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CONTRIBUIO DAS MICAS NA SADE HUMANA: AVANOS E DESAFIOS

Contribution of the omics siences to human health: advances


and challenges
Ana Rosa Linde Arias1, Marina Moreira Freire2
RESUMO
O seqenciamento do genoma humano abriu portas para uma era de descries
holsticas sobre a sade humana. Hoje, possvel estudar os mecanismos biolgicos
humanos em relao a dietas e fatores ambientais como drogas e poluentes. No
passado, as pesquisas cientficas estiveram muito focadas nas doenas e em como
restabelecer a sade humana aps estas enfermidades. Atualmente, a preveno das
doenas vem ganhando maior ateno e reconhecimento. Para que se possa entender
a relao do ambiente com a sade, as pesquisas devem abranger uma ampla faixa
de reas, desde nveis moleculares at o estudo do corpo como um todo. Ultimamente,
tm sido revistas as implicaes do sistema biolgico no entendimento da sade
humana e sabido que a descrio mecanicista completa do organismo humano
ainda no possvel. Entretanto, recentes avanos no estudo da biologia dos sistemas
determinam uma trajetria para as pesquisas futuras garantindo melhora das condies
de sade individuais e das populaes. A preveno de doenas se tornar mais
importante, sendo vista como o caminho bvio para pesquisas em cincias da vida.
Alm disso, mais nfase ser dada nesses caminhos naturais. Novas disciplinas mediaro
recentes percepes sobre a sade humana que, sem dvida, tero significante impacto
positivo em nossa qualidade de vida.
PALAVRAS-CHAVE
Sistemas biolgicos, genmica, transcriptmica, protemica e metabolmica
Abstract
The sequencing of the human genome has opened the door to the most exciting new
era of the holistic system description of human health. It is now possible to study the
mechanisms of human health in relation to diet and other environmental factors such
as drugs and toxic pollutants. Life-Science research has in the past much focused on
diseases and how to reestablish human health after illness. Today, prevention of illness
is gaining recognition. To understand the link between environment and health, research
must cover a broad range of areas, from the molecular level to whole body studies.
The current state and implications of systems biology in the understanding of human
health are reviewed. It becomes clear that a complete mechanistic description of the

Doutora em Cincias Ambientais. Pesquisadora da Fundao Oswaldo Cruz. - End.: Rua Leopoldo
Bulhes, 1480 - Manguinhos, CEP: 21041-210, Rio de Janeiro - RJ Laboratrio de Ecotoxicologia do
CESTEH - ENSP - FIOCRUZ. E-mail: arlinde@ensp.fiocruz.br

Mestre em Sade Pblica. Fundao Oswaldo Cruz.


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human organism is not possible yet. However, recent advances in systems biology
provide a trajectory for future research in order to improve health of individuals and
populations. Disease prevention will become more important as the obvious path of
research in life sciences and more focus will need to be put in those natural ways. The
new disciplines, will mediate new insights into human health that will finally have
significant positive impact on our quality of life.
KEY WORDS
Systems biology, genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics

1. INTRODUO
A biologia de sistemas pode ser definida como a cincia que visa identificar os
elementos em um sistema e analisar suas interaes enquanto o sistema est
funcionando, objetivando entender o todo (Wolkenhauer, 2001). A biologia de
sistemas tem por finalidade estudar sistematicamente todos os processos que
ocorrem em uma clula ou tecido por mensuraes globais de estados de perturbaes diferentes. O objetivo final desta integrar os dados dessas observaes
em modelos que possam, eventualmente, representar e tornar possvel a simulao
da fisiologia da clula (Ideker et al., 2001).
De forma geral, os principais objetivos da biologia de sistemas so:
(1) O entendimento dos componentes de um sistema biolgico, tais como
genes, protenas e metablitos, assim como suas estruturas fsicas;
(2) O entendimento da dinmica dos sistemas, com anlises tanto quantitativas
quanto qualitativas bem como a construo de teorias/modelos com uma
capacidade poderosa de previso;
(3) O entendimento dos mtodos de controle do sistema (Kitano, 2002).
O Projeto Genoma Humano (PGH) um exemplo do avano da cincia no
sentido das descobertas globais. O PGH buscou, a partir de um objeto biolgico
complexo o genoma definir todos os seus elementos, ou seja, as seqncias de
DNA dos 24 diferentes cromossomos humanos (Lander et al., 2001; Venter et al.,
2001). Este projeto deu origem a uma nova cincia chamada de genmica (Stuart
et al., 2003). Com a concluso deste projeto aumentaram as possibilidades de
estudos dos sistemas biolgicos de forma completa, atravs do entendimento de
como cada parte contribui para a criao do todo. Estudos nos quais todos ou a
maioria dos elementos de um sistema poderiam ser estudados quantitativamente
ou em termo de suas interaes. Enquanto o enfoque da gentica era tradicionalmente reducionista, dissecando um organismo com mutaes para ver quais so
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as partes, a biologia dos sistemas tenta juntar as partes para compreender o


