Asam nukleat dan Protein

Aliran informasi genetik

Pustaka:
Glick, BR and JJ Pasternak, 2003, Molecular Biotechnology:
Principles and Applications of Recombinant DNA, ASM
Press, Washington DC, hal. 23-46 dan 75-78
Groves MJ, 2006, Pharmaceutical Biotechnology, 2nd ed.,
CRC, Taylor & Francis, hal. 5 29
 ASAM NUKLEAT, POLIPEPTIDA
DAN PROTEIN

DEBBIE S. RETNONINGRUM
SEKOLAH FARMASI
INSTITUT TEKNOLOGI BANDUNG

http://laxmi.nuc.ucla.edu:8248/M248_98/intro/DNA.gif
 ASAM NUKLEAT
DNA dan RNA
Polimer/Polinukleotida
Monomer : nukleotida
Komponen : gula, fosfat, basa

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 3
 Struktur Nukleotida dan Polinukleotida

www.esb.utexas.edu/ mabrybio211/chapter05/ch5.htm

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 4
 DNA
Tulang punggung :
Fosfat-gula
Basa dalam untai
Antiparalel

Polaritas :
53 vs 35

Komplemen :
Pasangan basa
(C=O dan N-H basa
antar polinukleotida)

Ikatan fosfodiester
(antar nukleotida)

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 5
 KROMOSOM VS PLASMID
KROMOSOM VS PLASMID

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 6
 SEL

DNA : menyimpan dan mentransmisi informasi

genetik
RNA : berperan dalam ekspresi informasi genetik
Protein : hasil dari ekspresi informasi genetik
memiliki fungsi tertentu
Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 7
Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 8
 DNA vs RNA
Gula: deoksiribosa Gula: ribosa
Basa: AGCT Basa: AGCU
Untai ganda Untai tunggal
Prokariot: Prokariot:
sitoplasma sitoplasma
Eukariot: inti Eukariot: inti dan
sitoplasma

Penyimpan informasi Hasil transkripsi

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 9
 POLIPEPTIDA
PROTEIN
Polimer

Monomer : asam
amino (20 aa)
Polaritas :
Ujung N - Ujung C
Ikatan peptida

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 10
 Asam Amino

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 11
 Asam amino
Amino acid One letter symbol Three letter symbol
alanine A Ala
arginine R Arg
asparagine N Asn
aspartic acid D Asp
cysteine C Cys
glutamic acid E Glu
glutamine Q Gln
glycine G Gly
histidine H His
isoleucine I Ile
leucine L Leu
lysine K Lys
methionine M Met
phenylalanine F Phe
proline P Pro
serine S Ser
threonine T Thr
tryptophan W Trp
tyrosine Y Tyr
valine V Val

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 12
 Urutan asam amino insulin manusia

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 13
 Urutan asam amino Interferon 2a
MCDLPQTHSLGSRRTLMLLAQMLRISLFSCLK
DRH DFGFPQEEFGNQFQKAETIPVLHEM
IQQIFNLFST KDSSAAWDET LLDKFYTELY QQ
LNDLEACVIQGV GVTETPLMKEDSILAV RKY
FQRITLYLKEKKYSPCA WEVVRAEIMRSFS
LSTNLQESLRSKE

panjang 165 asam amino

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 14
Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 15
 FUNGSI PROTEIN

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 16
 Lokasi Protein pada Sel Bakteri
Gram positif Gram negatif

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 17
 Asam nukleat vs Protein

Nukleotida Asam amino

Polaritas 5 3 Polaritas N C
Ikatan Ikatan peptida
fosfodiester
Penyimpan Hasil ekspresi DNA
informasi

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 18
 SENYAWA TERAPEUTIK
PROTEIN: INSULIN, INTERFERON,
STREPTOKINASE, ERITROPOEITIN,
ANTIBODI MONOKLONAL, HBsAg

DNA: TERAPI GEN, DNA ANTISENS,

OLIGONUKLEOTIDA, VAKSIN DNA

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 19
 ALIRAN INFORMASI
GENETIK

