SOAL RESPONSI SISMIK

1. Taksonomi Adansonian didasarkan atas 5 prinsip utama, kecuali....

a. Taksonomi ideal mengandung informasi terbesar
b. Masing-masing karakter diberi nilai setara
c. OTU merupakan fungsi proporsi similaritas
d. Similaritas tidak bersifat fenetis
Jawaban: D
2. Untuk mengkonstruksi phylogeny tree yang didasarkan atas data sequence 16s rDNA
maka ada beberapa tahap yang tepat yaitu....
a. Preparasi sequence, aligment, konstruksi phylogeny tree, pengeditan,
presentasi, visualisasi, konstruksi matriks similaritas
b. Preparasi sequence, aligment, konstruksi phylogeny tree, visualisasi,
pengeditan, presentasi, konstruksi matriks similaritas
c. Preparasi sequence, aligment, konstruksi phylogeny tree, pengeditan,
presentasi, konstruksi matriks similaritas, visualisasi
d. Preparasi sequence, konstruksi phylogeny tree, aligment, pengeditan,
presentasi, konstruksi matriks similaritas, visualisasi
Jawaban: B
3. Pada klasifikasi molekular filogenetik, terdapat 3 pohon filogenetik yang dihasilkan.
Apa sajakah aplikasi yang digunakan untuk mendapatkan pohon filogenetik tsb?
a. Phylip dan MEGA
b. Phylip dan PFE
c. MEGA dan MVSP
d. MEGA dan PFE
Jawaban: A
4. Klasifikasi mikrobia secara molekular dapat dilakukan dengan menggunakan data
berupa a)................................................, b)...................................................., dan
c).............................................
Jawaban: a. fingerprinting DNA b. Sequence DNA c. hasil hibridisasi DNA-DNA dan
DNA-RNA
5. Data yang digunakan pada praktikum klasifikasi molekular filogenetik bedasarkan
analisis ............................. yang diperoleh dari .......................................
Jawaban: 16s rDNA dari NCBI
6. Pada klasifikasi numerik fenetik dengan data fingerprint, software yang digunakan
adalah..........................................................................................
Jawaba: excel dan mvsp