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Taxonoma

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Para clasificaciones no biolgicas, vase Clasificacin.

rbol filogentico, en este caso con forma de dendrogramanota 1 , como cada nodo del dendrograma se
corresponde con un clado, entonces es un cladograma. Cada clado agrupa a todos los descendientes
de una poblacin ancestral comn, es decir es un grupo monofiltico. Los nodos terminales (aqu
simbolizados por letras individuales) no pueden ir ms all de las especies, ya que por definicin, por
debajo de la categora especie las poblaciones no evolucionan como linajes independientes.

rbol filogentico (en este caso, las lneas representan la secuencia de organismos ancestros y
descendientes, es un filogramacita 1 ) que muestra un ejemplo de diversificacin de una especie ancestral
en tres especies presentes en la actualidad. Cada nodo del rbol (como el marcado con un crculo rojo)
representa la divergencia de un linaje ancestral en dos linajes que evolucionan independientemente,
esto es, que tienen el potencial de adquirir su propio set de cambios evolutivos. En barras rojas se
muestran las apomorfas: los nuevos estados del carcter. Un cladograma se puede interpretar como
una secuencia de ancestros y descendientes, lo cual es una hiptesis que se superpone al dendrograma
obtenido al determinar las apomorfas de los linajes ancestrales. No todos los investigadores estn de
acuerdo en interpretar un cladograma de esta forma, porque por ejemplo la historia filogentica del
grupo puede no haberse dado en forma de cladognesis.cita 2
Del rbol filogentico se puede derivar una clasificacin de los organismos. Los taxones terminales se
circunscriben y agrupan en taxones de rango sucesivamente ms alto. Los anidamientos deben tener
congruencia o "consistencia lgica" con el rbol filogentico, aunque la forma en que se tiene que dar
esta consistencia est en discusin.14 Ntese que la clasificacin tiene forma de dendrograma.

La Taxonoma (del griego , taxis, ordenamiento, y , nomos, norma o regla) es,


en su sentido ms general, la ciencia de la clasificacin. Habitualmente se emplea el trmino
para designar a la Taxonoma Biolgica, la "teora y prctica de clasificar organismos"15 16 cita
4
Como se la entiende en la actualidad, la clasificacin biolgica tiene que ser congruente con
el rbol filogentico siempre que se disponga de ste, en ella, los organismos son agrupados
en taxones mutuamente excluyentes a su vez agrupados en taxones de rango ms alto
tambin mutuamente excluyentes, de forma que cada organismo pertenece a uno y slo un
taxn en cada rango o "categora taxonmica". En cada taxn, los organismos poseen
caracteres (singular carcter) cuyos estados del carcter los diferencian de los organismos
fuera del taxn, y son los que en conjunto se utilizan para delimitar los taxones. La mayora cita
5
de los especialistas ve a las especies, a las que ubican en taxones en la categora
taxonmica del mismo nombre, como una realidad objetiva, y a los diferentes conceptos de
especie como diferentes aproximaciones para reconocer los linajes que evolucionan
independientemente, por lo que a pesar de las discrepancias entre autores en su concepto
taxonmico y por lo tanto en general en los lmites taxonmicos de cada una, suele ser
considerada la categora taxonmica ms importantecita 6 cita 7 en la clasificacin. Los taxones
supraespecficos son los que agrupan especies y se jerarquizan en categoras taxonmicas de
rango cada vez ms alto: gnero (grupo de especies), familia, etc. hasta el reino. En esta rea
tambin est debatido el concepto de taxn a utilizar. Muchos especialistas afirman que slo la
"filosofa taxonmica" para agrupar los organismos en taxones de la escuela cladista logra que
la clasificacin ofrezca el servicio que se espera de ella al resto de las ramas de la biologa,
pero la escuela evolucionista tiene razones para delimitar con otros conceptos los taxones, y
las dos se atribuyen la creacin de sistemas de clasificacin que cumplen en mayor medida
sus funciones de sistemas de almacenamiento y recuperacin de datos, y
de predictores del estado de los caracteres y las direcciones de la evolucin que no se han
medido.
La Taxonoma tambin se ocupa de debatir y actualizar los Cdigos de Nomenclatura, que
definen el sistema taxonmico a utilizar -el recin descripto es el "sistema linneano"-,
reglamentan la formacin y uso de los nombres de los taxones y cuidan que todos ellos se
atengan a los principios de nomenclatura, con el objetivo de proveer la mxima estabilidad
en la nomenclatura. Los Cdigos no evitan las "diferencias filosficas" entre taxnomos en
los conceptos taxonmicos a utilizar ni en la categora especie ni en las categoras
supraespecficas que son una fuente de inestabilidad frecuente en los nombres de los
taxones.
La Taxonoma Biolgica es aqu tratada como una subdisciplina de la Biologa Sistemtica,
que adems tiene como objetivo la reconstruccin de la filogenia, o historia evolutiva, de la
vida.cita 3 Como aqu comprendida la Taxonoma abarca la decisin de qu sistema taxonmico
utilizar, la de qu conceptos taxonmicos asociar a esos taxones, la delimitacin de esos
taxones dejando explcitos los mtodos que fueron utilizados para alcanzarla, su
Nomenclatura formal, y tambin las herramientas para la Determinacin o identificacin de
especmenes.cita 3 cita 6 Teniendo en cuenta que slo el 10% de las especies del planeta est
descripto, que esas descripciones son hiptesis con diferentes grados de resolucin, cita 8 y que
las especies evolucionan (cambian con el tiempo en trminos de sus caracteres) y cambia su
distribucin, la determinacin funciona recursivamente con la descripcin y delimitacin de
especies en el rea llamada alfa-Taxonoma o Taxonoma Descriptiva, o, deslindndola de
la definicin minimalista de Taxonoma que se maneja desde hace dcadas y debido a que se
intergradan en esa categora taxonmica, el rea de la Sistemtica Descriptiva22 o Ciencia
de la Biodiversidadcita 6 , la que se ocupa del descubrimiento, la identificacin, la descripcin,
la clasificacin y la catalogacin de la biodiversidad del planeta, utilizando el organismo como
unidad de trabajo y cuya prioridad es la descripcin23 de todas las especies dentro de un
contexto evolutivo.cita 6
La historia de la Taxonoma ha sido largamente recorrida por stos y otros interrogantes y a lo
largo de ella fueron formndose el sistema de clasificacin y las reglas que nos han quedado
como legado.
La nueva crisis de biodiversidad, los avances en el anlisis del ADN, y la posibilidad de
intercambiar informacin a travs de internet han revitalizado a esta ciencia en el ambiente
cientfico desde las dcadas de 1990-2000, y han generado un debate acerca de la necesidad
de hacer reformas sustanciales a los Cdigos, algunas de las cuales an se estn debatiendo
y otras ya se han incorporado. Algunas de estas propuestas son el BioCode, el PhyloCode, el
agregado de atributos al tipo nomenclatural como podran ser los nuevos "marcadores de
ADN" (ADN barcodes), y las relacionadas con la informatizacin de los datos y la utilizacin
formal de Internet.

ndice
[ocultar]

1Definicin de taxn

2La taxonoma segn las diferentes escuelas

3Las dos funciones de los sistemas de clasificacin

4Construyendo una clasificacin

5La clasificacin en la categora especie

6Nomenclatura biolgica

o 6.1Categora taxonmica

o 6.2Nombre cientfico

o 6.3Por qu cambian los nombres de los taxones?

7Determinacin o identificacin de especmenes


8Historia de la taxonoma

o 8.1De la taxonoma linneana al origen de los Cdigos

o 8.2Taxonoma y evolucin

o 8.3Formalizacin de las normas: los Cdigos

o 8.4Relacin con las taxonomas populares

9Perspectivas actuales de la ciencia de la Taxonoma

o 9.1El impedimento taxonmico

o 9.2El rol del ADN y los "marcadores de ADN"

o 9.3La crisis de biodiversidad

o 9.4Biodiversidad informtica

o 9.5La armonizacin de los Cdigos y el BioCode

o 9.6Propuestas de un registro central de nombres

o 9.7El PhyloCode

10Vase tambin

11Notas

12Citas

13Referencias citadas

14Bibliografa general utilizada como referencia

15Enlaces externos

Definicin de taxn[editar]
El taxn es un grupo de organismos con circunscripcin, posicin y rango. De la estructura de
la clasificacin biolgica como dada en la introduccin, comnmente llamada "taxonoma
linneana" o "sistema linneano" (pero vercita 9 ), se deriva la definicin de taxn, que como
explicitan los Cdigos de Nomenclatura,cita 11 es un grupo de organismos que posee:

circunscripcin: el conjunto de caracteres extrados de los organismos que lo


componen que, junto con la regla de decisin propuesta al observalos, diagnostican al
taxn, establecen sus lmites o lo delimitan, vuelven al taxn nico, diferencian sus
organismos claramente de los organismos fuera del taxn; la circunscipcin se define en
funcin de poder determinar si un organismo nuevo pertenece o no al taxn mediante la
observacin de sus caracteres segn el protocolo dado, y ella puede incluir idealmente o
no una lista de caracteres diagnsticos (presentes en ese taxn y slo en ese taxn), el
trmino aristotlicocita 10 "definicin" se sigue utilizando en el Cdigo de Zoologa para
referirse a la descripcin exhaustiva que debera hacerse de un taxn al nombrarlo, de la
que se extraera la circunscripcin;cita 11

Una jerarqua absolutanota 2 o rango llamada categora taxonmica,

y una posicin taxonmica formada por los taxones de rango ms alto que lo
contienen.
El taxn se redefine segn la taxonoma, el "sistema" taxonmico, del que se est derivando,
si bien la circunscripcin es necesaria para ubicar organismos nuevos en su respectivo taxn
y por lo tanto, fundamental en todas las clasificaciones. As, puede ser modificada su
definicin para adaptarse a taxonomas que no utilizan rangos absolutos, o por taxnomos
que definen los taxones de formas ms restringidas, pero las filosofas taxonmicas que han
formado tres escuelas de la sistemtica que dejaron un legado a la materia, se diferencian en
el concepto que debe utilizarse para aglomerar los organismos en taxones, es decir
su definicin conceptual, su delimitacin conceptual, el concepto que relaciona los organismos
del taxn ms entre s que con los dems organismos, los diferentes "conceptos de taxn" o
"conceptos taxonmicos".cita 12

La taxonoma segn las diferentes escuelas[editar]

Un cladocita 1 en una definicin ms rigurosa es el conjunto de organismos en las poblaciones actuales


(en naranja) que se hipotetiza que son todas las descendientes de una secuencia de ancestros y
descendientes con ancestro comn (en naranja y blanco). Pero se puede ser ms riguroso todava cita 2 .

Segn la escuela cladista, la que predomina hoy en da,cita 14 la taxonoma es la ciencia que
debe decidir qu clados del rbol filogentico sern "convertidos" o representados por taxones
y en qu categora taxonmica ubicarlos.cita 15
Si bien en los libros de texto el clado en general se define como "una secuencia de una
poblacin ancestral y todos sus descendientes", resulta ser una definicin poco rigurosa cita 1 : el
clado, como lo utilizan los taxnomos, agrupa slo poblaciones vivientes o al menos las que
se utilizaron para tomar los datos, las que en el mtodo original de Hennig el fundador 39 , o la
"voz ms articulada"37 del cladismo se asocian como descendientes de un mismo linaje
cuando se "encuentran" o determinan sus apomorfas: los cambios de carcter en el linaje
ancestral.cita 1 Otras formas de anlisis filogentico como los mtodos fenticos (cuyo punto de
partida es ciego en lo que respecta a la evolucin de los caracteres cita 16 cita 17 ) fueron
incorporados a la definicin de clado, de forma que pueden hipotetizar un "clado" (poblaciones
agrupadas por poseer caracteres compartidos desde el ancestro comn ms reciente)
mediante mtodos de anlisis no Hennigianos.cita 1 El lector interesado puede recurrir a las
siguientes lecturas, listadas en Judd et al. (200718 ): Farris (197952 ), Donoghue y Cantino
(198853 ), Nelson y Platnick (19815 ), Humphries y Parenti (198654 ), Brooks y McLennan
(199155 ), Forey et al. (199256 ), Cracraft y Donoghue (200457 ).
"Clado" proviene de cladognesis.cita 1 Los grupos descendientes de un linaje comn y nico se
llaman grupos monofilticos (mono: nico, phylum: linaje) sensu Hennig,cita 13 y los trminos
usualmente son utilizados como sinnimos (pero vercita 2 ). Los taxones que representan
grupos monofilticos se llaman "taxones monofilticos", y las apomorfas del clado que
representan, que pueden haberse encontrado, no alcanzan normalmente como
circunscripcin. Las apomorfas pueden haberse perdido en algunos miembros del grupo y
pueden ser compartidas por otros clados que las hubieran adquirido independientemente.
Slo despus de haber obtenido una circunscripcin y decidido una categora se puede
considerar al grupo un taxn y decidir si nombrarlo segn las reglas formales de
nomenclatura.

La taxonoma en la actualidad. La taxonoma (definida segn la escuela cladista) decide qu cladoscita 1 se correspondern con taxones
con su circunscripcin, posicin taxonmica, categora taxonmica, y nombre formal o cientfico.

Hay otras escuelas de clasificacin. Quizs la ms importante, dentro de las "minoritarias" cita
14
es la que considera que los grupos parafilticos tambin deberan ser representados por
taxones nombrados formalmente, si los grupos que los conforman son lo suficientemente
similares entre s y lo suficientemente dismiles del clado que queda afuera (escuela
evolucionistacita 18 ). Los autores listados en Judd et al. 200718 para el lector interesado:
Simpson 1961,15 Ashlock 1979,61 Cronquist 1987,63 Mayr y Ashlock 1991,16 Stuessy
1983,64 Stevens 198665 . Ejemplos de "taxones parafilticos" que se utilizan en las
"clasificaciones evolucionistas" son los procariotas (parafilticos con respecto a los eucariotas)
en el clsico sistema de clasificacin en reinos iniciado por Whittaker (196966 Margulis
197167 ) y que hoy se sigue utilizando (p.ej. Cavalier-Smith 1998cita 19), y las dicotiledneas,
parafilticas con respecto a las monocotiledneas (p.ej. Takhtajan 200968 ).

Comparacin de rboles filogenticos (filogramas) de grupo monofiltico, grupo parafiltico y grupo polifiltico.
Dibujado a partir de Cavalier-Smith (201039 ).

Otra escuela que fue encabezada por RR Sokal y PHA Sneath69 (Sokal y Sneath 196346 ,
Sneath y Sokal 197370 , comentarios de los autores originales en Sokal 19862 y Sneath
199569 ) recordaba que como no haba forma de testear si eran verdaderas las "hiptesis
previas" sobre evolucin, los razonamientos se hacan circulares: los "grupos preferidos"
determinan las "apomorfas preferidas" que a su vez determinan los "grupos preferidos". cita
20
En los '60 cada autor de una clasificacin propona un rbol completamente distinto cita 21 y
eran pocos los grupos que se mantenan entre autores. Sokal y Sneath no slo presentaban
novedosos mtodos de anlisis "numricos"nota 3 cuantitativos que sacaban provecho de las
en ese momento novedosas computadoras, sino que tambin eran mtodos "fenticos" nota 3 :
intentaban no asumir hiptesis de evolucin para armar el rbol, que deba buscarse siempre
que existiera la posibilidad.cita 16 cita 22 En las ltimas dcadas, en que "toda la sistemtica es en
alguna forma numrica"69 debido a la cantidad de caracteres que se obtienen a su vez de
cantidad de lneas de evidencia diferentes (a las tradicionales se sumaron los anlisis
moleculares de ADN, los caracteres bioqumicos y de ultraestructura), se pudo dar vida til a
los mtodos de esta escuela fentica que al mismo tiempo perdi visibilidad, porque a medida
que se agregan hiptesis evolutivas para aumentar la congruencia entre lneas de evidencia
diferentes, los taxnomos van llegando a un consenso acerca de cules sern las
"verdaderas" de ellas con las que estimar la filogenia, con las que inferir las relaciones
cladsticas.cita 22 Desde mediados de los '90 la sistemtica vivi momentos emocionantes: se
empezaba a vislumbrar un nico rbol predictivo y robusto, y efectivamente, muchos grupos
fueron abandonados por no estar basados en hiptesis evolutivas correctas, incluidos algunos
de larga data que causaron mucha sorpresa. Los autores de esta tradicionalmente llamada
"escuela"cita 18 enfatizaban que slo propusieron mtodos de anlisis numrico 4 , que fueron
slo una parte de importantes avances numricos en anlisis filogentico, sistemtica
molecular, anlisis morfomtrico e identificacin numrica.69
Hoy, las clasificaciones cladistas predominan por sobre las evolucionistas. cita 14 Las dos
escuelas admiten que se necesitan nombres tanto para los grupos parafilticos como para los
monofilticos que los abarcan, la discusin entre cladistas y evolucionistas radica en cul es el
sistema de nombres que debera formalizarse en una clasificacin. cita 23Los evolucionistas
formalizan nombres de grupos parafilticos, y mencionan con nombres informales los grupos
monofilticos no clasificados (por ejemplo Cavalier-Smith 1998 en adelante cita 19 formaliza los
reinos y nombra los supergrupos de eucariotas sin formalizarlos), mientras que los cladistas
formalizan slo grupos monofilticos, llamando con nombres informales a los grupos
parafilticos (por ejemplo Adl et al. 200589 formalizan los supergrupos de eucariotas y
proponen el nombre informal procariotas o bacterias para ese grupo parafiltico).
Las dos funciones de los sistemas de clasificacin [editar]
Ms all de los resultados de los anlisis filogenticos, todas las escuelas coinciden en que la
formalizacin de taxones en sistemas de clasificacin tiene dos funciones, en miras de ser un
servicio para todo un abanico de usuarios finales, que no siempre pueden hacerse coincidir:

Deben permitir hacer identificaciones,18 cita 24 o visto de otra manera, deben funcionar
como un sistema de almacenamiento y recuperacin de datos; para lo que cada taxn
debe estar claramente delimitado: un especmen encontrado del que se pudieran extraer
los estados de sus caracteres, debera poder ubicarse inequvocamente en un taxn
conocido. Los cientficos en todas las disciplinas deben utilizar los taxones como unidad
de trabajo, y publicar los resultados de sus trabajos en relacin con el taxn estudiado.
Por lo tanto los nombres cientficos de los organismos, los taxones formales, deben
representar el consenso de la comunidad cientfica, slo de esta forma funcionan como
llave de acceso a un cuerpo de informacin que refiere siempre al mismo grupo de
organismos, aunque est disperso en libros y revistas escritos en muchas lenguas por
diferentes autores, o proceda de diferentes campos de la biologa o la divulgacin: como
idealmente hacen referencia los taxnomos, "El nombre de un organismo es la llave hacia
su literatura"cita 25

Deben permitir hacer predicciones.18 cita 24 . Por ejemplo, cuando se encuentra un


compuesto de inters mdico en una planta, es comn que haya inters en investigar si
ese compuesto se encuentra tambin en otras especies relacionadas con ella; una
taxonoma bien armada debera permitirle al investigador presuponer a priori lmites de su
investigacin para los que sea ms probable confirmar sus hiptesis y ahorrar esfuerzos
de muestreo.18
La decisin de si armar la clasificacin para predecir o para identificar recorri toda la historia
de la taxonoma; las dos funciones coincidiran en una clasificacin que fuera al mismo tiempo
"natural" como "artificial",cita 26 con claves de identificacin que la reensamblen en grupos con
parecidos superficiales y por lo tanto muy poco predictivos, pero con las que se llega con
facilidad al taxn terminal.cita 24 La dificultad radica en que si se hace el ejercicio de buscar un
solo carcter que sea diagnstico de un taxn (si el organismo posee un estado del carcter,
pertenece al taxn, si posee otro estado, no pertenece al taxn, invariablemente, es decir una
clasificacin monottica), se notar que esta bsqueda puede fallar al menos potencialmente
en todos los grupos "naturales", debido a que todos los caracteres son inestables en algn
grado y pueden evolucionar, y esto puede suceder tambin si se toma un conjunto de
caracteres. La forma alternativa de circunscripcin es proponer los estados de forma
probabilstica, esto es, un organismo es miembro de un taxn si posee un nmero muy alto de
estados de caracteres similares a la descripcin del taxn, especialmente de los poco
lbiles.cita 27 El mismo algoritmo polittico dar siempre el mismo resultado, basado en las
probabilidades, pero a veces puede no ser el esperado. Aqu se encuentra la diferencia
fundamental entre las clasificaciones "naturales" y las "artificiales": en la clasificacin natural,
la determinacin es una probabilidad de estar acertado, dicho de otra manera un porcentaje
de veces se espera que la determinacin est equivocada. Esto es porque el grupo existe
independientemente de si el taxnomo lo circunscribi correctamente, e independientemente
de la clave de identificacin utilizada. En las clasificaciones artificiales, la determinacin,
aunque provenga de un pesaje probabilstico de los caracteres, siempre es la correcta,
aunque el grupo no resulte ser lo que el taxnomo tena en mente. El trabajo del taxnomo se
manifiesta en su habilidad para corregir los grupos artificiales creados por el hombre de forma
de acercarlos cada vez ms a los grupos naturales con cada agregado de informacin
nueva.nota 4
Si un grupo "natural" es un grupo "predictivo" y esto, en taxones superiores a especie, se logra
debido al nmero de caracteres medidos y no medidos compartidos por los miembros del
grupo, entonces la "naturalidad" de los grupos ser una cuestin de grado, y habr grupos
ms o menos similares, o ms o menos "naturales".cita 26 Su componente ms importante es el
histrico o filogentico,2 que adems ofrece impresas en sus similitudes fenticas las
restricciones construccionales que restringen las direcciones en la evolucin del grupo de una
forma que no puede ser explicada por factores ecolgicos.39 Tanto cladistas como
evolucionistas se adjudican las clasificaciones con mayor valor predictivo, o "ms naturales"
(p.ej. T Cavalier-Smithcita 28 , E Mayrcita 29 , NI Platnickcita 30 , Hrandl y Stuessycita 31 ).

