Guía de Uso de Pubmed

1
Universidad Nacional de La Plata - Facultad de Ciencias Mdicas

rea de Capacitacin en Informtica Mdica
Breve gua visual de PubMed

PubMed (http://pubmed.gov) es un servicio de la National Library of Medicine
(http://www.nlm.nih.gov) que da acceso libre y gratuito a ms de dieciocho millones de
referencias bibliogrficas.
Breve gua visual de PubMed, versin 10 - marzo de 2009. rea de Capacitacin en Informtica Mdica, Facultad de Ciencias Mdicas, Universidad
Nacional de La Plata, Argentina. Todos los derechos reservados. Permitida la reproduccin sin fines de lucro.
Bsqueda simple y pantalla de resultados

Escriba un trmino en el
campo de bsqueda y
presione "Go".
Pantalla de resultados. Se
puede ver una lista de
referencias en formato
Summary (ver pgina 5) y a
la derecha una lista de
sugerencias y la actividad
reciente de bsqueda.
.
Es posible escribir varios

trminos y unirlos mediante
operadores booleanos (AND,
OR).
Presentacin en la pantalla y guardado en el disco

Se puede modificar la
presentacin de los registros en la
pantalla mediante mens
desplegables. El programa
inicialmente muestra 20 registros
por pantalla en formato Summary.
Si desea ver los Abstracts, elija
"Abstract" en el men, y si adems
quiere ver el MeSH, elija "Citation".
Tambin se puede elegir el

nmero de registros mostrados.
Elija la opcin "Text" para mostrar

los registros que estn en la
pantalla como texto (sin la barra
lateral ni el campo de bsqueda).
"File" descarga todos los registros
al disco (independientemente del
nmero mostrado en la pantalla).
"E-mail" permite enviar los
resultados a una direccin de
correo electrnico (ver la pgina
siguiente).
Envo de los resultados por E-mail

Pantalla para el envo de los
resultados por E-mail.
"Format" permite elegir entre
las distintas formas de
presentacin: Summary,
Abstract o Citation. La opcin
"HTML" permite enviar texto
con formato (subrayados,
negrita, etc.) y "Text", en el
mismo men desplegable,
enva el texto sin formato
(archivos ms pequeos).
"Sorting" modifica el orden de
los registros.
Se puede elegir el nmero de
registros para enviar;
asegrese de que el men
desplegable ubicado despus de "send" marque un nmero mayor a la cantidad de registros encontrados.
Coloque comentarios adicionales en "Additional text".
Coloque en "E-mail" la direccin del destinatario (este campo es obligatorio).
Presione "Mail" para enviar los resultados.
Pgina de resultados: visualizacin de los registros
Ttulo del artculo
Autores
Nombre del journal,

fecha de publicacin,
volumen, nmero y
pginas
Identificador
nico
Artculos
similares
Status de la
referencia
Artculo gratuito en la base PMC y/o en

el sitio web del journal
Detalle de un registro en formato Summary
Formato Abstract. Se
muestra la referencia
(source), el ttulo del
artculo, los autores, la
direccin, el abstract
(cuando est presente en el
artculo original), el nmero
de identificacin del registro
en PubMed (PMID), y el
identificador del artculo en
la base PMC (PMCID), si
corresponde. Observe
tambin los iconos con el
link al texto completo en el
sitio del journal (BMJ en
este caso) y en PubMed
Central (PMC), la base de artculos free full text de la NLM.
Formatos de presentacin
Formato AbstractPlus.
Adems de los
campos mostrados en
el formato Abstract se
pueden ver los
primeros cinco ttulos
de artculos similares
(Related Articles) y la
actividad reciente de
bsqueda del usuario.
Formato Citation.
Obsrvense los
trminos MeSH
correspondientes a la
referencia. Los temas
centrales del artculo
(MeSH Major Topic)
estn sealados con
un asterisco.
Men Limits
El men Limits permite restringir la
bsqueda segn determinados
criterios: Autor, journal, full text, full
text gratuito, artculos con abstract,
fecha, humano o animal, gnero,
idioma, subset, tipo de artculo,
edad. En cada caso, elija la(s)
opcin(es) deseada(s) en el men
y luego oprima "Go".
Los lmites aplicados quedan

escritos en la parte superior de la
pgina de resultados. Al desmarcar
el casillero de la solapa Limits,
stos quedan desactivados en
bsquedas posteriores.
Men Limits (2): Bsqueda por autor o por nombre de journal

