BIOLOGA CELULAR Y
MOLECULAR 2016 SOLUCIONARIO
CSAR AMANZO
UNIVERSIDAD SAN MARTN DE PORRES - FACULTAD DE MEDICINA
USMP FMH Seminario de Biologa Celular y Molecular 2016 Solucionario
SEMANA 2
SEMINARIO I-1
ORIGEN Y EVOLUCION DE LAS CLULAS
Se ha aceptado desde hace mucho tiempo que la atmsfera de principios del Arcaico era anxica
y probablemente dbilmente reductora, y dominado por especies oxidantes tales como el CO 2,
N2, CO y H2O, con pequeas cantidades de H2, que se habra escapado rpidamente al espacio
exterior. La reduccin de los gases suministrados por la desgasificacin volcnica, como CH 4 y
NH3, habra sido destruida por radiacin UV (fotodisociacin), y pueden haber subsistido slo a
nivel local alrededor de los respiraderos hidrotermales.
La comprensin del origen de la vida fue en gran parte especulativa hasta que la dcada de 1920,
cuando Oparin y Haldane, trabajando independientemente, propusieron un modelo terico para
la "evolucin qumica". El modelo Oparin- Haldane sugiri que, bajo las condiciones fuertemente
reductoras, como se teoriza que fue el estado de la atmsfera de la tierra primitiva (hace 4,0 y
3,5 mil millones aos), las molculas inorgnicas podran formar espontneamente molculas
orgnicas (azcares simples y aminocidos).
En 1953, Stanley Miller, junto con su asesor de
postgrado Harold Urey, prueba esta hiptesis
mediante la construccin de un aparato que
simulaba la tierra primitiva de Oparin-Haldane.
Cuando una mezcla de gases en base a las
predicciones de la atmsfera primitiva fue
calentada y recibi una carga elctrica, se
formaron compuestos orgnicos. Por lo tanto, el
experimento de Miller-Urey demostr cmo
algunas molculas biolgicas, tales como
aminocidos simples, podran haber surgido
abiticamente, a travs de procesos no
biolgicos, en las condiciones que se consideran
similares a los de la tierra primitiva. Este
experimento proporcion la estructura para la
investigacin posterior sobre el origen de la vida.
A pesar de muchas revisiones y adiciones, el
escenario de Oparin-Haldane sigue siendo parte
del modelo en uso hoy en da. El experimento de
Miller-Urey es simplemente una parte del
programa experimental producido por este paradigma.
(http://ncse.com/files/pub/creationism/icons/gishlick_icons1.pdf)
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El experimento se hizo con el fin probar que la sntesis de compuestos orgnicos era
espontnea, a partir de molculas sencillas que se encontraban en la Tierra primigenia.
Partieron de la idea de Alexander Oparin y John Haldane, que dicha Tierra estaba compuesta
principalmente de NH3 (amoniaco), CH4 (metano), H2 (dihidrgeno), siendo estos tres la
composicin de la atmsfera original; H 2O (agua), siendo esta la que simulaba los ocanos.
A
Production of Amino Acids Under Possible Primitive Earth Conditions Stanley L. Miller SCIENCE, Vol. 117 May. 15, 1953
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(The origin of modern terrestrial life. HFSP Journal Vol. 1, September 2007)
3. Qu puede sealar del origen y evolucin temprana de la vida, hasta el surgimiento del
ltimo Ancestro Comn Universal? Resuma.
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que contienen ARN debido a que los contra iones seleccionan las cargas negativas de ARN. Esta
presin osmtica es contrarrestada por la tensin de la membrana, conduciendo a la captacin de
cidos grasos. Este mecanismo podra haber favorecido que las vesculas que contienen molculas
cargadas, tales como el fosfato de ribosa y/o polifosfato, sobre los que contienen molculas neutras.
La encapsulacin de replicadores ARN habra inducido una forma primitiva de competencia entre las
primeras clulas ARN, ya que los que contienen replicadores ms eficientes habran crecido ms
rpido. En estos escenarios, la seleccin natural entre las protoclulas en competencia en la
ausencia de sistemas genticos podra haber sido impulsado originalmente por las caractersticas
fsico-qumicas de los primeros sistemas Por ltimo, el crecimiento de vesculas de membrana genera
un gradiente de pH transmembrana, lo que sugiere que algunas de las caractersticas universales de
los seres vivos podran tener su origen en las caractersticas fsico-qumicas fundamentales.
El ATP (adenosintrifosfato) y otros NTPs (nucletidos trifosfatos), incluyendo muchas bases
modificadas que no se incluyeron posteriormente en el ARN, probablemente se originaron por
primera vez como transportadores de energa en el protometabolismo y como coenzimas
catalizadores de pptidos antes del origen del RNA por s mismo.
Se discute actualmente como las ribozimas pudieron iniciar la reaccin autocataltica y evitarse la
degradacin de los productos, por la gran inestabilidad del ARN.
Durante la evolucin una polimerasa eficiente no slo fue capaz de replicarse a s mismo, sino
tambin logro replicar plantillas de catalizadores que producen ya sea ribozimas (o pptidos) tiles
para el metabolismo de la clula ARN.
Se generaron varios tipos diferentes de sntesis de pptidos catalizados por ribozima, pero slo uno
sobrevivi, llevando al aparato de traduccin moderna con ARNt y ribosomas
Se supone que el cdigo gentico primitivo era ms simple (por ejemplo, con un codn de dos
nucletidos y menos aminocidos) y se expandi en el curso de la evolucin.
Se supone que los mecanismos de transferencia de genes estaban en funcionamiento muy
tempranamente, lo que permiti el intercambio gentico entre clulas de ARN-protena. Este
perodo termin con el establecimiento de los modernos superfamilias de protenas por las diferentes
combinaciones de plegamiento proteico.
El ADN se origin probablemente mucho ms tarde que el ARN, es decir, en el mundo
ribonucleoprotena (tambin llamado "la segunda edad del mundo ARN)
Se supone generalmente que el ADN reemplaz al ARN, ya que es ms estable y se puede replicar
ms fielmente
Se ha propuesto que el ADN primero se origin en los virus como una forma modificada de
ARN para proteger el material gentico viral contra los mecanismos de defensa de la clula
infectada.
