1er Parcial
Biologa molecular
2 Medicina
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ndice de contenidos
Tema 1. Estructura y caractersticas del DNA________________________3
Tema 2. Organizacin del DNA: Genoma y epigenoma_______________18
Tema 3. Replicacin____________________________________________24
Tema 4. Transcripcin__________________________________________30
Tema 5. Traduccin____________________________________________46
Tema 6. Regulacin de la expresin gnica_________________________57
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Componentes estructurales
Disponemos de dos cidos nucleicos: DNA y RNA
Los elementos comunes a ambos son:
Pentosa, que ser ribosa o desoxirribosa. Los carbonos son
nombrados con numeracin N (1, 2 ,3 ,4 ,5)
Bases nitrogenadas. Existen dos tipos de ciclos
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Un nucletido se forma al establecerse un enlace ster fosfrico el cual se
produce entre un fosfato y el C5 de la pentosa.
Nomenclatura de nucletidos: Adenilato (A), Citilidato (C), Guanilidato (G),
Timidilidato (T), Uridilidato (U).
Los nucletidos tambin pueden estar en sus formas di y trifosforilados. Estos
nucletidos fosforilados sirven de vector energtico y como monmeros de las
cadenas de DNA y RNA.
Los nucletidos polimerizan mediante uniones que se conocen como enlaces
fosfodister que se lleva a cabo mediante carbonos 3-5. El primer nucletido
deja libre su carbono 5 y el ultimo su carbono 3 de forma que afirmamos que
la direccin de sntesis es 5
3.
Composicin
Su azcar es la desoxirribosa
Sus bases nitrogenadas son Adenina, Guanina, Citosina y
Timina.
Tiene gran tamao (109 Daltons)
No es una molcula lineal aislada, sino que es bicatenaria en
forma de doble hlice con giro dextrgiro
Claves estructurales
Composicin 1-1-1 (1 base 1 fosfato 1 azcar)
Se trata de una molcula anfiptica. El grupo fosfato es hidrfilo
mientras que las bases y el azcar son hidrfobas y se disponen hacia el
interior.
La difraccin de rayos X ayud a establecer el modelo de doble hlice.
Un anlisis qumico nos aporta que hay el mismo numero de purinas
que de pirimidinas, tambin nos informa de que el apareamiento es
(A - T / G - C).
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Las dos cadenas son antiparalelas (5 3 se aparea con 3 5) y se
aparean mediante puentes de hidrogeno entre bases complementarias.
Timina aparea con Adenina mediante 2 puentes de hidrgeno
(A=T)
Citosina aparea con Guanina mediante 3 puentes de hidrgeno
(CG)
Estructura
Hacia el interior del DNA quedan las partes mas apolares (BN + pentosa)
El dimetro de la doble hlice es de 2 nm en toda su longitud. Entre dos pares
de bases en la escalera hay 0,34 nm y un desfase de 36.
El desfase de 36 causa que cada vuelta de hlice (360) contenga 10 pares
de bases, as pues, la distancia entre una vuelta de hlice y la siguiente es de
34 nm.
Hay un surco mayor y un surco menor. Estas zonas son importantes, ya que
en algunas zonas del surco mayor existen interacciones con protenas, con
funcin reguladora promotora de genes.
Los surcos surgen ante la siguiente estructura qumica del DNA:
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Aparte de sta estructura (B-DNA) existen otras estructuras menos comunes.
Las diferentes estructuras de organizacin del DNA son las siguientes:
A-DNA
Z-DNA
B-DNA
Si comparamos el B-DNA con el A-DNA, observamos que las bases del BDNA son perpendiculares al eje mientras que las del A-DNA estn mas
inclinadas.
En un corte transversal encontramos que el B-DNA tiene bases mas
concentradas y el A-DNA es menos denso.
El A-DNA se encuentra como forma deshidratada con altas concentraciones de
sales en el medio.
En cambio si comparamos el Z-DNA con el B-DNA encontramos que el B-DNA
es dextrgiro y el Z-DNA es levgiro.
El Z-DNA se encuentra en ocasiones en nuestras clulas como modo de
regulacin, ya que en esta configuracin el surco mayor queda inaccesible para
las protenas reguladoras, inutilizando el gen. Suele darse en regiones de
Guanina y Citosina ante condiciones concretas del medio.
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Propiedades
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Agentes desnaturalizantes. Como detergentes, urea, etc
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Niveles de organizacin
En organismos eucariticos el DNA debe estar aun ms compactado ya que
debe caber en el ncleo, y en ocasiones estructurarse en cromosomas.
El material nuclear est formado fundamentalmente por cromatina, la cual a su
vez est formada fundamentalmente por DNA, histonas y el resto de protenas
que se engloban todas dentro de las siglas PNH (Protenas No Histonas) que
pueden ser de todo tipo, las hay que estabilizan el DNA, participan en la
transcripcin, etc
Las histonas son las protenas ms importantes que ayudaran a plegarse al
DNA, y pertenecen a 5 clases en prcticamente todo tipo de organismos
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denominado nucleosoma, que consta de unos 200 pares de bases de DNA y
contiene adems:
2x (H2A, H2B, H3, H4)
1x H1
Se denomina tambin fibra de 10 nm. Se compone por un core o ncleo de
DNA unido a histonas y una fibra de DNA desnudo llamado linker o
espaciador.
El core nucleosomal esta formado por un tetrmero de histonas H3 y H4 y dos
dmeros de H2A y H2B estructura completa que se denomina como octmero
de histonas. El DNA rodea esta estructura por fuera de la misma
interaccionando con las cargas positivas de las histonas, realizando un
arrollamiento levgiro equivalente al superenrrollamiento negativo de las
bacterias.
La histona H1 se coloca interaccionando con el DNA de fuera cerrando esa
estructura para estabilizar de forma definitiva el superenrrollamiento.
Este tipo de estructura en nucleosoma es aun insuficiente para que el DNA
quepa en la clula, por lo que es preciso otro nivel superior de compactacin
conocido como solenoide o fibra de 30 nm, lo cual se forma cuando esta
estructura nucleosomal se arrolla en torno a un eje imaginario formando una
estructura helicoidal con unos 6 nucleosomas por vuelta.
Para la estructura de solenoide se precisan PNH.
Los grados de compactacin a partir del solenoide no se conocen con detalle.
DNA mitocondrial
La mayor parte del DNA en los organismos eucariticos se encuentra en el
ncleo, pero una pequea parte de este DNA se localiza en las mitocondrias.
