inhibidor competitivo potente de la ECA. Los esfuerzos
posteriores desarrollaron un compuesto llamado captprilo que se convirti en
el primer antihipertensivo til que actuaba mediante la unin con la enzima
convertidora de la angiotensina
La efectividad de un inhibidor competitivo depende de su actividad relativa con
la enzima. Al margen de lo anterior, la inhibicin competitiva puede superar si el
ndice de sustrato/inhibidor es bastante grande.

La inhibicin no competitiva donde el sustrato y el inhibidor no compiten por

el mismo sitio de unin, por lo general, el inhibidor es un sitio distinto al punto
activo de la enzima. El nivel de inhibicin depende solo de la concentracin del
inhibidor y el aumento de la concentracin de sustrato no puede vencerlo. Dado
que la presencia de un inhibidor no competitivo una determinada fraccin de las
molculas de enzimas permanece inactiva en un instante particular, no puede
alcanzarse la velocidad mxima de la poblacin de molculas enzimticas.

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ENZIMAS Seminario 1

LA REGULACIN ALOSTRICA
Es
nico

el

mecanismo importante de control, por el cual la tase de reacciones catalizadas

enzimticamente, se ajustan a las necesidades celulares. El trmino alostrico
deriva del griego otra forma o estado, indicando por lo tanto, que todas las
enzimas con capacidad de regulacin alstrica, pueden existir en dos estados
diferentes. En una de las dos formas, la enzima tiene una afinidad alta por
sustrato, mientras que la otra tiene poca o ninguna afinidad. Estas formas
diferentes son fcilmente interconvertibles y estn de hecho, en equilibrio una
con otra. La velocidad de reaccin es alta cuando la enzima est en la forma de
alta y baja afinidad, incluso nula, cuando la enzima est en su forma de baja
afinidad.

De manera ms general, un factor alostrico es una pequea molcula orgnica

que regula la actividad de una enzima, para la cual no es ni el sustrato, ni el
producto de inmediato.
Un efector alostrico influye en la actividad de la enzima unindose a una de las
dos formas interconvertibles de esta, estabilizndola en ese estado. En otras
palabras una enzima alostrica puede existir en una forma compleja o simple,
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ENZIMAS Seminario 1
dependiendo de si tiene una molcula efectora unida a ella o no. El efector se
une a la enzima debido a la presencia de la superficie de sta de un sitio
alostrico (regulador) que es distinto del sitio activo en el cual tienen lugar el
evento cataltico. Por eso en toda enzima alostrica hay un sitio activo al que se
le une el sustrato y un sitio alostrico que se le une el efector.
El efector puede ser un inhibidor alostrico o un activador alostrico,
dependiendo del efecto que ejerza cuando se una al sitio alostrico de la
enzima, es decir dependiendo de si la forma compleja es el estado de baja
afinidad o alta afinidad en la enzima. La unin entre el inhibidor alostrico
cambia el equilibrio entre las dos formas de la enzima para favorecer el estado
de baja afinidad. La unin del activador alostrico, cambia el equilibrio a favor
del estado de alta afinidad. En cada caso la unin estabiliza la enzima en una
de sus dos formas, incrementando o disminuyendo de ese modo la probabilidad
de unin al sustrato.
La mayora de las enzimas alostricas son protenas grandes, multimricas y
con un sitio activo o un sitio alostrico en cada subunidad. Estos sitios activos y
los sitios alostricos estn normalmente en diferentes subunidades de la
protena, a las que denominan subunidades catalticas y subunidades
reguladoras. Esto es que la unin de las molculas efectoras a los sitios
alostricos, no solo afecta a la forma de subunidades reguladoras sino tambin
a las catalticas.