Los genomas celulares de ARN seran entonces transformados ms tarde en genomas de
ADN siguiendo el reclutamiento por las clulas de ARN de las enzimas virales para producir
y replicar el ADN, o por la toma de control de las clulas de ARN por virus de ADN que vivan
en un estado de portador
El principio bsico de la divisin celular y la herencia de membrana implica que todas las clulas
modernas se derivan de una sola clula.
Se establece claramente que LUCA (ltimo ancestro comn universal, Last Universal
Common Ancestor, LUCA) no debe confundirse con la primera clula, pero era el producto de
un largo perodo de evolucin. Siendo el ltimo medio de que LUCA fue precedida por una larga
sucesin de antiguos "antepasados".
No hay un consenso sobre la naturaleza de LUCA. Para algunos autores LUCA era un organismo
muy simple, incluso, posiblemente, acelular, mientras que otros consideran que LUCA fue una
bacteria de tipo moderna o incluso un eucariota primitiva con un ncleo.
La identificacin de un conjunto de genes presentes en Archaea, Bacteria y Eukarya ha dado lugar
a la definicin de un contenido mnimo de genes de LUCA.
El conjunto mnimo de protenas incluye un ncleo de protenas ribosomales, aminoacil ARNt
sintetasas y factores de traduccin (tanto para la iniciacin y la elongacin), de tal manera que el
aparato de traduccin ya estaba bien establecido en LUCA.
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Reino Protista.
Los protistas son organismos eucariotas que no pueden ser clasificadas como una planta,
animal, o un hongo.
En su mayora son unicelulares, pero algunos, como las algas, son pluricelulares. Las algas,
o "algas marinas", son protistas pluricelulares que proporciona alimentos, hbitat, y el oxgeno
para numerosos ecosistemas submarinos.
Los protistas mayormente unicelulares y por lo general se desplazan mediante cilios, flagelos,
o por mecanismos ameboides. Usualmente no tienen pared celular, aunque algunas formas
pueden tenerla.
Tienen orgnulos incluyendo un ncleo y pueden tener cloroplastos, por lo que algunos sern
verdes y otros no lo sern.
Son pequeos, aunque muchos son lo suficientemente grandes como para ser reconocido en
un microscopio de diseccin o incluso con una lupa.
Los nutrientes son adquiridos mediante la fotosntesis, la ingestin de otros organismos, o
ambos.
A pesar de que se asemejan a una planta las algas, no se clasifica en el Reino Plantae porque
carece de la complejidad celular de las clulas vegetales.
Los protistas poseen clulas eucariotas y no disponen de rganos o de tejidos diferenciados.
Reino Fungi.
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Los hongos son pluricelulares, con una pared celular, orgnulos, e incluyen un ncleo, pero
no tienen cloroplastos.
No tienen mecanismos de locomocin.
Los hongos varan en tamao desde tamaos microscpicos hasta muy grandes y visibles
sin microscopio.
Los nutrientes son adquiridos por absorcin. En su mayor parte, los hongos adquieren
nutrientes a partir de material en descomposicin.
Reino Plantae.
Son pluricelulares y la mayora no se mueven, aunque los gametos de algunas plantas se
desplazan mediante cilios o flagelos.
Tienen organelas incluyendo ncleo y cloroplastos.
Las paredes celulares estn presentes.
Los nutrientes son adquiridos por la fotosntesis (todos ellos requieren luz solar).
Reino Animal.
Los animales son pluricelulares, y se mueven con la ayuda de los cilios, flagelos, o los
rganos musculares a base de protenas contrctiles.
Tienen orgnulos, incluyendo un ncleo, pero no tienen cloroplastos ni paredes celulares.
Adquieren nutrientes por ingestin.
Reproduccin sexual
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Virus.
Partcula consistente en cido nucleico (ARN o ADN) encerrado en una cubierta proteica,
capaz de replicarse dentro de una clula husped y propagarse de clula a clula.
Prin.
Los priones son partculas infecciosas proteicas, que se forma cuando las protenas normales
se plieguen incorrectamente y aglutinan. El trmino prin (de las primeras letras de partcula
infecciosa proteica) fue propuesta (Prusiner 1982) para distinguir el patgeno infeccioso de
virus o viroides. Los priones se definieron como "pequeas partculas infecciosas
proteinceas que se resisten a la inactivacin por procedimientos que modifican los cidos
nucleicos".
Los priones ('partculas infecciosas proteinceas') son los agentes infecciosos no
convencionales que consisten en una molcula proteca prinica mal plegada (PrP); en su
estado mal plegado, las molculas se agregan entre s e imponen su estructura anmala en
las molculas de PrP benignos. Los priones actan como plantillas de corrupcin (semillas)
que incitan una reaccin en cadena de mal plegamiento y la agregacin de PrP. Los priones
crecen, se fragmentan y propagan, perturbando la funcin del sistema nervioso y en ltima
instancia causan la muerte del individuo afectado.
La protena prin anormal (PrPsc) tiene una abundancia de hojas beta.
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No - ir a 3
2. Podra ser una planta o un protista, o una bacteria azul-verde. Asegrese de que el verde es realmente parte del organismo,
sin embargo. Un animal podra haber comido algo verde, por ejemplo.
Unicelular? ir a 6
Multicelular? Plantae. Busque paredes celulares, estructura interna. En el microscopio compuesto podra ser capaz de
ver los cloroplastos.
4. Podra ser un monera o un protista?. Puedes ver algn detalle dentro de la clula?
S - Protista. Usted debe ser capaz de ver al menos un ncleo y/o vacuola contrctil, y una forma definida. El movimiento
debe estar presente, con cilios, flagelos, o el movimiento ameboide. Los cilios o flagelos pueden ser difciles de ver.
No - Monera. En caso de ser bastante pequeo. Puede ser en forma de guiones cortos (varillas), pequeos puntos (cocos),
o curvado o espiral en forma. El ms grande de ellos que se encuentra comnmente en el agua dulce se llama Spirillum
volutans. Es en forma de espiral, y puede ser casi un milmetro de largo. Excepto por Spirillum, es muy difcil ver mneras
excepto en un microscopio compuesto con una iluminacin especial.
