INTRODUCCION

Posiblemente, con la aparicin de la segunda edicin del tratado The Procaryotes,

publicado hace catorce aos, desglosado en cuatro volmenes y editado por A.
Balows, H.G.Trper, H. Dworkin, W. Harder y K.H. Schleifer (1991), se ha
consolidado una nueva visin, un nuevo enfoque, en el estudio de la taxonoma
bacteriana. Segn sus autores trata de la ecofisiologa, aislamiento, identificacin
y aplicaciones de la biologa de las bacterias.
El conocimiento del mundo bacteriano y su organizacin de acuerdo a un modelo
filogentico es un anhelo tan antiguo como la propia bacteriologa. Con la llegada
de las tcnicas de secuenciacin molecular se pudo disponer de las herramientas
adecuadas para construir un modelo taxonmico fundamentado en una autntica
filogenia. Como afirman los autores de este tratado, la Microbiologa es una
ciencia sin pasado. A diferencia de la Zoologa y la Botnica, la Microbiologa
carece de una dimensin histrica basada en el conocimiento de la evolucin
estructural de sus representantes. No se dispona de una historia evolutiva. Con
todo, la ordenacin familiar de la antigua clasificacin con sus engaosas
connotaciones proporcion el camino hacia un valioso sistema filogentico; por
ello, y aunque hemos comenzado este breve relato histrico a partir de la
aportacin rigurosa ms moderna, es necesario presentar un modesto recorrido
de la taxonoma a partir de sus inicios.

El siglo XIX fue testigo de la transformacin de un sistema de clasificacin basado

en la idea de Linneo que haba conseguido una sistemtica filogentica para los
metazoos. El xito de este sistema resida en la complejidad morfolgica de
animales y vegetales, el estudio de la ontogenia y el conocimiento de los fsiles
existentes. Ante estas circunstancias, los primeros microbilogos reconocieron las
ventajas de esta clasificacin e intentaron trasladarla hasta los microorganismos,
pero la simplicidad morfolgica de los microorganismos, las caractersticas de su
desarrollo y la ausencia de fsiles condujeron estos planteamientos hacia un
completo fracas. En tiempos de L. Pasteur y F. Cohn los bacterilogos luchaban
frente a cuestiones bsicas relacionadas con la naturaleza de las bacterias, su
pleomorfismo (con frecuencia se trabajaba, involuntariamente, con cultivos

mixtos), la dificultad de su aislamiento y cultivo, as como la investigacin de un

nmero suficiente de caracteres que proporcionasen diferenciaciones tiles para
su identificacin. Era evidente que no resultaba importante establecer un sistema
taxonmico natural de clasificacin; probablemente lo ms interesante en aquellos
momentos se basaba en la ubicacin de las bacterias en el 3 er Reino de Haeckel
(Monera), as como la proximidad de las mismas respecto a las algas azules. De
acuerdo a estos principios se construye un sistema simple de formas genricas
cuya base era la fisiologa y morfologa de las bacterias.

Al acabar la centuria, y coincidiendo con la descripcin de numerosas bacterias

patgenas, el conocimiento de la microbiologa experimenta un avance
importante. En este sentido, microbilogos como Kluyver y Van Niel aportan
numerosos datos que se traducen en un estudio ms riguroso de la taxonoma
bacteriana; no obstante, este conocimiento se basa ms en la morfologa que en
la fisiologa porque para ellos las bacterias mostraban un gran rango de
adaptacin poco predecible a distintos medios.

En realidad poda hablarse de dos sistemas de clasificacin bacteriana que

abarcaban dos finalidades distintas; la clasificacin natural, anloga a la utilizada
en organismos superiores y que agrupaba a los microorganismos de acuerdo a su
semejanza y presuntiva posicin filogentica y, en segundo lugar, la clasificacin
utilitaria que pretenda caracterizar a cada especie en funcin de las dems.
Como puede verse, no era fcil conseguir la unidad entre estos dos modelos de
clasificacin. No haba una separacin neta entre los distintos tipos bacterianos ni
en caracteres morfolgicos ni en caracteres fisiolgicos. No se conocan
mecanismos de intercambio gentico claros que situaran en unos lmites definidos
a una especie bacteriana concreta, y por supuesto, resultaba muy complicado
situar en zonas geogrficas determinadas a la mayora de las especies
bacterianas conocidas porque eran prcticamente cosmopolitas.
En 1786 Mller distingue solamente dos clases de Animlculos : Monas y Vibrio.
En 1838 Ehrenberg distingue cinco gneros bacterianos que incluye en el Reino
Animal. Este autor habla de Bacterium, Vibrio, Spirillum, Spirochaeta y
Spirodiscus, segn las bacterias se presentaran en forma de bacilos rgidos,