sistema de forma integrada. Um sistema biolgico constitui redes de regulao
gnica, cascatas de transduo de sinais, comunicao clula-clula, e muitas
formas de interaes no apenas entre molculas genticas, mas com todas as
outras molculas da clula e o ambiente. A compreenso do sistema requer no
s ver as partes em ao, mas ainda mais importante, formular os fundamentos
pelos quais o sistema pode existir e funcionar.
Desta forma, a genmica levou naturalmente a outras cincias, tais como, a
transcriptmica (Stuart et al., 2003), a protemica (Zhou et al., 2002), a metabolmica
(Price et al., 2003). A genmica e todas as outras omissas constituem a chamada
biologia dos sistemas.
2. GENMICA
Genmica estudo dos genomas e das seqncias de nucleotdeos de DNA.
A disponibilidade de genomas completamente seqenciados acelerou o surgimento
da biologia de sistemas e verdadeiramente revolucionou a biologia. O HGP foi o
primeiro exemplo da Cincia de Descobrimento Global uma tentativa de, a
partir de um objeto biolgico complexo, o genoma, definir todos os seus elementos
(Lander et al., 2001, Venter et al., 2001). Os Bilogos possuam uma listagem da
parte gentica para o humano, nomeando uma enumerao de todos (ou a maioria)
de nossos genes (e, atravs da traduo, nossas protenas). Pela primeira vez, desde
o advento da biologia molecular, as questes biolgicas se dirigem ao estudo de
um conjunto completo de um sistema, em contraste com investigaes anteriores
de funes de genes individuais e seus produtos, um ou poucos de cada vez.
O Genoma de um organismo representa um sistema coordenado ideal para a
biologia de sistemas, um ncleo de informaes digital definvel precisamente
para um organismo (Davidson et al., 2002). Os genes so a listagem de partes
genticas nas quais todas as outras informaes biolgicas podem estar ligadas.
As transcries esto diretamente ligadas aos genes. As protenas esto ligadas s
transcries e, logo, aos genes. Toda informao hierrquica na natureza: DNA,
RNAm, protena, interaes entre protenas, caminhos da informao, redes de
informao, clulas, tecidos ou redes de clulas, um organismo, populaes e
ecossistemas completos. Deste modo, tentador construir um ndice de genes no
qual todos os genes dos organismos so listados, numerados e utilizados como
ncleo central para ligar a ele todo tipo de informao biolgica (Lander et al.,
1996). As seqncias genmicas fornecem acesso a seqncias regulatrias nos
genomas, que so componentes vitais para o descobrimento do cdigo regulatrio.
Estes componentes combinados compem os elementos na tabela peridica da
vida. Com esses componentes nas mos, o desafio imediato coloc-los no
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contexto de seus caminhos e redes de informaes. Alm disso, as seqncias