Bsqueda por autor: Clickee sobre
"Add Author" para desplegar el
men de bsqueda.
Ingrese uno o ms autores y luego

presione "Go". Observe que los
autores se buscan escribiendo el
apellido seguido de las iniciales.
Los autores quedan

automticamente incorporados a la
estrategia de bsqueda.
Bsqueda por journal: Clickee

sobre "Add Journal para
desplegar el men de bsqueda;
luego escriba uno o varios
nombres de journals. Los nombres
pueden escribirse tanto en forma
abreviada como completa. El
men desplegable muestra
automticamente los nombres
completos. Oprima "Go".
El nombre del journal queda
automticamente incorporado a la
estrategia de bsqueda.
Men Limits (3)

Es posible solicitar referencias
publicadas desde una determinada
fecha segn una serie de opciones
preestablecidas.
Eligiendo "Choose date range" el

programa da la opcin de elegir un
rango especfico de fechas.
Tambin es posible solicitar

referencias de artculos free full
text.
10
Advanced Search
El men Advanced
Search, al que se
accede desde la
pgina principal de
PubMed, permite
acceder desde una
sola pantalla a todas
las opciones de
bsqueda que
aparecen de manera
separada en las
distintas solapas o
en la barra izquierda.
En este esquema se
muestra la pgina
Advanced Search, a
la izquierda y las
correspondientes
solapas, a la
derecha.
Advanced search
Solapas y barra
de men
11
Vocabulario MeSH
MeSH (Medical Subject Headings) es un vocabulario de trminos mdicos y cientficos asignados a

los documentos de PubMed por un equipo de expertos. El vocabulario MeSH est ordenado
jerrquicamente por tema, con los trminos ms especficos ubicados debajo de los trminos ms
generales. La MeSH Database incluida en PubMed permite ver esta jerarqua y seleccionar los
trminos. La aplicacin del vocabulario MeSH asegura que los artculos estn clasificados por tema,
independientemente de las palabras utilizadas por el autor.
Los trminos MeSH se asignan al artculo completo, no solamente a la referencia (ttulo y abstract).
Por lo tanto, una bsqueda usando un trmino MeSH puede encontrar documentos relevantes
incluso cuando el trmino no se encuentra en la referencia. Esto es especialmente importante para
aquellas referencias que no incluyen abstract, dado que los ttulos son breves y frecuentemente
omiten trminos importantes.
Por otra parte, el vocabulario MeSH facilita las bsquedas cuando existen varios sinnimos para
una misma entidad. Por ejemplo referencias que contienen los trminos celiac disease, sprue,
steatorrhea o gluten entheropathy pueden ser todas buscadas bajo el trmino MeSH "celiac
disease".
Algunos trminos MeSH se designan como Major Topic, lo que significa que el indexador ha
determinado que estos trminos representan el tema central del artculo. Usando el campo Major
Topic (majr) se pueden descartar referencias menos relevantes. Estos trminos estn designados en
la referencia con un asterisco (*).
Algunos trminos MeSH tienen subencabezamientos (subheadings), que indican que un trmino
MeSH se aplica de una manera especfica. Estos subencabezamientos se agregan al trmino con una
barra (/). Por ejemplo, el trmino "amoxicillin/administration and dosage" significa que el
documento trata especficamente la administracin y dosis de amoxicilina. Una bsqueda del
trmino "amoxicillin" sin subheadings tambin encontrar esta referencia.
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MeSH Database
Para acceder elija la opcin
"MeSH Database" en la barra
izquierda de la pantalla principal
de PubMed. Escriba un trmino en
el campo de bsqueda y luego
clickee "Go".
Debajo del campo de bsqueda