INTERACCIONES COOPERATIVAS ENTRE SUBUNIDADES

Muchas enzimas alostricas poseen la propiedad de cooperatividad. Esto es que
a medida que mltiples sitios catalticos unen molculas de sustrato, la enzima
sufre cambios conformacionales, que afectan a la unidad restantes de sitios de
unin de sustrato. La cooperatividad positiva es la unin de una molcula
sustrato a una subunidad cataltica incrementa la afinidad de otras subunidades
catalticas por el sustrato. La cooperatividad negativa en la cual el sustrato
unido a una subunidad cataltica reduce la afinidad de otros sitios catalticos por
el sustrato.
Este efecto permite producir en las clulas enzimas que son ms o menos
sensibles a cambios en la concentracin de sustrato, lo que por parte, seria
predecible por la cintica. La cooperatividad positiva hace que la actividad
cataltica de la enzima se incremente ms rpido de lo normal a medida que la
concentracin del sustrato aumenta, mientras que la cooperatividad negativa
aumenta ms lentamente de lo esperado.

ENZIMAS LISOSOMALES
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ENZIMAS Seminario 1

1.-LOS LISOSOMAS.
Son un grupo de organoides intracitoplasmticos que contienen una variedad de
enzimas hidrolticas, cuya funcin principal es la digestin de material
intracelular o proveniente del exterior.
Los lisosomas se distinguen de otros organoides por su morfologa y por las
funciones que desempean:

Digieren alimentos y otros materiales incorporados por endocitosis

Digieren partes de las clulas por el proceso de autofagia
Digieren material extracelular por medio de enzimas que liberan en el
medio circundante

2.- DISTRIBUCIN DE ENZIMAS LISOSOMALES SOLUBLES HACIA LOS

ENDOSOMAS Y LISOSOMAS
Esta distribucin est mediada por la etiqueta manosa-6-fosfato.
En el RE, las enzimas lisosomales sufren una glicosilacin en N, seguida
de eliminacin de unidades de glucosa y manosa.
Una vez en el complejo de Golgi, los residuos de manosa de las enzimas
lisosomales, se fosforilan en dos reacciones enzimticas. En la primera se
aade N-acetilglucosanina-1-fosfato al carbono 6 de la manosa y en la
segunda se elimina N-acetilglucosamina, exponiendo el residuo de
manosafosforilada.
Las enzimas lisosomales, ahora etiquetadas, se unen a los receptores
manosa-6-fosfato de la RTG y se empaquetan en vesculas cubiertas de
transporte, que alcanzan a los endosomas tardos.
La acidez de la luz de los endosomas tardos, hace que se disocien las
enzimas de los receptores.
Los receptores se reciclan en vesculas que vuelvan a la RTG. Los
endosomas tardos maduran, formando lisosomas, o transfieren su
contenido a un lisosoma activo.

3.- ENZIMAS LISOSOMALES:

Son enzimas hidrolticas, utilizadas para descomponer las bacterias o los
orgnulos. Los cientficos descubrieron que las enzimas lisosomales solo se
activan en condiciones muy acidas. 100 veces ms acidas que el nivel de acidez
normal del citoplasma. Cuando los lisosomas son liberados del complejo de
Golgi, el pH de su interior es muy similar al del citosol (7-7,3). A este nivel de
pH, las enzimas estn inactivas. Si el lisosoma se rompe o libera la enzima
accidentalmente, no provocara dao a la clula. Pero cuando el lisosoma se
asienta en el citoplasma acumula H en un proceso que se consume energa. El
pH interior de la vescula disminuye a 4,8-5 y las enzimas se activan, una vez
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ocurrido esto las enzimas son capaces de degradar varias biomolculas de la
luz. Estn contenidas en dos subgrupos de grnulos de neutrfilos. El primero,
el granulo especifico, contiene lisozima, colagenasa, protena que se une a
vitamina B12, gelatinasa, y protenas bactericidas conocidas como defensinas.
El segundo, el granulo azurofilo, contiene a la beta-glucuronidasa, elastasa,
entre otras. Los grnulos especficos se fusionan y descargan su contenido ms
rpido que los grnulos azurofilos. Poco despus de la fagocitosis, los grnulos
lisosomales se fusionan con la membrana de vesculas fagocticas y descargan
su contenido hacia ellas. Este proceso es crucial para las defensas normales del
husped. En algunos casos, los constituyentes lisosomales pueden ser liberados
de forma extracelular y median algunos aspectos de inflamacin y lesintisular.
Las enzimas lisosmicas son principalmente hidrolasas cidas. Entre ellas se
encuentran:

