Anda di halaman 1dari 9

28/09/2016

Pendahuluan
Sistem Endomembran disusun oleh berbagai membran
yang tersuspensi di sitoplasma sel eukariotik.
Membran tersebut membagi sel menjadi kompartemen yang
struktural dan fungsional organel
Retikulum endoplasma, Badan Golgi, Endosom, Lisosom, Vakuola
Biologi Sel dan Molekuler
Sel prokariot tidak memiliki sistem endomembran
5. Sistem Endomembran
Lab. Genetika dan Biologi Molekuler
Prodi Biologi FMIPA UNPAD
2016

Pendahuluan Sistem Endomembran


Organel pada sistem endomembran bersifat dinamis Vesikula Golgi
dan membentuk suatu jejaring yang terintegrasi RE Kasar transport apparatus
dari RE Vesikula
Berperan penting dalam sintesis (dan hidrolisis) transport
mekromolekul di dalam sel dari Golgi
Juga dalam memodifikasi makromolekul agar fungsional Membran
Fungsi setiap organel merupakan bagian dari unit-unit yang Plasma
terkoordinasi Nukleus

RE
halus
Vakuola
Selubung Lisosom
inti

Transport Materi via Sistem Endomembran Jalur Transportasi Vesikula Transport


Materi ditransport dari satu organel menuju organel lain Jalur biosintetik:
menggunakan vesikula transport bermembran yang merupakan Protein disintesis protein dengan bantuan ribosom di RE -
tunas dari komparteman donor bermembran dimodifikasi saat menuju dan di badan Golgi - ditransport ke
berbagai tujuan, mis. ke membran plasma, lisosom atau vakuola;
Saat mencapai tujuan, vesikula dapat fusi dgn membran akseptor Dinamakan pula jalur sekretori
Vesikula transport bergerak dengan pola yang terarah, seringkali Transportasi protein (protein terlarut yg akan dikeluarkan sel
ditarik oleh protein motoris yang bekerja di jalur yang dibentuk atau disimpan di kompartemen lain [mis.:enzim lisosom], protein
oleh sitoskelet (mikrotubulus dan mikrofilamen) integral di membran sel), lipid, dan polisakarida kompleks
Terdiri atas dua jenis: sekresi konstitutif dan sekresi regulatif

Jalur endositik:
materi dari luar masuk ke dalam kompartemen sel
mis.: endosom dan lisosom yang berada di sitoplasma

1
28/09/2016

Transportasi Vesikula Transport via Jalur


Jalur Transportasi
Biosintetik
Vesikula Transport
a) Konstitutif
Materi yang dibawa vesikula, akan dibawa dari tempat sintesis dan Jalur Biosintetik
dikeluarkan ke ruang ekstrasel secara kontinyu, mis.
materi untuk matriks ekstraselular; materi untuk pembentukan dinding a) Konstitutif
sel; materi untuk membran sel
b) Regulatif
b) Regulatif
Materi yang akan dikeluarkan dari sel disimpan dahulu dalam Jalur endosistik
vesikula di dalam sel, materi akan dikeluarkan bila ada stimulus yg
sesuai. mis:
Sel saraf yang mengeluarkan neurotransmiter; Sel pankreas mengeluarkan
enzim pencernaan; Sel endokrin melepaskan hormon
Pada jalur ini, sel dapat menyimpan materi yg akan disekresikan di
dalam granula sekretoris yg berukuran lebih besar dan padat

A. Retikulum
Endoplasma (RE) A. Retikulum Endoplasma (RE)
Terdiri dari:
Struktur
RE kasar (RER)
Membran yang terkoneksi
berikatan dengan ribosom
dengan selubung inti dan
menyebar di hampir RE halus (SER) tidak
keseluruhan sitoplasma berikatan
dgn ribosom
Merupakan sistem berpasangan
dari membran paralel yang Studi dgn penanda
melingkupi ruang sempit (lumen) radioaktif menunjukkan
dengan berbagai ukuran tersusun oleh jejaring saluran bahwa RE halus
(tubulus) dan kantung pipih (cisternae) yang terpisah dari disintesis dari RE kasar
lingkungan sitoplasma
Menyusun sekitar 50% membran pada sel eukariot

