Meraih masa depan berkualitas bersama Sekolah Pascasarjana IPB

BIOLOGI TUMBUHAN
Ketua Program Studi/Koordinator Mayor: Dr.Ir. Miftahudin, MSi

Staf Pengajar:
Prof. Dr. Ir. Alex Hartana, MSc
Dr. Ari Prihardianto *
Dr. Ir. Aris Tjahjoleksono
Prof. Dr. Ir. Dede Setiadi, MS
Dr. Dedy Darnaedi*
Dr. Ir. Diah Ratnadewi
Dr. Ir. Dodi Supriadi, MSc. *
Dr. Ir. Dorly, MSi.
Dr. Eko Baroto Waluyo *
Dr. Ir. Ence Darmo Jaya Supena, MSi
Dr. Ir. Hamim, MSi
Dr. Harry Wiriadinata *
Dr. Ir. Ibnul Qayim
Dr. Ir. Ignatius Muhadiono
Ket: * Dosen Luar Biasa

Prof. Dr. Mien Ahmad Rifai *

Dr. Ir. Miftahudin, MSi
Dr. Nunik Sri Aryanti, MSi
Dr. Rita Megia
Dr. Rugayah*
Dr. Sri Sudarmiyati, MSc
Dr. Ir. Suharsono, DEA
Dr. Ir. Sulistijorini, MSi
Dr. Sumaryono*
Dr. Ir. Tatik Chikmawati, MSi
Dr. Teguh Triono *
Dr. Triadiati, MSi
Dr. Ir. Utut Widyastuti, MSi
Dr. Yohannes Purwanto *

Tujuan Pendidikan:
1. Menghasilkan lulusan Magister dan Doktor yang profesional dan berakhlak
tinggi,
2. Mengembangkan penelitian dan inovasi ilmu pengetahuan dan teknologi
dalam bidang Biologi Tumbuhan guna memanfaatkan sumber daya alam
secara berkelanjutan bagi kesejahteraan manusia,
3. Membina kehidupan akademik yang berkualitas tinggi.

Kompetensi Lulusan S2:

Mampu memahami prinsip dasar ekologi atau taksonomi tumbuhan atau
biologi selular dan molekular tumbuhan, dan mengaplikasikannya dalam bidang
biodiversitas, sistematika dan atau bioteknologi tumbuhan.

Kompetensi Lulusan S3:

Menguasai prinsip dasar dan mampu menemukan inovasi dalam bidang
ekologi atau taksonomi tumbuhan atau biologi selular dan molekular tumbuhan,
dan mengembangkannya dalam penelitian dasar dan terapan untuk mendukung
pengelolaan biodiversitas tumbuhan dan ekosistemnya, pengembangan
sistematika tumbuhan dan pengembangan bioteknologi tumbuhan.
Katalog 2012 - 509

Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor

KURIKULUM
Program Magister Sains
Kode

Mata Kuliah

SKS

Semester

Mata Kuliah Wajib SPs 6 SKS (14.6%)

PPS

500

Bahasa Inggris

Ganjil/Genap

STK /
SPS

511
551

Morfometrika / Analisis Statistik

Genap

Mata Kuliah Wajib Mayor 22 SKS (56.1%)

BIO

541

Genetika

3(3-0)

Ganjil

BIO

533

Sumberdaya Tumbuhan

3(2-3)

Ganjil

BIO

543

Metabolisme Tumbuhan

3(2-3)

Ganjil

BIO

531

Ekologi Tumbuhan

3(2-3)

Ganjil

BIO

590

Metode Ilmiah

2(2-0)

Genap

PPS

601

Kolokium

Genap

PPS

690

Seminar

Ganjil/Genap

PPS

699

Penelitian dan Tesis

Ganjil/Genap

Mata Kuliah Pilihan Mayor minimal 12 SKS (29.3%) Mata Kuliah Kode BIO 5xx / 6xx
dari mayor Biologi Tumbuhan
Kelompok I : Minat Biologi Sel dan Fisiologi Tumbuhan
BIO

546

Ekofisiologi Tumbuhan

3(2-3)

Genap

BIO

545

Biologi Kultur In Vitro Tumbuhan

3(2-3)

Ganjil

BIO

641

Pertumbuhan dan Perkembangan

Tumbuhan Lanjut

3(2-3)

Ganjil

BIO

635/6
xx

Mikroteknik Lanjut atau Pilihan BIO 6XX

3(2-3)

Genap

Kelompok II : Minat Genetika dan/atau Biologi Molekular Tumbuhan

BIO

544

Genetika Molekular*

3(2-3)

Genap

BIO

643

Analisis Genetika*

3(2-3)

Ganjil

BIO

642

Rekayasa Genetika Tumbuhan

3(2-3)

Genap

BIO

613

Fisiologi Molekular* atau Plihan BIO 6xx

3(2-3)

Ganjil

Kelompok III : Minat Ekologi dan Sumberdaya Hayati Tropika

BIO

534

Ekologi Sumberdaya Tropis

3(2-3)

Genap

BIO

532

Metodologi Ekologi Tumbuhan

3(2-3)

Genap

BIO

636

Fitoindikator atau Plihan BIO 6xx

3(2-3)

Ganjil

BIO

631

Biologi Konservasi Tumbuhan

3(2-3)

