2.

Prinsip-prinsip Bioremidiasi
Ilmu-ilmu baru dalam biologi molekular dan ekologi memberikan banyak
kesempatan pada banyak proses biologis yang efisien. Prestasi penting
dalam ilmu-ilmu ini termasuk

membersihkan air tercemar dan lahan.

Bioremidiasi digambarkan sebagai proses dimana limbah organik secara

biologis terdegradasi dalam kondisi yang terkendali ke keadaan berbahaya,
atau pada tingkat bawah batas konsentrasi yang ditetapkan oleh otoritas
pengaturan (Mueller 1996). Dari definisi tersebut, bioremidiasi berguna
untuk kehidupan organisme, terutama mikroorganisme, untuk mendegradasi
lingkungan tercemar menjadi kondisi yang berkurang kandungan racunnya.
Ini menggunakan bakteri alami dan jamur dan tumbuhan-tumbuhan untuk
mendegradasi atau mendetoksifikasi zat bahaya untuk kesehatan manusia
dan/atau lingkungan. Mikroorganisme mungkin sudah ada ditempat tersebut
untuk daerah yang terkontaminasi atau mereka dapat diisolasi dari tempat
lain dan dibawa ke situs yang terkontaminasi. Bahan yang terkontaminasi
diubah oleh organisme hidup melalui reaksi yang terjadi sebagai bagian dari
proses metabolisme organisme hidup. Biodegradasi senyawa seringnya
terjadi akibat gerakan/tindakanbeberapa organisme. Ketika mikroorganisme
diimport ke situs yang terkontaminasi untuk meningkatkan degradasi kami
memiliki proses yang dikenal dengan bioaugmentasi. Agar bioremidiasi
menjadi efektif, mikroorganisme harus menyerang secara enzimatik polutanpolutan dan merubahnya menjadi produk yang tak berbahaya (Vidali 2001).
Seperti

bioremediasi

dapat

efektif

hanya

apabila

kondisi

lingkungan

memungkinkan pertumbuhan dan aktivitas mikroba, penerapannya sering

melibatkan

manipulasi

parameter

lingkungan

untuk

memungkinkan

pertumbuhan mikroba dan degradasi untuk melanjutkan pada tingkat yang

lebih

cepat.

keterbatasan.

Seperti

teknologi

Beberapa

yang

kontaminan,

lainnya,
seperti

bioremidiasi
chlorin

memiliki

organik

atau

hidrokarbon beraroma tinggi, resistan diserbu/diserang mikroorganisme.

Mereka mendegradasi salah satunya dengan pelan atau tidak langsung

keseluruhan, oleh sebab itu bukan hal yang mudah untuk memprediksi
tingkat pembersihan pada penggunaan bioremidiasi; tidak ada peraturan
untuk memprediksi jika kontaminan dapat didegradasi. Teknik bioremediasi
biasanya lebih ekonomis daripada metode tradisional seperti pembakaran,
dan beberapa polutan yang dapat diobati di tempat, sehingga mengurangi
risiko paparan personil pembersihan, atau paparan yang berpotensi lebih
luas

sebagai

akibat

dari

kecelakaan

transportasi.

Sejak

bioremidiasi

berdasarkan redaman alam kebanyakan masyarakat lebih menerimanya

dibanding teknologi lainnya. Kebanyakan sistem bioremidiasi berjalan
dibawah kondisi aerobik, tapi menjalankan sistem dibawah kondisi anaerobik
(Colberg dan Young 1995) yang dapat memperbolehkan organisme mikroba
mendgredasi molekul yang bersifat melawan.
2.1 Populasi mikroba dan proses bioremidiasi
Mikrooganisme dapat diisolasi dari hampir setiap kondisi lingkungan. Mikroba
dapat beradaptasi dan tumbuh pada suhu 0, serta panas yang ekstrim,
gurun, air, dengan kelebihan oksigen dan kondisi anaerobik, dengan
keberadaan senyawa berbahaya atau pada aliran limbah. Syarat utama
adalah sumber energi dan sumber karbon (Vidali 2001). Karena penyesuaian
mikroba dan sistem biologis lainnya, dapat digunakan untuk mendegradasi
memperbaiki lingkungan yang berbahaya. Organisme alami, (baik pribumi
atau asing (diperkenalkan), adalah agen utama yang digunakan untuk
bioremidiasi (Prescott et al., 2002). Organisme yang digunakan bervariasi,
tergantung pada sifat kimia dari agen polusi, dan harus hati-hati memilih
karena mereka hanya bertahan dalam kisaran terbatas pada kontaminan
kimia (Prescott et al., 2002 Dubey, 2004). Sejak banyaknya jenis polutan
yang

akan

dihadapi

di

tempat

yang

terkontaminasi,

beragam

jenis

mikroorganisme yang mungkin diperlukan untuk mediasi yang efektif (Tabel

1 dan 2; Watanabe et al., 2001). Agen remidiasi biologis pertama dipatenkan
pada tahun 1974, menjadi strain Pseudomonas putida (Prescott et al., 2002)
yang dapat menurukan minyak bumi. Pada tahun 1991, sekitar 70 mikroba

genera dilaporkan untuk menurunkan senyawa minyak bumi (Kongres U.S,

1991) dan hampir dalam jumlah yang sama telah ditambahkan ke daftar
dalam dua decade secara berturut-turut.
2.2 Beberapa kelompok mikroba
1. Aerobic: contoh bakteri aerobic yang dikenal dengan kemampuan
degradatifnya

adalah

Pseudomonas,

Alcaligenes,

Sphingomonas,

Rhodococcus, dan Mycobacterium. Mikroba-mikroba tersebut sering

dilaporkan menurunkan pestisida dan hidrokarbon, baik senyawa
alkalin

dan

poliaromatik.

