Qumica de las

protenas
FUNCIONES BIOLGICAS

ENZIMAS ESTRUCTURAL ENERGETICA

Reacciones Membrana 15% de los
qumicas celular requerimientos
energticos
 TRANSPORTE RESPUESTA MENSAJERO
Hemoglobina INMUNE QUMICO
(O2) Antgeno (hormona)
Albumina (ac.
Anticuerpo RECEPTOR
Grasos)
Ceruloplasmina
(Cu)
Transferrina (Fe)
CONTRACCION CRECIMIENTO Y REGULACION DE
MUSCULAR PROLIFERACION LA
(actina-miosina) CELULAR CONCENTRACION
DE
HIDROGENIONES
COAGULACION
SANGUINEA
COMPOSICIN ELEMENTAL
aminocidos. aminocidos +
C:50%, O:23%, grupo
N:16%, H:7%, prosttico
S:3%
SIMPLE CONJUGADA

El contenido de N permite estimar el contenido proteico de una muestra:

P= Np (100/16)

P: contenido proteico de una muestra.

Np: contenido de nitrgeno de la muestra
 CARCTER MACROMOLECULAR

Pptido Aminocidos
< 50 aa (20)

Cadena
poli
peptdica
Protena
( >50aa
1 o + c. poli
peptdica)
 AMINOCIDOS
Unidades estructurales de las
protenas, son de bajo peso
molecular.
Solamente 20 aa
son codificados
por el DNA para
formar las
protenas
(proteinognicos)
CLASIFICACIN
CLASIFICACIN
Aa con Aa con cadena R
cadena R no polar pero sin
polar o carga elctrica a
hidrofbica pH cercano a la
neutralidad

GRUPO I GRUPO II

Aa con cadena R Aa con cadena

polar y con carga R polar con
negativa a pH carga positiva a
cercano a la pH
neutralidad cercano a la
neutralidad
GRUPO III
GRUPO IV
 R aliftica
*soluble R aliftica
R aliftica

I minnooaacciddo
m R aromtica
o

R azufre

R aliftica

R aromtica
> PM
 Hidroxilo
*enzimas
Hidrogeno
hidroxilo
+simple

hidroxilo
Sulfhidrilo

Amidas Amidas
IV

Imidazol

Guanidino

psilon
amino
AA: PROPIEDADES FSICAS
Actividad ptica:
Son capaces de desviar el plano de luz polarizada
(carbono asimtrico)
Excepto la glicina
Se mide como rotacin especifica
Clasifica a los aa en Dextrgiros (+) si desvan el
plano de luz polarizada hacia la derecha, y
Levgiros (-) si lo desvan hacia la izquierda.
AA: PROPIEDADES FSICAS
Absorcin de luz:
En el espectro UV lejano
Triptfano, tirosina y fenilalanina (tambin
cistena)
Permite estimar la concentracin proteica
de una muestra biolgica.
Permite estimar el grado de contaminacin
proteica en una preparacin de ac.
Nucleicos.
AA: PROPIEDADES ELCTRICAS
En disolucin acuosa, son capaces de
ionizarse, dependiendo del pH:
como un cido (cuando el pH es bsico),
como una base (cuando el pH es cido)
AA: PROPIEDADES ELCTRICAS
como un cido y una base a la vez (cuando el
pH es neutro). En este ltimo caso adoptan un
estado dipolar inico conocido como zwitterin.
 K carboxilo= 5x10 -3

K amino=2.5x 10 -9

Como son cifras tan pequeas es mas practico expresarlas como su logaritmo
negativo = pK

pK= -Log 5x10-

3
pK = - (Log 5 +log 10- )
pK = - (0.69 -3) 3
pK = -(-2.31)
pK = 2.31

[H+] K [aa]
[base]
1 1 [base]
[H] K [aa]
Log 1/H= log 1[base] / k[aa]
-log [H] = -log K + log [base]/[aa] Ecuacin de
pH = pK + log [base]/[aa] Henderson-Hasselbach
El pH en el cual un aa tiende a adoptar
una forma dipolar neutra (igual nmero
de cargas positivas que negativas) se
denomina Punto Isoelctrico.
AA: PROPIEDADES ELCTRICAS
Separacin de
aa por
cromatografa
de intercambio
inico
 AA: PROPIEDADES ELCTRICAS
Separacin
de aa por
electrofore
sis
AA: PROPIEDADES ELCTRICAS
Separacin de aa por cromatografa de
particin (papel)
 AA: PROPIEDADES QUMICAS
Reacciones del grupo alfa amino:
Los aa experimentan arilacion cuando
reaccionan con el 1- fluoro 2,4
dinitrobenceno.

Los aa reaccionan con el fenilisotiocianato,

reaccin de Edman.
 AA: PROPIEDADES QUMICAS
Reacciones del grupo alfa amino:
Los aa reaccionan con el cloruro de dansil

La reaccin de los aa con ninhidrina

prolina
AA: PROPIEDADES QUMICAS
Reacciones del grupo alfa carboxilo:
Reaccin de reduccin
 AA: PROPIEDADES QUMICAS
Reacciones de los grupos de reactivos
de la cadena lateral:
Reaccin Reactivo Aminocido Color
Millon Nitrato de mercurio en ac. nitrico Tirosina Rojo
Ehrlich Triptfano Azul
Nitroprusito Nitroprusiato de sodio en Cistena Rojo
amoniaco diluido
Sullivan Sulfonaptoquinona e hidrosulfito Cistena Rojo
de sodio
Pauli Ac. Sulfamlico en medio alcalino Histidina y Rojo
tirosina
Folin Ac. fosfomolibdotungstico Tirosina Azul
 PROTENAS: PROPIEDADES
FSICO QUMICAS
Derivadas de su peso molecular

