STRUKTUR MOLEKULER DNA & RNA

MUJOSEMEDI
LAB BIOLOGI FK UNS

1. GENOME MANUSIA
Genome adl komplemen khrom haploid (the
complete set of chromosomes) = 23 khrom.
Sel manusia (diploid, nonreplicated) = 46
khrom td 6x109 bp (base pairs). Tiap pasang
basa berikatan dg 6 molk H2O = 0.34 nm
pjg molk DNA = 2 m.

Bgmn fit 2 m hydrated DNA kedlm nukleus

[diameter 10 m (1 m = 1 x 10-6 m)] &
mudah
diakses
enzim
dan
prot
regulatornya?
Jwban tgt pd bgmn molk DNA dipak.
11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

Pengemasan DNA
11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

 Khrom td khromatin = DNA +

prot
Prot khromatin td histone &

nonhistone

(prot

regulator,

enzimatis & prot struktural)

Prot histone ada 5 kelas

berdasar kandungan lys & arg
: H1, H2A, H2B, H3, & H4.
11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

 Khromatin juga mengandung RNA (dlm pembtkan) & snRNA

(terlibat dlm pre mRNA splicing).
DNA & histon diorganisasi kedlm subunit berulang yg dsb
nucleosome
Nucleosome td nucleosome core particle (NCP) yg
mengandung 146 bp supercoiled DNA yg mengelilingi 2 x
kompleks 8 molk histone (H2A, H2B, H3, & H4).
Histone H1 tltk diluar NCP.
NCP dihub satu sm lain oleh linker DNA (pjg 60 bp).
11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

NUCLEOSOME :

Histone H1
diluar NCP.

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

terltk

2. DNA & RNA

Difraksi sinar X pd molk DNA

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

 DNA : Deoxyribonucleic acid,

adl sebuah polynucleotida
linear ganda, yg berfungsi sbg
molk informasi genetik yg
mengandung deoxynucleotida
Adenine (A), Guanine (G),
Cytosine (C) & Thymine (T).

Gbr molk DNA (hasil difraksi sinar

X)

11/4/2010

RNA : Ribonucleic Acid, adl

sebuah polynucleotida linear
tunggal yg mengandung
ribonucleotida Adenine (A),
Guanine (G), Cytosine (C), &
Uracyl (U).

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

DNA DAN RNA :

DNA
stranded

double
helix

(pita/rantai ganda)
RNA single strand

(pita/rantai tunggal)

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

DNA DOUBLE HELIX :

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

10

Bbrp bentuk DNA :

a. A-DNA : right handed and double stranded DNA containg about 11
residue per turn. It is formed through the dehydration of B-DNA
b. Z-DNA : A formed of DNA in which the two antiparallel polynucleotida
chains form a left handed double helix. It consists of about twelfe

residues per turn and has been shown to be present along with B-DNA
in chromosomes and may have a role in regulation of gene expression.
c. B-DNA : The classic form Watson Crick double helix DNA containing
about 10 residues per turn; having a helix diameter of about 24 A. The
planes of the base pairs in the double helix are perpendicular to the
helix axis
11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

11

A, B and Z-DNA
11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

12

DNA double helix

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

13

Perpasangan Basa DNA

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

14

 Perpasangan Basa DNA antara pita yg satu dg pita yg lain dihub oleh
ikatan hydrogen.
Antara gula yg satu dg gula yg lain dlm satu pita dihub oleh ikatan
phosphodiester.
11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

15

MOLEKUL DNA :
Dua pita/rantai (strand) antiparallel.
Right handed double helix.
10 nukleotida per putaran helix.
Dinomori dr kanan ke kiri (dlm 1 rantai berakhir pd 3C dan
5C berkenaan dg atom C pd deoxyribose).
11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

16

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

17

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

18

5. NUKLEOTIDA DNA & RNA :

Nucleotida adl the basic building block dr asam nukleat, yg td

basa nitrogen (purine atau pyrimidine), sebuah gula pentosa

(ribosa atau deoxyribosa) dan sebuah phosphate

Antara basa nitrogen
dan

gula

pentosa

dihubungkan
ikatan

oleh

glycosidic

(kovalen)
11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

19

NUKLEOTIDA :

Nukleotida =

basa + gula + phosphate

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

20

6. BASA DNA :
a) PURINE
(A + G)

b) PYRIMIDINE
(T + C)

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

21

BASA :

Basa DNA adl A, G, C, dan T.

Basa RNA adl A, G, C, dan U (Uracil)
11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

22

7. GULA DNA & RNA :

Gula DNA adl pentosa (td 5 atom C) deoxyribosa.

Gula RNA adl pentosa ribosa.
11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

23

PERPASANGAN BASA KOMPLEMENTER PD DNA:

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

24

 DNA merup molk rantai panjang

dr nucleotida (polynucleotida).

Tiap rantai berakhir pd 3 OH

dan 5 PO4.

Arah rantai DNA adl antiparalel.

Antara A dan T dihub oleh 2
ikatan H (hydrogen) sdgkan ant
G dan C dihub oleh 3 ikatan H.
11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

25

PENAMBAHAN NUKLEOTIDA BARU PD UJUNG 3OH DNA :

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

26

Penambahan nukleotida baru pada ujung 3OH dikatalisis oleh enzim

DNA polymerase III dg menggunakan pita satunya sbg template
11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

27

ANIMASI PENAMBAHAN NUKLEOTIDA BARU PD 3OH :

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

28

FUNGSI DAN TIPE RNA SEL EUKARYOTE :

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

29

STRUKTUR mRNA :

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

30

tRNA :

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

31

tRNA :

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

32

rRNA :

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

33

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

34

RIBOSOM RNA (rRNA) :

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

35

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

36

DOGMA SENTRAL BIOLOGI MOLEKULER :

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

37

DOGMA SENTRAL BIOLOGI MOLEKULER :

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

38

11/4/2010

BLOK 3 BIOLOGI MOLEKULER

39