El DNA mitocondrial es ms pequeo con 16.569 pares de bases y es
completamente diferente del nuclear, ya que es circular y cerrado, muy similar
al bacteriano y con escasas interacciones con protenas
Suele haber entre 3 y 10 molculas de DNA por mitocondria, y tiene tambin
muy pocos genes (sobre 37) que codifican diferentes RNA mitocondriales y
toda una serie de protenas las cuales en su mayora pertenecen a la cadena
respiratoria.
Este DNA es muy importante ya que variaciones en algunos genes pueden
producir patologas importantes, en general de tipo neurolgico (p.e. Parkinson,
distona)
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Longitud. Las longitudes del RNA son mucho mas variables que el
DNA aunque siempre ms pequeas (65 a miles de nucletidos)
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RNA mensajero
El mRNA tiene como funcin codificar las protenas, de manera que la parte
ms importante de un mensajero es lo que denominamos codn: el triplete que
codifica un aminocido en la protena, y es la parte funcional del mRNA.
Los mRNA tienen por lo tanto una longitud muy variable dependiendo de la
protena que codifiquen, de forma que son muy variables en tamao, y muy
heterogneos.
Hay una gran diferencia en bacterias y en eucariotas. En bacterias los mRNA
suelen llevar informacin para varias protenas (RNA policistrnico: contiene
varios genes).
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El RNA de eucariotas suele ser monocistrnico, es decir, contiene un solo
gen por fragmento, aunque estos genes estn entrecortados por secuencias
inservibles. Los extremos 5 y 3 estn protegidos en todos los mRNA
eucariticos.
El extremo 5 tiene lo que denominamos CAP caperuza, que es una
estructura que sirve para proteger el 5 debido a que no es reconocido por
nucleasas, y tiene una participacin directa en la sntesis.
El CAP es un nucletido raro con ciertas caractersticas anormales:
En el fin de la secuencia gnica existe una cola de adeninas (secuencia poliA) que tiene entre 100-200 adeninas lo que protege el extremo final de las
nucleasas, retrasando su llegada a la parte codificante.
La cola poli-A tambin estabiliza el mRNA y regula su salida del ncleo.
Respecto a la estructura del mRNA no presenta apenas estructura
doblehelicoidal, debido a que es una molcula que no suele permanecer mucho
tiempo en la clula.
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RNA de transferencia
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Hipoxantina/Hx (inosina)
Uracilo/
(Pseudouridina). Se une de forma anormal a la ribosa
Bases metiladas
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Como hemos mencionado tiene una estructura en triple horquilla:
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La estructura terciaria del tRNA tiene forma de L invertida.
RNA ribosmico
Se trata de un rRNA que presenta 3 especies distintas en procariotas y 4
especies distintas en eucariotas.
Los procariotas tienen:
Subunidad grande del ribosoma (50 S)
rRNA 5S
rRNA 23S
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protenas
rRNA 16 S
21 protenas
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En los eucariotas en cambio los ribosomas tienen la siguiente conformacin:
Subunidad grande (60 S)
rRNA 5 S
rRNA 28 S
rRNA 5,8 S
49 protenas
33 protenas
rRNA 18 S
Otros RNA
snRNA (RNA pequeos nucleares). Son una serie de RNA de
pequeo tamao muy ricos en uracilo (se nombran como U1, U2) y
tienen un papel fundamental en las transformaciones que tienen que
sufrir los RNA desde que se forman hasta que son funcionales.
Son ms importantes en procariotas que en eucariotas.
Mitocondriales. La mitocondria tiene RNA diferentes que el resto de la
clula. Los ribosmicos son ms similares a los bacterianos que a los
citoplasmticos
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En las bacterias casi todos los fragmentos de DNA se presentan como copia nica, es
decir, las secuencias aparecen slo una vez en todo el DNA, sin embargo en el DNA de
organismos eucariotas hay una gran cantidad de secuencias que se repiten mucho en
todo el DNA de forma que en el DNA eucaritico veremos tanto secuencias de copia
nica como secuencias repetitivas las cuales se pueden repetir hasta un milln de
veces en toda la cadena de DNA
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Los genes no contienen solo una parte estructural codificante para protenas sino
tambin contienen una regin reguladora.
Los genes estn compuestos por exones e intrones (zona estructural) y una
regin reguladora.
El DNA no codificante incluye los intrones, los cuales son el DNA que entrecorta los
fragmentos codificantes de los genes (se considera que los intrones forman parte del
gen, pero que no codifica protena).
DNA repetitivo
El DNA repetitivo no es ms que secuencias de DNA que se repiten muchas veces a
lo largo del genoma, desde algunos cientos de veces hasta incluso 106 veces
representando entre el 20-50% (30% en humanos) del total de material gentico.
Podemos separar al DNA repetitivo en DNA codificante y DNA no codificante. El DNA
codificante puede estar agrupado en regiones concretas del DNA o bien disperso.
El DNA repetitivo codificante y agrupado se compone de genes que codifican
protenas o RNA pero que a diferencia de los anteriores que aparecen en copia nica,
stos aparecen en mltiples copias a lo largo del genoma.
La mayor parte de las protenas vienen codificadas por un gen de copia nica, pero hay
algunas que disponen de muchas copias y las expresan todas, de manera que estos
genes repetitivos aparecen en zonas concretas del DNA y que codifican o bien
protenas o bien RNA.
Pueden agruparse en mltiples familias:
Familias gnicas clsicas con secuencias repetidas en tndem (p.e. genes
de las histonas). En humanos se considera que existen 40-50 copias pero
pueden llegar a tener unas 100 copias. Todas las copias son prcticamente
idnticas y todas se expresan. Tambin responden a este esquema los genes de
los rRNA ms grandes y genes de los tRNA.
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Familias multignicas con genes agrupados (p.e. genes de las globinas o
genes de los antgenos de histocompatibilidad). Estas copias no son
exactamente iguales, sino que codifican protenas ligeramente distintas las
cuales se expresan unas u otras dependiendo de la etapa vital, es decir, estos
genes no se expresan todos a la vez.
Algunos de estas zonas presentan genes, pseudogenes (no se expresan nunca
debido a que han mutado), genes truncados o fragmentos gnicos.
Familias multignicas con genes dispersos. Presentan mltiples copias por
todo el genoma pero distribuidas en distintas zonas del DNA o incluso distintos
cromosomas.
DNA no codificante
El DNA no codificante tambin se puede presentar agrupado o disperso.
El DNA repetitivo agrupado es un DNA que aparece desde varios miles de veces en
el DNA a incluso 1,5 millones de veces (DNA altamente repetitivo). Tambin podemos
decir que aparecen en regiones heterocromticas. Aparece siempre en repeticiones y
generalmente es denominado DNA satlite.