Construyendo una clasificacin[editar]


Hoy en da los taxnomos, aun dentro de la escuela cladista (p. ej. Judd et al. 200718 :33),
tienen claro que no es de utilidad que cada clado o concepto de taxn por arriba de especie se
formalice, es decir se corresponda con un "taxn nombrado". Las decisiones a la hora de
sintetizar el rbol, inevitables, pueden parecer un poco arbitrarias por falta de mtodos
confiables para lograr los dos objetivos recin mencionados cita 32 , pero se pueden generalizar
algunos criterios (18 :32-35):

1. El criterio principal es la fuerza de la evidencia que respalda al grupo18 : para convertir


un grupo en taxn nombrado debe haber un anlisis filogentico que lo respalde de
forma robusta, sobre la base de ms de una lnea de evidencia de forma que todas
ellas muestren congruencianota 5 . Segn Judd et al.18 esto se evidencia en una
cantidad importante de apomorfas que definan su ancestro.

2. Debe haber una cantidad de caracteres diagnsticos que permitan diferenciarlo


claramente del resto de los taxones.18 Segn algunos sistemticos cada taxn debera
poder ser diagnosticado morfolgicamente en lo posible (p.ej. 18 ,101 ).

3. Deberan poder inferirse aspectos de su biologa nicos a ese taxn, para ello debera
tener caracteres morfolgicos interesantes ("obvios") que permitan que el taxn se
comporte como una unidad predictiva (Judd et al. 200718 :33).

4. Algunos autores18 afirman que los taxones deberan tener, en lo posible, entre tres y
siete subtaxones, un nmero que puede manejar con facilidad la memoria
humana.102 En las palabras de Davis y Heywood (196390 :83): "Debemos ser capaces
de ubicar a los taxones en taxones de categora ms alta de forma que podamos
encontrarlos de nuevo". Los sistemas de clasificacin permiten la creacin de
categoras intermedias hasta lograr el nmero de taxones deseados en cada una.

5. Por estabilidad de la nomenclatura, los taxones que ya han sido nombrados en el


pasado deben continuar con el mismo nombre en lo posible, a menos que haya
fuertes justificaciones para abandonarlos.
Hay dos criterios para decidir la categora taxonmica. Uno, el tradicional, es el que existe
desde los inicios de la clasificacin y es anterior a la teora de la evolucin; ste decide la
categora taxonmica segn el grado de variacin del plan corporal entre taxones.39 Desde la
incorporacin de la teora de la evolucin al pensamiento cientfico, se interpreta a la categora
taxonmica como la que deriva de un grupo de apomorfas que aportan cierto grado de
variacin en el plan corporal del taxn en relacin a los dems taxones en la misma
categora.39 Entonces los reinos y los filos (las categoras ms altas) derivan de
transformaciones evolutivas importantes que definieron de nuevo el plan corporal, a las que
sigui un batalln de novedades evolutivas forzadas a adaptarse al nuevo cambio, mientras
que las categoras ms bajas, como gneros y especies, poseen variaciones en caracteres
ms triviales, y por lo tanto ms inestables.39 Esta construccin de categoras, basada en
variacin de caracteres ms a menos estables, es la que lleg hasta nuestros das y prob ser
til para los usuarios finales de una clasificacin (ej. Cavalier-Smith 201039 ). Otro criterio de
clasificacin en categoras fue el iniciado por Hennig (1950, 35 196636 ), quien propona que la
edad geolgica absoluta de un grupo fuera el criterio para decidir su categora taxonmica, y
si bien hay cientficos trabajando para lograr esta meta en algunos grupos 103 segn otros
parece ser un concepto abandonadonota 6 . Las categoras resultaron ser tiles para los
objetivos de la clasificacin (ej.105 106,107 ), pero algunos autores las desestiman por
considerarlas arbitrariasnota 7 y hasta los hay que proponen eliminar el sistema de clasificacin
con categoras (por ejemplo en de Queiroz 2006nota 8 ). Por razones histricas se utilizan
las categoras linneanas de
clasificacin: reino, filo o divisin, clase, orden, familia, gnero y especie.

La clasificacin en la categora especie[editar]


Un "concepto de taxn" particular es el de especie. La mayora de los especialistas ve
las especies, a las que ubican en taxones en el rango o categora taxonmica del mismo
nombre, como un "taxn natural", una realidad objetivacita 5 , haciendo uso los diferentes
conceptos de especie de las diferentes aproximaciones o las diferentes propiedades
emergentes en el nivel de organizacin del linaje que evoluciona independientemente, esto es
que, al menos potencialmente, adquiere su propio set de cambios evolutivos. A diferencia de
la situacin en los rangos ms altos, el hecho de que este rango es objetivo y que existe al
menos entre o en forma de dos cotas superior e inferior es poco cuestionado en la prctica, le
es intuitivo al lego110 , y es el concepto que hace que cobren sentido objetivos de otras ramas
como "conservar todas las especies": un linaje que se pierde no puede ser regenerado sin
cambios evolutivos en linajes emparentados. Pero como no se sabe cmo van a evolucionar
los linajes y por lo tanto cules de las delimitaciones posibles constituyen una "unidad
evolutiva" en proceso de especiacin, o cul considerar la "unidad evolutiva especie" cuando
diferentes caracteres evolucionan de a grupos de tamaos diferentes, la delimitacin a veces
se vuelve enteramente una cuestin de consenso.

Las gaviotas del gnero Larus presentan alrededor del rtico un anillo de poblaciones cuyos extremos
no son interfrtiles. Los taxnomos reconocen entre 2 y 8 especies. En base a este grfico en el primer
concepto taxonmico de la taxonoma moderna Linneo hubiera nombrado 7 "tipos" en correspondencia
con los 7 nombres vulgares, y hubiera reconocido la existencia de hbridos entre ellos, dejando a
resolver el dilema de los lmites de cada especie.

Un linaje es una secuencia de organismos con cohesin espacial y continuidad temporal. Un


linaje, una especie, consta de una o un grupo de poblaciones, que tambin son difciles de
definir, si bien el concepto espacial, sus lmites geogrficos, siempre estn presentes.
Normalmente se definen como un grupo de individuos de una misma especie que ocupan una
regin geogrfica ms o menos bien definida y con los individuos interactuando entre
s.18 Estas "interacciones" no slo refieren al intercambio de genes que puede haberlo o no
segn su tipo de reproduccin sino tambin al hecho de que compiten por los mismos
recursos, comparten las mismas condiciones, son afectados por los mismos gremios de
predadores, patgenos y parsitos y de competidores interespecficos por algn recurso, y se
reproducen y dispersan por los mismos mecanismos, por lo que la poblacin sufre adems de
los avatares del azar una seleccin de genes mediante la supervivencia y reproduccin sexual
o asexual de aquellos individuos que los porten y cuya descendencia eventualmente ocupa
el nicho que ocupaban los dems. (El nicho en ecologa se define en funcin de la
supervivencia del linaje111 : las caractersticas ecolgicas del gnero o rangos superiores no
alcanzaran para explicar cmo sobreviven sus linajes; algunos taxnomos pueden utilizar una
definicin ms amplia de nicho para referirse a los espacios dimensionales que acotan el
nicho de las especies involucradas en taxones superiores, concepto que otros prefieren llamar
"zonas adaptativas".nota 9 ) Estas interacciones entre individuos son definidas tradicionalmente
como "cohesin",cita 33 un concepto que considera un nmero de factores para definir los linajes
ms que la posibilidad de hibridar pero no siempre los delimita en unidades discretas: la
cohesin es una cuestin de grado, las poblaciones se comunican entre s por "corredores"
que las mantienen ms o menos cohesivas y quizs a diferente grado en cada aspecto a
evolucionar, y cada concepto de especie utilizado puede dar resultados diferentes. Incluso si
se llega a un acuerdo en estos grados los linajes pueden constar de un continuum espacial
con extremos no relacionados entre s y que entre ellos pueden ser divididos en unidades de
forma arbitraria.136 Esto llevara incluso a clasificaciones incompatibles, cuando sus
delimitaciones se solapan.110 137 En la bsqueda de la categora se puede reconocer una cota
inferior (una poblacin que no sobrevive sin su metapoblacin, es decir que no es
independiente, no es una especie) y una superior (por ejemplo, la descripcin de un gnero no
debera alcanzar para explicar cmo sobrevive cada uno de sus linajes, cmo se mantiene su
"continuidad" en el tiempo). Esa bsqueda al menos hoy en da parece ser infructuosa en
algunos taxones, especialmente microbios de reproduccin asexual, cuya cohesin parece ser
un continuum, en el que todas las categoras parecen ser arbitrarias.136
De los conceptos de especie, que son "casi tantos como especialistas dispuestos a
discutirlos", dos tuvieron importantes implicancias en la estabilidad de la nomenclatura y en las
ramas de la ciencia que los utilizan.110 Uno es el "concepto de especie biolgica" o BSC
(biological species conceptcita 34 ), que delimita a la especie como el grupo de poblaciones que
puede hibridar entre s y dar descendencia frtil, que no subdivide las comunidades
reproductivas a menos que se mantengan aisladas en simpatra, y es el concepto ms
utilizado, o al menos el ms invocado, desde su articulacin por E Mayr en los 1940-1960
hasta los '1980-'1990; el otro que gan popularidad en las ltimas dcadas es el "concepto de
especie filogentica" o PSC (phylogenetic species conceptcita 35 ), que divide las comunidades
reproductivas en un grano ms fino segn si conservan caracteres en un anlisis de filogenia,
y en muchos taxones, incluso en algunos que parecan muy estables como Primates, se
superpuso su clasificacin a la del BSC.110
Una de las intenciones del BSC como formulado por E Mayr era en parte minimizar la
confusin causada por la multitud de razas o variedades geogrficas o ecotipos dentro de
las especies biolgicas mediante el no reconocimiento de esas variedades como especies
separadas salvo que se mantengan reproductivamente aisladas en simpatra.136 Esto es
porque la prctica habitual es que se describan las especies de una pequea regin dada, que
en esa regin estn bien aisladas reproductivamente, pero un intento de integrar la
informacin entre regiones ofrece una situacin en que es comn un continuum de tipos
intermediarios.136 Pero entre ellos puede haber diferentes grados en la capacidad de hibridar, y
quizs en un 10% de las especies biolgicas de animales y un porcentaje ms alto de plantas
y microbios se encuentren hbridos y no necesariamente con especies hermanas. 136 Habiendo
decidido el concepto de especie a utilizar, todava se suman a la incertidumbre las
inconsistencias histricas entre la delimitacin prctica -normalmente fentica- y la
delimitacin conceptual de las especies136 , y debido a que los diferentes aspectos de la
cohesividad se pueden dar a diferente grado se siguen encontrando diferencias entre
taxnomos a los que se ha denominado "divisores" (splitters) y "agrupadores" (lumpers)
(110 misma terminologa que en taxones superiores138:238-241). El requerimiento clave en estos
casos es que los cientficos sean explcitos acerca de qu concepto taxonmico y qu mtodo
para alcanzar su delimitacin estn siendo utilizados, de forma de poder superponerlas y
utilizarlas sincronizadamente cuando eventualmente se encuentran dos clasificaciones
describiendo la misma regin.110 136

Nomenclatura biolgica[editar]
Nomenclatura biolgica redirige aqu. Para otras acepciones, vase Nomenclatura
(desambiguacin).
El ltimo paso en una clasificacin consiste en buscar qu nombre cientfico le corresponde al
taxn o averiguar si se necesita publicar uno nuevo, y eso se hace segn las reglas escritas
en los Cdigos Internacionales de Nomenclatura. Por razones histricas hay un Cdigo para
cada disciplina: de Zoologa,30 de Botnica,28 y de Bacterias,29 nota 10y se actualizan
frecuentemente como resultado de los Congresos Internacionales que renen a los cientficos
para tal efecto. Por ejemplo, a julio del 2015 el ltimo Cdigo de Botnica es el de Melbourne
(revisin 2011, publicado en 201228 ), el ltimo de Zoologa es la cuarta edicin (revisin 1999,
publicado en el 200030 ), y el ltimo de Bacterias es la revisin de 1990 (publicado en 1992 29 ).
Las ediciones pueden no ser la ltima versin, ya que se han publicado posteriormente
enmiendas. Los Cdigos poseen algunas diferencias entre s, pero en su esencia funcionan
de forma similar.
Los Cdigos buscan que cada concepto taxonmico o cada conjunto de subtaxones que ya ha
sido nombrado contine con el mismo nombre en lo posible, si vuelve a ser nombrado en una
nueva publicacin, que el nuevo nombre no tenga validez para el resto de la comunidad y
pase a ser un sinnimo del primero.nota 11 . Con este objetivo de "estabilidad en la
nomenclatura"cita 36 los autores de los Cdigos enumeran sus principios,cita 37 de los que el
"principio de prioridad" consiste en que cada taxn con su circunscripcin, posicin y rango
debe poseer ese primer nombre como nico "nombre aceptado" ("nombre correcto" en
Botnica, "nombre vlido" en Zoologa) para la comunicacin.
El principio de prioridad es sencillo de expresar; lo que es dificultuoso es decidir cundo dos
autores se estn refiriendo al mismo taxn y cundo a uno diferente, o dicho con ms rigor, lo
dificultuoso decidir, cuando un nuevo autor cambia las hiptesis taxonmicas de forma de
recircunscribir los grupos o cambiarlos de posicin o rango, cul de los nuevos taxones
deber utilizar un nombre ya utilizado en el pasado. Los Cdigos decidieron que el nuevo
taxn que hereda el nombre es el que mantiene el mismo tipo dentro de l. De esta forma los
Cdigos definieron lo que en nomenclatura se llama el "taxn nominal"cita 38 : la asociacin
permanente entre un "nombre" y un "tipo", este ltimo establecido, en estos Cdigos, en una
categora taxonmica primaria dada. Esta asociacin perdura a travs de los cambios de
circunscripcin, necesaria para establecer y reutilizar el taxn nominal pero variable entre
autores; a travs de los cambios de posicin taxonmica, que en la categora especie puede
llevar alguna modificacin en el nombre; y a travs de los cambios de categora si se cambia a
una categora cercana que mantiene el tipo (del mismo "grupo de categoras", ver ms abajo),
que normalmente lleva tambin alguna modificacin en el nombre. cita 39

Cada especie correctamente descripta y nombrada posee un tipo (tcnicamente, es el nombre formal el
que posee un tipo). En plantas, por lo general son ejemplares de la especie que fueron recolectados y
secados (aplastndolos entre papeles de diario que se cambian todos los das hasta que dejan de
humedecerse), y luego almacenados cuidadosamente en un herbario accesible al pblico, como un
museo o un jardn botnico. Si almacenar un ejemplar como tipo es complicado, se puede reemplazar
por cuidadosas ilustraciones y fotos. En los ltimos aos es buena prctica 99conservar una muestra del
especmen de forma que se pueda extraer su ADN para los anlisis.

En especies de aves y mamferos los tipos suelen ser animales disecados, almacenados en
colecciones en general en museos. En zoologa se suelen conservar partes duras como huesos,
caparazones, valvas, y en frascos en formol los animales blandos.

El "tipo", lo que se fija permanentemente al nombre, es algo diferente si estamos hablando de


un nombre en la categora especie o inferior, o de un nombre de una categora superior a
especie. En la categora especie o inferior a especie (las categoras del grupo especie), "el
espcimen tipo nomenclatural" es un espcimen especfico de la especie idealmente completo
y en buenas condiciones, almacenado en una coleccin cuya manutencin y crecimiento son
dirigidos por un taxnomo especializado (un curador), que idealmente debera permitir al
pblico un acceso a los tipos aunque sea restringido. Cuando es posible, las colecciones se
encuentran en instituciones dedicadas a la ciencia como museos de historia
natural, herbarios, jardines botnicos. Cuando el tipo utilizado en la publicacin original (el
"holotipo") se ha perdido o vuelto irreconocible, no hay otro espcimen de la coleccin original
que pueda reemplazarlo (un "lectotipo"), y hay necesidad de un tipo para reutilizar un nombre,
el nombre no se pierde sino que se puede seleccionar de los especmenes depositados en
colecciones e identificados con el mismo nombre y localidad que el original, un "neotipo" cita 40 .
En los casos particulares de bacteriascita 41 , protozooscita 42 , algas y hongoscita 43 cuyas
colecciones constan de cepas vivas, el tipo no es un nico organismo muerto sino que es una
cepa cultivada viva, en general congelada, y disponible en al menos una cita 41 o doscita
43
colecciones diferentes segn el Cdigo.
Con respecto a los taxones superiores a especie, el nombre del gnero -y de las dems
categoras del grupo gnero- posee como "tipo" al taxn nominal de aquella especie contenida
en l que fue publicada primero; y el nombre de una familia -y de las dems categoras del
grupo familia- posee como "tipo" al taxn nominal del gnero contenido en ella que fue
publicado primero. Ntese que en estos casos el "taxn nombrado" es un grupo
de organismos cuyo tipo es un gnero o una especie contenidos en l, aunque, como est
nombrado segn las reglas formales de nomenclatura, el tipo contiene a su vez un especimen
tipo o un taxn que eventualmente lo anida. Con los cambios de circunscripcin, ese
especimen es el nico que se mantiene necesariamente dentro de los lmites de cada taxn
de cualquier categora.
Si dentro de la extensinnota 12 (la composicin de organismos) del taxn no hay ningn
ejemplar especificado como "tipo", el autor de la circunscripcin puede decidir
nombrarla formalmente, es decir, crear un taxn nominal que pasar al terreno de los
"nombres cientficos" por el resto de la historia de la taxonoma. El tipo ser un ejemplar
identificado dentro de la extensin del taxn, debidamente depositado en una coleccin, y el
nombre ser un nombre en latn o latinizado construido segn ciertas reglas explicitadas en
los Cdigos (algunas de las cuales se vern ms abajo). Todos los datos del nuevo taxn (el
nombre, la posicin, la categora taxonmica, la descripcin o la diagnosis escrita en forma de
caracteres expresados en palabras, los datos de la ubicacin del tipo) son "efectivamente
publicados" si lo son donde sean accesibles para otros cientficos y expertos locales, como
una revista cientfica, o un libro. No se consideran efectivamente publicados los nombres
publicados en medios efmeros de publicacin como un catlogo de semillas, un diario, o por
correo electrnico. Todos estos datos efectivamente publicados convierten al taxn nominal en
un nombre establecidocita 44 ("vlidamente publicado" en Botnica, "disponible" en Zoologa), y
es cuando decimos que un nombre tiene el estatus de "nombre cientfico" o de "nombre
formal".cita 45
Cuando se encuentra ms de un "tipo" dentro del taxn, los dems nombres pasan a ser
sinnimos taxonmicos del primero, el "nombre aceptado" ("nombre correcto" en Botnica,
"nombre vlido" en Zoologa) del taxn. Pero si al descubrirse este hecho un nombre ms
reciente ya est muy extendido, puede proponerse a la Comisin respectiva como excepcin
al principio de prioridad y en aras de la estabilidad, agregar el nombre a la lista de nomina
conservanda, nombres que se consideran el nombre aceptado por razones prcticas.
Los dos tipos de sinonimia se denominan:

(1) los sinnimos subjetivos en Zoologa, sinnimos


taxonmicos o heterotpicos en Botnica: los nombres que compiten por un mismo
taxn, y

(2) los sinnimos objetivos en Zoologa, sinnimos


nomenclaturales u homotpicos en Botnica, todos los taxones que "heredan" el
mismo nombre, con el mismo autor original y diferente autor de la descripcin.
Ntese que lingisticamente stos no son "sinnimos", los sinnimos
nomenclaturales son en realidad trminos ambiguos. En los casos de las
especies, que necesitan adems especificar la "posicin taxonmica" en el
nombre, ya que su nombre es el del gnero + un epteto, cuando una especie
"hereda" el taxn nominal en otra posicin taxonmica que la original (en otro
gnero), se crean dos nombres cientficos con diferente gnero y mismo epteto,
con el mismo autor original y diferente autor de la posicin taxonmica, aunque
tuvieran la misma circunscripcin; la ambigedad est en el epteto.cita 46
Los nombres tambin pueden ser establecidos pero ilegtimos. Esto es porque
las reglas enunciadas para establecerlos no han impedido su formacin, pero se descubre
que no cumplen con los principios, los que se intentan cumplir mediante las reglas y que
son enunciados en la primera parte de cada Cdigo. Por ejemplo los principios ms
importantes son que debe haber un solo nombre para cada taxn, y el principio de
prioridad. Las dos razones principales por las que un nombre puede ser ilegtimo son que
al momento de la publicacin no se ha evitado que (a) fuera redundante, es decir que el
autor establece un nombre cientfico para un taxn que en la composicin de organismos
posee un ejemplar que ya forma parte de un taxn nominal y es as de una forma
"evidente", y (b) que fuera homnimo -no sinnimo- de otro anterior, es decir que un
"nombre" que ya formaba parte de un taxn nominal fuera asociado a un "tipo" nuevo.
Mientras no haya un registro central de nombres incluido en las reglas estas situaciones
no son evitables mediante ellas, y a pesar de que se lo intenta no son todava fciles de
detectar, se publican decenas de miles de nombres nuevos por ao 149 y slo se ha logrado
establecer un registro central mandatario de nombres y publicaciones en bacterias, que
existe desde 1980.150 No se han terminado de informatizar los datos de la literatura
publicada en papel para indexarlos, y botnicos y zologos no consensan la creacin de
"ndices de nombres adoptados"150 ("no suprimidos") en los taxones que les tocan por
temor a que unos pocos especialistas dejen publicaciones fuera de la indexacin y
acaparen la nomenclatura de un grupo.137
Cuando la aplicacin estricta de un Cdigo resulta en confusin o ambigedad, como en
las propuestas de conservacin o las de supresin de nombres pobremente establecidos,
la situacin se presenta ante su Comisin respectiva, que tiene la responsabilidad de
tomar una decisin al respecto.cita 47 La composicin y funciones de cada Comisin estn
contempladas en su respectivo Cdigo, y tanto las propuestas como las decisiones
tomadas en relacin a ellas son publicadas en su respectiva revista especializada. Las
decisiones tomadas por la Comisin Internacional de Nomenclatura Zoolgica son
publicadas en su revista, The Bulletin of Zoological Nomenclature,151 las tomadas por los
Comits auspiciados por la Asociacin Internacional para la Taxonoma de Plantas (IAPT)
son publicadas en su revista, Taxon,152 y las tomadas por el Comit Internacional de
Sistemtica de Procariotas y Bacteriologa son publicadas en su revista, el International
Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM).153
Finalmente, la nomenclatura botnica, la nomenclatura zoolgica y la nomenclatura
bacteriolgica son independientes la una de la otra. Como consecuencia, el mismo
nombre puede ser utilizado para una planta, para un animal o para una bacteria, con
pocas restricciones,nota 13 y aunque no es lo aconsejable hoy en da animales y
plantas pueden estar compartiendo el 13% de sus nombres genricos 154 .
Categora taxonmica[editar]
Artculo principal: Categora taxonmica