Proteasas: que digiere protenas

Lipasas: que digiere lpidos
Glucosidasas: que digiere carbohidratos
Nucleasas: que digiere cidos nucleicos

Las hidrolasas lisosmicas se sintetizan en el retculo endoplsmico y acaban su

maduracin en el aparato de Golgi donde son marcadas con manosa-6-fosfato.
Del aparato de Golgi surgen por gemacin los lisosomas, conteniendo aquellas
protenas que fueron marcadas con manosa-6-fosfato.
Las protenas que se encuentran en la membrana de la vescula estn
altamente glicosiladas para evitar su degradacin por las hidrolasas del
lisosoma.
La mayora de estas enzimas tienen un pH ptimo cido y, en efecto, el interior
del lisosoma es cido (pH alrededor de 5)

ENZIMAS

FUNCIN

Ribonucleasa

Nucleotidiltransferasas

Esterasa

Hidrolasas que actan sobre uniones

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Lipasa
Fosfolipasas A1 y A2
Fosfatasa cida (varios tipos)
Fosfoprotena-fosfatasa
Fosfodiesterasa (exonucleasa)
Fosfolipasa C
Desoxirribonucleasa II
Arilsulfatasa A y B
Lisozima (muramidasa)
Neuraminidasa
Glucosidasa
Glucosidasa
Galactosidasa
Glucuronidasa
Hialuronidasa

ster

Hidrolasas que actan sobre

compuestos glucsidos

Carboxipeptidasa
Catepsina A
Carboxipeptidasa cida
Dipeptidasa
Catepsina B1 y B2
Catepsina C
Catepsina D
Catepsina E
Renina
Colagenasa
Activador del plasmingeno

Enzimas que actan sobre uniones

peptdicas (pptido hidrolasas)

Pirofosfatasa
Arilfosfatasa

Enzimas que actan sobre la unin

anhdrido cido en anhdridos que
contienen fosforilo

Fosfamidasa

Enzimas que actan sobre las

uniones P-N

ENZIMAS CITOPLASMATICAS

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ENZIMAS QUE PARTICIPAN EN LA GLUCLISIS

1. HEXOCINASA: consumo del primer ATP
Es la enzima que cataliza la primera reaccin de la va glucoltica, es inhibida
por la GLUCOSA-6-FOSFATO y activada por el grupo fosfato.
La hexocinasa cambia su conformacin al unirse a las hexosas. Este cambio se
produce gracias a que la enzima tiene dos dominios unidos por medio de otro
ms que acta como una bisagra. La enzima en su conformacin abierta
permite que la hexosa se acomode en su sitio activo; cuando esto ha sucedido,
la enzima adquiere su conformacin cerrada en la cual se desplaza a las
molculas de agua y disminuye la energa de solvatacin, necesaria para que se
lleve a cabo la reaccin de fosforilacin.

2. FOSFOGLUCO ISOMERASA
Llamada anteriormente glucosa 6 fosfato isomerasa o tambin glucocinasa que
es muy abundante en el hgado.
La glucocinasa es inhibida por la FRUCTOSA-6-FOSFATO en vez de GLUCOSA-6FOSFATO como en el caso de la hexocinasa.
Es una enzima que cataliza la isomerizacin de una aldosa, la GLUCOSA-6FOSFATO en una cetosa, la FRUCTOSA-6-FOSFATO; la reaccin se lleva a cabo
en cinco pasos para los cuales la enzima necesita abrir el anillo de la glucosa,
para hacer la isomerizacin y posteriormente cerrarlo convirtindola
en fructosa-6-fosfato.

1.-Formacin del complejo ES.

