Aminocido e peptdeos

Princpios de bioqumica do Lehninger, captulo 3,

itens 3.1 e 3.2

Importncia das protenas

Protenas medeiam praticamente todos os
processos que ocorrem em uma clula,
exibindo um nmero infinito de funes
Protenas so a expresso final do cdigo
gentico

Aminocidos
Existem 20 tipos diferentes de aminocidos (aa)
na extrutura primria das protenas
Os aa so ligados atravs de ligaes covalentes
Esses aa podem ser arranjados em sequncias
diferentes e gerando protenas de tamanhos
diferentes, o que fornece grande diversidade s
protenas

As protenas formadas a partir desses

20 aa podem ter uma diversidade de
funes

 aa diferem uns dos outros por sua cadeia lateral (R)

Todos tm um grupo carboxil, um grupo amino ligados ao
carbono (C)

 O C dos aa esto ligados a 4 grupos diferentes (exceto pela

glicina cujo R=H), constituindo-se em centros quirais

Os aa podem se apresentar como dois estereoismeros

 Configurao de Fisher: aa encontra-se na configurao L ou D, de

acordo com a configurao do gliceraldedo.
Estereoismeros L e D so como a mo direita e a mo esquerda:
so semelhantes, mas no podem ser sobrepostas

 Os aa presentes na estrutura de protenas so todos estereoismeros L

D-aa s foram encontrados em poucos peptdeos pequenos presentes
na parede celular bacteriana e em certos antibiticos peptdicos

Mas porque ser que a natureza selecionou

apenas o estereoismero L???

Mas porque ser que a natureza selecionou

apenas o estereoismero L???
R: Porque para se formar estruturas estveis e
repetitivas, preciso que essa ocorra a partir
de um tipo nico de estereoismero de aa
Porque enzimas so estereoespecficas,
diferenciando um estereoismero do outro

Os aa podem ser classificados de acordo

com as caractersticas do seu grupo R

Tambm so apolares, porm a tirosina pode formar ligao de H

Pontes dissulfeto tm funo importante na estrutura de muitas

protenas uma vez que essas formam interaes covalentes entre
partes de um mesmo polipeptdeo ou entre polipeptdeos diferentes

 A histidina o nico aa que tem um grupo R

ionizvel com pKa prximo ao pH neutro, assim a
histidina pode se encontrar positivamente ionizada
ou sem carga no pH 7,0.
Devido a essa caracterstica, os resduos de
histidina facilitam muitas reaes catalisadas por
enzimas por servirem como doadores/aceptores de
prtons

Alm desses 20 aa, protenas podem conter

resduos de aa que foram modificados aps
terem sido incorporados sequncia da
protena

 Hidroxiprolina e hidrolisina podem ser encontrados no colgeno

Metillisina est presente em miosina

 -carboximglutamato econtrado na protrombina e em outros

protenas que se ligam a clcio
Desmosina encontrada na elastina

 Selenocistena introduzida durante a sntese proteica e

modificado posteriormente (o enxofre substitudo por selenium)
derivada da serina

Aminocidos podem ainda ser

alterados por fosforilao,
metilao, acetilao, adenilao,
ADP-ribosilao, etc.

Foram identificados mais de 300 aa adicionais

Por exemplo, a ornitina e citrulina so intermedirios na

sntese da arginina e no ciclo da uria

Aminocidos podem agir

como cidos e bases fracas:
As formas no ionizadas no
ocorrem em quantidades
apreciveis em soluo
aquosa, onde predominam as
formas ionizadas.

Um aa com cadeia lateral no ionizvel um cido

diprtico

Concluso: o pKa de qualquer grupo funcional pode ser altamente afetado por seu
ambiente qumico. Esse fenmeno muitas vezes explorado pelo stio ativo de
enzimas para promover mecanismos de reao que dependem de valores de pKa
alterados de resduos que so doadores/aceptores de prtons

O ponto isoeltrico:
No pH 1,0, a glicina se moveria
para o eletrodo positivo ou negativo
se submetida a um campo eltrico?
E no caso do pH 5 ou 9,7 ? ? ? ?

 Aminocidos que apresentam grupo R no ionizvel, tero comportamento similar a

glicina em uma curva de titulao.
O pKa da carboxila varia de 1,8 a 2,4 e o pKa do grupo amina varia de 8,8 a 11,0,
dependendo da influncia do grupo R

 J aa que apresentam grupos R ionizveis possuem curvas de titulao mais

complexas: 3 processos de ionizao distintos

PI=3,22

PI=7,59

Peptdeos so cadeias de aa

Ligao peptdica: bastante estvel no ambiente celular (meia

vida de 7 anos)

Pentapeptdeo

Oligopeptdeos .... Polipeptdeos (at 10 mil aa) ... Protenas ...

Ligao Peptdica

pKa3
Tetrapeptdeo

pKa2

As caractersticas cido-base de
peptdeos so exploradas para sua
separao
pKa4
pKa1

O pKa dos resduos de aa podem ser alterados

enormemente quando em uma cadeia polipeptdica
por causa da perda de carga dos grupos carboxila e
amina e pela presena de grupos R de outros
resduos de aa na cadeia do peptdeo

Peptdeos biologicamente ativos

Outros exemplos: hormnios (como ocitocina), substncias

nocivas (amanitina) e antibiticos

Multi-subunidades de protenas

O nmero de aa de uma
protena pode ser determinado
dividindo-se a massa molecular
da protena por 110

Ribonuclease

Ativa

Inativa

( + O2 )