Son siete las categoras primarias o principales:cita 48 Reino, Filo o Divisin, Clase,
Orden, Familia, Gnero, Especie. Histricamente, el Cdigo de Zoologa utiliz la
categora Filo (Phylum en ingls y en latn), y el Cdigo de Botnica, del que se
escindi el de Bacterias, la de Divisin (Division, en ingls, Divisio en latn), hoy en
da en una direccin hacia la armonizacin se los trata como sinnimos. cita 48
Una regla mnemotcnica para recordarlas es la siguiente:
El rey es un filsofo de mucha clase que ordena para su familia gneros de buena espec

Reino Filum Clase Orden Familia Gnero Especie

La reina es una diva de mucha clase que ordena para su familia gneros de bu

Reino Divisin Clase Orden Familia Gnero Especie

El establecimiento de un nombre en una categora primaria genera un "tipo" en lo que los


Cdigos llaman el "grupo de categoras" que abarca todas las categoras intermedias por
arriba y por debajo de la categora primaria, que poseern, justamente, el mismo "tipo".
Estos taxones sern establecidos cuando se los publique por primera vez, con su
respectiva circunscripcin.cita 48
Luego de establecer las categoras primarias pueden intercalarse algunas categoras
secundarias, pero stas pueden ser salteadas, y pueden no utilizarse para todos los
taxones primarios de una misma categora en una clasificacin, dos caractersticas que
las diferencian de las categoras primarias: tribu entre familia y gnero (perteneciente al
grupo familia), seccin entre gnero y especie (perteneciente al grupo gnero), o bien
recurrir a prefijos: superfamilia, subfamilia.cita 48 La categora de subtribu slo puede
establecerse despus de la de tribu, y la de subseccin despus de la seccin. Las
categoras secundarias propuestas por cada Cdigo se presentarn en la seccion
siguiente.
Nombre cientfico[editar]
Artculo principal: Nombre cientfico

En los Cdigos de Nomenclatura, cada especie queda designada por un binomio (una
expresin de dos palabras) en latn, donde la primera palabra, el "nombre de gnero", es
compartida por las especies del mismo gnero; y la segunda, el "adjetivo especfico" o
"epteto especfico", hace alusin a alguna caracterstica o propiedad distintiva de esa
especie en particular, como pueden ser el color (albus, blanco; cardinalis, rojo
cardenal; viridis, verde; luteus, amarillo; purpureus, prpura; etc.), el origen (africanus,
africano; americanus, americano; alpinus, alpino; arabicus, arbigo; ibericus, ibrico;
etc.), al hbitat (arenarius, que crece en la arena; campestris, de los campos; fluviatilis,
de los ros; etc.), un homenaje a una personalidad de la ciencia o de la poltica o atender
a cualquier otro criterio. No es necesario que el nombre est en latn, slo es necesario
que est latinizado. Los nombres de gnero siempre van con la primera letra en
maysculas, los eptetos especficos siempre van en minsculas, y los nombres de gnero
y de especie van siempre en itlicas (o subrayados, si se escribe a mano). nota 14 Al escribir
el nombre de especie, el epteto especfico nunca es utilizado solo, y es mandatario que
est precedido por el nombre del gnero, de forma que el nombre de la especie sea el
binomio completo. La abreviacin a la primera letra del nombre del gnero precediendo el
epteto especfico completo tambin es aceptable una vez que el nombre ya apareci en
su forma completa en la misma pgina o en un artculo pequeo. As por ejemplo, la
lombriz de tierra fue llamada Lumbricus terrestris por Linneo, y si el nombre ya apareci
antes en el artculo y no hay ambigedad, puede volver a referirse a ella como L.
terrestris. Con respecto a los taxones ubicados en la categora de gnero y superior, los
nombres son uninomiales (constan de una sola palabra) y siempre se escriben con la
primera letra en maysculas (aunque solamente en la categora de gnero van en
itlicasnota 15 ). Como los Cdigos de Nomenclatura prohben que dentro de cada Cdigo
haya dos taxones con el mismo nombre, no puede haber dos gneros con el mismo
nombre (ni dos taxones por arriba de gnero con el mismo nombre), pero como ocurre
que el epteto especfico de las especies slo se usa despus del nombre del gnero,
puede haber dos especies diferentes pertenecientes a gneros diferentes que compartan
el mismo epteto especfico. Una vez fijado, un nombre no es sustituido por otro sin un
motivo nomenclatural. Por ejemplo el roble de los alrededores de Madrid fue bautizado
como Quercus pyrenaica errneamente, puesto que no se encuentra en los Pirineos, pero
tal circunstancia no justifica un cambio de nombre.
La recomendacin es que los nombres sean fciles y descriptivos,cita 51 pero no hay reglas
que impidan a los investigadores utilizar su propia inventiva para crear los nombres
cientficos ms inslitos: el nombre de la araa Pachygnatha zappa, porque tiene una
mancha en el abdomen igual al bigote del artista Frank Zappa;
algunas moscas chupadoras de sangre del gnero Maruina: Maruina amada, M. amadora,
M. cholita, M. muchacha, M. querida, M. chamaca, M. chamaguita, M. chica, M. dama, M.
nina, M. tica y M. vidamia, todos adjetivos cariosos; el dinosaurio que fue
llamado Bambiraptor debido al Bambi de Disney; el molusco bivalvo Abra
cadabra (aunque despus se lo cambi de gnero); y quizs el caso ms sobresaliente, el
gnero de araas brasileas Losdolobus, llamado as porque los investigadores que lo
describieron, queriendo homenajear a dos argentinos que haban colaborado, les pidieron
a stos que inventasen un nombre para el nuevo gnero, que qued como Losdolobus por
"los dolobus", trmino del lunfardo argentino intraducible en una enciclopedia.157 . Los
Cdigos en una de sus recomendaciones hacen un llamado a la responsabilidad, "Los
autores deberan ejercitar un razonable cuidado y consideracin en la formacin de
nombres nuevos para asegurarse de que son elegidos con sus subsecuentes usuarios en
mente y que, mientras sea posible, sean apropiados, compactos, eufnicos, fciles de
memorizar y no causen ofensa".cita 51
En las categoras superiores a gnero los nombres cientficos son la raz del tipo (un
gnero del taxn, en los rangos ms bajos el ms antiguo) con un sufijo que denota la
categora en la que el taxn fue ubicado,cita 52 segn se indica en la siguiente tabla:

Plantas Algas Hongos Bacterias


Animales
Categora taxonmica (Rev.199029
(Rev.201128 ) (Rev.199930 )
)
-phytacita 53 o -phycotacita -mycotacita Hay
53
nombre o nombre 53 o nombre recomendacion
Divisin/Filo -
descriptivocit descriptivocit descriptivocit es en el
a 52 a 52 a 52
BioCode.cita 54
Grupo
Filo -
-phytinacita -mycotinacita Hay
53 phycotinacita 53
Subdivisin/Subfi o nombre 53 o nombre recomendacion
o nombre -
lo descriptivocit cit descriptivo
cit
es en el
a 52 descriptivo a 52
a 52 BioCode.cita 54

Grupo Clase -opsidacita -phyceaecita -mycetescita Hay Nombre


53
Clase o nombre 53 o nombre 53 o nombre recomendacion descriptivocita
descriptivocit descriptivocit descriptivocit es en el 55
a 52 a 52 a 52 cita 54
BioCode.
-idae (pero -
-phycidaecita Hay
no -iridae)cita 53 mycetidaecita Nombre
53 o nombre 53 recomendacion
Subclase o nombre cit o nombre descriptivocita
cit descriptivo cit es en el 55
descriptivo a 52 descriptivo
a 52 a 52 BioCode.cita 54

Hay
recomendacion
Orden -alescita 56 o nombre descriptivocita 52 -alescita 57
es en el
Grupo BioCode.cita 54
Orden Hay
cita 56 cita 52 recomendacion
Suborden -ineae o nombre descriptivo -ineaecita 57
es en el
BioCode.cita 54
Superfamilia - -oideacita 58 -
Familia -aceaecita 59 -idaecita 58 -aceaecita 57
Grupo
Subfamilia -oideaecita 60 -inaecita 58 -oideaecita 57
Familia
Tribu -eaecita 61 -inicita 58 -eaecita 57
Subtribu -inaecita 61 -inacita 58 -inaecita 57

El color rojo indica la categora primaria y el grupo de categoras generado por ella. El azul
indica las celdas para las que el principio de prioridad en la eleccin del gnero tipo es
mandatario en cada Cdigo. Las celdas dejadas en blanco indican que no est
formalizada esa categora en el Cdigo dado.
Un "nombre descriptivo" es por ejemplo Monocotyledoneae ("un cotiledn"), o un nombre
con una raz descriptiva en lugar de derivar de un gnero tipo como Coniferales (raz:
"Conifer-" sufijo: "ales").cita 52 Estos nombres no estn asociados a un gnero "tipo" en
Botnica, sino a la descripcin del nombre (p.ej. las monocotiledneas pueden
recircunscribirse de forma de dejar cualquiera de sus subtaxones fuera del grupo, pero
poseer "un cotiledn"), en cambio s estn asociados a un gnero tipo en Bacterias cita 52 .
Los Cdigos llaman a los nombres descriptivos sin gnero tipo typeless ("sin tipo"),
algunos autores definen como "tipo" al contenido del taxn que est asociado al nombre
en un taxn nominal, por lo que la descripcin en un nombre descriptivo sera tambin un
"tipo". Ntese que esta situacin difiere de la de taxones inferiores, en los que la
descripcin del nombre descriptivo nunca se agrega al "tipo". En taxones superiores al
grupo familia, o superiores al grupo orden en bacterias, no es mandatario que el gnero
seleccionado como "tipo" sea el primero de los nombrados en regla.
Un ejemplo de taxn es el orden Primates. En esta expresin, "orden" especifica la
categora taxonmica del grupo, ms abarcativa que la categora de familia y menos
abarcativa que la de clase. "Primates" es el nombre del taxn. El orden Primates est
incluido en la clase Mammalia (los mamferos), y a su vez incluye diversas familias como
la familia Cebidae (cbidos, las monas americanas) o la familia Hominidae (homnidos,
nuestra propia familia).
Por debajo de la categora especie se encuentran la subespecie, variedad y forma. Su
nombre se arma con el nombre de la especie seguido de subsp. o de var. o f.
respectivamente, seguido de un epteto subespecfico: Carpinus
caroliniana subsp. caroliniana, Lyonia ligustrina var. ligustrina, salvo en las subespecies de
animales que no llevan la partcula subsp: Canis lupus familiaris. Son nombres trinomiales.
Adems, en todos los taxones, la primera vez que se nombra un taxn en una publicacin
cientfica, el nombre cientfico puede verse seguido del apellido del autor de su
descripcin (normalmente llamado la "autoridad"), mejor an si se sigue del ao en que el
taxn fue descrito. El nombre del autor puede estar abreviado, por ejemplo a Linneo se lo
abrevia con una L.. Las veces posteriores que se nombra al taxn en la publicacin se
evita el autor y el ao de publicacin. A veces se encuentran variaciones en la forma en
que autor y ao son escritos (por ejemplo hay dos autores conectados por palabras en
latn como in o et o ex, o el autor est entre parntesis), y cada una de estas variaciones
tiene su significado en Nomenclatura. Por ejemplo, en el caso de los animales, si en la
actualidad una especie en particular est ubicada en un gnero diferente al que le fue
asignado por su autoridad original, el nombre del autor y el ao se ponen entre parntesis
indicando as que originalmente se la describi con otro nombre. As, el len en la
actualidad es Panthera leo (Linnaeus, 1758), y se pone autor y ao entre parntesis
porque Linneo lo describi originalmente como Felis leo. El autor y ao de publicacin no
son reglas sino recomendaciones de los Cdigos de Nomenclatura, pero son de uso
corriente en la literatura y recomendados por muchos autores. Cuando se hace referencia
a la circunscripcin de un concepto taxonmico utilizado en la actualidad que difiere de la
circunscripcin de la publicacin del taxn nominal, se puede encontrar el
conector sensu158 (p.ej. "Arenaria sensu McNeill (1962)"). El autor y ao del taxn nominal
original se mantienen tiles para evitar errores con nombres homnimos, y
esperablemente en el futuro ambos autores puedan reemplazarse por un Identificador
Global de Conceptos Taxonmicos (de nombres segn cada autor), que cuando se
resuelva gue a la cita del concepto utilizado con todas sus referencias y quizs un enlace
a la publicacin.33 159 158
Por qu cambian los nombres de los taxones?[editar]
La descripcin formal y la tipificacin de los taxones son procedimientos en los que es
frecuente observar errores e inconsistencias, y esto ocurra aun en mayor medida antes
de que los Cdigos Internacionales reglamentaran estos trabajos muy
pormenorizadamente. Los nombres de los taxones pueden cambiar cuando son
redescubiertas descripciones ms antiguas del mismo taxn, y se aplica el principio de
prioridad, o cuando se observa que la descripcin original en realidad refera a un taxn
diferente. No suelen darse estos casos en los grupos ya bien estudiados, y en los Cdigos
hay adems mecanismos para la supresin de nombres pobremente definidos en los
grupos ms complicados. Una vez asentada la taxonoma fundamental de un grupo, es
poco probable que los cambios de nombres se den por esta clase de motivos.
Los nombres cambian cuando el descubrimiento de nueva informacin obliga a modificar
las circunscripciones, pero tambin -y sin necesariamente nueva informacin que lo
justifique-, los nombres cambian por diferencias de criterio entre los especialistas.
Por ejemplo, es muy comn que a distintos grupos de organismos recin descubiertos se
les d nombres de especie (y de gnero incluso) nuevos y que aos despus un
taxnomo que los estudie llegue a la conclusin de que todos pueden hibridar entre s y
dar descendencia frtil, y unifique todos los taxones en una nica especie (en este caso
todos los nombres cambian al nombre de la primera especie descrita dentro del grupo),
dejando, en todo caso, los antiguos nombres de especies como subespecies. Con
posterioridad puede llegar otro taxnomo que considere que esos grupos de organismos
deberan dividirse en dos especies distintas, que en la naturaleza conviven sin hibridarse
(aunque pudieran), debido a que cada una de las especies que l propone forma una
unidad monofiltica en un anlisis de filogenia. Entonces a los que se encuadran en la
"nueva" especie, se les cambia el nombre de especie por el nombre de la especie ms
antigua descrita dentro de la "nueva" especie. Otro taxnomo podra argumentar ms
tarde que todos los grupos originalmente descritos son especies vlidas del mismo
gnero, debido a que cada uno de ellos puede ser identificado por su propio grupo de
caracteres morfolgicos, y que dentro de cada uno de ellos hay un patrn de ascendencia
y descendientes. En este caso, todos los nombres de especies cambiaran al primer
nombre dado a cada grupo cuando fue descrito, pero todos los nombres de gnero se
unificaran en uno solo, por lo que todos los gneros pasaran a nombrarse como el
gnero ms antiguo descrito dentro del grupo. Esta inestabilidad de los nombres se habra
producido casi nicamente por cambios de "filosofa taxonmica": lo que cada autor
considera que se corresponde con la categora especie. Estas diferencias conceptuales
entre taxnomos son extremadamente comunes hoy en da, lo cual lleva a una gran
inestabilidad potencial en los nombres de los taxones (Vane-Wright 2003 160 citado en Mallet y
Willmott 2003137 ).

Determinacin o identificacin de especmenes [editar]

Captura con red de los insectos que sobrevuelan el estrato herbceo de una comunidad dominada
por gramneas.

La disciplina de la Determinacin, o identificacin de especmenes, es el proceso de


observar los caracteres de un especmen hasta encontrar el taxn en el que se ubica
("determinarlo") o reconocer que es nuevo para la ciencia y necesita una descripcin
formal y un nombre. Como slo el 10 % de las especies del planeta est descripto, y esas
descripciones son hiptesis con diferentes grados de resolucincita 8 161 , la Determinacin
funciona recursivamente con la descripcin y delimitacin de especies en el rea
llamada alfa-Taxonoma o Taxonoma Descriptiva, o, modernamente y deslindando las
diferencias en las definiciones de Taxonoma -desde hace dcadas con una definicin
minimalista- y Sistemtica, y debido a que se intergradan en esa categora, el rea de la
"Sistemtica Descriptiva"22 o la "Ciencia de la Biodiversidad" (como en el US NSFcita 6 ).
Este rea se ocupa adems de la investigacin expedicionaria y exploratoria en ambientes
naturales para avanzar en el descubrimiento, la identificacin, la descripcin, la
clasificacin y la catalogacin de la biodiversidad del planeta, utilizando como unidad de
trabajo el organismo y cuya prioridad23 es la descripcin de las especies dentro de un
contexto evolutivo, aproximndose a ello desde la investigacin primaria sobre un grupo
taxonmico dado, un gremio ecolgico, o una regin geogrfica;cita 6 se ocupa de realizar
nuevas colectas (el "trabajo de campo") y depositarlas en colecciones, del trabajo de toma
de datos sobre las colecciones existentes, de la realizacin de clasificaciones
revisionarias, de desarrollar hiptesis taxonmicas (determinacin de homologas,
caracteres, apomorfas y plesiomorfas, especies, clados23 ), de testear las hiptesis
taxonmicas de especie, y la creacin y uso de las herramientas informticas necesarias
para todo ello y para publicar las nuevas claves de identificacin y las nuevas
descripciones, con las que en conjunto se llega a los taxones redefinidos, junto con el
desarrollo terico de las hiptesis en la literatura taxonmica primaria, cuyos productos
ms acabados22 son las llamadas floras, faunas y monografas taxonmicas.cita 6 En reas
donde la biodiversidad presenta una tarea desafiante, como en los trpicos debido al
nmero de especies y tambin al vasto nmero de especies que no ha sido an
publicado, o exhaustivamente fotografiado el rol del especialista, profesional o experto
local, en la determinacin es crtico. (18 :7)
Adems de la finalidad en s misma de generar una taxonoma slida y estable, hay varias
otras razones por las que se puede necesitar una determinacin, y todas si estn
correctamente documentadas y los ejemplares depositados en colecciones con acceso al
pblico general y a la comunidad cientfica, aportan datos a la alfa-Taxonoma. Los
taxnomos necesitan identificar los organismos sobre los que extraen nuevas lneas de
evidencia con las que ajustar los anlisis de filogenia en taxones de categoras ms altas,
y a pesar de que se elige para sus muestreos a los especmenes que se consideran bien
determinados tampoco ha faltado algn error en la filogenia por un error de arrastre de
determinacin163 . En Biogeografa se utilizan los datos de especmenes identificados por
localidad u "ocurrencias", lo que se llama "datos georreferenciados", en los anlisis 164 ,
cuyas conclusiones a su vez pueden debilitar o robustecer hiptesis taxonmicas. Muchos
trabajos de investigacin realizados por bilogos eclogos implican un conteo de alguna
unidad taxonmica de biodiversidad en cierta rea, como en las investigaciones
relacionadas con la conservacin,165 o en las relacionadas con las invasiones biolgicas y
su impacto en el ecosistema, o en los cambios en patrones de sucesin en relacin a
algn otro tipo de disturbio. Una correcta identificacin se necesita cuando se sospecha
que una enfermedad o muerte en humanos, animales o plantas es causada por un ser
vivo, como cuando se sospecha que el ganado est consumiendo una planta txica que le
produce enfermedad o muerte,166 167 o cuando un animal salvaje pica o muerde a un
humano, o un microbio patgeno lo infecta,168 la correcta identificacin en estos casos
abre la literatura que indica las formas de control y tratamiento conocidas, y estas
ocurrencias agregadas pueden analizarse en la bsqueda de correlaciones y patrones
predictivos. Los fabricantes de pesticidas y herbicidas169 y los servicios relacionados con la
salud pblica170 pueden requerir un monitoreo de insectos o plantas dainos en cada zona
con el objetivo de mantener regulada su abundancia y para probar efectividad de
tratamientos cuando se decide aplicarlos. En el campo de la biologa forense la
identificacin de especmenes puede esclarecer asuntos legales.171 172
Slo si las circunstancias lo permiten, porque pueden ser difciles de colectar o estar en
peligro de extincin, los especmenes a identificar pueden colectarse con cuidado de no
daar ninguno de sus caracteres. Los especmenes no tienen ningn valor si se pierde el
dato de la localidad de la que se extrajeron y el momento en que fueron encontrados, los
datos de especmen/localidad-momento se llaman ocurrencias,173 sean stos colectados,
fotografiados o slo ingresados como dato (lo que puede permitirse segn la confiabilidad
del colector). Al colectar el especmen o al fotografiarlo se realiza una ficha de
coleccin con datos de localidad, fecha y colector; y otros que se perdern al llegar al
lugar de identificacin como hbitat, si estaba asociado a alguna otra especie, su
abundancia en esa localidad, si era de noche o llova, el mtodo por el que fue colectado,
y cualquier informacin sobre el estado del espcimen que el colector piense que pueda
no ser evidente una vez llegue a su lugar de identificacin: fotografiar o anotar claramente
el color y textura de los rganos que podra cambiar debido a la preservacin, anotar la
fragancia, etctera (18 :553). Si se colecta ms de un espcimen de especies diferentes,
debe hacerse una ficha de coleccin para cada ejemplar. Luego de la identificacin debe
agregarse la misma a la ficha y tambin quin es el identificador, que no necesariamente
es la misma persona que hizo la coleccin, o cules fueron los mtodos utilizados para la
identificacin (claves o colecciones con las que se lo compar), para dejar lo ms explcita
que se pueda la circunscripcin utilizada para ese nombre aceptado. Despus de una
campaa se posee tpicamente para cada especmen, un id, una ficha de coleccin y un
set de fotos asociados a ese id, una ubicacin en la coleccin (una entrada o accession,
no todos los especmenes fueron colectados y poseen nmero de accession, y hay
entradas que albergan un lote de varios organismos similares colectados en el mismo
momento, por lo que corresponden con varios id de especmen), y esperablemente
tambin posee asociada una lista de los estados de los caracteres que posee, necesarios
para llegar a la identificacin y que fueron convenientemente dejados por escrito en
alguna planilla estandarizada. Cada id de especmen representa una fila en una coleccin
de "ocurrencias". Si se ingresan las fichas en un formato electrnico, debe preveerse que
cumpla con los estndares provistos por el Biodiversity Information
Standards (anteriormente TDWG) para facilitar su acceso (ver el estndar para
ocurrencias Darwin Core); un software para manejar datos de herbarios muy extendido
es BRAHMS.