bacilos flexibles, espirales rgidas, espirales flexibles y espirales aplastadas

respectivamente.
En 1872, Cohn, asigna por vez primera a las bacterias una naturaleza vegetal y
distingue 6 gneros: Micrococcus (esfricos), Bacterium (bacilos cortos), Bacillus
(bacilos largos), Vibrio (bacilos largos ligeramente curvados), Spirillum (espirales
rgidas) y Spirochaeta (espirales flexibles).
En 1895 Migula distingue dos rdenes, el de las Thiobacteriales o bacterias del
azufre y el orden de las Eubacteriales o bacterias verdaderas; las Eubacteriales
las ordena a su vez en 4 familias:
1. Familia Coccaceae, que comprende las formas esfricas y que a su vez
clasifica de acuerdo a la movilidad:

Inmviles. Comprendan tres gneros:

1) Streptococcus si se dividan en un solo plano.
2) Micrococcus si se dividan en dos planos.
3) Sarcina si se dividan en tres planos.
Mviles. Comprendan dos gneros:
1) Planococcus si se dividan en dos planos.
2) Planosarcina si se dividan en tres planos.

2. Familia Bacteriaceae, que incluye las formas bacilares y que clasifica a vez
en funcin de la movilidad en los siguientes gneros:

1) Bacterium que corresponde a bacilos inmviles.

2) Pseudomonas si la movilidad es monotrica.

3) Bacillus si la movilidad es peritrica

Familia Spirillaceae, que comprende las formas curvadas y en la que distingue los
siguientes gneros:

1) Spirosoma que corresponde a formas inmviles.

2) Microspira que incluye formas mviles con uno o dos flagelos
polares.
3) Spirillum o formas mviles que contienen un haz de flagelos.
4) Spirochaeta donde se ubican los bacilos con movimiento flexuoso.

3. Familia Chlamydobacteriaceae, que agrupa a las bacterias formadoras de

vainas filamentosas y que clasifica a su vez en los siguientes gneros:

1) Chlanydrothrix aquellas bacterias que no forman ramificaciones.

2) Crenothrix que comprende las formas que se ensanchan en un
extremo.
3) Phragmidiothrix si la vaina es gruesa y sin ramificaciones.
4) Sphaerotilus que comprende a las bacterias formadoras de vainas
delgadas y con ramificaciones.

OBJETIVO GENERAL
Conocer la clasificacin del mundo de los microorganismos, por medio de la
investigacin de diversas fuentes, as poder cumplir los objetivos especificos
OBJETIVO ESPECIFICO
1.

Establecer la importance de la clasificacin de los microorganismos.

2.

Identificar la ubicacin de los diferentes grupos microbianos en el mundo

biolgico.

3.

Definir Taxonoma y Fiilogenia. Sealar el objetivo de Taxonoma.

4.

Enumerar los diferentes enfoques de la Taxonoma bacteriana, sealando su

funda mento y aplicaciones.

5.

Citar y ordenar jerrquicamente los rangos taxonmicos.

6.

Definir Nomenclatura y sealar su objetivo.

7.

Establecer la diferencia entre Taxonoma y Nomenclatura.

8.

Clasificar a los microorganismos en base a las caractersticas morfolgicas y/o

fisio- lgicas, utilizando los esquemas correspondientes.

9.

Discutir las bases de la clasificacin de los virus y cmo ellas difieren de las
usadas para

la clasificacin de los otros microorganismos.