A. Retikulum
Endoplasma (RE) A. Retikulum Endoplasma (RE)
Fungsi:
Struktur Menghasilkan membran
Komposisi dari ruang sistena Berperan dalam biositesis
atau luminal di dalam membran
Berparan dalam penyokong mekanik dan distribusi sitoplasma
RE berbeda dgn ruang sitoplasma
Berperan dalam konduksi intraseluler impuls saraf, secara
di sekitarnya
khusus disebut retikulum sarkoplasmik
Antara RE kasar dan RE halus
Berperan dalam pertukaran intraseluler dari materi dengan
merupakan struktur membran yang kontinyu
sitoplasma
Beberapa protein yang sama berada di keduanya(misalnya yg
terlibat dalam sintesis lipid dan kolesterol), ada juga protein yg
Menyediakan area permukaan yang luas untuk terjadinya reaksi
berada di salah satu RE kimia
Tempat penyimpan sementara dan pengepakan materi

2
28/09/2016

A1. RE Halus A1. RE halus


Banyak ditemukan di sel otot rangka, sel-sel pada tubulus ginjal, Peran RE halus
sel-sel kelenjar endokrin penghasil steroid; pada tumbuhan banyak dalam sintesis lipid,
misalnya di sel epitel
ditemukan pada sel penghasil minyak.
pada usus halus,
yaitu RE halus
Peran SER: menyintesis lipid
Sintesis hormon steroid dalam sel endokrin di gonad dan korteks dari asam lemak dan
adrenal gliserol yang
sebelumnya
Detoksifikasi berbagai senyawa organik di dalam sel hati diabsorbsi melalui
Termasuk barbiturat dan alkohol -- pemakaian kronis proliferasi SER pada mikrovili, yg
sel-sel hati selanjutnta
Pembebasan glukosa dari glukosa-6-fosfat, mis. dalam sel hati diteruskan ke badan
Pengaturan kadar Ca2+dalam sitoplasma sel otot rangka dan sel otot Golgi untuk
jantung kontraksi otot dieksport
Sintesis lipid minyak, fosfolipid, steroid

Model pembentukan badan lemak pada tumbuhan A2. RE Kasar


yang melibatkan peran dari retikulum endoplasma Fungsi:
Menghasilkan protein yang akan dieksport menggunakan
vesikula transport
Banyak ditemukan di dalam sel
yang memiliki aktivitas sekresi
protein yang tinggi, misalnya
Sel-sel asinus pankres, sel Goblet
(penghasil mukusmukoprotein)
di saluran pencernaan dan
respirasi, sel-sel endokrin
penghasil hormon polipeptida,
sel plasma penghasil antibodi,
hepatosit penghasil protein
serum darah

Lokalisasi
Lokalisasi Produksi Polipeptida Produksi
Bbrp polipeptida disekresi di ribosom yg terikat di
permukaan sitosolik dari membran RE kasar
Polipeptida
Protein yang disekresikan keluar sel
Protein integral di membran
Protein terlarut yang disimpan dalam komparetemen lain di
sistem endomembran (RE, Badan Golgi, lisosom, endosom,
vesikula, vakuola)
Bbrp polipeptida disintesis di ribosom bebas yg tersebar
di sitoplasma, dan dilepaskan ke sitosol
Protein yg tetap berada di sitosol (enzim utk glikolisis, protein
penyusun sitoskelet)
Protein perifer yg berada di permukaan dalam membran plasma
Protein yg ditransport ke nukleus
Protein yg akan bergabung pada organel peroksisom, kloroplas,
dan mitokondria.