Separacin por Separacin por ultra Anlisis por

dilisis centrifugacin cromatografa de
exclusin molecular
Incapacidad de Capacidad de
atravesar sedimentar cuando
membranas estando en solucin
semipermeables son centrifugadas a
alta velocidad
>PM >coeficiente
de sedimentacin
 PROTENAS: PROPIEDADES
ELCTRICAS
Comportamiento anftero.
Valores de pK no son iguales a los de aa
libres.
El PI depende de los aa constituyentes.
Precipitacin
Separacin
Electroforesis
Accin buffer
 PROTENAS
Accin buffer: regulacin del pH (cede
o acepta hidrogeniones)
 PROTENAS
Electroforesis:
 PROTENAS
Precipitacin:
Fuerza inica de la solucin

Salting in: fuerza inica ( solucin mas dil uida), protena es mas
soluble

Salting out: fuerza inica (solucin mas concentrada) , protena

es menos soluble.
pH:
pH de la solucin es cercano al PI, protena es menos soluble
pH > o < al PI, protena es mas soluble
Naturaleza del solvente:
depende de la constante dielctrica de la solucin.
Temperatura: (0 - 40)
A mayor T la protena es mas oluble
 PROTENAS
Reacciones de color:
PROTENAS: NIVELES DE
ESTRUCTURACIN
El carcter parcial de doble
enlace del enlace peptdico (-
C-N-) determina la
disposicin espacial de ste
en un mismo plano, con
distancias y ngulos fijos.
Secuenciacin de las protenas

Determinacin de Fragmentacin de
Determinacin del
aa en cada pptido las cadenas
nde cadenas de la
(Reaccin de peptdicas intactas
protena
Edman) que se repiten.

Ruptura de la Separacin por Descripcin del

uniones electroforesis o orden que siguen
interpeptdicas cromatografa los aa en la protena

Fragmentacin de la Determinacin de
Identificacin del aa
cadena los aa que
C terminal y N polipeptdica intervienen en las
terminal
(tripsina) uniones de cadenas
 Protenas homlogas:
=comportamiento biolgico (=funcin)
Enzimas: catalizan la misma reaccin
Inmunoglobulinas: reaccionan con el
mismo antgeno
Hay secuencias de aa estables que no se
modificaron durante la evolucin
Se relacionan aa prximos, mediante enlaces de hidrogeno,
entre el grupo NH de un aa y el grupo CO de un aa cercano.
0 HELICE ALFA
espiral o resorte.
3,6 aa por cada vuelta.
Altura de 5.4 A por cada vuelta.
1 aa ocupa 1.5 A
Puentes H son lineales y
paralelos al eje.
Puede ser:
alfa hlice derecha (Hb,
mioglobina, queratina)
alfa helice izquierda (colageno)

Prolina impide espiral.

0 LAMINA PLEGADA
Puentes H son perpendiculares
Gran estabilidad
Puede ser:
Paralela
antiparalela
AL AZAR
Existen secuencias en el polipptido
que no alcanzan una estructura
secundaria bien definida y se dice
que forman enroscamientos
aleatorios
Grupos sulfhdrilo
Cistena- cistena

Forma globular

COOH- tirosina
 Enlace hidrfobo o apolar
Leucina, isoleucina, valina, alanina,
fenilalanina

Enlace amida
Grupo carboxilo - amino
Ac asprtico/glutmico- glicina
 PROTMEROS
Cadenas protena homognea

Cadenas protena heterognea

Protena nativa
 Difraccin de rayos X:
permite determinar la estructura espacial de las
protenas
 Desnaturalizacin de protenas

Alteracin de propiedades fsicas,

qumicas y biolgicas:
incrementa la viscosidad
perdida de capacidad de cristalizacin
disminucin solubilidad
cambia coeficiente de sedimentacin y
difusin
Disminucin de solubilidad
Perdida de su funcin biolgica
Agentes desnaturalizantes
Calor
Radiaciones: rayos x, luz UV
FSICOS
Grandes presiones
Agitacin mecnica

Solventes orgnicos: etanol, acetona,

metanol
Solucin concentrada de urea (8M) y de
QUMICOS sales
Sales de guanidina
Detergentes: SDS( dodecil sulfato de sodio)
Soluciones con pH<3 o>10
Estructura de algunas
protenas especficas:

Inmunoglobulinas
Colgeno
Hemoglobina
INMUNOGLOBULINAS
 INMUNOGLOBULINAS
REGIN VARIABLE:
Especificidad antignica
INMUNOGLOBULINAS
COLGENO
 COLGENO
3 SUBUNIDADES:
ALFA : cadena polipeptdica bsica.
BETA : 2 subunidades alfa unidas
covalentemente.
GAMMA: 3 subunidades alfa unidas
covalentemente.
Unidad bsica estructural: TROPOCOLAGENO
COLGENO
ENLACES COVALENTES DENTRO DE LA
MISMA CADENA Y ENTRE LAS CADENAS
RESISTENCIA MECANICA
> Edad > n de enlaces covalentes
COLGENO
 COLGENO
LATIRISMO
 HEMOGLOBINA
Protena transportadora de O2
Formada por 4 subunidades
2 cadenas a y 2 cadenas b =A1 (adulto)
2 cadenas a y 2 cadenas =A2 (adulto 2%)
2 cadenas a y 2 cadenas g =F (feto)

Enlaces no covalentes
 HEMOGLOBINA
Hb S anemia falciforme