La clasificacin es la estructuracin de los organismos en grupos o taxones en funcin

de semejanzas mutuas o del parentesco evolutivo.
La nomenclatura es la rama de la taxonoma que se ocupa de la asignacin de
nombres a grupos taxonmicos de conformidad con normas publicadas.
La identificacin constituye el lado prctico de la taxonoma que consiste en establecer
que un organismo determinado pertenece a un taxn reconocido.
Se han distinguido diversas posturas ante las relaciones entre la Taxonoma (facilitan
el an- lisis comparativo) y la Filogenia (historia evolutiva de los taxones, sostenida
por algunos ec- logos), ambas se consideran herramientas o mtodos que permiten
dar un nombre tipificado

a determinadas entidades. Existen posturas contrarias que

conciben a la Taxonoma como una aproximacin a la Filogenia, debiendo reflejar la

evolucin de las especies y, por tanto, considerando a ambas disciplinas como
interdependientes.
En fin, la taxonoma microbiana es un tema muy amplio y que requiere del
conocimiento de muchos aspectos, en este tema nos centraremos en los principios
generales y daremos al- gunos ejemplos.
Desarrollo de la Taxonoma Microbiana
El creador de la Taxonoma fue el botnico sueco Carl von Linneo, su sistema de
nomencla- tura, el sistema binomial, se usa todava en la actualidad.
Hasta mediados del siglo XIX se conocan slo dos reinos, animal y vegetal. Luego de
co- menzar a conocerse la existencia de microorganismos, en 1866, Ernst Haeckel
cre un ter- cer reino que llam los Protistas.

Con el desarrollo del microscopio fue posible el reconocimiento de las clulas

eucariotas y procariotas y eso condujo a la ubicacin de las bacterias en un reino
separado de microor- ganismos sin ncleo al que se
G. E. Murray en 1968.
En 1969, R. H. Whittaker propuso un sistema de clasificacin en cinco reinos:
1. Monera, incluye a todos los microorganismos procariotas.
2. Protista, incluye a todos los microorganismos eucariotas unicelulares u
ocasionalmente multicelulares.
3. Fungi, reino que incluye a los hongos en sus diversas formas
4. Plantae, corresponde al reino vegetal
5. Animalia, corresponde al reino animal.
6.
Posteriormente, nuevas tcnicas de biologa molecular se usaron para estudiar
la composi- cin del ARN ribosmico y revelaron que hay realmente dos tipos
de clulas procariotas (ar- queas y bacterias) y un tipo de clulas eucariotas. En
1978, Carl R. Woese propuso elevar

los tres tipos de clulas a un nivel por

encima del reino, llamado dominio y de ah surgi el sistema de cla- sificacin

de tres dominios que se conoce en la actualidad y que comprende:
1. Bacteria (procariotas unicelulares cuya pared celular contiene peptidoglucano)
2. Arquea (procariotas unicelulares cuya pared celular no contiene peptidoglucano)
3. Eukarya (todos los eucariotas)

Los virus no son asignados a ningn reino ya que ellos son microorganismos
acelulares que comparten slo unas pocas caractersticas de seres vivientes.

ENFOQUES DE LA TAXONOMA BACTERIANA

1.

ENFOQUE CLSICO

Se denomina as porque es el que se ha utilizado durante ms de 100 aos. Se

determinan caractersticas
utilizan despus

de

diferentes microorganismos y esas caractersticas se

en la separacin de los grupos. La unidad taxonmica de la

Microbiologa es el CLON o CEPA, se denomina as a una poblacin de clulas

genticamente idnticas derivadas de la divisin sucesiva de una sola clula. Un grupo
de cepas que tiene la mayora o todas las caractersticas en comn ser clasificado
como una ESPECIE, y las especies relacionadas se clasifican en el mismo GNERO.
En general en este enfoque se le da ms valor a las caractersticas
estructurales

y morfolgicas que a las fisiolgicas y bioqumicas por las

razones siguientes:
1. La morfologa de una bacteria es el resultado de la expresin de un gran nmero
de genes que controlan enzimas, las cuales a su vez determinan la sntesis de
diversos componentes estructurales.

