Anda di halaman 1dari 37

Name

Christina
1 Avanti

2 Erni

Elisabeth
4 Tantono
5

Nrp

email account

Deskripsi singkat
Serial femtosecond crystallography
(SFX)
Science, 2012, Vol. 337, issue 6092, memanfaatkan x-ray free-electron laser (XFEL) dapat
High-Resolution Protein Structure Determination
p. 362-354
digunakan untuk menentukan struktur kristal model protein
123456 christina.avanti@gmail.com by Serial Femtosecond Crystallography
Boutet, S. et. al.
lysozyme.
cyclodextrins have a wide range of applications in different
areas of drugdelivery and pharmaceutical industry karena
kemampuan kompleksasinya dan karakteristik yang
serbaguna. Aplikasi yang paling umum dari siklodekstrin
adalah kemampuan untuk meningkatkan
kelarutan,stabilitas, keamanan dan bioavailabilitas molekul
ARUN RASHEED *,
obat. Dalam bidang industri siklodekstrin digunakan
ASHOK KUMAR C.
sebagai agen pengompleks untuk meningkatkan kelarutan
111001
Cyclodextrins as Drug Carrier Molecule: A
K., SRAVANTHI V.
obat dan untukmeningkatkan bioavailabilitas dan
9 erni_nia93@yahoo.com
Review
V. N. S. S.
Sci Pharm. 2008; 76: 567598
stabilitasnya

111002 elisabeth_sipitz@yahoo.co
0 m

Sherly
5 Cendrasari

111004
9

6 Lelyani Herly

111005
0 131z.herly@gmail.com

7 tantik tandela

8 Trisnatali
9

Title

Author (s)

Larry R Brown

Enhancement of dissolution and bioavailability of


piroxicam in solid dispersion systems.

Dielectric and Spectroscopic Investigation of


Amorphous Captopril
Deteremination of Drug - Plasma Protein Binding
Konetics and Equilibria by Chromatographic
109003
Profiling : Exemplification of The Method Using
6 tantik_tandela@yahoo.com L-Tryptophan and Albumin
Enhancement of solubilization and bioavailability
of poorly soluble drugs
by physical and chemical modifications: A recent
109008
review
2 tries_coolz@rocketmail.com

Journl, year, Volume, issu, page

Epic Therapeutics, Inc. a wholly


owned subsidiary of Baxter
Healthcare Corporation, 220
Norwood Park South, Norwood, MA
02062, USA
(2005) 2 (1):29-42

Komersial keberhasilan protein pengiriman oleh rute


hidung, mulut, dan paru telah lebih oportunistik daripada
penerapan teknologi platform yang berlaku untuk setiap
protein atau peptida. Rintangan besar tetap dalam rangka
untuk mengatasi hambatan alami gabungan dari obat, obat
permeabilitas stabilitas, farmakokinetik, dan
farmakodinamik dari protein terapi

Sistem dipersi padat dari piroxicam yang tidak larut dalam


polyethylene glycol (PEG) 4000 dan dalam urea disiapkan
dengan peleburan dan metode pelarut. Studi kelarutan in
vitro menunjukkan bahwa sistem dipersi yang
mengandung piroxicam dan PEG4000 atau urea
memeberikan kelarutan yang lebih cepat daripada
campuran tunggal. Studi differential scanning calorimetry
(DSC) mengindikasikan bahwa sistem piroxicam-PEG
disiapkan dengan peleburan adalah dispersi padat,
sementara sistem piroxicam-urea disiapkan dengan
metode pelarut mirip seperti larutan solid piroxicam dalam
urea. Percobaan menunjukkan bahwa seluruh dispersi
stabil, kecuali pengambilan airselama penyimpanan
mungkin akan muncul di sistem PEG. Studi dengan kelinci
Pan RN, Chen JH, Drug Dev Ind Pharm. 2000
menunjukkan bahwa sistem dipersi disiapkan sangat
Chen RR.
Sep;26(9):989-94.
statistik untuk nilai bioavailibilitas.
Metode meningkatkan bioavailabilitas dan stabilitas
Captopril dengan mengubahnya menjadi bentuk amorf.
Metode ini memanfaatkan BDS (Broadband Dielectric
Sailaja Urpayil, M. IOSR Journalof Pharmacy, Vol.
Spectroscopy) untuk mempelajari spektrum dielektrik
Shahin Thayyil
2,Issue 3, pp. 479-484
Captopril yang menunjukkan mobilitas molekulnya
Ann M. Talbert,
Sebuah metode cepat secara bersamaan menentukan
George E. Tranter,
konstanta laju kinetik dan konstanta kesetimbangan dari
Elaine Holmes, and Analysis Chemical, 2002, 74 (2), pp profil kromatografi telah dikembangkan, didasarkan pada
Peter L. Francis
446-452
penggunaan kolom protein bergerak dan HPLC.
Amit Chaudhary*,
Upendra Nagaich,
Neha Gulati, V. K.
Journal of Advanced Pharmacy
Tujuan dari kajian ini adalah untuk meningkatkan kelarutan
Sharma, R. L.
Education & Research
dan bioavailabilitas obat dengan menggunakan berbagai
Khosa
2 (1) 32-67 (2012) ISSN 2249-3379 teknik seperti fisika, kimia.

Name
Christina
1 Avanti

2 Erni

Elisabeth
4 Tantono

10 Yuliana P.S.

Nrp

email account

Title

Deskripsi singkat
Serial femtosecond crystallography
(SFX)
Science, 2012, Vol. 337, issue 6092, memanfaatkan x-ray free-electron laser (XFEL) dapat
High-Resolution Protein Structure Determination
p. 362-354
digunakan untuk menentukan struktur kristal model protein
123456 christina.avanti@gmail.com by Serial Femtosecond Crystallography
Boutet, S. et. al.
lysozyme.
cyclodextrins have a wide range of applications in different
areas of drugdelivery and pharmaceutical industry karena
kemampuan kompleksasinya dan karakteristik yang
serbaguna. Aplikasi yang paling umum dari siklodekstrin
adalah kemampuan untuk meningkatkan
kelarutan,stabilitas, keamanan dan bioavailabilitas molekul
ARUN RASHEED *,
obat. Dalam bidang industri siklodekstrin digunakan
ASHOK KUMAR C.
sebagai agen pengompleks untuk meningkatkan kelarutan
111001
Cyclodextrins as Drug Carrier Molecule: A
K., SRAVANTHI V.
obat dan untukmeningkatkan bioavailabilitas dan
9 erni_nia93@yahoo.com
Review
V. N. S. S.
Sci Pharm. 2008; 76: 567598
stabilitasnya

111002 elisabeth_sipitz@yahoo.co
0 m

111016
2 jul_jul_28@yahoo.com

RELATION OF ELECTRONIC STRUCTURES


WITH
THEIR ANTIMALARIAL ACTIVITIES ON
ARTEMISININ DERIVATIVES

Author (s)

Journl, year, Volume, issu, page

Larry R Brown

Epic Therapeutics, Inc. a wholly


owned subsidiary of Baxter
Healthcare Corporation, 220
Norwood Park South, Norwood, MA
02062, USA

Ria Armunanto, Sri


Sudiono

Indonesian Journal of Chemistry,


2004, 4 (3), 212 - 217

Komersial keberhasilan protein pengiriman oleh rute


hidung, mulut, dan paru telah lebih oportunistik daripada
penerapan teknologi platform yang berlaku untuk setiap
protein atau peptida. Rintangan besar tetap dalam rangka
untuk mengatasi hambatan alami gabungan dari obat, obat
permeabilitas stabilitas, farmakokinetik, dan
farmakodinamik dari protein terapi
Hubungan struktur elektronik dengan kegiatan anti malaria
mereka atas derivatif artemisinin adalah
dievaluasi melalui kegiatan struktur hubungan metode
kuantitatif (QSAR). Untuk menggambarkan elektronik
struktur, biaya atom dan momen dipol dihitung dengan
mekanika kuantum pada PM3 semiempirical
tingkat. Sebuah hubungan linear antara aktivitas dan
struktur elektronik digunakan untuk membangun
persamaan linier
model. Sebuah model persamaan statistik menunjukkan
kriteria baik dan realibility aktivitas antimalaria adalah
dipilih untuk digunakan untuk merancang suatu senyawa
dengan kegiatan baru melawan P. facilparum. Hasil
penelitian menunjukkan bahwa 13
model persamaan yang diperoleh, hanya menampilkan
tiga model dengan kriteria baik. O2 dan C4 atom yang
diamati untuk peran kunci dari peningkatan aktivitas
antimalaria.

Name
Christina
1 Avanti

2 Erni

Elisabeth
4 Tantono

Nrp

email account

Deskripsi singkat
Serial femtosecond crystallography
(SFX)
Science, 2012, Vol. 337, issue 6092, memanfaatkan x-ray free-electron laser (XFEL) dapat
High-Resolution Protein Structure Determination
p. 362-354
digunakan untuk menentukan struktur kristal model protein
123456 christina.avanti@gmail.com by Serial Femtosecond Crystallography
Boutet, S. et. al.
lysozyme.
cyclodextrins have a wide range of applications in different
areas of drugdelivery and pharmaceutical industry karena
kemampuan kompleksasinya dan karakteristik yang
serbaguna. Aplikasi yang paling umum dari siklodekstrin
adalah kemampuan untuk meningkatkan
kelarutan,stabilitas, keamanan dan bioavailabilitas molekul
ARUN RASHEED *,
obat. Dalam bidang industri siklodekstrin digunakan
ASHOK KUMAR C.
sebagai agen pengompleks untuk meningkatkan kelarutan
111001
Cyclodextrins as Drug Carrier Molecule: A
K., SRAVANTHI V.
obat dan untukmeningkatkan bioavailabilitas dan
9 erni_nia93@yahoo.com
Review
V. N. S. S.
Sci Pharm. 2008; 76: 567598
stabilitasnya

111002 elisabeth_sipitz@yahoo.co
0 m

Title

Author (s)

Journl, year, Volume, issu, page

Larry R Brown

Epic Therapeutics, Inc. a wholly


owned subsidiary of Baxter
Healthcare Corporation, 220
Norwood Park South, Norwood, MA
02062, USA

Komersial keberhasilan protein pengiriman oleh rute


hidung, mulut, dan paru telah lebih oportunistik daripada
penerapan teknologi platform yang berlaku untuk setiap
protein atau peptida. Rintangan besar tetap dalam rangka
untuk mengatasi hambatan alami gabungan dari obat, obat
permeabilitas stabilitas, farmakokinetik, dan
farmakodinamik dari protein terapi

Name
Christina
1 Avanti

2 Erni

Elisabeth
4 Tantono

Nrp

email account

Deskripsi singkat
Serial femtosecond crystallography
(SFX)
Science, 2012, Vol. 337, issue 6092, memanfaatkan x-ray free-electron laser (XFEL) dapat
High-Resolution Protein Structure Determination
p. 362-354
digunakan untuk menentukan struktur kristal model protein
123456 christina.avanti@gmail.com by Serial Femtosecond Crystallography
Boutet, S. et. al.
lysozyme.
cyclodextrins have a wide range of applications in different
areas of drugdelivery and pharmaceutical industry karena
kemampuan kompleksasinya dan karakteristik yang
serbaguna. Aplikasi yang paling umum dari siklodekstrin
adalah kemampuan untuk meningkatkan
kelarutan,stabilitas, keamanan dan bioavailabilitas molekul
ARUN RASHEED *,
obat. Dalam bidang industri siklodekstrin digunakan
ASHOK KUMAR C.
sebagai agen pengompleks untuk meningkatkan kelarutan
111001
Cyclodextrins as Drug Carrier Molecule: A
K., SRAVANTHI V.
obat dan untukmeningkatkan bioavailabilitas dan
9 erni_nia93@yahoo.com
Review
V. N. S. S.
Sci Pharm. 2008; 76: 567598
stabilitasnya

111002 elisabeth_sipitz@yahoo.co
0 m

Title

Author (s)

Journl, year, Volume, issu, page

Larry R Brown

Epic Therapeutics, Inc. a wholly


owned subsidiary of Baxter
Healthcare Corporation, 220
Norwood Park South, Norwood, MA
02062, USA

Komersial keberhasilan protein pengiriman oleh rute


hidung, mulut, dan paru telah lebih oportunistik daripada
penerapan teknologi platform yang berlaku untuk setiap
protein atau peptida. Rintangan besar tetap dalam rangka
untuk mengatasi hambatan alami gabungan dari obat, obat
permeabilitas stabilitas, farmakokinetik, dan
farmakodinamik dari protein terapi

Name
Christina
1 Avanti

2 Erni

Elisabeth
4 Tantono

Nrp

email account

Deskripsi singkat
Serial femtosecond crystallography
(SFX)
Science, 2012, Vol. 337, issue 6092, memanfaatkan x-ray free-electron laser (XFEL) dapat
High-Resolution Protein Structure Determination
p. 362-354
digunakan untuk menentukan struktur kristal model protein
123456 christina.avanti@gmail.com by Serial Femtosecond Crystallography
Boutet, S. et. al.
lysozyme.
cyclodextrins have a wide range of applications in different
areas of drugdelivery and pharmaceutical industry karena
kemampuan kompleksasinya dan karakteristik yang
serbaguna. Aplikasi yang paling umum dari siklodekstrin
adalah kemampuan untuk meningkatkan
kelarutan,stabilitas, keamanan dan bioavailabilitas molekul
ARUN RASHEED *,
obat. Dalam bidang industri siklodekstrin digunakan
ASHOK KUMAR C.
sebagai agen pengompleks untuk meningkatkan kelarutan
111001
Cyclodextrins as Drug Carrier Molecule: A
K., SRAVANTHI V.
obat dan untukmeningkatkan bioavailabilitas dan
9 erni_nia93@yahoo.com
Review
V. N. S. S.
Sci Pharm. 2008; 76: 567598
stabilitasnya

111002 elisabeth_sipitz@yahoo.co
0 m

Title

Author (s)

Journl, year, Volume, issu, page

Larry R Brown

Epic Therapeutics, Inc. a wholly


owned subsidiary of Baxter
Healthcare Corporation, 220
Norwood Park South, Norwood, MA
02062, USA

Komersial keberhasilan protein pengiriman oleh rute


hidung, mulut, dan paru telah lebih oportunistik daripada
penerapan teknologi platform yang berlaku untuk setiap
protein atau peptida. Rintangan besar tetap dalam rangka
untuk mengatasi hambatan alami gabungan dari obat, obat
permeabilitas stabilitas, farmakokinetik, dan
farmakodinamik dari protein terapi

No

Judul paper

Pengarang

1 I Putu Agus Yulyastrawan

Name

1110055 agus.yulyastrawan@gmail.com

Self-micro emulsifying drug


delivery systems (SMEDDS) : A
Novel Approach For Lipophilic
Drugs

Sharma et al

2 Ni Wayan Susanti

1110327 susantiniwayan@gmail.com

Interpretation of the dissolution of


insoluble peptide sequences
Luciana Malavolta, Marcelo R. S. Pinto, Janile H. Cuvero, Clovis R. Nakale.
based on the acid-base
properties of the soluent.

3 Dewa Ayu Kusuma Dewi

1110352 dewaayu.kusumadewi@yahoo.com

Bioavailability enhancement of
poorly water soluble drugs: A
review

4 Arnold Edrick

1110255 arnold.edrick18@gmail.com

Thermal stabilty of glucokinase


(GK) as influenced by the
substrate glucose, an allosteric
glucokinase activator drug (GKA) B. Zelenta, C. Buettgera, J. Grimsbyb, R. Sarabub, J.M. Vanderkooia, A.J. Wanda, F.M. Matschinskya,
and the osmolytes glycerol and
urea

5 Ni Nengah Muswita
Wikantini

1110265 muswita_wikantini@ymail.com

6 Maria Lovenia Limantara

1110041 fe_ling93@yahoo.co.id

7 Sharly Dwijayanti

1110081 sharly_dwijayanti@live.com

Carrier-mediated delivery of
peptidic drugs of cancer therapy Crispin R. Dass , Peter F.M. Choong

8 Ervina Lukman

1110077 ervina_lukman@yahoo.com

X-ray Diffraction from Membrane M.S. Hunter, D.P. DePonte, D.A. Shapiro, R.A. Kirian, X. Wang, D. Starodub, S. Marchesini, U. Weierstall, R.B. Doak, J.C.H. Spence, P. Fromme
Protein Nanocrystals

9 Sherly Liady Lie

1110094 goddess_sherly@yahoo.co.id

Protein structure determination


from NMR chemical shifts

Andrea Cavalli, Xavier Salvatella, Christopher M. Dobson, Michelle Vendruscolo

10 Wenny Tanyawan Tan

1110076 wenny_tanyawan@yahoo.com

A Fluorescence Polarization
Assay for the Identification of
Inhibitors of the p53DM2
ProteinProtein Interaction

Stephen M. G. Knight, Naoki Umezawa, Hee-Seung Lee, Samuel H. Gellman


and Brian K. Kay

11 Evelyn Hoeij

1110122 Velyn_green@yahoo.com

Defining Minimal Structural


Features in Substrates of the
H+/Peptide Cotransporter PEPT2 Stephan Theis, Bianka Hartrodt, Gabor Kottra, Klaus Neubert, and Hannelore Daniel
Using Novel Amino Acid and
Dipeptide Derivatives

12 Cornelia Khanis Genial

1110083 cornelia.genial@yahoo.co.id

Molecular Lipophilicity in Protein Roman G. Efremov, Anton O. Chugunov, Timothy V. Pyrkov, John P. Priestle, Alexander S. Arseniev, dan Edgar Jacoby
Modeling and Drug Design

13 I Gede Dhananjaya Putra

1110087 abcdeny11@yahoo.com

Review on self Emulsifying Drug


Delivery System: Novel
Patel Nitesh N. Rathva Sunil R. MR.Shah Viral H. DR.Upadhyay Umesh M.
Approach for Solubility
Enhancement

14 Meilyana

1110060 melz_ching93@yahoo.com

Protein Based Drug Discovery

15 Vina Fitriana Pratiwi

1100133 vinafitrianapratiwi@yaho.co.id

Cargo-dependent mode of
uptake and bioavailability of TATcontaining proteins and peptides
in living cells
Gisela Tunnemann, Robert M, Martin, Simone Haupt, Christoph Patsch, Frank Edenhofer and M. Cristina Cardoso

Ni Kadek Ayu Dewinta


Pramitha

Nrp

1110173

Email account

dewintahahaha@yahoo.com

Jurnal, Tahun, Volume, issue, halaman

Gupta & Sehrawat

Peptide deformylase inhibitors as


antibacterial agents :
Identification of VRC3375, a
Proline-3-Alkylssucinyl
D. Chen et al
hydroxamate derivative, by using
an integrated combinatiorial and
medicinal chemistry approach.
Electric Dipole Moments of
Acetoneand of Acetic Acid
O. Dorosh, Z. Kisiel
Measuredin Supersonic
Expansion

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) protein and proteonemics, 2012,


vol.1824,issue 5, p. 769 - 784

Glucokinase activator drug berpotensi menjadi obat


anti-diabetik baru, penentuan batas stabilitas suhu
denaturasi GK dengan pengukuran kinetika, absorpsi,
flourosence dan dengan kalorimetri

Antimicrobal Agents and Chemotherapy,


2004, vol. 48, DOI:
10.1128/AAC.48.1.250261.2004, p. 250261

Peptida deformylase (PDF), sebuah metallohydrolase


penting untuk pertumbuhan bakteri, merupakan target
yang menarik untuk digunakan dalam penemuan antibiotik
baru.

Institute of Physics, Polish Academy of


Sciences, 2007, vol 112,issue 1,95 - 104

Teknik utama untuk penentuan momen dipol listrik dari


molekul terisolasi dipamerkan oleh transisi rotasi molekul
sasaran

Protein and petide drugs digunakan untuk pengobatan


berbagai penyakit. Akan tetapi, penggunaanya terhambat
oleh rendahnya bioavailabilitas dan mahalnya biaya
uyang dibutuhkan dalam memproduksi obat-obatan.
Dalam jurnal ini dibahas mengenai beberapa carriermediated methods yang digunakan untuk menghantarkan
peptide and protein drugs dengan penekanan pada
sistem penghantaran liposomal dan microspherical.
untuk mengembangankan konsep baru dalam
menentukan struktur membran protein dilakukan
Biophysical Journal, 2012, vol 100, issue 1, penelitian pada metode nanocrystallography serial.
p.198-206
Nanocrystallography Serial mampu mengatasi masalah
kerusakan yang timbul dari penggunaan x-ray dalam
menentukan struktur kristal kecil.
NMR spectroscopi memiliki peran utama dalam
penentuan struktur dan dinamika protein dan
makromolekul biologi lainnya. Perubahan kimia
PNAS, 2007, vol 104 no.23, 9615-9620
merupakan parameter yang paling mudah dan akurat
sebagai parameter ukur NMR, dan mereka juga
mencerminkan konformasi yang spesifik dari posisi
protein yang asli dan tidak.
Pada penderita kanker, gen DM2 mengalami overekspresi
sehingga p53 tidak mampu melakukan apoptosis. Uji
pada jurnal ini bertujuan untuk mengembalikan fungsi
p53, dengan mengembangkan inhibitor interaksi protein
Analytical Biochemistry, 2001, vol. 300,
p53-DM2. Flurorcence Polarization (FP) digunakan untuk
230236
mengukur interaksi antara N-terminal protein p53 dan
DM2 dan juga menunjukkan bahwa peptida dengan
subtitusi b-asam amino nonhydrolyzable dapat berikatan
dengan DM2 dengan afinitas yang sebanding dengan
peptida p53.
Transporter peptida PEPT2 digunakan untuk berbagai
obat peptidomimetic, yaitu untuk mengidentifikasi molekul
penting fitur substrat yang menentukan afinitas dan
Molecular Pharmacology,2001, vol.61, 214- transportasi oleh PEPT2, kita disintesis serangkaian
221
turunan asam amino serta dimodifikasi dipeptides. Kinetic
konstanta untuk menginteraksikan senyawa uji dengan
PEPT2 diperoleh dalam uji menggunakan sel ragi Pichia
pastoris mengekspresikan mamalia PEPT2.
Pengembangan metode komputansi efisien dalam desain
obat memerlukan kuantitatif penilaian sifat hidrofobik
spasial (lipofilik) dari molekul-molekul. salah satu metode
yang mungkin digunakan untuk penilaian kuantitatif sifat
Current Medicinal Chemistry, 2007, 14,
hidrofobik ini dengan penerapan konsep potensi
393-415
hidrofobisitas 3-dimensi molekul (MHP). Interaksi
hidrofobik memainkan peran kunci dalam lipat dan
pemeliharaan 3-dimensi struktur protein, serta dalam
pengikatan ligan (misalnya obat) dengan target protein.
Obat lipofilik dapat solubilized untuk meningkatkan
International Journal of Pharmaceutical
bioavabilitas dengan menggunakan beberapa metode
Research & Allied Sciences, volume1, issue sebagai mikroemulsi, suspensi, nano, liposom,
3 (2012), 1-12
nanopartikel lipid padat (SLN) self obat pengemulsi
banyak penemuan yang dapat digunakan untuk
mengidentifikasi adanya protein baru.G-protein coupled
reseptor adalah salah satu target yang paling penting.
sekitar 60% dari target reseptor tersebut berada diatas
permukaan sel dan setengah dari mereka adalah
International Journal of Drug Discovery,
GPCRs.sebuah analisis protein-protein individu sistem
ISSN: 09754423, Volume 1, Issue 2, 2009, interaksi baru-baru ini menghasilkan keberhasilan dalam
pp-40-51
penemuan obat seperti inhibitor.
Bioavailabilitas
peptida TAT diinternalisasi diuji dan dikonfirmasi oleh efek
penghambatan yang
kuat pada perkembangan siklus sel dari dua peptida fusi
TAT berasal dari p21WAF/Cip
The FASEB Journal, 0892-6638/06/0020, supresor tumor dan ligase DNA saya diukur dalam hidup
vol 20, september 2006, 1775-1784
cells.
Struktur senyawa kristal yang terikat dengan protein bisa
mengarahkan optimasi sifat kimia obat untuk
Neuropharmacology, Volume 60, Issue 1,
meningkatkan obat, tidak hanya untuk meningkatkan
January 2011, Pages 723
afinitas mengikat atau selektivitas, tetapi juga dapat
menunjukkan senyawa yang dapat dimodifikasi untuk
memodulasi sifat fisiko-kimia dan keberhasilan biologis.
Peptides 27, 2006,p. 3020-3028

Joshi B. Gupta G. Gupta N. Gupta M. Trivedi S. Patil P. Jhadav A. Vamsi K.K. Khairnar Y.Boraste A. Mujapara A.

Structure-based drug discovery


and protein targets in the CNS

SMEDDS merupakan campuran isotropik minyak,


surfaktan, dan co-solvent. Hal ini menyebabkan SMEDDS
International Journal of Pharmaceutical
memiliki keungulan untuk memberikan makromolekul
Science and Research, 2012,vol. 3,issue 8, seperti peptida, hormon, enzim dan substrat inhibitor
2441-2450
karena SMEDDS dapat memberikan pelindungan
terhadap makromolekul tersebut dari hidrolisis enzimatik.
Sifat-sifat asam-basa dari suatu pelarut dapat
menyebabkan terjadinya tata ulang dari urutan ikatan
Protein Science, 2006, vol. 15, issue 6, p. peptida. Efek urutan tergantung pH pada kelarutan
1476-1488
peptida yang dikonfirmasi melalui spektroskopi dichroism
melingkar.
bioavailabilitas obat tergantung pada kelarutan dalam
media air yang berada pada rentang pH berbeda,
International Journal of Pharmacy & Life
Sciences, 2011, vol.2, issue 3, p.640-650 berbagai teknik digunakan untuk meningkatkan kelarutan
diantaranya mikronisasi, penyesuaian dispersi, modifikasi
kimia dan co-solvabilitas.

Roderick E. Hubbard

16

Putri Givella Carmelita E.