No - Hongo. En caso de ser ramificado, filamentos incoloros. Puede tener algn tipo de cuerpo fructfero (las setas es un
tipo de hongo, no se olvide). Por lo general, unido a alguna pieza de materia en descomposicin - pueden formar un
recubrimiento difuso en o alrededor de un objeto. En el agua, algunas infecciones bacterianas de los peces y otros animales
y bacterias de cido lctico vivos para el intestino del beb. A diferencia de otras bacterias, stas
pueden ser confundidos con un hongo.
parecen ser adaptados de forma nica para residir en el tracto digestivo humano e interactuar
6. Lo ms probable Protista. Si consiste en largos filamentos verdosos, no ramificados sin estructura aparente en el interior, son
con nosotros en simbiosis desde el momento en que nacemos. Tradicionalmente se ha
bacterias azul-verde (a veces errneamente llamadas algas verde-azules), un Monera. La mayora de los protistas verdes son
considerado que selasmueven
flagelados, es decir, bacterias presentes
rpidamente en la leche
con un movimiento materna
en espiral. A menos que fueron
usted adquiridas
consiga que se por mera
detengan,
realmente no se puede ver los flagelos. Tenga cuidado con las colonias de protistas, sin embargo, como Volvox, que forma una
contaminacin de la piel
bola giratoria de clulas verdes. No se deje engaar pensando que es una planta.
Recuerde, cuanto ms se observa el organismo, mayor seguridad de que pueda ser. Muchos seres vivos tienen etapas que se
parecen a los miembros de otro Reino.
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(http://www.ruf.rice.edu/~bioslabs/studies/invertebrates/kingdoms.html)
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Sin embargo, se ha encontrado que los lactobacilos y enterococos aislados presentes en la leche
humana son genotpicamente diferente de los aislados en la piel dentro del mismo husped.
Adems, varios estudios sugieren la existencia de una microbiota mamaria durante la ltima
etapa del embarazo y la lactancia. Bacterias en vivo desde el intestino materno podran colonizar
la glndula mamaria a travs de una ruta endgena (la llamada va entero-mamaria), con clulas
dendrticas y macrfagos maternos.
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SEMANA 3
SEMINARIO I-2
COMPOSICIN Y ORGANIZACIN MOLECULAR DE LA MEMBRANA CELULAR.
Las bicapas formadas por lpidos con colas hidrocarbonadas cortas seran
mucho ms fluidas. Las bicapas tambin seran menos estables, ya que las
colas ms cortas seran menos hidrofbicas y, por lo tanto, las fuerzas que
impulsan la formacin de la bicapa se reduciran.
C. Todas las cadenas de hidrocarburos son saturadas.
Las bicapas formadas por lpidos con colas hidrocarbonadas saturadas seran
mucho menos fluidas. Considerando que una bicapa lipdica normal tiene la
viscosidad del aceite de oliva, una bicapa de lpidos hecho con colas de
hidrocarburos saturados tendra la consistencia de la grasa de tocino.
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En una protena transmembrana con una estructura alfa-hlice, debido a que el agua
est ausente en el interior de la bicapa, los tomos que forman la columna vertebral son
impulsados para formar enlaces de hidrgeno uno con otro en el interior de la hlice.
Los enlaces de hidrgeno se maximizan si la forma
de la cadena del polipptido es el de una hlice alfa
regular, y as la gran mayora de los segmentos que
atraviesan la membrana son cadenas
polipeptdicas organizadas como hlices-alfa.
En estas hlices-alfa transmembrana, las cadenas
laterales hidrofbicas estn orientadas hacia la
parte externa de la hlice, donde entran en contacto
con las colas de los lpidos hidrofbicos, mientras
que los tomos en el interior de la hlice forman
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El orden es: CO2 (pequea y no polar) > etanol (pequea y ligeramente polar) >
H2O (pequea y polar) > glucosa (grande y polar) > Ca2 + (pequea y cargada) >
ARN (muy grande y muy cargada). Esta lista muestra claramente las dos
propiedades bsicas que rigen la capacidad de las molculas para difundir a
travs de una bicapa lipdica: el tamao (pequeo > grande) y la polaridad (no
polar > polar > cargado).
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Cuatro mecanismos bsicos por los que las molculas del soluto se
mueven a travs de membranas. Los tamaos relativos de las letras
indican las direcciones de los gradientes de concentracin.
(A) La difusin simple a travs de la bicapa, que procede siempre de mayor a
menor concentracin.
(B) La difusin simple a travs de un canal acuoso formado dentro de una
protena de membrana o un grupo de tales protenas. Al igual que en una, el
movimiento es siempre hacia abajo un gradiente de concentracin.
(C) La difusin facilitada en el que las molculas del soluto se unen
especficamente a una protena transportadora de membrana (un transporte
facilitado). Al igual que en A y B, el movimiento es siempre de mayor a menor
concentracin.
(D) El transporte activo por medio de una protena transportadora con un sitio
de unin especfico que se somete a un cambio en la afinidad impulsado con
energa liberada por un proceso exergnico, tal como la hidrlisis de ATP. El
movimiento se desarrolla en contra de un gradiente de concentracin.
(Cell and Molecular Biology. Concepts and Experiments / Gerald Karp, 7th Edition, 2013)
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SEMANA 4
SEMINARIO I-3
CITOPLASMA, CITOESQUELETO, MATRIZ EXTRACELULAR
Las mitocondrias (F) estn presentes en mayor nmero, usualmente miles por
cada clula.
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2. En cul de los siguientes tipos de clulas Usted espera una alta densidad de
filamentos intermedios citoplasmticos? Explique su respuesta.
a. Amoeba proteus (una ameba de vida libre).
b. Clula epitelial de la piel humana.
c. Clula muscular lisa en el tracto digestivo de un vertebrado.
d. Clula nerviosa en la mdula espinal de un ratn.
e. Espermatozoide humano.
f. Clula vegetal.
