TUGAS MATA KULIAH TEKNOLOGI INFORMASI

RINGKASAN TENTANG SOFTWARE KIMIA

OLEH :
FELIXNA ELIN VINSENSYA (14081105053)
ROSANTI S.T MBATU (1408105057)
MELLI ( 1408105065)

JURUSAN KIMIA
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS UDAYANA
2015

1.1 Macam-macam Software Pembuat Struktur Molekul

Sekarang ini, telah banyak software yang diciptakan orang untuk membuat struktur
molekul. Software-software tersebut kini telah tersebar luas. Software-software tersebut
diantaranya adalah:
1. ChemOffice
ChemOffice merupakan salah satu software yang digunakan untuk membuat struktur
kimia dengan mudah dan digunakan untuk menggambar secara 2 dimensi (2-D) dan 3
dimensi (3-D). ChemDraw merupakan salah satu program aplikasi dari ChemOffice, untuk
menggambar struktur 2D dalam bidang ilmu kimia, terutama kimia organik, biokimia, dan
polimer.
2. HyperChem
Program

HyperChem,

merupakan

program

kimia

yang

dikembangkan

oleh HyperCube Inc, untuk sistem operasi Windows 95/98, Windows NT, Windows XP,
Windows Vista, Windows 7 dan Linux. HyperChem menyediakan fasilitas pembuatan model
tiga dimensi (3D), perhitungan mekanika molekuler dan mekanika kuantum.
3. Jmol
Jmol adalah software visualisasi struktur molekul dalam tiga dimensi yang ditulis
dengan program Java. Fitur yang dimiliki software ini adalah membaca berbagai jenis file
input dan output dari program-program kimia kuantum seperti VASP, serta animasi file multiframe dan modus normal yang dihitung dari program kuantum.
4. Avogadro
Avogadro adalah software kimia gratis, open source, tersedia dalam berbagai paltform
sistem operasi merupakan editor molekul yang dirancang untuk digunakan secara fleksibel
dalam kimia komputasi, pemodelan molekul, bioinformatika, ilmu material, dan bidang
terkait lainnya. Avogadro yang tersedia dapat dijalankan pada sistem Windows, Linux, dan
Mac OS X.
5. ChemSketch
ChemSketch adalah software yang digunakan untuk mengambar dan memodelkan
struktur kimia seperti software ChemOffice. Software ChemSketch dapat mengambar
struktur kimia dalam bentuk 2D dan 3D. Program ini juga menyediakan struktur asam amino,
alkaloid, karbohidrat, asam nukleat, DNA/RNA, lab kit (semua peralatan kimia berupa gelas),

orbital, senyawa phospor, steroid, terpen, dll. Software ini juga menyediakan pengambaran
kurva dan grafik.
6. ChemDoodle
ChemDoodle adalah software yang digunakan untuk menggambar struktur kimia baik
dalam bentuk 2D atau 3D. Software ini juga menyediakan tool-tool yang yang mudah
digunakan seperti ikatan, berbagai macam bentuk cincin, orbital, spektra, grafik, tabel
periodik dan masih banyak tool-tool yang lain yang memudahkan kita untuk
menggunakannya. Software ini hampir mirip dengan software ChemSketch dan ChemOffice.
Software ini bisa dijalankan di sistem Windows, Linux, OSX dan didukung oleh program
Java.
2.2.

ChemOffice
ChemOffice merupakan software yang dikeluarkan oleh CambridgeSoft. ChemOffice

merupakan salah satu software yang digunakan untuk membuat struktur kimia dengan mudah
dan digunakan untuk menggambar secara 2 dimensi (2-D) dan 3 dimensi (3-D). ChemOffice
terdiri atas tiga aplikasi kimia yaitu ChemDraw, Chem3D dan ChemFinder. Software ini
dapat dijalankan pada sistem Macintosh dan Microsoft Windows.
ChemDraw merupakan salah satu program aplikasi dari ChemOffice, untuk
menggambar struktur dua dimensi dalam bidang ilmu kimia, terutama kimia organik,
biokimia, dan polimer. Sedangkan, untuk membuat struktur tiga dimensi, dapat dilakukan
dengan menggunakan Chem3D.
2.2.1. Fungsi-fungsi ChemOffice
Dengan menggunakan Chemoffice, kita tidak hanya bisa membuat struktur molekul.
Selain membuat struktur molekul, software ChemOffice sebenarnya masih memiliki beberapa
fungsi yang lain.
Fungsi-fungsi yang dapat dijalankan oleh Chemoffice adalah:
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.

Membuat struktur molekul dua dimensi.