17 Lie

1110073 givellaputri@yahoo.co.id

Multivalent Protein Polymers with


Controlled Chemical and
Physical Properties
Ayben Top, Kristi L. Kiick

18 Dini Dwi Kusdiyanti

1110176 dhini_moetz93@yahoo.com

Globular proteins at solid/liquid


interfaces

19 Hana Listiyana Vinthea

1110127 hana.vinthea@yahoo.com

Encapsulation of bovine serum


albumin within cyclodextrin/gelatin-based
polymeric hydrogel for controlled
protein drug release
A.A.Haroun, N.R.El-Halawany

IRBM, 2010, Volume 31, Issue 4, Pages


234-241

20 Komang Oni Widiantari


21 Ni Luh Putu Riyan Dini

1110177 piggy_slow@yahoo.com
1110135 dini15@me.com

Proteinexcipient interactions:
Mechanisms and biophysical
characterization applied to
protein formulation development Tim J. Kamerzell,Reza Esfandiary, Sangeeta B. Joshi, C. Russel Middaugh,David B. Volkin

Advanced Drug Delivery Reviews, 2011,


Volume 63, Issue 13, Pages 1118-1159

Advanced Drug Delivery Reviews, vol 62,


issue 15, p. 1530-1538

Colloids and Surfaces B: Biointerfaces


Charles A. Haynes, Willem Norde

Volume 2, Issue 6, 29 July 1994, Pages


517566

Mendeskripsikan desain, karakteristik, dan modifikasi dari


serangkaian alanine-rich helical polipeptida dengan fungsi
baru. Salah satu anggota dari keluarga polipeptida ini
menunjukkan ciri khas pholymorphological yang mudah
dimanipulasi dengan perubahan sederhana pada Ph dan
temperatur.
Kajian komprehensif terakhir pada mekanisme protein
globular adsorpsi untuk antarmuka padat / air. Sejak saat
itu, kontribusi tahunan ke lapangan telah terus meningkat
dan kemajuan substansial telah dibuat dalam sejumlah
bidang penting. Ulasan ini melihat kekuatan pendorong
untuk protein adsorpsi dengan menggabungkan
kemajuan terbaru dengan hasil kunci dari masa lalu.
Empat efek, penyusunan ulang yaitu struktural dalam
dehidrasi, proteinmolecule dari (bagian) permukaan
sorben, redistribusi kelompok dibebankan pada lapisan
antarmuka, dan polaritas protein permukaan biasanya
membuat kontribusi utama untuk perilaku adsorpsi
keseluruhan.
Novel biodegradable pH-responsif hidrogel polimer
berdasarkan -siklodekstrin (-CD) dan gelatin (G) yang
disiapkan untuk studi pemberian protein obat terkontrol.
Hidrogel polimer, Gg-poli (GMA) diperoleh dengan
mencangkok kopolimerisasi monomer metakrilat glisidil
(GMA) ke gelatin di hadapan amonium nitrat Ceric (CAN)
sebagai inisiator. Imobilisasi -CD ke Gg-poli (GMA)
hidrogel kemudian dilakukan. Hidrogel polimer disiapkan
yang ditandai dengan Fourier transform infrared
spectroscopy (FT-IR), pemindaian termogram (DSC), dua
dimensi X-ray pola difraksi (2D-XRD) dan transmisi
mikroskop elektron (TEM). Sebuah protein model obat,
bovine serum albumin (BSA), yang dikemas dalam
hidrogel dan dalam profil rilis vitro didirikan secara
terpisah di kedua lambung enzim bebas simulasi dan
cairan usus (SGF dan SIF).
Tujuan sebagai langkah kunci dalam mendesain rasional
formulasi untuk menstabilkan dan memberikan proteinobat berbasis terapi dan vaksin. Metode biofisik
digunakan untuk memeriksa berbagai interaksi molekul
antara zat terlarut dan molekul protein dibahas dengan
penekanan pada aplikasi untuk eksipien farmasi dalam
hal pengaruhnya terhadap stabilitas protein. Mekanisme
kunci dari protein-eksipien interaksi seperti interaksi
elektrostatik dan kation-pi, hidrasi preferensial, pasukan
dispersif, dan ikatan hidrogen disajikan dalam konteks
keadaan fisik yang berbeda dari formulasi seperti cairan
beku, solusi, gel, beku-kering padatan dan antarmuka
fenomena. Gambaran dari kelas yang berbeda dari
eksipien farmasi yang digunakan untuk merumuskan dan
menstabilkan obat protein terapeutik juga disajikan
bersama dengan alasan untuk digunakan dalam bentuk
sediaan yang berbeda termasuk pertimbangan farmasi
praktis.

22

23

24

Meilinvia Cahyadi

1110061

makerten12@yahoo.com

Pengaruh Penambahan Kosolven


Propilen Glikol Terhadap
Kelarutan Asam Mefenamat Oleh
Linda Widyaningsih

Swarbrick and Boylan, 1990 ; Yalkowsky, 1981.

Meilinvia Cahyadi

1110061

makerten12@yahoo.com

Analisis QSAR (Quantitative


Structure - Activity Relationship)
Senyawa Turunan Flavon /
Flavonol Dengan Menggunakan
Pendekatan Analisis Hansch
Oleh Ir. Drs. Sumatera Tarigan

Santoso, 2000.

petokhentudz@yahoo.com

Protein and Peptide Drug


Delivery: Oral Approaches

Jessy Shaji* and V. Patole

qiulian93@hotmail.com

Compositional Analysis aLactalbumin

Henny Puspita Sulistyono


1110059
Putra

Febe Debora Jakoeb

1110128

25 Astri Novita Wulandari

1110192 achieewulandariii@yahoo.com

Protein
targetdiscoveryofdruganditsreacti
ve
intermediate
metabolitebyusingproteomicstrat
egy
Lianghai Hua,b, JohnPaulFawcettc, JingkaiGua,b,n

26 Shinta Amelia

1110330 shintaamelia93@yahoo.com

Cyclodextrins as Drug Carrier


Molecule: A Review

Arun Rasheed*, Ashok Kumar C. K., Sravanthi V. V. N. S. S.

1110196 Yessynovika@yahoo.co.id

Computation of the Dipole


Moments of Proteins

Jan Antosiewicz

25 Violitta Irwan P.
26 Ni Wayan Deviani Susanti

1110058 agathaviolittairwan@yahoo.com
1110057 devi_vi50@yahoo.com

27 Zelin Angelina Anggriani

1110047 zelin888ang@gmail.com

28 Ainun Jariyah R

1110069 ajrandini@gmail.com

EFFECT OF DIELECTRIC
CONSTANT OF MEDIUM ON
CHEMICAL SPECIATIONOF LHISTIDINE COMPLEXES OF
Co(II), Ni(II) AND Cu(II)

kimia medisinal
Calculation of Transition Dipole
Moment in Fluorescent protein
Towards Efficient Energy
Transfer

Raju Sala, Ananda Kumar Bokka, Bharath Kumar Naik Kethavath and Nageswara RaoGollapalli

Tamar Ansbacher, Hemant Kumar Srivastava, Tamar Stein, Roi Baer, Maarten
Merkx and Avital Shurki

Asam Mefenamat memiliki kelarutan rendah dengan daya


tembus membran yang tinggi, sehingga kelarutan perlu
ditingkatkan untuk mendapatkan bioavailabilitas yang
maksimal karena ditentukan oleh kecepatan obat saat di
lepas dari bentuk sediaan, disolusi obat, dan absorbsi
obat. Kosolven memiliki peran dalam polaritas sistem,
Skripsi, 2009, - , - , Page 1 - 20
ditandai pengubahan konstanta dielektrik. Kosolven
seperti propilen glikol sebagai zat untuk meningkatkan
kelarutan obat dalam larutan pembawa. Pemilihan
kosolven yang tepat menjamin kelarutan komponen dalam
formulasi, serta mengurangi risiko pengendapan,
sehingga kemungkinan terjadi iritasi jaringan dapat
diminimalkan.
Analisis QSAR dengan nilai korelasi yang lebih dari 0,5
menandakan kuatnya hubungan sifat fisik molekul obat
dengan aktivitas antioksidannya. Urutan korelasi tertinggi
terhadap aktivitas antioksidan : Panas Pembentukan > log
P > Energi Hidrasi > Momen Dwikutub > Energi Atom
Terisolasi > (log P) > Energi Total > Massa Molekul >
Kultura, 2009, Vol. 10, No. I, Page 1-10 Energi Elektronik > Energi Interaksi Inti - inti > Luas
Permukaan > Volume Molekul > Polarisabilitas >
Refraktivitas > Energi Ikat. Arah korelasi positif
menandakan variabel sebanding dengan aktivitas,
sedangkan arah korelasi negatif menandakan pengaruh
yang berlawanan. Kelarutan dalam lemak menentukan
kecepatan senyawa antioksidan melewati penghalang
selaput.
Indian J Pharm Sci. 2008 May-Jun; 70(3): meningkatkan protein oral dan bioavailabilitas peptida
dengan mengatasi hambatan fisiologis terkait dengan
269277.
berbagai protein terapeutik dan peptida.
a-Lactalbumin, protein whey utama yang ditemukan
dalam susu semua mamalia. Analisis struktural dan
fungsional sejauh ini didapatkan mengenai protein yang
diuraikan di sini. Mengenai struktur, akan menampilkan
kondisi gumpalan terbaik karakteristik leburan yang telah
dipelajari oleh berbagai teknik seperti X-ray scattering,
NMR, studi termodinamika, studi ultrasonik, dll. Aspek
fungsional menunjukkan fitur yang luar biasa, banyak
lokasi ikatan kalsium dan ditemukan untuk menjadi unsur
yang berharga untuk memperkaya susu formula. Selain
itu, a-LA dapat mengubah fungsi biologisnya tergantung
keadaan konformasi dan secara aktif berinteraksi dengan
membran lipid, yang aktivitasnya mengarah ke
antimikroba dan antitumor yang memiliki peran penting
untuk menginduksi apoptosis pada sel tumor. Baru-baru
ini ditemukan bahwa pembuatan a-LA nanopartikel
digunakan dalam obat dan sistem pengiriman makanan
dalam nanomedicine juga dimungkinkan.
Mengidentifikasi target protein senyawa bioaktif
merupakan pendekatan yang efektif untuk menemukan
fungsi protein tidak diketahui, mengidentifikasi mekanisme
molekuler kerja obat, dan memperoleh informasi untuk
optimasi senyawa timbal. Pada saat yang sama, aktivasi
metabolisme obat dapat menyebabkan cytotoxicities. Oleh
karena itu, sangat penting untuk secara sistemik ciri obat
dan yang intermediate reaktif. Spektrometri massa
berbasis pendekatan proteomik telah muncul sebagai
yang paling efisien untuk mempelajari fungsi protein dan
modifikasi. Ulasan ini akan membahas metode
pengembangan untuk target penemuan obat dan aplikasi
Acta
dalam berbagai bidang, termasuk mekanisme toksisitas
PharmaceuticaSinicaB2012;2(2):126136 obat yang disebabkan oleh metabolit reaktif.
Aplikasi farmasi yang paling umum dari siklodekstrin
adalah untuk meningkatkan kelarutan, stabilitas,
keamanan dan bioavailabilitas molekul obat. Stoikiometri
dari kompleks terbentuk dan nilai numerik dari konstanta
stabilitas dapat ditentukan dengan mengamati perubahan
fisikokimia sifat seperti kelarutan, reaktivitas kimia, dan
absorbansi UV/VIS, retensi obat, kimia stabilitas, efek
pada permeabilitas obat melalui membran buatan dll.
Formasi dari kompleks inklusi antara omeprazole (OME)
dan metil--siklodekstrin (MCD) telah dipelajari dan
stoikiometri dari kompleks ditemukan 1:1 mol: mol Ome:
siklodekstrin dan nilai Kswas tinggi untuk OME: MCD
Sci Pharm. 2008; 76; 567-598
daripada OME: CD kompleks inklusi.
Sebuah prosedur sederhana dan komputasi layak untuk
perhitungan muatan bersih dan momen dipol protein pada
pH sewenang-wenang dan kondisi garam dijelaskan.
Metode ini dimaksudkan untuk memberikan data yang
dapat dibandingkan dengan hasil sementara percobaan
dichroism listrik pada solusi protein. Prosedur ini
diterapkan untuk 1 protein. Hal ini menunjukkan bahwa
Biophysical Journal Volume 69 October
memberikan parameter hidrodinamik dan listrik untuk
1995 1344-1345
protein dalam baik perjanjian dengan data eksperimen.

Bull. Chem. Soc. Ethiop. 2012, 26(2), 22723

Spesiasi kimia dari pasangan kompleks ion Co(II), Ni(II),


Cu(II) dengan L-histidine telah dipelajari pH nya secara
metris dalam rentang konsentrasi 0-60% v/v campuran air
DMSO dengan ionic yang dipelihara 0.16 M pada 303 K.
Konstanta dielektrik medium yang terdapat pada
campuran air-DMSO atau panjang jarak interaksi,
bertanggung jawab untuk jalannya stabilitas.

Obat merupakan salah satu kebutuhan yang digunakan


dalam upaya menunjang upaya peningkatan dan
pemeliharaan kesehatan masyarakat. Banyak bentuk
sedian farmasi yang beredar di masyarakat diantaranya
sediaan padat dan cair. Absorpsi sistemik suatu obat dari
tempat ekstravaskular dipengaruhi oleh sifat-sifat
fisikokimia produk obat. Untuk obat-obat yang mempunyai
kelarutan kecil dalam air, laju pelarutan seringkali
merupakan tahap yang paling lambat, oleh karena itu
mengakibatkan terjadinya efek penentu kecepatan
terhadap bioavailabilitas obat. kelarutan suatu senyawa
bergantung pada sifat fisika dan kimia zat terlarut dan
pelarut.Selain itu, juga bergantung pada faktor
temperatur,tekanan,pH,dan untuk jumlah yang kecilb
ergantung pada terbaginya zat terlarut.Salah satu sifat
fisika yang mempengaruhi kelarutan adalah konstanta
dielektrik pelarut. Konstanta dielektrik adalah suatu
besaran tanpa dimensi yang merupakan rasio antara
kapasitas elektrik medium (Cx) terhadap vakum
Perhitungan dari Transisi Dipole Moment dilakukan pada
Electronic Supplementary Material (ESI) for struktur optimal dari fluorophores. Akibatnya struktur akhir
Physical Chemistry Chemical Physics This menjadi planar dan dalam beberapa kasus sebagian
journal is The Owner Societies 2012
planar.
Struktur eksperimental yg dikenal biasanya tidak
sepenuhnya planar dan kadang-kadang menyimpang
signifikan dari bentuk planar , selanjutya akan dibahas
pengujian dampak geometri khususnyasimetri pada
transisi dipole moment yang dihasilkan

No

Nama
1 Nur Afifatullaily

Nrp
1110157

Email account
Judul paper
Pengarang
Jurnal, Tahun, Volume, issue, halaman
fifaapu@yahoo.co.i Probing the efficacy Lyndsey R. Powell, Biophysical Chemistry, Volume 160, Issue
d
of peptide-based
Kyle D. Dukes,
1, January 2012, Pages 12-19
inhibitors against
Robin K. Lammi
acid- and zincpromoted
oligomerization of
amyloid- peptide
via single-oligomer
spectroscopy

Deskripsi singkat
Salah satu jalan untuk pencegahan dan pengobatan penyakit Alzheimer
melibatkan menghambat agregasi amiloid -peptida (A). empat peptida
berbasis inhibitor fibrillogenesis dan / atau sitotoksisitas, menilai
kemampuan mereka untuk menghambat hubungan dalam oligomer
terkecil (n = 2-5). Inhibitor diuji pada pH asam dan di hadapan seng,
kondisi yang dapat meningkatkan oligomerisasi in vivo dengan
menggunakan single photon emission computed tomography (SPECT)
atau positron emission tomography (PET).

2 Zhidni Robbi R

1110160

Colloids and Surfaces A: Physicochemical


and Engineering Aspects , 1 March 1999,
Volume 148, Issues 12, Pages 95-106

Besar momen dipol protein globular lama dikenal secara eksperimental,


kurangnya sarana untuk membuktikan momen dipol menjadi
kelemahan utama penelitian momen dipol protein. Dengan munculnya
X-ray kristalografi protein globular, struktur protein kecil dikenal secara
rinci. Hal ini mensyaratkan upaya baru untuk menghitung momen dipol
protein menggunakan database.

3 Riyani Widiastuti

1110155

zidniearnez@yaho Computation of the


o.com
dipole moment of
protein molecules
using protein
databases.:
Bacteriophage T4
lysozyme and its
mutants
sha_luph_4ever@y Dipole Moment
ahoo.com
Enhancement in
Molecular Crystals
from X-ray
Diffraction Data

Mark A. Spackman ChemPhysChem, 8 October 2007, Volume


Prof., Parthapratim 8, Issues 14, Pages 2051-2063
Munshi Dr., Birger
Dittrich Dr.

4 Andri Utomo

1110075

penentuan eksperimental dikenal dan menggunakan database ini untuk


mengidentifikasi tren luas dalam peningkatan momen dipol tersirat oleh
pengukuran serta outlier perangkat tambahan yang diucapkan. Bukti
kuat muncul bahwa momen dipol molekul dari X-ray data difraksi dapat
memberikan banyak informasi tentang perubahan dalam distribusi
muatan molekul yang dihasilkan dari pembentukan kristal.
Adanya Interaksi protein protein dalam mengatur berbagai jalur selular
yang teramat penting sehingga dapat digunakan untuk interaksi obat
jadi dilakukan penemuan obat-obat baru.Sebuah analisis tentang
protein tunggal-sistem interaksi protein baru-baru ini berhasil dalam
penemuan obat seperti inhibitor.

5 Putri Wardhani

1110141

6 Dwi Rachmadhina D.

1110091

7 Inne Christine Yuhana

1110080

8 Cindy Marselim

1110086

Shiro Takashima

soul_eater04@yma Protein Based Drug Joshi B. , Gupta G.,


il.com
Discovery
Gupta N., Gupta
M., Trivedi S., Patil
P., Jhadav A.,
Vamsi K.K.,
Khairnar Y.,Boraste
A., Mujapara A.
pvt3putri@yahoo.c Intestinal
Beck JG,
J Am Chem Soc. 2012 Jul
o.id
permeability of
Chatterjee J, Laufer 25;134(29):12125-33. Epub 2012 Jul 12.
cyclic peptides:
B, Kiran MU, Frank
common key
AO, Neubauer S,
backbone motifs
Ovadia O,
identified
Greenberg S, Gilon
C, Hoffman A,
Kessler H.

dyn4_luph3@yaho The dipole moment Shiro Takashima


o.co.id
of membrane
proteins: potassium
channel protein and
-subunit

Kesamaan struktural Template


dengan struktur cyclo somatostatin analog secara orally bioavailable
(-Pro-Phe-NME-d-Trp-NME-Lys-Thr-NME-Phe-), dan kemiripan yang
mencolok dengan -turns dari
siklosporin peptida secara orally bioavailable A, menunjukkan bahwa
pengenalan urutan bioaktif pada
Caco-2 template
dapat menyebabkan calon obat dapat permeabel dan ampuh
mengatasi penyakit secara orally biovalable.

Biophysical Chemistry, Volume 94, Issue 3, Moment dipole protein saluran kalium dan -subunit, dihitung dengan
25 December 2001, Pages 209218
menggunakan X-ray data difraksi. Sebuah moment dipole besar
ditemukan untuk -subunit sementara moment dipole K-channel protein
ditemukan jauh lebih kecil dibandingkan dengan -subunit. Perhitungan
ini dilakukan sebagai studi pendahuluan dari penelitian yang
komprehensif tentang struktur dipole protein saluran dalam membran.
piggy_inne@yahoo High dielectric
John Robertson
Progress in Physics, 2006, volume 69,
The scaling transistor semikonduktor oksida logam komplementer telah
.com
constant gate
Issue 2 (Ferbruary 2006)
menyebabkan lapisan silikon dioksida, digunakan sebagai dielektrik
oxides for metal
gerbang, yang sangat tipis (1.4 nm) yang saat ini kebocoran terlalu
oxide Si transistors
besar. Hal ini diperlukan untuk menggantikan SiO2 dengan lapisan fisik
tebal oksida dielektrik tinggi konstan () atau 'tinggi K' gerbang oksida
seperti oksida hafnium dan hafnium silikat. Kedua oksida ini belum
diteliti secara luas seperti SiO2, dan mereka ditemukan memiliki sifat
rendah dibandingkan dengan SiO2, seperti kecenderungan untuk
mengkristal dan kepadatan tinggi cacat elektronik. Penelitian intensif
diperlukan untuk mengembangkan oksida setinggi bahan elektronik
berkualitas.
cindy_mrclm@yaho Dipole Moments of Dj. M. Petkovic, B. The Journal of Physical Chemistry, volume Momen dipol dari sejumlah ester netral asam fosfat ditentukan dalam no.com
some neutral
A. Kezele, D. R.
77, pp 922-924
heksana dan berkorelasi dengan persamaan Hammet. Momen dipol dari
organic phosphates Rajic
fosfat tributil ditentukan dalam beberapa pengencer dan digunakan
untuk mempelajari pengaruh pelarut dengan persamaan Muller. Nilai
momen dipol tributil fosfat dalam bentuk gas diperkirakan dan nilai yang
sama diperoleh dari persamaan Onsager menggunakan data dari fosfat
tributil murni.

9 Maria Elovita Herlina


Dewi

1110281

10 Ayu Soraya Arindira

1110297

11 ivonne natalia tanajaya

1110276

12 Kevin Kusuma Hadi

1110288

13 Febriati Mahdalena.S

1110184

14 Levina

1110181

15 Ika Purnama Sari

1110180

cao_shen2@yahoo Physical chemistry Dan W.Urry


.com
of biological free
energy transduction
as demonstrated by
elastic proteinbased polymers

J. Phys. Chem. B, 1997, 101 (51), pp


11007-11028

Polimer berbasis protein terdiri dari urutan peptida. Semua polimer


dengan keseimbangan yang benar dari gugus apolar dan kutub,
termasuk protein larut dalam air dan protein berbasis polimer. Suhu
dinaikkan diatas suhu kritis onset, atau yang disebut Tt. Nilai Tt
ditentukan oleh jumlah nilai hidrasi hidrofobik, hidrasi spesies kutub,
seperti yang diperlukan pada ionisasi. terjadi dengan mengorbankan
hidrasi hidrofobik dan meningkatkan Tt. Energi tersebut dibutuhkan
untuk hidrasi destruktur hidrofobik. Hasil dihidrofobik-diinduksi
perubahan pka.
soraya92a@yahoo. Discovery of a
Kleinert HD,
Science.1992 Sep 25;257 (5078) : 1940-3 Inhibitor renin peptidic telah buruk diserap di usus atau cepat
com
peptide-based
Rosenberg SH,
dihilangkan oleh hati dan telah dilaporkan memiliki bioavailabilitasnya
renin inhibitor with Baker WR, Stein
oral kurang dari 2%. Sebuah peptida berbasis renin inhibitor, A-72.517
oral bioavailability HH, Klinghofer V,
(massa molekul 706 dalton), telah dibuat yang memiliki ketersediaan
and efficacy.
Barlow J, Spina K,
hayati oral 8, 24, 32, dan 53% di monyet, tikus, musang, dan anjing,
Polakowski J,
masing-masing. Dosis yang berhubungan dengan penurunan tekanan
Kovar P, Cohen J,
darah, aktivitas plasma renin, dan plasma angiotensin II secara paralel
et al.
dengan konsentrasi obat dalam plasma meningkat diamati setelah
pemberian oral A-72.517 untuk sadar, garam-habis anjing. Dengan
demikian, peptida berbasis molekul massa molekul yang cukup besar
dapat diserap utuh ke dalam sirkulasi sistemik dari hewan. Temuan ini
mendukung potensi peptida berbasis obat untuk pemberian oral.
ivone_tan88@yaho Hydrogels in
N.A. Peppas a, P. European Journal of Pharmaceutics and
Ketersediaan berat molekul besar protein-dan peptida berbasis obat
o.com
pharmaceutical
Biopharmaceutics 50 (2000) 27- 46
karena kemajuan terbaru dalam eld biologi molekuler telah memberi
formulations
kita cara-cara baru untuk mengobati sejumlah penyakit. Hidrogel sintetis
menawarkan cara yang mungkin efektif dan nyaman untuk mengelola
suatu senyawa.
vinzkh@gmail.com A Quantitative
Diana Hjmark
The AAPS Journal, Vol. 12, No. 3,
Usus manusia proton-coupled peptida transporter, hPEPT1 (SLC15A1),
StructureActivity Omkvist,
September 2010
telah diidentifikasi sebagai transporter serap untuk kedua zat obat dan
Relationship for
Simon Birks
prodrugs. Pemahaman tentang prasyarat untuk transportasi sejauh ini
Translocation of
Larsen,
telah diperoleh dari model berdasarkan percobaan kompetisi. Model ini
Tripeptides
Carsten Uhd
memiliki nilai yang terbatas untuk memprediksi translokasi substrat
via the Human
Nielsen,
melalui hPEPT1. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui
Proton-Coupled
Bente Steffansen,
persyaratan untuk translokasi melalui hPEPT1. Satu set 55 tripeptides
Peptide
Lars Olsen,
dipilih dari analisis komponen utama berdasarkan deskriptor VolSurf
Transporter,
Flemming Steen
menggunakan desain statistik.
hPEPT1
Jrgensen,
(SLC15A1)
and Birger Brodin.
ena11sitepu@yaho Medicinal
Ivone Carvalho,*
Journal of Chemical Education Vol. 82 No. Artikel ini berfokus pada penggunaan komputasi kimia dan protein data
o.com
Chemistry and
urea D. L. Borges, 4 April 2005 www.JCE.DivCHED.org
bank (PDB) (3), untuk memahami dan memprediksi kimia dan dasar
Molecular
and Llian S. C.
molekul terlibat dalam obat-reseptor interaksi. Sebuah komprehensif
Modeling:An
Bernardes
studi struktur-aktivitas hubungan terdiri dari tiga pendekatan.
Integration To
Pendekatan pertama melibatkan analisis komparatif obat antimetabolit
Teach Drug
dan metabolit yang sesuai (Bernama substrat), dengan mewakili,
StructureActivity
visualisasi, dan melapiskan mereka3D struktur, diperoleh dengan
Relationshipand
proses minimisasi dan molekul-alignment teknik. Kedua, sifat numerik
the Molecular Basis
dari molekul ini kemudian dihitung, yang paling umum energi molekul
of Drug Action
menjadi dan konstanta fisik sebagai koefisien partisi, momen dipole,
molekul volume, dan jarak interatomik. Ketiga, khususnya struktural fitur
antara substrat dan antimetabolit dieksplorasi dengan menilai pola
elektrostatik dan geometris diperlukan untuk interaksi kimia dalam situs
aktif dari target molekul, yang diperoleh dari PDB.
Levina71@ymail.co Use of protein
Shiro Takashima
Biophysical Journal
Kita telah membahas perhitungan momen dipol protein dengan
m
database for the
Volume 64, Issues 5, May 1993, Pages
menggunakan tiga dimensi protein data-base. Kami mencatat kesulitan
computation of the
15501558
perhitungan protein yang lebih besar, khususnya yang terdiri dari
dipole moments of
beberapa subunit. Hemoglobin (Hb) adalah protein yang memiliki berat
normal and
molekul 64.000 yang terdiri dari empat subunit, kasus yang khas di
abnormal
mana perhitungan itu sulit ditemukan. Untuk menghindari kesulitan, kita
hemoglobins
menghitung momen dipol dari subunit masing-masing secara terpisah.
Momen dipol dari seluruh protein dihitung dengan penjumlahan vectorial
momen subunit.
ikaa_cassiopeia@y Rational drug
Soma Mandal ,
European Journal of Pharmacology 625
Pada artikel ini, pengetahuan desain obat saat ini ditinjau dan
ahoo.com
design
Mee'nal Moudgil , (2009) 90100
pendekatan desain obat rasional disajikan.Proses pengembangan obat
Sanat K. Mandal
yang menantang, mahal, dan memakan waktu, meskipun proses ini
telah dipercepat karena perkembangan alat komputasi dan metodologi.