Las clulas que migran rpidamente de un lugar a otro, como las amebas (A) y
clulas espermticas (E), no necesitan filamentos intermedios en su citoplasma, ya
que no desarrollan o mantienen grandes fuerzas de traccin. Las clulas vegetales
(F) son empujadas y tiradas por las fuerzas del viento y el agua, pero se resisten a
estas fuerzas a travs de sus paredes celulares rgidas hechas a base de celulosa,
ms que por su citoesqueleto.
Las clulas epiteliales (B), clulas de msculo liso (C), y los largos axones de
las clulas nerviosas (D) son ricos en filamentos intermedios citoplasmticos,
que les impiden la rotura a medida que se estiran y comprimen por los movimientos
de los tejidos circundantes.
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(Cell and Molecular Biology. Concepts and Experiments. 7 th Edition. Gerald Karp 2013)
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CONTRACCION MUSCULAR:
o Los filamentos delgados son regulados por la unin de cationes calcio a la
troponina C, y envuelve va el complejo de troponinas- el movimiento de la
tropomiosina hacia el surco del filamento delgado, removiendo el bloqueo
estrico que obstaculiza el enlazamiento de las cabezas de miosina a las
molculas de actina.
o Los filamentos delgados exhiben dos estados estructurales:
Estado desactivado, en el cual la tropomiosina bloquea el sitio de
enlazamiento de la miosina a las molculas de actina.
Estado activado en el cual la tropomiosina se mueve fuera del surco
descubriendo el sitio de enlazamiento de miosina.
o Al inicio del ciclo, la cabeza de la miosina, que carece de un nucletido unido,
se encuentra estrechamente unida al filamento de actina (estado I).
o La unin de ATP a la cabeza de la miosina, reduce la afinidad de la cabeza de
la miosina por la actina (estado II). La hidrlisis parcial del ATP (durante la cual
ADP y Pi permanecen unidos a la miosina), activa la cabeza de la miosina, la
que experimenta un cambio conformacional y se desplaza respecto del filamento
fino (estado III).
o La miosina activada contacta a una molcula de actina y se une a ella
producindose la liberacin de Pi (estado IV).
o Una vez unida a actina, la cabeza de la miosina experimenta un nuevo cambio
conformacional que se traduce en un desplazamiento del filamento fino y en la
liberacin de ADP (estado V).
o De esta manera, cada cabeza de miosina se desplaza hacia el extremo (+) del
filamento fino adyacente. Mientras la concentracin de Ca++ sea alta y exista
ATP disponible, los ciclos de formacin de puentes actina-miosina continan y
el sarcmero contina contrayndose.
o En ausencia de ATP, el complejo actina-miosina se estabiliza, fenmeno que
explica el "rigor mortis"
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(Molecular biology of the cell / Bruce Alberts, et.al. Sixth edition. 2015)
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SEMANA 5
SEMINARIO I-4
MOTILIDAD NO MUSCULAR. HUSO ACROMTICO
En contraste con los motores de miosina II, que trabajan en conjunto y se unen slo
transitoriamente a los filamentos de actina a fin de no interferirse unos con otros, la
miosina V se mueve continuamente, a lo largo de los filamentos de actina y sin dejar
de hacerlo. Las funciones de la Miosina V estn bien estudiados en la levadura
Saccharomyces cerevisiae, que se somete a un patrn estereotpico de crecimiento y
divisin denominada gemacin. Filamentos de actina en la clula madre en el punto
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(Molecular biology of the cell / Bruce Alberts, et.al. Sixth edition. 2015)
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2. Describa los pasos tomados por una clula de mamfero al arrastrarse sobre un
sustrato.
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Las secuencia repetitiva de las actividades que se produce cuando una clula se
arrastra sobre el substrato
Paso 1 Protrusin del borde anterior de la clula en forma de un lamelipodio.
Paso 2 Adherencia de la superficie ms baja del lamelipodio al sustrato, una unin
que est mediada por las integrinas que residen en la membrana plasmtica. La
clula utiliza esta unin para sujetar el sustrato.
Paso 3 Movimiento de la mayor parte de la clula hacia delante sobre el sitio de
unin, que permanece relativamente estacionario Este movimiento se consigue
mediante una fuerza (traccin) contrctil ejercida contra el sustrato.
Paso 4 Clula despus que las uniones con el sustrato se han cortado y la parte
posterior de la clula es tirada hacia delante.
(Cell and Molecular Biology Concepts and Experiments Gerald Karp 6th edition, 2010).
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En las clulas, la mayor parte de las subunidades de actina estn unidos a timosina,
que bloquea la actina en una forma que no puede hidrolizar su ATP unido y no puede
ser agregado a cualquier extremo de un filamento. La timosina reduce la
concentracin de subunidades de actina libre alrededor de la concentracin crtica.
Las subunidades de actina son reclutadas de este grupo inactivo por profilina, cuya
actividad es regulada de modo que la polimerizacin de la actina ocurre cuando y
donde sea necesario. La ventaja de tal disposicin es que la clula puede mantener
un gran nmero de subunidades para un crecimiento explosivo en los sitios y los
tiempos de su eleccin.
(Molecular Biology of The Cell. Bruce Alberts. Fifth Edition, 2008)
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(Cell and Molecular Biology Concepts and Experiments Gerald Karp 6th edition, 2010).
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La clula ciliada normal est compuesta por unas 250 protenas organizadas en
torno a un axonema o conjunto de microtbulos que se extienden desde el
citoplasma hasta el extremo final del cilio.
El cilio normal consiste en un par central de microtbulos rodeados por una vaina
y otros 9 dobletes externos formando la organizacin caracterstica 9+2
(AXONEMA).
Los complejos de dinena se asocian a los dobletes perifricos, los puentes de
nexina sostienen los dobletes perifricos entre s y los rayos radiales (radial
spoke) unen el par central con los perifricos.
Los microtbulos y sus protenas asociadas estn anclados en el citoplasma
apical de la clula por un complejo de 9 tripletes de microtbulos.
