Sitogenetika Molekul Dalam Shells Trough (Mactridae, Bivalvia):

Berbeda GC-Kaya Heterochromatin Content

Daniel Garca-Souto, Concepcin Prez-Garca, Jack Kendall dan Juan J.

Pasantes.

Departamento de Bioqumica, Xentica e Inmunoloxa, Universidade de Vigo, E-

36310 Vigo, Spanyol; danielgarciasouto@gmail.com (D.G.-S.);
concepcionperezgar@gmail.com (C.P.-G.); jk.kendall@hotmail.com (J.K.)
Korespondensi: pasantes@uvigo.es; Tel .: + 34-986-812-577

Editor Akademik : Montserrat Corominas

Menerima : 29 Juni 2016; Diterima: 8 Agustus 2016; Diterbitkan: 16
Agustus 2016

Abstrak: Keluarga Mactridae terdiri dari berbagai kelompok organisme laut,

umumnya dikenal sebagai kerang palung atau surfing kerang, yang
menggambarkan distribusi global. Meskipun keluarga ini termasuk beberapa
spesies kerang yang paling memancing dan berbudaya, kromosom mereka buruk
dipelajari. Dalam karya ini, kami menganalisis kromosom Spisula solida, Spisula
subtruncata dan Mactra stultorum dengan cara pewarnaan fluorochrome, C-
banding hibridisasi in situ menggunakan 28S DNA ribosom (rDNA), 5S rDNA,
gen H3 histone dan probe telomeric. Ketiga kerang palung disajikan 2n = 38
kromosom tetapi komposisi kariotipe yang berbeda. Seperti yang terjadi di
sebagian besar bivalvia, daerah GC-kaya yang terbatas pada nucleolus
mengorganisir daerah di Spisula solida. Sebaliknya, banyak band heterokromatik
kaya GC terdeteksi di kedua Spisula subtruncata dan Mactra stultorum. Meskipun
tiga kerang palung disajikan tunggal 5S rDNA dan H3 histone kelompok gen,
lokasi kromosom mereka berbeda. Mengenai cluster rDNA utama, sementara
Spisula subtruncata disajikan satu cluster, baik Spisula solida dan Mactra
stultorum menunjukkan dua. Tidak ada bukti sinyal telomeric kabisat terdeteksi
pada spesies ini. Karakterisasi sitogenetika molekuler taksa ini akan memberikan
kontribusi untuk memahami peran yang dimainkan oleh perubahan kromosom
dalam evolusi kerang palung.

Kata kunci: kerang palung; kromosom; heterochromatin; fluorescent in situ

hybridization; gen histon; gen RNA ribosom

1. Perkenalan
Keluarga Mactridae (Lamarck 1809) terdiri dari berbagai kelompok
organisme laut, umumnya dikenal sebagai kerang palung, bebek kerang atau
surfing kerang, menunjukkan distribusi global [1] dan termasuk beberapa
spesies kerang yang paling memancing dan berbudaya. Meskipun kerang
palung antara bivalvia lebih dikenal, beberapa pertanyaan tentang biologi
mereka tidak jelas. Berbeda dengan kebanyakan keluarga kerang lainnya di
mana banyak genera yang tersedia, sebagai keluarga Mactridae hanya ada
genera diakui sedikit dan beberapa kelompok tidak cocok untuk salah satu dari
mereka. hubungan filogenetik antara spesies dari keluarga ini, dan di antara
spesimen dari spesies yang diduga tunggal, adalah subjek dari beberapa
penyelidikan baru-baru menggunakan urutan DNA [05/02], memberikan
peningkatan bukti spesiasi samar dalam kelompok [2,4].
Karakterisasi kromosom kerang palung jauh melampaui pengetahuan
dicapai untuk keluarga kerang lainnya [6,7]. studi klasik yang terbatas untuk
menentukan jumlah kromosom dalam beberapa spesies [12/08]. Baru-baru ini,
yang kariotipe ombak clam kerdil Mulinia lateralis [13], yang gaper lemak
(clam kuda) Tresus capax (Lutraria maxima) [14,15], dan sinar matahari
surfing clam Mactra chinensis [16] dijelaskan. Mengenai teknik molekuler
sitogenetika, fluorescent in situ hybridization (FISH) hanya diterapkan untuk
memetakan urutan telomeric [17] dan DNA ribosom besar (rDNAs) [18]
dengan kromosom Mulinia lateralis.
Untuk cytogenetically mencirikan kerang palung Spisula solida,
Spisula subtruncata dan Mactra stultorum, kami mempelajari kromosom
mereka dengan cara chromomycin A3 (CMA) / 40, 6-diamidino-2-
phenylindole (DAPI) dan DAPI / propidium iodida (PI) pewarnaan fluoresensi,
 C-banding dan FISH menggunakan utama rDNA, 5S rDNA, gen H3 histone
dan probe telomeric. Hasil kami menyoroti kesamaan kromosom dan
perbedaan antara taksa ini yang dapat membantu untuk memahami peran yang
dimainkan oleh perubahan kromosom dalam evolusi kerang palung.