Las secuencias no suelen ser largas (20-30 pares de bases). Es un DNA muy rico en
adenina-timina, y si se lisa y se centrifuga, tiene menor densidad que otras clases de
DNA debido a su menor cantidad de puentes de hidrgeno
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Microsatlites. Repeticiones de unas 50 veces. Tienen unos 2-6 pb. Aparecen
distribuidos por todo el genoma y no tienen funcin conocida.
SIME. Tienen de 100-500 pares de bases. Las mas conocidas son las
secuencias Alu las cuales tienen una diana para rotura con endonucleasas de
restriccin.
Secuencias palindrmicas
Las secuencias palindrmicas son abundantes en el DNA eucariticos. Una secuencia
palindrmica es aquella que se lee igual en todos los sentidos, de forma que este
tipo de secuencias pueden formar estructuras cruciformes.
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Existen protenas que interaccionan con el DNA reconociendo estas estructuras de
forma que las secuencias palindrmicas tienen su papel en la regulacin gnica.
Tambin pueden reconocer estas estructuras las endonucleasas de restriccin.
Modificaciones de histonas
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Todos estos mecanismos muestran que sin alterar directamente las secuencias del
DNA alteran la expresin de un gen, se conocen globalmente como epigentica.
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DNA polimerasas
DNA polimerasa I
La primera enzima descubierta en procariotas fue la DNA polimerasa I que sintetizaba
DNA (Es capaz de aadir a una cadena de DNA un nucletido) con una serie de
requisitos:
Debe tener una cadena preformada (cebador) en el sentido en el que trabaja.
Necesita los cuatro nucletidos trifosfato (dATP, dGTP, dTTP y dCTP) para
aportar energa. No se utilizan los dNDP para hacer irreversible la reaccin.
No aade nucletidos al azar sino que utiliza un molde.
Necesita magnesio (Mg2+)
Necesita una fuente de energa (ATP)
Alberto Gmez Esteban & Laura del Olmo
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Necesita nucletidos de ribosa trifosfato (ATP, UTP, CTP y GTP)
Necesita NAD+
Tambin tena una actividad exonucleasa, hidrolizando nucletidos de un extremo 3
5 (5 3 / 3 5)
Su actividad exonucleasa 3 sirve para que al sintetizar un nucletido, si es incorrecto,
poder eliminarlo y sustituirlo por el correcto, por lo que se denomina actividad
correctora.
La reaccin en concreto que cataliza se da a partir de una cadena molde en el que se
da la unin de un extremo 3 con otro 5. Las hebras sern complementarias y
antiparalelas.
Una vez que se pens que la DNA-polimerasa 1 no poda ser la nica replicadora, se
descubri la DNA-polimerasa 3, con los mismos requisitos, pero con mucha mayor
velocidad que la DNA-polimerasa 1, la cual sintetiza tan lentamente que no es
compatible con la fisiologa celular. La DNA-polimerasa 3 tambin tiene actividad
exonucleasa 3
La estructura de la DNA-polimerasa 3 tiene una estructura mucho ms compleja que la
DNA-polimerasa1:
La parte cataltica de la enzima (core) esta formada por la subunidad:
. Actividad polimerasa
. Actividad exonucleasa
. Tiene funcin estructural de unin entre las otras dos
Tambin tiene otras dos subunidades unidas cada una a una parte de la molcula y
que sirve para formar el dmero, es decir, sirve de unin entre las dos partes de la
enzima.
Existe un complejo -
(2-2) unido al complejo core que va a sintetizar la hebra
retrasada y cuya finalidad es hacer ms simultnea la replicacin de ambas hebras.
Existe tambin una subunidad , que es la responsable de la procesividad de la
enzima. La procesividad es la copia sin soltar el molde unos cuantos nucletidos,
acelerando la copia (1000 nucletidos/segundo)
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Replicacin en procariotas
El primer punto para la replicacin es reconocer el origen de replicacin, que es
reconocido por una protena denominada DNA-A. En cuanto la protena reconoce el
origen se debe abrir la hebra, por ello, el origen suele ser rico en adenina-timina debido
a sus enlaces ms dbiles. La doble hlice se abre por helicasas (DNA-B y otras
protenas).
El DNA una vez abierto, tiende a estabilizarse formando los puentes de hidrgeno.
Para que se de la replicacin es preciso evitar que se vuelvan a formar, por lo que
existen una serie de protenas (SSB) que se unen al DNA monocatenario,
estabilizndolo.
Cuando la doble hlice esta abierta y estabilizada, se forma un cebador en el inicio del
5-3 (hebra adelantada) y en una zona cercana al inicio de la 3-5 (hebra retrasada).
Una vez completa la DNA polimerasa 3 (holoenzima) comienza a sintetizar la hebra
continua a partir del cebador. En la hebra discontinua la primasa sintetiza mltiples
fragmentos de Okazaki.
Una vez que avanza la sntesis de DNA, la zona siguiente se va abriendo, y la zona ya
formada va constituyendo la doble hlice nueva.
Al formarse la burbuja de replicacin se genera una tensin sobre el resto de la hebra,
de manera que son necesarias las topoisomerasas que estabilizan la estructura
cortando en determinadas zonas y realizando una serie de acciones complejas.
La actividad exonucleasa 3 de la DNA polimerasa 3 elimina un nucletido incorrecto
y aade el adecuado (actividad revisora o correctora) de forma que la replicacin
prcticamente transcurre sin errores.
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Una vez sintetizadas ambas hebras hijas, tendremos una hebra retrasada repleta de
cebadores de RNA en direccin 53 que se deben eliminar, lo que se hace gracias a
la actividad exonucleasa 5 de la DNA polimerasa 1, que los elimina. Los huecos
restantes son rellenados mediante la actividad polimerasa de la misma enzima,
utilizando los fragmentos preformados de la hebra hija.
Los trozos sueltos que quedan despus de sintetizar estos nuevos fragmentos deben
ser unidos entre s, lo que se realiza con la enzima DNA ligasa que forma el enlace
fosfodister, con energa aportada por NAD+. En eucariotas la aporta el ATP.
El cromosoma bacteriano en aprox. 40 minutos se replica completamente y cada mitad
(cortada por un eje imaginario) se sintetiza o bien continua o bien discontinua cada
monocadena.
Replicacin en eucariotas
Las caractersticas generales de la replicacin son idnticas. La diferencia se halla en
que en organismos eucariotas la replicacin tiene mltiples orgenes de replicacin.
Diversas protenas van a reconocer los orgenes y por un mecanismo similar se van a
formar las burbujas de replicacin y una vez formadas la sntesis va a ser idntica que
en eucariotas, de forma que cada burbuja considerada por separado se replica igual
que el cromosoma bacteriano.