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SEMANA 6
SEMINARIO I-5
MITOCONDRIAS. ADN MITOCONDRIAL
ESPACIO INTERMEMBRANA
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MATRIZ MITOCONDRIAL
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ESPACIO INTERMEMBRANA
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Estructuras de tres tipos de transportadores de electrones en sus formas oxidados y reducidos. (a) FMN de
NADH deshidrogenasa, (b) el grupo hem del citocromo c, y (c) la ubiquinona (coenzima Q). Los grupos hem
de los diferentes citocromos de la cadena transportadora de electrones difieren en las sustituciones en los
anillos de porfirina (indicados por el sombreado azul) y el tipo de unin con la protena.
Los citocromos slo pueden aceptar un electrn, mientras que FMN y las quinonas pueden aceptar dos
electrones y dos protones en reacciones sucesivas, como se muestra. FAD difiere de FMN en que tiene un
grupo de adenosina unido al fosfato.
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SEMANA 7
SEMINARIO I-6
LISOSOMAS. MUERTE CELULAR. APOPTOSIS Y NECROSIS
CONCEPTOS PREVIOS
Los lisosomas juegan un rol clave en el recambio de organelas, regulan la
destruccin de las organelas por s mismas y su reemplazo. Una mitocondria
tiene una vida media de 10 das
Las hidrolasas cidas son enzimas hidrolticas que son activas en
condiciones cidas.
Una H+ ATPasa en la membrana bombea H + hacia el interior del lisosoma,
manteniendo el lumen con un pH cido.
La bomba bomba H+ lisosomal pertenece a la familia de ATPasas tipo V y
tiene una arquitectura similar a la de las ATP sintasas de ATP (ATPasas tip-
F) mitocondriales y cloroplsticas, que convierten la energa acumulada en
los gradientes de H+ en ATP.
En contraste con estas enzimas, la ATPasa H+ vacuolar trabaja
exclusivamente a la inversa, bombeando
H+ dentro de la organela. Similares o
idnticas ATPasas tipo-V acidifican todas
las organelas endocticas y exocticas,
incluyendo lisosomas, endosomas,
algunos compartimentos del aparato de
Golgi y muchas vesculas de transporte y
vesculas secretoras. Adems de
proporcionar un entorno de pH bajo que es
adecuado para las reacciones que se
producen en el lumen del orgnulo (Lumen:
espacio interior de una estructura tubular), el
gradiente de H+ proporciona una fuente de
energa que impulsa el transporte de
pequeos metabolitos a travs de la
membrana de la organela.
AUTOFAGIA
La autofagia, una ruta catablica conservadas evolutivamente en las clulas
eucariotas, juega un papel importante en la respuesta al estrs y la
degradacin de los componentes citoslicos daados.
Hay tres tipos generales de autofagia que puede entregar materiales
intracelulares
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La organela es rodeada por una doble membrana que produce una estructura
denominada autofagosoma.
La membrana externa mitocondrial se fusiona con el lisosoma para
producir un autofagolisosoma en el cual la organela es degradada y los
productos de la degradacin se hacen disponibles para la clula.
En condiciones de ayuno grandes porciones de citosol son capturadas de
forma no selectiva en autofagolisosomas.
Los metabolitos derivados de la digestin del material capturado contribuyen
a la supervivencia celular cuando la disponibilidad de nutrientes externos es
limitada.
Se calcula que una mitocondria experimenta autofagia cada 10 minutos (ej.
Hepatocito).
Si la clula es deprivada de nutrientes, se observa un marcado incremento
en la autofagia.
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(Essential cell biology / Bruce Alberts [and seven others]. -- Fourth edition. 2014).
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(Cell and Molecular Biology Concepts and Experiments Gerald Karp 7th edition, 2013).
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Al activarse por la unin del ligando de Fas, los dominios de muerte en las
colas citoslicas de los receptores de muerte Fas unen protenas
adaptadoras intracelulares, que a su vez se unen a caspasas iniciadoras
(caspasa-8 principalmente), formando un complejo sealizador inductor de
muerte (DISC).
Una vez dimerizadas y activadas en el DISC, las caspasas iniciadoras
escinden sus parejas y luego activan las caspasas ejecutoras posteriormente
para inducir la apoptosis.
o En algunas clulas, la va extrnseca recluta a la va apopttica
intrnseca para amplificar la cascada de caspasas y matar a la clula.
o Muchas clulas producen protenas inhibidoras que actan
restringiendo la va extrnseca.
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Las tres clases de protenas de la familia Bcl2. Tener en cuenta que el dominio
BH3 es el nico dominio BH compartida por todos los miembros de la familia
Bcl2; que media las interacciones directas entre los miembros de la familia pro-
apoptticas y miembros de la familia anti-apoptticas.
(Molecular Biology of The Cell. Bruce Alberts. Sixth Edition, 2015)
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apoptosis. Cmo las imgenes confirman las diferencias entre los dos
procesos? Explique su respuesta.
NEURONA NECRTICA
NEURONA APOPTTICA
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SEMANA 9
SEMINARIO II-1
TRANSPORTE INTRACELULAR
1. Describa los pasos que se producen entre el momento en que un ribosoma se une a un
ARN mensajero que codifica una protena de secrecin y el momento en que una protena
abandona el Retculo Endoplsmico Rugoso (RER).
Todas las protenas de secrecin son sintetizadas por ribosomas citoslicos, el trfico
diverge en dos ramales principales. En cada una de las estaciones intermedias por las
que pasa la protena hasta su destino final, se realiza una decisin de s la protena se
queda retenida en ese compartimento o sigue hasta su destino final. En la mayora de
las ocasiones se necesita una seal determinada, pero tambin hay seales por defecto
(en ausencia de seal).
La hiptesis de la seal.
Una protena se dirige al Retculo Endoplasmtico (RE) mediante una secuencia de
seal, un tramo corto de aminocidos que, por lo general est en su amino terminal.
(Clulas. Lewin. 2da Edicin. 2011)
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Cmo una protena transmembrana de paso nico con una secuencia seal de RE
escindido est integrado en la membrana del RE?.