aparece una lista de trminos
MeSH relacionados con el trmino
buscado, con sus definiciones
respectivas. Si hay una
correspondencia exacta
("Pericarditis", en este caso), sta
se ubica en la parte superior de en
la lista. Clickee en el trmino para
ver la informacin completa, o bien
seleccinelo y use el men
desplegable "Send to" para
incorporarlo a la bsqueda (ver
pginas siguientes).
Se puede buscar el trmino

directamente eligiendo la opcin
"PubMed" bajo "Links".
La lista de sugerencias
(Suggestions) es til para ver la
ortografa correcta o encontrar
trminos alternativos.
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MeSH Database (2)

Informacin completa del trmino.
Se ve el trmino MeSH, la
definicin, los subheadings y el
rbol (Tree).
Puede elegir, si lo desea, otro

trmino ms relevante para su
bsqueda.
Marque la casilla correspondiente al

trmino y elija en el men
desplegable "Search Box with AND"
para agregar el trmino a la
bsqueda. (Ver la continuacin en
la pgina siguiente).
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MeSH Database (3)

La estrategia de bsqueda
queda armada. Presione
"PubMed Search " para
efectuar en PubMed la
bsqueda del trmino
elegido.
Pantalla de resultados. El
trmino qued
automticamente
incorporado al campo de
bsqueda.
15
MeSH Database (4) - Subencabezamientos (Subheadings)

Elija un subheading
(diagnosis, en este caso)
Seleccione en el men
desplegable "Search Box
with AND" para agregar el
trmino MeSH con el
subheading a la bsqueda.
Observe que no es
necesario seleccionar el
cuadro que se encuentra al
lado del trmino MeSH
(Pericarditis, en este caso).
se arma automticamente.
Presione "PubMed Search"
para ver los resultados.
Pantalla de resultados.
La estrategia qued
automticamente
incorporada al campo de
bsqueda.
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MeSH Database (5) - Subencabezamientos (Subheadings)

Es posible seleccionar ms
de un subheading
(diagnosis y therapy, en
este caso). Utilice "Search
box with AND" para armar
la estrategia de bsqueda.
queda armada. Observe
que los trminos aparecen
automticamente unidos por
un OR, lo que suele ser la
estrategia apropiada
cuando se combinan
subheadings.
Pantalla de resultados. La
estrategia qued
bsqueda.
17
MeSH Database (6) Bsqueda de temas principales (MeSH Major Topic)

Se puede limitar la bsqueda a
aquellas referencias que tienen un
determinado trmino MeSH como
tema principal (Major Topic). Para
lograrlo, marque la casilla "Restrict
Search to Major Topic headings
only" y luego seleccione "Send to
Search Box with AND" en el men
desplegable. La casilla adyacente
a Pericarditis queda
automticamente seleccionada.
La estrategia de bsqueda queda
armada. Presione "PubMed
Search" para ver los resultados.
Pantalla de resultados. La
estrategia qued automticamente
bsqueda.
Adems de seleccionar la casilla

"Restrict Search to Major Topic
headings only", se pueden
seleccionar uno o ms
subheadings de acuerdo a lo
explicado en las pginas
anteriores.
La estrategia de bsqueda queda

armada. Presione "PubMed
Search" para ver los resultados.
18
MeSH Database (7) - Combinacin de trminos
Busque el primer trmino en

el MeSH Database y
agrguelo al formulario.
Luego ingrese el segundo
trmino en el campo de
bsqueda y presione "Go".
Una vez encontrado y

seleccionado el segundo
trmino, incorprelo a la
estrategia de bsqueda
mediante el men "Send
To".
El men desplegable
permite relacionar entre s
los trminos mediante los
operadores AND, OR o
NOT.
queda armada. Presione
"PubMed Search " para ver
los resultados.
Pantalla de resultados.
La estrategia qued
automticamente
bsqueda.
19
Mapeo automtico - Uso de la opcin "Details"