Ejemplo de Argentina. Ocurrencias totales (todos los taxones, todas las pocas) publicadas
en GBIF. 979 datasets totalizando algo ms de un 1,8 milln de rcords (ocurrencias) al
09/2016.174
Ejemplo de Argentina. Ocurrencias totales (todos los taxones, todas las pocas) publicadas
en BOLD(repositorio de la lnea de evidencia ADN "barcode" COI). Casi 100 mil rcords
(ocurrencias) publicados, de los que algo ms del 5% est determinado hasta especie al
09/2016.175

Si se han realizado identificaciones para un trabajo que se est por publicar, es buena
prctica176 177 citar cul fue el taxnomo consultado o las publicaciones taxonmicas que
fueron utilizadas para identificar las especies, y agregar una seccin de Especmenes
examinados178 donde se cite la ubicacin de los especmenes que fueron depositados o
visitados en la coleccin que los preserva como referencia (los voucher179 ) de los datos
sobre los que se realiz la hiptesis publicada. La seccin "especmenes examinados"
debera incluir el nombre cientfico actual [o el aceptado sensu qu autor], el nmero de
identificacin del especmen individual dentro de la coleccin (el accesion), el nombre de
la coleccin o su acrnimo, la localidad donde fue colectado, y si se las obtuvieron,
los accessionde las secuencias de ADN publicadas por ejemplo en GenBank.178 Si fue
publicado el dataset de ocurrencias por ejemplo en GBIF, puede citarse la ubicacin del
mismo en el repositorio pblico en el que fue compartido o las ocurrencias dentro del
mismo utilizadas. Las colecciones de especmenes poseen una infraestructura especfica
para cada taxn, y cada autor puede tener una coleccin privada -incluso unicata (unicate
collection155 ), con un solo especmen o lote, quizs holotipo o isotipo- pero si es posible
se alojan180 en instituciones pblicas como museos de historia natural o jardines
botnicos, que son los sitios ms estables y las hacen perdurar por centurias, el taxnomo
especializado que dirige su manutencin y crecimiento el curador idealmente debera
permitir al pblico un acceso a los especmenes aunque sea restringido. Las colecciones
suelen tener catlogos electrnicos con la informacin de los especmenes que poseen,
que son cada vez ms fciles de acceder y, a pesar de que en sus inicios carecan de
estandarizacin en sus formatos, se prev que en el futuro muchas de esas bases de
datos puedan ser accedidas por un mismo portal, esperablemente mediante los
estndares TDWG. Uno de esos portales, creado en el 2001 por acuerdos internacionales
entre agencias gubernamentales despus de la Convention on Biological Diversity (CBD)
es GBIF, que aloja tanto datasets compartidos desde los catlogos de museos y herbarios
como datasets que se publican asociados a publicaciones cientficas. En las colecciones,
no es raro que los especmenes se reclasifiquen si estn lo suficientemente bien
documentados, se calcula que un porcentaje que puede llegar a ser de hasta un 20% o un
25% de los especmenes puede ser reclasificado durante el rechequeo (ver 176 ); algunos
de ellos podrn ser designados como el "tipo"180 de un nombre de especie nueva o de una
ya nombrada cuyo tipo original se ha perdido18 19 181 182 . Son cada vez ms comunes los
softwares que formatean la seccin de especmenes examinados a partir de la planilla de
datos, y tambin puede formatearse en forma de data paper un set de ocurrencias para
publicacin formal (p.ej. el GBIF IPT183 )

Caja entomolgica de dpteros, contiene una plancha de telgopor en la que se insertan


los alfileres entomolgicos en los que estn montados los dpteros y sus etiquetas.

El primer paso en una identificacin es una observacin a simple vista, que implica una
apreciacin inconsciente de muchos caracteres del espcimen al mismo tiempo, en la que
se asocia el espcimen a cierto taxn formal o informal (lo que se llama
apreciacin gestalt u holstica del espcimen184 ), los mtodos ms formales de
identificacin entran en juego cuando el interesado necesita que la identificacin contine
hasta taxones ms especficos, o cuando necesita confirmar una posible apreciacin ( 18 :6-
184
7; ). Los mtodos formales tienen en cuenta pocos caracteres, expresados adems de
forma "tipolgica"185 , resultando ser una simplificacin de la apreciacin gestalt del
taxnomo que los realiza; pero siempre que se dispone de ellos, es importante seguirlos.
Comparar directamente con las colecciones o las fotos puede inducir errores, ya que en
las fotos pueden no mostrarse o no ser evidentes para el lector no entrenado los
caracteres que diferencian el taxn de los dems.169
Los taxnomos concuerdan en que la mejor forma (19 :498) y la ms rpida (18 :6-7) de
identificar un espcimen con mtodos formales es consultar a un especialista, sea
profesional o experto local, al que le sean familiares la flora o la fauna de la regin y que
est bien entrenado y al tanto de las ltimas actualizaciones publicadas sobre el taxn. La
determinacin que l haga ser muchas veces ms exacta y actualizada que el nombre
que el usuario final pueda obtener con la literatura y los instrumentos a los que tenga
acceso (19 :498).
Los instrumentos para la identificacin de plantas y artrpodos, por ejemplo, son lupa de
mesa y elementos para manipular la muestra en la lupa (dos agujas de diseccin y una
pinza de punta fina), en el caso de las plantas un bistur para seccionar rganos o una
hoja de afeitar, puede ser til un calibre para hacer las mediciones, y quizs saber hacer
preparados para observar al microscopio (18 :557). Si adems se tiene acceso a las
fotografas del especmen vivo o recin colectado la tarea de identificacin se ve muy
facilitada. Raramente dos especies no pueden discernirse morfolgicamente y se debe
recurrir al envo de muestras para la extraccin y anlisis de ADN.

Herramientas para la identificacin de plantas y artrpodos


En la lupa se observan los caracteres con un aumento de hasta unos 40x (amplifica una imagen 40 veces su tamao).

Homemade dissecting needle and a flora.jpg


Aguja de diseccin para manipulacin en la lupa (la aguja, de coser, debe ser ms firme que en la foto), y unaflora detrs.

Pinza de punta fina para manipulacin en la lupa.

Bistur de hoja delgada para seccionar rganos de plantas, tambin puede ser una hoja de afeitar.

El microscopio ptico tiene un aumento de 40x a 400x. A diferencia de la lupa, la muestra debe presionarse entre dos vidrios
(portaobjetos y cubreobjetos) hasta formar una capa delgada, y a veces es necesario teirla.

Las lupas de mano o de bolsillo, que se pueden llevar al campo, tienen un aumento de unos 2x a 6x. Las de bolsillo consisten
de una lente con tapa rebatible similar a la de la foto.

Field guides and a camera.JPG


Guas de campo, tiles para conocer a priori algunos de los caracteres que convendra fotografiar durante la colecta.

Calibre.(18 :557)

Las herramientas literarias para la comparacin formal de esos datos son las claves de
identificacin, que hacen uso de los estados de los caracteres del espcimen para
descartar posibilidades hasta llegar al nombre del taxn 184 ; de ellas el mtodo ms
difundido todava es la -arcaica- clave dicotmica (18 :557).
En la clave dicotmica se elige siempre uno de dos caminos, dos descripciones
mutuamente excluyentes de los estados de algunos caracteres. La eleccin enva al
usuario al siguiente par de descripciones, hasta que, si el usuario no cometi un error, se
llega al nombre del taxn (18 :558,19 :496-497). La tarea se ve muy facilitada si la clave tiene
fotografas del aspecto de los estados de los caracteres.
Clave dicotmica de plantas que parte de la familia de las ninfceas (una familia de nenfares), y llega hasta el
gnero (tomada de la Wikipedia):

Flores hipginas. pice del gineceo formando un disco plano a ligeramente cncavo con estigmas
radiales. Spalos 5-14. Polen anasulcado, espinoso.
Subfamilia Nupharoideae Mot. Ito, 1987.
Gnero nico: Nuphar Sm. in Sibth. & Sm., 1809. Holrtico.

Flores perginas a epginas. pice del gineceo en forma de copa, toda su superficie estigmtica.
Spalos 4-5. Polen de otro tipo.
Subfamilia Nymphaeoideae Arn., 1832.

Plantas con acleos. Hojas escutiformes, peltadas.

Borde del limbo levantado formando un reborde continuo. Envs foliar aculeado. Estaminodios y
apndices carpelares presentes.
Gnero Victoria Lindl., 1837. Amrica meridional tropical.

Borde del limbo no levantado. Haz y envs foliares aculeados. Estaminodios y apndices
carpelares ausentes o inconspicuos.
Gnero Euryale Salisb., 1805. Asia, de la India al Japn.
Plantas sin acleos. Hojas de diversas formas, peciolo inserto en una escotadura del borde del
limbo.

Spalos 4-5. Estambres pndulos, epiptalos sobre la cara interna del tubo de la corola. Semillas
espinosas, sin arilo.
Gnero Barclaya Wall., 1827. Sureste de Asia.

Spalos 4(-5). Estambres erectos, perginos sobre la cara externa del tubo de la corola.
Semillas lisas, papilosas o pelosas, con arilo.

Ptalos 0-5. Eje floral central prominente por encima de la copa estigmtica. Hojas sumergidas
lineares con bordes fuertemente ondulados.
Gnero Ondinea Hartog, 1970. Australia occidental.

Ptalos (6-)8-40(-50). Eje floral central visible como pequea proyeccin en la base de la copa
estigmtica. Hojas sumergidas (si existen) anchas, de bordes apenas ondulados.
Gnero Nymphaea L., 1753. Cosmopolita.

Ms moderna es la clave multi-acceso o policlave, en la que se puede utilizar


cualquier conjunto de caracteres en cualquier orden, de forma que el usuario
selecciona los caracteres utilizados para la identificacin. Estas claves
normalmente contienen mucha ms cantidad de caracteres que las claves
dicotmicas, y son muy ventajosas cuando se posee un espcimen incompleto o
cuando se tiene informacin incompleta sobre el espcimen. Se han escrito
programas de computadora de claves multi-acceso, en que de forma interactiva
se ingresan los caracteres y el programa devuelve los posibles taxones.
Programas de identificacin asistidos por computadora son por ejemplo el antiguo
sistema DELTA ("Descriptive Language for Taxonomy") (Askevold y O'Brien
1994,186 Dallwitz 1993,187 2000,188 Dallwitz et al. 2002,189 Pankhurst
1978,190 1991,191 Watson y Dallwitz 1991,192 1993193 citados en Judd et al. 200718 )
(hoy superado por el TDWG estndar SDD), en la web se pueden encontrar otros
como el sistema LucID (Norton 2012194 ), el sistema Xper2 (Ung et al. 2010195 ); y
es seguro que se volvern ms importantes en el futuro196 . Los programas sirven
tanto para utilizar claves ya existentes como para construirlas a partir de una
matriz de taxones caracteres, y estn adaptados a que se agreguen fotos,
videos y sonido. Hoy en da, la mayor desventaja de las claves multi-acceso es su
disponibilidad (18 :558,19 :496-497), aunque ya hay que identifican las plantas de
cualquier regin del mundo hasta familia (como en colby197 , discoverlife198 ),
hormigas (antweb199 ), saltamontes (Common Western Grasshoppers200 ),
mariposas y polillas (Butterflies and Moths201 ), y muchas todava estn siendo
creadas (Farr 2006202 ). Hay esfuerzos crecientes para computarizar las claves de
identificacin, incluidas las multi-acceso.203
Si bien las claves informticas son valiosas, la mayor parte de las claves de
identificacin todava se encuentra, junto con las respectivas descripciones e
ilustraciones de cada taxn, en enormes volmenes en papel publicados en series
llamadas floras y faunas, que renen la informacin sobre la presencia de las
plantas o animales pertenecientes a un rea particular, a una pequea regin, o a
todo un continente (18 :560). Las floras y faunas son esfuerzos conjuntos en los que
un taxnomo editor le da a cada taxnomo o pequeo grupo de ellos a describir
exhaustivamente el taxn para el que es especialista en la regin dada, en
general hasta la categora de especie, convenientemente revisado, chequeado
con las colecciones existentes y la bibliografa previa convenientemente
revisionada; en general estos proyectos tardan dcadas en completarse y pueden
quedar incompletos si los subsidios en general gubernamentales dejan de
renovarse. Un problema que deben enfrentar los usuarios de estas claves es su
antigedad, por la que muchas veces estn desactualizadas. Los nombres recin
descriptos para la ciencia pueden no encontrarse en ellas, como tambin pueden
no encontrarse especies exticas que se hayan instalado hace poco en la regin.
Otro problema es que dos floras o faunas que afecten la misma rea (como una
flora o fauna local y una regional) pueden diferir en sus conceptos de taxn o en
sus circunscripciones y por lo tanto dar resultados diferentes. Las claves
computarizadas poseen muchos de los mismos problemas que las claves en
papel, aunque es esperable que en el futuro ofrezcan mejores facilidades para ser
actualizadas y para la bsqueda rpida de sinnimos.203 Las actualizaciones se
encuentran en las monografas (monographs), un estudio extenso con claves,
descripciones y fotos de un taxn en particular, y en las revisiones
taxonmicas (taxonomic revisions), similares a las monografas pero menos
exhaustivas.18 Las dos ltimas se publican en revistas cientficas (18 :560).
Las guas de campo (field guides), que todava son ms fciles de acceder y
poseen muchas fotografas e ilustraciones de las especies de un taxn en una
regin particular, se han vuelto muy populares y son tiles como una primera
aproximacin a conocer la flora o la fauna de una regin dada, siempre que se
utilicen con cautela y teniendo en cuenta que slo describen las especies ms
vistosas y no siempre pueden hacer uso de las herramientas que diferencian un
grupo de especies similares.204 184 167
Al utilizar una clave, siempre hay que leer cuidadosamente las dos opciones,
tener en cuenta todos los caracteres mencionados, no estimar las mediciones
sino realizarlas, buscar en el glosario todos los trminos que no se conozcan, y
tener en cuenta que los seres vivos poseen cierta variabilidad, as que si existe la
posibilidad de ver un carcter varias veces (por ejemplo en varias hojas de una
planta) se ganar en precisin. (18 :558) Muchas veces no es evidente que una
descripcin se corresponde con el especmen, porque no necesariamente todos
los caracteres de una descripcin se correspondern con todos los caracteres del
especmen. Al utilizar una clave es muy probable que en algn momento se llegue
a un par de descripciones donde el camino a seguir sea confuso. Cuando es as,
hay que seguir los dos caminos, si alguno de los dos es muy incoherente (por
ejemplo si pide la observacin de varios caracteres que no existen en el
espcimen) se descarta. Si no se pueden descartar caminos, se llegar a ms de
un posible taxn (167 ,18 :558,19 :496-497). Aunque se obtenga un solo resultado, es
importante chequearlo. Una forma de hacerlo es leer la descripcin y ver las
ilustraciones del taxn o los taxones a los que se lleg, especialmente evaluando
la lista de sus caracteres diagnsticos, que es una lista de todos los estados de
caracteres del taxn que lo distinguen de los dems taxones. Si coinciden con los
caracteres del espcimen, entonces se ha realizado la identificacin ( 18 :558,19 :495).
Otras formas de hacerlo son la comparacin con alguna coleccin de
especmenes, con colecciones de fotos, o en especmenes dificultosos donde an
queden dudas, envirselo a un especialista mejor entrenado en ese taxn ( 19 :497).
Vase tambin: Seguir leyendo en Identificacin de especmenes

Historia de la taxonoma[editar]
Los orgenes de la taxonoma se remontan a los orgenes del lenguaje, cuando
las personas llamaban con los mismos nombres a organismos ms o menos
similares, sistema que persiste hoy en da en lo que llamamos los "nombres
vulgares" de los organismos. Todas las sociedades humanas poseen un sistema
taxonmico que nombra a las especies y las agrupa en categoras de orden
superior. El ser humano posee un concepto intuitivo de lo que constituye una
especie, producto de agrupar a los organismos segn las propiedades
emergentes observadas a ese nivel de organizacin, y esto se ve reflejado en que
todas las clasificaciones populares de los organismos poseen remarcables
similitudes entre ellas y tambin con las utilizadas hoy en da por los bilogos
profesionales205 .
La taxonoma biolgica como la disciplina cientfica que conocemos hoy en da
naci en Europa. All, a mediados de la Edad Media se haban formado las
primeras universidades, donde se discutan temas de ndole filosfica y tcnica.
Pronto los naturalistas se dieron cuenta de que, si bien los nombres vulgares son
tiles para el habla cotidiana, necesitaban un sistema ms universal y riguroso
para nombrar a los organismos: cada especie deba ser nombrada, cada especie
deba poseer un nico nombre, y cada especie deba ser descripta de forma
inambigua. Al finalizar la Edad Media, con la dominacin militar y cultural que una
Europa revitalizada sostendra sobre el resto del mundo, el sistema all
consensuado se extendera a todo el globo.
De la taxonoma linneana al origen de los Cdigos [editar]
Vase tambin: Taxonoma de Linneo

Portada de la obra de Linneo Species Plantarum (1753), su largo ttulo informa al


lector la estructura del contenido, en la que encontrar los gneros "naturales" y las
clases y rdenes "artificiales". Est escrito en latn, el idioma universal de la poca.

Ya en 1583, el italiano Andreas Caesalpinus haba delineado cules deban ser


las caractersticas de un sistema de clasificacin "natural": deba ser fcil de usar
y de memorizar, estable en el tiempo, conciso, y adems predictivo (ver Greene
1983206 ). Por lo tanto exista la conciencia de que un sistema de clasificacin no
slo deba reflejar la naturaleza, sino tambin servirle de utilidad a una comunidad
de usuarios.
Por un tiempo los naturalistas hicieron tibios intentos de ordenar la informacin
disponible sobre los organismos y reglamentar sus nombres. Pero sin duda
alguna fue en el siglo XVIII en que la taxonoma recibi un empujn definitivo,
gracias al naturalista sueco Carlos Linneo, quien tena la ambicin de nombrar a
todos los animales, plantas y minerales, agruparlos segn sus similitudes, y
normalizar su denominacin. Si bien ya haba publicado trabajos ms modestos
antes, fue en 1753 cuando public un gigantesco trabajo de dos volmenes en
que almacen y orden toda la informacin disponible sobre las plantas, y debido
a su xito, termin siendo el trabajo que defini el sistema de clasificacin que se
utiliza hoy en da. El libro se llamaba Species Plantarum ("Las especies de
plantas"), y estaba escrito en latn, que era el idioma universal de la poca. En el
libro Linneo agrup los "tipos de plantas" en una categora de orden superior
llamada gnero, en lo que l llamaba gneros "naturales", que agrupaban a las
especies por sus similitudes morfolgicas. Al describir una especie slo deba
describir los caracteres de la misma que la diferenciaban de las dems especies
del mismo gnero. Al enfatizar el uso de similitudes morfolgicas para agrupar a
los organismos, Linneo estaba clasificando a los organismos en virtud de sus
similitudes genticas, y por lo tanto tambin evolutivas. En su libro, cada especie
era descripta con una frase en latn limitada a 12 palabras, en donde la primera
siempre era el gnero al que perteneca la especie. A estas pequeas
descripciones, o polinomios, l las llam "el nombre apropiado de cada especie",
pero hizo un importante agregado que haba sido inventado en su momento
por Caspar Bauhin (1560-1624): la nomenclatura binominal o binomios, como el
"nombre corto" de las especies. En los mrgenes del libro, seguido del nombre
"apropiado" polinomial de cada especie, escribi una sola palabra. Esta palabra,
combinada con la primera palabra del polinomio (todava hoy llamada gnero),
formaba un nombre ms fcil de recordar y corto para cada especie. Por ejemplo,
la hierba de gato fue nombrada "apropiadamente" con el polinomio: Nepeta
floribus interrupte spicatus pedunculatis (en espaol, "Nepeta con flores en una
espiga interrumpida pedunculada"). Linneo escribi la palabra cataria en el
margen del nombre apropiado de la especie, que quiere decir "relacionada con los
gatos", haciendo referencia a un atributo familiar de la especie. Tanto l como sus
discpulos adoptaron el nombre Nepeta cataria para esa planta, y rpidamente
sus contemporneos empezaron a llamar a las especies del libro con su nombre
binomial.
El rango de gnero tampoco fue un invento de Linneo, de hecho, en 1694 Joseph
Pitton de Tournefort ya haba provisto guas para describir gneros de plantas:
los caracteres de los gneros deban ser reconocibles en todos los miembros del
gnero y ser visibles sin el uso de un microscopio. En lo posible, estos caracteres
deban ser tomados de la flor y el fruto, que eran menos lbiles que otros
caracteres como los relacionados con el hbito. Linneo crea que tanto los
gneros como las especies, y algunas familias (grupos de gneros) existan en la
naturaleza, eran "grupos naturales", mientras que las categoras ms altas slo
fueron utilizadas por l por conveniencia humana. Esta distincin entre categora
"real" y categora "artificial" no era menor, ya que el creer que los gneros fueran
reales (es decir, que existen independientemente de nuestro discernimiento), gua
al investigador de una forma diferente de la que lo hace una categora artificial. En
palabras de Linneo:

Los caracteres no hacen al gnero, el gnero nos da sus caracteres.

Carlos Linneo 1751:119207


Con estas palabras, Linneo reconoca que las especies se agrupaban de forma
diferente si se elegan caracteres diferentes, pero haba "algo ms" que la mera
similitud de caracteres que agrupara a las especies en un mismo gnero, y haba
que saber elegir los caracteres a considerar para que la agrupacin resultara
corresponderse con un "grupo natural". Esta afirmacin, fruto de la intuicin de
Linneo, no tendra base cientfica hasta que pudo publicarse la teora de la
evolucin208 .

