Anda di halaman 1dari 20

LAPORAN PRAKTIKUM KIMIA MEDISINAL

Nama Percobaan

: Latihan Komputer Program Chemofice 2008

Tanggal Percobaan

: 2 Mei 2016

Dilaporkan Oleh

Anggota :
Risa Riski Maulida

(142210101033)

Ainun Nihayah

(142210101043)

Tsulsiyah Zahroh Putri

(142210101051)

Rizka Illa Chassana

(142210101065)

Anjar Rina Rahayu

(142210101071)

Adinda Nadia Naufalia

(142210101079)

Dwi Ayu Yuniarsih

(142210101083)

Kelompok

Dosen Jaga

: B3
: Indah Purnama Sary , M.Farm , Apt.

A. Tujuan
Dalam praktikum ChemOffice 1 ini mahasiswa dapat menggambar struktur 2 dimensi
dari beberapa senyawa obat serta dapat mencari nama kimia struktur menggunakan
program komputer CHEM-OFFICE
B. Teori
Kimia komputasi adalah suatu metode pemodelan dari struktur suatu molekul dengan
menggunakan komputer. Chemoffice merupakan salah satu aplikasi atau program
computer yang berperan dalam kimia komputasi . Chemoffice 2008 adalah program
komputer untuk menggambar struktur kimia obat secara 2 dimensi dan 3 dimensi serta
dapat secara langsung menghitung secara teoritis nilai parameter sifat kimia fisika obat ,
seperti berat molekul (BM) , molar refraksi (MR) , dll.
ChemDraw merupakan salah satu program aplikasi dari Chem Office, untuk
menggambar struktur 2D dalam bidang ilmu kimia, terutama kimia organik, biokimia, dan
polimer. ChemDraw memiliki banyak fungsi, diantaranya membuat nama dan struktur
senyawa,. membuat struktur streokimia dengan benar dari nama kimia, dan mendapatkan
nama IUPAC dengan akurat dari struktur , perkiraan spektra NMR dari struktur suatu

senyawa dengan atom langsung dengan korelasi spektral. Selain itu, ChemDraw
dilengkapi dengan peringatan jika terjadi kesalahan dalam pembuatan struktur kimia.
Peringatan tersebut biasanya berwarna merah dan mengelilingi bagian struktur yang salah.
Tool-tool dalam ChemDraw mewakili berbagai macam bentuk ikatan yang dapat disusun
menjadi struktur kimia sehingga tidak sulit bagi untuk menggambarkan struktur yang
kompleks sekalipun, bahkan juga dalam berbagai bentuk konformasi dan dalam bentuk
proyeksi.
Struktur-struktur tertentu yang telah umum dapat digambar secara langsung dengan
mengklik tool, seperti struktur cincin benzena, siklopentana, sikloheksana dan senyawa
siklis yang lain. Tool dalam ChemDraw juga menyajikan gambar struktur untuk asam
amino, DNA, dan RNA yang terdapat dalam template . ChemDraw merupakan program
aplikasi untuk menggambar yang di lengkapi dengan tool-tool sehingga pengguna dapat
dengan mudah membuat gambar yang diinginkan hanya dengan mengklik tool-tool
tersebut.
ChemDraw juga dapat menganalisis struktur kimia yang telah digambar dengan
menggunakan Analys Struktur pada menu Structure, di sini anda dapat mengetahui sifatsifat fisik struktur tersebut, misalnya, titik didih, titik leleh, berat molekul, temperatur,
tekanan, dll.
C. Alat-alat
Komputer dan kelengkapannya
Program komputer Chemoffice 2008
D. Cara kerja
1. Memilih program Chemoffice 2008
2. Menggambar senyawa
3. Mencetak output
Menggambar Struktur Kimia Dua Dimensi Senyawa Obat dari Senyawa Turunan
Fenol dan Sulfonamide

Menggambar Struktur Senyawa dari Template


a) Amino Acids

b) DNA Template

c) RNA Template

d) Hexoses

e) Mencari gambar struktur kimia suatu senyawa dengan cara menulis


nama kimianya (dalam bahasa Inggris/kimia yang benar) dengan
program komputer Chemoffice 2006.

f) Mencari nama kimia struktur obat dari gambar struktur kimia obat
pada program komputer CHEM-OFFICE 2006