En esta protena, el proceso de translocacin co-traduccional se inicia por una
secuencia de seal de RE N-terminal (rojo) que funciona como una seal de inicio de
transferencia, abriendo el translocador como se muestra en la figura. Adems de esta
secuencia de transferencia de inicio, la protena tambin contiene una secuencia de
detencin de transferencia (naranja); cuando esta secuencia entra en el translocador e
interacta con un sitio de unin dentro del poro, el translocador se abre en la costura y se
descarga la protena lateralmente en la bicapa lipdica, donde la secuencia de parada de
transferencia permanece para anclar la protena en la membrana. (En esta figura los
ribosomas se han omitido para mayor claridad.)
(Molecular Biology of The Cell. Bruce Alberts. Sixth Edition, 2015)
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2. Cmo logra una protena integral recin sintetizada insertarse en una membrana?
Todas estas protenas se dirigen inicialmente al RE por una secuencia seal de RE,
un segmento de ocho o ms aminocidos hidrfobos, que tambin est implicada en
el proceso de translocacin a travs de la membrana.
No todas las protenas producidas por los ribosomas unidos al RE se liberan en la luz
del RE. Algunas permanecen incrustadas en la membrana del RE como protenas
transmembrana. El proceso de translocacin de estas protenas es ms complicado
de lo que es para las protenas solubles, debido a que algunas partes de la cadena
del polipptido deben ser trasladadas por completo a travs de la bicapa lipdica,
mientras que otras partes permanecen fijas en la membrana.
o En el caso ms simple, la de una protena transmembrana con un solo
segmento que abarca la membrana, la secuencia seal N-terminal inicia la
translocacin como lo hace para una protena soluble.
o Pero el proceso de transferencia se detiene por una secuencia adicional de
aminocidos hidrofbicos, una secuencia de detencin de transferencia,
localizado a lo largo de la cadena polipeptdica.
o En este punto, el canal de translocacin libera la cadena polipeptdica en
crecimiento hacia los lados en la bicapa lipdica.
o La secuencia seal N-terminal se escinde, mientras que la secuencia de
detencin de transferencia permanece en la bicapa, atraviesa la membrana
mediante un segmento -helicoidal que ancla la protena en la membrana.
o Como resultado, la protena termina como una protena transmembrana de
paso nico insertado en la membrana con una orientacin de la N-terminal
definido en el lado luminal de la bicapa lipdica y el C-terminal en el lado
citoslico.
o Una vez insertada en la membrana, una protena transmembrana no cambia
su orientacin, que se conserva a lo largo de cualquier evento posterior de
gemacin y fusin.
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(Essential cell biology / Bruce Alberts [and seven others]. -- Fourth edition. 2014).
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3. Describa algunas de las maneras en que las organelas membranosas pueden mantener
sus composiciones nicas a pesar del continuo trfico de membranas y materiales que
se desplazan a travs de ellas.
Los estudios sugieren que las protenas se mantienen en una organela por una
combinacin de dos mecanismos:
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Las protenas residentes de RE solubles, tales como BiP, tambin contienen una
breve seal de recuperacin de RE en su extremo C-terminal, pero es diferente:
se compone de una Lys-Asp-Glu-Leu o una secuencia similar. Si esta seal
(llamada la secuencia KDEL) se elimina de BiP por ingeniera gentica, la
protena es secretada lentamente de la clula. Si la seal se transfiere a una
protena que normalmente se secreta, la protena ser devuelta ahora de manera
eficiente al RE donde se acumular.
La va de la recuperacin KDEL explica slo en parte cmo se mantienen las
protenas residentes del RE en el RE. Como se mencion, las clulas que
expresan las protenas residentes modificadas genticamente del RE, donde la
secuencia KDEL se ha eliminado experimentalmente, secretan estas protenas.
Pero la tasa de secrecin es mucho ms lenta que para una protena secretora
normal.
Parece que un mecanismo que es independiente de la seal KDEL normalmente
retiene las protenas residentes RE y que slo las protenas residentes que
escapan a este mecanismo de retencin son capturadas y se devuelve a travs
del receptor KDEL.
La va de recuperacin para regresar protenas escapadas de nuevo al RE
depende de las seales de recuperacin de RE. Las protenas de membrana RE
residentes, por ejemplo, contienen seales que se unen directamente a cubiertas
COPI y por lo tanto se empaquetan en vesculas de transporte COPI recubiertos
para la entrega retrgrada de RE. La seal de recuperacin mejor caracterizada
de este tipo consta de dos lisinas, seguido de cualquier otros dos aminocidos, en
el extremo C-terminal de la protena de membrana del RE.
(Molecular Biology of The Cell. Bruce Alberts. Sixth Edition, 2015)
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Las secuencias seal son necesarias y suficientes para dirigir una protena a un
determinado destino.
Una vez que una vescula de transporte ha alcanzado su objetivo, debe reconocer
y acoplarse con su organela especfica. Slo entonces puede fusionarse la
membrana de la vescula con la membrana diana y efectuar la descarga vesicular.
La impresionante especificidad del transporte vesicular sugiere que cada tipo de
vescula de transporte en la clula muestra marcadores moleculares en la
superficie que identifican la vescula segn su origen y la carga. Estos marcadores
deben ser reconocidos por los receptores complementarios en la membrana diana
apropiada, incluyendo la membrana plasmtica.
El proceso de identificacin depende de una diversa familia de GTPasas
monomricas llamadas protenas Rab.
Las protenas Rab especficas sobre la superficie de cada tipo de vescula son
reconocidas por las correspondientes protenas de anclaje en la superficie
citoslica de la membrana diana.
Cada organela y cada tipo de vescula de transporte lleva una combinacin nica
de protenas Rab, que sirven como marcadores moleculares para cada tipo de
membrana.
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SEMANA 10
SEMINARIO II-2
1. Seala las funciones de cada una de las estructuras mencionadas en la siguiente tabla
relacionando las caractersticas estructurales de la molcula y la funcin que cumplen:
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Uniones gap.