En eucariotas se han caracterizado 5 DNA polimerasas (aunque posiblemente hay
ms).
DNA polimerasa . Tiene actividad polimerasa y primasa de forma que es
capaz de sintetizar el primer e incluso iniciar la sntesis
DNA polimerasa . Tiene actividad polimerasa 5-3 y exonucleasa 3. Seria
equivalente a la DNA polimerasa 3 holoenzima. Requiere la protena PCNA para
que esta enzima funcione
DNA polimerasa . Tiene tambin actividad polimerasa y exonucleasa 3
participa en la replicacin pero su funcin fundamental es la reparadora.
DNA polimerasa . Esta implicada fundamentalmente en mecanismos de
reparacin
DNA polimerasa . Se trata de una polimerasa mitocondrial, que replica el DNA
mitocondrial con ayuda de primasas.
En eucariotas el DNA esta mucho ms compactado (estructura de nucleosoma) de
forma que se requieren multitud de protenas que desbaraten gran parte de la
estructura de la cromatina para hacer el DNA accesible. Adems, ninguna de las
polimerasa conocidas tiene actividad exonucleasa 5 de manera que se requieren
exonucleasas adicionales para eliminar los cebadores.
Por ltimo en eucariotas se da un problema (aparte de la compactacin de la cromatina
con histonas). En bacterias con una mitad del cromosoma circular se puede terminar de
replicar el DNA, pero en DNA lineales siempre quedar un extremo de 10 nucletidos
Alberto Gmez Esteban & Laura del Olmo
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sin rellenar, el cual se debe eliminar, este extremo corresponde a los telmeros. Estos
extremos estn formados por DNA repetitivos protectores del cromosoma los cuales
son prescindibles, pero en ocasiones si que se puede llegar a perder informacin
gentica. Esto se ve resuelto por las enzimas telomerasas, que se encargan de
rellenar los huecos, estn formadas por RNA complementario a los telmeros y
protenas con actividad polimerasa.
El DNA esta acomplejado con histonas, de forma que cuando se sintetizan hebras hijas
se deben sintetizar nuevas histonas para reorganizarlas. Muchas histonas antiguas se
aprovechan por las hebras hijas.
La replicacin en eucariotas es mas lenta que en bacterias pero el hecho de que se
lleve a cabo en mltiples orgenes de replicacin lo que a su vez origina fragmentos de
Okazaki mas cortos. El DNA humano se replica por concreto en unas 8 horas.
Formacin de dimeros
Base alterada
Rotura de cadenas
Apareamiento incorrecto
Delecin-insercin
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Existen enzimas que rastrean continuamente el DNA en busca de daos, por ejemplo
en el caso de un dmero, una endonucleasa consigue detectar el dmero y cortar la
zona daada (elimina unos 10-12 nucletidos) con lo cual existe un hueco que se
rellena utilizando el fragmento anterior (53) como cebador, y utilizando una ligasa
para unir esos nucletidos.
En eucariotas fundamentalmente la DNA polimerasa y se encargan de reparar
estos huecos.
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Sentido 53
Diferencias
Se requiere un DNA molde al que copiar, al que con nucletidos trifosfato va a formar una
cadena de RNA, es decir, nucletidos monofosfato liberndose el pirofosfato para
irreversibilidad la reaccin.
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El RNA que se forma es monocatenario, por lo que nicamente se copia una de las dos cadenas
de DNA que se denomina hebra molde. La secuencia de RNA tiene la misma secuencia que la
complementaria a la molde, que se denomina hebra codificante que tiene la misma direccin
que el RNA y se denomina tambin hebra con sentido (+). La hebra molde se denomina por el
mismo motivo hebra antisentido (-).
El primer nucletido que se copia se denomina +1, y hacia delante, en la zona que ya se
transcribe se va considerando +2, +3, +4 (sentido aguas abajo, downstream), y en
contrasentido -1, -2, -3 (Sentido aguas arriba, upstream).
Transcripcin
Procariotas
Los procariotas tienen nicamente un RNA polimerasa para sintetizar todo tipo de RNA. Esta
RNA polimerasa tiene una estructura compleja formada por tres tipos de subunidades que
constituyen el ncleo o core:
Subunidad 2. Tiene una funcin estructural y reguladora de manera que a ella se van a
unir determinadas molculas encargadas de regular la transcripcin
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En la posicin -10 vamos a tener lo que denominamos caja TATA o caja de Pribnow que es una
secuencia generalmente de 6 bases donde es caracterstica la secuencia TATAAT. Tambin
sobre la posicin -35 normalmente encontramos una segunda secuencia TTGACA de menor
importancia. Los promotores que tengan estas secuencias en dichas localizaciones son muy
eficaces iniciando la transcripcin (promotores fuertes). A estas secuencias se les denomina
secuencias consenso.
La RNA polimerasa recorre el DNA hasta localizar el promotor, y una vez lo localiza, la propia
RNA polimerasa es capaz de abrir la doble hlice para que pueda comenzar la copia llegando a
un estado de promotor abierto disponible para copiar.
Una vez se ha sintetizado una pequea cadena de RNA (10-12 nucletidos) la subunidad se
separa de la enzima ya que no es necesaria y es sustituida por una protena que se denomina
nusA que acompaara a la protena a lo largo de toda la sntesis del RNA.
La hebra de RNA a medida que se sintetiza va formando un hibrido con la cadena molde de
DNA. La formacin de este hibrido es fundamental de forma que a medida que avanza esta
transcripcin (doble hlice tipo A). Precisamente cuando el hibrido se desbarata termina la
transcripcin.
La transcripcin es bastante ms lenta que la replicacin, pero esta velocidad esta compensada
porque los genes se transcriben muchas veces y adems las secuencias que se transcriben son
mucho menores en tamao que el genoma total.
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TRANSCRIPCIN EN BACTERIAS
1 FASE: INICIACIN en el promotor (subunidad , protena NusA)
Se inicia en el promotor gracias a la subunidad sigma (). Una vez reconocido el promotor la
subunidad se desprende y es sustituida por la protena NusA, que contina con la RNA
polimerasa durante todo el proceso. Una vez superada la fase de iniciacin, la 2 fase es la
elongacin.
3 FASE: TERMINACIN
La elongacin contina hasta que aparece una seal de terminacin tan especfica como el
inicio. Una vez que se rompa el hbrido y finalice por tanto la transcripcin, la RNA polimerasa
y la protena nusA se separarn.
Se cree que la protena nusA (que acompaa a la RNA polimerasa en toda la
transcripcin) tiene algo que ver tambin con el reconocimiento de seales, pero no
se conoce bien.