2. La morfologa tiene un cierto grado de independencia de las influencias

ambientales y en general las bacterias presentan las mismas formas y estructuras
en los diversos ambientes en los que se desarrollan.
3. La morfologa es por lo general una caracterstica estable genticamente y no
2. ENFOQUE GENTICO O MOLECULAR
4. Tiene por objeto determinar el grado de relacin gentica de diferentes
organismos. Este enfoque involucra estudios diseados para demostrar directa o
indirectamente que las se- cuencias de bases del ADN de dos organismos son
semejantes o idnticas, lo cual puede hacerse de varias maneras. sufre amplios
cambios como resultado de mutaciones en un solo gen.
5. La

morfologa de una bacteria es fcil

de

determinar con la ayuda de un

microscopio.
Entre las caractersticas no morfolgicas que tienen valor taxonmico tenemos:
compo- sicin qumica de la pared celular, inclusiones citoplasmticas y productos de
reserva, composicin qumica de la cpsula,

pigmentos,

requerimientos

nutricionales, capacidad para usar diferentes fuentes de carbono, nitrgeno, azufre y

energa, productos de fermentacin, necesidades gaseosas, requerimientos y
tolerancias de temperatura y pH, sensibilidad a antibiticos, patogenicidad, relaciones
simbiticas, caractersticas inmu- nolgicas, hbitat, etc.
Algunas de estas caractersticas pueden no ser aplicables en un grupo en particular,
depen- diendo del caso variarn el nmero y tipo de los datos recopilados para
efectuar una buena clasificacin.
El enfoque clsico es casual y no sistemtico, pero resulta muy til para algunos
grupos de bacterias.

2.1 Composicin de bases del ADN o del ARN r

Es posible mediante mtodos fsicos o qumicos saber el contenido de bases del ADN,
el que por convenio se expresa en %G+C. Diferencias en %G+C mayores de 10%
nos indican que las cepas estudiadas no estn estrechamente relacionadas, pero
proporciones de bases semejantes no nos indican con certeza que las cepas
estudiadas estn relaciona-

das, ya que las bases podran estar en la misma

proporcin pero en secuencias diferentes.

Las tendencias ms recientes para establecer relaciones filogenticas se basan en la
com- paracin de las secuencias de ARN ribosmico.
2.2 Hibridizacin y homologa de cidos nucleicos
Este procedimiento est basado en la capacidad que tienen las cadenas de ADN de
un or- ganismo para formar un hbrido con las cadenas de ADN de otro organismo o
entre dos muestras de ADN desnaturalizado, uno de los cuales est marcado con
un radioistopo

o con un colorante fluorescente, para posteriormente cuantificar.

Para ello se requiere siempre un punto de referencia el cual es suministrado por ADN
de una cepa de referencia que es preparado marcado y no marcado. La cantidad
de reasociacin entre estos 2 ADN homlogos es determinada y se le asigna un valor
del 100%. La cantidad de reaso- ciacin entre el ADN de referencia y ADN de otra
cepa puede ser medido y expresado co- mo un porcentaje del valor para la
reasociacin de ADN de la cepa de referencia.
La tcnica de hibridizacin es ms eficaz si uno de los cidos nucleicos que se van a
re- asociar (hibridizar) est en forma de
previamente

fragmentos muy pequeos, por lo que

los cidos nucleicos se someten a una agitacin a alta velocidad. Para

estudios de orga- nismos con parentescos ms lejanos puede utilizarse tambin ARN
en vez del segundo ADN, ya que el ARN representa una pequea porcin del
genoma del ADN total.

Estas tcnicas de biologa molecular han dado lugar a nuevas herramientas

moleculares que se han adoptado rpidamente al campo del diagnstico
microbiolgico. Este nuevo enfoque utiliza factores genotpicos ms que fenotpicos
para identificar microorganismos especficos. Un ejemplo de estas tcnicas
modernas de identificacin lo constituyen las sondas de cido nucleico, son
oligonucletidos cortos y de secuencia nica que se emplean como sonda de
hibridizacin para la identificacin de microorganismos. Estos mtodos son altamente
sensi- bles y especficos.