Ganjil

510 - Katalog 2012

Meraih masa depan berkualitas bersama Sekolah Pascasarjana IPB

Kode

Mata Kuliah

SKS

Semester

Kelompok IV : Minat Sistematika Tumbuhan

BIO

535

Azas-azas Taksonomi Tumbuhan

3(2-3)

Ganjil

BIO

536

Tata Nama Biologi

3(2-3)

Genap

BIO

632

Teknik
Penelitian
Taksonomi
Pengelolaan Herbarium

3(2-3)

Genap

BIO

633

Taksonomi Numerika
Data Taksonomi

3(2-3)

Ganjil

BIO

630

Tinjauan Tumbuhan Rendah**

2(2-0)

Ganjil

dan

dan

Pemrosesan

Total SKS

40-42

* Menjadi Mata Kuliah Mayor di Program Studi Bioteknologi (BTK)

** Wajib diambil untuk mahasiswa yang mengambil topik penelitian tumbuhan rendah
Catatan:

Mata kuliah Pilihan Mayor diambil pada semester semester 2 sebanyak 6 SKS
dan semester 3 sebanyak 6-8 SKS.

Program Doktor
Kode

Mata Kuliah

SKS

Semester

2 (2-0)

Ganjil

Mata Kuliah Wajib SPS 2 SKS (5%)

PPS

702

Falsafah Sains
Mata Kuliah Wajib Mayor 24 SKS (60%)

BIO

731

Keragaman, Evolusi dan Ekologi Tumbuhan

3(2-3)

Ganjil

BIO

742

Analisis dan Presentasi Data Biologi

3(2-3)

Genap

BIO

744

Biologi Molekular Tumbuhan

3(2-3)

Genap

PPS

701

Kolokium

Ganjil/Genap

BIO

790

Seminar Biologi Tumbuhan

1(0-2)

Ganjil/Genap

PPS

790

Seminar

Ganjil/Genap

PPS

799

Penelitian dan Disertasi

12

Ganjil/Genap

Mata Kuliah Pilihan Mayor 15 SKS (35%) Mata Kuliah BIO 6xx / 7xx dari mayor
Biologi Tumbuhan atau mata kuliah kode 6xx / 7xx dari mayor lain
Kelompok I : Minat Biologi Sel dan Fisiologi Tumbuhan
BIO

741

Interaksi Tumbuhan-Mikroba

3(2-3)

Ganjil

BIO

743

Transport dan Metabolisme Unsur Hara

Tumbuhan

3(2-3)

Ganjil

BIO

746

Fisiologi Tumbuhan Lanjut

3 (3-0)

Genap

Ganjil

Mata Kuliah Penunjang

Katalog 2012 - 511

Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor

Kode

Mata Kuliah
Mata Kuliah Penunjang

SKS

Semester

Genap

Kelompok II : Minat Rekayasa Produk Alami Tumbuhan

BIO

642

Rekayasa Genetika Tumbuhan

3(2-3)

Genap

BIO

748

Produk Alami Tumbuhan dan Rekayasa

Metabolik

3(2-3)

Genap

BIO

733

Struktur Organ Sekretori dan Histokimia atau

Mata Kuliah Penunjang

3(2-3)

Ganjil

Mata Kuliah Penunjang

Ganjil

Mata Kuliah Penunjang

Ganjil

Kelompok III : Minat Biologi Molekular Tumbuhan dan Bioteknologi

BIO

642

Rekayasa Genetika Tumbuhan

3(2-3)

Genap

BIO

745

Reproduksi Tumbuhan

3(2-3)

Ganjil

BIO

747

Genetika Fisiologi Tumbuhan

3(3-0)

Ganjil

Mata Kuliah Penunjang

Ganjil

Mata Kuliah Penunjang

Genap

Kelompok IV : Minat Ekologi dan Sumberdaya Hayati Tropika

BIO

735

Populasi, Komunitas dan Sistem Ekologi

3(2-3)

Genap

BIO

737

Strategi Konservasi Biodiversitas

3(2-3)

Ganjil

BIO

732

Fitososiologi dan Fitogeografi

3(2-3)

Genap

BIO

637

Keragaman Tumbuhan Simbion

3(2-3)

Ganjil

BIO

631

Biologi Konservasi Tumbuhan

3(2-3)

Ganjil

Kelompok V ; Sistematika Tumbuhan

BIO

736

Seluk Beluk Konsep Jenis

2(2-0)

Genap

BIO

739

Falsafah Taksonomi

2(2-0)

Ganjil

BIO

738

Taksonomi dan Filogeni Tumbuhan

3(2-3)

Genap

BIO

639

Sitotaksonomi dan Sistematika Molekuler

3(2-3)

Ganjil

BIO

638

Klasifikasi Tradisional dan Sistematika Masa

Depan

3(2-3)

Ganjil

BIO

634

Etnobotani dan Etnoekologi***

2(2-0)

Ganjil/Genap

BIO

732

Fitososiologi dan Fitogeografi***

3(2-3)

Genap

Total SKS
*)

41-42

Mahasiswa yang belum mendapatkan mata kuliah Analisis Statistika/ Morfometrika, dan
atau Metodologi Penelitian/Metode Ilmiah atau yang setara pada jenjang S2 harus
mengambil mata kuliah-mata kuliah tersebut.
**) Pilihan mata kuliah harus disesuaikan dengan minat, topik penelitian dan seizin komisi
pembimbing

512 - Katalog 2012

Meraih masa depan berkualitas bersama Sekolah Pascasarjana IPB

***) Pilih salah satu dari mata kuliah tersebut
Catatan:

Mata kuliah Pilihan Mayor/Penunjang diambil pada semester 1 sebanyak 6 SKS,

semester 2 sebanyak 6 SKS dan semester 3 sebanyak 3-4 SKS.