Membuat struktur molekul tiga dimensi.
Konversi struktur molekul ke nama.
Konversi nama senyawa ke strukturnya.
Simulasi spektrum massa.
Simulasi spektrum NMR.
Koleksi template.

2.2.2. Membuat Struktur Molekul dengan ChemOffice

Membuat struktur molekul menggunakan ChemOffice tidak terlalu sulit. Misalnya

saja membuat struktur dua dimensi dari senyawa 1 propanol dengan menggunakan aplikasi
ChemDraw.
Senyawa 1 propanol dengan rumus molekul C 3H7OH memiliki struktur molekul
seperti pada gambar 2.
H2
C

H3C

H2
C

OH

1-Propanol

Gambar 2. Struktur dua dimensi 1 propanol.

Cara membuat struktur molekul dua dimensi menggunakan aplikasi ChemDraw dapat
dilakukan dengan langkah-langkah berikut:
1. Buka aplikasi ChemDraw.
2. Untuk membuat rantai karbonnya, gunakan Text tool, kemudian ketik CH3.

Gambar 3. Menggunakan Text tool pada ChemDraw.

3. Gunakan tool Solid Bond, kemudian klik pada huruf C, lalu tarik lurus ke kanan.

Gambar 4. Membuat ikatan menggunakan Solid Bond.

4. Klik lagi Text tool, kemudian ketik C, lalu tarik lagi ke kanan. Ulangi sekali lagi
hingga terbentuk cabang propil.

Gambar 5. Membentuk cabang propil.

5. Tambahkan OH di ujung cabang propil. Terbentuklah struktur senyawa 1 propanol.

Gambar 6. Terbentuk 1 propanol.

Selain dalam bentuk dua dimensi, dengan ChemOffice kita juga bisa membuat
struktur molekul tiga dimensi dengan menggunakan aplikasi Chem3D. Contohnya untuk
membuat struktur tiga dimensi dari 1 propanol dapat dilakukan dengan langkah-langkah
berikut:
1. Buka aplikasi Chem3D.
2. Buat ikatan tunggal dengan dua atom C menggunakan tool ikatan tunggal yang
terdapat di sebelah kiri.

Gambar 7. Membuat ikatan tunggal dengan dua atom C.

3. Tambahkan satu atom C lagi dengan mengganti salah satu atom hidrogen dengan
atom karbon dengan menggunakan Text tool.

Gambar 8. Menambahkan satu atom C.

4. Kemudian tekan Enter, maka terbentuklah struktur propana.

Gambar 9. Propana.
5. Untuk menambahkan gugus alkohol, ganti salah satu atom H yang terikat di atom C
yang berada di ujung dengan atom O.

Gambar 10. Menambahkan atom O.

6. Kemudian tekan Enter, maka terbentuklah struktur 1 propanol.

Gambar 11. 1 propanol.

7. Ganti tampilan Sticks dengan Ball & Sticks.

Gambar 12. Struktur Ball & Sticks 1 propanol.

8. Terbentuklah struktur tiga dimensi dari 1 propanol. Untuk melihat lebih jelas
susunan atom pada molekul, kita dapat memutar gambar molekul.

Gambar 13. Memutar struktur 1 propanol.

2.3.

HyperChem
HyperChem merupakan salah satu program komputasi kimia yang dapat digunakan

untuk membuat struktur molekul. Program ini dikembangkan oleh HyperCube Inc untuk
sistem operasi Windows 95/98, Windows NT, Windows XP, Windows Vista, Windows 7 dan

Linux. HyperChem merupakan program pembuat model molekul canggih yang dikenal
karena kualitas, fleksibilitas serta penggunaannya yang mudah.
Dengan menggunakan HyperChem, kita dapat membuat struktur molekul dalam
bentuk tiga dimensi.
Tidak hanya itu, berbagai macam pekerjaan komputasi kimia yang berhubungan
dengan molekul dapat kita kerjakan dengan menggunakan HyperChem. Itu karena program
ini memadukan visualisasi 3D serta animasi dengan perhitungan kimia kuantum, mekanika
molekuler, dan dinamika.
2.3.1. Fungsi-fungsi HyperChem
Fungsi utama program HyperChem ini adalah menampilkan struktur molekul tiga
dimensi. Namun fungsi HyperChem tidak sebatas hanya menampilkan struktur, tapi juga
dilengkapi dengan fungsi-fungsi yang lain. Fungsi-fungsi tersebut antara lain adalah:
1. Membuat model struktur molekul dari atom-atom dan menampilkannya dalam bentuk
2.
3.
4.
5.
6.

tiga dimensi.
Membuat model protein dan asam nukleat dari residu standarnya serta modifikasinya
Membuat model molekul dari Protein Data Bank.
Menata ulang molekul dengan rotasi, translasi maupun zoom.
Mengubah tampilan molekul (Rendering).
Perhitungan-perhitungan kimia dengan berbagai metode, seperti dinamik melekuler,
mekanika molekuler, semiempirik dan mekanika kuantum.