1.1 Homologa entre protenas:

Hay muchos mtodos para comparar protenas, de los cuales el ms seguro es la
determi- nacin de la secuencia de aminocidos de la protena purificada. Como
esta secuencia est directamente relacionada con la secuencia de bases de los
genes

que

controlan su sntesis, secuencias similares de aminocidos en

protenas funcionalmente similares indican que los organismos tienen secuencias

similares de bases para estos genes.
3.4

Recombinacin gentica:

En bacterias que poseen mecanismos para recombinacin gentica, puede

demostrarse proximidad
intercambio

gentica

por medio

de

estudios sobre la eficacia

del

gentico.

Sin embargo como incluso bacterias muy relacionadas no pueden aparearse por
diversas razones, el anlisis de la recombinacin gentica hace posible el

reconocimiento de seme- janzas pero no de diferencias, puesto que si no ocurre

recombinacin, no se puede decir por esta sola razn que no estn relacionadas.
NOMENCLATURA
Es el darle nombre a los microorganismos y su objetivo es precisamente elegir el
nombre adecuado y nombrar el germen siempre por el mismo nombre evitando as
confusiones.
Es importante diferenciar entre taxonoma y nomenclatura, ya que nomenclatura es
nica- mente darle el nombre al organismo luego que se ha completado el trabajo
taxonmico.
Para nombrar las bacterias se usa el esquema binomial en el cual el nombre de la
bacteria est constituido por 2 palabras;

la primera es una palabra en latn o

latinizada, que se escri- be con la primera letra en mayscula e indica el GNERO,

usualmente esta palabra provie- ne del nombre del descubridor u otro cientfico
relacionado o describe la morfologa del microorganismo. La segunda palabra indica la
ESPECIE, se escribe con minscula, y es usualmente descriptivo

refirindose al

color, origen, patogenicidad, etc.

Ejemplo: Bacillus subtilis

Gnero Especie
Los nombres cientficos de las bacterias deben ser escrito en letra cursiva (Itlica) o
en su defecto cada palabra debe ser subrayada. Las reglas y mtodos del sistema de
Nomenclatura Bacteriana se encuentran en el Cdigo Internacional de Nomenclatura
Bacteriana.

IDENTIFICACIN
La informacin acerca de los microorganismos obtenidas de los mtodos ya citados,
nos permite no slo la clasificacin de nuevos microorganismos sino tambin la
identificacin de los microorganismos ya conocidos, aislados de muestras de orgenes
diversos.
Dos de los mtodos utilizados para la identificacin son: las claves dicotmicas y los
clado- gramas.
Claves dicotmicas
Con el uso de las claves dicotmicas, la identificacin se basa en

preguntas

sucesivas, y cada pregunta tiene dos respuestas posibles. Despus de responder una
pregunta, se dirige

al investigador a otra pregunta hasta que el microorganismo es

identificado. Aunque estas claves a menudo tienen poco que ver con las relaciones
filogenticas, son de gran valor para la identificacin.
Cladogramas Son mapas o diagramas, como el que se presenta en la pgina 3,
que muestran relaciones evolutivas entre los microorganismos, basados
principalmente en la secuenciacin del ARN ribosmico.

MANUAL BERGEY DE BACTERIOLOGA SISTEMTICA

Para la clasificacin, identificacin y nomenclatura

de

las bacterias, la mejor

referencia que existe es el Bergey's Manual of Sistematic Bacteriology, conocido como

el Manual Ber- gey. La edicin ms reciente est siendo publicada progresivamente,
y estar constituida por 5 volmenes, en ella estarn incluidas todas las especies de
bacterias conocidas para la fecha de su publicacin y a diferencia de la anterior que
tena un enfoque que enfatizaba

en las caractersticas fenotpicas, esta edicin tiene

un anlisis filogentico basado en la se- cuenciacin del ARN r, del ADN y de las
protenas.
RANGOS DE LOS GRUPOS TAXONMICOS
Un grupo taxonmico es un grupo de microorganismos tratados como un grupo con
nombre en una taxonoma formal.
Las categoras taxonmicas que se dan a continuacin estn colocadas en rango
taxo- nmico descendente:
Clase Orden
Familia Tribu
Gnero
Especie
El nombre del grupo taxonmico entre el orden y el gnero se forma aadiendo el
sufijo correspondiente a la raz del nombre del gnero tipo.