Program Doktor Jalur Riset

Program Studi Biologi Tumbuhan membuka Program Doktor Jalur Riset dengan
persyaratan dan ketentuan sesuai persyaratan dan ketentuan yang berlaku pada
penerimaan Program Doktor Jalur Riset Sekolah Pascasarjana IPB. Bagi calon
mahasiswa yang akan mengambil jalur ini harus sudah memiliki calon pembimbing
utama di PS Biologi Tumbuhan.

SILABUS MATA KULIAH

BIO 531

Ekologi Tumbuhan

3(2-3) 1

Batasan sejarah dan perkembangan ekologi tumbuhan; perubahan energi

dan produktifitas primer; pembentukan dan perkembangan habitat, sifat fisik dan
kimia tanah serta lingkungannya. Hubungan stres air dan aspek fisiologisnya;
habitat tergenang dan hubungannya dengan perkembangan tumbuhan; hara
mineral dan siklus biogeokimia serta ekologi hara mineral bagi kehidupan;
kompetisi, struktur tumbuhan dan faktor penyebabnya; suksesi, komposisi
komunitas dan perubahan kecenderungan keragaman serta dominasi jenis;
interaksi, variasi genetik dan ekologi dalam awal suksesinya.
Dede Setiadi
Muhadiono
Ibnul Qayim
BIO 532

Metodologi Ekologi Tumbuhan

3(2-3) 2

Pengumpulan data ekologi, pengambilan contoh di lapang; pendugaan

kepadatan populasi tumbuhan; teknik penangkapan, penandaan dan penangkapan
ulang; metode kuadrat dan garis transek; metode titik perempat; pendugaan
parameter komunitas, kesamaan komunitas; analisis gugus dan pengukuran
keanekaragaman spesies.
Dede Setiadi
Muhadiono
BIO 533

Sumberdaya Tumbuhan

3(2-3) 1

Mata kuliah ini membahas arti dan makna sumberdaya tumbuhan, teknik dan
strategi prospeksi, evaluasi, konservasi, dengan penekanan pada kegunaan
plasmanutfah dan pemakaian bioteknologi dalam semua tahapan tersebut di atas,
serta peran database dan bioinformatika dalam pemanfaatan dan pengelolaan
sumberdaya tumbuhan juga dibahas arti dan makna biodiversitas tumbuhan,
penggunaan karakter fitografi untuk mengetahui keragaman dan kekerabatan
Katalog 2012 - 513

Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor

tumbuhan,peran domestikasi dan fitogeografi dalam persebaran jenis, tipe habitat

dan penentu pusat keragaman tanaman.
Rita Megia
Tatik Chikmawati
Harry Wiriadinata
BIO 534

Ekologi Sumberdaya Tropis

3(2-3) 2

Sifat dan ciri utama ekosistem tropis, silvigenesis dan derajat sklerofili,
pembandingan di dalam dan antar-daerah tropis, faktor dan sifat tanah hutan
tropis, serta ciri-ciri biologis. Studi kasus dan perkembangan daerah tropis.
Muhadiono
dan Tim
BIO 535

Azas-azas Taksonomi Tumbuhan

3(2-3) 1

Teori, hukum, praktek dan seluk beluk penamaan, pencirian dan

penggolongan. Bermacam kunci determinasi dan hakikat nama daerah dan nama
ilmiah. Bukti-bukti taksonomi beserta perincian
ciri dan sifat. Sejarah
perkembangan pendekatan klasifikasi dan sistem klasifikasi. Takson, peringkat
klasifikasi dan kategorisasi. Pendekatan penelitian flora, revisi dan monografi.
Mien Ahmad Rifai
dan Tim
BIO 536

Tata Nama Biologi

3(2-3) 2

Tata nama botani dan zoologi dalam teori dan praktek. Sejarah,
pertumbuhan dan perkembangan mutakhir sistem tata nama. Pendalaman asas
dan pasal demi pasal kode tata nama botani internasional. Latihan kasus tata
nama bermasalah.
Mien Ahmad Rifai
danTim
BIO 541

Genetika

3(3-0) 1

Genetika dan Organisme: gen sebagai penentu spesies, keragaman genetik,

metodologi yang digunakan dalam genetika, organisme Sebagai model, gen,
lingkungan, dan organisme. Pola Pewarisan: Pewarisan autosomal, kromosom
sex dan pewarisan terpaut seks, Pewarisan sitoplasma. Kromosom sebagai dasar
Pewarisan: Perkembangan sejarah teori kromosom, kodrat kromosom, Mitosis dan
Meiosis, tingkah laku kromosom dan pola pewarisan pada eukaryot, kromosom
orgarnel. Pemetaan Kromosom berdasarkan Rekombinasi: Penenemuan pola
pewarisan gen-gen terpaut, rekombinasi, peta keterpautan, uji khi-kuadrat dalam
analisis keterpautan, menghitung pindahsilang ganda yang tak tampak, peta
keterpautan berdasarkan data F2, keterpautan dalam silsilah manusia
menggunakan logaritme. Genetika bakteri dan virusnya: Bagaimana bekerja
dengan mikroorganisme, konjugasi bakteri, transformasi bakteri, genetika
bakteriofage, transduksi, peta fisik vs.peta keterpautan. Hubungan Gen ke
fenotipe: gen dan produk gen, interaksi alel dalam satu gen, interaksi gen dan
514 - Katalog 2012