Linneo fall en encontrar caracteres que fueran comunes a todos los miembros de una
familia, aun en las ms "naturales" de ellas, como las umbelferas.
En la foto: hojas de apio (Apium) con sus pequeas inflorescencias, hbito de la zanahoria (Daucus),

inflorescencias de hinojo (Foeniculum), inflorescencias del cardo corredor (Eryngium), raz de perejil

(Petroselinum).

La clave del "sistema sexual", clasificacin en categoras superiores a familia.

Linneo agrup a los gneros naturales en rdenes y clases artificiales, utilizados


cual clave de identificacin, tiles para que los gneros sean fciles de encontrar
en una lista o un herbario. Los caracteres que utiliz para ello fueron el nmero
de estambres y el nmero de estigmas de los carpelos, que eran estables dentro
de cada gnero y fciles de contar. Por ejemplo, en la clase Pentandria, orden
Pentandria Digyna, ubic a los gneros cuyas flores albergaban 5 "maridos" y 2
"esposas", entonces en ese orden quedaron agrupadas la umbelfera Daucus y el
olmo Ulmus; y a las criptgamas como no tienen flores las clasific como "plantas
de nupcias clandestinas".
Tambin trat de agrupar algunos gneros en familias "naturales", una categora
intermedia entre el gnero natural y el orden artificial (la idea de que existan
familias naturales tampoco era nueva y databa de Pierre Magnol en 1689209 ), si
bien fall en encontrar caracteres que pudieran funcionar ellos solos como
diagnsticos de las mismas, y para 1751 ya haba reconocido 67 familias (Linneo
1751207 ), dejando muchos gneros sin ubicacin. Linneo buscaba caracteres que
fueran encontrados en todos los miembros de cada familia, pero su bsqueda
fall an en las ms "naturales" de ellas, como Umbelliferae.
El xito del libro de Linneo se deba no slo a la claridad de sus descripciones y
clasificacin sino tambin a que se haba convertido en la revisin ms exhaustiva
de la literatura taxonmica hasta el momento, con una notacin cuidadosa de
sinnimos. De esta forma se lo consideraba un "pasaje en limpio" y nuevo punto
de partida de la literatura taxonmica, solventando as los problemas de
comunicacin producidos por la variedad de nombres y sistemas de clasificacin
locales. A partir de ese momento las actualizaciones de la clasificacin hechas por
el mismo Linneo o por autores posteriores, intentaron no abandonar la
nomenclatura binominal ni el sistema de clasificacin impuestos por Species
Plantarum.
En 1758 le llegara el turno a los animales cuando Linneo publica la dcima
edicin de su Systema Naturae, en el que por primera vez los clasific como
haba hecho en 1753 con las plantas, adoptando la nomenclatura binominal.
Linneo nombr unas 4.400 especies de animales, incluyendo Homo sapiens, lo
que demuestra que la poca ya no tena reticencias en clasificar al hombre con
los animalesnota 16 . Su concepto taxonmico de especie, sus "tipos", eran los que
hoy ubicaramos en especies, subespecies y razas o variedades o ecotipos segn
si el taxn presenta las ltimas o no, por lo que toda una comunidad reproductiva
(lo que posteriormente se llamara "la especie biolgica") era dividida por l en
especies del gnero con sus respectivos nombres binomiales.
Las excepciones fueron siendo agregadas al sistema de clasificacin, algunas
especies eran clasificadas en un orden diferente que el resto del gnero. Desde la
aparicin de los libros de Linneo a varios autores, como a Michel Adanson (1763-
1764209 ), se les hizo evidente que todos los caracteres podan variar y que no hay
caracteres "esenciales" para definir a un "grupo natural", que deban ser definidos
slo mediante un conjunto de caracteres tomados de todo el organismo, de los
cuales la mayora, pero no necesariamente todos, estaran en cada organismo de
la especie, en cada especie del gnero, en cada gnero de la familia. As se
abandonaba el concepto de taxn monotticocita 62 cita 27 al tiempo que se
empezaba a entrar en una era de taxonoma cuantitativa, o polittica, con
numerosos caracteres combinados en un diagnsticocita 63cita 26 cita 27 .
En 1778 Lamarck sugiri que los caracteres utilizados por los cientficos para
dividir los taxones no necesariamente tenan que ser los mismos que la gente
utilizara para identificar algn organismo encontrado. Lamarck promovi el uso
de claves de identificacin, clasificaciones artificiales unitticas en las que los
usuarios no expertos podan llegar al taxn natural de un organismo dado
mediante caracteres que estuvieran a su alcance y con reglas de decisin
explcitas. De esta forma se mitig el conflicto entre los creadores de los sistemas
de clasificacin, que a medida que aumentaban la informacin creaban
clasificaciones cada vez ms crpticas, y los usuarios de esos sistemas, que
estaban ms interesados en la utilidad del sistema que en la "naturalidad" de sus
grupos.
En 1789, Antoine-Laurent de Jussieu en su libro Genera plantarum212 describi
tanto gneros como familias de plantas y agrup a estas ltimas en clases. Por
primera vez apareca un tratamiento taxonmico que ubicara a todos los taxones
por arriba de gnero en un sistema natural, describa a todos los taxones de todas
las categoras claramente, y enumeraba los principios con los cuales se haba
armado su sistema (un "mtodo").213
El trmino "taxonoma" (del francs taxonomie) fue empleado por primera vez por
el bilogo suizo Augustin Pyrame de Candolle a comienzos del siglo XIX.214
Un cierto nmero de sistemticos, especialmente en Francia y Alemania, adopt
el concepto de "espcimen tipo". Estos "especmenes tipo" eran plantas
depositadas en un herbario que representaban la forma ms comn del taxn, o a
veces la forma que el autor consideraba la ms "perfecta", de la que el resto del
taxn seran plantas degradadas (hibridadas con otros tipos o mutantes), en la
poca era tendencia asumir que la forma tipolgica de cada especie de plantas
deba tener simetra radial y bisexualidad, por lo que se ha dado el caso de que se
depositaran mutantes como ejemplar tipo.
Durante varias dcadas despus de la edicin de los libros de Linneo proliferaron
los nombres para animales y plantas y muchas veces hubo ms de un nombre
para una especie dada. Cuando as era, el nombre de uso comn era
normalmente el ms descriptivo, o simplemente el utilizado por la autoridad ms
eminente del momento. A esto se sumaba que algunos nombres de gneros y
algunos eptetos especficos eran compuestos por ms de una palabra. Esta falta
de estabilidad nomenclatural hizo peligrar el logro de Linneo de una nica
clasificacin para la comunicacin. Eso llev a, en 1813, la adopcin de un cdigo
para nombrar a las plantas, llamado Thorie Elmentaire de la Botanique ("Teora
Elemental de la Botnica") donde se reglamentaba la eleccin del nombre vlido
para cada taxn. Por lo mismo y para los animales, en 1842, se adopt un cdigo
de reglas formuladas bajo el auspicio de la British Association for the
Advancement of Science ("Asociacin Britnica para el Avance de la Ciencia"),
llamado Strickland Code (el "Cdigo de Strickland", Strickland et al. 1842215 ).
De esta forma, desde Linneo hasta los Cdigos, nacieron las reglas de
nomenclatura zoolgica y botnica.
Taxonoma y evolucin[editar]

Charles Darwin evit escrupulosamente proponer rboles filogenticos para organismos


reales, para evitar el ridculo que le hubiera quitado mrito a su misin: demostrar la
evolucin como hecho, mostrando cmo la lucha por la existencia explica la adaptacin, y
tratando de explicar el cambio evolutivo (transformacin) por variacin gentica y la
multiplicacin diferencial de genotipos. Al enfatizar cmo la ascendencia comn ms la
divergencia de fenotipos explica los patrones de similitudes y diferencias que nos permiten
clasificar organismos en taxones sucesivamente anidados dentro de taxones superiores,
Darwin astutamente utiliz un rbol abstracto inmune al ridculo o al error filogentico. l
correctamente arguy que el plan corporal compartido por miembros de un filo estaba
presente en su ancestro comn ms reciente, y que fue heredado de forma estable
generacin tras generacin, sin cambios fundamentales por cientos de millones de aos.
Descendiendo en las categoras a travs de clases, rdenes, familias, gneros y especies,
cada grupo subordinado sucesivo difera de sus relativos ms cercanos en caracteres de
estabilidad decreciente. (39 :112)

Darwin en 1859 no fue el primer proponente, pero nunca antes la evolucin como
hecho haba tenido tal penetracin en el ambiente cientfico. Cuando irrumpi a
mediados del siglo XIX su teora de la evolucin pronto se admiti, tal como
formul el propio Darwin en El origen de las especies, que el grado de similitud
morfolgica entre las especies era explicado por la existencia de un rbol
filogentico que las conectaba por el parentesco de sus ramas ancestrales. El
debate entre los partidarios de los sistemas artificiales y los defensores de la
construccin de un sistema natural fue uno de los conflictos tericos ms intensos
de la biologa de los siglos XVIII y XIX, hasta que la teora de la evolucin ofreci
un criterio convincente de "naturalidad": la ascendencia comn. A principios del
siglo XIX, los creadores de las clasificaciones "naturales" haban aumentado
significativamente la cantidad de caracteres con los que delimitaban sus taxones,
y a partir de este momento se interpretara que no hay caracteres "esenciales" en
una clasificacin natural porque todos tienen el potencial de evolucionar dentro de
un grupo.
El sistema linneano de clasificacin est formado por grupos anidados, y un rbol
filogentico tambin puede dividirse de la misma manera, por lo que un sistema
de clasificacin linneano "natural" en principio sera, tal como afirmaba el propio
Darwin, congruente con la filogenia de las especies: las relaciones entre taxones
en las taxonomas naturales fueron reinterpretadas como el resultado de la
evolucin, y las categoras taxonmicas como indicadoras de la estabilidad
evolutiva de los caracteres que los definen. Aun sin haber descubierto la
estructura del ADN como portadora del cdigo gentico, que ocurrira recin en
los '1960 con Watson y Crick, se acumulaban las pruebas de la herencia de
los caracteres para las que los redescubiertos radios de Mendel fueron pioneros,
que derivaran en la "Nueva Sntesis" a principios del siglo XX. En pleno auge de
la Nueva Sntesis, Ernst Mayr defini el concepto de especie llamado, quizs algo
propagandsticamente, la especie biolgica -para otros autores ms neutralmente
la especie reproductiva- como el grupo de poblaciones capaz de hibridar entre s y
dar descendencia frtil, cuyo pool o acervo gentico se mantiene aislado de los de
otras en simpatra. E Mayr suele ser citado como un taxnomo que defini el
concepto de especie que ms fcilmente las delimitaba en vertebrados de tamao
grande -a los que pertenecan los taxones en los que trabajaba-. 18 George
Gaylord Simpson (196115), descontento con la atemporalidad del concepto de
especie biolgica de E Mayr, redefini a la especie como un linaje, una secuencia
de ancestros y descendientes con el potencial de fijar un cambio evolutivo en un
carcter (lo que Hennig36llamara una apomorfa), quizs el mismo modelo que
Linneo cautelosamente explic en su momento para las especies dentro de sus
gneros y familias "naturales". Si las especies se definen como poblaciones, o
como linajes, no siempre dos organismos de dos especies diferentes se
diferenciarn en trminos de sus caracteres -por ejemplo, dos poblaciones
todava muy similares en diferentes continentes, cuyo ndice de dispersin no les
permiti encontrarse por un tiempo prolongado, todava poseern al menos
potencialmente organismos que no puedan diferenciarse entre s
taxonmicamente ms que por la localidad de la que provienen. Hennig
(195035 en alemn, 196636 en ingls) se encontr con el mismo problema. Asumi
que los linajes, que para l tambin se correspondan con especies, se podan
diferenciar taxonmicamente en trminos de sus apomorfas adquiridas, por lo
que no habra conflicto entre la taxonoma y el rbol de linajes.
La incorporacin del concepto de evolucin a los taxones supraespecficos fue al
principio modelada de forma errtica. Por ejemplo, de las clasificaciones basadas
en filogenias, algunas de esas filogenias se componan slo de taxones que
todava contenan miembros vivientes, como los rboles de Charles Edwin
Bessey (1845-1915) y los de Arthur Cronquist (1919-1992). En estos rboles no
haba ancestros extintos (18 :43). En la clasificacin de Rolf Dahlgren, los ancestros
eran slo miembros extintos, el rbol filogentico era un rbol tridimensional, y los
miembros vivientes podan representarse por un corte de un plano de ese rbol,
en un diagrama llamado "Dahlgrenograma" con relaciones similares a las de los
pases en un mapa. Un paso crtico fue la adquisicin de los mtodos de
reconstruccin filogentica atribuidos a la escuela que hoy llamamos cladismo,
para la cual el bilogo Willi Hennig fue el que hizo el ms valioso aporte en la
dcada de 1960. Hennig model que las especies se conectaban entre ellas a
travs de especies ancestrales en su modelo original siempre extintas, y que
poda rastrearse la transformacin de especies ancestrales a especies derivadas
a travs de las apomorfas generadas durante una cladognesis: los cambios de
carcter en cada lnea luego de la divergencia de un linaje en dos. Estos rboles,
hoy llamados cladogramas, fueron propuestos por Hennig como material para
construir los taxones, que siempre deban ser, a su criterio, monofilticos. Estos
cladogramas tenan el no trivial supuesto de que la historia evolutiva de un grupo
siempre ocurre por procesos de cladognesis (divergencia en dos y adquisicin
de apomorfas). En la misma dcada la escuela fentica, para la que el libro
de RR Sokal y PHA Sneath (196346 ) fue fundacional, creaba mtodos numricos
de anlisis de datos intentando que fueran "ciegos", sin hiptesis de evolucin
previas (sin hiptesis previas de cules seran las apomorfas). Por la poca en
que Hennig se popularizaba y en respuesta al cladismo la escuela tradicional, que
incorpor los mtodos de construccin de dendrogramas Hennigianos y los
mtodos numricos en la bsqueda del rbol filogentico, pero difera en cul es
el dendrograma que debe trasladarse a una clasificacin, fue
llamada evolucionismo, la escuela evolucionista propone, como antiguamente,
que puede haber grupos parafilticos "naturales" que deben formar parte de una
clasificacin formal. El primero en utilizar el trmino "cladismo" en reemplazo del
confuso trmino Hennigiano "sistemtica filogentica" fue E Mayr (1965 38), pero
ya se utilizaba "clado" en un sentido ms amplio, como hiptesis de ser todos los
derivados de una secuencia de ancestros y descendientes con un ancestro
comn, es decir una hiptesis de grupo monofiltico. Esto es porque los mtodos
de la escuela fentica tambin pueden ser utilizados para buscar grupos
monofilticos. Hennig tambin redefini monofiltico, que hasta ese momento se
asuma incluyendo los grupos monofilticos y parafilticos sensu Hennig.39
Hacia fines de la dcada de 1970, cladistas como G Nelson5 , NI Platnick5 y C
Patterson6 evolucionaron el pensamiento cladista hacia un "cladismo de patrones"
o pattern-cladism o transformed cladistics, el cual separaba tericamente los
rboles filogenticos, es decir los rboles de secuencias de organismos ancestros
y descendientes, de los rboles de apomorfas, que pueden haberse
correspondido o no linaje por linaje con el rbol de organismos.cita 2
Como Hull (19793 ) ya ha hecho notar, los cladistas en realidad clasifican
caracteres en lugar de organismos, tienen que hacer la suposicin arbitraria de
que nuevas apomorfas se originan cada vez que una lnea [filtica] se ramifica
de su lnea hermana. Esto es poco probable en la mayora de los casos.
E Mayr (19814 )
Las clasificaciones cladistas no representan el orden de ramificacin de grupos
hermanos, sino el orden de emergencia de caracteres derivados nicos.
DL Hull (19793 ) citado en E Mayr (19814 ) nota 28.

Nosotros utilizamos el cladograma en el sentido de un sumario jerrquico de


los datos de caracteres, no contiene necesariamente supuestos sobre, ni hace
predicciones de, evolucin y especiacin.
Nelson y Platnick (19815 :14).

Los sistemticos siempre han sido, son, sern, y deberan ser tipologistas.
Nelson y Platnick (19815 :328)

Hoy en da la sistemtica en sus anlisis agrega una cantidad de caracteres en


varias lneas de evidencia diferentes, lneas que pueden considerarse bastante
independientes entre s: se desarrollaron mtodos de anlisis del ADN, mtodos
bioqumicos (isozimas, flavonoides...), se agregaron los caracteres de
ultraestructura y micromorfologa tomados con los microscopios electrnicos de
transmisin y de barrido, y se han hecho avances en paleontologa. Estas
matrices con una cantidad enorme de datos pueden analizarse con los mtodos
de anlisis filogentico para los que la escuela fentica fue pionera, y
aprovechando el uso de computadoras, que han producido en la dcada del 90 y
la del 2000 taxones nunca antes tan consensuados y muchos de ellos hasta
inesperados, lo cual ha obligado a modificar las clasificaciones al uso,
deshaciendo grupos de larga tradicin para definir otros nuevos. En la actualidad
los sistemas de clasificacin se publican en colaboracin de una larga lista de
autores: para las angiospermas el grupo que se ha llamado APG (1998, 2003,
2009216 ), para los taxones superiores Adl et al. (200589 ), etc. El debate que
todava perdura entre taxnomos es si deben aceptarse grupos parafilticos o no
en las clasificaciones.
Formalizacin de las normas: los Cdigos[editar]
El que originalmente fuera Thorie Elmentaire de la Botanique en 1813 fue
siendo reemplazado por sucesivos Cdigos, aunque a veces su uso no era
universal y se lleg a superponer, situacin que se termin en 1930 con el alto
consenso que tuvo el International Code of Botanical Nomenclature (Cdigo
Internacional de Nomenclatura Botnica o ICBN), que trata sobre la nomenclatura
de plantas y hongos. El que originalmente fuera el Strickland Code formado en
1842, que reglaba los nombres de los animales, fue revisado y renombrado
como International Code of Zoological Nomenclature (Cdigo Internacional de
Nomenclatura Zoolgica o ICZN) en 1901. El principio bsico de los dos Cdigos
era el principio de prioridad, que promovera su objetivo bsico: la estabilidad en
la nomenclatura. El de Botnica estableci el ao de la publicacin de Species
Plantarum, 1753, como el ao en que se inicia la nomenclatura botnica moderna,
dejando sin efecto los nombres publicados para las plantas antes de esa fecha.
De la misma forma, el Cdigo de Zoologa estableci el ao 1758, el ao en que
Linneo public la dcima edicin del Systema Naturae y el primero en que utiliz
su nomenclatura binominal para los animales, como el de inicio de la
nomenclatura zoolgica, dejando sin efecto los nombres publicados para animales
antes de esa fecha. Los dos Cdigos compartieron los mismos "principios de
Nomenclatura", y desde su aparicin se realizaron peridicamente Congresos
Internacionales para su revisin.
Los bacterilogos, que se haban atenido al Cdigo Botnico, con el tiempo
desarrollaron su propio Cdigo (Cdigo Internacional de Nomenclatura de
Bacterias, publicado en 1958). El Cdigo Internacional de Plantas Cultivadas a su
vez escindi los cultivares de las variedades botnicas en 1952, con su ltima
publicacin en 2009.217 Hace relativamente pocos aos se fueron revisando
versiones de lo que hoy se llama el Cdigo Internacional de Nomenclatura y
Clasificacin de Virus218 (nacido como "internacional" en 1998219 Actualmente se
debate sobre la urgencia de formalizar de manera equivalente la nomenclatura
de genes y protenas.
A lo largo del tiempo fueron constantes las propuestas de armonizar, unificar, o
reemplazar los Cdigos, pero ninguna lograra un alto consenso (Dall 1877, 220 ver
tambin Savory 1962221 ).
Relacin con las taxonomas populares[editar]
Sabemos muy poco acerca de la relacin entre los naturalistas profesionales y los
aficionados y el pblico en general, si bien estas relaciones forman parte del
trasfondo histrico que ayud a modelar la biologa sistemtica (Judd et al. 2007,
pero ver por ejemplo Allen 1976222 ).
Como la sistemtica tuvo su origen en Europa, los primeros grupos que se
formaron fueron aquellos que eran obvios en la flora europea. Adems, la
disciplina estuvo dominada por europeos durante centurias. Fuera de Europa,
especialmente en aquellos lugares que fueran colonias europeas, la dominacin
europea fue especialmente evidente en que las floras de los pases fueron
escritas por botnicos europeos y basadas en materiales guardados en
instituciones europeas (Judd et al. 2007:41). Fuera de Europa, los cientficos
muchas veces desvalorizaron los conocimientos que tenan sobre las especies los
nativos que posean un profundo conocimiento de la Naturaleza en el lugar del
que eran originarios. Por ejemplo, cuando los europeos descubrieron Amrica y
se relacionaron con sus pueblos originarios, desatendieron esa valiosa fuente de
conocimiento.