PubMed automticamente
busca el trmino MeSH de
significado ms prximo al
trmino escrito en el campo
de bsqueda.
Al presionar "Details" se
puede ver la bsqueda
efectuada por el programa.
Se muestra el "mapeo", o
traduccin al vocabulario
MeSH (myocardial
infarction, en este caso), del
trmino escrito en el campo
de bsqueda. Tambin se
muestran los trminos
alternativos agregados por
la base para aumentar la
sensiblidad de la bsqueda.
20
Single Citation Matcher
Para acceder presione la

opcin "Single Citation
Matcher" en la barra
izquierda de la pantalla
principal de PubMed.
Complete los campos
necesarios para encontrar
un artculo determinado y
luego presione "Go". No es
obligatorio completar todos
los campos. Si busca una
sola referencia, es suficiente
con completar el nombre del
journal (completo o
abreviado), el volumen y la
primera pgina del artculo.
La referencia bibliogrfica
aparece en la pantalla de
resultados. Si se encontr
una sola referencia, sta
aparecer en el formato
AbstractPlus.
21
History
La opcin "History" permite
ver las ltimas bsquedas
efectuadas y combinarlas
mediante operadores
booleanos. Escriba los
nmeros de las bsquedas
que desea combinar
precedidos por un signo
numeral (#). Tambin puede
clickear sobre los nmeros
de bsqueda de la lista y
utilizar el men desplegable
para incorporarlos al campo
de bsqueda.
Presione "Go" para ver los
resultados de la bsqueda.
Resultados de la bsqueda.
22
Bibliografa y guas de aprendizaje

Ayuda de PubMed:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=helppubmed&part=pubmedhelp
Recursos de la NLM para la educacin online:

http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
PubMed Tutorial
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmedtutorial/
Manuales del curso de PubMed dictado en la National Library of Medicine:

http://www.nlm.nih.gov/pubs/web_based.html
Understanding and using the Medical Subject Headings (MeSH) vocabulary to perform
literature searches. Lowe HJ and Barnett O. JAMA 1994. 271(14):1103-8.

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Breve gua visual de PubMed

Bsqueda simple y pantalla de resultados

Es posible escribir varios

Presentacin en la pantalla y guardado en el disco

Tambin se puede elegir el

Elija la opcin "Text" para mostrar

Envo de los resultados por E-mail

Pgina de resultados: visualizacin de los registros

Ttulo del artculo

Nombre del journal,

Artculo gratuito en la base PMC y/o en

Detalle de un registro en formato Summary

Los lmites aplicados quedan

Men Limits (2): Bsqueda por autor o por nombre de journal

Ingrese uno o ms autores y luego

Los autores quedan

Bsqueda por journal: Clickee

Men Limits (3)

Eligiendo "Choose date range" el

Tambin es posible solicitar

MeSH (Medical Subject Headings) es un vocabulario de trminos mdicos y cientficos asignados a

Debajo del campo de bsqueda

Se puede buscar el trmino

MeSH Database (2)

Puede elegir, si lo desea, otro

Marque la casilla correspondiente al

MeSH Database (3)

MeSH Database (4) - Subencabezamientos (Subheadings)

MeSH Database (5) - Subencabezamientos (Subheadings)

MeSH Database (6) Bsqueda de temas principales (MeSH Major Topic)

Adems de seleccionar la casilla

La estrategia de bsqueda queda

MeSH Database (7) - Combinacin de trminos

Busque el primer trmino en

Una vez encontrado y

Mapeo automtico - Uso de la opcin "Details"

Single Citation Matcher

Para acceder presione la

Bibliografa y guas de aprendizaje

Recursos de la NLM para la educacin online:

Manuales del curso de PubMed dictado en la National Library of Medicine:

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