Meraih masa depan berkualitas bersama Sekolah Pascasarjana IPB

protein, penggunaan uji khi-kuadrat dalam rasio interaksi gen. Mutasi Kromosom:
Perubahan pada struktur kromosom, perubahan dalam banyaknya kromosom.
Struktur dan replikasi DNA: DNA sebagai bahan genetik, struktur DNA, replikasi
semikonservatif, sekilas replikasi DNA, Replisom. Transkripsi dan prosesing RNA:
RNA, Transkripsi, Transkripsi dalam eukaryot. Protein dan sintesis protein:
Struktur protein, kolinearitas gen dan protein, Kode genetic, tRNA, ribosom,
kejadian pascatranslasi. Mutasi, Pemulihan, dan Rekombinasi.
Alex Hartana
Aris Tri Wahyudi

BIO 543

Metabolisme Tumbuhan

3(2-3) 1

Metabolisme tumbuhan membahas tentang pengetahuan terbaru mengenai

aspek-aspek metabolisme di dalam tumbuhan mulai dari energi dan enzim, sel,
fotosintesis, respirasi metabolisme karbohidrat, metabolisme lemak, metabolisme
nitrogen, metabolisme sekunder dan pemanfaatan pengetahuan metabolisme
untuk meningkatkan manfaat tumbuhan melalui rekayasa genetika, metabolik dan
bioteknologi. Juga dilengkapi dengan pembahasan tentang teknologi omic, seperti
metabolomic. Kuliah ini dilengkapi dengan kegiatan praktikum di laboratorium.
Miftahudin
Hamim
Diah Ratnadewi
Triadiati
BIO 544

Genetika Molekular

3(2-3) 2

Mata kuliah ini memberikan pengertian tentang: peranan gen dalam

kehidupan, sejarah penemuan bahan genetik, bahan genetik yang terdapat di inti
sel dan bahan genetik di organel mitokondria dan kloroplast, struktur genom,
proses replikasi DNA dan perangkat yang terlibat, proses ekspresi gen yang
meliputi proses transkripsi dan translasi dan perangkat yang terlibat di dalam
proses tersebut, faktor-faktor yang dapat menimbulkan keragaman genetik yaitu
mutasi dan rekombinasi secara molekuler, dan regulasi sintesis protein pada
organisme prokaryot, virus, dan organisme eukaryot.
Suharsono
Utut Widyastuti

BIO 545

Biologi Kultur In Vitro Tumbuhan

3(2-3) 1

Mata kuliah ini membahas teknik kultur sel dan jaringan tanaman, konsep
pertumbuhan dan diferensiasi sel/protoplas, de-diferensiasi dan re-diferensiasi,
embriogenesis somatik, organogenesis, kejadian variasi somaklonal dan variasi
yang diinduksi, metabolisme sekunder, serta berbagai fenomena yang terjadi
dalam kultur in vitro.
Diah Ratnadewi
Ence Darmo Jaya Supena
Sumaryono

Katalog 2012 - 515

Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor

BIO 546

Ekofisiologi Tumbuhan

3(2-3) 2

Mata kuliah ini mempelajari aspek-aspek fisiologi tumbuhan berkaitan

dengan dinamika yang terjadi pada lingkungan pada tingkat iklim mikro tumbuhan
hingga iklim global. Dalam mata kuliah ini juga dibahas respon fisiologis dari
tumbuhan dalam menghadapi perubahan lingkungan tersebut yang pada jangka
pendek melahirkan adaptasi dan pada jangka panjang menjadi mata rantai evolusi.
Triadiati, Sulistijorini

BIO 590

Metode Ilmiah

3(2-3) 2

Mempelajari bagaimana pengetahuan baru diciptakan. Sains faktual vs

sains ideal. Hal: sifat dan hukum. Kognisi dan pengetahuan. Persepsi dan
pengamatan. Pengujian dan bukti. Tata cara penulisan karya ilmiah. Metode
penelitian. Pembuatan proposal penelitian.
Bambang Suryobroto
Alex Hartana
BIO 613

Fisiologi Molekular

3(2-3) 1

Struktur sel prokariot dan eukariot; struktur dan fungsi intraselular, spora;
struktur, biogenesis dan peranan membran; asam amino dan protein; enzim;
fotosintesis; koordinasi metabolisme energi aerob; metabolisme energi anaerob
yang meliputi transport elektron anaerob, fermentasi; siklus sel dan kanker;
modifikasi pasca traskripsi dan sortasi protein; signal sel; pergerakan sel. Kuliah
dilengkapi praktikum.
Anja Meryandini
Nisa Rahmania
Miftahudin