(A) Un dibujo de las membranas plasmticas de interaccin de dos clulas adyacentes conectadas por
uniones comunicantes. Cada bicapa lipdica se muestra como un par de lminas rojas. Protenas de
ensamblaje denominadas conexones (verde), cada uno de los cuales est formado por seis subunidades
de conexinas, que penetran en las bicapas lipdicas yuxtapuestas. Dos conexones se unen a travs del
espacio intercelular para formar un canal acuoso continuo que conecta las dos clulas. (B) La organizacin
de conexinas en conexones y de los conexones en canales intercelulares. Los conexones pueden ser
canales homomricos o heteromricos, y los canales intercelulares puede ser homotipicos o heterotpicos.
(C) La estructura de alta resolucin de un canal de hendidura homomrico, determinado por cristalografa
de rayos X de la conexina humana. En esta vista, estamos mirando hacia abajo en el poro, formado a partir
de seis subunidades de conexina. La estructura ilustra las caractersticas generales del canal y sugiere un
tamao de poro de aproximadamente 1,4 m, como se predijo a partir de estudios de permeabilidad GAP-
unin con molculas de varios tamaos.
(Molecular Biology of The Cell. Bruce Alberts. Sixth Edition, 2015)
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2. Se requiere una fuerza de unos 20 piconewtons (pN) para tirar de una protena
transmembrana como P-selectina de una bicapa lipdica pura. Para tirar de una molcula
de P-selectina fuera de la membrana plasmtica se requiere ms de 110 pN. Por qu
crees que se necesita mucha ms fuerza para tirar de P-selectina fuera de la membrana
plasmtica que fuera de una bicapa lipdica?
CONSIDERACIONES PREVIAS:
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PROTEOGLICANOS
Las membranas basales y otras matrices extracelulares suelen contener grandes
cantidades de un tipo distintivo de complejo protena-polisacrido llamado
proteoglicano.
Un proteoglicano consiste en una molcula de protena ncleo a la que las
cadenas de glicosaminoglicanos (GAGs) se unen covalentemente. Cada cadena
de glicosaminoglicano se compone de un disacrido de repeticin; es decir, que
tiene la estructura -ABABA-, donde A y B representan dos azcares diferentes.
Los GAGs son muy cidos debido a la presencia de ambos grupos sulfato y
carboxilo unidos a los anillos de azcar.
Debido a las cargas negativas presentes en los GAGs sulfatados, los
proteoglicanos se unen un gran nmero de cationes, que a su vez se unen un gran
nmero de molculas de agua.
Como resultado, los proteoglicanos forman un gel poroso, hidratado que llena el
espacio extracelular como material de embalaje y resistente a las fuerzas de
aplastamiento (compresin).
Esta propiedad complementa la de las molculas de colgeno adyacentes, que
resisten fuerzas de traccin y proporcionan un andamio para los proteoglicanos.
Juntos, colgenos y proteoglicanos ofrecen al cartlago y a otras matrices
extracelulares fuerza y resistencia a la deformacin.
La matriz extracelular del hueso adems se compone de colgeno y
proteoglicanos, pero se endurece mediante impregnacin con sales de fosfato de
calcio.
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Los GAG se clasifican de acuerdo con el tipo de disacrido repetitivo que contienen. Los
grupos sulfato estn aadidos en las posiciones puestas de relieve en los disacridos.
(Lewins cells. 3rd ed. 2015)
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Las lamininas son una familia de glicoprotenas extracelulares que constan de tres
cadenas polipeptdicas diferentes unidos por enlaces disulfuro y organizados en
una molcula semejante a una cruz con tres brazos cortos y un brazo largo.
o Al menos 15 diferentes lamininas han sido identificadas.
Al igual que la fibronectina, la laminina extracelular puede influenciar gran medida
el potencial de una clula para la migracin, el crecimiento y la diferenciacin. Por
ejemplo, las lamininas desempean un papel fundamental en la migracin de
clulas germinales primordiales.
Estas clulas se encuentran en el saco vitelino, que se encuentra fuera del propio
embrin, y luego migran a travs del torrente sanguneo de los tejidos y embriones
a la gnada en desarrollo, donde finalmente dan lugar a los espermatozoides o los
vulos.
Durante su migracin, las clulas germinales primordiales atraviesan superficies
que son particularmente ricas en laminina.
Los estudios indican que las clulas germinales primordiales poseen una protena
de la superficie celular que se adhiere fuertemente a una de las subunidades de
la molcula de laminina
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Fibronectina
Un modelo del andamio de la membrana basal. Las membranas basales contienen dos molculas
formando una red, de colgeno IV (rosa), y laminina (verde), que est indicado por las molculas en
forma de cruz engrosadas. Las redes de colgeno y lamininas estn conectadas por molculas de
entactina (prpura)
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SEMANA 12
SEMINARIO II-3
Las clulas pueden detectar seales tanto qumicas como fsicas. Las seales fsicas por lo
general se convierten en seales qumicas a nivel del receptor
Comunicacin
Comunicacin Explicacin
humana
Autocrina Hablar consigo La clula que produce el mensaje expresa receptores en su
mismo superficie capaces de responder a ese mensajero.
En algunos casos, las clulas pueden responder a los
mediadores locales que ellas mismos producen.
En consecuencia, las clulas que liberan el mensaje se
estimularn (o inhibirn) a s mismas
Paracrina Hablar con Las molculas mensajeras viajan slo distancias cortas a
personas travs del espacio extracelular a las clulas que se encuentran
durante una en las proximidades de la clula que genera el mensaje.
fiesta En lugar de entrar en el torrente sanguneo, las molculas de
seal difunden localmente a travs del fluido extracelular, que
queda en la vecindad de la clula que la secreta.
Actan como mediadores locales en las clulas cercanas.
Muchas de las molculas seal que regulan la inflamacin en el
sitio de una infeccin o el control de la proliferacin celular en
la curacin de heridas funcionan de esta manera.
Las molculas mensajeras paracrinas generalmente estn
limitadas en su capacidad para viajar por todo el cuerpo, ya
que son inherentemente inestables, o son degradados por las
enzimas, o se unen a la matriz extracelular.
Endocrina Un anuncio en Las molculas mensajeras alcanzan sus clulas diana por
la radio medio del paso a travs del torrente sanguneo.