genmicas permitem o acesso aos estudos de polimorfismo e algumas destas
variaes so responsveis por diferenas na fisiologia e predisposio a doenas.
2.1. POLIMORFISMO GENMICO
A extenso lgica para estudar o genoma a determinao de diferenas
individuais entre o genoma das pessoas. Apenas um pequeno nmero de
polimorfismos comuns explica a maior parte da heterozigosidade. A diversidade
gentica humana se encontra no nvel de polimorfismos individuais, conhecidos
como Polimorfismos de Nucleotdeo Simples (PNSs), assim como nas combinaes
especficas dos alelos (hapltipos), como observado em locais com ligaes prximas
(Davison et al., 2002). O objetivo do projeto internacional HapMap, por exemplo,
desenvolver um mapa hapltipo do genoma humano, para descrever os padres
comuns da variao de seqncias de DNA do homem. O HapMap considerado
um recurso chave para pesquisadores no descobrimento de genes que afetem a sade,
a doena, as respostas para dietas e outros fatores ambientais (Jasny & Roberts, 2003).
O conhecimento sobre PNSs se mostra muito importante no tratamento de
doenas com remdios. Funes alteradas de protenas podem no levar o frmaco
para as clulas ou tecidos alvos, inutilizando as enzimas que ativam a droga
ocasionando sua remoo do corpo, ou, podem, ainda, alterar a estrutura do
receptor no qual a droga deve se ligar (Staddon et al., 2002). Variaes em genes
do sistema imune podem, da mesma forma, influenciar como os frmacos so
tolerados. Juntas, estas variaes genticas sutis significam que a dose em que um
remdio faria efeito pode variar enormemente de pessoa para pessoa. Exemplos
bem documentados de PNSs ativos so observados na famlia de protenas P450,
enzimas do fgado que oxidam substncias qumicas estranhas. Trs dos genes
P450 que so particularmente importantes para o metabolismo de drogas
comumente prescritas tm se mostrado altamente polimrficos e alguns j foram
ligados a falhas em certos pacientes (Higashi et al., 2002; Pirmohamed & Park, 2003).
O polimorfismo genmico ser capaz de ser investigado em muitos genomas
humanos completos disponveis, um feito que poder ser visualizado dentro de
mais alguns anos. Junto a isso, os avanos da nanotecnologia e de outros mtodos
iro permitir o seqenciamento rpido e barato dos genomas individuais, o que
ir levar ao avano da medicina preventiva. Alm disso, da mesma forma que os
cientistas so capazes de olhar 30.000 ou mais genes de cada paciente, os mdicos
podem usar tal seqncia genmica para prevenir quais problemas de sade um
paciente pode vir a enfrentar.
Nos dias de hoje, indivduos podem ter seus perfis genmicos avaliados com
uma eficincia crescente, e estes perfis podem ser utilizados para evidenciar genes
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polimrficos que influenciam ou respondem a medicamentos ou alimentos


especficos (Melton, 2003). Estes descobrimentos resultaram em disciplinas
completamente novas, como a Farmacogentica (Johnson, 2003), disciplina na
qual estudada a influncia da variao gentica nas respostas aos medicamentos,
e a Nutrigenmica, que procura fornecer um entendimento molecular de como
as substncias qumicas de dietas comuns afetam a sade alterando a expresso e/
ou estrutura dos elementos genticos individuais.
O sucesso destes mtodos ir depender muito de descobertas em grande
escala de PNSs, sua validao e a descoberta de genes relacionados dieta.
2.2. PERSPECTIVAS DOS ESTUDOS GENMICOS
Certamente, processos biolgicos devem ser considerados como uma rede
complexa de componentes interconectados. Alm disso, para estudar alguns de
seus componentes individualmente, o primeiro passo a determinao dos genomas
completos dos organismos. Porm o entendimento do genoma humano no est
completo com o estabelecimento da seqncia do genoma e com a determinao
dos polimorfismos. Mudanas hereditrias na funo dos genes podem ocorrer
sem uma mudana na seqncia de DNA (Dennis, 2003). Mecanismos epigenticos
tais como metilao de DNA, acetilao de histonas e interferncia de RNA, e
seus efeitos na ativao ou inativao gentica podem estar envolvidos no instinto
e cuidado parental nos quais a atividade do gene depende de quem ele foi herdado,
se do pai ou da me (Dennis, 2003). Existem evidncias sugerindo que fatores tais
como, estilo de vida e alimentao, deixam um trao de pegadas epigenticas no
nosso genoma, o que posteriormente herdado (Wolfe & Matzke, 1999). Em um
exemplo recente e impressionante, pesquisadores da Universidade de Duke nos
Estados Unidos, demonstraram em camundongos como doses extras de vitaminas
na alimentao da me, durante sua gravidez, muda a colorao dos filhotes
(Waterland & Jirtle, 2003). Este estudo o primeiro a descobrir um mecanismo
claro do efeito da nutrio maternal na doena e no fentipo. Os nutrientes
utilizados no estudo, B12, cido flico, colina e betana, silenciaram o gene que
deixa o camundongo gordo e amarelo, mas no alteraram sua seqncia. O gene
foi, de fato, metilado e ento, desativado, ligando a alimentao pr-natal a doenas
como diabetes, obesidade e cncer. Dessa maneira, o conhecimento sobre os
elementos genmicos dos indivduos ser crucial na pesquisa de doenas.
3. TRANSCRIPTMICA
O genoma descreve o maior potencial de um organismo, e o transcriptoma,
todos complementares s seqncias de DNA, descreve a utilizao/expresso
deste potencial. Transcriptmica a representao das expresses genticas
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utilizando DNA/RNA microensaios e descrio de expresses dos genes atravs