BIO 630

Tinjauan Tumbuhan Rendah

3(2-3) 1

Mengantarkan konsep terbaru penataan dunia tumbuhan rendah: ganggang

dan lumut. Mengupas evolusi, spesiasi, keanekaragaman morfologi dan reproduksi
serta aspek-aspek pemanfaatannya.
Sri Sudarmiyati
Nunik Sri Aryanti
BIO 631

Biologi Konservasi Tumbuhan

3(2-3) 1

Konsep konservasi biologi, tingkat kepentingan populasi, tingkat kepentingan

sistem, sasaran konservasi keanekaragaman hayati, kepunahan dan biografi
pulau, fragmentasi habitat, polusi dan degradasi habitat; konservasi pada tingkat
spesies, populasi, komunitas, dan ekosistem; peranan kelembagaan dalam
konservasi.
Dede Setiadi
dan Tim

516 - Katalog 2012

Meraih masa depan berkualitas bersama Sekolah Pascasarjana IPB

BIO 632

Teknik Penelitian Taksonomi dan Pengelolaan

Herbarium

3(2-3) 2

Pengadaan spesimen herbarium melalui eksplorasi dan tukar-menukar

koleksi. Pembuatan, pengelolaan, pendokumentasian, pengawetan dan
pemanfaatan spesimen. Pengelolaan umum herbarium sebagai spesimen acuan
dan bahan penelitian. Teknik pemeriksaan contoh tumbuhan hidup dan spesimen
herbarium untuk penelitian. Langkah-langkah dan administrasi penelitian
berdasarkan bahan herbarium. Seluk beluk penyusunan kunci determinasi.
Penyitiran sinonim, spesimen serta pemahaman singkatan dan akronim. Macammacam pertelaan dan diagnosis. Penyiapan naskah untuk penerbitan.
Teguh Triono, Nunik Sri Ariyanti
BIO 633

Taksonomi Numerika dan Pemrosesan Data

Taksonomi

3(2-3) 1

Pengelolaan data taksonomi dengan komputer. Pengelolaan spesimen

dalam data base, pembuatan label spesimen, membuat deskripsi dan kunci
determinasi serta peta persebaran. Program yang tersedia a. l. DELTA, IBIS,
KORT MAPPING SYSTEM. Aliran klasik, fenetik, filogenetik dan kladistika.
Pendekatan holistik, korelasi dan diskriminasi ciri serta penafsiran kekerabatan
dengan memanfaatkan semua data dan informasi yang terkumpul dengan bantuan
komputer. Teori dan praktek taksonomi numeris berdasarkan program yang
tersedia (NT-Sys, HENNIG 86, PAUP dll.). Penyusunan dan penafsiran
dendrogram dan kladogram sebagai alat bantu penelitian biosistematika.
Rugayah
dan Tim
BIO 634

Etnobotani dan Etnoekologi

2(2-0) 1/2

Sejarah pertumbuhan, ruang lingkup, konsep dasar dan pemanfaatan

etnobotani dan botani ekonomi. Pendekatan botani, ekologi, ekonomi dan
antropologi dalam penelitian sumber daya nabati suatu lingkungan budaya.
Etnobotani dan botani ekonomi sebagai pembantu dan kepanjangan tangan
taksonomi. Pengetahuan tradisional tentang adaptasi dan interaksi antar
organisme dan pengaruh pengelolaan tradisional lingkungan alam terhadap
kualitas lingkungan. Pengelolaan keanekaragaman hayati dengan melakukan
identifikasi praktis dan kemungkinan pengembangannya untuk dapat menunjang
pemanfaatan keanekaragaman hayati tersebut secara lestari dan menguntungkan.
Praktik konservasi untuk promosi konservasi biologi dan keanekaragaman genetik.
Etnoekologi mempelajari pula pengaruh aktivitas manusia terhadap lingkungan
pada masa lalu dan masa sekarang.
Eko Baroto Waluyo
B.Yohannes Purwanto
BIO 635

Mikroteknik Lanjut

3(2-3) 2

Pengetahuan tentang cara pembuatan sediaan mikroskopis tumbuhan

dengan berbagai metode dan pembuatan foto sediaan mikroskopis menggunakan
fotomikroskop, mikroskop fluoresens, fase kontras dan elektron
Miftahudin
Dorly
Katalog 2012 - 517

Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor

BIO 636

Fitoindikator

3(2-3) 1

Pengertian adaptasi organisme terhadap faktor-faktor lingkungan; peran

tumbuhan, hewan dan makro detritus dalam mengindikasikan kondisi lingkungan;
jenis organisme yang berfungsi sebagai indikator keadaan habitat; algae dan
tanaman tinggi sebagai indikator lingkungan, kehidupan ikan sebagai indikator
kualitas perairan; pengukuran parameter ekologi di masa depan dalam memantau
kualitas air.
Ibnul Qayim
dan Tim

BIO 637

Keragaman Tumbuhan Simbion

3(2-3) 1

Ragam simbiosis dalam ekosistem alamiah dan kegiatan pertanian.