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 20
 PRODUK BIOTEKNOLOGI FARMASI
ASAM NUKLEAT (DNA DAN RNA)

PROTEIN (OBAT, VAKSIN, KIT DETEKSI): HASIL

TRANSKRIPSI DAN TRANSLASI MATERI
GENETIK

PEPTIDA (LEBIH PENDEK DARI PROTEIN)

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 21
Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 22
 MENGAPA INFORMASI TENTANG
TRANSKRIPSI PENTING?
PROTEIN INGIN DIPEROLEH DALAM
JUMLAH BESAR

SALAH SATU STRATEGI ADALAH

MENINGKATKAN EFISIENSI TRANSKRIPSI

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 23
 TRANSKRIPSI
SINTESIS RNA (mRNA, rRNA, tRNA) MENGGUNAKAN
INFORMASI PADA DNA
RNA POLIMERASE (PROTEIN)
PROKARIOT (SITOPLASMA) ; EUKARIOT (INTI)
PROMOTOR (KUAT vs LEMAH)
TERMINATOR (KUAT vs LEMAH)

OPERATOR (REGULASI)
SITUS AKTIVATOR (REGULASI)

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 24
 TRANSKRIPSI

mRNA

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 25
 TRANSKRISPI DAN BIOTEKNOLOGI

PROMOTOR DAN TERMINATOR KUAT

PROMOTOR DAN TERMINATOR DIKENALI

OLEH RNA POLIMERASE INANG

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 26
Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 27
 TRANSKRIPSI BALIK

KEBALIKAN TRANSKRIPSI
RNA DNA (cDNA)
REVERSE TRANSKRIPTASE
VIRUS (RETROVIRUS, HIV) dan virus
hepatitis B

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 28
 TRANSLASI
SINTESIS POLIPEPTIDA MENGGUNAKAN INFORMASI
YANG ADA PADA mRNA
CETAKAN mRNA (tRNA dan rRNA TIDAK DITRANSLASI
TETAPI BERFUNGSI LANGSUNG)
LOKASI DI RIBOSOM
KOMPONEN YANG DIBUTUHKAN
mRNA
RIBOSOM BINDING SITE (RBS) UNTUK PROKARIOT
AUG (KODON START)
UAA, UGA, UAG (KODON STOP)

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 29
 Translasi

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 30
 Kodon stop Kodon start

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 31
 ORGANISASI GEN PROKARIOT

Coding sequence

5 RBS Kodon stop

3

3 5
Inisiasi Kodon start terminator
Promotor
transkripsi

Komponen transkripsi: promotor, terminator, situs inisiasi

transkripsi
Komponen translasi: RBS, kodon start, kodon stop

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 32
 Eukariot vs Prokariot

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 33
 ORGANISASI GEN EUKARIOT

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 34
 TRANSKRIPSI (EUKARIOT)

HASIL TRANSKRIPSI: RNA PRIMER

(INTRON DAN EKSON)
PENAMBAHAN CAP DAN EKOR POLI A
PENGHILANGAN INTRON (SPLICING)
RNA MATANG DIKIRIM KELUAR INTI SIAP
DITRANSLASI DI SITOPLASMA

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 35
 MENGAPA INFO MENGENAI TRANSKRIPSI
PADA EUKARIOT PENTING?

PROTEIN DARI EUKARIOT BANYAK

DIGUNAKAN SEBAGAI PROTEIN
TERAPEUTIK
INFORMASI PADA PROTEIN TERLETAK
PADA mRNA MATANG TANPA INTRON
MULAI BEKERJA DARI mRNA MATANG
DNA

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 36
 TRANSKRIPSI BALIK
MASALAH PADA EUKARIOT ADALAH GEN
MENGANDUNG INTRON DAN EKSON
SINTESIS DNA MENGGUNAKAN MRNA SEBAGAI
CETAKAN
DNA HASIL SINTESIS DISEBUT cDNA (TIDAK
MENGANDUNG INTRON)
KATALISIS OLEH REVERSE TRANSKRIPTASE

Sekolah Farmasi ITB Bioteknologi Farmasi - FA 4202 Asam Nukleat, Protein, Aliran info genetik 37