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2.- Un cido, presumiblemente el grupo e-amino de una lisina de la
enzima, cataliza la apertura del anillo.
3.- Una base, presumiblemente el carboxilato de un cido glutmico de la
enzima, retira el protn cido del C2 del azcar para formar un
intermediario cis-enediolato (este protn es cido porque ocupa una
posicin

con respecto al carbonilo).

4.- El protn es reemplazado en C1. Los protones retirados por bases,

son lbiles y se recambian rpidamente con el solvente.
5.- El anillo se cierra para formar el producto, el cual es posteriormente liberado.

3. FOSFOFRUCTOCINASA: consumo del segundo ATP

Fosfofructo-1-quinasa (PFK) es una enzima tetramrica que fosforila la fructosa6-fosfato en fructosa-1 ,6-bisfosfato, de la conversin de la glucosa en la
gluclisis. Tres PFK (fosfofructo-1-quinasa) son isoenzimas, que codifican los
genes por separado, se han identificados en mamferos en los msculos, hgado,
y plaquetas y se expresan en una forma especfica de tejido. Cuando las
necesidades energticas del organismo son elevadas, en el ejercicio o bien en
condiciones de ayuno prolongado, se generan las altas concentraciones de ADP,
de AMP y de FRUCTOSA-1,6-BISFOSFATO, lo cual ocasiona el incremento en la
actividad de la PFK.

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4. ALDOLASA
El nombre completo de la enzima es fructosa-1,6-bifosfato aldolasa.
La aldolasa cataliza la
transformacin
de
la
FRUCTOSA-1,6-BISFOSFATO
en gliceraldehdo-3-fosfato y dihidroxiacetona-3-fosfato.

5.

TRIOSA FOSFATO ISOMERASA

La triosa fosfato isomerasa (TPI) cataliza la interconversin del

GLICERALDEHDO-3-FOSFATO y DIHIDROXIACETONAFOSFATO. Esta reaccin es la
quinta de la gluclisis y la ltima de primera etapa de este proceso.

6. GLICERALDEHIDO-3-FOSFATO DESHIDROGENASA: formacin del

primer intermediario de alta energa
Esta reaccin de la gluclisis es la oxidacin y la fosforilacin del GAP por el
NAD+ y el Pi(fosfato inorgnico HPO42-, conocido como Pi), catalizada por la
enzima gliceraldehdo-3-fosfato deshidrogenasa (GAPDH). En esta reaccin la
oxidacin del aldehdo, una reaccin exergnica, conduce la sntesis del acil
fosfato de alta energa 1,3-bifosfatoglicerato (1.3-BPG).

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David Trenthan propuso un mecanismo enzimtico de la GAPDH.
Paso 1. El GAP se une a la enzima.
Paso 2. El grupo sulfhidrilo del sitio activo forma un tiohemiacetal con el
sustrato.
Paso 3. El NAD+ oxida el tiohemiacetal a un tioster.
Paso 4. El Pi se une a la enzima
Paso 5. Y ataca al tioster, formando el producto acil fosfato, 1,3-BPG, que se
disocia de la enzima seguida por el reemplazo del NADH recientemente formado
por un NAD+, y regenera por consiguiente la enzima activa.

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7. FOSFOGLICERATO CINASA:
produccin del primer ATP
En esta reaccin se produce ATP junto con 3fosfoglicerato(3PG) catalizada por la enzima
fosfogliceratocinasa (PGK). (Ntese que esta
enzima se llama cinasa porque la reaccin
inversa es la transferencia del grupo fosforilo
desde el ATP hasta 3PG).
A pesar de que la reaccin de la GAPDH es
endergnica, la naturaleza fuertemente
exergnica de la transferencia de un
grupo fosforilo desde el 1,3-BPG hasta el ADP
hace favorable la sntesis global de NADH y el
ATP a partir de GAP, P i, NAD+ y ADP. Esta
produccin de ATP, que no involucra al O 2, es
un ejemplo de fosforilacin a nivel de sustrato.
La oxidacin subsecuente del NADH producido
en esta reaccin por el O2
genera
ATP
adicional por medio de la fosforilacin
oxidativa.