Grupo
Orden
Familia
Tribu
Gnero

Sufijo
-ALES
-ACEAE
-EAE

Ejemplo
Pseudomonadal
Pseudomonada
Pseudomonade
Pseudomonas

CLASIFICACIN DE LOS HONGOS

La

identificacin

principalmente en

clasificacin

de

los

hongos

filamentosos

est

basada

sus rasgos estructurales y morfolgicos. Algunos hongos tienen

una apariencia tan carac- terstica que pueden ser identificados fcilmente, pero en la
mayora de los casos se requie-

re observar una preparacin del hongo al

microscopio y estudiar sus caractersticas tales como:

1.

Morfologa de las hifas

2.

Presencia o ausencia de septos

3.

Ramificaciones

4.

Tipo de esporas

5.

Caractersticas de las colonias, las que se estudian macroscpicamente

La clasificacin de las levaduras usa principalmente el enfoque clsico con un

gran nfasis en pruebas bioqumicas de utilizacin de carbohidratos.
El esquema taxonmico tradicional empleado para la clasificacin de los hongos
los ubica en cuatro divisiones, basndose fundamentalmente en variaciones en la
reproduccin sexual.
Divisin

ESPORAS

ESPORAS

MICELIO

EJEMPLOS

Zygomycota

ASEXUALE
Endgenas

SEXUALE
Oosporas

Cenoctico

Rhizopus, Mucor

Ascomycota

Exgenas

Zigosporas
Ascospora

Septado

Penicillium,

(Ascomicetos)

(en
puntas

las
o

Aspergillus,
Levaduras

Basidiomycot

Exgenas

(en

(Basidiomicet

puntas

os)
Deuteromycot

lados de las
Exgenas

(en

(Deuteromicet

puntas

humanos

os)

lados de las

animales

(Hongos

Basidiospo
las

Septado

ras

Seta
s
Roy

o
-

Septado

las

as
La mayora de los
pat-

genos

de
y

CLASIFICACIN DE LOS VIRUS

Dependiendo del tipo de clula que infectan, los virus se clasifican en:
a.

Virus animales

b.

Virus de plantas

c.

Virus de bacterias o bacterifagos

De ahora en adelante, nos vamos a ocupar de los virus animales, debido al gran
nmero de enfermedades de origen viral que afectan al hombre y a los animales.

Los virus animales se clasifican tomando en cuenta las caractersticas siguientes:

1.

Caractersticas primarias
1.1 Organizacin de la cpsida
a.

Forma y tamao de la partcula viral

b.

Nmero de capsmeros

c.

Presencia o ausencia de cubierta lipdica

d.

Simetra de la nucleocpsida

1.2 Estructura del cido nucleico

a.

Tipo de cido nucleico

b.

Nmero de cadenas

c.

Peso molecular del cido nucleico

d.

Nmero aproximado de genes

1.3 Presencia de transcriptasa

2.

Caractersticas secundarias

2.1

Husped
a. Especie
b. Tejido

2.2

Modo de transmisin

2.3

Caractersticas inmunolgicas

Los virus no se nombran usando el esquema binomial clsico que se utiliza para los
otros microorganismos, a los virus se les denomina con el nombre de la enfermedad
que causan, por ejemplo, virus de la rabia, virus del sarampin, etc.

CONCLUSION

La necesidad de establecer un orden jerrquico de los organismos vivos, lleva al

estudio de cada uno de los grupos y a la bsqueda de tcnicas que permitan llevar a
cabo una caracterizacin para poder establecer un orden jerrquico mas amplio y
adecuado.

En el caso de las bacterias, como organismos simples que son en cuanto a su

estructura morfolgica, hoy, gracias a las herramientas que nos provee la biologa
molecular como as tambin la ingeniera gentica est a nuestro alcance poder
ampliar ese orden jerrquico utilizando las tcnicas que nos permiten conocer y
estudiar el genoma de estos organismos y de esta forma poder ordenarlos y
clasificarlos de acuerdo a un criterio mucho ms amplio y nosolamente limitarnos a
ordenarlos por su morfologa, fisiologa y/o por estudios bioqumicos como por
ejemplo, el metabolismo del organismo.

BIBLIOGRAFIA
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