de microensaios de DNA/RNA.
Anlises simultneas da expresso gentica podem ser realizadas utilizando a
tecnologia que permite a sntese ou imobilizao de seqncias de DNA complementares, conhecidas em alinhamentos microscpicos e posterior RNA hbrido,
obtido de clulas neste alinhamento (Clark et al., 2003). Microarranjos exploram a
ligao preferencial de seqncias de cidos nuclicos, fita simples complementares.
Uma amostra desconhecida hibridizada ao arranjo de molculas de DNA
imobilizadas, cuja seqncia conhecida. Cada arranjo possui milhares de
diferentes seqncias de DNA arrumadas em uma matriz definida e, deste modo,
pode se identificar milhares de genes simultaneamente, significando que a anlise
gentica pode ser feita em uma escala monumental (Stears et al., 2003).
Outros usos de microarranjos incluem:

Estudos de hibridizao genmica comparativa;

Genotipagem individual para investigar diferenas genticas que possam


estar associadas a doenas;

Determinao de provveis funes para genes recm descobertos por


comparao com o padro de expresso de genes conhecidos;

Identificao de fatores chave nos caminhos de sinalizao;

Revelao de novas categorias de genes.

3.1. PERFIL DE TRANSCRIO


O perfil do transcriptoma pode mesurar a abundncia relativa de transcritos
simultaneamente para milhares de genes sob vrias condies experimentais
(Lockhart et al., 1996). Esta tecnologia revolucionou o modo que pesquisadores
analisam a expresso gentica em clulas e tecidos, pois permite aos pesquisadores
determinar quais genes esto sendo expressos, em um dado tipo de clula, em um
tempo particular e sob condies particulares (Velculescu et al., 1995). Pode ser
usado com diversos fins, entre eles, podemos destacar:

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Comparao do estado da expresso gentica em dois tipos diferentes de


amostras de clulas ou tecidos, por exemplo, tecido saudvel versus doente.

Exame de mudanas no perfil da expresso gentica em diferentes estgios


do ciclo celular ou durante o desenvolvimento embrionrio.

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reas de aplicao:

Novos alvos para drogas teraputicas, na diagnose de doenas, e


Toxicogenmica (o estudo de bases genticas de uma resposta individual
para atores ambientais tais como poluentes e drogas).

O perfil do transcriptoma atualmente aplicado em todas as principais reas da Biologia.

3.2. APLICAES DOS ESTUDOS DE TRANSCRIPTOMAS PARA SADE HUMANA


Os estudos de trancriptomas podem ser empregados com o objetivo de
desenvolvimento da segurana dos alimentos, medicamentos, vacinas, instrumentos
mdicos e outros produtos de interesse do consumidor (Howbrook et al., 2003).
Atravs dos arranjos de DNA, utilizados na identificao de bactrias e vrus
patognicos dos alimentos, reduzida a incidncia de intoxicao alimentar,
doena e morte associada contaminao bacteriana ou viral da carne, frutos do
mar, laticnios e outros alimentos (Soini & Musser, 2001).
Tambm no cenrio clnico, com a utilizao de tcnicas de microarranjos
possvel identificar microorganismos em pacientes com infeces bacterianas sistmicas,
admitidos em hospitais (Al Khaldi et al., 2002). A capacidade de identificar
indubitavelmente todas as bactrias comuns dentro de algumas horas de amostragem
permitir testes rpidos em cenrios de agricultura, manufatura e clnico.
Alm disso, pode ser possvel que os padres de expresso gentica sejam
utilizados para simplificar a descrio diagnstica do cncer utilizada amplamente
(Paweletz et al., 2001). Quando atualmente 7000 conceitos de doenas com 42000
nomes (e sinnimos) so utilizados por todo o mundo para descrever cnceres
diferentes e o nmero de perfis de expresso gentica vlidos para cncer cresce,
estes padres podem oferecer um meio til para aperfeioar esta lista e padronizar
a classificao do cncer em mbito nacional.
Outra possvel aplicao ser o teste de eficcia e segurana de frmacos,
tanto em testes clnicos quanto em tratamentos (Beaucage, 2001). Genotipagem
por alinhamento de DNA pode ser utilizada para estratificar pacientes que participam de testes clnicos, em populaes de com resposta e sem resposta, para
melhorar a eficincia dos resultados dos testes com medicamentos. Desta forma,
ser possvel confeccionar drogas para pores especficas da populao de acordo com claros marcadores identificveis na populao paciente.
Arranjos de DNA podem, tambm, ser usados para examinar os efeitos
fisiolgicos de uma alimentao especfica, permitindo a anlise de caminhos e a
identificao de reaes aos alimentos e seus componentes. Esta tecnologia poder
ser utilizada como uma ferramenta valiosa para identificar mecanismos pelos quais
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os nutrientes interagem com o corpo e como os indivduos respondem ingesto