2.3.2. Membuat Struktur Molekul dengan HyperChem

Untuk membuat struktur molekul dengan menggunakan program HyperChem tidak
sulit. Misalnya saja untuk membuat struktur molekul senyawa 1 propanol dilakukan dengan
langkah-langkah berikut:
1. Buka aplikasi HyperChem. Klik Build, kemudian pilih Default Element... lalu
pilih atom Carbon.

Gambar 14. Memilih unsur pada Default Element Table.

2. Buat cabang propil dengan membuat tiga atom karbon.

Gambar 15. Membuat tiga atom karbon.

3. Klik salah satu atom karbon, kemudian tarik ke arah atom yang lain hingga ketiga
atom terhubung dan membentik garis.

Gambar 16. Menghubungkan ketiga atom karbon.

4. Klik atom Oxygen pada Element Table, kemudian tambahkan satu atom Oksigen, lalu
hubungkan dengan atom karbon.

Gambar 17. Menambahkan atom oksigen.

5. Klik Build kemudian pilih Add H & Model Build. Terbentuklah struktur 1
propanol.

Gambar 18. Struktur Sticks 1 propanol.

6. Klik Display, pilih Rendering, lalu pilih Balls & Sylinders untuk melihat
struktur yang berbentuk seperti bola dan stik.

Gambar 19. Struktur Balls & Sticks 1 propanol.

2.4 chemsketh

ChemSketch adalah software yang digunakan untuk mengambar dan memodelkan

struktur kimia seperti software ChemOffice. Software ChemSketch dapat mengambar
struktur kimia dalam bentuk 2D dan 3D. Software ini sangat mudah digunakan, hanya dengan
mengklik dan mendrag tool-tool yang tersedia untuk mengambar struktur yang diinginkan.
Program ini juga menyediakan struktur asam amino, alkaloid, karbohidrat, asam nukleat,
DNA/RNA, lab kit (semua peralatan kimia berupa gelas), orbital, senyawa phospor, steroid,
terpen, dll. Software ini juga menyediakan pengambaran kurva dan grafik.
Cara menggambar rumus struktur senyawa hidrokarbon dengan menggunakan
ChemSketch adalah sebagai berikut:

1. Buka ChemSketch dari Star-Program-ACDLabs12-Chemsketch. Pada keadaan

standar
(default)
ChemSketch
dalam
mode
Structure.

2. Agar semua atom C muncul nantinya silahkan atur propertiesnya dari ToolsStucutures Properties. Caranya Centang All pada Show Carbons pada tab Common.

3. Pastikan anda ada pada mode Stukture dan bukan pada mode Draw.
4. Klik Atom C pada menu yg ada disamping kiri layar kerja chemsketch.
5. Drag kemudian klik sekali untuk membuat satu C (metana) dan drag lagi dengan
menyambung C pertama itu dan klik untuk menambah satu atom C untuk menjadi
etana. Begitu seterusnya, untuk membuat percabangan tinggal klik pada C utama yang

akan

dijadikan

tempat

percabangan

kemudian

di

drag

dan

klik.

6. Pastikan rumus struktur yg digambar pada langkah sebelumnya terpilih, jika belum
klik toolbar yang persis di bawah tulisan mode draw. Kemudian lakukan penseleksian
struktur untuk tujuan menampilkan secara stukutur terkembang dengan atom H dan C
nampak. Caranya klik Tools-Add explicit hydrogens. Jika berhasil maka tampilannya

menjadi

seperti

dibawah

ini.

7. Untuk menyalinnya agar bisa dikopikan ke dalam microsoft word, pindahkan dari
mode Structure ke mode Draw
8. Salin (copy) rumus struktur yang sudah jadi kemudian letakkan (rekatkan/paste)
dalam microsoft word.
9. Selesai.
Berikut adalah beberapa aplikasi yang bisa digunakan untuk mendukung pembelajaran
kimia. Diberikan sedikit paparan dan tautan untuk menuju sumber utamanya sehingga bisa
di-download di komputer. Banyaknya aplikasi visualisasi molekul ini tentu menjadikan kita
punya banyak pilihan disesuaikan dengan kenyamanan masing-masing pengguna.