B. Hasil Percobaan
1. Menggambar Struktur Kimia dari Senyawa Obat
a. Asam Mefenamat

b. Fenobarbital

2. Menggambar Struktur Senyawa dari Template


a. Amino acid
1) Alanin

2) Arginin

b. DNA Templates
1) Guaninedeoxyribosenucleotide

2)

Alaninedeoxyribosenucleoside/adenine

c. RNA Templates
1) Cytosineribonucleoside

2) Uracylribosenucleotide

d. Hexoses
1) D-glucose menurut Fischer Projection

2) D-glucose bentuk -pyranose

3) D-glucose bentuk -pyranose

4) D-glucose bentuk -furanose

5) D-glucose bentuk -furanose

3. Menulis nama kimia kloramfenikol , mencari gambar struktur kimia senyawa obat
tersebut dengan Chem Office dan mencari nama kimia strukturnya

C. Pembahasan
Menggambar Struktur Kimia Senyawa Obat
Pada praktikum kali ini mahasiswa melakukan latihan computer program
Chemoffice 2008. Dimana Chemoffice sendiri merupakan program aplikasi yang
digunakan untuk membuat struktur kimia baik dalam bentuk 2-Dimensi dan 3Dimensi dan juga sekaligus dapat mengetahui nilai parameter fisika kimia.
Namun dalam praktikum kali ini yang dilakukan hanya membat struktur kimia
dalam bentuk 2 dimensi dengan menggunakan chemDraw Ultra 8.0. Menggambar
struktur kimia 2-Dimensi dari senyawa turunan Fenol dan sulfonamide antara lain :
Fenol, 4-metil fenol, 4-kloro fenol, Nipagin, Nipasol, Sulfonamid, Sulfamerazin,
Sulfadiazin, Sulfaguanidin, dan Sulfadioksin.
Langkah-langkah yang dapat dilakukan dalam menggambar secara manual
strukturnya aatu menulis nama senyawanya langsung. Menggambar secara manual
strukturnya dapat dilakukan dengan membuat kerangka cincin dan struktur
tersebut, dilanjutkan dengan menambahkan rantai-rantainya (alkil) dan lengkapi
cincin dan alkil dengan unsure atom setelah timbul kotak hitam kecil, karena
apabila terjadi kesalahan maka akan timbul warna kotak merah.
Dalam memanfaatkan program aplikasi chemoffice untuk menggambar
struktur kimia khususnya dari senyawa obat, banyak sekali tool dari menu view
yang dapat dimanfaatkan sesuai dengan kebutuhan untuk senyawa yang ingin
digambar.Tool-tool dalam chemDraw mewakili berbagai macam bentuk ikatan
yang dapat disusun menjadi struktur kimia sehingga tidak akan menjadi sulit untuk
menggambar struktur yang kompleks sekalipun.Struktur struktur tertentu yang
telah umum dapat digambar secara langsug dengan mengklik gambar terseut

Gambar Tool
Ketika menggambar struktur senyawa obat, apabila ingin menyempurnakan
atau membenarkan hasil bentukan atau gambar manual dari struktur yang dibuat,
bisa memanfaatkan Menu Structure, pertama dengan menyeleksi struktur yang

ingin dipilih kemudian pilih Clean Up Structure. Beberapa struktur senyawa obat
yang dibuat pada praktikum kali ini adalah struktur dari senyawa obat
Amoxicillin, Morfin, dan Simvastin.