de alimento em uma dieta especfica.
3.3. FALHAS NOS TRANSCRIPTOMAS
Microarranjos de DNA vm se tornando ferramentas analticas teis para a
identificao de doenas (Beaucage, 2001). Entretanto, existe uma grande
necessidade por outras tecnologias de identificao que vo alm de medies de
nveis de RNA, particularmente para investigaes relacionadas a doenas. Isto se
deve ao fato de que os microarranjos de DNA possuem utilidade limitada para a
anlise de fluidos biolgicos e para o descobrimento de marcadores diretamente
no fluido. Para alcanar este objetivo, existe uma necessidade de analisar nveis e
atividades proticas. Inmeras alteraes podem ocorrer em protenas que no
sofrem reflexos ao nvel do RNA, fornecendo uma lgica obrigatria para anlises
adicionais diretas da expresso gentica ao nvel protico. O desafio futuro
integrar os dados de RNA com os dados de protenas.
4. PROTEMICA
Protemica definida como uma abordagem cientfica usada para elucidar
todas as espcies proticas em uma clula ou tecido e muitos pesquisadores tm
utilizado a tecnologia protemica para desvendar mudanas de protenas entre
os estados; saudvel e doente. A protemica tambm se estabeleceu como uma
tecnologia indispensvel para interpretar a informao codificada nos genomas
(Ideker et al., 2001).
Tecnologias protemicas buscam determinar, em larga escala, funes genticas e celulares diretamente no nvel protico. A anlise sistemtica de um maior
nmero de protenas expressas em uma clula vem avanando rapidamente,
principalmente devido ao desenvolvimento de novos enfoques experimentais. Uma
nica clula bacteriana pode produzir 4000 protenas, com abundncias e atividades variveis durante um experimento, enquanto o nmero de protenas
expressadas em eucariotos superiores aproximadamente 10 vezes maior. Tentativas de catalogar, visualizar e analisar experimentos protemicos, por esta razo,
se tornaram um grande desafio.
Espectrometria de Massa (MS) vem, cada vez mais, se tornando o mtodo de
escolha para anlise de amostras complexas de protenas (Aebersold & Mann, 2003).
Protemica baseada em MS uma disciplina que se tornou possvel pela disponibilidade de bases de dados de seqncias genticas e genmicas, alm dos avanos
tcnicos e conceituais na tecnologia dos instrumentos. Anlise de protenas por MS,
at agora, tem se mostrado bem sucedida quando aplicada a pequenos conjuntos de
protenas isoladas em contextos funcionais especficos (Unlu et al., 1997). No entanto,
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no h um nico mtodo ou instrumento que seja capaz de identificar e quantificar


