Review Jurnal

Gugus -carboline merupakan gugus yang biasa terdapat pada komponen-

komponen biologis dimana diketahui berperan dalam telah memberikan
aktivitas pada senyawa anti-tumor.

Pada jurnal ini seri senyawa yang digunakan merupakan seri senyawa dari
turunan -carboline. Dimana sebanyak 38 senyawa turunan -carboline diuji
aktivitasnya. Dilakukan perhitungan analisis secara QSAR untuk mengetahui
aktivitas senyawa -carboline. Dengan menggunakan software v-life sciences
versi 3.0.

Study Qsar yang digunakan adalah QSAR-3D dimana efek stereokimia

ikut berepengaruh dalam study QSAR-3D ini, dimana deskriptor yang digunakan
merupakan efek sterik dan dan efek medan elektrostatik dari senyawa turunan
-carboline.

Efek sterik dan medan elektrostatik di peroleh pada titik kisi gird dengan methyl
probe of charge +1.

Untuk medeannya dibuat dengan metode kNN dengan default energy 30kcal/ml
dan 10kcal/mol. Dimana muatan parsial atom dihitung dengan metode
Gasteiger-Marsii.
 Dalam uji QSAR aktivitas biologi dari senyawa turunan ini diharapkan
dapat menghambat kanker serviks hingga 50% . Dimana data aktivitas biologis
yang didapatkan dinamkan dengan IC50 diubah dalam satuan molar unit dan
kedalam skala negatif logaritma (pIC50) dan selanjutnya digunakan sebagai
variabel analisis QSAR.

Dalam penyusunan datanya, analisis regresi yang digunakan dengan

metode PLS (partial least-square) dan cross-validation dilakukan menggunakan
metode leave-one-out (LLO) dengan filter kolom 0,5 kcal/mol.

Model dibuat dengan pendekatan [(SW) kNN MFA] melalui stepwise

forward-backward method dengan variasi cut off 2.00 kcal/mol dengan
menggunakan auto scaling.

Persamaan QSAR yang di hasilkan

Jika saya melakukan penelitian berdasarkan jurnal ini , akan saya ubah
metodenya dari QSAR 3D menjadi metode QSAR HANSCH dengan deskriptor
yang lebih banyak seperti ikatan hidrogen, hidrophobisitas, karena panambahan
deskriptor akan menyebabkan proses berjalan lebih lama sehingga digunakan
metode QSAR hansch yang lebih cepat, lalu saya padukan dengan metode
molecular docking pada tumor yang menjadi sasaran.

Metode molekular docking ini akan mensimulasikan lebih tepat bagaimana

proses tumor dengan senyawa anti kanker ini. Sehingga hasilnya eksperimen
lebih dapat dipercaya karena hasil penelitian yang diperoleh dilakukan secara
QSAR dan molekular docking.