16 zaqia mirza anazhil

1110182

qiqimirza@ymail.co DIPOLE MOMENT PATRICK MAUREL Biophysical Journal, Volume 11, Issue 6,
m
OF
and LAURO
550-557, 1 June 1971
ACETYLCHOLINE GALZIGNA
AND ITS
RELEVANCE
TOTHE
CHEMICAL
SYNAPTIC
TRANSMISSION

17 merry enike

1110275

18 Kristina Eni Trisnowati

1110153

merryenike@ymail. THE INFLUENCE


com
OF DIPOLE
MOMENT
FLUCTUATIONS
ON THE
DIELECTRIC
INCREMENT OF
PROTEINS IN
SOLUTION
bintanglangit05@y Fast gradien HPLC
ahoo.com
method to
determine
compounds binding
to human serum
albumin.
Relationship with
octanol/water and
immobilized
artificial membrane
lipophilicity.

JOHN G.
KIRKWOOD AND
JOHN B.
SHUMAKERt

Valko K, Nunhuck
S, Bevan C,
Abraham MH,
Reynolds DP

The dipole moment of acetylcholine (AcCh) has been measured


inchloroform and a value of 8.49 D was obtained. Such a value actually
representsthe total dipole moment of the ion pair (AcCh)+(Cl)-. The
dipole moment of the(AcCh)+ cation alone turned out to be 2.65 D
whereas its theoretical value obtainedafter a vectorial calculation was
1.65 D. The discrepancy was related to aninteraction between AcCh and
the solvent. The meaning of the measured value isdiscussed on the
basis of a recent theory of chemical synaptic transmission basedon the
assumption of a much higher dipole moment value for the AcCh
molecule.
Proceedings of the National Academy of
Proteins in solution are known to produce' remarkably large
Sciences of the United States of
incrementsin the dielectric constant of water. These increments have
America,Vol. 38, No. 10 (Oct. 15, 1952), pp. been conventionallyattributed to large permanent molecular electric
855-862
dipole moments,which are partially oriented by an external electric field.
Analternative mechanism of dielectric polarization of macromolecules
containinga large number of loosely bound ions, for example, protons,
isprovided by the migration of the small ions within the molecule under
theaction of the external field.
J Pharm Sci, 2003 Nov; 92(11):2236-48

Metode fast gradien HPLC telah dikembangkan untuk menentukan


ikatan Human Serum Albumin (HSA) dengan menggunakan fase
stasioner protein yang terikat. Metode ini divalidasi dengan data ikatan
protein plasma dari 68 molekul obat yang diketahui.

No5

Name

NRP

Email account

TITLE

On-resin N-methylation
of cyclic peptides for
discovery of orally
1 Erlina Tutut Megawati 1110277
bioavailable scaffolds
Determination of
membrane protein
structure by rotational
resonance NMR:
2 Wirda Anggraini
1110294 Wirda_face@yahoo.com bacreriorhodopsin
Structure of larger
proteins in solution:
three- and fourdimensional
heteronuclear NMR
3 Lisma Dita F
1110282 Lisma_dita@yahoo.com spectroscopy

4 Novelin Belina Gosal

5 Nur Hayati

Vania Malinda
6 Santoso

Author (s)

...(National
Institutes of
Healt)

Creuzet F et
all

Journl, year, Volume,


issu, page

Deskripsi singkat

On-resin N-metilasi peptida siklik menghasilkan druglike membrane permeability dan bioavailabilitas oral.
Selektivitas dan derajat N-metilasi dari peptida siklik
Nat Chem Biol. 2011 ditentukan oleh stereokimia backbone, selektif pada
September 25; 7(11): resin-N-metilasi khususnya penggunaan rendah
810817.doi:
dielektrik pelarut (THF) pada langkah deprotonasi,
10.1038/nchembio.664 cenderung membentuk produk sangat permeabel.
NMR (Nuclear Magnetic Resonance) untuk mengukur
jarak internuclear berputar seperti dalam padatan.
Science, 1991 february Selain itu juga digunakan untuk menentukan jarak
15. Vol 251 no 4995
antara C-8 dan C-18 karbon dalam dua senyawa dan
pp. 783-786
dalam membran protein bacteriorhodopsin.

NMR sebagai metode digunakan untuk menentukan


struktur tiga dimensi dari protein dalam larutan di luar
Science, 1991 june 7. batas konvensional NMR dua dimensi (sekitar 100
Clore GM et
Vol 252no 5011 pp.
residu) dengan molekul di 150 untuk 300 kisaran
all
1390-1399
residu.
Empat 1-ns molekul simulasi komputer dinamika
tuftsin, Thr-Lys-Pro-Arg, telah dianalisis dimana terdiri
dari (1) cis tuftsin di air (2) trans tuftsin dalam air, (3)
cis tuftsin dalam 1 M NaCl, dan (4)trans tuftsin dalam
1 M NaCl. Selain itu, terpisah dari garam konsentrasi,
konfomer trans memiliki dielektrik konstan lebih tinggi
daripada konfomer cis karena bentuk tersebut
menunjukkan distribusi muatan dalam ruang yang
lebih luas. Kemudian, terpisah dari konformasi
peptida, adanya garam dapat mengurangi dielektrik
Liqui Yang,
konstan dari kedua peptida dan molekul air terlarut,
Claudia V.
karena ion-ionnya, dalam keadaan terikat, membatasi
Valdeavella,
gerak atom lainnya. Lalu berbeda dengan konstanta
Herb D. Blatt,
dielektrik, baik konformasi peptida maupun
Salt effects on peptide and B.
Biophysical Journal.
konsentrasi garam menunjukan pengaruh yang
conformers: a dielectric Montgomery 1996 December; 71(6): signifikan terhadap waktu relaksasi dielektrik molekul
1110003 novelinbelina@ymail.com study of tuftsin.
Pettitt
30223029.
air.
Momen dipol listrik protein kecil dihitung dengan
menggunakan NMR serta X-ray databases dan
dibandingkan dengan hasil eksperimen. Momen dipol
molekul protein terdiri dari momen dipol muatan
permukaan dan inti momen dipol karena rantai
Electric dipole moments
samping polar. Perhitungan momen dipol muatan
of globular proteins :
permukaan terdiri dari dua langkah yaitu perhitungan
measurement and
Journal of NonpK bergeser dari gugus polar dan perhitungan momen
calculation with NMR
Takashima
Crystalline Solid. 2002. dipol menggunakan PKS konpensasi untuk
1110283
and X-ray databases
Shiro
303-310
pergeseran elektrostatik.
The importance of
Menggunakan molecular modeling untuk menentukan
electrostatic charge and
konformasi larutan peptida kecil (2-6 residu), yang
dielectric constant in
Neil J.
Journal of Molecular
merupakan substrat untuk kedua transporter peptida
conformational analysis Marshall and Modeling, 2001,
dan peptidase, dan dapat secara klinis penting
of biologically active
John W.
Volume 7, Number 5, sebagai dasar dari agen berbagai terapi, termasuk B1110006 pink21v@hotmail.com
dipeptides.
Payne
112-119
laktam dan ACE inhibitor.

Dalam penelitian ini diberitahukan efek dari glikosiladi


peptida pada stabilitas metabolik, BBB transportasi,
dan analgesia. Glikosilasi Ser (6) dari peptida
The Journal of
menyebabkan peningkatan yang signifikan dalam
Pharmacology and
enzimatik stabilitas di kedua serum dan otak.Pada
Experimental
analgesia menunjukkan bahwa peningkatan secara
Therapheutic.
signifikan setelah diberikan secara intravena.
December,1 2001. vol Bioavailabilitas dapat ditingkatkan dengan
299 no.3. 967-972.
meningkatkan stabilitas dan transportasi ke otak.
Serangkaian gliseril monoolein / sistem air gel yang
mengandung air telah diteliti menggunakan dua teknik
pelengkap, reologi berosilasi dan analisis dielektrik,
untuk menyelidiki pengaruh masuknya peptida model,
A siklosporin, pada sifat-sifat gel.Kedua reologi dan
spektroskopi dielektrik mampu mengidentifikasi
perubahan struktural dalam sistem dianalisis,
Journal of
Penyelidikan telah menunjukkan bahwa rheologi dan
Pharmaceutical
dielektrik pengukuran menghasilkan informasi yang
SciencesVolume 94, berbeda namun saling melengkapi dan bahwa
Issue 11, pages
dimasukkannya peptida model yang dapat mengubah
24522462, November sifat-sifat gel, sejauh mana efek tergantung pada
2005
komposisi fase sistem

Improved Blood-Brain
Barrier Penetration and
Enhanced Analgesia of
theresia_nofie@yahoo.co an Opioid Peptide by
1110043 m
Glycosylation

R. D. Egleton,
S. A. Mitchell,
J. D. Huber,
M. M. Palian,
R. Polt and T.
P. Davis

9 Erni Mei Kristina

Rheological and
dielectric
characterization of
monoolein/water
mesophases in the
feberiana.1110011@gma presence of a peptide
1110011 il.com
drug
Dielectric study of the
molecular mobility and
the isothermal
crystallization kinetics
of an amorphous
pharmaceutical drug
1110045 ernimei@rocketmail.com substance

Bonacucina,
G., Palmieri,
G. F. and
Craig, D. Q.M.
Alie J,
Menegotto J,
Cardon P,
Duplaa H,
Caron A,
Lacabanne C,
Bauer M.

10 Fonnyza Mezque

The electric dipole


moment of DNAbinding HU protein
sakura_in_spring@yahoo calculated by the use of
1110328 .com
NMR database

Shiro
Takashima,
Kiwamu
Yamaoka.

Biophysical Chemistry,
Volume 80, Issue 3, 30
August 1999, Pages
153163

Joshi B, Gupta
G, Trivedi S,
Patil P,
Jhadav A,
Vamsi KK,
Khairnar Y,
Boraste A,
Mujapara A.

International Journal of
Drug Discovery, ISSN:
0975-4423, Volume 1,
Issue 2, 2009, pp-4051

7 Nofie Kusumawati S

8 Feberiana

Protein Based Drug


Discovery

Journal of
Pharmaceutical
Science, 2004, Vol 93,
Issue 1, 218-233

11 Meiliana Shoetanto

1110112 mei_c43m@yahoo.co.id

12 Lita Mevinda

Gerald Lo
Calculation of the
ffler, Hellfried
dielectric properties of a Schreiber and J.Mol.Biol, 1997,
protein and its solvent: Othmar
Volume 270, Pages
1110015 lita.mevinda@yahoo.com Theory and case study Steinhauser
520-534

Proses pertumbuhan kristal dari obat RSK tampaknya


dikendalikan oleh gerakan intramolekul melibatkan
beta modus-relaksasi dan bukan oleh gerakan molekul
yang bertanggung jawab untuk alpha modus-relaksasi
pada kisaran suhu > temperatur transisi gelas.
Momen dipol protein HU homodimer diukur
menggunakan database NMR protein.Database NMR
protein HU dari Bacillus stearothermophilus terdiri dari
25 model, maka muatan permukaan maupun momen
dipol inti dihitung untuk masing-masing struktur. Hasil
perhitungan tersebut menunjukkan bahwa momen
dipol bersih permanen protein HU homodimer adalah
sekitar 500-530 D (1 D = 3,33 10-30 Cm) pada pH
7,5 dan 600-630 D pada titik isoelektrik (pH 10,5). Ini
momen dipol permanen yang luar biasa besar untuk
protein kecil dari ukuran 19,5 kDa.
G protein-coupled reseptor adalah salah satu obat
yang paling penting. Nanoteknologi berbasis sistem
pengiriman obat telah melihat popularitas terakhir fisik
yang menguntungkan mereka, kimia, dan biologi, dan
besar upaya telah dilakukan untuk menargetkan
nanoDDSs untuk spesifik reseptor seluler. Protein
interaksi mengatur berbagai jalur seluler yang penting,
dan oleh karena itu mewakili kelas padat penduduk
target untuk penemuan obat. Analisis individu proteinprotein interaksi sistem baru ini menghasilkan dalm
penemuan obat seperti inhibitor.
Perhitungan dari frekuensi yang bergantung pada sifat
dielektrik dari masing-masing komponen sistem
protein / air / ion dengan tujuan perbandingan yang
memungkinkan untuk menentukan sifat dielektrik.
Peptida ditemukan memiliki perilaku dielektrik
relaksasi rumit, dengan statis konstan 15 dielektrik.

1110044 vonn.yinz@yahoo.com

Protein-Based
Nanomedicine
Platforms for Drug
Delivery

Aihui MaHam,
Zhiwen Tang,
Hong Wu, Jun
Wang, Yuehe
Lin*

14 Arsyan Dharmaguna

1110035 arz820@gmail.com

Dielectric properties of
soybean protein isolate
dispersions as a
function of
concentration,
temperature and pH

Jasim Ahmed,
H.S.
Ramaswamy, Small Volume 5, Issue
G.S.V.
15, pages 17061721,
Raghavan
August 3, 2009

15 Vivian Irmasari

Tubulin dipole moment,


dielectric constant and
quantum behavior:
computer simulations,
louffli_vhang@yahoo.co.i experimental results
1110037 d
and suggestions.

13 Ivon Sindu Wijaya

A.Mershin,
A.A.
Kolomenski,
H.A.
Schuessler,
D.V.
Nanopoulos

Materials Science and


Engineering: R:
Reports, Volume 62,
Issue 4, 1 September
2008, Pages 125-155

Elsevier, Biosystems
Volume 77, Issues
13, November 2004,
Pages 7385

Platform nano berbasis protein untuk pengiriman obat


alami terdiri dari subunit protein rakitan dari protein
yang sama atau kombinasi dari protein yang
membentuk sistem yang lengkap. Semuanya ideal
untuk obat-delivery platform
karena biokompatibilitas dan biodegradabilitas
ditambah dengan toksisitas rendah. Berbagai protein
telah digunakan untuk obat-delivery sistem, termasuk
protein feritin / apoferritin, tanaman yang diambil dari
capsids virus,protein
albumin, kedelai dan whey, kolagen, dan gelatin. Ada
berbagai perbedaan jenis dan bentuk yang telah siap
untuk menghantarkan molekul obat menggunakan
protein yang berbasis platform, termasuk berbagai
macam ruang lingkup protein, mikrosfer, nano
partikel, hidrogel, film, minirods, dan minipellets.
Ukuran yang seragam, multifungsi, dan
biodegradabilitas mendorong protein ini menjadi
penghantar obat terdepan. Perkembangan strategi
akhir akhir ini tentang penghantaran obat didiskusikan
dengan penekanan terhadap basis polimer, terutama
basis protein, nano medicine platform untuk
penghantar obat.
Sifat dielektrik dispersi "commercial soy protein isolate
(SPI)" diukur dalam rentang frekuensi 200-2.500 MHz
dengan metode "open-ended coaxial probe method"
menggunakan jaringan analyzer sebagai fungsi
konsentrasi (5, 10 dan 15 g/100 g air ), suhu (20-90
C) dan pH (4,5, 6,6 dan 10). Hasil penelitian
menunjukkan bahwa konstanta dielektrik ( ') menurun
dengan suhu (kecuali pada suhu 90 C) dan
frekuensi, namun meningkat dengan konsentrasi.
Perubahan perilaku asosiasi / disosiasi dispersi SPI
karena tarik elektrostatik / tolakan antara molekul
protein pada pemanasan sebagai fungsi dari pH
diasumsikan sebagai penyebab peningkatan yang
signifikan pada parameter dielektrik.
Kami menggunakan simulasi komputer untuk
mengukur momen dipol elektrikmonomer dan dimer
tubulin dan dan menemukan |p|=552D,
|p|=1193D and |p|=1740D. Independent surface
plasmon resonance (SPR) dan pengukuran
refaktomeri dielektrik konstan yang berfrekuensi tinggi
dan polarisitas kuat dikolaborasi dengan SPR kami
sebelumnya yang memberikan hasil n/c ~1.800x103 ml/mg. Indeks refraktif dari tubulin diukur ntub ~2.90
dan dielektrik konstan tubulin frekuensi tinggi saat
frekuansi polarisitasnya mencapai tub ~ 2.1x 10-33 C
m2/V. Metode untuk penentuan eksperimen p
frekuensi rendah sama dengan metode untuk menguji
conjectured quantum coherence kebanyakan dan
penentuan sifat tubulin.

16 Jessica Fellicia N.T

computer simulations,
jessica_lovetofu@yahoo. experimental results
1110002 com
and suggestions.

Water structuredependent charge


transport in proteins
(protons/electrons/char
17 Minati Dwi Priastiputri 1110215 minati_putri@yahoo.com ge transfer/dielectric)
influence of vehicle
dielectric properties on
acetaminophen
bioavailability from
jessicayunuspanga@gma polyethylene glycol
18 Angelina S Jessica H 1110026 il.com
suppositories

19 Dian Permata Sari

Approaches to improve
the solubility and
bioavailability of poorly
soluble drugs and
different parameter to
1110017 dian.xoxo93@yahoo.com screen them

20 Yessica Valensia

Effect of N-1 and N-2


Residues on Peptide
Deamidation Rate in
yessica.valensia.93@gm Solution and Solid
1110007 ail.com
State

Aspek karakteristik konstanta dielektrik dari terkonjugasi senyawa yang dijelaskan oleh struktur
hubungan properti studi kuantitatif (QSPR).Konstanta
dielektrik diprediksi diperoleh model terbaik sangat
berkorelasi dengan nilai-nilai eksperimental (koefisien
korelasi kuadrat R (2) dari 0,93 dan 0,97 untuk set
pelatihan dan uji, masing-masing), sementara model
sebelumnya prediksi untuk molekul organik umum,
tidak berlaku untuk dikumpulkan kami -terkonjugasi
Areum Lee,
senyawa organik.Telah diketahui bahwa konstanta
Daejin Kim,
dielektrik dari bahan organik yang sangat dipengaruhi
Kyung-Hyun
oleh korelasi orientational molekul konstituen. Secara
Kim, Seungumum, ikatan hidrogen adalah salah satu interaksi
Hoon Choi,
Journal of molecular
antarmolekul yang paling penting yang mempengaruhi
Kihang Choi, modeling. 04/2011;
korelasi orientational. Dalam kasus- terkonjugasi
Dong Hyun
18(1):251-6. 2.34
senyawa, bagaimanapun, - interaksi bisa menjadi
Jung
Impact Factor
lain interaksi sebanding dengan ikatan hidrogen
Dielektrik dan konduktivitas pengukuran dilaporkan
untuk serum albumin bovine sebagai fungsi hidrasi.
Bukti kuat yang ditemukan adanya tuduhan seluler
yang pendek dan panjang rentang melompat motin
PETER R.C,
sangat tergantung pada fisik keadaan air protein yg
GASCOYNE ,
terikat. keadaan ini memepertimbangkan menjadi
RONALD
Proc
proton. Wawasan ke dalam sifat sifat listrik dari
PETHIG* ,
NatL.Acad.Sd.USA
kompleks protein metil glioksal disediakan dan
AND ALBERT Vol.78, No.1, pp .261- kemungkinan gerakan elektron proton berkorelasi
SZENT265,January 1981
diuraikan.
GYORGYI
Biophysics
journal of
Shrikant N.
Pharmaceutical
Pagay,
Sciences
Rolland I.
Volume 63, Issue 1,
Poust*, John pages 4447, January
L. Colaizzi
1974
Neha,
Chaudhary
Neha et al., Novel
Preeti,
Science International
Khokhar Atin, Journal of
Patial Rajan, Pharmaceutical
Mehra
Science (2012),
Ravinder
1(4):171-182 Translam
Kumar, Mallik Institute of
Santanu,
Pharmaceutical
Kumar
Education and
Pardeep, Ali, Research, Meerut,
Munsab,
Received 30 May
Ahmad
2012; accepted 11 Jun
Shamim
2012
Stabilitas kondisi padat (solid-state) dari asparagine
(Asn) yang mengandung peptida/protein tidak dapat
Bei Li ,
dengan mudah diprediksi dari stabilitas solusinya.
Richard L.
Posisi residu di N-1 dan N-2 secara signifikan dapat
Schowen,
mempengaruhi tingkat deamidasi dari Asn dalam
Elizabeth M.
keadaan padat, walaupun residu memiliki efek minimal
Topp, and
The AAPS Journal,
dalam larutan. Peningkatan volume dan hidrofobisitas
Ronald T.
2006 vol. 8, issue 1, p. residu di N-1 dan N-2 posisi menurunkan laju
Borchardt
E166 - E173
deamidasi dalam keadaan padat.

Enhancement of
solubilization and
bioavailabilityof poorly
soluble drugs by
physical and chemical
modifications: A recent
review

21 Anis Watul K.

1110170 nesya.chan@gmail.com

Agri Tyas
22 Kusumadewi

Pharmaceutical
Applications of
Cyclodextrins. 1. Drug
tyaz_laswha_b02@yahoo Solubilization and
1110159 .co.id
Stabilization

A Method to Determine
Dielectric Constants in
Nonhomogeneous
Systems: Application to
Biological Membranes

23 Amatul Fitria

1110152 aaa_fitria@yahoo.com

24 Yenny Sutrino

Dielectric Relaxation
Studies of 1:1
complexes of Alkyl
Methacrylate with
1110038 yenny_1993@yahoo.com Phenols Derivatives

25 Selly Apriyanti

Anisotropic solvent
model of the lipid
bilayer. 2. Energetics of
insertion of small
molecules, peptides
sellyapriyanti906@ymail. and proteins in
1110227 com
membranes

Amit
Chaudhary*,
Upendra
Journal of Advanced
Nagaich, Neha Pharmacy Education &
Gulati, V. K.
Research 2 (1) 32-67
Sharma, R. L. (2012) ISSN 2249Khosa
3379

Untuk meningkatkan kelarutan dan bioavailabilitas


buruk larut obat dengan menggunakan berbagai
pendekatan seperti fisika, kimia dan modifikasi atau
teknik lain. kelarutan zat terlarut adalah jumlah
maksimum zat terlarut yang dapat larut dalam jumlah
pelarut tertentu atau kuantitas solusi pada temperatur
tertentu.
Siklodektrin adalah oligosakarida siklik yan telah
diakui berguna sebagai eksipien farmasi. Struktur
molekul derivat glukosa ini, dipotong kerucut atau
torus, menghasilkan permukaan eksterior hidrofilik dan
nonpolar yang rongga interior. Dengan demikian,
siklodekstrin dapat berinteraksi tepat ukuran molekul
Journal of
untuk menghasilkan pembentukan kompleks inklusi.
Thorsteinn
Pharmaceutical
Kompleks non kovalen menawarkan berbagai
Loftsson*x and Sciences October
keuntungan fisikokimia obat yang tidak termanipulasi
Marcus E.
1996 Volume 85,
termasuk peningkatan kelarutan air dan stabilitas
Brewster
Number 10
solusi.
Continuum model elektrostatik kuantitatif menjelaskan
fenomena elektrostatik-dimediasi pada skala atomistik.
Metode untuk menentukan profil dielektrik posisi
tergantung dari simulasi dinamika molekul. Dalam
metode ini, energi bebas mentransfer ion dari air bulk
ke lapisan ganda lipid dihitung dari simulasi atomistik
menunjukkan bahwa kesalahan besar yang
diperkenalkan ketika bilayer diwakili sebagai satu
lempengan dielektrik rendah tertanam dalam tinggidielektrik pelarut. Peningkatan signifikan lapisan
Hugh
tambahan intermediate dielektrik (sekitar 3) di setiap
Nymeyer and Biophysical Journal
sisi inti dielektrik rendah membentang dari 12A-18A.
Huan-Xiang
Volume 94 February
Sebuah dip kecil ditransfer energi bebas di luar lipid
Zhou
2008 1185-1193
menunjukkan adanya dielektrik sangat tinggi.
Penyerapan dielektrik studi mempelajari H-terikat
kompleks metil metakrilat (MMA) dan butil metakrilat
(BMA) dengan p-kresol, p-chlorophenol, 2,4dichlorophenol dan p-bromophenol telah mempelajari
pada frekuensi microwave 9,37 GHz kuat dari karbon
tetraklorida 308 k. Dimana parameter dielektrik yang
berbeda seperti konstanta dielektrik dan dielektrik
kerugian pada frekuensi microwave, statis konstanta
eo dan konstanta dielektrik pada frekuensi optik telah
ditentukan. Validitas satu frekuensi persamaan Higasi
et al. untuk beberapa waktu relaksasi T(1) ditemukan
F. Liakath Ali
untuk menjadi fungsi hidrogen ikatan kekuatan fenolik
Khan, J.
Rasayan Journal
hidrogen, sedangkan grup rotasi waktu relaksasi
Asghar, and
Chemistry Volume 3
T(2)adalah fungsi dari interaksi sterik proton donor.
M. Aravinthraj No 4(2010), 766-771 Waktu relaksasi maksimum pada 50: 50 mol % rasio.
Lipid bilayer direpresentasikan sebagai lingkungan
anisotropik cairan digambarkan oleh profil dari
konstanta dielektrik (), parameter dipolarity
J Chem Inf Model.
solvatochromic (* ), dan hidrogen keasaman ikatan
2011 April 25; 51(4):
dan parameter kebasaan ( dan ). Metode ini diuji
930946. Published
pada perhitungan energi mengikat dan posisi istimewa
National
online 2011 March 25. dalam membran untuk usaha kecil-molekul, peptida
Institute of
doi:
dan protein membran perifer yang telah dipelajari
Health
10.1021/ci200020k
eksperimen.

