Anda di halaman 1dari 2

TUGAS REKAYASA GENETIKA

NAMA: Sindy Juwita Kamagi


NIM

: 14051103037

1. Dasar pertimbangan apa yang digunakan dalam penelusuran filogeni


suatu spesies dengan analisis DNA mitochondria ?
DNA mitochondria (MtDNA) digunakan dalam penelusuran filogeni
suatu spesies karena

selalu diturunkan oleh induk betina ke sang

anak, berkembang sepuluh kali lebih cepat dari DNA inti. Pada MtDNA
juga, tapak-tapak restriksi dan urutan-urutan nukleotida sudah banyak
yang berhasil ditentukan.
2. Apa

yang

dimaksud

dengan

perpustakaan

genom

(What,Why,Where,How) ?
Perpustakaan genom merupakan koleksi klon-klon rekombinan yang
mengandung semua DNA dari suatu organisme.
Perpustakaan genom adalah kumpulan bakteri yang telah di rekayasa
secara genesis untuk menahan seluruh DNA dari suatu organisme.
Misalkan jika hendak mengklon satu gen kopi-tunggal dari genom
manusia. Kemudian genom tersebut dipotong dengan enzim restriksi
Eco RI dan menyiapkan vektor fag yang cocok, maka ada berapa
rekombinan yang hendak ditapis

untuk mendapatkan rekombinan

yang diinginkan ?Dengan asumsi bahwa Eco RI rata-rata menghasilkan


potongan-potongan yang berukuran 4 kb, dan diketahui genom haploid
manusia berukuran 2,8 x 106 kb, maka akan diperoleh nilai f = (4 .
103)/(2,8 x 106), dan ketika dimasukkan dalam rumus, maka berarti ada
sebanyak N = 7 x 10 5 rekombinan bebas yang harus dipersiapkan dan
ditapis agar diperoleh kesempatan untuk mendapatkan urutan yang
diinginkan. Dengan kata lain, ada sejumlah besar rekombinan yang
secara bersama-sama mengandung koleksi yang lengkap dari seluruh
(atau hampir seluruh) urutan DNA dalam seluruh genom manusia.

Koleksi semacam itulah yang disebut perpustakaan gen atau bank gen,
dan dari perpustakaan itulah suatu potongan DNA atau gen dapat
diambil untuk keperluan sidik jari atau untuk diklon.
3. Hasil kajian filogeni terhadap biota laut dari perairan Indonesia
Hasil kajian filogeni terhadap biota laut dari perairan Indonesia, antara
lain dilaporkan oleh Gaffar et al. (2009). Mereka melakukan analisis
filogeni menggunakan urutan 18S rRNA pada biota laut yang
dimanfaatkan sebagai obat tradisional di Indonesia. Dalam eksperimen
mereka,

gen 18S rRNA masing-masing dari empat

sampel biota,

diamplifikasi menggunakan PCR dengan primer 300F dan 1400R.


Produk PCR tersebut kemudian diklon menggunakan vektor pGEM-T
(Promega)

pada E. coli. Hasil sekuens terhadap gen rekombinan

menunjukkan ketiga sampel punya hubungan kekerabatan yang erat


dengan

empat

spesis

masing-masing

Chaetomorpha

crassa,

Ptilophora pinnatifida, Flagellaria indica, dan Wallemia ichthyophaga.