8. FOFOGLICERATO MUTASA
En esta reaccin el 3PG se convierten 2-fosfoglicerato (2PG) por medio
de la enzima fosfogliceratomutasa (PGM)

Una mutasa cataliza la transferencia de un grupo funcional desde una

posicin hacia otra en una molcula. Esta reaccin casi enrgicamente
neutra es necesaria para la preparacin de la prxima reaccin de la
gluclisis que produce un compuesto fosforilo de alta energa.

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9. ENOLASA: formacin del segundo intermediario de alta energa
En esta reaccin de la gluclisis, el 2 PG se deshidrata a fosfoenolpiruvato
(PEP) es una reaccin catalizada por la enolasa:

10.

PIRUVATO CINASA: produccin del segundo ATP

En esta reaccin final el piruvatocinasa (PK) acopla la energa libre de la

hidrlisis del PEP a la sntesis del ATP para formar piruvato:

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OTRAS ENZIMAS CITOPLASMTICAS

DESHIDROGENASA LCTICA (DHL)
Esta enzima acta en la fermentacin lctica y se da por el acoplamiento de la
oxidacin del NADH hasta

+
NAD

con la reduccin del piruvato a lactato.

La reaccin catalizada es:

Piruvato + NADH lactato deshidrogensa

lactato +

+
NAD

ALCOHOL DESHIDROGENASA
La enzima alcohol deshidrogenasa (ADH) fue descubierta a mediados de los
aos 1960, estas enzimas son un grupo de siete enzimas que estn presentes
en muchos organismos y facilitan la interconversin entre alcoholes y aldehdos
o cetonas con la reduccin de NAD a NADH. La reaccin catalizada es:
Alcohol + NAD+

Aldehdo o Cetona + NADH

Como cofactores en esta reaccin es posible utilizar zinc o hierro.

En los humanos y muchos otros animales, sirven para eliminar alcoholes que
podran ser txicos.

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ENZIMAS NUCLEARES
Las enzima nucleares son aquellas que se ubican en el ncleo de la clula y la
mayora de ella tiene funciones relacionadas con los procesos de transcripcin,
transcripcin y traduccin, es decir, las del dogma central de la biologa.
Enzimas enlazadas a cromatina:

RNA polimerasa II
RNA polimerasa III
DNA polimerasa
Trifosfatasa de nuclesido

Enzimas del nucleolo:

RNA polimerasa I
Topoisomerasa
Helicasa
ADN ligasa
Ribocleasa
La importancia de tales enzimas en realmente vital, ya que si esos procesos la
clula dejara de existir y la vida no sera posible.
ENZIMAS RELACIONADAS CON LA TRANSCRIPCION
La ARN polimerasa es la enzima encargada de la transcripcin. Realiza una copia
de ADN a ARN, de ah que sea dependiente de ADN. Esta copia se hace nucletido
a nucletido por complementariedad. En la copia de ARN el ribonucletido
complementario a adenina es uracilo en vez de timina. Las principales ARN
polimerasas de eucariotas son la I, la II, la III, y la mitocondrial.
La ARN polimerasa es una ARN nucleotidiltransferasa. Su funcin es llevar a cabo
la transcripcin. Realiza una copia de ADN a ARN catalizando la formacin de los
enlaces fosfodiester entre ribonucletidos. La copia la hace nucletido a
nucletido, usando ribonuclesidostrifosfato (rNTP). En el ARN el ribonucletido
uracilo
sustituye
a
la
timina
del
ADN.
Las principales ARN polimerasas de eucariotas son la I, la II, la III y la mitocondrial.
Los diferentes tipos de ARN polimerasas se diferencian en su composicin de
aminocidos, en su estructura, en su localizacin, en el tipo de ARN que
transcriben y en su forma de inhibicin. La ARN polimerasa en general es
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oligomrica (protena cuaternaria), estructurndose en un complejo formado por
varias subunidades. Las subunidades comunes ms grandes son dos: la B, que
funciona como centro activo; y la B', que es la subunidad de unin al ADN. La
subunidad B porta el dominio carboxiterminal que es funcionalmente importante.
Est formado por una larga cola de 52 repeticiones del heptapptido YSPTSPS
con residuos fosforilables. El resto de subunidades de la ARN polimerasa son ms
pequeas y participan en la unin a todos las protenas que intervienen en la
transcripcin. Algunas de estas subunidades son comunes y otras especficas de
cada ARN polimerasa. Cada ARN polimerasa tiene una localizacin caracterstica.
As, la I se encuentra en el nucleolo, la II y la III en el nucleoplasma y la
mitocondrial
en
la
mitocondria.
ARN POLIMERASA I
Enzima oligomrica, primera de su clase,
que se ubica a nivel del nuclolo. La ARN
polimerasa (pol I), es la enzima que se
encarga
de
transferirlos
genes
ribosomales 5.8S, 18S y 28S(ARNr). Los
genes ribosomales, son los que codifican
para ARNr que, al ensamblarsecon
protenas
de
la
celula
eucariota,
conforman
la
ribosoma,
organelo
responsable de la traduccin del ARN
mensajero y sntesis o formacin de
protenas celulares.
La RNA polimerasa se mantiene unida al organizador nucleolar durante la
mitosis (metafase y anafase), durante este periodo no hay sntesis de ARN de
manera que esta enzima puede mantenerse en un estado inactivo.

ARN POLIMERASA II
ARN polimerasa II es una enzima localizada en el nucleoplasma. Esta polimerasa
es el tipo ms estudiado, siendo su estructura tridimensional dilucidada por
Roger Kornberg.
La ARN polimerasa II transcribe la gran mayora de los genes que codifican para
protenas celulares, al igual que algunos genes denominados pequeos
ARNnucleares o pARNn. Estos ltimos son pequeos ARN que conforman el
complejo de procesamiento necesario para madurar un ARN pre mensajero a
ARN mensajero maduro que luego sern transportados posteriormente del
ncleo al citoplasma.
La subunidad funcional del ARN polimerasa II es capaz de catalizar la sntesis de
ARN pero es incapaz por si sola de inducir da manera especfica la transcripcin
de un gen, para ello es necesaria la presencia de factores accesorios (protenas)
denominados factores generales de transcripcin o GTF, estos se dividen en
fracciones A,B y D(los ms importantes) y E,H,F; estos factores le dan a la

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enzima en mencin la posibilidad de reconocer e iniciar de manera especfica la
transcripcin de los pARNn.

ARN POLIMERASA III

Es la tercera y ltima clase de ARN polimerasas en animales, ubicada a nivel del
nucleoplasma se denomina ARN (pol III), se encarga de transcribir los genes

para la formacin de precursores para el ARN de transferencia (ARNt), al igual

que el gen ribosomal 5S (ARNr) y otros pequeos ARNs nucleares.
El principal elemento de regulacin para genes transcritos por la ARN
polimerasa III se localiza dentro de la secuencia de ADN en que va a ser
transcrito y se conoce como regin interna de control o ICR.
ENZIMAS DE LA REPLICACIN DEL ADN
La replicacin es el mecanismo que permite al ADN duplicarse(es decir,
sintetizar una copia idntica). De esta manera de una molcula de ADN nica,
se

obtienen dos ms de la primera.