O
OH
OH

S
H

N
H
NH2
Gambar Amoxicillin

OH

OH

O
O

CH3

CH3

CH3

CH3

HO
Gambar Morphine

Gambar Simvastatin

Struktur Senyawa dari Template


Pada praktikum ini dilakukan percobaan menggambar struktur dari senyawa
menggunakan Chemoffice 2008. Untuk menggambar struktur dari senyawa,
Chemoffice menyertakan ChemDraw dan Chem 3D. Dalam hal ini yang
digunakan untuk menggambar struktur senyawa menggunakan ChemDraw.
ChemDraw merupakan program aplikasi untuk menggambar struktur 2D yang di
lengkapi dengan tool-tool sehingga pengguna dapat dengan mudah membuat
gambar yang diinginkannya hanya dengan mengklik tool-tool tersebut. Strukturstruktur tertentu yang telah umum dapat digambar secara langsung dengan
mengklik tool, seperti struktur cincin benzena, siklopentana, sikloheksana dan
senyawa siklis yang lain. Tool dalam ChemDraw juga menyajikan gambar struktur
untuk asam amino, DNA, dan RNA yang terdapat dalam template, tinggal klik,
membawanya ke layar, drag, maka jadilah gambar struktur yang diinginkan.
Pada percobaan kedua ini yaitu menggambar struktur senyawa dari template
yaitu asam amino, DNA template, RNA template, dan hexose. Yang pertama,
menggambar struktur senyawa asam amino, dilakukan dengan cara menekan kotak
template pada tool yang tersedia, kemudian mencari asam amino, menekan gambar
alanin. Selanjutnya menekan pointer pada layar maka akan tergambar struktur
alanin. Lakukan hal yang sama untuk struktur arginin. Yang kedua, menggambar
struktur DNA templates, yang dilakukan dengan cara mencari DNA templates
dengan menekan kotak template, kemudian pada alanin pada DNA template tekan
gambar deoxyribosenucleoside. Selanjutnya, menekan pointer pada layar maka
akan tergambar struktur Alaninedeoxyribose-nucleoside. Lakukan hal yang sama
pada

Guaninedeoxyribosenucleoside

dengan

menekan

gambar

deoxyribonucleotide pada Guanine. Yang ketiga, menggambar struktur senyawa


RNA templates. Caranya sama dengan menggambar struktur senyawa DNA
templates. Pada RNA templates dilakukan dengan cara mencari RNA templates
pada kotak template, kemudian pada Cytosine tekan gambar ribonucleoside.
Selanjutnya, menekan pointer pada layar maka akan tergambar struktur
Alanineribosenucleoside.

Lakukan

hal

yang

sama

untuk

struktur

Uracilribosenucleoside, pada Uracil ditekan gambar ribosenucleotide. Yang


terakhir yaitu menggambar struktur dari hexose, dengan menekan kotak templates
dan mencari pada hexose. Pada Fischer Projection tekan gambar D-glucose,
kemudian menekan pointer pada layar maka akan tergambar struktur D-glucose
menurut proyeksi Fischer. Untuk menggambar bentuk -pyranose, cari pada

hexose kemudian tekan gambar D-glucose. Selanjutnya, menekan pointer pada


layar maka akan tergambar struktur D-glucose bentuk -pyranose. Lakukan hal
yang sama untuk D-glucose bentuk -pyranose. Untuk menggambar struktur
bentuk furanose, cari pada hexose pada -furanose form tekan gambar D-glucose.
Kemudian, menekan pointer pada layer maka struktur D-glucose bentuk furanose. Lakukan hal yang sama untuk D-glucose bentuk -furanose.
D. Daftar pustaka
Siswandono dan Soekardjo B. 2000. Kimia Medisinal 1. Surabaya : Airlangga University
Press
Siswandono dan Soekardjo B. 1998. Prinsip-prinsip Rancangan Obat. Surabaya :
Airlangga University Press

E. Tugas
1. Membuat gambar struktur kimia (dua dimensi) dari senyawa turunan fenol dan
sulfomida ; menentukan nilai parameter sifat kimia fisika meliputi ; parameter lipofilik
(log P) , parameter elektronik (pKa) dan parameter sterik (BM) serta molar refraksi
(MR)
Struktur

Struktur

Fenol

4-metil fenol

4-kloro fenol
Nipagin

Sulfanilamid
Nipasol

Sulfamerazin

Sulfadiazin

Sulfaguanidin

Sulfadoksin

2. Menggambar Struktur Kimia Senyawa Obat


Struktur
Amoxicillin

Morfin

Simvastatin

3. Menulis nama kimia suatu senyawa (dalam bahasa inggris/kimia yang benar) dan cari
gambar struktur kimia senyawa tersebut dengan program KOMPUTER CHEMOFFICE 2006
Digunakan senyawa : Alizarin

4. Dari gambar struktur kimia obat tersebut , dicari nama kimia struktur tersebut dengan
program KOMPUTER CHEM-OFFICE 2006

5. Digambar stuktur senyawa obat dan nama kimianya :


a. Asetosal (Aspirin)

b. Parasetamol (Paracetamol)

c. Hidrokortison (Hydrocortisone)

Anda mungkin juga menyukai