JMol (Platform : Windows, Linux, Mac)

Jmol ini gartis, merupakan penampil strukutur molekul tiga dimensi (molecule
viewer) yang dapat digukan secara bebas oleh siapapun yang menekuni bidang kimia dan
biokimia. Aplikasi ini merupakan cross-platform, berjalan di sistem operasi Windows, Mac
OS X, dan Linux / Unix. Fitur yang dimilikinya di antaranya membaca berbagai jenis file dan
output dari program kimia kuantum, dan animasi file multi-frame. JmolApplet adalah applet
web browser yang dapat diintegrasikan ke dalam halaman situs. Aplikasi Jmol adalah aplikasi
Java standalone yang berjalan di desktop. JmolViewer merupakan seperangkat alat yang
dapat diintegrasikan ke dalam aplikasi Java lainnya.

ACD/ChemSketch

Freeware

(Platform

Windows,

Linux)

Chemsketch adalah software grafis untuk menggambar hal yang ada hubungannya dengan
kimia . Bisa menggambar secara manual atau menggunakan templet yang disediakan. Klik
dan gambar molekul, ion, stereobonds, teks, poligon, panah, serta perlengkapan laboratorium,
dll termasuk menentukan secara otomatis massa suatu atom atau molekul. Kita juga dapat
memperkirakan densitas, indeks bias, volume molar, dll. Selain itu dari ACDLabs juga
menawarkan beberapa download gratis untuk utilitas yang dapat dipergunakan dalam
ChemSketch sehingga lebih powerfull. MarvinSketch adalah software untuk menggambar
struktur molekul. MarvinSketch dibuat oleh Chemaxon. MarvinSketch dapat digunakan
secara gratis. Jika anda ingin menambah fitur seperti NMR Prediction, PKa prediction dll
maka anda bisa membayar. Atau anda bisa juga mengajukan Academic License untuk
mendapatkan full features tanpa biaya sepeserpun. Dengan versi gratis pun sebenarnya sudah
cukup memuaskan.

Tampilan antarmuka MarvinSketch (dok pri)

Fitur yang ada pada MarvinSketch (versi gratis) cukup komplit. Sama seperti ChemDraw,
MarvinSketch mendukung fitur convert name to structure dan juga sebaliknya. MarvinSketch
juga memiliki fitur pencarian struktur secara online menggunakan ChemSpider, Chemicalize,
dan PubChem. Struktur yang digambar di MarvinSketch dapat disimpan dalam format mol,
cube, dan berbagai format populer lainnya. Selain itu struktur tersebut juga bisa diekspor
menjadi file gambar.

Molegro Molecular Viewer (Platform: Windows, Linux, dan Mac OS X)

Sumber http://ahsystemsgroup.com
Aplikasi gratis dengan multiplatform yang digunakan untuk visualisasi molekul dalam
format PDB, SDF, Mol2, dan MVDML. Fiturnya meliputi pembuatan molekul secara
otomatis, visualisasi permukaan molekul dan backbone.
Ukuran file untuk windows sebesar 5,52 MB
Ukuran file untuk windows sebesar 9,41 MB

Symyx Chime dan Symyx Draw (Platform: Windows dan MacOSX, Linux belum
tersedia)

Sumber http://blog.goo.ne.jp/
Kedua aplikasi ini gratis (no fee) siapapun boleh mengunduhnya dan memakainya
secara cuma-cuma. Sebelum mengunduhnya diharuskan melakukan registrasi dengan
mengisikan beberapa data yang empunya situs perlukan. Sayang untuk platform linux belum
tersedia jadi mesti menggunakan Wine agar bisa menjalankannya di linux. Kedua software ini
saling melengkapi sehingga kita bisa memanfaatkannya dalam program pengajaran di kelas
untuk mata pelajaran kimia.Symyx Chime versi 2.6 SP8 berformat zip berukuran 3,9 MB.
Chime merupakan plug-in yang secara interaktif menampilkan molekul 2D (dua dimensi) dan
3D (tiga dimensi) langsung di halaman Web. Kita juga dapat memutar, memformat, dan
menyimpan molekul untuk digunakan dalam program lain.Symyx Draw versi 3.3 berukuran
cukup besar dalam format zip (66 MB). Dengan aplikasi ini kita bisa menyisipkan model
molekul yang kita buat ke dalam halaman situs, dokumen, spreadsheet maupun presentasi.