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Gracias a la complementariedad entre las bases que forman la secuencia de

cada una de las cadenas, el ADN tiene la importante propiedad de reproducirse
idnticamente, lo que permite que la informacin gentica se transmita de una
clula madre a una clula hija y es la base de la herencia del material gentico.
Debido a que cada una de las molculas de ADN formadas conserva
prcticamente la mitad de la cadena original se dice que la replicacin es
semiconservativa.
Debido a que en la clula ambas cadenas de la doble hlice del ADN se
sintetizan al mismo tiempo, estas deben separarse para que cada una de ellas
sirva de molde para la sntesis de una nueva cadena, por eso la replicacin
avanza con una estructura en forma de horquilla.
Otro punto importante para tener en cuenta es que la replicacin siempre se
produce en sentido de 5a 3 siendo el punto 3-OH. Esto plantea un problema
ya que las cadenas separadas conservan el ser antiparalelases decir, si un
extremo es 5 el otro ser 3 por ello una de las cadenas debera ser sintetizada
en direccin en direccin 3 a 5. Este problema los resolvieron los cientficos
japoneses ReijiOkazaki y TsunekoOkazaki al descubrir que una de las cadenas de
ADN (la cadena rezagada) se sintetiza en forma de segmentos cortos que en su
honor se denominaron fragmentos de okazaki.
Teniendo en cuenta esto podemos definir las diferentes enzimas que participan
en la replicacin:
TOPOISOMERASA
Las Topoisomerasas son enzimas que
poseen a la vez actividad nucleasa y ligasa.
Estas protenas varan la cualidad de ADN
de ser sper enrollado, ya que el super
enrollamiento del ADN est controlado por
esta enzima denominada topoisomerasa
debido a que alteran el estado topolgico
del ADN circular pero no su estructura
covalente. Existen 2 tipos de isomerasas en
procariotas y eucariotas:
Las Topoisomerasas tipo I, que crean roturas transitorias en una sola hebra del
ADN.
Las Topoisomerasas tipo II, que provocan roturas transitorias de la doble hebra
del ADN.
Estas enzimas creando roturas transitorias en la hlice de ADN y permiten que
una seccin rote, de manera que reducen el grado de superenrollamiento. Una
vez hecho esto, la enzima vuelve a unir los fragmentos de ADN.
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HELICASA
Las helicasas son unas enzimas protenas
que pertenecen al grupo de los motores
moleculares. Utilizan energa qumica
almacenada
en
los
nuclesidostrifosfatos,
fundamentalmente ATP, para romper
puentes de hidrgeno entre bases y
separar la doble hlice de ADN en hebras
simples, lo cual le es permitido gracias a
la polaridad que las caracteriza, la cual
va de 5 a 3 siguiendo el sentido de la
direccin de la horquilla de replicacin.
Despus del paso de las ADN helicasas el
ADN
monocatenario
queda
ya
formado,
originndose
monocatenarias, la cadena principal y la cadena rezagada.

cadenas

Inmediatamente despus que las cadenas han sido separadas aparecen unas
protenas de unin a las monocadenasconocidad como SSB por sus siglas en
ingles, las cuales completan la accin de separacin.
Estas enzimas son esenciales para la mayora de los procesos en los que las
enzimas necesitan acceder a las bases del ADN.

ADN POLIMERASA
La DNA polimerasa es una enzima que
cataliza la sntesis de ADN a partir de
desoxirribonucletidos y de una molcula de
ADN plantilla o molde que es la que ser
"copiada", es por eso que se las conoce como
enzimas creadoras de ADN.
Tanto las procariotas como las eucariotas
poseen mltiples actividades para la ADN
polimerasa, sin embargo solo una posee la
funcin de replicasa, las otras tienen papeles
auxiliares en la replicacin y/o participan en la
reparacin del ADN.
Las que poseen la actividad replicadora, su accin sinttica, consiste en alargar
una cadena de ADN aadiendo nucletidos uno a uno a un extremo 3-OH a la
cadena en crecimiento, de modo que la cadena sinttica se forma en direccin 5
a 3. Los precursores de la sntesis de ADN son nuclesidostrifosfato, que en la
reaccin pierden los dos grupos fosfatos terminales y son ellos los que
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proporcionan la energa para la sntesis, tal que permite el acoplamiento de
1000 bases nitrogenadas en un segundo.
Sin embargo para que la accin de la ADN polimerasa se inicie, hace falta algo
que le indique donde inicia o donde se encuentra aquel 3-OH, y dicha labor la
cumple el cebador, formado a partir de un ARN pequeo de 10 bases
nitrogenadas, dicha funcin se aprecia fundamentalmente en la cadena
rezagada, donde la sntesis es discontinua.
En cada horquilla de replicacin, la DNA polimerasa y otras enzimas sintetizan
dos nuevas cadenas de DNA que son complementarias respecto a las 2 cadenas
originales.

