Lista de Exerccios 2

Nome: Tibor Zequini

29/08/2016
1.a)

c) A molecula de
agua e polarizada e a molecula de H2 e apolar, por este
motivo a molecula de hidrogenio possuira um certo dipolo induzido, o
qual far
a com que seus hidrogenios fiquem ou na posicao horizontal ou
na posic
ao vertical, respeitando as interacoes eletrostaticas entre as duas
moleculas. Na primeira possibilidade, as forcas eletrostaticas se situam
na linha que liga o
atomo de oxigenio ao centro das duas moleculas de
hidrogenio (que est
ao alinhadas), e na segunda possibilidade as forcas
eletrost
aticas se situam na linha que liga o atomo de oxigenio da molecula
de
agua ao ponto medio entre a ligacao dos dois atomos de hidrogenio
molecular.

2. a) Considerando o range de -180o a 180o , o histograma e dado pela figura 1.

Figure 1: Angulo

2. b) O c
alculo da PDF (probability density function) foi feito a partir da funcao
1 x 2
1
2 ( ) em que os valores
da distribuic
ao dada por f (x, , 2 ) = (2)
1/2 e
de e s
ao dados pela tabela do item (f), utilizando um programa em
Python a func
ao foi iterada e o resultado grafico e dado a seguir. A normalizac
ao e feita a partir da integracao da funcao sobre todo seu domnio
e igualando a 1. Em x temos os angulos e em y a probabilidade.

c) Tomando apenas a metade da trajetoria para os angulos e , seus histogramas s

ao dados pelas figuras 2 e 3. Fazendo-se uma comparacao qualitativa entre as figuras 2 e 3, ve-se que o angulo diedral possui uma
distribuic
ao mais simetrica e densa em torno do angulo de 120o enquanto
o
angulo diedral apresenta uma maior dispersao em torno de seus angulos
com maior pico de distribuicao, ou seja, sua densidade e mais baixa.

Figure 2: Angulo

Figure 3: Angulo

e) i. Os diedrais est
ao estatisticamente relacionados, pois ao tracar uma
func
ao do tipo f(x) = mx + k, vemos que os dados na figura 4 se organizam simetricamente ao redor do fit, dizendo que de fato eles possuem
correlac
ao.
ii. Devido a aglomeracao verificada no grafico de Ramachandran, nos
perdemos a precis
ao dos angulos diedrais mais estaveis, que, no entando,
e facilmente verific
avel ao se olhar nos histogramas.

Figure 4: Ramachandran Plot

f) A vari
ancia e muito grande para o angulo diedral e um pouco menor
para o , o que est
a de acordo com a dispersao mostrada pelos histogramas, contudo, a vari
ancia de e muito baixa pois como se nota na figura
1 as barras encontram-se bastante compactas. Percebe-se tambem que as
distribuic
oes s
ao unimodais, pois os angulos assumidos em todos os histogramas se encontram em uma regiao especfica do grafico, ou seja, as
barras do histograma se encontram dentro de intervalos fechados e nao
transitam em intervalos angulares diferentes das quais se encontram inicialmente.
Desvio Padrao
Vari
ancia
Media

Theta
3.51
12.33
114.25

Psi
9.90
98.20
98.18

Phi
14.80
218.86
13.72