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TERMINADORES INTRNSECOS o independientes de Rho (no requieren a la
protena rho)
2. Aparicin de una secuencia palindrmica en la hebra de DNA, por tanto el RNA recin
sintetizado tambin la tendr, por lo que se podr aparear consigo mismo formando
una horquilla que tiene 2 consecuencias inmediatas:
(1) No aparea con el DNA.
(2) Interfiere en el avance de la RNA polimerasa (la ralentiza an ms).
Explicacin:
5 --- G C A T C G ------- C G A T G C ---- 3 (Secuencia palindrmica)
3 --- C G T A G C ------- G C T A C G ---- 5
Esta es la secuencia palindrmica que se va a copiar en el RNA recin sintetizado.
Va a ser muy rica en guaninas y citosinas, por lo que si hay muchos pb GC va a costar ms
abrir la doble hlice de DNA, ya que estos dan ms estabilidad a la cadena (3 puentes de
hidrgeno).
El resultado es que la RNA polimerasa se ralentiza, pero todava puede seguir copiando RNA.
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PROTENA RHO () o terminador dependiente de Rho: hexmero con 2
actividades enzimticas = (1) ATPasa y (2) *HELICASA* (la que realmente
finaliza la transcripcin)
1. Actividad ATPasa. Le permite aparearse/interaccionar con la molcula de RNA
que se est sintetizando y avanzar a travs de ella, ya que para ello requerir
hidrolizar ATP.
En otras palabras, la protena Rho reconoce algo en el RNA (posiblemente a la secuencia
palindrmica) y se aparea/interacciona con l gracias a la actividad ATPasa.
Secuencia de timinas
Protena Rho (actividad helicasa)
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En resumen, existen 4 tipos de terminadores especficos de la transcripcin:
2 no definitivos, ralentizan a la RNA polimerasa (intrnsecos no
dependientes de ):
(1) Secuencia rica en GC
(2) Secuencia palindrmica
2 definitivos, rompen la doble hlice:
(3) Fila de timinas (intrnseco no dependiente de )
(4) Protena Rho (actividad helicasa)
Es una estructura con varias molculas de tRNA (7-8), de manera que necesitamos enzimas
para liberar esos tRNAs y que queden ya como tRNAs funcionales y maduros.
Nucleasas. Cortan la molcula en puntos especficos.
*Hay que recordar que todos los tRNAs tienen en el 5 una G fosforilada y en el 3 la secuencia
ACC, que es la que se une en el a y para todos es la misma.
Modificacin de bases o adicin de los nucletidos que hagan falta.
*Hay que recordar que el tRNA tena algunas bases modificadas.
36
Biologa molecular
-
1er Parcial
rRNA transcrito primario (no funcional) nucleasas rRNA FUNCIONAL
MADURO
Es una estructura que contiene en una misma molcula las 3 especies de rRNA.
Nucleasas. Determinadas nucleasas van a tener que cortar al transcrito primario para
separar a las 3 especies.
RNA POLIMERASA I. Transcribe genes de tipo I que son los que dan lugar a rRNAs
grandes (los rRNAs pequeos son sintetizados por la RNA polimerasa III).
- Localizacin: nuclolo.
37
Biologa molecular
1er Parcial
*RNA POLIMERASA II*. Es la ms importante porque transcribe genes de clase II
que son los que dan lugar al mRNA. Adems tambin transcribe la mayor parte de los
RNAs pequeos y RNAs nucleares.
- Localizacin: nucleoplasma formando parte de la cromatina (protenas no
histonas).
RNA POLIMERASA III. Transcribe genes de clase III que son los que van a dar lugar al
tRNA, aunque tambin a rRNAs pequeos y algunos RNAs nucleares pequeos
(snRNA).
En resumen:
RNA POL I = rRNA
Al igual que en las bacterias, en la posicin +1 del promotor habr siempre una
PURINA.
PROMOTOR BASAL = parte de la caja TATA (-25): parte imprescindible para el
promotor; hace posible la transcripcin.
Hacia atrs tenamos la caja TATA/TATA box/caja de Hogness, pero en lugar de estar en la
posicin -10 como en las bacterias, en los eucariotas se localiza en la posicin -25.
De esta forma (con la purina en posicin +1 y con la caja TATA en posicin -25) el promotor es
an poco eficaz, es decir, apenas trascribe, por lo que necesitar de otras secuencias para
incrementar su capacidad de transcripcin:
38
Biologa molecular
1er Parcial
PROMOTOR PROXIMAL = secuencia K (-75) y secuencias ricas en G y C (-50, -100):
regiones que mejoran la eficacia del promotor; NO es imprescindible, simplemente
mejora la transcripcin.
o SECUENCIA K (posicin -75).
PROTENAS/FACTORES hasta para reconocer al promotor. Es decir, no nos vale solo la RNA
polimerasa, sino que requeriremos la colaboracin de muchas protenas para reconocer el
promotor, abrir el DNA, elongar (2 fase)
DISTALES que
Adems tambin necesitaremos determinadas SECUENCIAS
mejorarn/dificultarn la transcripcin unindose o interaccionando a/con los factores de
transcripcin.
Secuencias distales. Dentro de ellas hay:
-
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Biologa molecular
1er Parcial
En organismos eucariticos, al igual que en bacterias, la RNA polimerasa es la
que transcribe el RNA pero necesita la colaboracin de todos esos factores de
transcripcin y secuencias distales hasta para reconocer al promotor (origen).
Promotor eucaritico: Pu y caja tata (-25); ms atrs: secuencias promotores proximales.
Regiones ms importantes del promotor: caja tata, regin CAAT, regiones ricas en G y C
(mejoraban el promotor basal).
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Biologa molecular
1er Parcial
Tambin se ha descubierto que en el caso de la RNA POLIMERASA II actan algunas
PROTENAS SIMILARES A LA RHO que provocan el final de la sntesis.
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Biologa molecular
1er Parcial
La modificacin va a estar relacionada con la estabilidad de la molcula y la
complejidad de su estructura superior.
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Biologa molecular
1er Parcial
El proceso de splicing lo llevan a cabo una
serie de partculas formadas por snRNA (ricos en uracilo) y protenas, este complejo se
llama snRNP (pequeos y nucleares ribonucleoprotenas, o "snurps"). La parte
cataltica de los snRNP es el RNA de forma que es una ribozima. Los snurps al ser
ricos en uracilo se les denomina por U1, U2, U3
El corte y empalme se va a producir sucesivamente. Todos los intrones tendrn en el
extremo 5 una secuencia GU y en el extremo 3 una secuencia AG. En el centro
tienen tambin una secuencia especfica que es lo que se denomina punto de
ramificacin.