3
28/09/2016

Sintesis protein sekretoris, lisosomal, vakuolaris pada Sintesis protein sekretoris, lisosomal, vakuolaris pada
ribosom terikat membran RE ribosom terikat membran RE
1. Sintesis polipeptida dimulai di ribosom sesaat setelah mRNA terikat. Pada
saat sekuens sinyal (merah) berupa residu 6-15 aa hidrifobik keluar dari
ribosom, maka akan terikat pada SRP (Signal Recognation Particle)
Partikel pengenalan sinyal, yg akan menghentikan translasi hingga
kompleks SRP-ribosom-sekuens sinyal kontak dgn membran RE via
reseptor SRP (2) yg diperlukan utk penempatan polipeptida di lumen RE
3. Perlekatan kompleks dgn reseptor SRP menyebabkan pelepasan SRP dan
penggabungan ribosom dgn translocon (protein channel) di membran RE.
4. Peptida sinyal berikatan dgn bagian interior translocon , menggeser
sumbat dari saluran di protein channel, shg bagian sisa polipeptida
ditranslokasikan melalui membran masuk ke lumen RE peptida sinyal
dipotong oleh protein membran (peptidase) protein akan dilipat oleh
chapeon (misal BiP) untuk diproses lebih lanjut.

Sintesis protein integral membran Sintesis protein integral membran


Terjadi dalam RE
Mengandung satu atau lebih segmen transmembran yang
hidrofobik
Proses hampir serupa dengan sintesis protein yang akan
disekresikan, tetapi terdapat urutan asam amino yang
bersifat hidrofobik yang akan berikatan dengan protein
hidrofobik pada membran RE.

Biosintesis membran terjadi di dalam RE Sintesis lipid untuk membran


Membran sel tidak dihasilkan secara de novo, Lipid untuk membran pada umumnya disintesis di RE
Fosfolipid disintesis di RE
Membran baru dihasilkan dari membran yg sudah ada Sfingomielin dan glikolipid disintesis di RE dan dilengkapi di badan Golgi
Membran tumbuh saat protein dan lipid yg baru disintesis Enzim yang terlibat dalam sintesis fosfolipid merupakan protein
mengalami insersi pada membran yg sudah ada di RE. integral di membran RE dgn sisi aktifnya menghadap sitosol.
Komponen membran ditransport dari RE ke kompartemen Fosfolipid yg baru disintesis diinsersi ke bagian membran yg
lain di sel protein dan lipid dimodifikasi oleh enzim yang menghadap sitosol
terdapat di orgenel yg dituju Pada saat biosintesis membran, dapat terjadi pergerakan fosfolipid
dengan cara flipflop (bantuan enzim flippase) untuk mengubah
posisi fosfolipid
Lipid dibawa dari ER ke Golgi dan membran plasma dalam bentuk
bagian daripada bilayer yang membangun membran vesikula
transport.

4
28/09/2016

Sintesis lipid untuk membran


Dua molekul asam lemak akan ditambahkan pd gliserol-3-
fosfat untuk menghasilkan asam fosfatidat (acyl
transferase)
Hal ini terjadi untuk memperluas lipid bilayer
Fosfatese dan fosfotransferase melekat pada gugus kepala
(gugus fosfat)
Menentukan sifat kimia dari membran lipid

Lipid dapat didistribusikan di dalam sel melalui berbagai cara, yaitu:


(a) difusi lateral terjadi antara RE dan selubung inti;
(b) vesikula transport terjadi di antara membran dalam sistem
endomembran; dan (c) Protein penukar lipid dapat meneransfer lipid
di antara dua membran, seperti antara RE dan mitokondria

Glikosolasi di RE kasar Macam-macam Glikosolasi di RE kasar


Hampir semua protein yg dihasilkan di ribosom terikat N-linked -- glikan terikat
membran RE merupakan glikoprotein pada gugus amina di aspargin
Gugus karbohidrat berperan penting sebagai sisi pengikatan antara dlm RE
protein dgn makromolekul lain; juga dalam pelipatan protein agar O-linked monosakarida
fungsional terikat ke gugus hidroksil
Sekuens gula yg ditambahkan pada oligosakarida yg membentuk dari serin atau treonin dlm
glikoprotein sangat spesifik RE, Golgi, sitosol, dan inti
Penambahan gugus gula pada rantai oligosakarida dikatalisis oleh
enzim glikosiltransferase mentrasfer monosakarida spesifik dari Glypiation -- Glikan terikat
rantai gula nukleotida, misalnya GDP-mannose atau UDP-N- ke fosfolipid dan protein
astilglukosamin C-linked -- mannosa terikat
Urutan monomoner gula yg ditransfer saat pembentukan ke cincin indol dari triptofan
oligosakarida bergantung pd sekuens glikosiltransferase yg terlibat
Phosphoglycosylation
glikan terikat ke serin via
ikatan fosfodiester