Determination of the
dipole moments of
RNAse SA wild type
and a basic mutant

26 Yulianita Widjaja

1110025 cm_yoelie@yahoo.com

27 Dea Amelia A W

Binding Studies of
Lamotrigine with Sera
deamelia_aw@yahoo.co.i of Different Animal
1110028 d
Species

28 Yuliana

29 Yessica Christina W

30 tifany lai

Chari R, Singh
SN, Yadav S,
Brems DN,
Kalonia DS

Kalyan Kumar
Sen,Sanat
Kumar Basu
and Sadhan
Kumar Dutta

Frank C.
Lanfermeijer1,
2, Frank J.M.
Detmers1, Wil
N. Konings1
and Bert
Poolman1,3

1110304 yulia.0207@yahoo.com

On the binding
mechanism of the
peptide receptor of the
oligopeptide transport
system of Lactococcus
lactis

1110001 yess.chik@gmail.com

Amit Goyal ,
Molecular dynamics
Kannan Muthu
simulation of the
, Manivel
Staphylococcus aureus Panneerselva
YsxC protein: molecular m , Anil Kumar
insights into ribosome Pole and
assembly and allosteric Krishna
inhibition of the protein Ramadas

fannylai1993@yahoo.co
1110146 m

Guangwen
Hea, , , Martin
Comparison of
W.
dielectricconstant meter Hermantoa,
with turbidity meter and Martin
focused beam
Tjahjonoa, Pui
reflectance
Shan Chowa,
measurement for
Reginald B.H.
metastable zone width Tana, b, Marc
determination
Garlanda

Efek asam untuk mutasi titik residu dasar (5K) pada


momen dipol dari RNAse SA pada pH yang berbeda.
Momen dipol ditentukan dengan mengukur kapasitansi
solusi dari wild type (WT) dan 5K mutan dengan
analyzer impedansi. Momen dipol kemudian
dibandingkan dengan momen dipol yang dihitung
Proteins. 2012
secara teoritis, dan dianalisis untuk menentukan efek
Apr;80(4):1041-52. doi: dari mutasi titik, dan juga dianalisis untuk kontribusi
10.1002/prot.24006.
mereka terhadap keseluruhan protein-protein interaksi
Epub 2011 Dec 28
(PPI) dalam larutan secara kuantitatif.
Tujuan: Karakteristik serum protein-mengikat
lamotrigin dengan sera dari berbagai spesies
(kuda,tikus, kelinci dan kambing) yang mempelajari
dielectric constant dan suhu yang berbeda. Dengan
cara mengevaluasi efek dielectric constant pada
Tropical Journal of
afinitas mengikat, dan mementukan pengaruh variasi
Pharmaceutical
spesies pada interaksi obat protein plasma.Melalui
Research, October
evaluasi tersebut diperoleh bahwa jika binding contant
2009;8(5): 409-415
menurun maka dielectric constant meningkat
Lactococcus lactis degrades exogenous proteins such
as -casein to peptides of 430 amino acids, and uses
these as nitrogen sources. The binding protein or
receptor (OppALl) of the oligopeptide transport system
(Opp) of L.lactis has the unique capacity to bind
peptides from five up to at least 20 residues. To study
the binding mechanism of OppALl, nonameric
peptides were used in which the cysteine at position 1,
3, 4, 5, 6, 7 or 9 was selectively labeled with either
bulky and non-fluorescent or bulky and fluorescent
groups. Also, nonameric peptides with a non-natural
residue, azatryptophan, at positions 3 or 7 were used.
The peptide binding mechanism of OppALl is
The EMBO Journal
discussed in relation to known three-dimensional
(2000) 19, 3649 structures of members of this class of proteins, and an
3656doi:10.1093/embo adaptation of the general binding mechanism is
j/19.14.3649
proposed.
YsxC dari Staphylococcus aureus adalah anggota dari
keluarga protein GTPase, dan terlibat dalam perakitan
ribosom dan stabilitas mikroorganisme ini melalui
interaksinya dengan L17, S2 dan protein ribosomal
S10. Penghambatan interaksi dengan L17, S2, S10
dan subunit 'polimerase RNA mempengaruhi
Journal of Molecular
perakitan ribosom, yang dapat mempengaruhi
Modeling , 2011 ,
pertumbuhan mikroorganisme. Hal ini membuat YsxC
Volume 17, Number 12 target baru untuk desain inhibitor untuk mengobati
, Pages 3129-3149
penyakit yang disebabkan oleh S. aureus.
Karya ini menunjukkan proses rinci analisis teknologi
(PAT) perbandingan studi pengukuran konstanta
dielektrik dengan pengukuran kekeruhan dan balok
pengukuran reflektansi terfokus (FBRM) dalam
mendeteksi transisi fase selama kristalisasi dari tiga
solusi model, yaitu asam stearat-etil asetat, etanol dan
Chemical Engineering parasetamol-karbamazepin-metanol. Penelitian ini
Research and Design, membuka peluang baru untuk penggunaan meteran
Volume 90, Issue 2,
konstanta dielektrik sebagai alat PAT sederhana dan
February 2012, Pages murah alternatif untuk pemantauan proses kristalisasi
259-265
solusi.

31 Cindy tiara

Yuliana P.S.

biochemical
engineering nerve
conduits using peptide
1110233 cindyrexsy09@ymail.com amphiphiles

aaron tan,
jayakumar
rajadas,
alexander m.
seifalian

RELATION OF
ELECTRONIC
STRUCTURES WITH
THEIR ANTIMALARIAL
ACTIVITIES ON
Ria
ARTEMISININ
Armunanto,
1110162 yulianaps28@gmail.com DERIVATIVES
Sri Sudiono

penggunaan
saluran saraf bioartificial sebagai alternatif untuk
cangkok saraf autologous.
Ini termasuk bahan sintetis dan buatan, yang dapat
diproduksi menjadi saluran
saraf menggunakan teknik terinspirasi oleh
nanoteknologi. Bukti terbaru
journal of conrolled
menunjukkan bahwa amphiphiles peptida (PA) adalah
release volume 62,
kandidat yang menjanjikan
issue 3, 28 september untuk digunakan sebagai bahan untuk saluran saraf
2012, pages 621-623 bioteknologi.
Hubungan struktur elektronik dengan kegiatan anti
malaria mereka atas derivatif artemisinin adalah
dievaluasi melalui kegiatan struktur hubungan metode
kuantitatif (QSAR). Untuk menggambarkan elektronik
struktur, biaya atom dan momen dipol dihitung dengan
mekanika kuantum pada PM3 semiempirical
tingkat. Sebuah hubungan linear antara aktivitas dan
struktur elektronik digunakan untuk membangun
persamaan linier
model. Sebuah model persamaan statistik
menunjukkan kriteria baik dan realibility aktivitas
antimalaria adalah
dipilih untuk digunakan untuk merancang suatu
senyawa dengan kegiatan baru melawan P.
facilparum. Hasil penelitian menunjukkan bahwa 13
model persamaan yang diperoleh, hanya
menampilkan tiga model dengan kriteria baik. O2 dan
Indonesian Journal of C4 atom yang
Chemistry, 2004, 4 (3), diamati untuk peran kunci dari peningkatan aktivitas
212 - 217
antimalaria.

No

Name

Nrp

Email account

1 Wijaya Kartanegara

1110097 Wijaya_kartanegara@yahoo.com

2 Yuni Megawati

1110119 yuniekitty@yahoo.com

3 Ama Yosina Tubulau

1110178 mhe_oshin@yahoo.com

4 Astridia Zahrina Tiffany 1110106 fanny.minoz@yahoo.co.id

5 Amelia Susetyo

1110098 truliamaze@yahoo.com

Patricia Valiana
6 Senduk

1110100 patriciavaliana@ymail.com

7 Eva Ratna Dewi

1110117 evo.hzu@gmail.com

8 Christvin Hotama

1110140 christvin_hotama@hotmail.com

Fanny Aristia
9 Kurniawan

1110109 fannyaristia@yahoo.com

10 Budi Suwongso Wong 1110115 Budiwong56@yahoo.co.id


11 Ajeng Anggoro Putri

1110105 ajengx5_03@yahoo.com

Kinia Tirta Ayu


12 Nugraini

1110342 Kiniatirtaayu@yahoo.co.id

Valentina Sintya
13 Hunandar

1110085 xin_starrynight@yahoo.com

14 Vani Oktavia Sugiharto 1110118 vani.oktavia@yahoo.com

Title

Author (s)

Journl, year, Volume, issu, page

Deskripsi singkat
Pengetahuan struktur tiga dimensi protein merupakan salah satu
dasar dari desain protein dan rekayasa protein. Spektroskopi
resonansi magnetik nuklir baru-baru ini diperkenalkan sebagai
metode kedua untuk penentuan struktur protein, selain teknik
difraksi kristal protein tunggal. Pendekatan baru ini memungkinkan
seseorang untuk melaksanakan studi struktural rinci protein dalam
larutan dan bentuk non-kristalin lainnya, yang mungkin mirip atau
identik dengan lingkungan fisiologis, dan menjanjikan wawasan
Protein Structure Determination in Solution by
Science; Jan 6, 1989; Vol. 243, Issue
baru ke dalam dinamika molekul protein dan masalah proteinNuclear Magnetic Resonance Spectroscopy
Wuthrich, Kurt
4887; Academic Research Library, p. 45 folding
Ground Radar Penetrasi (GPR) telah mendapatkan popularitas
dalam beberapa tahun terakhir karena kecepatan dan kemudahan
penggunaan. Dua kegunaan utamanya adalah anomali deteksi
dan elektromagnetik (EM) penentuan kecepatan dari bawah
Dielectric constant determination using
permukaan yang dangkal. Analisa kecepatan terbatas pada survei
ground- penetrating radar reflection
Geophysics ,May 21, 1999; Vol 43, Issue titik tengah umum (CMP), yang memberikan struktur kecepatan di
coefficients
Philip M Reppert , F Dale Morgan, M Nafi Toksoz
2000; Elsevier 189-197
atas reflektor di satu lokasi.
Sifat dielektrik dari protein ini masih kurang dipahami. Ini
membatasi akurasi metode penghitungan struktur berbasis energi
elektrostatik dan nilai-nilai pKa. Nilai-nilai ini secara substansial
lebih tinggi dari konstanta dielektrik dari 2-4 diukur eksperimental
High Apparent Dielectric Constant Inside a
dengan protein kering. Data ini menunjukkan bahwa protein
Protein Reflects Structural Reorganization
Biophysical Journal, Volume 92, Issue 6, dielektrik konstan yang diperlukan untuk mereproduksi nilai pKa
Coupled to the Ionization of an Internal Asp
Daniel A. Karp*, Apostolos G. Gittis*, Mary R. Stahley*, Carolyn A. Fitch*, Wesley E. S 2041-2053, 15 March 2007
Asp-66 dengan perhitungan kontinum elektrostatika tinggi .
Kelarutan adalah fenomena pembubaran solid dalam fase cair
untuk memberikan suatu sistem homogen dan merupakan salah
satu parameter penting untuk mencapai konsentrasi yang
diinginkan dari obat dalam sirkulasi sistemik untuk respon
farmakologis. Buruk larut dalam air obat setelah pemberian oral
sering membutuhkan dosis tinggi untuk mencapai konsentrasi
Bioavailability enhancement of poorly water
Int. J. of Pharm. & Life Sci. (IJPLS), Vol. 2, plasma terapeutik. Bioavailabilitas obat oral tergantung pada
soluble drugs
Issue 3: March: 2011
kelarutan dalam media air selama rentang pH yang berbeda.
Prediksi struktur dan perilaku dinamis dapat dilakukan oleh
kombinasi dari pemodelan struktur dan dinamika molekul simulasi.
Simulasi juga harus peka terhadap kendala dari lingkungan di
Structural modelling and dynamics of proteins
Advanced Drug Delivery Reviews, 30
mana protein berada. Disajikan metode untuk menghasilkan dan
for insights into drug interactions
Tim Wernera et al.
March 2012, vol 64, issue 4, page 323-343 memahami struktur dan fungsi protein dan studi perilaku dinamis.
Kemajuan teknologi terbaru dalam metode NMR dan instrumentasi
mengalami dampak yang signifikan dalam biologi struktural.
Inovasi ini juga berdampak bioteknologi farmasi seperti sekarang
NMR Spectroscopy and Protein Structure
mungkin untuk menggunakan spektroskopi NMR untuk cepat
Determination: Application to Drug Discovery
Current Pharmaceutical Biotechnology,
mengkarakterisasi semakin banyak obat protein calon dan target
and Development
David Wishart
2005, vol 6, no 2, 105-120
protein obat.
Spektrometri massa berbasis pendekatan proteomik telah muncul
sebagai yang paling efisien untuk mempelajari fungsi protein dan
modifikasi. Ulasan ini akan membahas metode pengembangan
Protein target discovery of drug and its
untuk target penemuan obat dan aplikasi dalam berbagai bidang,
reactive intermediate metabolite by using
termasuk mekanisme toksisitas obat yang disebabkan oleh
proteomic strategy
Lianghai Hu, John Paul Fawcett, Jingkai Gu
Acta Pharmaceutica Sinica B, Volume 2, I metabolit reaktif.
Volumetric, Electric, and Magnetic Properties
of Thioxanthen-9-one in Aprotic Solvents as
Revealed by High-Precision Densitometry,
High-Accuracy Refractometry and Magnetic
Pengukuran densitometri dari Thipxanthen-9-one (TX) di dalam
Susceptibility Measurements and by DFT
JOURNAL OF SOLUTION CHEMISTRY, 1,4-dioxane, DMSO, toluena, dan benzena untuk mendapatkan
Calculations
Ysaas J. Alvarado, Jos Caldera-Luzardo, Carlos De La Cruz, Gladys Ferrer-Amado, 2006, volume 35, Number 1, 29-49
sifat-sifat volumetrik, elektrik dan magnetiknya.
Kelarutan obat dalam air dan pelarut organik memainkan peranan
penting dan juga mempengaruhi proses farmasi, termasuk desain,
The Importance of Dielectric Constant for Drug
AAPS PharmSciTech. 2010 December;
sintesis, ekstraksi, pemurnian, formulasi, penyerapan, dan
Solubility Prediction in Binary Solvent
11(4): 17261729.
distribusi dalam cairan tubuh. Dapat dilihat juga konstanta
Mixtures: Electrolytes and Zwitterions in
Published online 2010 December 4. doi:
dielektrik pelarut dan campuran mereka mungkin dapat membantu
Water+Ethanol
Mohammad Amin Abolghassemi Fakhree, Daniel R. Delgado, Fleming Martnez, and 10.1208/s12249-010-9552-3
dalam kelarutan elektrolit.
Eritrosit Biokompatibel, biodegradable, memiliki kehidupan
sirkulasi setengah panjang, dan dapat diisi dengan berbagai
senyawa biologis aktif menggunakan berbagai metode kimia dan
Cell Based Drug Delivery System Through
IJPSDR January-March,2010,Vol 2, Issue fisika. Eritrosit adalah vektor biokompatibel potensi zat bioaktif
Resealed Erythrocyte
A Gupta, AK Mishra, P Bansal, S Kumar, V Gupta, R Singh, GS Kalyan
1, 23-30
yang berbeda, termasuk obat.
Protein denaturation and protein:drugs
Protein Science
Protein stabilitas dan ligand-binding pengukuran afinitas secara
interactions from intrinsic protein fluorescence
Volume 19, Issue 8, Article first published luas diperlukan untuk perumusan protein biofarmasi, protein teknik
measurements at the nanolitre scale
Gaudet Matthieu, Remtulla Nina, Jackson Sophie E., Main Ewan R. G., Bracewell Dan online: 15 JUN 2010
dan skrining obat dalam kehidupan penelitian ilmu pengetahuan.
Ketersediaan berat molekul besar protein-dan peptida berbasis
obat karena kemajuan terbaru dalam eld biologi molekuler telah
memberi kita cara-cara baru untuk mengobati sejumlah penyakit.
European Journal of Pharmaceutics and Hidrogel sintetis menawarkan cara yang mungkin efektif dan
Hydrogels in pharmaceutical formulations
N.A. Peppas a, P. Bures a, W. Leobandung a, H. Ichikawa b
Biopharmaceutics 50 (2000) 27- 46
nyaman untuk mengelola suatu senyawa.
Timidilat sintase (TS) adalah target lama untuk obat antikanker
dan menarik untuk mekanistik fitur-fitur. Enzim mengkatalisis
konversi dump untuk dTMP menggunakan
methylenetetrahydrofolate co-enzim, dan mungkin yang baik
dipelajari enzim yang mengkatalisis karbon-karbon pembentukan
ikatan Arg 126 ditemukan di semua TSs tetapi membentuk hanya
1 dari 13 ikatan hidrogen untuk membuang selama katalisis, dan
hanya satu dari tujuh sampai kelompok fosfat saja. Meskipun
demikian, ketika Arg 126 dari TS dari Escherichia coli diubah
Crystal structures of a marginally active
Protein Science (1997). 6:2504-2511.
menjadi glutamat (R126E), protein yang dihasilkan memiliki Kcat
thymidylate synthase mutant, Arg 126 -+Glu
Pavel Strop, Liming Changchien, Frank Maley, and William R.Montfort
Cambridge University Press.
berkurang 2000-kali lipat dan Km berkurang 600-kali lipat.
Sebuah parameter fisik untuk memprediksi stabilitas termal protein
menggunakan cahaya Dynamic Light Scattering (DLS). Hubungan
antara titik lebur diukur dengan Differential Scanning Calorimetry
(DSC) dan polidispersitas diameter hidrodinamik ditentukan oleh
analisis DLS yang diperiksa. Calmodulin (CAM) dan Concanavalin
A (ConA) digunakan sebagai protein model. Titik lebur diukur
dengan DSC, indikator untuk termal stabilitas, meningkat dan
polidispersitas yang menurun pada peningkatan protein untuk
ligan spesifik, menunjukkan bahwa polidispersitas dapat
digunakan indikator untuk memprediksi stabilitas termal. Selain itu,
Polydispersity as a Parameter for Indicating
peningkatan stabilitas termal yang dihasilkan dari pembentukan
the Thermal Stability of Proteins by Dynamic
Analytical Sciences, June 2010, Vol 26,
kompleks dapat diukur dengan analisis polidispersitas bahkan
Light Scattering
Kohei SHIBA, Takuro NIIDOME, Etsuko KATOH, Hongyu XIANG, Lu HAN, Takeshi M Page 659
ketika titik leleh berubah hanya sedikit.

15 Steven Victoria H

1110142 s_v_93@yahoo.com

Dielectric properties of proteins from


simulation: The effects of solvent, ligands, pH,
and temperature

16 Sinta Dewi Japari

1110103 sintadewijapari@ymail.com

Knowledge-Based Elastic Potentials for


Docking Drugs or Proteins with Nucleic Acids

17 Maria Yohana Finnike 1110130 maria_yf@yahoo.com

Fragment-Based Lead Discovery Using X-ray


Crystallography

18 Felicia Kristianti

Electric dipole moments of globular proteins:


measurement and calculation with NMR and
X-ray databases

1110065 pheli_lutchu@hotmail.com

19 Kharisma Dwi Puspita 1110108 emi_charisma@yahoo.com

Electrostatic energy in fields provides a route


to dielectric permittivity of proteins

Lidya Christy
20 Lauwrenz

1110339 lidya.lauwrenz@gmail.com

Protein structure determination in soution by


NMR Spectroscopy

21 Ayu Luciana Dewi

1110154 ayulucianadewi@ymail.com

Protein Structure Determination in Living Cells


by in-cell NMR Spectroscopy

22 Devi Fajar Agustina

1110147 deph_luv@yahoo.com

Dipole Moment and Structure of Trioxane

23 Defilia Tan

1110066 nat.ailifed@ymail.com

Protein-Based Nanomedicine Platforms for


Drug Delivery

24 Dessy Iqra Sardy

1110246 littledhezy@yahoo.com

Deuterium NMR spectroscopy of biofluids for


the identification of drug metabolites:
Application to N,N-dimethylformamide

25 Bella Susanto

1110165 bella.ndud@ymail.com

Dielectric constant of particles determined by


impedance spectroscopy

Ario Adibratha
26 Gunawan

1110179 arioadibratha@gmail.com

Protein and Peptide Drug Delivery: Oral


Approaches

27 Erick Adi Nangoy

Development of a nanoprecipitation method


meguriaukagi_no_roxas@yahoo.co intended for the entrapment of hydrophilic
1110113 m
drugs into nanoparticles

Penggunaan model Frhlich-Kirkwood saat fluktuasi dipol standar


untuk menghitung permitivitas dielektrik statis, epsilon (0), untuk
empat protein yang berbeda, masing-masing disimulasikan
setidaknya dalam dua kondisi yang berbeda dari pH, temperatur,
solvasi, atau pengikatan ligan . Untuk berbagai protein, kita
menghitung nilai untuk epsilon (0) antara 15 dan 40. Hasil
penelitian menunjukkan, bahwa perilaku residu adalah penentu
utama dari permitivitas efektif. Selain itu, hanya perubahan
lingkungan yang mengubah sifat residu berpengaruh signifikan
Biophysical Journal, Volume 80, Issue 6, terhadap epsilon. Sebaliknya, molekul air terkubur atau ligan
Jed W. Pitera, Michael Falta and Wilfred F. van Gunsteren
2546-2555
memiliki sedikit efek atau tidak ada pada sifat dielektrik protein.
Fungsi ellipsoidal elastis didefinisikan oleh pola hidrasi diamati
sekitar basa DNA memberikan dasar baru untuk mengukur
pengakuan ligan dalam alur dari heliks ganda struktur.Potensi
ellipsoidal muncul menjanjikan sebagai alat matematika untuk
Biophysical Journal, Volume 88, Issue 2, studi obat-dan protein-DNA interaksi dan untuk memperoleh
Wei Ge, Bohdan Schneider, Wilma K. Olson
February 2005, Pages 1166-1190
wawasan baru ke dalam DNA-mengikat mekanisme.
Fragment screening dengan menggunakan metode X-ray
kristalografi. Metode ini diilustrasikan terhadap 5 protein (p38MAP
kinase, CDK2, thrombin, ribonuclease A, and PTP1B). Contohnya
ilustrasi berbagai interaksi molekul (yaitu lipofilik, ikatan hidrogen
Journal of Medicinal Chemistry, 2005, Vol. netral) dapat mendorong fragmen mengikat dan menyebabkan
Hartshorn et al.
48, No. 2 page 403-413
pergerakan protein.
Momen dipol listrik protein kecil dihitung dengan menggunakan
NMR serta database X-ray dan dibandingkan dengan momen dipol
hasil eksperimental. Momen dipol molekul protein terdiri dari
Journal of Non-Crystalline Solids, 2002,
momen dipol muatan permukaan dan inti momen dipol karena sisi
Shiro Takashima
pages 303-310
kutub chains.
Bentuk energi elektrostatik dari sistem pengisian dan dielektrik
menggambarkan hubungan antara medan listrik dan pemindahan
dielektrik, dimana dapat menyediakan rute perhitungan
permitivitas dielektrik protein. Perhitungan dilakukan pada ruang
hampa dan hasilnya merupakan suatu persetujuan dalam
penentuan tetapan dielektrik pada percobaan bubuk protein yang
Journal of Molecular Structure (Theochem) tersedia pada medan listrik berdaya lemah menggunakan struktur
Sibsankar Kundu*, Pinaki Gupta-Bhaya
639 (2003) 2126
kristal X-ray pada P-450 sitokrom protein dan komplek ligannya.
Pengenalan resonansi magnetik nuklir (NMR) spektroskopi seagai
metode kedua untuk penentuan struktur protein pada resolusi
aom, selain x-ray difraksi dalam kristal tunggal, ini sudah
menyebabkan peningkatan signifikan dalam jumlah diketahui
Journal of Biological Chemistry, 1990, Vol. strutur protein. NMR Spektrokopi menghasilkan sebuah array
Kurt Wuthrich
265, No.36, page 22059-22062
pelenaran wawasan perilaku molekul tersebut.
Investigasi protein dalam lingkungan hidup pada resolusi atom
adalah tujuan utama dari biologi molekuler, yang belum tercapai
D * Daisuke Sakakibara,
meskipun metode untuk penentuan struktur tiga dimensi (3D) dari
* Atsuko Sasaki,
protein yang dimurnikan dalam kristal tunggal atau dalam larutan
* Teppei Ikeya,
secara luas digunakan. Perkembangan terkini dalam hardware
* Junpei Hamatsu,
NMR dan metodologi telah memungkinkan pengukuran resolusi
* Tomomi Hanashima,
Nature International Weekly Journal of
tinggi spektrum heteronuklir multi-dimensi NMR makromolekul
* + et al.
Sience, 2009, nature 458, page 102-105 dalam sel hidup.(dalam sel-NMR) 1, 2, 3, 4, 5.
Trioksan adalah polimer padat formaldehida menyerupai terkenal
pelarut dioksan dalam sifat kimianya. Molekul ini bisa eksis dalam
dua spacially bentuk yang berbeda menyerupai kursi dan cradle,
dimana dipol teoritis momen adalah 2.3 dan 0.6X 10-18 satuan
Part of Journal of Research of the National elektrostatik (ESU). Eksperimental nilai dalam benzen ditemukan
Bureau of Standards, Volume 33, July
2.18X 10-18 ESU. Perhitungan momen dipol dari bentuk "kursi" ini
Arthur A. Maryott and S. F. Acree
1944
dapat dengan cara penambahan vektor dari momen ikatan.
Platform nano berbasis protein untuk pengiriman obat alami yang
terdiri dari rakitan subunit protein yang sama atau kombinasi dari
Small, Volume 5, Issue 15, pages
protein yang membentuk sistem yang lengkap. Berbagai protein
Aihui MaHam, Zhiwen Tang, Hong Wu, Jun Wang, Yuehe Lin
17061721, August 3, 2009
telah digunakan sebagai karakteristik dari sistem penyaluran obat.
Metabolisme N, N-dimetilformamida pada tikus Sprague Dawleytelah diteliti kembali menggunakan spektroskopi NMR dari
urin.Secara khusus, melalui penggunaan N, N-dimetilformamidaJournal of Pharmaceutical and Biomedical D7 (DMF-D7) dan 2H-NMR spektroskopi,metabolit utama dari
AnalysisVolume 11, Issue 8, August 1993, senyawa ini telah dikonfirmasi secara langsung.Penggunaan
Pages 687692An International Journal on inverse-terdeteksi dua dimensi 2H korelasi 13C dengan
all Drug-Related Topics in Pharmaceutical, decoupling 13C dibantu identifikasi metabolit melalui penyediaan
R.Duncant Farrant , Salman R. Salman ,John C. Lindon ,Belinda C.Cupid , Jeremy K. Biomedical and Clinical Analysis
pergeseran kimia 13C.
Teknik spektroskopi impedansi diperkenalkan untuk mengukur
sifat dielektrik partikel pada rentang frekuensi yang berbeda.
Journal of applied physics 100, 014102
Konstanta dielektrik partikel strontium titanat, tergantung di
(2006), Issue 5 July 2006, American
butoxyetanol dan ditentukan dengan spektroskopi impedansi
Petrovsky, Vladimir
Manohar, Abhisek
Doyan, Fatih
Institute of physics
reproducibly menggunakan model rangkai yang sesuai.
Sampai saat ini, injeksi masih menjadi cara paling utama
dalam memberikan terapi protein dan peptida yang dikarenakan
bioavailabilitas
oralnya yang rendah. Tetapi, cara penggunaan oral akan lebih
diinginkan karena
kesenangan pasien dalam menggunakannya dan penggunaan
jangka panjang. Mendesign
obat ini untuk diberikan secara oral merupakan sebuah tantangan
karena
permeabilitas membrannya yang rendah dan molekul nya yang
besar dan yang utama
adalah bagaimana cara meningkatkan bioavailabilitas oralnya dari
Department of Pharmaceutical Sciences, kurang dari 1%
Prin. K. M. Kundnani College of
sampai 30-50%.
Shaji J, Patole V
Pharmacy,November 10, 2006