Estas secuencias son reconocidas por un determinado snurp1 que produce un corte
especfico que deja un OH libre en el extremo 3 del exn1 y la estructura GU-intrn-AG
en el extremo 5 del exn2. Otro snurp2 eliminar el intrn unido al 5 exn2 dejando a
los dos exones libres. Otro snurp3 acta como una ligasa uniendo a los dos exones
entre s.
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Biologa molecular
1er Parcial
La presencia de intrones se da gracias a que una molcula de RNA heterogneo
nuclear se pueden dar distintos RNA mensajeros maduros eliminando o no exones.
Siempre se deben mantener el primer y ltimo exn. Esto se denomina
splicing diferencial o
alternativo.
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Biologa molecular
1er Parcial
En ocasiones el propio RNA ribosmico tambin participa en el proceso de corte y
empalme en lo que se denomina "autosplicing".
Inhibidores de la transcripcin
Hay toda una serie de molculas, fundamentalmente antibiticos, que inhiben la
transcripcin.
La rifamicina es un compuesto natural de streptomyces y la rifampicina es un
compuesto artificial. Ambos interactan con la unidad de la RNA polimerasa
bacteriana y por tanto bloquea la transcripcin en bacterias. Es un antibitico muy til
para combatir infecciones dado que al ser humano no le afecta.
Los intercalantes se intercalan en la doble hlice de DNA e impiden su apertura para
que el gen sea transcrito. A altas concentraciones pueden llegar a inhibir la replicacin.
Uno de los ms estudiados es la actinomicina D que es un antibitico que siempre
que aparecen pares seguidos G-C se intercala en ese punto anclndose al DNA.
-amanitina)
Algunas toxinas fngicas como la producida por la Amanita phalloides (
interacciona con la RNA polimerasa eucaritica (sobre todo la RNA polimerasa II que
sintetiza el mensajero).
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Biologa molecular
1er Parcial
*Recordatorio*
El tRNA tiene una regin que reconoce especficamente al codn, que se denomina
anticodn y la molcula de tRNA en su extremo 3 poda unirse a un aminocido.
Cada tRNA tiene un anticodn de tres bases (distintas para cada tipo de tRNA) que
interacciona con un aminocido distinto, y reconoce al codn en sentido antiparalelo
determinando el aminocido que debe ser incorporado en la protena.
El tRNA interaccionar con el codn mediante puentes de hidrgeno y con el
aminocido mediante un enlace covalente.
tRNA maduro
Aminocidos
Ribosomas
Enzimas
Factores de traduccin
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Biologa molecular
Cdigo gentico
1er Parcial
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Biologa molecular
1er Parcial
Traduccin
Globalmente la traduccin consta de tres pasos fundamentales:
1. Activacin del aminocido. Es previa a la sntesis y capacita la formacin del
enlace peptdico ya que dota de energa al aminocido.
2. Proceso de traduccin en s mismo
3. Modificaciones estructurales debido a que ninguna protena recin sintetizada
es funcional
Activacin
Se produce de la misma manera en procariotas y en eucariotas. En procariotas tiene
lugar en el citoplasma y consiste en la unin del aminocido a su tRNA especfico.
Necesitamos energa proporcionada por ATP y el aminocido se une a su tRNA
liberndose AMP y pirofosfato.
La reaccin anterior se produce en dos pasos:
1. Aminocido + ATP. Dar lugar a un aminocido unido a AMP por un enlace rico
en energa (anhdrido mixto) y la liberacin de pirofosfato.
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Biologa molecular
1er Parcial
2. Aminocido + tRNA. El enlace que se forma tendr una energa considerable
(enlace tipo ster) y dar lugar a una estructura conocida como aminoaciltRNA
o tRNA cargado. Tambin se libera el AMP. Se trata de una reaccin de
transferencia.
La enzima que cataliza la reaccin global es la aminoacil-tRNA sintetasa (especfica
de cada aminocido). Estas enzimas tienen capacidad para reconocer los errores y
sustituir al aminocido errneo por el especfico de cada enzima por lo que son
responsables de la especificidad. Esta enzima primero se une al aminocido (son
especficas para cada aminocido y hay 20 de ellas) y una vez que tiene el aminocido
correcto reconoce al tRNA mediante las regiones singulares del mismo. Cada
aminoacil-tRNA sintetasa reconoce 1 solo aminocido y todos los tRNA isoaceptores
del aminocido (20 tipos de enzima).
Traduccin
La traduccin requiere un inicio claro y tambin un final bien delimitado, por lo que
tendremos tres etapas:
Reconocimiento e iniciacin
Elongacin
Terminacin
Todas las protenas bacterianas deben ser iniciadas por metionina (codn AUG
inicial). En su extremo NT tendrn siempre una metionina pero tambin puede estar
intercalada en la secuencia, por lo que el codn AUG no debe ser la nica seal de
inicio. Deben existir mas seales de inicio como una secuencia rica en purinas (-10)
llamada secuencia de Shine-Dalgarno que adems aparea de forma complementaria
con una secuencia rica en pirimidinas presente en el rRNA (subunidad pequea).
La metionina inicial de las protenas aparece modificada (formilada) en su NT en forma
de N-formil-metionina, por ello la metionina tiene dos tRNA especficos:
tRNAMet. Se trata del tRNA que codifica una metionina intercalada en la
secuencia proteica.
tRNAfMet. Se trata del tRNA que codifica la metionina inicial. La metionina se
formila despus de unirse al tRNAf gracias a una molcula de formilTHF.
Para la iniciacin necesitamos una serie de protenas libres que se conocen en general
como factores de iniciacin que son extrarribosmicas y son tres:
IF-1
IF-2
IF-3
Dos de estos factores (IF-1 e IF-3) quedan unidos a la subunidad menor y causan que
se abra el ribosoma para comenzar la transcripcin. En el lugar P del ribosoma se sita
el codn AUG. La formil-metionina va unida al IF-2 y a GTP de manera que el tRNA
se incorpora el aminocido apareando el anticodn con el codn.
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Biologa molecular
1er Parcial
El paso siguiente es simultneo y se produce la liberacin de los factores IF-3 y IF-1, se
hidroliza el GTP liberndose GDP y se separa tambin el IF-2. Todo esto promovido
por la hidrlisis del GTP permite que se incorpore la subunidad mayor del ribosoma. En
esta actividad GTPasa participa tambin el ribosoma. En este paso no se produce
revisin de errores
La elongacin como el paso anterior requiere protenas libres que van a ser los
factores de elongacin:
EF-Tu
EF-Ts
EF-G
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Biologa molecular
1er Parcial
RF-1
RF-2
RF-3
Iniciacin. 1 GTP
Elongacin. 2 GTP
Terminacin. 1 GTP
Esto se produce por cada aminocido, y una protena normal tiene cerca de 200
aminocidos, por lo que se consumir una enorme cantidad de energa, por ello es
preciso una regulacin de la expresin gnica que estudiaremos en unidades
siguientes.