ADN LIGASA
Es un enzima de tipo ligasa, tambin
llamada enzima ligadora de polinucletidos,
cuya funcin principal es completar la
unin de la sntesis del ADN en la cadena
rezagada.
Recordemos que la cadena rezagada est
formada de manera discontinua y esos
espacios es los que se encarga de
completar o ligar esta enzima. Para ello, su
funcin
es
catalizar
un enlace
fosfodister entre el grupo 3'-hidroxilo
extremo de una de las cadenas de ADN y el
grupo 5'-difosfato del extremo de la otra
cadena de ADN. Para llevar a cabo esta
reaccin, la clula necesita energa porque se trata de una reaccin
termodinmicamente desfavorable, es decir, no es una reaccin que sucede de
manera espontnea.
Para formar los dos enlaces fosfodister covalentes entre ambos extremos de
las dos cadenas, la ADN ligasa cataliza una reaccin junto con el ATP que sigue
3 pasos:
1-Adenizacin de un residuo en el centro activo de la enzima liberando
fosfato.
2- Transferencia del AMP hacia el fosfato 5 'del donante originando la
formacin de un enlace pirofosfato.
3-Formacin de un enlace fosfodister entre el fosfato 5 'del donante y el
hidroxilo 3' del aceptor.
Finalmente, como resultado neto, se completa la cadena rezagada y la
replicacin del ADN en sus 2 cadenas est terminada.
La accin de las diferentes enzimas y molculas mencionadas se aprecia mejor
en la siguiente imagen.

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OTRAS ENZIMAS NUCLEARES:

TRIFOSFATASA DE NUCLESIDO
Una enzima que cataliza
nuclesidosdifosfatos.

la

hidrlisis

de

nuclesidostrifosfatos

Tambin puede catalizar la hidrlisis de nucletidos trifosfatos, difosfatos,

tiamina difosfatos y FAD. El nuclesidotrifosfatofosfohidrolasas I y II son subtipos
de la enzima y se encuentran principalmente en virus.
Tambin cumple otra funcin, tal como transportar Ca 2+a travs de la
membrana. Estas enzimas pueden ser dependientes de Ca 2+, Mg2+, aniones, H+,
o ADN.

RIBONUCLEASAS

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Las ribonucleasaabreviada comnmente
como RNasa, es una enzima (nucleasa)
que
cataliza
la hidrlisis de ARN en
componentes
ms
pequeos.
Las
ribonucleasas
son
extremadamente
comunes, lo que resulta en periodos de
vida muy cortos para cualquier ARN en
un ambiente no protegido.
Como todas las nucleasas, estas
enzimas se dividen en dos clases
generales, las exonucleasas y las
endonucleasas.
Las
endonucleasas
cortan enlaces especficos dentro de las
molculas de ARN, generando fragmentos discretos. Estn implicadas en las
reacciones de corte, en la que las secuencias maduras se separa de las
secuencias flanqueantes. En cambio las exonucleasas eliminan residuos uno a
uno, desde un extremo de la molculas, liberando mononucletidos; las
exonucleasas estn implicadas en reacciones de ajuste.
Las ribonucleasa T1 y la ribonucleasa pancretica son dos ribonucleasas de gran
importancia prctica aunque sus funciones fisiolgicas se desconoces.
Las RNasas juegan un rol crtico en muchos procesos biolgicos, incluyendo
la angiognesis y
la
auto-incompatibilidad
de
las plantas con flores (angiospermas).

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