Trofobiosis, pola interaksi cahaya dan produktivitas tanaman. Lingkungan tumbuh
optimum untuk produktivitas, sustainabilitas, stabilitas dan ekuitabilitas dalam
sistem ekologi tropis. Analisis gradasi lahan, imobilisasi hara dan mimik multistrata
komunitas tumbuhan menuju produktivitas optimum.
Muhadiono
dan Tim
BIO 638

Klasifikasi Tradisional dan Sistematika Masa

Depan

3(2-3) 1

Persepsi tradisional terhadap sumberdaya alam tumbuhan melalui analisis

simbolik dalam ritual dan
mitos serta konsekuensi ekologinya, sistem
pengetahuan tradisional tentang klasifikasi dan organisasi lingkungan melalui studi
etnotaksonomi dan kapita selekta pembahasan perkembangan penelitian
taksonomi mutakhir. Pemantauan kemajuan penyelesaian project flora Malesiana.
Pemutakhiran dan pengupasan keberlakuan tata nama tetumbuhan sekitar sesuai
simpulan versi dan penelaahan terakhir.
Mien Ahmad Rifai
dan Tim
BIO 639

Sitotaksonomi dan Sistematika Molekular

3(2-3) 1

Kuliah ini membahas tentang pendekatan sitologi dan molekular dalam

perkembangan mutahir dari taksonomi. Data Kromosom, isozim dan DNA dipakai
untuk mengetahui variasi genetika pada tingkat populasi maupun jenis serta
makna evolusinya dalam pemahaman kekerabatan antar takson.
Tatik Chikmawati
Dedi Darnaedi
BIO 641

Pertumbuhan dan Perkembangan Tumbuhan

Lanjut

3(2-3) 2

Kuliah Pertumbuhan dan Perkembangan Tumbuhan Lanjutan adalah mata

kuliah yang mengajarkan tentang aspek-aspek penting dari pertumbuhan dan
perkembangan tumbuhan yang meliputi pengenalan pertumbuhan dan diferensaisi
518 - Katalog 2012

Meraih masa depan berkualitas bersama Sekolah Pascasarjana IPB

sel, pendalaman materi tentang fisiologi dan metabolisme hormon tumbuhan
termasuk hubungannya dengan toleransi dan interaksi tumbuhan dengan mikroba,
perkembangan dan pematangan buah dan biji, pembentukan cadangan makanan
pada organ vegetatif, senesensi dan absisi. Pada bagian akhir mata kuliah ini
dibahas aspek-aspek molekular dari kerja hormon, transduksi sinyal dan sistem
penangkapan sinyal pada tumbuhan serta responnya terhadap perubahan
lingkungan.
Diah Ratnadewi
Hamim
BIO 642

Rekayasa Genetika Tumbuhan

3(2-3) 2

Rekayasa dan teknik-teknik dalam konstruksi mutan secara in vitro dan in

vivo, pemetaan fisik dan genetik pada plasmid dan genom total,pengklonan
molekular dan strateginya, analisis komplementasi dan hibridisasi Southern,
transkripsi/translasi in vitro, pulse field gel electrophoresis (PFGE), PCR, DNA
sequencing, analisis DNA dan protein dengan komputer, analisis transkripsi,
mutagenesis terarah dan rekayasa protein, produksi protein di sel eukariot,
rekayasa genetika pada tanaman. Analisis sifat quantitatif secara molekular. Gene
slencing. Biosafety, paten dan bioetika.
Utut Widyastuti
Suharsono
Miftahudin
BIO 643

Analisis Genetik

3(2-3) 1

Mata kuliah ini membahas struktur dan ekspresi genom, teknik manipulasi
DNA, isolasi DNA dan RNA, teknik pengklonan gen, pustaka genom, analisis
genetik dan fisik genom virus dan bakteri, pemetaan genom eukariot, analisis
rekombinasi dan analisis molekular, analisis genetik populasi, struktur,
kesetimbangan dan keragaman populasi, analisis jarak dan kemiripan antar
populasi, analisis genetik kuantitatif dan populasi, sifat monogen dan poligen,
keragaman genetik dan lingkungan, heterosis dan kemajuan seleksi
Suharsono
Alex Hartana
BIO 731

Keragaman, Evolusi dan Ekologi Tumbuhan

3(2-3) 1

Membahas tentang keragaman tumbuhan dari berbagai sudut pandang,

seperti keragaman morfologi, anatomi, fisiologi, dan genetika yang dikaitkan
dengan perjalanan evolusi dan ekologi dari tumbuhan tersebut. Disamping itu juga
dibahas tentang mekanisme adaptasi dari berbagai ragam tumbuhan terhadap
ekologi tertentu. Topik-topik terbaru dari aspek-aspek tersebut di atas akan
menjadi bahan diskusi mahasiswa.
Ibnul Qayim
Tatik Chikmawati
BIO 732

Fitososiologi dan Fitogeografi

3(2-3) 2

Sejarah fitososiologi, kelompok masyarakat tumbuhan sebagai satuan

Katalog 2012 - 519

Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor

vegetasi, dinamika kelompok tumbuhan, simorfologi, metode pengambilan contoh

vegetasi, pengolahan tabel dan data fitososiologi, ordinasi, pemetaan vegetasi,
sintaksonomi dan sikronologi serta terapan fitososiologi. Asas-asas pemencaran
dan persebaran tetumbuhan. Persebaran membujur dan melintang bumi serta
meninggi. Peta bumi tumbuhan, pola vegetasi Malesia dan pemetaan. Plastisitas,
fenotipe dan ekotipe dan pendekatan morfogeografi.
Ibnul Qayim
Ari Prihardianto