Los nombres nativos parecen perder toda importancia y repetidamente los expedicionarios los sealan
Quechua de los Incas se aproxima ms al lenguaje de los nios". Al parecer, los nativos no comprenda
civilizada como Dios, virginidad o inmaculada concepcin. Los indgenas americanos tenan innumera
traducir como rbol. Culturas cuya supervivencia dependa del conocimiento y uso de la vegetacin cir
eran sus usos, y les haban dado nombres descriptivos. Sin embargo, es obvio que no compartan con lo
Para conquistar plantas extraas, el europeo se deb[a] deshacer de contingencias locales y fabricar "tip
Pocas veces los conocimientos locales han sido utilizados tanto con criterios
antropolgicos como para la investigacin farmacutica. La adecuacin o no de
las taxonomas tradicionales al criterio cientfico ha sido objeto de algunas
investigaciones. nota 17

Perspectivas actuales de la ciencia de la


Taxonoma[editar]
En las dcadas de 1990 y 2000 se ha vuelto a poner de moda la ciencia
taxonmica en el ambiente cientfico,137 23 225 226 debido en parte al revolucionario
enfoque que posibilita la cantidad de datos derivados del anlisis de ADN a los
problemas taxonmicos,137 y en parte a la conciencia de su utilidad, dada la crisis
de biodiversidad que estamos viviendo. Nuevas tecnologas relacionadas con la
digitalizacin de los datos y la utilizacin de internet ofrecen un potencial sin
precedentes para la diseminacin de los productos de la investigacin, pero al
mismo tiempo que stas emergen se observan "vigorosos intentos" hacia el
encapsulamiento y el establecimiento de nuevas barreras para la
comunicacin.227 Las nuevas herramientas disponibles generan un debate acerca
de la utilidad de las reglas de la nomenclatura en su estado actual, y plantean la
necesidad de reformar los Cdigos, reformas que an se estn debatiendo y
algunas de ellas ya se han incorporado.150
El impedimento taxonmico[editar]
En el perodo de novedad tecnolgica de los anlisis moleculares de ADN de los '90 se
presupuest a la Biologa Sistemtica, pero la descripcin de la biodiversidad qued
relegada. (23 ,228 citado en22 )

Quizs sorpenda que la descripcin de las especies hoy se calcula realizada slo
en un 1% o hasta un 15%, porque las plantas y los animales grandes de regiones
bien pobladas como las regiones templadas estn relativamente bien descriptos,
pero fuera de ellas, como en los estratos arbreos ms altos de las selvas
tropicales o en el mundo microbiano con sus tiempos generacionales tan
pequeos que lo vuelven vasto y lo hacen evolucionar a una velocidad mucho
mayor que las plantas y animales de los que acostumbramos a vernos rodeados,
las descripciones tienen actualmente una resolucin muy baja. Como muchos
autores nos recuerdan, las descripciones de especies "nunca estn
completas",229 23 100 230 ya que los descubrimientos de nuevos caracteres y nuevas
poblaciones que trae cada nueva lnea de evidencia y cada nueva colecta obligan
a retestear las hiptesis y chequear cmo evolucionaron los linajes y cmo se
dispersaron desde la ltima colecta. Las dems ciencias de la vida (life sciences)
se ven limitadas cuando las hiptesis taxonmicas de las que hacen uso son poco
resueltas o confiables,176 23 231 232 , lo que vuelve los objetivos de esta ciencia hoy
en da muy alejados de la demanda233 , a lo que se refiere desde234 la Convention
on Biological Diversity de 1995 como "el impedimento taxonmico".229 233 Las
causas del impedimento fueron llamadas por los cientficos "la crisis
taxonmica"229 99 , o tambin "el impedimento a la taxonoma"233 , en referencia a
la relativa233 falta de recursos trasladados a alfa-taxonoma y a los impedimentos
sociales235 236 para su desarrollo, una ciencia que debe competir por los recursos
limitados en universidades y subsidios con las mismas ciencias que la tienen de
impedimento.176 230
Los taxnomos descriptivos tienen pocos gastos adems del salario, los que
necesitan para publicar, para realizar algn viaje y quizs algn equipamiento
adicional, de lo que lo ms oneroso es el "molecular lab" del que basta con uno
cada 10 laboratorios.22 A lo que los taxnomos se refieren por recursos en alfa-
taxonoma es presupuestar ms cantidad de taxnomos con subsidios, plazos y
evaluaciones curriculares ms realistas, y el mantenimiento a largo plazo de las
colecciones:237

(1) Las colecciones238 230 237 a las que hoy se suman las de archivos digitales
y las de cultivos vivos de bacterias, protozoos, algas y hongos 239 , que se
sugiere que se depositen en instituciones dedicadas como museos y jardines
botnicos. Algunos de ellos poseen colecciones ya centenarias que preservan
los ejemplares de la distribucin de las especies en otras pocas y son una
referencia de su evolucin,236 y son independientes de los arbitrios de un
investigador o "pequeo lab"cita 64 que quizs se deshaga de las colecciones
despus de la muerte del especialista, o quizs l mismo deba deshacerse
peridicamente de las colecciones que no utiliza para hacer lugar en el
espacio limitado que le es asignado en la universidad para depositar colectas
nuevas. Hoy se estima que se encuentran depositadas entre 1,2 y 2,1 240 o
3 mil millones241de unidades. Las colecciones dedicadas deben estar
preparadas para el crecimiento constante de sus colecciones 23 de lo que se
ocupan en parte sus curadores mediante los intercambios con otras
colecciones, quienes tambin hacen el valioso trabajo de re-identificacin de
especies para garantizar su actualidad y evitar propagaciones de
errores238 230 ; y

(2) El entrenamiento y salario de nuevos taxnomos quienes, en base a los


datos crudos tomados de sus colectas y otras previamente depositadas en
colecciones, publicar trabajos de literatura taxonmica primaria (slo
prepararlos, la finalidad del impresionante programa PEET234 , no funcion
porque luego no consiguieron trabajo237).
Como la mayor parte del trabajo cientfico, el trabajo del alfa-taxnomo es
conducido en proyectos relativamente pequeos, con un investigador principal
con un laboratorio asignado en la universidad y dedicacin part-time al proyecto, y
quizs dos o tres estudiantes de doctorado que ya se han ganado esa primer
beca utilizando el laboratorio de otro o investigadores part-time del staff.242 En
taxonoma descriptiva los proyectos son particularmente pequeos, normalmente
se hace referencia a un solo investigador, "el taxnomo especializado en tal
taxn", que trabaja en solitario en un taxn particular con su salario cobrado en la
universidad o el museo.230 La mayor parte de los subsidios (grants) otorgados por
agencias gubernamentales o internacionales dedicadas a la manutencin de la
ciencia son otorgados a la "pequea ciencia" (small science), con una duracin
promedio de 3 aos,242 los investigadores mantienen su estabilidad laboral
consiguiendo empleo en una universidad -o museos de historia natural, jardines
botnicos-, a los que dedican la otra parte de su tiempo de trabajo. 242 En ciencia,
pocos proyectos son ambiciosos e involucran docenas de cientficos,
normalmente enfocados en la toma de datos relativamente homogneos y en
cantidad gigantesca organizados alrededor de alguna instrumentacin cara y
dedicada,242 la llamada "big science" que aporta "big data", de la que los
ejemplos que suelen mencionarse son la astronoma y la fsica de las partculas
de alta energa.236 Las universidades perciben un porcentaje de los subsidios
adquiridos por sus investigadores y del prestigio que stos acarrean por lo que
tienen preferencia por ocupar investigadores que los obtengan. 235 Las agencias de
subsidios obligan a la alfa-taxonoma a competir con otros proyectos para ganar
los grants, pero sta termina relegada por razones en apariencia
emocionales23 22 -muchos usuarios y hasta cientficos ven a la alfa-taxonoma o
taxonoma descriptiva como una "ciencia polvorienta"243 244 , y no pareciera que los
desperdigados taxones de los que se ocupa su piso pudiera afectar el trabajo del
resto de la facultad230 .
Los investigadores que ya tienen su propio laboratorio son los que eligen de entre
los estudiantes de sus materias a los que pedirn un subsidio y un puesto de
trabajo y que potencialmente competirn con el mismo investigador que les est
dando una oportunidad, esto ha sido mencionado como impedimento ( 235 ,245 ,230 en rta.
a234 ), pero no hay diferencias en ese punto entre las dems ramas de la ciencia y
la alfa-taxonoma. (230 ,235 ,245 ) El mecanismo para evaluar el trabajo de un
cientfico tradicionalmente es su visibilidad,246 244 de esa forma se promociona la
calidad y se desalientan las conductas inadecuadas.246 247 Pero hace dcadas que
se lo evala en lo que se convirti uno de los puntos ms sobresalientes en su
currculum:230 248 la cantidad de publicaciones en revistas cientficas y el prestigio
de cada revista en la que se ha publicado medido en forma de "factor de
impacto", este ltimo calculado por el Institute of Scientific Information (ISI),
desde los '90 parte de Thomson Reutersnota 18 . El factor de impacto como
actualmente calculado es, en cada ao determinado, de las revistas indexadas en
la Web of Science (WoS) -ndice mantenido por Thomson Reuters-, la cantidad de
veces que se han citado durante el ao los artculos publicados en esa revista en
los 2 aos anteriores a ese, dividido el nmero total de artculos publicados por
esa revista en esos dos aos237 250 . Los cientficos intentan publicar en revistas de
alto impacto para alimentar su currculum, pero stas suelen rechazar los trabajos
de ndole taxonmica debido a que ocupan mucho espacio en la revista y
argumentan251 252 237 253 que su baja cantidad de citas en los 2 aos siguientes les
disminuir el factor de impacto. Las publicaciones taxonmicas son largas,
requieren muchas ilustraciones, y tpicamente tienen una audiencia muy
especializada que dura por muchos aos: la vida promedio de una monografa
taxonmica puede calcularse en dcadas o hasta centurias, en lugar de en meses
o en aos como el comn de las publicaciones.254 237 Al autor a su vez le toma
aos o incluso dcadas la realizacin de una monografa; 248 sus trabajos ms
acabados los publican al final de su vida.22 Parte fundamental aunque implcita de
la estructura de un trabajo cientfico, artculos muy diversos utilizan por muchos
aos la informacin o las claves recogidas de cada publicacin de alfa-taxonoma,
pero no hay costumbre de citarlos en las referencias (algunas revistas requieren
que al nombrar un taxn se cite el autor del nombre y la primera descripcin, pero
tampoco requieren que se los cite en las referencias). 253 237 244 248 La informacin
recogida impresiona como si no necesitara un autor que la respalde, no hay
inters de las editoriales que corren tras las mtricas de factor de impacto en
citarlos245 , ni una vez publicados se agrega la cita correspondiente ni los lapsos
temporales adecuados en los ndices de los que se hacen los anlisis de
rnkings, por lo que los autores de las descripciones y claves quedan fuera del
rango reconocido de publicaciones en lo emocional y en las mtricas de factor de
impacto248 . La necesidad de cumplir con un umbral de impacto, que no mide la
calidad ni la necesidad de la descripcin de un taxn, sino la "atencin" 255 235 que
se le presta al mismo, tambin aumenta la disparidad en las descripciones
taxonmicas: ha provocado la desercin en sub-campos de investigacin
pequeos o impopulares256 , por lo que los llamados "taxones
subrepresentados", pobremente descriptos, todava son ignorados237 256 ; en el
otro extremo se le est dando una importancia desmedida, debido a su
popularidad, a los estudios que testean las hiptesis taxonmicas exclusivamente
por mtodos moleculares y a las publicaciones sobre los muy publicitados
ADN barcodes, si bien sta es slo una de las herramientas utilizadas por los
taxnomos para testear los lmites de los taxones y para identificarlos 237 . El
nmero de citas se reduce a las que hacen los pocos taxnomos especializados
en el mismo taxn en los dos aos siguientes a las espordicas publicaciones, y a
su vez si estos colegas publican en las pocas revistas taxonmicas cubiertas por
el ndice de Thomson Reuters.254 Los trabajos publicados para el lego o no
intencionados para ser citados, como las guas de campo, no son valorados.22 Las
monografas, floras y faunas parecen un trabajo que se hace con un salario que
se pagar de todos modos, no se premian con subsidios los trabajos
terminados.22 El taxnomo no percibe la conveniencia de publicar todo el material
que tiene,234 256 22 257 y una fuente de conocimiento valiosa se pierde con el retiro
del especialista, volvindose atrs en las hiptesis taxonmicas sobre su
taxn.234 258 La alfa-taxonoma claramente necesita que se amolde a su medida el
modo de evaluar sus publicaciones cientficas, en esta "era del factor de
impacto" (HCJ Godfray107 , S Knapp107 , I Agnarsson237 , M Kuntner237 , YL
Werner256 , R Page259 , MC Ebach233 260 , AG Valdecasas261 262 233 260 , QD
Wheeler233 260 , LR Landrum22 , S Castoviejo261 , LF Marcus261 , MR de Carvalho260 ,
DM Williams260 , SS Nihei260 , MT Rodrigues260 , T Grant260, LF Silveira260 , H
Zaher260 , AC Gill260 , RC Schelly260 , JS Spaks260 , FA Bockmann260 , B Sret260 , H-
C Ho260 , L Grande260 , O Rieppel260 , A Dubois260 , A Ohler260 , J Faivovich260 , LCS
Assis260 , PZ Goldstein260 , EAB de Almeida260 , G Nelson260 , JL Payne248 , FA
Smith248 , M Kowalewski248 , RA Krause Jr248 , AG Boyer248 , CR McClain248244 , S
Finnegan248 , PM Novack-Gottshall248 , L Sheble248 , CHC Lyal, AL Weitzman204 , T
Borsch, P Hernndez-Ledesma, WG Berendsohn, H Flores-Olvera, H Ochoterena,
FO Zuloaga, S von Mering y N Kilian 2015 manuscrito aceptado263 , JV Crisci264 , F
Boero249 , H Wgele265 , A Klussmann-Kolb265 , M Kuhlmann265 , G Haszprunar265 ,
D Lindberg265 , A Koch265 y JW Wgele265 , KA Seifert266 , PW Crous266 , JC
Frisvad266 , P Pyek252 , PE Hulme252 , LA Meyerson252 , GF Smith252 , JS
Boatwright252 , NR Crouch252 , E Figueiredo252 , LC Foxcroft252 , V Jarok252 , DM
Richardson252 , J Suda252 , JRU Wilson252 , van der Velde267 , F-T Krell268 , J Ellis269 ,
HA Bentez270 , LA McDade271 , DR Maddison271 , R Guralnick271 ,HA Piwowar271 ,
ML Jameson271 , KM Helgen271 , PS Herendeen271 , A Hill271 , ML Vis271 , GH
Pyke272 , B Pll-Gergely273 , P Venu274 , M Sanjappa274 , a pesar de la respuesta del
creador del IF, E Garfield275 ). PA Lawrence nos recordaba en el 2008245 que la
forma ms segura de evaluar un trabajo cientfico es leyndolo, lo cual era la
forma habitual de hacerlo en el pasado. El problema de este enfoque es que slo
evala en retrospectiva, sobre trabajos que tomaron muchos aos de
realizacin.22

"Dado que muchas especies tienen rangos amplios y


complejos y que los especmenes de la mayora de ellas
estn desperdigados en las colecciones de los museos de
muchos pases diferentes, un testeo verdaderamente
riguroso de los lmites de cada una no es automtico ni
fcil."

QD Wheeler (200423 )
Algunas conductas hacia la nomenclatura formal pueden reducir la calidad de la
informacin taxonmica y repercutir en el prestigio de la rama en general 237 99 . No
hay requisitos mnimos para describir una especie, y algunos autores estn de
acuerdo en nombrar una colecta de la que no pudo determinarse el taxn al que
perteneca luego de la revisin taxonmica siempre que est correctamente
depositada en una coleccin accesible por otros taxnomos, como si se fijara un
epteto a un "tipo" para despus circunscribir las especies cuando pueda
presupuestarse276 , pero hay autores que denuncian que algunas colectas estn
siendo nombradas formalmente sin que el paper brinde la posibilidad a los dems
bilogos de retomar o testear sus hiptesis, o sin haber hecho una revisin
taxonmica exhaustiva que lo justificara.99 237 277 278 Decenas de miles de nombres
nuevos se publican por ao149 , de los cuales un porcentaje muy alto, que segn el
autor y el taxn tratados puede ser estimado entre el 25 y el 75%, 279 280 sern
nombres sinnimos de nombres previos de especies ms ampliamente
distribuidas o ms variables que lo originalmente descripto. En plantas
angiospermas, quizs el grupo ms estudiado, se calcula que hay 5 veces ms
nombres cientficos que especies segn los conceptos
taxonmicos actuales.281 No parece que se valoren los data papers, las
publicaciones que exponen los datos de las colectas sin cambios en las hiptesis
taxonmicas -que a pesar del nombre incluyen muchas hiptesis taxonmicas: los
caracteres, las apomorfas, las especies segn cada autor...-, en cambio los
papers que contienen actos nomenclaturales como el establecimiento de nombres
nuevos parecen asumirse como una seal honesta de la cantidad de trabajo que
se habrn tomado.282 . Los nombres no tienen que estar solamente establecidos,
tienen que ser nombres "robustos"230 23 . Quizs algunas de las propuestas que se
vern ms adelante, como una reforma que modifique el "tipo" en los Cdigos, o
la accesibilidad online a las descripciones de los taxones segn cada autor,
funcionen para sobrellevar estas actitudes hacia la nomenclatura.

Diferencias entre los datos crudos compartidos por la


cristalografa y la geobiologa283

caracterstica
cristalografa geobiologa
s de los datos

plantilla
datos crudos:
reducida
un value mayorment
tiene valores
e rico en
promedio
informacin, de
para
larga vida para
tipos y value observacione
reusar el formato de
s mltiples:
texto CIF: el tipo
lo ms
de datos ms
comnmente
comnmente
requerido por
compartido
otros

datos binarios:
imagen CIF: Plantilla de
formato
estndar de texto Excel
amplio en el campo
cada imagen o
frame = 0.251
MB set es de
tamao aproximadamente <1 MB
2400 frames (aprox.
1 GB) archivo de
texto >500 kB

repositorios de
amplio uso en el
pedidos
campo en los que
directos de
muchas revistas
los datos,
requieren que se
dificultuosos
accesibilidad depositen los CIFs
y ad hoc,
herramientas OAI-
muchas veces
PMHb se estn
en base a
volviendo
publicaciones
disponibles para los
CIFs

variable
dependiendo
de la fuente
del
modelo de servicio:
presupuesto:
soluciones de
primariament
estructura de
e gobierno e
cristales provistos a
industria; la
los qumicos; la
propiedad autora y
autora de los datos
intelectual derechos
es ambigua,
varan desde
requiere
completo
negociacin antes
copyright a
de que los datos
muy
pasen de manos
limitado;
comn el
embargo de
largo plazo