Ugo Bilati, Eric Allemann, Eric Doelker

European Journal of Pharmaceutical


Sciences 24 (2005) 6775

Penelitian ini meneliti modifikasi formulasi dan proses untuk


meningkatkan fleksibilitas dari teknik nanoprecipitation, khususnya
yang berkaitan dengan enkapsulasi obat hidrofilik (misalnya
protein)

28 Weilinten Salim

1110110 lim.wei78@gmail.com

Dielectric Dispersion in Branched


Polypropylene Oxides

29 Oky Fenty Mulyawati

1110258 popophio@yahoo.com

M O L S C R I P T : a program to produce
both detailed and s c h e m a t i c plots of
protein structures.
P. J. Kraulis

30 diana syarifah

1110331 mollynaa11@yahoo.com

QSAR - Hansch Analysis and Related


Approaches in Drug Design

Bharat Jhanwarb, Vandana Sharmaa, Rajeev K Singlaa*, Birendra Shrivastavaa`

31 Nurul Safina
32

1110334 naomiusagi@ymail.com

Observing the water molecule in


macromolecules and aqueousmedia using
infrared spectrometry

Y. Marechal*,1

W. H. Stockmayer, J. J. Burke

Liquid trifungsi star polymer dari propylen oxida menyerupai


polymer lurus dalam memperlihatkan dua daerah dari dispersi
dielektrik. Ini terjadi
pada frekuensi yang sama dari polimer lurus. Dispersi kedua yang
kecil muncul
Department of Chemistry, Massachusetts kembali koresponden dengan komponen paralel momen dipol dari
Institute of Technology, Cambridge,
0.18 D per unit. Dan
Massachusetts 02139 and Department of waktu relaksasi bisa diprediksi dari berat molekul dan
Chemistry, Darthmouth College, Hanoter, kekentalannya.
Newhamshire 03755. Received 21,1969
Sebuah struktur protein yang berasal dari data eksperimen akan
subyek banyak sumber kesalahan, baik eksperimental dan di
dalam terpretation hasil (Briindrn & Jones, 1990). Hal ini penting.
Oleh karena itu, memiliki penilaian keseluruhan 'kualitas' struktur
ini dan untuk dapat mengidentifikasi daerah yang mungkin perlu
berhati-hati dalam vestigation. Hal ini berlaku tidak hanya pada
penentuan struktur- panggung tetapi juga ketika salah satu adalah
'model bangunan' urutan ke struktur yang dikenal (Biundell et al.,
1988), atau menggunakan yang ada database struktur yang
dikenal untuk analisis dan prediksi. Untuk menentukan kualitas
secara keseluruhan, dua yang paling banyak digunakan tindakan
adalah resolusi dan faktor R. Semakin tinggi resolusi, semakin
besar jumlah eksperimental independen pengamatan yang
diperoleh dari data difraksi dan karenanya besar akurasi dari
struktur molekul. Ini adalah ilustrated oleh Hubbard & Blundell
(1987), yang menunjukkan bagaimana rms jarak antara yang
sesuai C ~ atom independen restruktur didenda identik asam
amino urutan menurun seiring resolusi membaik. Dengan kata
lain, struktur pendekatan satu sama lain sebagai resolusi
membaik, yang menunjukkan bahwa kesalahan dalam masingmasing menurun, seperti yang diharapkan. The R faktor, di sisi
lain, adalah panduan kurang yakin, bisa artifisial berkurang dalam
beberapa cara dan jadi kadang-kadang dapat menyesatkan- ing
(Br ~ indrn & Jones, 1990). Namun demikian, itu adalah umum
Journal of Applied Crystallography Volume untuk mengambil handal struktur sebagai orang-orang dengan
24, Part 5 (October 1991) J. Appl. Cryst. resolusi 2,0 A, atau lebih baik dan faktor R tidak lebih buruk
(1991). 24, 946-950
daripada 20%.
Dalam studi QSAR klasik, afinitas ligan ke situs mengikat mereka,
penghambatan konstanta, konstanta laju, dan titik akhir biologis
lainnya, dengan atom, kelompok atau
molekul properti seperti lipofilisitas, polarisabilitas, sifat elektronik
dan sterik (Hnsch
analisis) atau dengan fitur struktural tertentu (Free-Wilson
Pharmacologyonline 1: 306-344 (2011)
analisis) telah berkorelasi
Molekul H2O adalah molekul yang mengambil sangat penting
ketika tertanam dalam makromolekul. Hal ini, bagaimanapun,
sulit untuk mengamati dan menentukan interaksi yang
menetapkan dengan kelompok hydrophylic makromolekul.
memiliki
akibatnya lama diabaikan. Spektroskopi IR, alat yang paling
Journal of Molecular Structure 648 (2003) ampuh untuk melihat ikatan hidrogen, telah sampai baru-baru ini
2747
diabaikan untuk melihat molekul-molekul.

No

Name

Deskripsi singkat
Di antara potensi sistem yang tersedia pembawa obat koloid, protein berbasis nanocarriers sangat
menarik. Protein berbasis nanocarriers merupakan kandidat yang menjanjikan untuk obat efisien dan
pengiriman gen. Selain itu, struktur protein yang unik menawarkan kemungkinan situs-spesifik
konjugasi obat dan penargetan ligan menggunakan berbagai memodifikasi permukaan nanocarriers
Protein-based nanocarriers as
protein. Review saat ini menyoroti kemajuan utama dicapai dalam memanfaatkan nanocarriers protein
promising drug and gene delivery
Ahmed O. Elzoghby, Wael M. Journal of Controlled Release, Volume 161, Issue 1, 10 July sebagai kendaraan alami untuk tugas pengiriman obat dan gen yang berkaitan dengan jenis,
Gloria Stevany Haryanto 1110241 stephaniegloriah@yahoo.com systems
Samy, Nazik A. Elgindy
2012, Pages 38-49
keuntungan, keterbatasan, aspek formulasi serta hasil utama dari in vitro dan in vivo penyelidikan.
Antara 1950-an dan 1980-an, para ilmuwan berfokus pada bagaimana kode genetik ditranskripsi ke
RNA dan diterjemahkan ke protein, tapi bagaimana protein yang terdegradasi menjadi terabaikan.
Intracellular protein degradation:
Kami sekarang mengakui bahwa degradasi protein intraseluler yang terlibat dalam regulasi dari array
From a vague idea thru the lysosome
yang luas dari proses seluler, seperti siklus sel dan pembelahan, regulasi faktor transkripsi, dan
and the ubiquitinproteasome system
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and
jaminan kontrol kualitas selular. Tidak mengherankan, penyimpangan dalam sistem telah terlibat dalam
and onto human diseases and drug
Proteomics, Volume 1824, Issue 1, January 2012, Pages 3- patogenesis penyakit manusia, seperti keganasan dan gangguan neurodegenerative, yang dipimpin
Debby Angelina
1110259
angelz.da08@yahoo.com
targeting
Ciechanover, A.
13
selanjutnya untuk upaya peningkatan untuk mengembangkan mekanisme berbasis obat.

Liliani Tri Anita

Nrp

1110078

Stephanie Jane

1110056

Dewi Chandra Lita

1110186

Clara Octavianty

1110248

Jeffy Armadoni Karya

1110052

Fransisca Rosella Lisan 1110208

Email account

Title

liliani3anita@yahoo.co.id

Acylated Chitosan: a promising


carrier in novel drug delivery of
albendazele

jane_elisse@yahoo.co.id

Activity and Structural Comparisons


of Solution Associating
and Monomeric Channel-Forming
Peptides Derived
from the Glycine Receptor M2
Segment

dclita28@yahoo.com

Protein Based Drug Discovery

octavianty.clara@yahoo.com Small Molecule Antagonist Protein


What Are the Dielectric Constants
of Proteins and HowTo
jeffyak@ymail.com
Validate Electrostatic Models?

rosellafransisca@yahoo.com Peptide and Protein PEGylation III

Ita Dwilestari

1110053

ita_dwi_lestari@yahoo.com

Dielectric Constant and Ionic


Strength Effects on DNA
Precipitation

10

Ferdy Rankilie

1110046

ferdy_rankilie@yahoo.com

Making Sense About Dipole


Moments

11

Vivi Silvia Indriyana

Proteins: Structure and Function


1110222 silviaindriyana23@yahoo.com Sequence to

Tirtawijaya Desinta

Solvent effect on the spectral


properties of dipolar laser
dyes:Evaluation of ground and
1110201 desintatirtawijaya@yahoo.com excited state dipole moments

12

Author (s)

Anuradha Rathore,
Shikha Agrawal, Nimita
Manocha
Gabriel A. Cook,* Om
Prakash,* Ke Zhang,* Lalida
P. Shank,* Wade A.
Takeguchi,* Ashley
Robbins,*Yu-Xi Gong,*
Takeo Iwamoto,* Bruce D.
Schultz, and John M.
Tomich*

Journl, year, Volume, issu, page

IJPRD, 2011; Vol 3(12): February-2012 (48 - 55)

Chitosan adalah biodegradable alami bermuatan positif dan


biokompatibel polimer. Ini adalah polisakarida linear yang terdiri dari
h-1, 4 monomer terkait glukosamin dan N-asetilglukosamin.
Chitosan memiliki satu reaktif amino pada posisi-2 C dari
glukosamin residu, dan ini amina berunding penting
fungsional properti untuk chitosan yang bisa dimanfaatkan untuk
biofabrication untuk menghasilkan turunan dimodifikasi secara kimia berbagai
dan menggali potensi mereka untuk bidang farmasi

Sejumlah saluran pembentuk peptida yang berasal dari kedua transmembran (TM) segmen (M2) dari
glisin reseptor a1 subunit (M2GlyR), termasuk urutan 22-residu NK4-M2GlyR p22 wild type (WT)
(KKKKPARVGLGITTVLTMTTQS), menginduksi permeasi anion di monolayers sel epitel. Dalam uji in
vitro menunjukkan bahwa peptida atau
urutan terkait bisa berfungsi sebagai calon untuk terapi pengganti saluran ion dalam mengobati
channelopathies seperti cystic
Biophysical Journal Volume 86 March 2004 14241435 fibrosis (CF). Urutan wild type membentuk asosiasi larut dalam air yang mengurangi kemanjurannya.
Penemuan obat target baru saat ini sangat populer dengan potensi besar untuk memajukan penelitian
biomedis dan genomik kimia. Penemuan obat adalah proses menemukan dan merancang obat yang
mencakup identifikasi sasaran, validasi target,memimpin identifikasi, optimasi dan pengenalan obat
baru kepada publik. G protein-coupled reseptor adalah salah satu target obat yang paling penting.
Dalam skenario ini dari penelitian obat, sekitar 60% dari target molekul obat berada di permukaan sel,
dan setengah dari mereka adalah GPCRs. Nanoteknologi berbasis sistem pengiriman obat telah
Joshi B., Gupta G.
melihat popularitas terakhir karena menguntungkan fisik kimia, sifat biologi, dan upaya-upaya besar
Gupta N., Gupta M.
telah dilakukan untuk menargetkan nanoDDSs ke reseptor seluler spesifik. Protein-protein interaksi
Trivedi S. Patil P.
mengatur berbagai jalur seluler yang penting, dan karena itu mewakili kelas yang dihuni target untuk
Jhadav A., Vamsi K.K.
penemuan obat. Sebuah analisis protein individu, protein sistem interaksi baru-baru ini menghasilkan
Khairnar Y., Boraste A.
International Journal of Drug Discovery, ISSN: 09754423, keberhasilan dalam penemuan obat seperti inhibitor.
Mujapara A.
Volume 1, Issue 2, 2009, Pages 40-51
Depatemen Of Bioorganic Chemistry,Genetech Inc,1 DNA urutan terkait bisa berfungsi sebagai calon untuk terapi pengganti saluran ion dalam mengobati
Thomas R Gadek, John B Ni
Way, South San Fransisco,CA 9080, USA
channelopathies seperti cystic
PROTEINS: Structure, Function, and Genetics 44:400417 Model implisit untuk evaluasi energi elektrostatik dalam protein termasuk konstanta dielektrik yang
(2001)
mewakili pengaruh lingkungan protein
Poli Etilen Glikol (PEG) merupakan polimer yang sangat diselidiki untuk
modifikasi kovalen makromolekul biologi dan permukaan untuk aplikasi farmasi. Peptida dan protein
yang sangat penting. Peptida dan protein mencakup perisai antigenik dan imunogenik epitop, perisai
reseptor-dimediasi serapan oleh sistem retikuloendotelial (RES), dan pengakuan mencegah dan
degradasi oleh enzim proteolitik. PEG konjugasi juga
Francesco M.
meningkatkan ukuran jelas dari polipeptida, sehingga mengurangi filtrasi ginjal
Veronese
Adavanced Drug Delivery Reviews, Volume 60, Issue 1, dan mengubah biodistribusi. Sebuah aspek penting dari pegilasi adalah penggabungan kelompok PEG
J. Milton Harris
Page 459-476 (3 Januari 2008)
berbagai fungsional yang digunakan untuk melampirkan PEG untuk peptida atau protein.
Efek dari senyawa zwitterionic berbeda pada sekumpulan DNA, yang kemudian diinduksi oleh
beberapa polyamine, seperti: spermin 4+, Glycin, B-alanin, 4- asam amino butirat, dan 6- asam amino
kaproat telah menunjukkan adanya peningkatan kapasitas untuk melemahkan sekumpulan DNA. Efek
proteksi ini memiliki hubungan atau keterkaitan dengan adanya peningkatan konstanta dielektrik dari
Biophysical Journal, Volume 70, March 1996 pages 1456- masing-masing senyawa. Hal ini dijelaskan dengan peningkatan efek proteksi dengan perbedaan
Stephane Flock , Rudi Labar
1465
konsentrasi polyamine.
Meskipun metode momen dipol baru-baru ini meninggalkan sedikit di bawah bayang-bayang metode
cepat berkembang lainnya, ini masih merupakan alat yang penting untuk penyelidikan struktural dalam
kimia organik. Hal ini digunakan untuk penentuan jenis ikatan kimia (polar atau kovalen) geometri
molekul (isomerisme, valensi sudut dll) saling pengaruh atom dan kelompok (mesomeric elektron
Tridib Tripathy, B. R. De
Journal of Physical Sciences, Vol. 12, 2008, 155-172
pergeseran, orto efek, dll) sifat kompleks dan sebagainya.
Dalam era yang telah didominasi oleh Biologi Struktural untuk 30-40 tahun terakhir, perubahan
dramatis dari fokus terhadap analisis urutan telah mendorong munculnya proyek genom dan urutan
divergen resultan / struktur defisit.Tantangan utama Biologi Struktural Komputasi karena itu untuk
merasionalisasi massa menjadi pengetahuan biokimia dan biofisik dan menguraikan struktural,
Sandhya R. Shenoy and B. S Current Protein and Peptide Science, 2010, 11, 498-514 fungsional dan petunjuk evolusi dikodekan dalam bahasa urutan biologis
Pengaruh bahan pelarut pada spektrum penyerapan dan fluoresensi dan momen dipol dari dua media
pewarna laser yang berukuran dipole 2 - (2,7-dikloro-6-hidroksi-3-okso-3H-xanthen-9-il) benzoat Asam
(Fluorescein 27) (F27) dan N-[6-diethylamino) -9 - (2,4-disulfophenyl)-3H-xanthen-3-ylidene]-Nethylhydroxid (Sulfarhodamine B) (BPRS) telah dipelajari secara komprehensif dalam polar aprotik
pelarut protik polar dan pada suhu kamar (298 K). Pergeseran batokromik diamati pada spektrum
penyerapan dan fluoresensi dari F27 dan BPRS dengan pelarut meningkat polaritas menandakan
bahwa transisi terlibat *. Korelasi yang Solvatochromic digunakan untuk memperoleh tanah dan
momen dipol keadaan tereksitasi. Keadaan tereksitasi diamat momen dipol ditemukan lebih besar
daripada rekan-rekan negara mereka tanah di semua pelarut dipelajari. Saat-saat tanah dan keadaan
tereksitasi dipole probe ini juga telah dihitung dari perhitungan ab initio dan dibandingkan dengan
Nagachandra et al. / European Journal of Chemistry 3 (2) mereka yang ditentukan secara eksperimental.
Laser Spectroscopy Program
(2012) 163171
Claudia N. Schutz and Arieh

13

14

15

16

17

18

19

20

Amelia Fransiska Muslim 1110224

Iga Synthia

1110269

ameliafrnsiska@yahoo.com

igacynthia43@gmail.com

Using NMR Chemical Shifts as


Structural Restraints in Molecular
Dynamics Simulations of Proteins

Molecular Fragment Replacement


Approach to Protein Structure
Determination by Chemical Shift and
Dipolar Homology Database Mining

Paul Robustelli, Kai Kohlhoff,


Andrea Cavalli, Michele
Vendruscolo

Structure 18, 923933, August 11, 2010

Georg Kontaxis, Frank


Delaglio, Ad Bax

Methods in Enzymology, vol 394

Kami memperkenalkan sebuah prosedur untuk menentukan struktur dari protein dengan memasukkan
pergeseran NMR kimia sebagai struktur hambatan dalam simulasi dinamika molekuler. Dalam
pendekatan ini, pergeseran kimia dinyatakan sebagai fungsi terdiferensiasi dari atom koordinat dan
digunakan untuk menghitung kekuatan untuk menghasilkan lintasan yang mengarah pada
pengurangan perbedaan antara eksperimental dan penghitungan pergeseran kimia. Kami
menunjukkan bahwa strategi ini memungkinkan pelipatan dari satu set protein dengan perwakilan
topologi mulai dari awal denaturasi sebagian konformasi tanpa menggunakan informasi tambahan
eksperimental. Metode ini juga memungkinkan Kombinasi langsung dari pergeseran bahan kimia
dengan pembatas standar NMR lainnya, termasuk yang berasal dari NOE, J-kopling dan pengukuran
dipole residual kopling. Kami menggambarkan aspek ini dengan menghitung struktur dari penempatan
sementara keadaan tereksitasi konformasi dari pergeseran kimia dan residual data dipole kopling
diukur dengan relaksasi dispersi percobaan NMR.
Sebuah pendekatan baru dijelaskan untuk menentukan struktur dasar protein yang didasarkan pada
penemuan fragmen protein dalam bank data(PDB).Untuk setiap fragmen dalam protein target,
biasanya dipilih untuk menjadi residu7-10 panjang, fragmen PDB
dipilih yang paling cocok untuk eksperimen ditentukan satu-ikatan heteronuklir kopling dan
menunjukkan bahwa kesepakatan antara pergeseran kimia diperkirakan untuk fragmen PDB dan
eksperimental nilai untuk fragmen target.Fragmen yang kemudian disempurnakan oleh simulated
annealing untuk meningkatkan kesepakatan dengan data eksperimen. Jika energi-terendah fragmen
halus membentuk akhir klaster khas, struktur ini diterima dan rantai samping yang ditambahkan pada
dasar potensi basisdata konformasi. Proses perakitan dasar berurutan memperluas rantai dengan
menerjemahkan sebuah fragmen yang
berlaku ke atasnya. Untuk beberapa protein kecil, dengan luas set kopling diukur
dalam dua media keselarasan, struktur akhir yang unik diperoleh bahwa setuju dengan struktur yang
sebelumnya diselesaikan dengan metode konvensional.Dengan kurangnya data input dipole,besar,
orientasi fragmen dari setiap protein diperoleh, namun posisi
relatif mereka membutuhkan baik set kecil translationally menahan nuklir Overhauser tambahan
(Noes)atau protokol yang mengoptimalkan penguburan kelompok hidrofobik
dan pasangan dari benang .

nilai untuk molekul terisolasi yang sesuai telah dihitung untuk tekanan rendah-tiga polimorf glisin
menggunakan Mindo / 3 Hamiltonian semiempirical. Dalam perhitungan
pengaruh kisi pada molekul referensi terpilih telah dimasukkan dengan memodifikasi elemen diagonal
dari matriks Hcore. Mulai dari satu set beban atom dihitung untuk molekul terisolasi suatu kisi kristal
awal telah dibentuk dan dimasukkan ke dalam perhitungan baru konsisten diri (SCF) pengisi referensi
molekul . Hasil dari satu set SCF baru kemudian digunakan untuk mengganti muatan kisi dari
sebelumnya, dan perhitungan SCF baru ditampilkan. proses berulang-ulang ini dilanjutkan hingga
perbedaan antara energi elektronik dan jumlah dari nilai absolut dari perbedaan antara muatan atom
Semiempirical Calculations on the
dari dua berikutnya perhitungan SCF
Dipole Moment Enhancement in the
09320784 / 04 / 12000977 $ 06.00c 2004 Verlag der lebih rendah dari 10-5 10-5 eV dan e0, masing-masing. Hasilnya disetujui dengan baik bersama data
Tommy Gunawan
1110189 tommygunawan25@yahoo.com Solid State
Gerhard Raabe
Zeitschrift fur Naturforschung, Tubingen
eksperimen yang diperoleh oleh penulis lain untuk -glisin.
Rett sindrom (RTT) adalah postnatal parah neurologis gangguan yang disebabkan oleh mutasi pada
metil-CpG mengikat protein 2 (MECP2) gen dan defisit dalam metabolisme bioaminergic telah
diidentifikasi di tingkat seluler dan molekuler, di lebih dari 200 pasien.Baru-baru ini tersedia
transgenik tikus strain dengan Mecp2 cacat gen juga menunjukkan kelainan, sangat
menunjukkan bahwa ada hubungan langsung antara fungsi protein MECP2 dan metabolisme amina
biogenik. Biogenik amina tampaknya memiliki peran penting dalam patofisiologi sindrom Rett, untuk
beberapa alasan. Amina biogenik memodulasi besar sejumlah fungsi otonom dan kognitif. Banyak
fungsi-fungsi ini dipengaruhi dalam RTT pasien. Amina biogenik yang itu hanya neurotransmitter
Joshi B., Gupta G., Gupta N.,
yang telah berulangkali ditemukan diubah pada pasien RTT . Dalam studi ini, efek dari fosfolipid
Gupta M., Trivedi S, Patil P.,
(DG) atau protein (BSA) dimasukkan dalam berpori kationik polisakarida (NP (+)) pada mereka fisikoJhadav A., Vamsi K.K.,
kimia struktur dan efek pada aktivasi komplemen dianalisis . Dilipat respon protein (UPR) telah
Khairnar Y.,Boraste A.,
international Journal of Drug Discovery, ISSN: 09754423, berkembang melawan tekanan yang terjadi di endoplasma retikulum (ER) sebagai akibat dari gagal
Alvinesa felicia
1110029 alvinesa.felicia@yahoo.com Protein Based Drug Discovery
Mujapara A.
Volume 1, Issue 2, 2009,
melipat protein.
Dielektrik teknik, termasuk spektroskopi relaksasi broadband dielektrik dan arus depolarisasi termal
distimulasi, dan untuk skala yang lebih kecil diferensial scanning kalorimetri dan air keseimbangan
penyerapan isoterm pengukuran, yang bekerja untuk menyelidiki molecularmobility dalam kaitannya
dengan morfologi Polimida-poli (dimethylsiloxane) hibrida jaringan (PI-PDMS). Pengukuran NMR pada
sampel yang sama telah mengindikasikan singkat bahwa PDMS rantai dengan kedua ujungnya kimia
terikat pada fase PI, membentuk domain berbentuk bola dengan ukuran nanometer. Lokal relaksasi
sekunder PI, relaksasi utama, terkait dengan transisi kaca PDMS, dan relaksasi Maxwell-WagnerDielectricstudies of molecularmobility
Sillars antarmuka, berkaitan dengan morfologi mikrofasa dipisahkan, dipelajari secara rinci. Hasilnya
in hybrid
S Kripotoua, P Pissisa, , , V.A
dibahas dalam kurungan nano dari kedua komponen dan rantai tetap ujung komponen PDMS. Faktorpolyimidepoly(dimethylsiloxane)
Bershteinb, P Syselc, R
faktor yang ditemukan untuk mempengaruhi jauh besarnya dan relaksasi, sedangkan skala waktu
Michael Lie Lasmono 1110016
michael.lie08@gmail.com
networks
Hobzovac
Polymer, Volume 44, Issue 9, April 2003, Pages 27812791 relaksasi tetap praktis tidak berubah.
Peningkatan kelarutan, laju disolusi dan bioavailabilitas obat adalah tugas yang sangat menantang
dalam pengembangan obat, hampir 40% dari entitas kimia baru sedang ditemukan obat larut dalam air
kurang baik. Sifat kelarutan dan disolusi obat memainkan peran penting dalam proses pengembangan
formulasi. Masalah kelarutan merupakan tantangan besar bagi ilmuwan formulasi yang dapat
diselesaikan dengan pendekatan teknologi yang berbeda selama pekerjaan pengembangan produk
Enchanment Of Solubility and
P. S Mohanachandran, P. G
farmasi. Kesepakatan tinjauan saat ini secara detail mengenai teknik berbeda yang digunakan untuk
Ratna Eka Puspita Sari 1110200
dewa.adna@ymail.com
Dissolution Rate : An Overview
Sindhumol and T. S Kiran.
Pharmacie Global (IJCP), 2010, Vol. 01, Issue 04,
penyempurnaan tingkat kelarutan dan pelarutan buruk obat larut air.
Nanopartikel biodegradable diformulasikan dari poli (d, l-laktida-co-glycolide) (PLGA) telah diteliti untuk
pengiriman berkelanjutan dan ditargetkan / lokal dari agen yang berbeda termasuk DNA plasmid,
protein dan peptida dan senyawa berat molekul yang rendah. Penelitian terbaru di laboratorium kami
menunjukkan nanopartikel PLGA dari kompartemen endo-lisosomal ke sitosol menyusul penyerapan
Biodegradable nanoparticles for drug
Advanced Drug Delivery Reviews, Volume 55, Issue 3, mereka. Berdasarkan mekanisme di atas, aplikasi berbagai potensi nanopartikel untuk pengiriman dari
Eka Damayanti
1110256 echase7en.mhey@yahoo.com and gene delivery to cells and tissue Panyam, J.; Labhasetwar, V
February 2003, Pages 329-347
agen terapeutik ke sel dan jaringan yang dibahas.
banyak spesies bakteri yang mengandung nano dan mikro kompartemen intraselular yang terdiri dari
self-assembling protein. melalui bioteknologi, kita bisa menggunakan sifat self assembling dari partikel
Self-assembling, protein-based
ini untuk menghasilkan shell assembling and enzyme packaging. Upon appropriate engineering of the
intracellular
building blocks, they could act as a new family
bacterial organelles: emerging
of self-assembled, protein-based vehicles in Nanomedicine to encapsulate, target and deliver
vehicles for
therapeutic cargoes
encapsulating, targeting and
to specific cell types and/or tissues. This would provide a new, intriguing platform of microbial origin for
delivering
Jos L Corchero and Juan
drug
The Monica Adi P.
1110064 sundeii_cream@yahoo.com therapeutical cargoes
Cedano
Corchero and Cedano Microbial Cell Factories 2011, 10:92 delivery.