Glikosilasi di RE kasar Transport ke Golgi B. Apparatus Golgi


Pasca glikosilasi, protein Struktur
dikeluarkan dar RE dgn Terutama disusun oleh kantung membran yang pipih cisternae
membentuk vesikula
yang tersusun bertumpuk dan membengkok, serta tubulus-
transport
tubulus
Pada tempat keluar dari
sisterna RE kasar tidak cisternae : 0,5-1,0 m, dgn jumlah lapisan 8 dalam satu tumpukan
ribosom Dalam satu sel terdapat bbrp hingga ribuan tumpukan kantung Gologi
Setelah terbantuk tunas dari Terdiri atas dua muka:
membran RE, terjadi fusi antar
vesikula transport hingga cis menerima materi dgn
membentuk vesikla yg lebih cara fusi dgn vesikula transport
besar dan tubulus yg saling
terkoneksi di ruang antara RE trans bagian yg melakukan
dan Golgi ERGIC pengiriman dan membentuk
(endoplasmic reticulum Golgi tunas vesikula transport
intermediate compartment)

5
28/09/2016

B. Apparatus Golgi Pemerosesan protein di apparatus Golgi


Selama mengalami transport dari area cis ke trans, produk
cis face
(receiving side of dari RE dimodifikasi untuk membentuk struktur akhir.
Golgi apparatus)
Mater diberi kode tanda, disortir, dan dikemas hingga membentuk
vesikula transport
1 Vesicles move 2 Vesicles coalesce to 0.1 0 m
6 Vesicles also
transport certain
from ER to Golgi form new cis Golgi cisternae Peran :
Cisternae
proteins back to ER
3 Cisternal Menerima dan memodifikasi hasil dari RE dan meneruskannya ke
maturation:
Golgi cisternae
organel lain atau ke membra sel
move in a cis-
to-trans
Pemilahan, penyelesaian dan transport produk dari sel
direction
4 Vesicles form and Tempat terjadi glikosilasi
leave Golgi, carrying
specific proteins to Sintesis polisakarida, termasuk rantai glikosaminoglikan dari
other locations or to
the plasma mem-
proteoglikan, serta pektin dan hemiselulosa yg mrpkn komponen
5 Vesicles transport specific trans face brane for secretion dinding sel tumbuhan
proteins backward to newer (shipping side of
Golgi cisternae Golgi apparatus)

Pemerosesan protein di apparatus Golgi B. Apparatus Golgi Glikosilasi


Kompleks Golgi berperan dalam merangkai komponen karbohidrat dari
glikoprotein dan glikolipid.
Di RE, saat sintesis rantai karbohidrat terikat gugus N, residu glukosa
dihilangkan dari pusat oligosakarida
Di Golgi, saat melalui cisterna cis dan medial, residu mannosa juga
dihilangkan, namu ditambahkan bbrp gula lain oleh glycosyltransferase.

Modifikasi
protein di
Apparatus
Golgi

6
28/09/2016

C. Vesikula Transport C. Vesikula Transport

Tipe vesikula transport:


1. Vesikula terbungkus COPII dari RE menuju ERGIC & Golgi
2. Vesikula terbungkus COPI arah retrograde dari ERGIC dan
Golgi menuju RE
3. Vesikula terbungkus clathrin dari Golgi menuju endosom,
lisosom dan vakuola

D. Lisosom D. Lisosom
Kantung/vesikula berisi enzim pencernaan 50 enzim yang akan Enzim pada lisosom
menghidrolisis makromolekul - Mencerna makanan
Enzim dan membran penyusun lisosom disintesis di RE kasar dan
ditransportasikan ke Golgi - Menghancurkan patogen
Enzim dapat aktif pada pH rendah (~5) : protein di membarn lisosom recycle organel yang rusak
memompa ion H+ dari sitosol ke internal lisosom Berperan dalam
Terbentuk dari pertunasan trans badan Golgi perkembangan embrio
Ukuran 25-50 nm -- 1m. pada hewan
Hanya ditemukan pada sel hewan
Membran lisosom sangat
ter-glikosolasi gugus KH
membantuk lapisan proteksi
dari serangan enzim yg dikandungnya