Los mensajeros endocrinos tambin se denominan hormonas,
y por lo general actan sobre las clulas diana localizadas en
sitios distantes en el cuerpo
Las molculas de sealizacin extracelular utilizadas de esta
manera se denominan hormonas, y, en los animales, las
clulas que producen hormonas se llaman clulas endocrinas.
En los organismos multicelulares, el estilo ms "pblico" de la
comunicacin de clula a clula implica transmitir la seal a lo
largo de todo el cuerpo mediante la secrecin en el torrente
sanguneo de un animal o la savia de la planta.
Sealizacin Una Al igual que las clulas endocrinas, las clulas nerviosas
sinptica conversacin (neuronas) pueden transmitir mensajes a travs de largas
telefnica distancias.
En el caso de la sealizacin neuronal, un mensaje no se
difunde ampliamente, pero en su lugar se entrega rpida y
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(Cell and Molecular Biology Concepts and Experiments Gerald Karp 7th edition, 2013).
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Ejemplos:
Receptores acoplados a protenas G (GPCR)
o Una gran familia de receptores que contienen siete -hlices
transmembrana.
o Promueven la activacin de protenas de unin a GRTP heterotrimricas
llamadas protenas G, que se asocian con la cara interna de la membrana
plasmtica y transmiten seales hacia mltiples protenas intracelulares.
(http://1.bp.blogspot.com/-PK7YlKuJEoA/Un5ZLygSjrI/AAAAAAAAHhc/gh4DfstAndc/s1600/%25C3%259Cbersicht+GPCR+Liganden.png)
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(http://4.bp.blogspot.com/-zfuM9lBDo4Y/UHLVdZ7mSgI/AAAAAAAAC5Y/7RP7gsvuDgs/s1600/%C3%9Cbersicht+Effekt+G%C2%B4Proteine.jpg)
http://www.nature.com/nrc/journal/v7/n2/images/nrc2069-f1.jpg
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(http://www.vi.cl/gepe/12-05.jpg)
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Otras enzimas que atraviesan una sola vez la membrana, como la guanil ciclasa,
tienen una estructura general similar a las protena cinasas receptoras pero
diferentes actividades enzimticas.
La adenil ciclasa cataliza la conversin de ATP en 3:5-AMT cclico, que se usa
para propagar la seal.
La guanil ciclasa cataliza la conversin de GTP en 3:5-GMT cclico, que se usa
para propagar la seal.
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Fosfoprotena fosfatasas
o Revierten el efecto de las protena cinasas al eliminar los grupos fosforilo
aadidos por estas ltimas.
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Existe una serie de otros tipos de receptores que actan por mecanismos nicos.
Algunos de estos receptores, por ejemplo, los receptores de clula B o T que estn
implicadas en la respuesta a antgenos extraos, se asocian con molculas de
sealizacin conocidas como las protena-tirosina quinasas citoplasmticas.
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Los receptores rara vez actan de manera directa sobre los procesos
intracelulares que finalmente regulan.
Los receptores inician una secuencia de eventos reguladores que comprenden
protenas intermediarias y molculas pequeas.
El uso de vas de emisin de seales de mltiples pasos permite a las clulas
amplificar seales, ajustar la cintica de emisin de seales, insertar puntos de
control, integrar seales mltiples, y mandar seales a distintos efectores.
Las vas ramificadas otorgan a las clulas la capacidad para integrar mltiples
seales entrantes, y dirigir informacin hacia los puntos de control correctos. La
ramificacin puede ser convergente, con regulacin de puntos terminales
comunes por seales mltiples, o divergente, con ramificacin de una va nica
para controlar ms de un proceso.
(Cell and Molecular Biology Concepts and Experiments Gerald Karp 7th edition, 2013).
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Las entradas de estas redes son los receptores que captan las seales del exterior
y que suelen tener un dominio extracelular, un dominio transmembrana y un
dominio intracelular.
Estos receptores pueden unir molculas especficas llamadas ligandos solubles o
interactuar con otros receptores de membrana de otras clulas.
Muchos receptores al unir su ligando cambian la conformacin de su porcin
intracelular que se activa.
Esta activacin puede realizar un cambio qumico especfico (frecuentemente
fosforilacin) sobre alguna protena intracelular.
Una vez fosforilada la protena, sta tiene capacidad para modificar (fosforilar) a
otras protenas que a su vez modifican a otras y as sucesivamente.
Estas cascadas de sealizacin se entrecruzan unas con otras dibujando unas
complejas redes que son capaces de integrar la informacin de los estmulos y
estados externos e internos.
En estas cascadas de sealizacin se suele producir un proceso de amplificacin
de la seal ya que cada elemento activa a ms de uno, y segn avanzamos de
nivel puede haber ms elementos involucrados.
Para limitar en el tiempo la accin de la seal y preparar la red para detectar
nuevos estmulos se necesita que acten las fosfatasas que retiran el fsforo de
las quinasas inactivndolas.
Un fino equilibrio entre la accin de quinasas y fosfatasas es clave en las redes de
fosforilacin.
( http://medmol.es/temas/70/ )
Las clulas diana pueden utilizar una gran variedad de mecanismos intracelulares,
incluyendo los circuitos de retroalimentacin, para ajustar la forma en la que
responden a seales extracelulares.
Los circuitos de retroalimentacin positiva pueden ayudar a la clula a responder de
forma todo o nada a un incremento gradual en la concentracin de una seal
extracelular o a convertir una seal de corta duracin en una respuesta de larga
duracin o incluso irreversible.
La retroalimentacin negativa retrasada permite a la clula desensibilizarse a una
molcula seal, lo cual posibilita responder a pequeas variaciones de la
concentracin de la molcula seal en un amplio rango de concentraciones.
(Molecular Biology of the Cell / Bruce Alberts [et al.].-- 5th ed. 2008).
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(Cell and Molecular Biology Concepts and Experiments Gerald Karp 7th edition, 2013).
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(Cell and Molecular Biology Concepts and Experiments Gerald Karp 7th edition, 2013).
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5. Los receptores nucleares tienen un sitio de unin para una molcula seal y para una
secuencia de ADN. Cmo es posible que receptores nucleares idnticos en diferentes
clulas puedan activar genes diferentes cuando se unen a una misma molcula seal?
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