21

Bernadus Singgih P

1110079

geradofs@yahoo.com

NMR Studies of Drug Interaction with


Membranes and MembraneAssociated Proteins

Yan Xu,Victor E.
Yushmanov,and Pei Tang

Bioscience Reports, Vol. 22, No. 2, April 2002 ( 2002)

Ulasan ini berfokus pada perkembangan terakhir dalam studi interaksi obat dengan membran biologis
dan membran-terkait protein menggunakan resonansi magnetik nuklir(NMR) spektroskopi dan teknik
spektroskopi lainnya. Penekanan ditempatkan pada kelasrendah afinitas neurologis agen
sebagaimana dicontohkan oleh anestesi umum volatile dan struktural terkait senyawa. Aspek teknis
ditinjau dari bagaimana mempersiapkan sistem membranemimetic dan pendekatan NMR yang baik
digunakan saat ini atau membuka baru prospek.Pada konsentrasi klinis yang relevan, anestesi
menghambat baik glutamat dan GABA rilis, sementara nonanesethetic strukturnya sama ditekan hanya
rilis glutamat. NMR dapat digunakan untuk mengukur fluks ion melalui membran saluran di organ utuh
terisolasi, seperti yang dicontohkan oleh 87 RB, 23 Na, dan 31 P studi NMR efek cardioselective
pembuka saluran antiischemic (misalnya, pinacidil dan cromakalim) pada yang ion fluks melalui ATPsensitif saluran + K dalam hati tikus. Dengan demikian, studi NMR mekanisme molekuler dari interaksi
obat-membran menggunakan sistem membran model, dikombinasikan dengan studi tentang sistem
biologis alami, dan pada akhirnya dapat mengakibatkan pemahaman yang lebih lengkap membran
yang berhubungan dengan proses dalam organisme hidup.

No

Name

Nrp

Email account

Title

Author (s)

Siti Efrina Dwi


3 Kurnia

Physical Chemistry of
Biological Free Energy
Transduction As
arasatif@gmail.co Demonstrated by Elastic
1110211 m
Protein-Based Polymers Dan W. Urry
Cyril Prknyi,
Michelle R. StemBeren, Omar R.
Martnez, JeanSolvatochromic
Jacques Aaron,
correlations and ground- Mihaela
and excited-state dipole Bulaceanubeztytjung@ymail.c moments of curcuminoid MacNair, Antonio
1110296 om
dyes
F. Arrieta
John M. Peltier,
Srdjan Askovic,
Robert R. Becklin,
Cindy Lou
Chepanoske, YewSeng J. Ho,
Vladimir Kery,
Shuping Lai,
Tahmina Mujtaba,
Mike Pyne, Paul B.
Robbins, Moritz
von Rechenberg,
Bonnie Richardson,
Justin Savage,
Peter Sheffield,
Sam Thompson,
An integrated strategy for Lawrence Weir,
the discovery of drug
Kartika Widjaja,
targets by the analysis of Nafei Xu, Yuejun
finafi_finafi@yahoo. proteinprotein
Zhen, J. Jay
1110354 com
interactions
Boniface, et al.

4 Rio Fernandes Tan

John J. Dwyer*, ,
Apostolos G.
Gittis*, Daniel A.
Karp*, Eaton E.
High Apparent
Lattman*, Daniel S.
DielectricConstants in the Spencer, Wesley
rio_cr1tz@yahooo. Interior of a Protein
E. Stites, Bertrand
1110286 com
Reflect Water Penetration Garca-Moreno E.

1 Larasati W

Zsa-Zsa Besty
2 Oematan

Journl, year,
Volume, issu,
page

Deskripsi singkat
pada polimer berbasis protein terdiri dari mengulangi urutan peptida,
ulasan penelitian dari laboratorium penulis meliputi jangka waktu lebih
dari dua dekade, melainkan menyajikan mekanisme umum untuk
protein Folding dari fungsi dan menunjukkan mekanisme dengan
merancang protein modal yang mampu melakukan banyak konversi
J. Phys. Chem. B, energi yang menopang kehidupan dengan merancang mesin
1997, 101 (51), pp biomolekuler beragam dan bahan dengan aplikasi yang menjanjikan
1100711028
bagi masyarakat.
Spectrochimica
Acta Part A:
Molecular and
Biomolecular
Spectroscopy,
Volume 60, Issues
89, July 2004,
Pages 1805-1810

International
Journal of Mass
Spectrometry,
Volume 238, Issue
2, 1 November
2004, Pages 119130

Biophysical
Journal, Volume
79, Issue 3,
September 2000,
Pages 1610-1620

Momen dipol eksperimental curcumin (1) dan senyawa


dicinnamoylmethane induknya (2) ditentukan dalam dioksan dan
benzene, masing-masing. Momen dipol teoritis dihitung menggunakan
kombinasi metode PPP (-saat ini) dan jumlah vektor dari -ikatan
momen (-momen) serta oleh ZINDO / 1 metode. Korelasi
Solvatochromic digunakan untuk mendapatkan pertama percobaan
bersemangat singlet-negara momen dipol. Spektrum serapan
eksperimental elektronik dibandingkan dengan transisi dihitung.

Proteomik berbasis teknologi memiliki potensi untuk mempercepat


pengembangan obat, namun teknologi tersebut harus terintegrasi
dengan baik dalam memiliki dampak positif.Proses untuk menemukan
interaksi protein protein menunjukkan bahwa tahapan proses yang
saling ketertergantung dan dapat mempengaruhi, baik secara positif
maupun negatif.
Sebuah asam glutamat ditanamkan di inti hidrofobik dari staphylococcal
nuklease dengan penggantian Val-66. PKa yang diukur dengan metode
termodinamika ekuilibrium yaitu 4,3 unit lebih tinggi dari pKa Glu dalam
air. Peningkatan ini sebanding dengan pKa dari 4,9 unit diukur
sebelumnya untuk lisin ditanamkan di lokasi yang sama. Menurut
formalisme Born ini pKa yang penuh semangat setara dengan transfer
gugus dibebankan dari air ke media dielektrik konstan 12. Sebaliknya,
konstanta dielektrik statis bubuk protein kering berkisar dari 2 sampai 4.
Dalam struktur kristalografi dari mutan V66E, rantai molekul air terlihat
bahwa hidrat yang terkubur Glu-66 dan menghubungkannya dengan
pelarut massal. Molekul-molekul air yang tertanam sebelumnya belum
pernah telah terdeteksi di> 20 struktur nuklease. Struktur dan
energetika diukur merupakan bukti eksperimental kuat dan belum
pernah terjadi sebelumnya bahwa penetrasi pelarut dapat memberikan
kontribusi signifikan terhadap polarisabilitas jelas tinggi di dalam
protein. Untuk meningkatkan perhitungan struktur berbasis efek
elektrostatik dengan metode kontinum, akan perlu belajar untuk
menjelaskan secara kuantitatif untuk kontribusi oleh penetrasi pelarut
untuk efek dielektrik di dalam protein.

5 Ayu Kristianingsih

6 Rizki Amalia

7 Amirul Mu'minin

Buah merah secara komersial dapat diperoleh dalam ekstrak (minyak)


bentuk dan minyak berkapsul (softcapsule). Dalam bentuk minyak,
produk ini memiliki ketahanan yang lebih rendah dan stabilitas terhadap
cahaya, oksigen panas,, dan kondisi lingkungan yang ekstrim karena
isinya senyawa antioksidan kelompok mudah terdegradasi aktif. Buah
Merah esensi produk berbasis telah pernah diperkaya ke dalam produk
makanan lainnya, tetapi hanya diperkaya menjadi minyak goreng untuk
meningkatkan tingkat karoten. Salah satu alternatif untuk mengatasi
masalah ini mengacu pada mikroenkapsulasi. Mikroenkapsulasi berarti
proses membungkus satu partikel sentral tertentu dengan bahan lain
untuk mencapai karakteristik fisik dan kimia diharapkan.
Mikroenkapsulasi Metode yang digunakan dalam penelitian ini telah
semprot pengeringan. Penelitian ini disusun dengan menggunakan
Rancangan Acak Lengkap yang terorganisir dalam pola faktorial yang
melibatkan dua faktor. Faktor pertama meliputi bahan pelapis (protein
kedelai mengisolasi dan Na-caseinate), sedangkan faktor kedua buah
memerlukan proporsi minyak merah (20%, 30%, dan 40%). Analisis
meliputi kadar air, -karoten, mikro, efisiensi mikroenkapsulasi, hasil,
aktivitas antioksidan, dan stabilitas mikrokapsul terhadap temperatur.
Hasil analisis menunjukkan bahwa mikrokapsul dengan Na-caseinate
memiliki kualitas yang lebih baik dibandingkan dengan membungkus
dengan protein kedelai mengisolasi. Perlakuan terbaik berasal dari
kombinasi pengobatan dengan Na-caseinate pembungkus dalam
proporsi minyak buah merah 20%. Mikrokapsul dengan pengobatan
terbaik memiliki kadar air 1,34%, -karoten dari 580,42 mg / g,
Characteristics and
mikrokapsul ukuran 36,98 m, efisiensi mikroenkapsulasi dari 95,59%,
Antioxidant Stability of
dan 93,37% dari hasil. Proses mikroenkapsulasi minyak buah merah
Red Fruit
Willy Yanuwar,
Jurnal Teknologi
dengan Na-caseinate di proporsi 20% dapat digunakan sebagai
(Pandanus conoideus
Simon Bambang
Pertanian, Vol, 8
alternatif untuk memfasilitasi proses distribusi, untuk meningkatkan
ayu.kristia@ymail.c Lam) Protein Based
Widjanarko, dan Tri No.2 (Agustus
daya simpan produk, dan proses produk fortifikasi ke dalam produk
1110295 om
Microcapsule
Wahono
2007) 127-135
makanan lainnya.
Kelarutan adalah fenomena pembubaran solid dalam fase cair untuk
memberikan suatu sistem homogen dan merupakan salah satu
parameter penting untuk mencapai konsentrasi yang diinginkan dari
obat dalam sirkulasi sistemik untuk respon farmakologis. Buruk larut
dalam air obat setelah pemberian oral sering membutuhkan dosis tinggi
untuk mencapai konsentrasi plasma terapeutik. Bioavailabilitas obat
oral tergantung pada kelarutan dalam media air selama rentang pH
yang berbeda. Laju disolusi cukup obat adalah faktor pembatas dalam
Atul Kumar Gupta*
bioavailabilitas oral buruk senyawa larut dalam air. Berbagai teknik
and Susheel
Int. J. of Pharm. & yang digunakan untuk peningkatan kelarutan air, laju disolusi, dan
Kumar Sehrawat
Life Sci. (IJPLS),
bioavailabilitas buruk obat larut air termasuk mikronisasi, modifikasi
Bioavailability
M. M. College of
Vol. 2, Issue 3:
kimia, penyesuaian pH, dispersi padat, kompleksasi, co-solvabilitas,
enhancement of poorly
Pharmacy, M. M.
March: 2011, 640- solubilisasi misel, hydrotropy dll Tujuan dari Artikel review adalah untuk
water soluble drugs: A
University, Mullana, 650
menggambarkan teknik solubilisasi untuk pencapaian penyerapan yang
1110341 review
(Haryana) - India
641
efektif dengan bioavailabilitas ditingkatkan.
Department of
Chemistry Stanford
UniVersity
Penyerapan spektrum terpolarisasi kristal ortorombik untuk
Stanford, California memperoleh informasi tentang arah dari elektronik, transisi momen
94305dipole (mb) dari kromofor relatif terhadap sumbu molekul. Transisi
5080ReceiVed
dipole Orientasi sejenak adalah parameter spektroskopi dasar relevansi
Polarized Absorption
August 15, 2002;
ahli biologi ketika menafsirkan Fo rstertype Data fluoresensi energi
Spectra of Green
ReVised
resonansi transfer dan untuk membandingkan serapan dan spektrum
Fluorescent Protein
Manuscript
fluoresensi. GFP dengan perhitungan kuantum kimia, Kepunahan
Single Crystals:
Federico I. Rosell ReceiVed
maksimal diperoleh seluruh spectrum bila arah polarisasi vektor listrik
amex_devil@yahoo Transition Dipole Moment and Steven G.
NoVember 12,
dari cahaya insiden itu sejajar dengan sumbu c-dari kristal. Momen
1110267 .com
Directions
Boxer
2002
transisi dipole diasumsikan sejajar dengan bidang kromofor.

Jene Vida
8 Christanti

Momen dipol listrik dari sembilan


turunan N N-dimethylaniline yang
ditentukan secara eksperimental dalam larutan benzena sesuai dengan
metode
literatur. Momen dipol teoritis dari senyawa ini dihitung dari perkiraan
orbital
molekul menurut Del Re -elektron pengobatan, metode -elektron
Hkel,
pengobatan Pariser-Parr-Pople, pengabaian secara lengkap dari
metode
Comparison between
diferensial tumpang tindih, dan kombinasi yang dipilih dari metode ini.
theoretical
Parameter tidak dilaporkan sebelumnya ditentukan untuk kelompok
and experimental electric
nitro dengan
dipole moments of
reproduksi momen dipol eksperimental untuk digunakan dalam
selected
N,
perhitungan Re Del.
N-dimethylaniline
Perbandingan antara momen eksperimental dan teoritis
derivatives
mengindikasikan bahwa
Journal of
kombinasi dari metode Re Del -elektron-elektron dan metode
(Perbandingan antara
John M.
Pharmaceutical
Huckel memberikan reproduksi terbaik dari
teori dan eksperimen
Clayton1,, George Sciences
nilai momen dipol eksperimental ketika sedang jauh lebih murah dalam
momen dipol
E. Bass1, William
hal ukuran
listrik dari beberapa
P. Purcell1,*,
Volume 63, Issue komputer dan waktu, serta membutuhkan waktu sedikit dalam
turunan N, NClifton C.
2, pages 230234, mempersiapkan data
vidajene@yahoo.co dimethylaniline)
Thompson2
February 1974
daripada metode yang lebih canggih yang diperiksa.
1120228 .id
Influence of vehicle
dielectric
properties on
acetaminophen
bioavailability from
polyethylene glycol
suppositories

Jene Vida
10 Christanti

(Pengaruh penggunaan
media alat dielektrik
pada bioavailabilitas
acetaminophen dari
supositoria polietilen
vidajene@yahoo.co glikol)
1120228 .id

Penyerapan dengan
pemberian melalui dubur dari acetaminophen dari larutan berbahan
dasar air dan
dari beberapa bentuk berbasis polietilen glikol , dosis dipelajari pada
enam
subyek manusia menggunakan pengukuran ekskresi urin.
Journal of
Pharmaceutical
Sciences
Shrikant N. Pagay, Volume 63, Issue
Rolland I. Poust*, 1, pages 4447,
John L. Colaizzi
January 1974

Hubungan
yang diamati antara bioavailabilitas acetaminophen dan sifat dielektrik
dari alat-alat
yang digunakan. Dipelajari pula tingkat disolusi rata-rata in vitro
acetaminophen dalam bentuk sediaan tersebut dan terkadang/
beberapa terkait dengan waktu
terjadinya laju ekskresi urin maksimal.
Elektron resonansi paramagnetik (EPR) spektroskopi dan dinamika
molekul (MD) simulasi digunakan untuk menyelidiki dinamika
chymotrypsin-dalam pelarut mulai konstanta dielektrik 72-1,9. EPR
pengukuran menunjukkan bahwa gerakan di sekitar dua spin-label
asam amino (Met-192 dan Ser-195) menurun drastis dengan
penurunan konstanta dielektrik pelarut,
kecenderungan yang konsisten dengan perubahan
gaya elektrostatik
antara residu dibebankan protein. Hasil EPR dan simulasi MD
mengungkapkan sangat mirip fungsional ketergantungan antara tingkat
gerak dalam protein dan konstanta
dielektrik dari pelarut massal. namun, gerakan prediksi atom protein
yang
nyata lebih cepat diukur gerakan label berputar. Secara
umum, di bawah atom dielektrik konstan banyak protein
bergerak lebih perlahan-lahan, dan banyak residu paling lambat yang
dekat eksterior.

9 M.Ainun Azhar

RHETT AFFLECK,
CHARLES A.
HAYNES, AND
ainunazhar@ymail. Solvent dielectric effects DOUGLAS S.
1110343 com
on protein dynamics
CLARK

Proc. Nati. Acad.


Sci. USA Vol. 89,
pp. 5167-5170,
June 1992
Biochemistry

Hasil ini menunjukkan bahwa dinamika


dapat berkontribusi bukan dari sifat biasanya, misalnya : dimodifikasi
Stereoselektivitas-of enzim dalam pelarut organik yang hampir kering.

10 Firman Dwi S

11 Agus Harizani

12 Wisian Nugraha

Skala oksida logam komplementer semikonduktor (CMOS) transistor


telah menyebabkan lapisan silikon dioksida yang digunakan sebagai
gerbang dielektrik menjadi sangat tipis (1.4 nm) saat ini kebocoran
terlalu besar. Hal ini diperlukan untuk menggantikan SiO2 dengan
lapisan fisik tebal oksida konstanta dielektrik yang lebih tinggi () atau
'tinggi K' gerbang oksida seperti oksida hafnium dan hafnium silikat.
Sedikit yang diketahui tentang oksida seperti, dan segera menemukan
bahwa dalam banyak hal mereka memiliki sifat elektronik kalah dengan
SiO2, seperti kecenderungan untuk mengkristal dan konsentrasi tinggi
cacat elektronik. Penelitian intensif sedang dilakukan untuk
mengembangkan oksida menjadi baru bahan berkualitas tinggi
elektronik. Ulasan ini mencakup pilihan oksida, struktural dan perilaku
Eur. Phys. J. Appl. metalurgi, difusi atom, deposisi mereka, struktur dan antarmuka reaksi,
Phys. 28, 265291 struktur elektronik mereka, ikatan, offset band, degradasi mobilitas,
(2004)DOI:
tegangan pita datar bergeser dan elektronik cacat. Penggunaan oksida
firmandwi008@yah High dielectric constant
10.1051/epjap:200 K tinggi dalam kapasitor yang dinamis memori akses acak juga tertutup.
1110247 oo.com
oxides
J. Robertsona
4206
Efek muatan-stabilisasi terkait dengan-heliks di protein telah diperiksa
ulang dengan mikroskopis perhitungan tanpa asumsi apriori tentang
dielektrik konstan protein. Mereka juga
menunjukkan bahwa dielektrik yang
efektif konstan untuk helix-charge interaksi yang jauh lebih besar dari
sebelumnya
diasumsikan dan bahwa efek menstabilkan helix tidak terkait dengan
helix macrodipole melainkan dengan
dipol lokal beberapa
terbatas terutama untuk giliran pertama dari helix. Sekarang
JOHAN AQVIST*t,
menunjukkan bahwa efek yang relatif pendek berkisar dari helix pada
HARTMUT
Proc. Natl. Acad.
dasarnya mirip dengan kasus-kasus lain di mana dipol lokal memainkan
LUECKEf,
Sci. USAVol. 88,
peran kunci
Dipoles localized at helix FLORANTE A.
pp. 2026-2030,
dalam stabilisasi
agusharizani@yah termini of proteins
QUIOCHOt, AND March
elektrostatik.
1110204 oo.co.id
stabilize charges
ARIEH WARSHEL* 1991Biophysics
Scaling hukum yang diturunkan untuk saat waktu-rata dipol
magnetik dalam berputar konveksi-driven model dinamo numerik.
Dua rezim yang berbeda ditemukan Reynolds kritis magnetik untuk
onset kerja dinamo. Pada rezim pertama medan magnet eksternal
dipole dominant, sedangkan untuk fluks apung yang lebih besar atau
rotasi lambat bidang eksternal didominasi oleh multipol tinggi dan dipole
Saat berkurang dengan faktor 10 atau lebih dibandingkan dengan
rezimdi pole. Dinamo dipole Reversing cenderung mengelompok di
Received 26
dekat transisi multipolar, yang ditampilkan bergantung pada parameter
January 2006;
nomor Rossby lokal. Geodynamo terletak dekat dengan transisi ini,
received in revised menunjukkan penjelasan untuk pembalikan polaritas dan kemungkinan
form 10 July 2006; sejarah lemah awal Bumi dipol. Dinam internal dipanaskan
accepted 3 August menghasilkan momen dipol kecil secara keseluruhan dan menunjukkan
2006Available
transisi bertahap dari dipole ke negara multipolar. Kami skala hasil
Dipole moment scaling
Peter Olson a,,
online 18
urutan besarnya kesepakatan dengan momen dipol Bumi, Jupiter,
wisiannugraha@g for convection-driven
Ulrich R.
September
Saturnus, Uranus, Neptunus, dan
1110302 mail.com
planetary dynamos
Christensen b
2006Editor: S. King Ganymede, dan memprediksi multipolar-jenis dinamo untuk Mercury.

13 Abdunnafi' Budiana

14 M. Bahrul Ulum

Tim protein alfa / beta kali lipat barel dari alfa / beta kelas seperti yang
diberikan dalam database SCOP diambil untuk analisis momen dipol.
Dalam semua, 32 struktur werw dianalisis untuk Iuran dipol mereka
saat. Perwakilan struktur dari 2020 keluarga super di alfa / beta kali
lipat, dengan fungsi enzim yang berbeda dan domain protein 12
keluarga TIM dianggap. Situs aktif protein ini terletak pada sisi Cterminal dari untaian beta. Molekul-molekul yang sama dari alfa / beta
kali lipat, namun berbeda dalam fungsi mereka juga menunjukkan pola
medan elektrostatik umum sepanjang sumbu barel dan memiliki momen
dipol sepanjang sumbu barel dan menuju C-terminal akhir starnds beta.
Namun, hal ini dilihat dari perhitungan kami bahwa arah momen dipol
mungkin adalah konsekuensi dari flip struktural, dengan distribusi biaya
memainkan peran modulatory, dan tidak memberikan kontribusi ke
lokasi situs aktif. Kami menunjukkan di sini bahwa selain dari
pandangan umum seperti yang diusulkan oleh Hol et al [Ho1 WGL, van
Duijnen PT dan Berendsen HJC (1978) Nature (London),, 273 443-446]
dari peran saat heliks alfa dipol, lembar beta dalam tong juga dapat
recived 16 january memiliki kontribusi yang cukup besar momen dipol. Diambil bersama2003 ; resived 24 sama dengan analisis dipol kami pada protein membran integral
februari 2003
[Vasanthi G dan Krishnaswamy S (2002) India J Biochem Biophys 39,
alfaeastbonastar@ Dipole moment in time
G.Vasanthi and
;accepted 28 april 93-100] ini menunjukkan kebutuhan untuk memeriksa peran momen
1110250 yahoo.com
alfa/ beta fold protein
Krishnaswamy
2003
dipol dalam kasus terutama lembar beta membentuk barel
Di sini, kami menerapkan "diinduksi-fit" protokol untuk meningkatkan
model homologi dari 5-HT2A reseptor, dan kami menilai kualitas modelXingyu Lin , Ximodel dalam skrining maya retrospektif. Selanjutnya, kita komputasi
Ping Huang ,
disaring molekul obat yang disetujui FDA terhadap induksi-cocok 5Gang Chen , Ryan
HT2A model dan memilih top hits enam skor untuk tes eksperimen.
Whaley , Shiming
Anehnya, Eksplorasi awal kami SAR mendukung modus mengikat
Peng , Yanli
J. Med. Chem.,
diprediksi dan selanjutnya menyarankan sorafenib menjadi senyawa
Wang , Guoliang 2012, 55 (12), pp timbal baru untuk penemuan ligan 5HTR. Meski telah dikenal bahwa
Life Beyond Kinases:
Zhang , Simon X. 57495759 DOI:
sorafenib menghasilkan efek antikanker melalui penargetan kinase
Structure-Based
Wang , Shaohui
10.1021/jm300338 beberapa, studi eksperimental hati-hati dirancang yang diinginkan untuk
Discovery of Sorafenib as Wang , Bryan L.
m Publication Date sepenuhnya memahami apakah yang "off-target" 5-HTR kegiatan
Bahrulmblendes@y Nanomolar Antagonist of Roth , and Niu
(Web): June 13,
mengikat berkontribusi terhadap keberhasilan terapi atau efek samping
1110305 ahoo.co.id
5-HT Receptors
Huang *
2012
yang tidak diingini.