os componentes de uma amostra complexa de protenas. Dentre os mtodos existentes, podemos destacar a eletroforese bidimensional (2DE) seguida por MS e a
purificao limitada de protena com peptdeo automtico MS/MS. Enquanto
2DE claramente tem suas falhas, o uso de cromatografia lquida combinada com
experimentos seqenciais de MS (LC MS/MS) aparentemente parece extremamente promissor (Rabilloud, 2002). Entretanto, espectrmetros de massa so
inerentemente fracos como aparelhos quantitativos. Os dados coletados por este
mtodo, compreensivamente, necessitam de ferramentas mais sofisticadas para suas
anlises do que as atualmente existentes. O desafio atual para a avaliao de dados
baseados em MS o desenvolvimento de ferramentas para sua anlise de alto fluxo.
4.1. UTILIZAES DA PROTEMICA
A protemica um componente essencial da pesquisa em biologia de sistemas,
pois as protenas so responsveis por muitos processos celulares cruciais. Esta
tecnologia se tornou extremamente valiosa para a descrio de processos biolgicos
tais como: abundncia de protenas, mapas de ligao a outras protenas ou a
outros tipos de biomolculas incluindo DNA e lipdeos (Ideker et al., 2001).
Podem tambm, por exemplo, interpretar a expresso, as atividades, as modificaes
e os estados proticos, e sua localizao subcelular. Infelizmente, com a exceo
da interpretao quantitativa da expresso protica e interaes protenaprotena, nenhuma destas propriedades podem atualmente ser mensuradas
sistematicamente, quantitativamente e com alto fluxo. Rpidos avanos na tecnologia
sugerem que estas limitaes podem ser apenas momentneas (Conrads et al., 2003).
Os perfis da expresso de RNAm e da expresso protica parecem ser complementares e, por isso, contribuem com uma descrio mais refinada do sistema.
Combinando resultados genmicos e protemicos diferentes, obtidos do
mesmo sistema biolgico, ser possvel aumentar substancialmente o entendimento
sobre os processos biolgicos complexos. Mais especificamente, os estudos em
biologia de sistemas baseados em dados protemicos de alta qualidade j esto
definindo modelos biolgicos funcionais e revelam conexes antes desconhecidas
entre processos e modelos bioqumicos (Mann & Jensen, 2003). As novas hipteses
que so geradas por este enfoque podem ser testadas tanto por mtodos tradicionais quanto pela gerao direcionada de mais dados genmicos e protemicos.
Como resultado, uma interpretao individual da sade global baseada nas
identificaes de protenas ir se tornar factvel, revolucionando o campo de
diagnstico de doenas e monitoramento da sade (Liotta et al., 2003). Pode ser
possvel, no futuro, que uma pequena amostra de sangue revele uma imagem dos
estados fisiolgicos e patolgicos de todos os tecidos do corpo.
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H poucos anos atrs, cientistas reportaram um simples teste de sangue,


baseado em protemica, como uma tecnologia que com sucesso detecta o
cncer de ovrio mesmo em seus estgios mais prematuros (Petricoin et al., 2002).
Atualmente, laboratrios clnicos esto prontos para empregar o teste. O campo
emergente da protemica clnica ir fornecer mtodos para diagnsticos prematuros, abrindo caminho para a cura potencial de tais doenas e encontrando
biomarcadores das enfermidades.
Em concluso, o avanar da pesquisa protemica representa uma das mais
promissoras tecnologias para a investigao da sade humana.
5. METABOLMICA
Metabolmica pode ser definida como o estudo da influncia da expresso
gentica nos metablitos, ou ainda como estudo de todo o grupo de metablitos
em uma amostra de clula, tecido ou rgo. Nosso metabolismo a expresso de
um estado fixo - transitrio, na dinmica da biossntese celular. Protenas funcionam
como enzimas, receptores, transportadores, canais, hormnios e outras molculas
sinalizadoras ou fornecem elementos estruturais para as clulas, rgos ou esqueleto.
Metablitos, em contraste, servem em uma vasta gama de funes na clula. So,
usualmente, convertidos rapidamente, em reaes enzimticas e qumicas,
servindo como blocos construtores para macromolculas ou podem servir como
armazenamento transitrio de energia. Por isso, a identificao, quantificao e
as reaes dos metablitos so importantes no contexto da biologia de sistemas
(Nicholson & Wilson, 2003). Em muitos aspectos, os metablitos so o estgio
final da atividade celular biolgica, durante o processo que passa do gene para o
RNAm, da para a protena e ento para a funo e finalmente para o fentipo.
5.1. TCNICAS METABOLMICAS
Abordagens analticas que levam em considerao a complexidade qumica e
o alcance dinmico do metaboloma empregam usualmente a extrao de
metablitos da clula por diferentes tcnicas seguidas de anlises paralelas destas
subfraes (Watkins & German, 2002). Esta estratgia necessria para segregar
o metaboloma em subclasses mais mensurveis, com propriedades qumicas similares
que ajudam, tambm, a minimizar reaes qumicas secundrias entre eles. As
subclasses so submetidas a tcnicas analticas paralelas para gravar a informao
do perfil do metablito. A segregao das subclasses durante anlises paralelas
ajuda a visualizar uma grande poro do metaboloma (Kauffman et al., 2003). Na
maioria dos casos, os mtodos utilizam tcnicas de separao cromatogrficas
clssicas que podem compreender Espectroscopia Infravermelha de Transformao
Fourier (FTIR), Espectrometria de Massa de Eletrospray (ESI-MS) e Espectroscopia
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de Ressonncia Magntica Nuclear (NMR). O metaboloma pode ser avaliado de


