Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuria

Embrapa Cerrados
Ministrio da Agricultura, Pecuria e Abastecimento

Genomas
Ana Maria Costa Csar Martins

Embrapa Cerrados
Planaltina, DF
2010
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Equipe de reviso
Fernanda Vidigal Cabral de Miranda
Francisca Elijani do Nascimento
Jussara Flores de Oliveira Arbus
Normalizao bibliogrfica
Shirley da Luz Soares de Arajo
Capa, projeto grfico e diagramao
Fabiano Bastos

1a edio
1a impresso (2010): 500 exemplares

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Dados Internacionais de Catalogao na Publicao - CIP

Embrapa Cerrados

C 937e Costa, Ana Maria.

Estrutura e evoluo dos genomas / Ana Maria Costa, Cesar
Martins. Planaltina, DF : Embrapa Cerrados, 2010.

110 p. : il.. color.

ISBN 978-85-7075-055-6

1. Gentica. 2. Genoma. 3. Evoluo. I. Martins, C.. II. Ttulo.

572.86

Embrapa 2010
Apresentao
O retrato que se v hoje dos seres vivos o resultado das varia-
es genticas ocorridas ao longo dos milhes de anos. comum a
impresso de se estar diante do final evolutivo, em que toda diver-
sidade e variabilidade existentes j foram alcanadas. Contudo, o
tempo passa e as alteraes genticas continuam a acontecer tanto
para o homem quanto para todos os seres vivos. Acreditar que o
homem possa deter esse processo um erro.
O ambiente contribui na seleo dos indivduos mais aptos, mas
tambm um agente desencadeador de processos celulares que re-
sultam na alterao genmica.
Os mecanismos que geram variabilidade so to poderosos que
nem sempre fcil manter a uniformidade gentica nas situaes
onde ela desejvel, como nos casos dos cultivos de microorganis-
mos para fins de pesquisa ou industrial, alguns sistemas de produ-
o agrcola e conservao de recursos genticos. Em geral, essas
atividades exigem constantes esforos para selecionar e recuperar a
linhagem original.
O livro Estrutura e Evoluo de Genomas faz um apanhado geral
dos esforos para se conhecer o material gentico, apresenta concei-
tos bsicos de biologia molecular e sintetiza os conhecimentos gera-
dos nos projetos genomas quanto estrutura e organizao cromos-
smica das espcies. Finalizando, apresenta e discute os mecanismos
moleculares que promovem variabilidade e diversidade biolgica.
Os assuntos apresentados contribuem para o entendimento da
dinamicidade dos processos evolutivos importantes aos programas
de conservao e melhoramento gentico.

Jos Robson Bezerra Sereno

Chefe-Geral da Embrapa Cerrados
Sumrio
O Genoma e sua Histria 11

Uma Viso Geral dos Genomas: de Vrus a Humanos 19

Genoma viral 19
Vrus de DNA 21
Vrus de RNA fita simples positiva 22
Vrus de RNA fita simples negativa 22
Vrus de RNA fita dupla 24
Vrus de transcrio reversa 24
Genoma bacteriano 25
Estrutura do genoma bacteriano 26
Evoluo e dinmica do genoma bacteriano 27
Organizao dos genes bacterianos 30
 Genoma eucarionte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
Genoma das organelas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
Genoma dos cloroplastos e mitocndrias . . . . . . . . . . . . 37
Genoma mitocondrial de tripanossomatdeos . . . . . . . . . 39

Organizao Estrutural e Instabilidade do Material Gentico . . . 43

Elementos repetitivos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
Elementos repetitivos mveis longos . . . . . . . . . . . . . . 50
Elementos repetitivos mveis curtos . . . . . . . . . . . . . . . 54
Instabilidade de sequncias . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
Repeties do tipo satlites . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
Instabilidade de insertos clonados . . . . . . . . . . . . . . . . 59
Instabilidade e estruturas no-B . . . . . . . . . . . . . . . . . 62

Evoluo do Genoma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69

Mutao intragnica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71
Embaralhamento de xons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72
A transferncia horizontal de genes . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
Transferncia horizontal de genes e caractersticas estruturais
do genoma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
Transferncia horizontal de genes de sequncias de
minicrculos de kDNA de Trypanosoma cruzi para o genoma
da clula hospedeira . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78
Duplicao gnica: a maior fora da evoluo . . . . . . . . . . . . 80

Consideraes Finais . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .85

Referncias Bibliogrficas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 87
O Genoma e
sua Histria
Cesar Martins
Ana Maria Costa

A palavra genoma foi cunhada por Hans Winkler, em 1920,

como uma conjugao de gene e cromossomo. No entanto, o con-
ceito geral de genoma pode ser atribudo ao sculo IV, antes da Era
Crist, quando Aristteles apontou os primeiros conceitos em re-
lao hereditariedade. Embora os trabalhos de Mendel, no final
do sculo XIV, tenham propiciado grandes contribuies no campo
da hereditariedade, essa rea mostrava-se, ainda, bastante abstrata.
Com o avano dos mtodos cientficos e das tecnologias, a heredi-
tariedade passou a ser associada s estruturas presentes no ncleo
das clulas chamadas cromossomos (final do sculo XIX e incio do
sculo XX) e finalmente com os polmeros de nucleotdeos dupla-
fita chamados de DNA (meados do sculo XX), que formam os cro-
mossomos.
Anteriormente ao advento do sequenciamento de molculas de
DNA, os cromossomos forneceram as primeiras noes detalhadas

O genoma e sua histria 11