BIO 733

Struktur Organ Sekretori dan Histokimia

3(2-3) 1

Pengetahuan tentang berbagai struktur organ sekretori yang merupakan

tempat diakumulasinya berbagai senyawa metabolit sekunder dan pembahasan
tentang beberapa teknik histokimia dan teknik isolasi senyawa kimia tersebut.
Juliarni
dan Tim
BIO 735

Populasi, Komunitas dan Sistem Ekologi

3(2-3) 2

Evaluasi berdasarkan prinsip-prinsip ekologi terhadap manajemen

lingkungan, faktor abiotik dan biotik yang mempengaruhi distribusi jenis, strategi
sejarah kehidupan, kompetisi antarspesies dan persamaan Lotka-Voltera;
pendugaan kepadatan populasi pada organisme yang kontinyu, diskret doubling
time, interaksi antar individu dalam populasi dan komunitas.
Dede Setiadi
dan Tim

BIO 736

Seluk Beluk Konsep Jenis

2(2-0) 2

Perkembangan konsep jenis dan Linneaus sampai kini, berawal dari konsep
jenis morfologi, biologi, internodon dan komposit. Penerapan konsep tersebut
dalam penyelesaian permasalahan taksonomi.
Mien Ahmad Rifai
dan Tim
BIO 737

Strategi Konservasi Biodiversitas

3(2-3) 1

Nilai dari keanekaragaman hayati alami; kehilangan keanekaragaman hayati;

strategi untuk konservasi keanekaragaman hayati; kebijakan nasional dalam
konservasi keanekaragaman hayati; dorongan kebijakan lingkungan internasional
dalam konservasi keanekaragaman hayati; insentif terhadap konservasi
keragaman hayati lokal; pengelolaan keragaman hayati dalam lingkungan
manusia; konservasi spesies, populasi, dan keragaman genetik; pengelolaan
sumberdaya manusia untuk melindungi keanekaragaman hayati.
Dede Setiadi
Dodi Supriadi

520 - Katalog 2012

Meraih masa depan berkualitas bersama Sekolah Pascasarjana IPB

BIO 738

Taksonomi dan Filogeni Tumbuhan

3(2-3) 2

Sejarah perkembangan konsep analogi dan homologi, paralelisme dan

konvergensi, filogenetik dan filetik, monofiletik dan para filetik. Pengembangan
dendogram menjadi pohon filogeni, fenogram, kladogram dan makna pengertian
klasifikasinya.
Mien Ahmad Rifai
dan Tim
BIO 739

Falsafah Taksonomi

2(2-0) 1

Perkembangan pemikiran klasifikasi dari Theophrathes sampai sekarang.

Intuisi, diktum, teori Hennig. Intervensi teori evolusi dan kladistika dalam pola pikir
penyusunan Klasifikasi.
Mien Ahmad Rifai
dan Tim
BIO 741

Interaksi Tumbuhan-Mikroba

3(2-3) 1

Mata kuliah ini menjelaskan tentang interaksi antara tumbuhan dan mikroba
dengan penekanan pada pengetahuan tentang interaksi yang bersifat simbiotik
terutama simbiosis fiksasi nitrogen dan simbiosis mikoriza. Materi yang diberikan
meliputi jenis-jenis interaksi yang dapat terjadi antara tumbuhan dengan mikoriza
dan manfaatnya dalam kehidupan terutama di bidang pertanian, biodiversitas dan
ekologi bakteri pemfiksasi nitrogen, metabolisme nitrogen di dalam rhizobia,
metabolisme karbon dan fosfat, mekanisme molekular dan gen-gen yang terlibat di
dalam proses simbiosis fiksasi nitrogen, beberapa metode pendekatan yang dapat
digunakan dalam mempelajari interaksi antara tumbuhan dengan mikroba.
Disampaikan pula secara terbatas tentang aspek molekular dari interaksi yang
bersifat patogenik terutama interaksi cendawan patogen dengan tumbuhan dan
mikoriza.
Aris Tjahjoleksono
Utut Widyastuti
BIO 742

Analisis dan Presentasi Data Biologi

3(2-3) 2

Membahas teknik analisis dan presentasi data biologi dalam forum ilmiah
secara benar dan baku, yang meliputi teknik analisis data, penulisan dan koreksi
suatu makalah, penyajian hasil penelitian dalam bentuk poster, seminar dan
publikasi ilmiah pada jurnal ilmiah nasional dan internasional. Mahasiswa akan
mendapat kesempatan latihan membuat poster, makalah seminar, bahan
presentasi seminar dan mempresentasikan makalah seminar, serta membuat
publikasi ilmiah.
Ence Darmo Jaya Supena
dan Tim
BIO 743

Transport dan Metabolisme Unsur Hara Tumbuhan

3(2-3) 1

Mata kuliah ini membahas tentang prinsip unsur hara tumbuhan dari
pengetahuan klasik sampai terkini, transport dan metabolismenya di dalam
Katalog 2012 - 521

Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor

tumbuhan. Topik yang dipelajari meliputi definisi dan klasifikasi unsur hara
tumbuhan, fisiologi hara, ketersediaan hara, pergerakan hara dari tanah sampai
tumbuhan; absorpsi dan tranport yang meliputi ion uptake, transpor jangka pendek
dan panjang di dalam tumbuhan, mobilitas hara dalam floem, tinjauan fisiologi dan
molekular tranport melalui ion channel, transporter dan bagian lain dari membran;
asimilasi dan fungsi unsur hara di dalam tumbuhan yang meliputi unsur hara
makro, fiksasi N biologis, hara mikro; aspek-aspek ekologi, genetik dan molekular
dari unsur hara yang meliputi resistensi terhadap penyakit, variasi genetik dalam
pengambilan unsur hara, kompetisi unsur hara, adaptasi tumbuhan terhadap
defisiensi dan keracunan unsur hara. Kuliah akan dilengkapi dengan seminar dan
diskusi.
Triadiati
dan Tim

BIO 744

Biologi Molekular Tumbuhan

3(2-3) 2

Mata kuliah ini akan membahas pendekatan molekular yang digunakan

dalam mempelajari memecahkan masalah-masalah biologi tumbuhan dari mulai
proses-proses perkembangan tumbuhan sampai respon fisiologi. Dalam kuliah ini
akan dipelajari dan didiskusikan topik-topik antara lain, overview pendekatan dasar
molekular dalam biologi tumbuhan; model/sistem ekspresi gen, analisis genetik,
pendekatan molekular dalam mempelajari pembelahan sel, perkembangan
tumbuhan (embriogenesis, meristem, akar, pembungaan); pensinyalan hormon,
interaksi tumbuhan-patogen; respons tumbuhan terhadap cekaman biotik dan
abiotik; fotomorfogenesis; rekayasa genetik pada tumbuhan, projek genom
Arabidopsis dan Padi.
Miftahudin
Utut Widyastuti

BIO 745

Reproduksi Tumbuhan

3(2-3) 1

Reproduksi merupakan tahapan menentukan bagi organisme untuk

kelangsungan hidupnya dan merupakan kajian yang sangat menarik dalam
penelitian dasar biologi tumbuhan maupun pengembangan dan aplikasinya dalam
agrobisnis. Mata kuliah reproduksi tumbuhan membahas mulai dari siklus hidup
dan dasar selular reproduksi seksual dan aseksual; organ dan mekanisme
pembungaan; gametogenesis dan fertilisasi; sampai embriogenesis dan
perkembangan biji. Embriogenesis nonzigotik yaitu embryogenesis somatik,
androgenesis, ginogenesis dan apomiksis; serta perbanyakan vegetatif secara
alami dan induksi in vivo maupun in vitro juga merupakan materi yang dibahas
berikutnya. Kuliah ini akan dilengkapi dengan materi praktikum untuk beberapa
pokok bahasan, presentasi dan diskusi topik pilihan, maupun kunjungan ke
instansi atau perusahaan yang proses kerjanya menggunakan prinsip dasar
reproduksi tumbuhan.
Ence Darmo Jaya Supena
dan Tim

522 - Katalog 2012

Meraih masa depan berkualitas bersama Sekolah Pascasarjana IPB

BIO 746

Fisiologi Tumbuhan Lanjut

3 (3-0) 2

Kuliah ini menjelaskan tentang fisiologi tumbuhan C3, C4 dan CAM, struktur
dan perkembangan fotosistem, respon fotosintesis terhadap CO2 dan suhu global,
efek lingkungan terhadap tumbuhan, fisiologi perakaran, fisiologi tanaman epifit,
fitoremediasi dan fisiologi tumbuhan penambang polutan.
Diah Ratnadewi
Triadiati

BIO 747

Genetika Fisiologi Tumbuhan

3(3-0) 1

Organisasi genetik, ekson dan intron, gen struktural, regulasi ekspresi gen;
elemen pengontrol dan fungsi gen; penyaringan selektif; isozim dan
penggunaannya sebagai ciri dan alat genetik; fisiologi dan genetika interaksi
parasit dan inangnya; pengontrol genetik pada protein biji; Mutan-mutan yang
mempengaruhi fotorespirasi; flavonoid dan karotenoid; mutan dan zat pengatur
tumbuh; transfer DNA ke dalam tumbuhan; mutan auksotropik pada tumbuhan;
peranan genetika fisiologi dalam pemuliaan tanaman.
Suharsono
dan Tim

BIO 748

Produk Alami Tumbuhan dan Rekayasa Metabolik

3(2-3) 2

Membahas aspek-aspek metabolisme sekunder dari tumbuhan, termasuk di

dalamnya tentang terpenoid, flavonoid, alkaloid dan metabolit sekunder lainnya.
Teori dan metode rekayasa metabolit tumbuhan melalui aplikasi teknik-teknik
biologi molekular dan bioteknologi untuk tujuan peningkatan kualitas pangan dan
obat-obatan.
Miftahudin, dan tim

BIO 790

Seminar Biologi Tumbuhan

1(0-2) 1/2

Mempresentasikan topik khusus dalam biologi tumbuhan sesuai dengan

minat mahasiswa di bawah arahan dosen pembimbing (ketua komisi pembimbing
mahasiswa bersangkutan) dalam suatu seminar departemen biologi yang dihadiri
oleh dosen dan mahasiswa pasca sarjana departemen biologi atau mayor biologi
tumbuhan.
Seminar ini bisa disubstitusi dengan presentasi seminar pada
pertemuan ilmiah nasional atau internasional.
Aris Tjahjoleksono
dan Tim

Katalog 2012 - 523