BIOINFORMATIKA

Bioinformatika merupakan hipotesis research. In silico ada karena adanya data

penelitian yang berkumpul tanpa dimanfaatkan. Tahun 2006, data penelitian
dimanfaatkan. Bioinformatika (biologi dan komputasi/computer sains). Harus
tersambung internet.

Manfaat bioinformatika

1. Kesehatan (kedokteran, farmasi

Computer Aidect Drug Design (CADD)

Menscrening senyawa berpotensi obat bisa mengurangi biaya dan waktu

Doking adalah interaksi 2 ikatan molekul.

Doking ada 2 jenis senyawa

- Reverse docking : sudah diketahui senyawa yang bisa menghambat autis

tapi protein belum diketahui. Pada saat docking memerlukan senyawa
control. Misalkan senyawa Antaxantin pada alga. Senyawa control bisa
lebih dari 1.

- Virtual screening : senyawa yang bisa mendocking protein itu, senyawa

dikumpulkan, senyawa didocking yang mana berpotensi sebagai bahan
obat

Yang didocking adalah

 REVERSE DOCKING

SOFTWARE: Pubchem UNTUK MENCARI senyawa-senyawa

Misalnya: curcumin

Copy names and identifies bagian canonical SMILES untuk menemukan protein
target.

Download 3Dsave

SOFTWARE UNTUK MENCARI PROTEIN

1. PHARmMapper UNTUK MENCARI PROTEIN

Berdasarkan nilai farmapeppernya.

Tekan Submit Job

Masukkan hasil download 3D nyapilih protein targen human only atau all target

Job ID disimpan
2. Swiss TargetPrediction
Copy canonicalsmile di pubchempaste
Arti hijau probabilitas simpan dalam bentuk pdf atau excel submit
Pipih choosen organism

3. SuperPred webserver
Klik Target Predictionmasukin nama di kolom punchem dan canonical
smiles
4. ChemMapper
Contoh Your
curcumin: Job ID: 53361
simpan job id
5. PassOnline
Klik Go for predictionpredic new compoundSMILE

Login : dknatow
paswod : 2444218c20
Pa>0,7 artinya lebih banyak positifnya jika diuji di lab
Pa<0,3 artinya bisa positif atau negative