Peran Lisosom: Fusi dgn organel atau


makromolekul di sitosol untuk recycle materi
Nucleus 1 m
Lysosome containing
1m
two damaged organelles

Mitochondrion
fragment

Peroxisome
Lysosome fragment

Lysosome contains Food vacuole Hydrolytic Lysosome fuses with Hydrolytic enzymes
active hydrolytic fuses with enzymes digest vesicle containing digest organelle
enzymes lysosome food particles damaged organelle components

Digestive
enzymes

Lysosome Lysosome
Plasma membrane
Digestion
Food vacuole Digestion
Vesicle containing
damaged mitochondrion
(a) Phagocytosis: lysosome digesting food (b) Autophagy: lysosome breaking down damaged organelle

7
28/09/2016

Enzim yang terdapat di Lisosom 5. Vakuola


Organel multifungsi merupakan fusi berbagai vesikula
Pada sel dewasa suatu kompartemen besar, mengisi hampir
90% volume sel
Memiliki membran tunggal tonoplas, yang mengandung
sistem transport aktif
Vakuola memiliki
berbagai fungsi dan
karakter, tergantung
pada tipe sel

5.Vakuola Vakuola makanan dan vakuola kontraktil pada Paramecium

Dimiliki oleh sel tumbuhan atau fungi dan protista


Contractile Vacuole Paramecium feeds mainly on bacteria.
Terdiri dari: Paramecium, like other freshwater
protists, constantly takes in water
Rows of cilia along a funnel-shaped oral
groove move food into the cell mouth,
by osmosis from the hypotonic environment.
Vakuola makanan dibentuk melalui fagositosis
where the food is engulfed into food
Bladderlike contractile vacuoles accumulate vacuoles by phagocytosis.
excess water from radial canals and periodically

Vakuola kontraktil (pada protista) memompa kelebihan


expel it through the plasma membrane.
Oral groove

air keluar dari sel Cell mouth

Vakuola sentral (sel tumbuhan)


pemyimpanan molekul organik 50 m
Thousands of cilia cover
the surface of Paramecium. Food vacuoles combine with
Central vacuole lysosomes. As the food is digested,
dan air Micronucleus
the vacuoles follow a looping path
through the cell.
Cytosol
Macronucleus

Tonoplast

Nucleus Central
vacuole
The undigested contents of food
Cell wall vacuoles are released when the
vacuoles fuse with a specialized
Chloroplast region of the plasma membrane
that functions as an anal pore.
5 m

Peran vakuola Peran vakuola


Kompartemen yang aktif secara osmotik Tempat penyimpanan cadangan makanan
Air masuk secara osmosis senyawa dan makromolekul sementara, mis. protein, enzim
pH dalam vakuola rendah pompa H+ATPase dalam untuk pencernaan
tonoplas yang memompa proton ke dalam carian vakuola Tempat penyimpanan senyawa metabolit sekunder
Pada tumbuhan CAM pH cairan dalam vakuola berfluktuasi Alkaloid; vinblastin, nikotin; pigmen
di malam hari terjadi akumulasi asam malat
Kristal
Berfungsi seperti lisosom komponen bersifat toksik menyimpan hasil samping
tempat penghancuran senyawa tertentu oleh enzim hidrolase metabolisme.

8
28/09/2016

Hubungan antar organel penyusun sistem


endomembran
1Membran inti terhubung
Nucleus
dengan RE kasar, yang
berlanjut dengan RE halus

Rough ER

Membran dan protein


yang dihasilkan oleh RE Smooth ER
ditransportasikan dalam cis Golgi
bentuk vesikula trasnport Nuclear envelop
menuju apparatus Golgi

3
Vesikula transport dihasilkan
kembali oleh Apparatus
Golgi, selain itu dibentuk pula
Vesikula lain yg berkembang Plasma
menjadi lisiosom dan Vakuola membrane
trans Golgi

4 Lysosom dapat fusi 5 Vesikula transport 6 Membran plasma meluas karena ada fusi
Vesikula lain untuk membawa protein menuju Vesikula, protein disekresikan ke luar sel
Proses digesti intrasel membran plasma untuk
disekresikan.