15 Lilis Rahmawati

16 Lydia Maria Bili


Laila Nur
17 Hidayatulloh

18 Dea Ristya Ananda

Dalam dekade terakhir, tirosin kinase limpa (Syk) telah menunjukkan


potensi tinggi untuk penemuan pengobatan baru untuk gangguan
inflamasi dan autoimun. Inhibitor Farmakologi potensi bantalan situs
Syk katalitik terapi telah dikembangkan, dengan spesifisitas namun
terbatas terhadap Syk. Untuk membahas masalah ini, kami memilih
untuk desain obat seperti senyawa yang bisa menghambat interaksi
Syk dengan mitra selular tetap menjaga protein kinase yang aktif. Untuk
mencapai hal ini tugas yang menantang, kami menggunakan potensi
yang kuat dari antibodi intraseluler untuk modulasi fungsi sel in vivo,
dikombinasikan dengan struktur-berbasis di skrining silico. Dalam studi
sebelumnya, kami melaporkan anti-alergi sifat G4G11 antibodi
intraseluler. Dengan tujuan menemukan meniru fungsional G4G11,
kami mengembangkan Assay Pemindahan Antibodi dan kami
mengisolasi senyawa obat-seperti C-13, dengan menjanjikan in vivo
anti-alergi aktivitas. Rongga mengikat kemungkinan senyawa ini
terletak di sekitar dekat G4G11 epitop, jauh dari situs katalitik Syk. Di
sini kita melaporkan layar virtual koleksi 500.000 molekul melawan
rongga baru, yang menyebabkan isolasi dari 1000 senyawa kemudian
dievaluasi dalam efek penghambatan in vitro menggunakan Assay
Pemindahan Antibodi. Delapan puluh lima senyawa yang dipilih dan
dievaluasi karena kemampuan mereka untuk menghambat
pembebasan mediator alergi dari sel mast. Di antara mereka, 10
Bruno O.
senyawa menghambat degranulasi dengan nilai IC50 10 pM.
Villoutreix1,
Senyawa yang paling bioaktif menggabungkan aktivitas biologis,
Tyrosine Kinase Syk
Guillaume
journal.pone, 2011, penghambatan yang signifikan dari afinitas antibodi mengikat dan kuat
Non-Enzymatic Inhibitors Laconde1, David
Received: April 22, untuk Syk. Selain itu, molekul-molekul menunjukkan potensi yang baik
and Potential Anti-Allergic Lagorce1, Pierre
2011; Accepted:
untuk bioavailabilitas oral dan tidak kinase inhibitor situs katalitik.
Drug-Like Compounds
Martineau2,3,4,5,6, May 19, 2011;
Senyawa bioaktif dapat digunakan sebagai titik awal untuk
lilis_rahmawati13@ Discovered by Virtual and Maria A. Miteva1, Published: June 20, pengembangan kelas baru non-enzimatik inhibitor Syk dan untuk
1110291 yahoo.co.id
In Vitro Screening
Piona Dariavach
2011
penemuan obat usaha di bidang gangguan peradangan terkait.
Teori perkembangan terbaru memungkinkan prediksi 1H, 13C, 15N,
dan 19F nuklir pergeseran kimia resonansi magnetik dalam protein dan
menawarkan cara-cara baru menganalisis struktur sekunder dan tersier
serta untuk menyelidik elektrostatika protein. Untuk 13C, phi, psi sudut
torsi mendominasi perisai untuk C alpha dan beta C, namun
penambahan ikatan hidrogen dan elektrostatika memberikan sesuai
bahkan lebih baik dengan eksperimen. Untuk 15NH, sisi rantai (chi 1)
sudut torsi juga penting, seperti efek tetangga terdekat urutan,
Secondary and tertiary
Science 4 June
sedangkan untuk 1HN, ikatan hidrogen sangat signifikan. Untuk 19F,
structural effects on
1993, Vol. 260 no. bidang elektrostatik lemah atau jangka panjang mendominasi
protein NMR chemical
5113 pp. 1491nonequivalencies perisai 19F. Kemampuan untuk memprediksi
lydiabl87@yahoo.c shifts: an ab initio
AC de Dios, JG
1496
perubahan kimia dalam protein dari struktur yang diketahui atau tes
1110306 om
approach
Pearson, E Oldfield
membuka jalan baru untuk perbaikan atau penentuan struktur
Dipole moments and
eksperimen momen dipol diukur dalam benzena anhidrat dan dioksan,
conformational structures
dibandingkan dengan perhitungan yang sama dengan 2- subtituen
lala_noer@yahoo.c of 2-substituted
Levayer C, Galy
J Pharm Sci. 1980 derivat phenotiazine. Momen dipol dan efek pelarut mendukung
1110347 o.id
phenothiazines as solutes AM, Barbe J.
Jan;69(1):116-7
keberadaan campuran konformasi senyawa sebagai zat terlarut.
Penemuan obat baru saat ini sangat populer dengan potensi besar
untuk memajukan penelitian biomedis dan genomik kimia. Eksperimen
Joshi.B,
untuk menemukan obat baru dengan menganalisis berbagai struktur
Gupta.G,Gupta.N, International
protein,sifat,dan fungsi dari protein dan dapat terlihat GPCRs ( G
Gupta.M,Triveti.S, Journal Of Drug
Protein Coupled Receptor) sebagai penelitian obat komposisinya 60 %
Patil.P, Jhadav.A, Discovery,ISSN
dalam permukaan sel. nanoteknologi dan kristalografi protein
Vamsi.KK,.Khairnar :0975 - 4423,
mendukung dalam penentuan identifikasi dan penentuan calon molekul
dearistya@ymail.co Protein Based Drug
Y.,Boraste
Volume 1, Issue 2, obat baru. Keberadaan tersebut mendukung keberhasilan dalam
1110309 m
Discovery
A.,Mujapara A,.
2009, pp - 40 -51 penemuan obat baru seperti inhibitor.

Fawandi Fuad
19 Alkindi

20 I Nyoman Artawan

21 Gede Yudha Sugita

22 Michelle Wenas

Roesmala
23 Sukmaningtyas

Studi sebelumnya telah menekankan peran saat polarisabilitas dan


listrik molekul, momen dipol dan terutama quadrupole, di tempat
berikatannya obat. Sebuah publikasi terbaru dari ED50s yang
mencegah respon terhadap stimulus berbahaya selama delapan
fluorobenzenes telah memungkinkan untuk membandingkan potensi
anestesi dengan perhitungan ab initio Hartree-Fock dari polarisabilitas
molekul serta momen dipol dan quadrupole. Fluorobenzenes
menyediakan tes ketat peran saat listrik dalam potensi anestesi karena
momen dipol individu berkisar 0-2,84 Debye (D), sementara saat
quadrupole benzena besar dan negatif (-30 10-40 C m2), yaitu
hexafluorobenzene besar dan positif (30 10-40 C m2), dan bahwa
dari 1,3,5-trifluorobenzene hampir nol. Kami menemukan bahwa
potensi anestesi fluorobenzenes tidak terpengaruh oleh adanya baik
momen dipol atau quadrupole. Hasil ini cukup mengejutkan karena
Contributions of dipole
fluoroalkanes dan fluorocycloalkanes yang paling ampuh ketika
moments, quadrupole
Biophysical
setengah fluorinated dan biasanya tidak anestesi saat perfluorinated.
moments, and molecular
Chemistry, Volume Hasil penelitian menunjukkan bahwa interaksi elektrostatik tidak penting
polarizabilities to the
73, Issues 12, 13 bagi pengikatan fluorobenzenes di anestetik site dan anestetik site
alkindijoe@yahoo.c anesthetic potency of
July 1998, Pages tersebut berbeda dengan yang mengikat anestesi biasanya.
1110290 om
fluorobenzenes
James R Trudell
7-11
Dhruthiman R.
JOURNAL OF
Tujuan untuk mengetahui perilaku linear peningkatan konduktivitas
Mantheni, M. P. K. THERMAL
ionik sebelum mencair suhu diamati untuk bahan farmasi aktif , bahan
Maheswaram,
ANALYSIS AND
kimia organik, asam amino, dan karbohidrat. Kami telah menemukan
Hany F. Sobhi,
CALORIMETRY
sifat konduktivitas listrik baru dan variasi analisis fisik yang dapat
Naullage Indika
Volume 108,
menyebabkan rute sintetis yang unik dari entitas kimia tertentu.
Solid state studies of
Perera, Alan T.
Number 1 (2012), Penelitian ini difokuskan pada frekuensi 0,1 sampai 10 Hz, karena
drugs and chemicals by Riga, M. Ellen
227-233, DOI:
konduktivitas pada frekuensi ini berhubungan dengan analisis
inyomanartawan17 dielectric and calorimetric Matthews and K.
10.1007/s10973permukaan. Sifat fisik baru yang mengarah ke baru prosedur sintetik
1110356 5@yahoo.com
analysis
Alexander
011-1423-y
elektro untuk memodifikasi atau mempersiapkan bahan kimia.
Rheological and dielectric
Journal of
characterization of
Giulia
Pharmaceutical
monoolein/water
Bonacucina1,
Sciences Volume
mesophases in the
Giovanni F.
94, Issue 11, pages Tujuan dari kajian ini adalah membandingkan 2 tehnik, yaitu oscillatory
eide_yudhsu@yah presence of a peptide
Palmieri1, Duncan 24522462,
rheology dan analisis dielektrik pada gliseril monoolein / sistem air gel
1110351 oo.co.id
drug
Q.M. Craig2,*
November 2005
yang mengandung 10%, 22%, dan 30% b / b air.
Peptida berpotensi untuk mengobati berbagai macam penyakit yang
berasal dari sistem saraf pusat. Kenyataannya, peptida pada umumnya
larut dalam air dan tidak akan masuk ke dalam sistem saraf pusat
melalui difusi pasif, karena adanya penghalang darah-otak. Peptida
Ken A Witt,
juga dapat mengalami deaktivasi metabolik oleh peptidase, sehingga
Terrence J
semakin mengurangi manfaat terapeutik peptida. Telah dirumuskan
Peptide drug
Gillespie, Jason D Peptides Volume
fokus terbaru yaitu meningkatkan bioavailabilitas dan ambilan atau
modifications to enhance Huber, Richard D 22, Issue 12,
serapan otak. Fokus ini telah diuji pada beberapa strategi. Hasilnya
michelle_wenas@y bioavailability and blood- Egleton, Thomas P December 2001,
terdapat perbedaan keuntungan dan kerugian dari masing-masing
1110315 ahoo.com
brain barrier permeability Davis
Pages 2329-2343 strategi.
Efek dari bromadryl, dithiaden, chloroquine dan propranolol pada
trombin dirangsang agregasi trombosit tikus dan generasi tromboksan
B2 dibandingkan dengan empat terpilih fisiko-kimia parameter obat ini.
Agregasi trombosit terhambat dalam urutan peringkat potensi:
bromadryl> dithiaden> propranolol> klorokuin, yang berhubungan
dengan penurunan dalam biaya bersih dari kelompok metil-terminal
(atau etil-) dalam rantai samping dan dengan peningkatan dipol saat
molekul obat. Di lain sisi, urutan peringkat potensi dimana obat yang
diuji menghambat pembentukan tromboksan B2 (chloroquine>
dithiaden> bromadryl> propranolol) berkorelasi baik dengan penurunan
kebiasan molar obat. Tidak ada hubungan yang ditemukan antara efek
Inhibition of blood platelet
penghambatan obat-obatan dan koefisien partisi mereka. Hasil yang
functions by cationic
Volume 22, Issue disajikan menunjukkan bahwa penghambatan fungsi trombosit mungkin
amphiphilic drugs in
12, December
terdiri dari beberapa jenis obat-sel interaksi, tergantung pada struktur
tyas2308@yahoo.c relation to their physico2001, Pages
dan fisiko-kimia dari obat-obatan dan tidak dapat diperkirakan hanya
1110272 o.id
chemical properties.
23292343
berdasarkan koefisien partisi

Jason D Hubera,

Yosua Natar
24 Tampubolon

25 Yermi Njudang

Richard D
Egletona,
Thomas P Davis

Arginine kaya sel penetrasi peptida (CPPs) yang dapat memasuki selsel non-endocytotical, meskipun begitu pengangkutan muatan yang
melintasi membran harus secara resmi dikaitkan dengan kemunculan
hambatan yang energi sangat tinggi. Kami mempelajari partisi dari
turunan beberapa penetratin CPP dalam sistem dua-fase air-oktanol di
hadapan fosfolipid alami untuk mengeksplorasi jika solvasi dengan
pasangan ion untuk ion kontra hidrofobik dapat berfungsi sebagai
mekanisme untuk internalisasi sel. Kami menunjukkan bahwa lipid
anionik dapat membantu partisi peptida menjadi oktanol. Partisi sangat
efisien dalam oktanol diamati dengan penetratin yang kaya arginin
dibandingkan dengan turunannya yang kaya lisin. Mengganti
tryptophans untuk hasil phenylalanines di partisi yg kurang menjadi
oktanol, karena penurunan keseluruhan hidrofobisitas peptida. Partisi
yg menjadi oktanol tergantung pada jenis fosfolipid dan peptida yg
diinduksi perubahan struktural dalam majelis lipid yang ditemukan di
Counterion-mediated
oktanol. Lampiran carboxyfluorescein sebagai model kargo ditemukan
Membrane Penetration :
Biochimica et
untuk meningkatkan partisi peptida menjadi oktanol. Kami membahas
Cationic Cell-penetrating
Biophysica Acta
hasil kami sehubungan dengan energi elektrostatik teoritis, skala
Peptides Overcome Born
(2007) Volume:
hidrofobisitas empiris dan dalam hal implikasi untuk mekanisme
Energy Barrier by IonElin K Esbjrner,
1768, Issue: 6,
penyerapan CPP. Perbaikan penting dari energi transfer teoritis
jojhobreax@rocket pairing with
Per Lincoln, Bengt Publisher: Elsevier, diperoleh sesaat, bukan ion tunggal, penyisipan pada spesies dipolar
1110217 mail.com
Phospholipids.
Nordn
Pages: 1550-1558 yg berpasang ion dianggap.
pentingnya memahami interaksi protein-eksipien sebagai langkah awal
dalam merancang formulasi yang benar untuk menstabilkan dan
memberikan terapi obat dan vaksin berbasis protein. Metode biofisik
digunakan untuk memeriksa berbagai interaksi molekul antara zat
terlarut dan molekul protein dibahas dengan penekanan pada aplikasi
untuk eksipien farmasi dalam hal pengaruhnya terhadap stabilitas
protein. Mekanisme kunci dari protein-eksipien interaksi seperti
interaksi elektrostatik dan kation-pi, hidrasi preferensial, dan ikatan
hidrogen disajikan dalam konteks keadaan fisik yang berbeda dari
formulasi seperti cairan beku, solusi, gel, beku-kering padatan.
Gambaran dari kelas yang berbeda dari eksipien farmasi yang
Proteinexcipient
Tim J. Kamerzella, Advanced Drug
digunakan untuk merumuskan dan menstabilkan obat protein terapeutik
interactions: Mechanisms Reza Esfandiaryb, Delivery
juga disajikan bersama dengan alasan untuk digunakan dalam bentuk
and biophysical
1, Sangeeta B.
ReviewsVolume
sediaan yang berbeda termasuk pertimbangan khusus farmasi. Utilitas
characterization applied Joshib, C. Russell 63, Issue 13,
tinggi metodologi analisis untuk memeriksa interaksi protein-eksipien
yermi_njudang@ya to protein formulation
Middaughb, David October 2011,
disajikan dalam hal memperluas ruang formulasi desain dan
1110213 hoo.co.id
development
B. Volkinb, ,
Pages 11181159 mempercepat jadwal eksperimental

Name

1 Dikna Oktaverinda

2 Aida Fita A.

Langgeng Dewi
3 Ariani

4 Ratna efi Agustin

5 Filivia Okta Royani

Nrp

email account

1110188 dikna_na@yahoo.com

Title
Advances and challenges
in analytical
characterization of
biotechnology products:
Mass spectrometry-based
approaches to study
properties and behavior of
protein therapeutics

Author (s)

1110313

Role of the dielectric


constants of membrane
proteins and channel water Bastug Turgut and Kuyucak
in ion permeation
Serdar

1110346 langgeng.dewi@yahoo.com

Pharmacokinetics of
Peptide Mediated Delivery Weina Ma, Sheng Lu, Pei Pan,
ofAnticancer Drug
Parisa Sadatmousavi, Yongfang
Ellipticine
Yuan, P. Chen

1110243 Ratnaefi@ymail.com

Crystal structure of the


Leishmania major MIX
protein: A scaffold protein
that mediates
Michael A. Gorman, Alex D.
proteinprotein interactions Uboldi, Peter J.,et al

1110263 filivia_okta@yahoo.com

Structure-Based Drug
Design The Use of
Protein Structure in Drug
Discovery

Igor A. Kaltashov, Cedric E. Bobst,


Rinat R. Abzalimov, Guanbo
Biotechnology Advances, Volume
Wang, Burcu Baykal, Shunhai
30, Issue 1, JanuaryFebruary
Wang
2012

G. Lange

1110242 princesz_zincho@yahoo.co.id

Single molecule effects of


osteogenesis imperfecta
Alfonso Gautieri, Simone
mutations in tropocollagen Vesentini, Alberto Redaelli,
protein domains
Markus J. Buehler

7 Sari Narolita

1110311 narolita.sari@yahoo.co.id

Interplay of charge
distribution and
conformation in peptides:
comparison of theory and
experiment

8 Citra Hayu Adi M.

NMR Structure
Determination for Larger
citrahayuadimakayasa@yahoo. Proteins Using Backbone1110345 com
Only Data
Raman, et al.

6 Ratna Efa Agustin

Journl, year, Volume, issu, page Deskripsi singkat

Joanna Makowska, Katarzyna


Baginska, F. Kasprzykowski,
Jorge A. Vila, Anna Jagielska,
Adam Liwo, Lech Chmurzynski,
Harold A. Scheraga

Biologi spektrometri massa (MS) menawarkan berbagai pendekatan untuk


mempelajari struktur dan perilaku obat protein kompleks dan telah menjadi alat
standar untuk karakteristik struktur kovalen protein terapi, termasuk urutan dan
modifikasi pasca-translasi
Menggunakan solusi analisa yang diperoleh dari sistem yang disederhnakan dan
hasil numerik dari kasus yang pebih realitis dapat menyelidiki peran yang
dimainkan oleh konstnta dielektrik membran protein dan pori air ion permeasi di
saluran. Batas dan kelengkungan yng merupakan faktor penting dalam
Biophysical Journal. May 2003. Vol menentukan bagaimana energi potensial ion ini tergantung pada konstanta
84 2871-2882
dielektrik.
EPT diekstraksi dari plasma tikus dengan deksametason natrium fosfat sebagai
standar internal (IS). Parameter farmakokinetik telah diperoleh dengan
menggunakan tinggi tekanan kromatografi cair (HPLC). Signifikan perbedaan
parameter farmakokinetik utama antara EPT dan EAKEPT kompleks diamati,
menunjukkan bahwa kompleks dengan EAK memperpanjang waktu tinggal obat
dan memperbesar area di
Plos One , August 2012, vol 7,
bawah kurva konsentrasi-waktu (AUC). Ini berarti bahwa EAK dapat berfungsi
Issue 8, page 1-6
sebagai pembawa yang sesuai untuk meningkatkan bioavailabilitas EPT.
Infeksi dari Leishmania Trypanosoma dapat menyebabkan penyakit yang parah
yang nantinya dapat berakibat fatal bagi penderita. Hal ini sebagian besar
disebabkan karena resistensi terhadap obat. Dijurnal ini dijelaskan bahwa ada
protein membran yang ada dimitokondria yaitu MIX dapat dimanfaatkan untuk
Medical science. Volume 21 Issue infeksi yang disebabkan Leishmania Trypanosoma. MIX berbentuk seperti lipatan
9-September 2012 page 1241-heliks yang terdiri dari tujuh -heliks yang melipat ke dalam satu domain dan
1252
dapat digunakan sebagai alternatif penyakit tersebut.
Aplikasi yang paling umum dari struktur berbasis desain adalah optimalisasi
inhibitor lemah mengikat. Contoh termasuk yang high-throughput screening (HTS)
hits atau ligan alami seperti substrat atau transisi-state analog telah cocrystallized
dengan protein target mereka. Berdasarkan analisis yang cermat struktur tesis, itu
menunjukkan bagaimana potensi ligan mengikat dapat ditingkatkan dalam desain
berikutnya dan langkah-langkah sintesis. Selain itu, contoh dijelaskan yang
menunjukkan bahwa struktur berbasis desain obat dapat mendukung proses
Comprehensive Medicinal
penemuan obat pada tahap sangat terlambat. Berdasarkan struktur protein,
Chemistry II, 2007 , Volume 4 ,
modifikasi dari inhibitor dapat diusulkan yang telah menyebabkan inhibitor selektif
Pages 597-650
dan senyawa menghambat varian resisten dari protein target.
Osteogenesis imperfecta (OI) adalah penyakit genetik yang ditandai oleh tulang
rapuh, kelainan bentuk tulang, dan, dalam kasus yang parah, kematian perinatal
yang mempengaruhi lebih dari 1 dalam 10.000 orang. Jurnal ini menunjukkan
dengan simulasi atomistik penuh dalam pelarut eksplisit bahwa OI mutasi memiliki
pengaruh yang signifikan terhadap sifat mekanik molekul tropocollagen tunggal,
dan bahwa keparahan berbagai bentuk OI secara langsung berkorelasi dengan
pengurangan kekakuan mekanik molekul tropocollagen individu. Penurunan
kekakuan molekul memberikan wawasan ke dalam skala molekul mekanisme
penyakit. Analisis mekanisme molekuler menunjukkan bahwa parameter fisik-rantai
sisi volume dan indeks pengobatan air dari residu bermutasi mengontrol hilangnya
kekakuan mekanik molekul tropocollagen individu. Dalam jurnal ini mengusulkan
Biofisika Journal, Volume 18, Issue suatu model yang memungkinkan kita untuk memprediksi hilangnya kekakuan
1, pages 161168, January 2009 berdasarkan karakteristik fisik mutasi.
Keterkaitan antara distribusi muatan dengan konformasi fleksibel peptida dengan
membandingkan potensiometrik-titrasi secara teoritis dihitung dari kurva dua model
peptida Ac-Lys5-NHMe (model poli-L-lysine) dan Ac-Lys-Ala11-Lys-Gly2-Tyr-NH2
(P1) dalam air dan metanol, dengan kurva eksperimental. Kurva titrasi secara
Biopolymers (Peptide Science),
teoritis setuju dengan kurva eksperimental, jika di konformasi ikatan hidrogen
Volume 80, 214224 (2005) 2005 merupakan bagian penting dari ensemble jika tidak teori prediksi pH terlalu kecil.
Penentuan struktur protein dari data NMR sangat bergantung pada jarak sisi rantai
proton ke proton. Struktur dapat ditentukan secara akurat tanpa informasi NMR
pada rantai samping protein hingga 25 kiloDaltons,tetapi dengan memasukkan
pergeseran kimia backbone, sisa kopling dipol, dan jarak proton amida dalam
metodologi pemodelan struktur protein Rosetta. Data ini berfungsi untuk memandu
Science, 2010, Vol. 327, Issue
pencarian konformasi energi terendah, model rincian yang ditentukan oleh reaksi
5968, p. 1014-1018
kimia fisika dalam semua fungsi energi atom Rosetta.

Rizky Ayu Artama


Putri

1110262 mesra_rizky@yahoo.com

9
10 Siti Maghfiroh

1110284 citie_firoh35@yahoo.com

11 Wilujeng Aprillina

1110285 ujeng_april@yahoo.com

Evi Lestari

1110337 viesstarlie_vie@ymail.com

Comparison
of dielectric constant meter
with turbidity meter and
focused beam reflectance
measurement for
metastable zone width
determination

Guangwen He
Martin W. Hermanto
Martin Tjahjono
Marc Garland
Reginald B.H. Tan

Volume 90, Issue 2,


February 2012, Pages 259265

Karya ini menunjukkan proses rinci analisis teknologi (PAT) perbandingan studi
pengukuran
konstanta dielektrik dengan pengukuran kekeruhan dan balok pengukuran
reflektansi
terfokus (FBRM) dalam mendeteksi transisi fase selama kristalisasi dari tiga
solusi model, yaitu asam stearat-etil asetat, etanol dan parasetamol-karbamazepinmetanol.
Sebuah teknik kalibrasi dapat lebih diterapkan pada konstanta dielektrik untuk
meningkatkan keakuratan deteksi titik awan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa
meteran
konstanta dielektrik dapat diandalkan digunakan untuk penentuan lebar zona
metastabil
(MZW). Penelitian ini membuka peluang baru untuk penggunaan meteran
konstanta
dielektrik sebagai alat PAT sederhana dan murah alternatif untuk pemantauan
proses
kristalisasi solusi.
NMR and crystallographic Reema Alag, Insaf A. Qureshi,
Protein Science, 2010, Vol 19,
Obat imunosupresif FK506 menunjukkan aktivitas antimalaria. Mekanisme kerja
structures of the FK506
Nagakumar Bharatham, Joon
Issue 8, p.1577-1586
obat melibatkan interaksi molekul dengan protein target parasit PfFKBP35 dan
binding domain of human Shin, Julien Lescar, Ho Sup Yoon
PvFKBP35. FK506 binding protein (FKBP) merupakan bagian dari Plasmodium
malarial parasite
falciparum dan Plasmodium vivax. Saat ini, mekanisme molekul protein keluarga
Plasmodium vivax FKBP35
FKBP di dalam parasit masih tetap sulit dipahami. Untuk memahami fungsi mereka,
di sini kita telah menentukan struktur domain FK506 pengikatan Plasmodium vivax
(PvFKBD) dalam bentuk unliganded oleh spektroskopi NMR dan kompleks dengan
FK506 oleh X-ray kristalografi. . Kami menemukan bahwa parasit kelompok FKBP
memainkan peran biologis yang sama dalam siklus hidup mereka. Meskipun
kesamaan, perbedaan yang diamati dalam mode mengikat ligan antara PvFKBD
dan HsFKBP12, sebuah homolog FKBP manusia, dapat memberikan informasi
mendalam dalam merancang obat antimalaria selektif terhadap parasit.
Binding of ferredoxin to
Antonio R. De Pascalis, Ilian
Protein Science, 2008, Vol 2, Issue kecil, larut, (2Fe-2S)yang mengandung protein ferredoxin (Fd) menengahi transfer
ferredoxin: NADP +
Jelesarov, Friederike Ackermann, 7, p.1126-1135
elektron dari kloroplas fotosistem I ke ferredoxin: NADP + oksidoreduktase (FNR),
oxidoreductase: The role of Hans Rudolf Bosshard, Willem H.
sebuah flavoenzyme terletak di sisi stroma dari membran tilakoid. Ferredoxin dan
carboxyl groups,
Koppenol, Masakazu Hirasawa,
oksidoreduktase (FNR) membentuk kompleks 1:1, yang distabilkan oleh interaksi
electrostatic surface
David B. Knaff
elektrostatik antara residu asam dari Fd dan residu dasar FNR. diferensial
potential, and molecular
modifikasi kimia Fd digunakan untuk menemukan residu asam aspartat dan
dipole moment
glutamat pada antar muka antar molekul dari Fd: FNR kompleks (baik protein dari
bayam). Gugus karboksil dari Fd bebas dan FNR-terikat yang diamidasi dengan
carbodiimide/2-aminoethane asam sulfonat (taurin). Reaktivitas diferensial
kelompok karboksil dinilai dengan pelabelan isotop ganda. Residu dilindungi di Fd:
FNR kompleks adalah D-26, E-29, E-30, D-34, D-65, dan D-66. Ujung negatif dari
vektor momen dipol molekul dari Fd (377 Debye) dekat cluster besi-sulfur, di
tengah area dibatasi oleh kelompok karboksil. Momen dipol molekul dan potensi
permukaan asimetris dapat membantu untuk mengarahkan Fd dalam reaksi
dengan FNR. Untuk mendukung, kita menemukan domain untuk melengkapi
potensi elektrostatik positif di kedua sisi pusat FAD redoks FNR. Hasil
memungkinkan model ikatan untuk Fd: FNR kompleks yang akan dibangun.
Holo-neocarzinostatin (holo-NCS) adalah suatu protein kompleks pembawa antitumor enediyne kromofor cincin aktif oleh perancah yang terdiri dari
immunoglobulin-seperti tujuh- stranded anti-paralel -barrel. Karena kromofor labil
mencerminkan DNA yang sangat kuat terhadap aktivitas pembelahan dan
stabilisasi lengkap di kompleks, holo-NCS telah menarik banyak perhatian dalam
penggunaan klinis serta untuk sistem pengiriman obat. Kami menentukan struktur
tiga dimensi dari protein dan gerakan internal oleh NMR multinuclear untuk
menyelidiki mekanisme pelepasan. Eksperimen relaksasi NMR kompleks
menunjukkan struktur yang kaku untuk loop serta dengan -barel dalam larutan air.
Solution NMR Structure
Hiroyuki Takashima,
Kromofor menampilkan gerakan internal serupa sebagai bagian protein.
Investigation for Releasing Takuya Yoshida,
Perbandingan struktural antara struktur solusi halus dan struktur kristal x-ray
Mechanism of
Tetsuya Ishino,
menunjukkan perbedaan karakteristik. Kami mengusulkan mekanisme pelepasan
Neocarzinostatin
Katsumi Hasuda,
kromofor menggambarkan ikatan yang kuat dan cepatnya pelepasan kromofor.
Chromophore from the
Tadayasu Ohkubo, and
Vol. 280, No. 12, Issue of March
Kami menunjukkan bahwa kami bisa menjembatani sifat dinamis dan fitur struktur
Holoprotein
Yuji Kobayashi
25, pp. 1134011346, 2005
statis dengan asumsi kinetik sederhana untuk memecahkan fungsi biokimia.