forma promissora atravs da anlise metablica acoplada a mtodos estatsticos
de agrupamento e anlises de fentipo de maneira igual.
O estado de sade de um indivduo rapidamente refletido em seu estado
metablico. Assim, pode ser possvel para profissionais de sade e nutricionistas
realizarem recomendaes para um tratamento especfico ou alimentao para
determinada condio (German et al., 2002; 2003). Para alcanar este objetivo,
uma base de dados apropriada, contendo um grande nmero de medies de
concentraes precisas de metablitos de pessoas saudveis, necessria. Conseqentemente, o desenvolvimento de um Atlas metablico pblico pode
ser imprescindvel.
A quantificao especfica de metablitos tem sido utilizada para caracterizar
os processos metablicos em mltiplos estudos enfocados nos caminhos metablicos
(Takahashi et al., 2003). Os mtodos desenvolvidos vm sendo otimizados para
produzir dados de alta qualidade que descrevem os compostos de interesse. Hoje
em dia, estes dados constituem os estados metablicos dos indivduos. Entretanto,
este tipo de anlise pouco aconselhvel para captar simultaneamente informaes
sobre a vasta gama de metablitos que caracterizam os processos nutricionais de
um organismo.
Outra tcnica, denominada Identificao Metablica, foi formulada para
monitorar simultaneamente, centenas ou mesmo milhares de metablitos, utilizando
tecnologias de alto fluxo (Segre et al., 2003). Isso feito para permitir a procura
por mudanas relativas ao invs de concentraes absolutas dos compostos.
6. REUNINDO AS INFORMAES
A disponibilidade das seqncias genmicas, de protenas expressas e
metablitos identificados para vrios organismos, incluindo humanos, permitiram
a transio da biologia analtica clssica para a Biologia de Sistemas. Nesta nova
abordagem, os processos biolgicos de interesse, na grande maioria sistemas, so
estudados como redes complexas de macromolculas e reaes funcionais
interagindo. Este enfoque da genmica funcional pode ser de grande ajuda
para acelerar a identificao dos genes e seus produtos envolvidos em mdulos
particulares, e para descrever as relaes funcionais entre eles. Entretanto, dados
oriundos dos enfoques das micas individualmente devem ser vistos com cautela
por causa da ocorrncia de resultados erroneamente negativos ou positivos. Um
dos problemas que os bilogos encontram que o conjunto de dados muito
grande para ser totalmente compreendido.
Atualmente, o maior desafio alcanar uma descrio da biologia celular.
Teorias atuais so capazes de capturar e modelar somente uma pequena poro
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de dados de cada vez. Enfoques generalistas para integrar, visualizar e modelar


informaes sobre clulas, que iro ajudar o entendimento biolgico amplo, so
necessrios. Para aumentar a confiabilidade de uma constatao da funo de um
gene, precisam ser integrados mltiplos conjuntos de dados. Tais integraes
sero cruciais para a biologia de sistemas alcanar o objetivo proposto.
7. CONCLUSES E EXPECTATIVAS
O que a biologia de sistemas alcanou para a descrio completa da biologia
humana? Com todos os avanos, temos que aceitar que partir de um gene e
chegar ao ser humano no to direto quanto alguns esperavam. Apesar do
ponto de partida da genmica para a pesquisa em sade ser a identificao dos
mecanismos atravs dos quais os componentes interagem em um estado saudvel
e tambm quais genes esto associados determinada doena, a grande complexidade de nossa biologia est projetando este objetivo em um futuro relativamente
longnquo. Algumas evidncias sugerem que a composio gentica pode parcialmente
explicar porque pessoas de diferentes ancestrais experimentam doenas ou
nutrientes metablicos de forma diferente. Ainda, estas pistas genticas precisam se
tornar slidas o bastante para guiar a prtica mdica. Genmica e Protemica esto
apenas comeando a influenciar a prtica da medicina, mais notavelmente na diagnose
de doenas, desenvolvimento de drogas e recomendaes de alimentos nutritivos.

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Recebido em: 10/07/2008


Aprovado em: 12/12/2008

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