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Biologa molecular
1er Parcial
En cualquier proceso que gaste mucha energa se asegura la fidelidad del proceso
(que se da al activar el tRNA y cada vez que se incorpora un aminocido a la protena)
por ello la sntesis de protenas es muy precisa.
La sntesis de protenas en bacterias va acoplada a la transcripcin, es decir, a medida
que se sintetiza el mRNA como es muy inestable empieza ya a ser traducido
simultneamente por mltiples ribosomas a la vez (polisoma), obteniendo mltiples
copias de la misma protena.
Las protenas recin sintetizadas en bacterias no son funcionales de manera que
deben modificarse para ser maduras. Las modificaciones en eucariotas son similares
a las de las bacterias pero hay un caso que no ocurre en eucariotas:
Deformilacin. Todas las protenas deben perder el radical formilo de la primera
metionina gracias a una deformilasa, de forma que las protenas pasan a tener
una metionina normal en su extremo NT. Este proceso es simultneo a la
traduccin. Esto se lleva a cabo en todas las protenas bacterianas.
Prdida de la metionina. Hay otra opcin aparte de la deformilacin, que es la
perdida de la metionina. Esto se lleva a cabo gracias a aminopeptidasas. Se
lleva a cabo en muchas protenas bacterianas.
Perdida del primer fragmento. Se pierde un fragmento del NT de la cadena
gracias a una peptidasa (peptidasa de seal). Esto se lleva a cabo en la
minora de protenas bacterianas y suelen ser protenas de secrecin al medio
extracelular.
Traduccin en eucariotas
Se trata de un proceso similar que al procaritico pero hay una serie de diferencias:
1. El mensajero eucaritico se sintetiza en el ncleo, se modifica, sale al citosol y
se traduce, de manera que traduccin y transcripcin son procesos
independientes.
2. Las protenas eucariticas empiezan todas por metionina deformilada salvo
las protenas sintetizadas en las mitocondrias que s empiezan por
formilmetionina.
3. La metionina, al igual que las bacterias tiene dos tRNA: tRNAf y tRNAMet. El
tRNAf ( tRNAiMet) es especfico de metionina en la posicin inicial, pero la
metionina no est formilada.
4. En eucariotas no se ha observado ningn tipo de secuencia Shine-Dalgarno,
pero el primer codn AUG que aparezca tras el CAP del mRNA ser el
punto de inicio. Si aparece una purina en (-3) y una guanina en (+4) el tRNA se
copia aproximadamente 20 veces ms rpido esto se conoce como segmento
Kozak.
5. El mRNA bacteriano carece de estructura, pero el mRNA eucaritico si puede
estar parcialmente plegado formando horquillas.
Alberto Gmez Esteban & Laura del Olmo
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Biologa molecular
1er Parcial
6. Para que se inicie la traduccin necesitamos muchos factores de iniciacin.
En eucariotas se han caracterizado alrededor de 9 factores de iniciacin. En
general se denominan factores de iniciacin eucariotas (eIF). Entre los ms
importantes est el conocido como protena de unin al CAP.
Para llevar a cabo la traduccin necesitamos formar una estructura de mRNA
desplegado. Un eIF separa la subunidad mayor del ribosoma y la traduccin
comienza gracias a tRNAf unida a eIF2 (unido a GTP) despus se produce un
despliegue del mRNA y la subunidad menor migra hasta localizar el AUG (con
gasto de ATP) que es situado en la posicin P acoplndose la metionina en un
proceso anlogo al procaritico. La hidrlisis del GTP provoca el desacople de
todos los factores y la incorporacin de la subunidad mayor en una situacin
idntica a la bacteriana.
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Biologa molecular
1er Parcial
Hay una serie de cambios con respecto a los factores de elongacin:
EF-Tu eEF-1
EF-Ts eEF-1
EF-G eEF-2
Modificaciones en eucariotas
Las protenas recin sintetizadas no son funcionales, por lo que sufren una serie de
modificaciones importantes:
Modificacin de los extremos. Eliminacin del formilo en protenas
mitocondriales y prdida de la metionina en muchas protenas de todo tipo.
Prdida del pptido seal. Todas aquellas protenas insolubles de la
clula se sintetizan en ribosomas del RER, y se sintetizan con un extremo
NT extra que en cuanto emerge del ribosoma, dirige al pptido al retculo.
Este pptido seal se pierde en todas aquellas protenas asociadas a
membrana.
Ruptura proteoltica. Se sintetizan como preprotenas con pptidos seal que
deben perder (Pre-pptido). En ocasiones tambin se sintetizan con un fragmento
extra (Pro-Pptido) o ambos. Por ello deben perder estos pptidos para ser
funcionales.
Este es el caso de hormonas como la insulina (sintetizada en forma de Pre-ProInsulina) o los zimgenos.
Agregacin de grupos funcionales
Hidroxilacin. Hay protenas que tienen determinados residuos
hidroxilados (los requieren para ser funcionales) ocurre en el caso de
numerosos aminocidos del colgeno
Metilacin. Ocurre lo mismo que en la hidroxilacin. Este proceso junto con
el anterior sirve para variar las cargas de las protenas alterando sus
funciones.
Fosforilaciones. Modifica su funcin y es abundante en enzimas.
Puentes disulfuro. Afecta a dos aspectos: elimina el carcter reductor de
la Cys (SH S-S) y crea un enlace covalente que estabiliza la protena.
Esto es comn en protenas de secrecin ya que el medio externo es muy
oxidante y con puentes disulfuro se protege la protena de la oxidacin.
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Biologa molecular
1er Parcial
Glicosilacin y unin de lpidos
Glicosilacin. La Glicosilacin de protenas es la unin covalente de
hidratos de carbono que sufren muchas (sobre todo de secrecin) que
causan que sean reconocidas por receptores. Las protenas de membrana
glicosiladas suelen actuar como receptores.
Unin de lpidos. La unin covalente de lpidos que puede darse en
muchas protenas de membrana ya que les permite anclarse con mayor
facilidad. Normalmente se denominan proteolpidos.
Plegamiento de la protena. Se lleva a cabo a medida que se va sintetizando o
bien una vez sintetizada.