1110298

Christophe L.M.J. Verlinde, Ethan


A. Merritt, Focco Van Den Akker,
Hidong Kim, Ingeborg Feil, Luis F.
Delboni, Shekhar C. Mande, Steve
Protein crystallography and Sarfaty, Philip H. Petra, Wim G.J.
infectious diseases
Hol

14 Alfina Illiyin

1110333 vina_miow@yahoo.com

The Effect of Protein


Relaxation on ChargeCharge Interactions and
Dielectric Constants of
Proteins

Valentina Puspa
15 Corniawanti

Calibration of dielectric
constant measurements to
improve the detection of
valentina_puspa@rocketmail.c cloud and clear points in
1110338 om
solution crystallization

12 Zela Selviana A

16 ARINI SHOLICHA

1110197 arsh_idiotclub@yahoo.com

Yuk Yin Sham, Ingo Muegge,


Arieh Warshel

Martin Wijaya Hermanto,


Guangwen He, Martin Tjahjonoa,
Pui Shan Chowa, Reginald B.H.
Tana, b, Marc Garlanda

Iron, Zinc, and Protein


Bioavailability Proxy
Measures of Meals
Prepared with Nutritionally
Enhanced Beans and
H. Pachn, D.A. Ortiz, C. Araujo,
Maize
M.W. Blair, J. Restrepo

Pertumbuhan yang pesat saat ini dalam jumlah 3 diketahui, struktur protein
dimensional memproduksi sebuah database dari struktur yang semakin berguna
sebagai titik awal untuk pengembangan molekul medis yang relevan baru seperti
obat-obatan, protein terapi, dan vaksin. Perkembangan ini indah digambarkan
dalam struktur, buku Protein baru-baru ini: Pendekatan Baru terhadap penyakit dan
terapi (Perutz, 1992). Ada janji yang besar dan berkembang untuk desain molekul
untuk pengobatan atau pencegahan berbagai macam penyakit, upaya yang
dimungkinkan oleh wawasan berasal dari struktur dan fungsi protein penting dari
organisme patogen dan dari manusia.
Kami hadir di sini 2 ilustrasi struktur, desain obat based. Yang pertama adalah
prospek pengembangan obat antitrypanosomal berdasarkan kristalografi, ligan,
binding, dan studi pemodelan molekul enzim glikolitik glycosomal dari
Trypanosomatidae. Organisme uniseluler bertanggung jawab untuk penyakit tropis,
termasuk trypanosomiases Afrika dan Amerika, serta berbagai bentuk
leishmaniasis. Karena enzim target juga hadir dalam inang manusia, proyek ini
merupakan studi perintis dalam desain selektif. Kasus kedua adalah ilustratif
prospek merancang anti, cholera obat berdasarkan analisis rinci tentang struktur
toksin kolera dan panas Escherichia coli terkait erat, labile enterotoksin. Potensi
obat tersebut dapat ditargetkan baik di situs reseptor mengikat toksin itu
menghambat atau menghalangi aktivitas katalitik intraseluler toksin itu.
Studi cholerae Vibrio dan racun E. coli berfungsi pada saat yang sama sebagai
contoh pendekatan umum untuk struktur, desain vaksin based. Racun ini
menunjukkan kemampuan luar biasa untuk merangsang sistem kekebalan mukosa,
dan hasil awal menunjukkan bahwa properti ini dapat dipertahankan oleh protein
fusi rekayasa berdasarkan struktur toksin asli. Tantangannya adalah demikian
untuk menggabungkan epitop dipilih dari patogen asing ke dalam kerangka asli dari
racun sehingga fitur penting dari kedua epitop dan toksin diselenggarakan. Artinya,
toksin dimodifikasi harus terus membangkitkan respon kekebalan yang kuat
Protein science, 2008, Vol. 3,
mukosa, dan respon ini harus diarahkan terhadap karakteristik konformasi epitop
Issue 10, p.1670-1686
dari patogen yang asli.
Pengaruh reorganisasi kelompok protein kutub pada biaya-biaya interaksi dan
dielektrik yang efektif yang sesuai konstan ( eff) diperiksa oleh versi
semimicroscopic dari Protein Langevin Dipole dipol (PDLD / S) metode dalam
kerangka Respon Linear Approximation (LRA). Hal ini dilakukan dengan
mengevaluasi interaksi antara residu terionisasi di pusat reaksi sphaeroides
Rhodobacter, sementara memperhitungkan energi reorganisasi protein. Hal ini
ditemukan bahwa pertimbangan eksplisit dari relaksasi protein menyebabkan
peningkatan yang signifikan dalam eff dan bahwa model semimicroscopic yang
tidak mengambil relaksasi ini berlaku satu account untuk menggunakan nilai yang
besar untuk apa yang disebut "dielektrik protein konstan," p, dari model PoissonBoltzmann atau yang sesuai di dalam model PDLD / S. Peningkatan tambahan
dalam eff diharapkan dari reorganisasi residu terionisasi dan dari perubahan
tingkat penetrasi air. Temuan ini memberikan dukungan lebih lanjut untuk gagasan
bahwa dalam (atau p) merupakan kontribusi yang tidak dianggap eksplisit.
Penelitian ini juga memberikan ilustrasi sistematis sifat eff, mendukung
pandangan kami sebelumnya melaporkan bahwa muatan-muatan interaksi sesuai
dengan nilai besar ini "konstanta dielektrik," bahkan dalam interior protein. Hal ini
juga menunjukkan bahwa eff untuk interaksi antara kelompok-kelompok
terionisasi dalam protein sangat berbeda dari dielektrik yang efektif konstan, 'eff,
yang menentukan energi bebas dari pasangan ion protein (' eff mencerminkan
efek dipol protein preoriented ). Akhirnya, masalah yang terkait dengan mencari
umum dibahas. Hal ini menjelaskan bahwa dalam mereproduksi efek relaksasi
protein pada biaya-biaya interaksi tidak sama dengan di yang mereproduksi efek
yang sesuai pada pembentukan biaya individu. Hal ini mencerminkan inkonsistensi
mendasar dalam upaya untuk melemparkan konsep mikroskopis dalam model
Biophysical Journal, Volume 74,
makroskopik. Jadi salah satu harus juga menggunakan besar dalam untuk biayaIssue 4, April 1998, Pages 1744- biaya interaksi dan kecil dalam untuk biaya-dipol interaksi atau
1753
mempertimbangkan relaksasi protein mikroskopis.
Zona metastabil lebar, yang dapat diperkirakan sebagai kesenjangan antara lokus
awan dan poin merupakan parameter kontrol penting bagi keberhasilan operasi
proses kristalisasi solusi. Penelitian ini mencoba untuk meningkatkan akurasi
penentuan titik awan di parasetamol-etanol solusi menggunakan pengukuran
dielektrik konstan dan teknik kalibrasi khusus. Sebuah model kalibrasi yang cocok
berdasarkan logaritma-polinomial ekspansi dikembangkan menggunakan adjusted
R2 dan Kriteria Informasi Akaike sebagai panduan pemilihan model. Model, yang
decouples pengaruh suhu dan konsentrasi zat terlarut pada konstanta dielektrik
solusi, digunakan untuk mengubah profil konstanta dielektrik ke dalam profil
konsentrasi zat terlarut. Hasil menunjukkan bahwa titik-titik awan ditentukan dari
profil konsentrasi zat terlarut yang lebih akurat daripada yang ditentukan secara
langsung dari profil dielektrik konstan. Yang pertama yang terbukti dalam perjanjian
Chemical Engineering Research yang baik dengan yang diperoleh dari pengukuran kekeruhan, yang digunakan
and Design Volume 89, Issue 12, sebagai tolok ukur dalam penelitian ini. Akibatnya, lebar zona metastabil lebih
December 2011, Pages 2613-2619 akurat juga dapat diperoleh dengan menggunakan teknik kalibrasi.
Nutrisi kacang ditingkatkan dengan Fe dan Zn lebih dari kacang konvensional dan
jagung nutrisi ditingkatkan (NEM) dengan triptofan lebih dan lisin dibandingkan
jagung konvensional (CM) yang dikembangkan sebagai bagian dari strategi
tanaman-biofortifikasi untuk meningkatkan nutrisi manusia. Proxy digunakan untuk
menilai bioavailabilitas Fe dan Zn dan kecernaan protein dari resep kacang (frjol
sancochado) dan resep jagung-susu (mazamorra) siap dengan tanaman
ditingkatkan atau konvensional di Kolombia. Konsentrasi nutrisi tinggi +
Journal of Food ScienceVolume
bioavailabilitas yang sama (protein dalam NEM, Zn di NEB), konsentrasi hara yang
74, Issue 5, pages H147H154, sama + bioavailability yang lebih tinggi (Fe di NEM) atau konsentrasi hara tinggi +
June/July 2009
bioavailability yang lebih tinggi (protein dalam NEB)

Raisah Ismi
17 Indraswari

Ayu Natasya
18 Pratiwi

19 Eki nuri fauziyah

Essential considerations for Gregory L. Warren, Thanh D. Do,


using proteinligand
Brian P. Kelley, Anthony Nicholls,
1110239 raissaismy@gmail.com
structures in drug discovery Stephen D. Warren
Christophe L.M.J. Verlinde, Ethan
A. Merritt, Focco Van Den Akker,
Hidong Kim, Ingeborg Feil, Luis F.
Delboni, Shekhar C. Mande, Steve
ayunatasyapratiwi@yahoo.co.i Protein crystallography and Sarfaty, Philip H. Petra, Wim G.J.
1110234 d
infectious diseases
Hol

1110209 luv_videx@yahoo.co.id

Tiffany Nuratie
20 Aryasetiawan

1110012 thief_31@yahoo.com

yovita selma
21 desiyana

1110280 yovitaselma@yahoo.com

Amalia Chintya
22 Dewi

1110314 ama_chintya@yahoo.co.id

Shandy Parvita
23 Surojo Putri

1110303 mizzsenyum@yahoo.co.id

The effects of substituted


cyclodextrins on the
colloidal and
conformational of selected
proteins

Drug Discovery Today, In Press,


Corrected Proof, Available online
21 June 2012

Protein Science, Volume 3, Issue


10, pages 16701686, October
1994

Journal of Pharmaceutical
Sciences
Hardeep S. Samra, Feng He,
Volume 99, Issue 6, pages
Akhilesh Bhambhani, J.D. Pipkin, 28002818, June 2010
Roz Zimmerer, Sangeeta B. Joshi,
C. Russell middaugh

Protein-ligan struktur adalah data inti yang diperlukan untuk struktur berbasis
desain obat (SBDD). kesalahan dalam data ini sangat penting untuk keberhasilan
pengembangan alat SBDD. Metode untuk menilai protein-ligan kualitas struktur dan
satu set baru kriteria identifikasi yang disajikan di sini. Ketika kriteria tersebut
diterapkan pada satu set 728 struktur yang sebelumnya digunakan untuk
memvalidasi perangkat lunak docking molekul, hanya 17% yang ditemukan untuk
dapat diterima. Struktur itu kembali disempurnakan untuk menjaga konsistensi
internal dalam perbandingan dan penilaian kriteria kualitas. Proses ini
menghasilkan Iridium, protein-ligan yang sangat dipercaya struktur database yang
akan digunakan untuk pengembangan dan validasi struktur berbasis desain alat
untuk penemuan obat.
Pertumbuhan yang pesat saat ini dalam jumlah yang diketahui 3-dimensi struktur
protein yang menghasilkan database struktur yang semakin berguna sebagai titik
awal untuk pengembangan molekul medis yang relevan baru seperti obat-obatan,
protein terapi, dan vaksin.
Efek dari berbagai jenis siklodekstrin tersubstitusi dan nonsubstituted (CD) pada
stabilitas fisik dan koloid dari tiga protein yang berbeda dipelajari untuk lebih
memastikan mekanisme yang siklodekstrin menstabilkan protein. Tiga protein
diperiksa dalam penelitian ini adalah Clostridium difficile Toxoid A, Yersinia pestis
rendah kalsium-respons V atau antigen V (LcrV), dan faktor pertumbuhan fibroblast
10 (FGF-10). Ketiga protein farmasi relevan berbeda dalam berat molekul, pI, serta
struktur sekunder dan tersier. Secara keseluruhan, dampak utama dari
siklodekstrin pada protein adalah kemampuan mayoritas dari mereka untuk
menghambat agregasi termal diinduksi. Studi ini menunjukkan bahwa stabilisasi
protein oleh siklodekstrin ditentukan oleh jenis dan derajat substitusi, serta sifat fisik
dan kimia dari protein yang sedang diperiksa.

Peptida adalah kunci untuk penemuan obat modern. Peptida, sebagai obat
modern, saat ini diproduksi dalam jutaan dalam mg skala untuk tujuan penelitian,
dalam rangka untuk lebih memahami fungsi dari sistem biologi. Beberapa urutan
baru ditemukan membentuk dasar dari obat modern dan sekarang diproduksi
dalam multi-ton. Sebuah produksi skala multi-ton dibuat perlu didasarkan pada
From Production of
tingginya jumlah pasien, pentingnya sosio-ekonomi dari penyakit dan dukungan
Peptides in Milligram
Current Pharmaceutical
yang kuat oleh lembaga-lembaga pemerintah seperti FDA. Fuzeon adalah obat
Amounts for Research to
Biotechnology, February 2004,
peptida berbasis pertama yang diproduksi dalam multi-ton pada dukungan yang
Multi-Tons Quantities for
Bruckdorfer T.; Marder
Volume 5, Number 1, pp. 29solid. Ini memiliki efek revolusioner pada teknik sintesis peptida seluruh secara
Drugs of the Future
O.; Albericio F.
43(15)
umum termasuk produksi bahan awal.
Buah merah dapat diperoleh dalam bentuk ekstrak dan minyak dalam kapsul lunak
(softcapsule). Produk ini memiliki ketahanan dan stabilitas yang rendah terhadap
Characteristics and
cahaya, panas, oksigen, dan kondisi lingkungan ekstrim karena mudah
Antioxidant Stability of Red
terdegradasi. Untuk menangani masalah ini dapat menggunakan metode
Fruit
mikroenkapsulasi, yakni proses membungkus suatu partikel terntu dengan bahan
(Pandanus conoideus Lam)
lain untuk menentukan karakter fisik dan kimia yang diharapkan. Dengan
Protein Based
willy yanuar, simon bambang
Jurnal Teknologi Pertanian, Vol, 8 menggunakan dua faktor yakni dengan mengisolasi protein kedelai dan NaMicrocapsule
widjanarko, tri wahono
No.2 (Agustus 2007) 127-135
caseinate dan dengan menggunakan minyak merah.
Pengembangan obat oral telah terhambat oleh masalah bioavailabilitas, meskipun
popularitas pasar yang luas. Eksipien Lipid ditunjukkan untuk meningkatkan
Effect of Monoclycerides
bioavailabilitas dari sejumlah obat hidrofobik, namun mekanisme yang mendasari
on Rhodamine 123
tindakan oleh lipid masih jelas. Salah satu mekanisme yang diusulkan adalah lipid
Accumulation, Estradiol17
yang eksipien bisa memfasilitasi serapan obat dengan mengubah kegiatan
-D-Glucuronide
penghabisan membran apikal usus transporter. Dengan demikian, penelitian ini
Bidirectional Transport and
bertujuan untuk mengetahui efek dari 1-monopalmitin, 1-monoolein dan 1 MRP2 Protein Expression
Journal of Pharmaceutical
monostearin pada aktivitas efflux dan protein ekspresi multidrug resistance-terkait
within Caco-2 cells
Jessica X. Jia & Kishor M. Wasan Sciences 11 (3): 45-62, 2008
protein 2 (MRP2) in vitro.
Pendiri bioaktif senyawa seperti vitamin, probiotik, peptida bioaktif dan antioksidan
menyediakan cara sederhana untuk mengembangkan makanan fungsionl baru
yang mungkin memiliki manfaat fisiologis atau mengurangi resiko penyakit. sebagai
makronutrien penting dalam makanan protein memiliki sifat fungsional yang unik,
termasuk kemampuan mereka untuk membentuk gel dan emulsi, yang
memungkinkan mereka untuk menjadi bahan yang ideal untuk enkapsulasi
senyawa bioaktif. Berdasarkan pengetahuan sifat fisik dan kimia protein, ulasan ini
mengambarkan peran potensial dari protein makanan sebagai substrat untuk
pengembangan sistem pengiriman nutraceutical dalam bentuk hidrogel, mikro-,
Food Protein-based
atau nano-partikel. Aplikasi ini mengilustrasikan matriks makanan protein untuk
materials as nutraceutical Lyngyun Chen, Gabriel E.
Volume 17, Issue 5, 2006, pages melindungi dan pengiriman senyawa sensitif nutraceutical dan ditekankan dampak
delivery systems
Remondetto, Muriel Subirade
272-283
dari ukuran partikel pada sifat rilis.

24 khaula asma A.H

1110326 khaulaantika@yahoo.co.id

physicochemical aspects of
drug delivery and release
from polymer-based
colloids
Lin Yang, Paschalis Alexandridis

25 Hernanda Saputri

1110191 nda_ndtdiaa@yahoo.com

Toward in silico structure- Gautier Moroy, Virginie Y. Martiny,


based ADMET prediction in Philippe Vayer, Bruno
ScienceDirect,Volume 17, Issues
drug discovery
O.Villoutreix, Maria A. Miteva
12, January 2012, Pages 4455

26 ciptania puspitasari

1110088 cipusimoet@yahoo.co.id

Human proteinprotein
interaction networks and
Heinz Ruffner, Andreas Bauer,
the value for drugdiscovery Tewis Bouwmeester

Drug Discovery Today, Volume 12,


Issues 1718, September 2007,
Pages 709-716

27 Dina Taurisya P

1110195 dinamutz69@yahoo.com

Structure-based Drug
Discovery Using GPCR
Homology Modeling:
Successful Virtual
Screening for Antagonists
of the Alpha1A Adrenergic Andreas Evers * and Thomas
Klabunde
Receptor

J. Med. Chem., 2005, 48 (4), pp


10881097

28 Wahyu Suluh F

Protein Based Drug


1110253 wahyu_suluh@rocketmail.com Discovery

29 Karina Ayu W

30 Louise Audina

current opinion in colloid &


interface science, march 2000,
volume 5, issues 1-2, page 132143

Joshi B., Gupta G., Gupta N.,


Gupta M., et al

International Jurnal of Drug


Discovery, 2009, volume 1, issue
2, Page Paper 40-51, ISSN: 09754423

karinaayuwulandari@ymail.co
1110299 m

Physical Chemistry of
Biological Free Energy
Transduction As
Demonstrated by Elastic
Protein-Based Polymers

Department of Chemical
Engineering and Materials
Science, University of
Minnesota, Twin Cities Campus,
421 Washington Avenue SE,
Minneapolis,
Minnesota 55455, and the
Biological Process Technology
Institute, 1479
Gortner Avenue, St. Paul,
Minnesota 55108

J. Phys. Chem. B, 1997, 101 (51),


pp 1100711028

1110219 kuedotcom@yahoo.com

Bioavailabylity Prediction
Based on Molecular
Structure for a Diverse
Series of Drugs

Joseph V. Turner , Desmond J.


Maddalena and Snezana
Agatonovic Kustrin

PHARMACEUTICAL RESEARCH
, Volume 21 , Number 1 ( 2004 )

kemajuan terbaru dalam penyusunan / loading, sifat permukaaan, dan aplikasi


berbasis polimer pemberian obat koloid dan sistem rilis seperti blok kopolimer
misel, polimer nano dan mikro partikel. polimer dimodifikasi liposom kimia fisika
hidrogel disajikan. pelepasan obat dari polimer berbasis sistem dipengaruhi oleh
obat polimer interaksi serta mikro polimer dan disosiasi / sifat erosi. modifikasi
permukaan dengan poli (etilen oksida) telah banyak digunakan dalam
meningkatkan biokompatibilitas dan biodistribusi operator pemberian obat. spesifik
lokasi pemberian obat dapat dicapai dengan berbasis polimer pembawa obat koloid
ketika ligan menargetkan informasi yang melekat pada permukaan pembawa atau
ketika fase transisi yang disebabkan oleh stimulus eksternal.sementara kemajuan
yang signifikan dalam pembuatan, masih banyak tantangan dalam melestarikan
aktivitas biologis dan mencapai sifat drug release yang diinginkan terutama untuk
obat protein dan DNA
Metode Quantitative structureactivity relationship (QSAR) dan pendekatan yang
terkait dapat digunakan untuk menyelidiki sifat-sifat molekul protein ADMET dari
obat-obatan dengan menerapkan metode docking-scoring yang melibatkan
metabolisme sulfotransferases fase II.
Sistematis genome-wide dan jalur spesifik interaksi protein yang telah
menghasilkan kerangka, diduga adanya keterkaitan sebagian besar protein
manusia, termasuk berbagai terapi yang relevan yang terkait penyakit-protein .
Nilai intrinsik bagi penemuan obat adalah protein-protein jaringan fisik yang
berinteraksi dapat berkontribusi pada pemahaman mekanisme dari patofisiologi
penyakit dan dapat membantu dalam identifikasi dan menjadi sasaran prioritas
serta menghasilkan hipotesis tentang cara pemberian obat terbaik untuk penyakit
keturunan. Disini, kita meninjau 'potensi terapi' dari generasi 1 sub-genom dalam
skala jaringan interaksi manusia dan jaringan protein terkait penyakit yang
dihasilkan oleh ragi hibrida dua layar dan pemurnian massa afinitas pendekatan
spektrometri.
Dalam makalah ini, kami menjelaskan pemodelan homologi dari reseptor alpha1A
berdasarkan struktur X-ray dari sapi rhodopsin. Model protein telah dihasilkan
dengan menerapkan ligan didukung pemodelan homologi, menggunakan data SAR
mutasi dan ligan untuk memandu prosedur pemodelan protein. Kami melakukan
skrining virtual koleksi senyawa perusahaan untuk menguji seberapa baik model ini
cocok untuk mengidentifikasi antagonis alpha1A. Kami menerapkan prosedur
penyaringan hirarkis virtual yang dipandu oleh filter 2D dan tiga-dimensi model
pharmacophore. The ca. 23 000 senyawa disaring berlabuh ke dalam model
homologi alpha1A dengan GOLD dan mencetak gol dengan PMF. Dari peringkat
atas senyawa, 80 senyawa beragam diuji dalam uji perpindahan radioligand. 37
senyawa mengungkapkan nilai Ki lebih baik dari 10 pM, senyawa yang paling aktif
mengikat dengan 1,4 nM pada reseptor alpha1A. Temuan kami menunjukkan
bahwa rhodopsin berbasis model homologi dapat digunakan sebagai dasar
struktural untuk memimpin temuan GPCR dan optimasi senyawa.
Research articel about new drug with very populer target is a great potential from
discovery advancing biomedical research and chemical genomics. This research of
drug, approximately 60% of drug target molecules are located at the cell
surfaceand half of them is GPCRs. That is G protein-coupled receptors one of the
most important drug. Fragment based drug discovery is establish as an alternative
approach to high throughput screening for generating novel small molecule drug
candidates (Nanotechnology based drug delivery systems). So this research want
make we can use that's GPCRs with a great potential from biomedical and
chemical genomics research metode
Artikel ini menjelaskan tentang studi ulasan yang
menyajikan mekanisme umum untuk protein folding dan fungsi dan menunjukkan
mekanisme dengan merancang protein model yang mampu melakukan banyak
konversi
energi yang menopang kehidupan dan dengan merancang mesin biomolekuler
beragam
dan bahan dengan aplikasi yang menjanjikan bagi masyarakat. Fenomenologis,
hasil mekanisme ini dalam lima aksioma atau prinsip untuk fungsi protein dan
rekayasa protein dimana protein dirancang berbasis polimer interconvert enam
energi bebas interconverted oleh organisme hidup. Keenam variabel intensif
untuk transduksi energi biologis bebas adalah kekuatan mekanik, temperatur,
potensial kimia, potensial elektrokimia, tekanan, dan radiasi elektromagnetik.
Dalam artikel ini , Penelitian Pharmaceutical ingin mengembangkan hubungan
struktur farmakokinetik kuantitatif dari senyawa obat. Bioavailabilitas berbagai
macam obat dapat dilihat hanya melalui struktur molekulnya saja. Dan senyawa
obat yang diserap dalam jumlah besar / bioavailabilitasnya tinggi merupakan
senyawa obat yang independen. Jadi semua informasi yang diperoleh dapat
digunakan untuk perkembangan obat selanjutnya.