Kalzium (Platform: Linux)

Kalzium adalah nama sebuah software (open source software - OSS) yang memanfaatkan
tabel periodik untuk mengeksplorasi setiap unsur. Tapi ternyata tidak sekedar tabel periodik
biasa, lebih dari sekedar tabel periodik. Kalzium berasal dari bahasa Jerman dari kata
kalsium. Saat ini Kalzium sampai di versi Hidrogen. Untuk diketahui semenjak Kalzium

menjadi aplikasi standalone ia versinya akan dinamai dengan urutan nama unsur dalam tabel
periodikTentu ini hanya merupakan alternatif dalam penggunaan media pembelajaran.
Sampai saat ini Kalzium belum mendukung untuk sitem operasi Windows. Hanya bisa
berjalan untuk sistem operasi Linux. Oleh karena itu di sarankan pengguna yang ingin
mencobanya sebaiknya meningstall sistem operasi Linux, gratis dan halal. Silahkan pilih
distro yang disukai.

MarvinSketch (Platform: Windows, Linux, MacOS)

Banyak hal yang bisa dimanfaatkan dari MarvinSketch untuk pengajaran kimia. Gambar
dan animasi molekul dapat dibuat dengan mudah. Selanjutnya dapat disisipkan dalam media
pembelajaran kimia.. MarvinSketch adalah software kimia hanya untuk visualisasi rumus
struktur kimia yang gratis, bisa dijalankan di sistem operasi Windows dan Linux juga
MacOS.
CHEMDOODLE

ChemDoodle adalah software yang digunakan untuk menggambar struktur kimia baik
dalam bentuk 2D atau 3D, sehingga teman-teman dapat memahami struktur senyawa kimia
menurut teori. Software ini juga menyediakan tool-tool yang yang mudah digunakan seperti
ikatan, berbagai macam bentuk cincin, orbital, spektra, grafik, tabel periodik dan masih
banyak tool-tool yang lain yang memudahkan kita untuk menggunakannya. Software ini
hampir mirip dengan software ChemSketch dan ChemOffice. Software ini bisa dijalankan di
sistem Windows, Linux, OSX dan didukung oleh program Java.

BALL AND STICK

Balls & Sticks (BS) adalah perangkat lunak gratis untuk menggambarkan struktur kimia,
terutama kristal, dalam 3D dan dapat menghasilkan gambar bitmap yang dapat disalin ke
clipboard dan ditempelkan (paste) pada dokumen pengolah kata seperti Microsoft Word.

DAFTAR PUSTAKA
http://www.teguhsantoso.net/2014/08/marvinsketch-software-alternatif.html di akses pada
tanggal 30 Oktober 2015.
http://riotirta.blogspot.co.id/p/software.html di akses pada tanggal 30 Oktober 2015.
Amalia, Nurul. 2012. Avogadro (Program Kimia ChemPup), (Online), (http://nurulamilia.blogspot.com/2012/01/avogadro-program-kimia-chempup.html,

diakses

tanggal 30 Oktober 2015).

Amalia,

Nurul.

2012.

ChemOffice,

(Online),

(http://nurul-

amilia.blogspot.com/2012/01/chemoffice.html, diakses tanggal 30 Oktober 2015).

Amalia,

Nurul.

2012.

HyperChem,

(Online),

(http://nurul-

amilia.blogspot.com/2012/01/hyperchem.html, diakses tanggal 30 Oktober 2015).

Amalia, Nurul. 2012.

Jmol (Program Kimia ChemPup), (Online), (http://nurul-

amilia.blogspot.com/2012/01/jmol-program-kimia-chempup.html, diakses tanggal

30 Oktober 2015).
Amalia,

Nurul.

2012.

Kemampuan

HyperChem,

(Online),

(http://nurul-

amilia.blogspot.com/2012/01/hyperchem.html, diakses tanggal 30 oktober 2015).

Anonim.

2012.

Aplikasi

ChemPup:

Jmol,

(http://flexaero.blogspot.com/2012/01/aplikasi-chempup-jmol.html,
tanggal 31 Oktober 2015 ).

(Online),
diakses

Anonim. Tanpa Tahun. ChemDraw, (Online), (http://en.wikipedia.org/wiki/ChemDraw,

diakses tanggal 31 Oktober 2015).
Anonim.

Tanpa

Tahun.

Hyperchem

7.5,

(Online),

(http://www.chemistry-

software.com/hyperchem/hyperchem7.5.htm, diakses tanggal 31 Oktober 2015).

Faijal.

2010.

Hyperchem,

(Online),

(http://faijalchemistry.blogspot.com/2010/04/hyperchem.html, diakses tanggal 31

Oktober 2015).
Khanza. 2012. Menggambar Rumus Kimia dengan ChemOfiice 2010, (Online),
(http://khanzamultimedia.blogspot.com/2012/04/menggambar-rumus-kimiadengan.html, diakses 31 Oktober 2015 ).