La autora de la publicacin de los datos primarios asociados a las publicaciones


primarias, como fotografas digitales de los caracteres, secuencias de ADN, datos
de ocurrencia o de coleccin y de estados de los caracteres de cada especmen
de referencia (R Page259 , MJ Costello284 279 285 , B Vanhoorne284 , W Appeltans284 ,
WK Michener279 , M Gahegan279 , ZQ Zhang279 , PE Bourne279 , E Vanden
Berghe285 , X Huang257 , BA Hawkins257 , F Lei257 , GL Miller257 , C Favret257 , R
Zhang257 , G Qiao257 , VS Chavan286 241 , L Penev286 , D Hobern286 , P Ingwersen241 ,
Thomson Reuters 2012287 ), evaluara al taxnomo con la evaluacin de la calidad
de los mismos y del trabajo que respaldan284 279 286 . Los datos crudos son el
fundamento del trabajo taxonmico, pero hace muchas dcadas que se bajaron
los costos de la publicacin en papel279 y a pesar de que revistas electrnicas
como Zootaxa y Phytotaxa y repositorios externos con la infraestructura y la
capacidad de almacenamiento requeridas han reabierto esa posibilidad279 al 2015,
como en biologa en general, la situacin no se ha revertido y todava son
raramente publicados,236 como son raramente citados formalmente.288 289 Cuando
se les pregunta, la mayora de los cientficos contesta que guarda datos no
publicados de experimentos publicados y tambin de experimentos "que no
dieron" (que no rechazaban una hiptesis nula y no seran aceptados para
publicacin), que "descansan en el sector inferior de la cajonera del lado izquierdo
de su escritorio", y la mayora de las veces termina en la basura al momento del
retiro del especialista, "an en los retiros ms planificados", porque nadie -ni
siquiera el cientfico- sabe exactamente qu hay en esos medios de
almacenamiento y formatos que van quedando obsoletos ya que les falta la
documentacin adecuada para retomarlos cuando los metadatos no anotados ya
fueron olvidados.242 En las encuestas como la publicada en Huang et al. (2012 257 )
o la hecha por Thomson Reuters en 2010 (Fig.1289 ) la mayora de los cientficos
estara de acuerdo en publicar sus datos en internet de forma open access si
recibiera reconocimiento por ello en alguna forma similar a la publicacin en
revistas cientficas, como coautora o citas indexadas en bases de datos utilizadas
en clculos de mtricas relevantes como las mediciones de factor de
impacto289 257 246 . Sin embargo, y a pesar de que parece evidente que la
publicacin de los datos aumenta el nmero de citas de la publicacin cientfica
que hace uso de ellos290 , al 2010 la proporcin de datos subidos a GBIF, el
repositorio ms grande de ocurrencias de especmenes creado en el 2001 para
satisfacer un objetivo clave de la Convention on Biological Diversity,279 baj ao a
ao en relacin a la que se detecta o "encuentra",279 y de ella slo fragmentos
estn asociados a publicaciones cientficas, siendo la mayor parte datos de
colecciones financiadas por organizaciones gubernamentales 279 , y ms de la
mitad de los que lo haban hecho que contestaron la encuesta denegaban la
responsabilidad de la calidad de los datos subidos a ese repositorio 279 . Al 2013
est demostrado que una poltica que hiciera mandataria la publicacin de los
datos con un aseguro de su preservacin y acceso al momento de la publicacin
del paper altera este paisaje para los autores,291 y desde el 2011 se han reforzado
polticas en esta direccin por parte de varias editoriales, gobiernos y
organizaciones (p.ej. Canad292 , USA293 , UK294 , la National Science
Foundation NSF295 , Evolution296 297 , The American Naturalist297 , Journal of
Evolutionary Biology297 , otras adherentes a la
poltica JDAP298 297 , PLOS journals299 ). El mismo presidente Obama resalt en su
discurso al estilo inicio de sesiones State of the Union 2012 que la "data
management" ser una de las habilidades crticas de trabajo en este siglo XXI. 300
Variadas propuestas se han hecho del tipo de modernizar la infraestructura para
mejorar la eficiencia del trabajo y facilitar la evaluacin del mismo, algunas de las
cuales se vern en las secciones siguientes. La que sobrevuela todas ellas es la
de digitalizar y proveer acceso online a los recursos taxonmicos.280 Se propone
digitalizar la literatura en papel301 302 303 , que las publicaciones sean de contenido
libre (ej.229 304 305 , pero ver306 ), que los museos digitalicen sus colecciones307 305 240 308 ,
que stas sean de contenido libre305 309 , que hubiera "megarrevistas" electrnicas
para las publicaciones taxonmicas -que pueden llevar ms de mil pginas-, 310 311 ,
que stas sean open-access311 , que se alojen los datos primarios utilizados en las
publicaciones en bases de datos pblicas para verificacin248 , que esos datos
estn relacionados con claves interactivas225280 , que stas sean accesibles225 ,
que sean actualizables.280 Son muchas las propuestas de un nico portal que
tenga acceso a todas las bases de datos, tanto de colecciones como de
bibliografa (p.ej. EOL281 ), a veces asociada a la propuesta de relacionar esos
datos en una nica clasificacin, tambin se propone relacionarlos mediante
buscadores (search engines) especializados que detecten e indexen sus
identificadores estandarizados312 , como son comunes las propuestas de crear
listas de taxones establecidos313 . Tecnologas que se promueven son la
digitalizacin 3D de imgenes de preparados al microscopio (ej225 ,rSEM314 ), la
creacin de fotografas focus stacking de especmenes tipo, ensamblarlas en
imgenes 3D307 314 , que los museos compren la tecnologa para el anlisis de
ADN y quizs encontrar barcodes (ej. Tautz et al. 2003258 ), o que haya un
"molecular lab" cada 10 laboratorios22 , que se implemente la toma de datos
telemtricos y monitoreo satelital de distribucin y ecologa (Patterson et al.
2006281 ). Estas iniciativas son tecnolgicamente sencillas, en este momento las
principales dificultades estn relacionadas con su integracin: la falta de
estandarizacin de los formatos236 -para lo cual est trabajando el TDWG-, las
dificultades en la creacin y mantenimiento de registros150 236 , ndices, e
Identificadores Globales reusables315 (algunos proponen en bases de datos
copiables316 y cosechables por buscadores especficos317 ), y que la financiacin
no debe perder el objetivo de obtener descripciones de especies publicadas, que
incluyan claves de identificacin bien documentadas204 y accesibles225 204 que
eviten la duplicacin de esfuerzos en el futuro, lo que han llamado a veces
peyorativamente "la actitud hacia el usuario final" o del usuario final (end-user
attitude318 cita 65 ). Se han financiado proyectos "horizontales" en miras de organizar
una "big science" a partir de una "small science" articulada,242 como GBIF
(repositorio de ocurrencias y fichas de coleccin de especmenes) y los proyectos
asociados de digitalizacin de los catlogos de museos y herbarios; y el registro
de nombres y actos nomenclaturales Zoobank y algn proyecto de digitalizacin
de catlogos de bibliotecas y hemerotecas; y desde el punto de vista del trabajo
del taxnomo, al '2010 ha demostrado en vistas del nmero real de especies 319 -
mucho ms alto que el estimado en centurias previas319 -, organizarse por taxones
de tamao ms pequeo que los Reinos gobernados por los Cdigos 150 229 . Las
monografas son "consumidoras de tiempo ms que consumidoras de dlares"
adems del salario,22 y los subsidios son pocos y muy grandes y de corto plazo
para el equipo y el tiempo que necesita cada taxnomo, 22 por lo que la falta de
taxnomos en cada taxn podra solventarse otorgando subsidios de tamao ms
realista y con evaluaciones curriculares ms realistas22 (PEET poda haber
otorgado 10 veces ms subsidios 10 veces ms pequeos, a 400 labs en lugar de
40, por los 5 aos que duraba el subsidio22 ; la Flora of North America poda haber
pagado pequeos subsidios a quienes colaboraron en ella a medida que iban
terminando su trabajo22 ), en lugar de ser un equivalente a "ganarse una
lotera".22 En cada taxn de tamao ms pequeo cuando cada cuerpo
mandatario internacional lo decida puede organizarse una nueva fecha de inicio
de la nomenclatura, la que hoy en da slo existe en bacterias, fijada en
1980.150 229
El copyright ("derecho de copia") es de concernimiento en la preservacin de la
literatura taxonmica. La literatura taxonmica primaria en una distribucin sin
formato no se vera afectada por las leyes que restringen la realizacin de copias
y su distribucin (p.ej. el Convenio de Berna), pero son pocos los investigadores
que publican comentarios al respecto (p.ej. Costello 2009) y parece que las
editoriales no se hacen eco del tema.
nicamente las publicaciones de De Carvalho y colaboradores brasileos
denuncian que los "piratas de la biodiversidad" pueden boicotear el trabajo del
taxnomo.
El rol del ADN y los "marcadores de ADN" [editar]
Los anlisis moleculares de ADN se utilizan hoy habitualmente en los anlisis
filogenticos y desde los '90 que unos pocos cientos de bases, con su cantidad
enorme de combinaciones potenciales, parecen bastar para hacer anlisis de
identificacin y parentesco.137 Esto llev a algunos autores, como Hebert et
al. (2003320 ) y Tautz et al. (2003258 ), a proponer asignar un rol central al ADN en la
descripcin e identificacin de las especies, de forma que una muestra de ADN y
la lectura de una de sus secuencias de bases debera ser una especie de
marcador para ubicar el taxn al cual pertenece un espcimen, de una forma
similar a como se usa el cdigo de barras en los supermercados. Tautz et
al.258 incluso proponen refomar los Cdigos para que este "identificador" sea un
carcter agregado al "tipo". Esta "Taxonoma basada en ADN" an adolecera de
muchos de los mismos problemas que tienen las dems propuestas de
identificaciones o de agregar atributos al "tipo", en particular, hay que decidir qu
secuencia usar, ya que algunas secuencias no dan informacin que diferencie al
taxn de los dems. Esto puede ser porque un mismo gen puede mantenerse
inalterado durante millones de generaciones y muchas especiaciones despus de
su formacin, o debido al fenmeno de introgresin, de forma que un gen que se
haba diferenciado vuelve a su estado anterior. Por lo tanto, de la misma forma en
que no es conveniente confiar en un solo carcter morfolgico para identificar una
especie, tampoco es conveniente confiar en una sola secuencia de ADN. Adems,
aun cuando la "Taxonoma basada en ADN" fuera financiada, habra que
preguntarse si es necesario agregar un requerimiento extra al ya lento proceso de
describir nuevos taxones, en especial teniendo en cuenta que se calcula que slo
el 10 % de las especies del planeta ha sido descrito. Debido a eso,
probablemente la mayora de los bilogos ver las secuencias de ADN como un
complemento de la informacin morfolgica, ms que intentar reemplazarla
buscando verdaderos barcodes. De todas formas, los Cdigos no especifican
ningn carcter en particular para diagnosticar nuevos taxones, as que la
"Taxonoma de ADN", con el tipo nomenclatural de costumbre, ya es vlida,
aunque la identificacin mediante caracteres visibles puede ser de uso ms
inmediato y su realizacin ms econmica que la lectura de un
verdadero barcode.137 204 321 322 323 264

Los principales324 recursos de "barcodeo de ADN" (DNA barcoding) al 2012324 .

Presidente: Dr. Scott E. Miller, opera desde el


museo Smithsonian Institutions National Museum of
CBOL(Consortium for 2004 en Natural History en Washington.
the Barcode of Life). adlnte.

Realiza barcodes para 200 organizaciones en 50 pases.

BOLD(Barcoding of 2005 en Opera desde el Biodiversity Institute de Ontario,


Life Data System). adlnte. Canad, cuyo director es el Dr. Paul Hebert.
Opera como banco de trabajo online: repositorio
de barcodes, anlisis, interfaz para submisin
a GenBank, herramienta de identificacin de especies,
conectividad con recursos externos.

El hub cientfico es el Biodiversity Institute de Ontario y


el director cientfico es el Dr. Paul Hebert.
iBOL(International 2010 en
Barcode of Life). adlnte.
Compromisos y grupos de trabajo sin fines de lucro en
25 pases "tanto desarrollados como en desarrollo".

Los atributos estandarizados por el "barcodeo de ADN" apoyado por el CBOL.325

Eucariotas,
Una regin de 658 pares de bases del gen
principalmente Hebert et al. (2003320 )
mitocondrial cytochrome c oxidase I (COI).
animales

Dos fragmentos plastdicos de 500- a 800-


Hollingsworth et al.
pares de bases de la subunidad grande del
(2009326 ) (CBOL
Plantas gen ribulose 1,5-biphosphate
Plant Working Group
carboxylase (rbcL) y del gen maturase
2009326 )
K (matK)

Los atributos a estandarizar por el "metabarcodeo de ADN".325

ADN Secuencias a estandarizar luego de referenciar


Taberlet et al.
ambiental (no los genomas organelares completos y el rDNA
(2012325 ) y referencias
separado por nuclear repetitivo, mediante la tecnologa NGS
en ese texto
organismo) (next-generation sequencing)

Al 2003 ya era rutina que los microorganismos se delimitaran con mtodos


moleculares,137 y est claro que para dilucidar el rbol de la vida completo, sera
til secuenciar los mismos genes en muchos taxones diferentes 137 . Para lograr
esto, sera necesario un "proyecto genoma horizontal"137 y un sistema de
archivo de secuencias de ADN como el INSDC327 que incluye al
estadounidense GenBank, ms all de si el ADN se vuelve un requerimiento en la
descripcin o identificacin de especies o si se lo agrega al "tipo"137 . Al 2005, dos
proyectos haban recibido el millonario presupuesto para llevar a cabo la empresa
global de secuenciacin de barcodes322 100 -nombre que qued a las secuencias
seleccionadas por los proyectos presupuestados-, el Barcode of Life Data
System328 (BOLD)329 , y el Consortium for the Barcode of Life330 (CBOL, "Consorcio
para el cdigo de barras de la vida").324 Sus seguidores promocionan los casos de
macroorganismos en que el agregado de esa lnea de evidencia molecular a las
hiptesis taxonmicas llev al esclarecimiento de problemas de sinonimias, como
cuando la secuencia de ADN "barcode" COI logr diferenciar en 4 especies
"crpticas" la sanguijuela medicinal europea.331 ,332 . Como en ese mismo ejemplo,
la secuencia estandarizada de ADN que es parte del gen COI tomada de un
especmen es de utilidad para delimitar especies slo acompaada de la matriz
de caracteres del especmen tomados de otras lneas de evidencia, moleculares y
no moleculares, y de una preidentificacin morfolgica -QD Wheeler nos recuerda
que muchos especmenes de referencia descansan en las colecciones sin una
caracterizacin morfolgica adecuada,23 y en un porcentaje significativo est mal
la determinacin o no se ha intentado su identificacin 23 176 -, slo de esta forma
puede utilizarse esta secuencia en una matriz de anlisis filogenticos; 230 y
posteriormente quizs forme parte de una clave de identificacin. 99 100 333 136 A
diferencia de lo que ocurri en los '90 en que los "barcodes" se tomaban slo
sobre especmenes morfolgicamente caracterizados hasta hiptesis de
especies,18 al 2013 los barcodes se han producido a una velocidad mayor que la
revisin taxonmica que debera acompaarlos, lo que ha hecho proliferar en el
estadounidense GenBank los llamados taxones "en la oscuridad" (dark
taxa).34 stos podran formar parte de taxones conocidos en los que el organismo
del que se extrajo el ADN an no haya sido ubicado, o de taxones nuevos, no
caracterizados.34 Muchos barcodes "sin nombre" (unnamed) haban sido
suprimidos por GenBank, pero aun as su nmero sigui aumentando en los
ltimos aos.34
En respuesta a la intensa propaganda230 realizada a favor de esta empresa -que
para muchos autores desbalanceaba las necesidades presupuestarias de la alfa-
taxonoma100 99 23 -, el trmino "taxonoma integrativa" fue acuado,
independientemente y casi al mismo tiempo114 , por Dayrat (200599 ) y Will et al.
(2005100 ), el ltimo luego de una conferencia, el DNA barcoding debate Will vs.
Hebert,100 el "padre del barcode"243 . La taxonoma o aproximacin integrativa
alude a la prctica tradicional, y la esperable en taxonoma, de integrar lneas de
evidencia durante la generacin de hiptesis taxonmicas, y en particular a la
integracin de los variados mtodos moleculares con los morfolgicos como la
nica primera aproximacin vlida para delimitar taxones en la categora
especie.99100 Desde esa fecha un considerable226 114 nmero de estudios
taxonmicos se hizo eco del trmino.
La presupuestacin de los proyectos promovidos por Hebert et al. (2003 320 ) dej
como legado lo que algunos autores325 llaman la primera regin de ADN
"horizontal"137estandarizada para su utilizacin como atributo en una matriz de
anlisis filogenticos, para lo que anteriormente se haban utilizado muchas
regiones de ADN nucleares y organelares diferentes enfocadas en taxones de
tamao ms pequeo325 (ver p.ej. en plantas). QD Wheeler deca en el 200423 :
"Estamos en el umbral del salto ms excitante de la 'Taxonoma basada en
morfologa' [identificacin de especies mediante claves morfolgicas] desde
Linneo (1758), lo que vuelve estos tiempos un momento inoportuno para darse
por vencido". ... "Los datos visuales morfolgicos nunca haban podido ser
eficientemente comunicados en el pasado. Ahora tenemos la tecnologa para una
edad dorada de la morfologa comparativa si podemos sobrellevar las presiones
para conformarnos a lo 'tecnolgicamente correcto'."
La crisis de biodiversidad[editar]
La crisis de biodiversidad causada por actividades humanas, como las que llevan
a la prdida del hbitat y la introduccin de especies exticas, es tal vez
comparable en magnitud a las grandes extinciones registradas en los perodos
geolgicos (PH Raven 2002334 ). El trmino "biodiversidad" fue acuado335 por EO
Wilson en 1985336 como un reemplazo eufnico de "diversidad biolgica", en una
serie de populares ensayos donde pona el foco en sta y su crisis; en 1992, el
tratado internacional llamado Convenio sobre la Diversidad
Biolgica (Convention on Biological Diversity), ratificado por todos los pases
miembros de la ONU salvo Estados Unidos, reconoci como un derecho
internacional la valoracin de la biodiversidad en el contexto de su conservacin y
uso sustentable. Sin embargo, existe una conciencia general de que no ser
posible conservar toda la biodiversidad.337 Los especialistas deben calcular en qu
hbitats y en qu especies focalizar los magros presupuestos asignados a la
conservacin, priorizar los hotspots (regiones con una concentracin de especies
endmicas con peligro de perder el hbitat338 277 ), y generar modelos predictivos
acerca del futuro de la biodiversidad.339 . A 1995, se haba hecho evidente para el
CBD que los especialistas no pueden medir una biodiversidad no descripta, lo que
bautizaron como "el impedimento taxonmico",229 233 a raz del cual el organismo
impuls el desarrollo de la alfa-taxonoma. Las medidas concretas encaminadas a
cumplir estos objetivos empezaron a ser visibles en algunos pases e instituciones
internacionales a fines de 1990309 , momento a partir del cual se hizo evidente un
segundo impedimento: la eleccin del concepto taxonmico a utilizar tiene sus
consecuencias en las decisiones de conservacin. Por ejemplo, Peterson y
Navarro-Sigenza (1999340 ) analizaron la cantidad de especies
de aves endmicas de Mxico utilizando dos clasificaciones diferentes basadas
en distintos conceptos de especie. Segn el concepto biolgico de especie o BSC
(que agrupa dentro de la misma especie a los organismos con capacidad de
hibridar y dar descendencia frtil), obtuvieron 101 especies, con la mayor
concentracin de especies endmicas en las regiones montaosas del sur y del
oeste. En cambio segn el concepto filogentico de especie o PSC (que asigna
como miembros de una especie a los que poseen evidencia de conservar
caracteres en un anlisis de filogenia, ms all de si pueden hibridar con otras
poblaciones o no), obtuvieron 249 especies endmicas, con la mayor
concentracin en zonas tanto llanas como montaosas del oeste. La eleccin de
una clasificacin u otra, por lo tanto, afecta enormemente las prioridades de
conservacin de cada hbitat. La estabilidad que presentaron por al menos dos
dcadas desde las influentes publicaciones de E Mayr hasta ~1985 algunos
taxones bien conocidos, contrasta fuertemente con la reciente incertidumbre
sobre el concepto de especie a utilizar y la "inflacin" en su nmero, que
especialmente en los grupos bien estudiados, incluso en primates, ocurri en
parte significativa por un cambio en la preferencia de los taxnomos del concepto
de especie biolgica o BSC al concepto de especie filogentica o PSC.110
La preferencia de conservacin de la categora especie trajo un problema extra a
la clasificacin.110 Esto ha animado la elevacin al rango de especie a las
poblaciones que necesitaban proteccin, ms all de si la decisin poda ser
respaldada cientficamente.110 El fenmeno fue descrito en la tortuga
negra Chelonia agassizi, pero es probable que haya ocurrido tambin en otros
taxones.110 Esta inflacin de especies estara sesgada hacia formas carismticas,
de gran tamao, raras y en peligro de extincin, que atraigan inters del pblico y
cientfico para su conservacin.110 Un inters local puede llevar a una poblacin a
ser listada aparte, pero su sobrevivencia puede ser ms probable si se la gestiona
como un componente de una metapoblacin viable. (Isaac et al. 2004110 )
Ha habido otras propuestas de medidas de biodiversidad, con sus consecuencias
en las propuestas de conservacin, se ha propuesto como medida de
biodiversidad la categora de gnero (incluso en primates, como en Harcourt et al.
2002341 ) o las poblaciones, otros estudios abandonaron la taxonoma biolgica
para describir la biodiversidad con medidas de "diversidad filogentica" 110 . Sin
embargo, esas medidas pueden quitar atractivo presupuestario debido a que la
opinin pblica favorece los taxones especie como unidad de medida. 110 Una
solucin sera que los checklists o inventarios (listas de especies por regin) se
agreguen de forma globalizada especificando el concepto de especie utilizado y
se enlazaran a sinonimias bajo otros conceptos de especie, 110 de forma que se
sincronicen todas las clasificaciones que afectan una regin para presentar su
diversidad taxonmica sin dejar de lado ninguna autoridad. La tecnologa para
hacerlo est disponible, pero se necesita una inversin institucional fuerte y de
largo plazo110 .
Biodiversidad informtica[editar]
La digitalizacin de la taxonoma entra en su mayor parte en el campo de la
informtica de la biodiversidad (biodiversity informatics), la informatizacin de la
diversidad biolgica en la categora de los organismos,239 delimitada de la
bioinformtica (bioinformatics), que trabaja a nivel molecular y otras lneas
relacionadas como la fisiologa, y de la ecoinformtica (ecoinformatics), a nivel de
los ecosistemas. (Berendsohn et al. 2011239 )
El material a digitalizar consta de los "datos crudos" y sus metadatos, y de la
"literatura taxonmica primaria" y sus respectivos metadatos. La digitalizacin
requiere un id "nico" para cada uno de ellos, idealmente "global", es decir nico
en internet. Por ejemplo la forma ms directa de crear un id global es concatenar
el id del dato con el de su tabla en la base de datos con el identificador de esa
base de datos en internet.342 Hay varias propuestas de formacin de id globales y
alguna de ellas puede volverse estandarizada en el futuro, cuando la aceptacin
por parte de la comunidad de usuarios lo decida. En internet adems se busca
que este GUI (identificador global nico, global unique identifier) pueda
"resolverse", enlazarse a travs de internet a un archivo con sus metadatos y
quizs una lista de enlaces a copias del dato taxonmico, los dos alojados en su
base de datos online, en lo que cuando son adecuadamente citados se llam el
mundo emergente de los Linked Open Data de la Big New Biology, la "Nueva
Biologa Gigante" ms "data-cntrica".236 Las discusiones en la comunidad de la
informtica de la biodiversidad se enfocan en 3 tipos de GUIs "autorresolubles",
es decir que sean una direccin de internet que al tipearla en la barra de
direcciones devuelva la pgina con los datos o los metadatos: los HTTP URIs (es
decir URLs), los GUI recomendados como estndar por el TDWG que son los
LSID (que hacen uso de los DNS de internet, y resuelven a una pgina de
metadatos), y los DOI, que hacen uso de una autoridad central para resolverse y
son por ejemplo los asignados por CrossRef para publicaciones cientficas que los
resuelve al dato159 . Los GUIs no ocupan espacio en las publicaciones
taxonmicas porque los metadatos y el material al que hacen referencia pueden
agregarse en bases de datos externas, las bases de datos deberan ser
"copiables" para amortiguar la posibilidad de que metadatos y datos se pierdan, y
para independizarse de las autoridades que mantienen las bases de datos
mediante buscadores -search engines- especficos o inespecficos que indexen
los GUI, sus metadatos, sus locaciones, sus GUI sinnimos y usos posteriores de
los mismos34 . Como la unidad de trabajo en la clasificacin es el organismo, los
datos crudos y la literatura primaria deberan enlazarse a los id de los organismos
o cepas referenciados en ellos, por lo que implican la necesidad de un GUI por
organismo/cepa.33 Los id de los organismos son el taxn terminal de las
clasificaciones segn cada autor. Cada nombre de taxn sensu cada fuente
tambin necesita un id, para poder separar sinnimos nomenclaturales del
nombre y sincronizar conceptos sinnimos con diferente nombre. 33 34
Los datos primarios y su literatura asociada pueden agregarse en proyectos
"verticales" de un taxn algo superior o con lneas de evidencia que requieren
diferentes especialistas, la digitalizacin de los metadatos primarios que tengan
"actos nomenclaturales" (establecimientos de nombres, etc.) por taxn "vertical"
en miras de crear las tan esperadas Listas de Nombres Adoptados (no
suprimidos) necesarias para los Cdigos en uso es considerada una prioridad
para el BioCode.150 Tambin hay proyectos "horizontales" como los de
ADN barcodes, la Biodiversity Heritage Library que digitaliza literatura taxonmica,
los proyectos que digitalizan los especmenes y sus metadatos (ficha de
coleccin, etc.) de las colecciones de los museos. Algunos sitios web, como
la Encyclopedia of Life (EoL) son "iniciativas globales", funcionan como portales
que presentan la informacin "agregada" de "asociados" (partners), las bases de
datos indexadas en ellos. El candidato obvio para ser el id que combinara bases
de datos diversas haba sido el nombre cientfico, como fue utilizado en iSpecies y
EOL, pero pronto se vieron sus limitaciones como identificadores debido a que no
son ni completamente estables ni globalmente nicos: en los nombres cientficos
son permitidas, o inevitables, las sinonimias y las homonimias.159 Idealmente en el
futuro los nombres cientficos sean reemplazados por id de conceptos
taxonmicos33 34 , que puedan resolverse hacia la cita a la que corresponde la
descripcin del taxn utilizada con todas sus referencias 34 .
Entre las iniciativas ms populares desde el 2003 quizs estn: 137

GBIF343 Financiado por agencias gubernamentales en acuerdos


internacionales luego del CBD. Portal de acceso a los datos de ocurrencias
provenientes de cientos de instituciones de todo el mundo. Recomienda
enviar las colaboraciones individuales a iNaturalist344 , eBird345 o
la Encyclopedia of Life (EOL).346

Species 2000347 . Al 2015 se lee: "ITIS y Species 2000 se han asociado para
formar el Catlogo de la Vida (Catalogue of Life, CoL) que orgullosamente
provee el esqueleto de la Enciclopedia de la Vida (Encyclopedia of Life,
EOL348 )".349 La Enciclopedia de la Vida naci en el ao 2003350 y puede
agregarse informacin luego de registrarse como usuario. Es muy publicitada
en Science (por ejemplo en Stuart et al. 2010351 ).