Kebanyakan

dari

bacteria

tersebut

menggunakan kontaminan sebagai satu-satunya karbon dan energy.

2. Anaerobic: bakteri anaerobic tidak sering digunakan seperti bakteri
aerobic. Ada peningkatan minat pada bakteri anaerob yang digunakan
untuk bioremidiasi polychlorinated biphenyls (PCBs) dalam endapan
sungai, dechlrorinasi pelarut trichloroethilen (TCE) dan klorofom.
3. Jamur Ligninolitik. Jamur seperti jamur putih busuk Phanaerochaete
chrysosporium memiliki kemampuan untuk menurunkan yang sangat
beragam dari polusi lingkungan persisten atau beracun. substrat yang
umum digunakan termasuk jerami, serbuk gergaji, atau tongkol
jagung.
4. Methilotrof. Bakteri aerobic tumbuh memanfaatkan metana untuk
karbon dan energy. Enzim awal dalam jalur untuk degradasi aerobic,
metan monooxigenase, memiliki berbagai substrat yang luas dan aktif
terhadap

berbagai

senyawa,

termasuk

trichloroethylene

alifatik

diklorinasi dan 1,2 dikloroetan.

Untuk degradasi perlu bahwa bakteri dan kontaminan harus dalam kontak.
Ini tidak mudah untuk dicapai, selama mikroba atau kontaminan tidak yang
tersebar merata di tanah. Beberapa bakteri yang mobile dan menunjukkan
respon kemotaksis, merasakan kontaminan dan bergerak ke arah itu.
Mikroba

lain

seperti

jamur

tumbuh

dalam

bentuk

filamen

menuju

kontaminan. Berbagai jenis organisme seperti tanaman dapat digunakan

untuk bioremediasi tetapi mikroorganisme menunjukkan potensi terbesar.
Mikroorganisme terutama bakteri dan jamur yang daur ulang asli alam.

Kemampuan mereka untuk mengubah bahan kimia alami dan sintetis ke

sumber-sumber energi dan bahan baku untuk pertumbuhan mereka sendiri
menunjukkan bahwa bahan kimia yang mahal atau proses perbaikan fisik
mungkin diganti dengan proses biologis yang lebih rendah biaya dan lebih
ramah lingkungan. Oleh karena itu, mikroorganisme berpeluang untuk
pemanfaatan sumber daya yang sebagian besar belum dimanfaatkan untuk
bioteknologi

lingkungan

baru.

Penelitian

terus

memverifikasi

potensi

bioremediasi mikroorganisme. Misalnya, tambahan terbaru ke daftar tumbuh

bakteri yang dapat mengurangi logam adalah Geobacter metallireducens,
yang menghilangkan uranium, limbah radioaktif; dari perairan drainase di
operasi pertambangan dan dari air tanah yang terkontaminasi. Bahkan selsel mikroba mati dapat berguna dalam teknologi bioremediasi. Penemuan ini
menunjukkan bahwa eksplorasi lebih lanjut keragaman mikroba cenderung
mengarah penemuan banyak organisme lebih banyak dengan sifat unik
berguna

dalam

bioremediasi

(U.S

EPA

Seminars

1996).

Penerapan

mikroorganisme tidak terbatas pada satu bidang studi bioremediasi, memiliki

penggunaan

yang

luas;

Petroleum,

produk

dan

minyak

merupakan

hidrokarbon dan jika hadir di lingkungan menyebabkan polusi. Lapisan

minyak yang disebabkan oleh kapal tanker minyak dan kebocoran bensin ke
dalam

lingkungan

laut

sekarang

fenomena

terus

terjadi.

Beberapa

mikroorganisme dapat memanfaatkan minyak sebagai sumber makanan,

dan banyak dari mereka menghasilkan permukaan senyawa aktif ampuh
yang

dapat

mengemulsi

minyak

dalam

air

dan

memfasilitasi

penghapusan.Tidak seperti surfaktan kimia, emulsifier mikroba tidak beracun

dan biodegradable. Mikroorganisme yang mampu mendegradasi minyak
bumi termasuk pseudomonad, berbagai corynebacteria, mikobakteri dan
beberapa ragi (Mueller 1996). Terlepas dari merendahkan hidrokarbon,
mikroba juga memiliki kemampuan untuk menghapus limbah industri,
mengurangi kation beracun dari logam berat ke bentuk racun yang kurang
larut. Misalnya, tanaman seperti locoweed menghapus sejumlah besar unsur
selenium beracun. Selenium yang disimpan dalam jaringan tanaman di mana

ia tidak menimbulkan bahaya sampai dan kecuali tanaman yang dimakan.

Banyak alga dan bakteri menghasilkan sekresi yang menarik logam yang
beracun dalam kadar tinggi. Logam-logam yang berlaku dihapus dari rantai
makanan dengan menjadi terikat pada sekresi. Degradasi pewarna juga
dibawa oleh beberapa bakteri anaerob dan jamur (Colberg 1995). Untuk
meningkatkan

tingkat

produksi

pangan

dunia

untuk

mengimbangi

meningkatnya populasi, pestisida yang digunakan. Penggunaan booster

buatan secara ekstensif telah menyebabkan akumulasi senyawa kompleks
buatan yang disebut xenobiotik. Dengan memperkenalkan mikroba diubah
secara genetik, memungkinkan untuk menurunkan senyawa ini.