Inhibidores de la traduccin
Hay una serie de sustancias capaces de inhibir la traduccin, y sobre todo las
especficas de la traduccin bacteriana pueden ser utilizadas como antibiticos:
Cloranfenicol. Se une a la subunidad 50 S inhibiendo la actividad peptidiltransferasa. Este antibitico es poco selectivo y afecta a los ribosomas
mitocondriales eucariticos, por ello es bastante txico.
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Biologa molecular
1er Parcial
*Clnica*
La toxina diftrica es producida por la bacteria Corynebacterium diphteriae. La
toxina diftrica es una protena con dos dominios bien diferenciados la cual
interacciona con la membrana de una clula, lo cual produce la rotura proteoltica
de ambos dominios. Uno de ellos abre un canal en la membrana que causa la
entrada de la otra subunidad.
La subunidad entrante es una enzima que cataliza la siguiente reaccin:
eEF-2 ADP-Ribosa-eEF2
Por tanto la toxina de la difteria inactiva la translocasa eEF-2 mediante ADPribosilacin. Hasta que no se descubri la vacuna la difteria provocaba una gran
cantidad de muertes.
La bacteria se aloja sobre todo en las vas respiratorias superiores (faringe,
laringe) aunque su toxina puede llegar a afectar a todo el organismo.
El ADP-Ribosa es aportado por la coenzima NAD+ que pasa a ser nicotinamida.
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Biologa molecular
1er Parcial
Control pretranscripcional
Dependiendo de la estructura de la cromatina el DNA se va a expresar con mayor o
menor facilidad. El DNA esta muy compacto en la cromatina y cuanto ms condensado
este ms difcilmente accesible ser. Por ello distinguimos dos tipos de cromatina:
Eucromatina. Difusa y poco compactada, por ello esta disponible para la
transcripcin.
Heterocromatina. Es cromatina compactada y indispuesta para la transcripcin.
Normalmente va a estar formada por DNA repetitivo (centrmeros, telmeros).
La replicacin de esta zona es lenta al haber dificultades para desplegar la
protena, pero la transcripcin es imposible.
Estos estados dependen de las posibles modificaciones de las histonas y del DNA
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Biologa molecular
1er Parcial
las anteriores, es decir, facilita la transcripcin sin embargo hay casos en que dificulta
la transcripcin debido a que en determinados casos el metilo es dificulta la interaccin
con los factores de transcripcin.
*Investigacin*
El DNA compactado es menos sensible a nucleasas que el DNA que forma parte de
la eucromatina, por tanto estas modificaciones se estudian utilizando nucleasas para
estudiar la vulnerabilidad del DNA y por tanto averiguar el grado de compactacin del
material gentico.
Los genes de la globina se expresan en los eritroblastos de forma que el gen de la
globina est muy modificado en stas clulas, mejorando enormemente su expresin
pero en otros tejidos no est modificado y no se expresa.
Control transcripcional
El principal punto de regulacin de la expresin gnica se da en este punto. Para iniciar
la transcripcin necesitamos el promotor basal (caja TATA, punto de inicio) el
promotor proximal y elementos distales promotores de la transcripcin. Todas las
secuencias del DNA interventoras en la transcripcin se denominan elementos cis.
Los elementos distales pueden estar a miles de pares de bases de distancia, pero
gracias a que los factores de transcripcin y la RNA-polimerasa los pueden aproximar
mucho al punto de inicio, influyen en la expresin del gen.
Los genes domsticos son los genes que se expresan continuamente y expresan todos
estos elementos.
Para que todos estos elementos funcionen, requieren interaccin de una protena (sea
la RNA-polimerasa o bien algn factor de transcripcin) a los elementos que
interaccionan con un elemento cis se denominan elementos trans.
Los elementos distales pueden actuar como respuesta o bien a hormonas o bien a
AMPc y regulan la eficacia de la transcripcin, siendo generalmente activadores
enhancers aunque en ocasiones la inhiben.
Los elementos de respuesta a hormonas (HRE) se basan en hormonas liposolubles
que atraviesan sin problema las membranas celulares (esteroideas y tiroideas) y tienen
su receptor en el citosol. Cuando la hormona interacciona con el receptor ste acta
como un factor de transcripcin especfico. Estos factores son especficos de un tejido,
o del momento.
Alberto Gmez Esteban & Laura del Olmo
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Biologa molecular
1er Parcial
Otros se denominan elementos de respuesta a AMPc (CRE). El AMPc activa a la
protena quinasa A (PKA) la cual fosforila una protena que activa al CRE. Estos
intensificadores estn en todas las clulas pero solo se expresan en determinados
momentos
Todos los factores de transcripcin que interaccionan con los elementos cis
respondern a unas estructuras muy tpicas. Todos los factores de transcripcin
interaccionan por una parte con DNA y por otra con protenas (RNA-polimerasa o bien
otros factores). Las regiones de interaccin con DNA tendrn siempre una estructura
especfica:
Control postrasncripcional
Una vez sintetizado el mRNA podemos regular la maduracin del mensajero lo que
implica la eliminacin de intrones y la adicin de la cola poli A.
En el caso de la eliminacin de intrones hablamos del splicing alternativo, que se
lleva a cabo eliminando exones siempre que se conserve el primero, el ltimo, y el
orden.
En el caso de la cola poli A sta se puede aadir en diversos puntos del mensajero. El
mRNA se puede cortar en un punto u otro dependiendo de donde se aada esta cola.
Hay algunos mensajeros que no salen del ncleo, con lo que si no son transportados al
citoplasma no se traducen. Esto puede depender de la longitud de la cola poli A.
Una vez tenemos el RNA en el citoplasma, depende de la estabilidad del mensajero. El
mRNA es muy inestable la traduccin debe ser muy rpida. Se ha visto que las
hormonas esteroideas aparte de promover la expresin gnica tambin aumenta la
estabilidad del mRNA.
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1er Parcial
Control traduccional
La traduccin se regula en una gran cantidad de protenas, que en humanos
conocemos fundamentalmente dos:
Sntesis de ferritina
Sntesis de hemoglobina
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Biologa molecular
1er Parcial
Si la concentracin de hemo es alta nos interesa formar globinas, de forma que se
inactiva la HCI y el eIF-2 estar defosforilado y capacitado para intercambiar GTP
(forma funcional) lo que produce la sntesis de globinas. Lo mismo ocurre al contrario.
Tambin las globinas ejercen un control similar en la sntesis del grupo hemo, aunque
ste no sea una protena.
*Controles postraduccin*
Es mucho menos importante que las vistas anteriormente
La modificacin proteica es un modo de control postraduccin ya que si una
protena no se modifica adecuadamente como ya vimos en la unidad anterior, no es
funcional.
Tambin es posible controlar la degradacin de una protena envejecida o
defectuosa mediante su ubiquitinizacin y su digestin en un proteasoma.
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