Tree of Life352 , desarrollado en los '90 y anunciado formalmente en 1996, 353 el


esqueleto taxonmico lo provee la comunidad cientfica, la comunidad de
usuarios puede agregar contenido multimedia por taxn. Al 2007 se lee,
"muchos usuarios y contribuyentes de Tree of Life han notado el extenso
solapamiento en los objetivos de EOL y ToL, y ha habido algn
concernimiento acerca de la supervivencia a largo plazo de ToL corriendo en
paralelo de un proyecto similar pero mucho ms grande, financiado a una
escala de rdenes de magnitud por encima de los recursos de ToL. En orden
de evitar la duplicacin de esfuerzos, ToL y EOL han acordado coordinar
cercanamente las actividades futuras, compartir contenido y herramientas de
software".354 El proyecto se dej de actualizar en el 2011.355
Pero hubo ms de 50 proyectos en todo el mundo. 137 Un problema comn a
muchos de ellos fueron las expectativas irrealistas de los usuarios respecto al
nmero de datos que deban ser curados, por lo que luego de la fundacin inicial
los recursos se desvanecan y los proyectos quedaban detenidos.356 Un ejemplo
fue All Species Foundation, creado en el 2001 por un ambicioso grupo de "Silicon-
Valley types" entre los que estaban prominentes investigadores como EO
Wilson de Harvard, y Peter Raven del Missouri Botanical Garden.357 Su objetivo
era catalogar todas las especies del planeta en 25 aos, pero en el 2005 el
proyecto haba muerto.357 Se haban terminado las donaciones luego de finalizada
la "explosin de la burbuja punto com" (dot.com bubble burst), una visita del 2005
a su pgina web slo deca, "Nos fuimos" ("Gone").357 Ni los assets fueron
reutilizados.357 EO Wilson ya haba retomado la idea358 en su nuevo proyecto,
la Encyclopedia of Life (EOL), con el objetivo a plazos ms modestos de una
pgina web para cada especie del planeta, presentada por el mismo EO Wilson
en el 2003.359

Cajones entomolgicos en un corredor de la torre 4 del museo del Naturalis


Biodiversity Center.

Pero si bien ya en el 2010 Padial et al.226 calcularon que tomara 400 aos de
trabajo taxonmico constante llegar a describir las cerca de 10 millones 360 de
especies de eucariotas, al 2012, la realidad es que las colecciones de historia
natural estn casi tan lejos de la digitalizacin completa como 20 aos atrs, y
an no hay una verdadera database central de acceso a colecciones, ni un
registro completo de las mismas para ofrecer a los usuarios.240 A travs de GBIF,
la fuente ms grande de informacin, Ario (2010361 ) estim que eran accesibles
no ms del 3% de los datos de especmenes preservados en las colecciones de
todo el mundo.240 Blagoderov et al. (2012240 ) calcularon que el costo de la
digitalizacin de los cerca de 30 millones de especmenes de insectos alojados en
la coleccin de entomologa del Museo de Historia Natural de Londres, por
ejemplo, tomara 23 aos de trabajo continuo de las 65 personas que componen
el staff del departamento, y en el mundo, dependiendo de la coleccin los costos
varan entre 0,50 a unos cuantos dlares por especmen para capturar sus datos
completamente, por lo que la digitalizacin completa de todas las colecciones de
historia natural del planeta costara unos 150 mil millones de euros y tomara unos
1500 aos.240 La solucin ms comn propuesta es la prioridad de la digitalizacin
en base a la demanda, tambin se propone financiar los costos de una
digitalizacin "industrial" de las colecciones.240
Zootaxa fue la primera "megarrevista"310 electrnica con referato. Creada en el
2001,310 lleg a publicar monografas de ms de mil pginas310 , y en el 2004 ya se
perfilaba como la mayor revista en taxonoma zoolgica, 310 momento en el que
entr a las mediciones de factor de impacto de ISI.310 362 Al 2008 se promocion
como la primera en publicar un "paper cibertaxonmico" con enlaces y otras
utilidades.310 A ella sigui una generacin de nuevas "revistas rpidas" en
taxonoma,310 incluyendo Phytotaxa (2009363364 ) y Zookeys (2008314 ). Pensoft
(Zookeys, Phytokeys, Mycokeys) distribuye desde el 2011 de rutina los datos
taxonmicos publicados hacia una serie de recursos online que incluyen GBIF,
EOL, y la indexacin en Zoobank,365 al 2015, una actualizacin del software
permite que estas bases de datos externas "cosechen" los datos de los papers
que corrigen datos de papers anteriores, as los datos se corrigen dinmicamente
en ellas.365 Estas revistas tambin hicieron las primeras pruebas de publicar
papers "de datos" (data papers).286 En el 2012 los dos Cdigos permitieron la
publicacin electrnica de actos nomenclaturales, facilitando el uso de este
recurso.310 366 363
Algunas revistas tradicionales hoy exigen que los datos crudos (raw data) sobre
los que fueron tomados los datos de publicaciones taxonmicas sean alojados en
bases de datos pblicas.248 Tambin son usuales los artculos "suplementarios"
publicados en formato exclusivamente electrnico.
Por otro lado, al 2014, las bases de datos externas ofrecen la posibilidad de
publicar monografas taxonmicas fuera del circuito de las revistas cientficas, con
las facilidades que podra dar una base de datos interactiva.280 263 Algunos
softwares para monografas son las plataformas Scratchpads, KE-EMU, Diversity
Workbench Platform, EDIT Platform for Cybertaxonomy (el ltimo el nico de los
listados con capacidad de alojar clasificaciones alternativas), softwares para alojar
una base de datos descriptivos y crear claves son Lucid2, Xper2.263
La armonizacin de los Cdigos y el BioCode[editar]
La IUBS es un organismo que tiene su participacin en los Cdigos en uso y en
1985 form un Comit de Nomenclatura Biolgica, el cual desde ese momento ha
organizado numerosos congresos y reuniones, a los que se han sumado el
auspicio de la IUMS (International Union of Microbiological Societies) y del IAPT, y
el apoyo de organismos como CAB International, el Linnean Society of London,
la Royal Society of London, entre otras. En 1994 se form el IUBS/IUMS
International Committee on Bionomenclature (ICB). Fue el ICB quien propuso un
primer borrador de un Cdigo unificado de nomenclatura despus de sus
esperables congresos y revisiones que fue presentado como el "Borrador del
BioCdigo 1997" (Draft BioCode 1997) (DL Hawksworth, presidente de la
IUBS150 ).
El Biocode propuso que fuera utilizado en reemplazo de los Cdigos en uso, pero
su uso no fue implementado por los autores de publicaciones taxonmicas. La
crtica principal consista en que haba baja disposicin de botnicos y zologos
en aprenderse todo un conjunto de reglas nuevas367 , argumentando que los
problemas existentes podan superarse reformando cada Cdigo en uso, lo que
quizs est relacionado con la crtica de haber sido "poco maduros"368 369 370 371 al
presentar una propuesta semejante.
La crtica fue escuchada y la nueva versin del BioCode, el Draft BioCode 2011,
ha sido sustancialmente reescrita de forma no de reemplazar los Cdigos
actuales, sino para proveer un marco comn que los englobe. Est repensado
para ser utilizado junto con los Cdigos en uso -a los que llama los Cdigos
Especiales-, como su complemento, y est listo para su implementacin
inmediata. Es un "terso texto de slo 35 artculos", que refiere a los dems
Cdigos cuando lo considera apropiado, pero para la mayora de los propsitos
puede funcionar por s mismo. Propone un nmero de mejoras futuras, que
dependen de que se hagan reformas en los Cdigos Especiales para poder
efectuarse "y que esperablemente disparen esas reformas". Una de ellas es el
requerimiento de registrar nombres nuevos y actos nomenclaturales (por ejemplo
las designaciones de lectotipos), que en la nueva versin fue modificada para
tomar ventaja de los recientes progresos tecnolgicos. Otras innovaciones
propuestas son el requerimiento de que las descripciones de nuevos taxones
sean en ingls o latn (en el 2011 todava se deban hacer en latn para plantas, y
en cualquier lengua en animales), la opcin de proteger nombres y sus atributos
por medio de Listas de Nombres Adoptados, el prospecto de evitar los homnimos
entre-Cdigos para los nombres futuros, y el permiso, para los llamados
organismos "ambirregnos", de usar sufijos de cualquier Cdigo para los nombres
supragenricos, independientemente del Cdigo que se est aplicando. Introduce
rangos adicionales a los primarios (profamilia entre familia y subfamilia, prognero
entre gnero y subgnero, proespecie entre especie y subespecie) de forma de
implementar las reglas de forma retroactiva para todos los tipos de organismos sin
efectos desestabilizadores en el sistema actual de nombres. (W Greuter,
secretario de la ICB372 ).
A comienzos de este siglo, la rpida evolucin de las bases de datos dej en
evidencia que es ms prctica la produccin de listas de nombres adoptados por
taxn, y la nueva edicin fue creada para que sus provisiones puedan ser
adoptadas en diferente momento por diferentes taxones dentro de cada Cdigo, lo
cual estara determinado por el cuerpo internacional mandatario apropiado para
cada taxn si fuera operacional. (DL Hawksworth150 ).
Algunos cambios menores fueron realizados en los Cdigos Especiales desde
1997150 373 Con la llegada de los anlisis moleculares aument la cantidad de
grupos que fueron tratados sucesivamente bajo los Cdigos de Botnica y
Zoologa, por lo que se acentu la necesidad de armonizar la nomenclatura de
protistas, que al 2011 queda pendiente. Tambin queda pendiente un registro
mandatario de nombres y una lista de nombres en uso, que al 2011 slo sigue
existiendo en bacterias (DL Hawksworth150 ).
Las variaciones de terminologa entre Cdigos, y la terminologa unificada
propuesta:

ICNCP (de
BC (de ICBN (de ICZN (de
BioCode (unificado) Plantas
Bacterias) Botnica) Zoologa)
Cultivadas)

Publicacin y fecha de los nombres

efectivamente efectivamente
publicado publicado publicado
publicado publicado
fecha (o
fecha fecha fecha prioridad
prioridad)

precedencia prioridad prioridad precedencia precedencia

anterior senior anterior anterior senior

posterior junior posterior posterior junior

Estatus nomenclatural

vlidamente vlidamente
establecido establecido disponible
publicado publicado

registro validacin registro registro ------

potencialmente
aceptable legtimo legtimo -----
vlido

Estatus taxonmico

aceptado correcto correcto aceptado vlido

Tipos o especmenes de referencia

tipo portador de nombre tipo tipo estndar tipo


nomenclatural nomenclatural nomenclatural nomenclatural
(nombre del
especmen o
fotos de
referencia; ya
que el "tipo" es
toda la
descripcin
original, que es
invariable)nota 19

taxn nominal nombre y tipo nombre y tipo ------ taxn nominal

Sinonimia

nomenclatural u
homotpica objetiva ------ objetiva
homotpica

taxonmica o
heterotpica subjetiva ------- subjetiva
heterotpica

sustituto
declarado
(avowed
reemplazo
nombre de reemplazo substitute) o
------- ------- explcito (explicit
(replacement name) nombre de
replacement)
reemplazo
(replacement
name)

Prescindiendo de las reglas

conservacin conservacin conservacin ------- conservacin

supresin
supresin rechazo ------- supresin
explcita

Propuestas de un registro central de nombres[editar]


Para cerrar las "listas de nombres adoptados"150 Charles Godfray (2002229 )
propuso una "primera revisin a travs de la web" como el nuevo punto de partida
de la nomenclatura en cada grupo, de forma que luego de una exposicin por un
tiempo predeterminado de las listas provisorias con su revisin taxonmica
abiertas a los agregados de informacin nueva por parte de la comunidad con
acceso a internet, stas fueran cerradas y las descripciones previas encontradas
posteriormente fueran consideradas como descripciones con nombres informales.
Propuestas como sta suelen estar acompaadas por la propuesta de registrar
los nuevos actos nomenclaturales en alguna database central, de forma que el
nombre no fuera establecido si no fue registrado. Alessandro Minelli (2003253 ), el
presidente de la Comisin Internacional para la Nomenclatura
Zoolgica,137 tambin argument sobre lo prioritario de contar con un registro
central de nombres. El Cdigo de Bacterias ya tiene un registro central de
nombres: todos los nombres establecidos de las bacterias ahora son publicados
en una nica revista, con una nueva fecha de comienzo de la nomenclatura fijada
en 1980.374 Se esperaban reformas similares en los Cdigos de macroorganismos,
pero zologos y botnicos todava tienen que ratificar las propuestas. 137 La
posibilidad de que unos pocos especialistas pudieran monopolizar la
nomenclatura de cada grupo haba sido una de las preocupaciones que llev a los
botnicos a rechazar las llamadas para un registro central de nombres en el
Congreso Internacional de Botnica en 1999, propuestas similares fueron
rechazadas en el Congreso de Zoologa de 1999.137
La posible reglamentacin que haba sido parte del borrador del BioCode 1997,
fue modificada en el borrador del BioCode 2011 para incorporar las nuevas
tecnologas y la posibilidad de dividir los taxones abarcados por los Cdigos en
grupos de tamao ms pequeo, cada uno con su propio cuerpo mandatario
internacional.150 En el ao 2012 una enmienda375 del Cdigo de Zoologa oficializ
un registro central de nombres llamado Zoobank,376 , la enmienda no modifica sin
embargo la fecha de inicio de la nomenclatura de cada grupo, ni el registro es
mandatario, slo insta a que a partir del momento se informen las publicaciones
taxonmicas en esa web. En Botnica slo el Mycobank, que haba sido creado
en el 2004, se adopt como registro mandatario desde el 2013. 377 Al 2015 las
listas no estn cerradas.
El PhyloCode[editar]
Algunos autores argumentan problemas usando el sistema linneano de
clasificacin cuando se lo basa en el rbol filogentico (p. ej. de Queiroz y
Gauthier 199095 ). El PhyloCode (http://www.ohio.edu/phylocode378 ), creado en
1998 y actualizado peridicamente, est basado en lo que sus autores llaman una
"aproximacin filogentica" a la nomenclatura. Con su objetivo de ser un cdigo
de nomenclatura, tiene "varias similitudes en sus metas y en sus mtodos" con lo
que los autores llaman la "nomenclatura basada en rangos" (lo que otros autores
llaman la nomenclatura linneana): provee mtodos inambiguos para aplicar
nombres a los taxones, para seleccionar un nico nombre aceptado para cada
taxn, y no impide a los taxnomos aplicarles rangos taxonmicos,
"contrariamente a un concepto errneo frecuente". Una de las diferencias es que
el PhyloCode aplica los nombres a "la secuencia de ancestros y descendientes, o
sus productos, los clados"; en lugar de aplicarlos "a una circunscripcin + rango".
De esta forma el Cdigo define un taxn nominalcita 66 cuando realiza la asociacin
entre un nombre y un clado,95 o ms rigurosamente, entre un nombre y las
hiptesis cladsticas delimitadas por los especificadores (otros taxones o
especmenes y apomorfas) de un clado, como publicadas en la primera
descripcin; lo que los autores llaman las "definiciones del nombre". cita 66 Tres tipos
de "definiciones del nombre" son la basada en nodos, la basada en ramas, y la
basada en apomorfas. Una definicin del nombre Asteraceae podra ser "el clado
que se deriva del ancestro comn ms reciente de Barnadesia y Aster".cita 66 Los
nombres de los taxones no cambiaran con los cambios de circunscripcin
mientras se mantenga ese tipo, y como esos nombres no dependen del rango
taxonmico (como en la nomenclatura de los Cdigos que tiene reglas
relacionadas al respecto, como el uso de sufijos), entonces cuando hay cambios
de categoras taxonmicas no es necesario que cambien los nombres de los
taxones (de Queiroz 201227 ).
Los autores del PhyloCode pretenden reemplazar los Cdigos de la nomenclatura
linneana con su nuevo Cdigo, lo cual no lleg a discutirse en el debate acerca de
una taxonoma unitaria en el ambiente cientfico.137 380
Sin embargo, el PhyloCode ha sido intensamente debatido en revistas cientficas
de prestigio como Taxon25 142 , y hasta aparecieron remeras universitarias con
inscripciones "anti-rangos" que fueron sospechadas de propaganda hacia ese
Cdigo106 10 . La crtica principal hacia el PhyloCode es que el sistema linneano es
compatible con el rbol filogentico, por lo que no hay necesidad de cambiar todo
un sistema nomenclatural por otro.142 10 De hecho el PhyloCode no es compatible
con el rbol filogentico en la categora especie, ya que no maneja los conceptos
taxonmicos utilizados en esa categora.142 Otra crtica es que ese "tipo" no prob
ser en realidad ms estable, "a menos que se redefina estabilidad"142 10 , por lo
que aun dentro de una "filosofa taxonmica" cladista sera difcil evitar la
convivencia con otros Cdigos especialmente en categoras muy altas.142 Quitar
las categoras absolutas quitara informacin sobre exclusiones y la mayora de
los taxnomos ve como suficientemente til para la comunicacin que estn
impresas en los sufijos como para abandonarlos en las categoras del grupo
familia.10 106 (pero ver88 ) La posibilidad de intercalar categoras sin rango entre
categoras primarias -que de hecho se hace, informalmente-, la posibilidad de que
ms de un especmen de referencia, y las apomorfas o la descripcin de un
epteto descriptivo puedan agregarse formalmente al "tipo" -lo ltimo de hecho
mandatario en taxones de categoras ms altasnota 20 -, y otras propuestas se
podran hacer bajo los Cdigos en uso (p.ej.142 ,106 ), que seran aprobadas
despus de un debate adecuado y un amplio consenso. Los "nombres
descriptivos" de categoras altas de hecho cuando hacen referencia a un carcter
o un plan corporal sobresaliente se interpretan como derivados de hiptesis
cladsticas que contienen las apomorfas que definieron el plan corporal en su
linaje ancestral y que le dan el nombre al grupo -que no necesariamente es
monofiltico. Por ejemplo Cavalier-Smith (2013381 ) define al reino Fungi como
derivado del linaje que adquiri rizoides absorbentes, tempranamente acoplado
en su desarrollo a la adquisicin de una pared celular de quitina con prdida de la
fagocitosis, propone a Excavata como grupo parafiltico, y propone abandonar el
nombre del supergrupo Unikonta ("un cilio"), ya que se haba determinado que el
cilio se haba originado dos veces independientemente dentro del grupo. 381 Del
aluvin de publicaciones referentes al PhyloCode, las dos lecturas recomendadas
por el FAQ del ICZN son Wheeler (200423 ) y Knapp et al. (2004155 ).
Los nombres de los supergrupos de eucariotas ubicados en el rbol segn la filogenia de
Cavalier-Smith (2013381 ).
El PhyloCode fue slo una de las manifestaciones de los taxnomos que, en
general bajo la nomenclatura de los Cdigos en uso, sealan que es buena
prctica que sea explicitado el "concepto de taxn" utilizado
(p.ej.110 ,136 ,114 ,124 para los conceptos de especie,263 en categoras intermedias). En
taxones intermedios, un ejemplo del 2007 en subfamilias de rosceas ha quedado
as:382

Subfamily Dryadoideae Juel, Kongl. Svenska Subfamilia Dryadoideae Juel, Kongl. Svenska
Vetensk. Akad. Handl. n.s. 58: 55 (1918): Vetensk. Akad. Handl. n.s. 58: 55 (1918):

The most inclusive clade containing Dryas (as El clado ms inclusivo conteniendo a Dryas (como
typified by Dryas octopetala L.), but not Rosoideae tipificado por Dryas octopetala L.), pero no
(cf. above) nor Spiraeoideae (cf. below). Rosoideae (cf. ms arriba) ni Spiraeoideae (cf. ms
abajo).

Included taxa: Cercocarpus H. B. and Taxones includos: Cercocarpus H. B. and


K., Chamaebatia Benth., Dryas L., Purshia DC. K., Chamaebatia Benth., Dryas L., Purshia DC.
(including Cowania D. Don) (incluyendo Cowania D. Don)

Distinctive non-molecular features: Shrublets, Caractersticas distintivas no moleculares:


shrubs, or small trees. Symbiotic nitrogen fixation Arbustillos, arbustos, o arbolillos. Fijacin de
present. Cyanogenic glycosides present. Sorbitol nitrgeno simbitica presente. Glucsidos
present in trace amounts. Leaves compound cianogenticos presentes. Sorbitol presente en
in Chamaebatia, simple in the other genera. Stipules cantidades traza. Hojas compuestas en Chamaebatia
present. Hypanthium free from ovary. Pistils 1 simples en los dems gneros. Estpulas presentes.
(Cercocarpus, Chamaebatia, Purshia) or 4-many Hipanto libre del ovario. Pistilos 1 (Cercocarpus,
(Cowania, Dryas). Fruit an achene or achenetum. Chamaebatia, Purshia) o 4-muchos (Cowania,
Base chromosome number x=9. Dryas). Fruto aquenio o aquenetum. Nmero de
cromosomas bsico x=9.

Potter et al. 20073

La diferencia entre ambos Cdigos est en el tipo, que se traspasa de forma


inalterable de taxn a taxn.