2. Bagian Eksperimental
2.1. Trough Shell Spesimen
Sampel dari palung shell tebal Spisula solida (Linnaeus 1758),
memotong melalui shell Spisula subtruncata (da Costa 1778) dan diperiksa
dengan sinar melalui shell Mactra stultorum (Linnaeus 1758) dikumpulkan
dari populasi alami di Ria de Pontevedra dan Ria de Vigo (NW Spanyol).

2.2. Kromosom Persiapan, fluorochrome Pewarnaan dan C-Banding

persiapan kromosom diperoleh dari insang dan jaringan gonadic
berikut metode sebelumnya diterbitkan [19,20]. Setelah mengekspos kulit
melalui semalam untuk colchicine (0,005%), insang dan organ reproduksi
telah dihapus, diperlakukan dengan 50% (20 menit) dan 25% (20 menit)
air laut dan tetap dalam etanol / asam asetat (3: 1) tiga kali selama 20
menit setiap kali. potongan-potongan kecil jaringan tetap yang dipisahkan
dalam 60% asam asetat dan suspensi sel dijatuhkan ke slide dipanaskan
sampai 50 C.
pewarnaan fluorochrome dilakukan seperti yang dijelaskan
sebelumnya [21,22]. Beberapa persiapan kromosom ternoda dengan CMA
(0,25 mg / mL, 2 jam), counterstained dengan DAPI (0,14 ug / mL, 8 min)
dan dipasang dengan antifade (Vectashield, Vector, Burlingame, USA).
Setelah visualisasi dan fotografi, persiapan kromosom yang sama kembali
diwarnai dengan kombinasi DAPI dan PI (0,07 ug / mL, 8 min), dipasang
di antifade dan difoto lagi. jumlah kromosom dilakukan di setidaknya 200
piring metafase diperoleh dari 10 spesimen (5 laki-laki, 5 perempuan) dari
masing-masing spesies. Untuk mendeteksi daerah heterokromatik pada
spesies ini, beberapa persiapan juga C-banded menggunakan barium
hidroksida [23] dan diwarnai dengan acridine orange (0,1 mg / mL).
2.3. DNA Ekstraksi, PCR amplifikasi dan Probe Pelabelan
Total DNA genomik diekstraksi dari otot adduktor etanol-
diawetkan mengikuti metode klasik [24] dengan sedikit modifikasi [25].
potongan kecil jaringan yang homogen di heksadesiltrimetilamonium
bromide (CTAB) buffer dan dicerna dengan pronase (1,5 mg / mL, 60 C,
semalam) (Sigma Aldrich, St. Louis, MO, USA) dan RNase A dari
pankreas sapi (1 mg / mL, 37 C, 1 h) (Sigma Aldrich, St. Louis, MO,
USA). DNA diekstraksi dengan fenol: kloroform: isoamil alkohol (24: 24:
1) dan disimpan pada 4 C sampai digunakan lebih lanjut.
probe FISH yang dihasilkan oleh reaksi berantai polimerase (PCR)
di 20 reaksi uL mengandung 50 DNA ng, 1 PCR penyangga, 0,5 mM
setiap dNTP (Thermo Fisher Scientific. Waltham, MA, USA), 2,5 mM
MgCl2, 1 pM primer masing-masing dan 1 U BIOTAQ DNA polimerase
(Bioline, London, UK). Seperti terlihat pada Tabel 1, primer universal [26]
digunakan untuk memperkuat sebuah fragmen gen 28S rRNA dari repeat
rDNA utama. Seluruh pengulangan 5S rDNA diamplifikasi menggunakan
primer yang dijelaskan dalam [27]. gen histon H3 diamplifikasi
menggunakan primer yang diusulkan oleh [28]. Berikut langkah denaturasi
pada 95 C selama 5 menit, 30 siklus amplifikasi (Tabel 1) dan
perpanjangan akhir dari 7 menit pada 72 C dilakukan dalam sistem
GeneAmp PCR 9700 (Applied Biosystems. Foster City, CA, USA) .
Produk PCR diperiksa dengan elektroforesis 2% gel agarosa. 28S rDNA
probe berlabel biotin-16-dUTP (Roche Sains Terapan, Penzberg, Jerman)
dan / atau digoksigenin-11-dUTP (10 DIG Labeling Mix, Roche Sains
Terapan) oleh terjemahan nick (Roche Applied Science. Penzberg,
Jerman ). gen histon H3 dan 5S rDNA probe berlabel dengan baik biotin-
16-dUTP (20 M) atau digoksigenin-11-dUTP (5 M) dengan PCR. produk
PCR berlabel diendapkan sebelum FISH.
 2.4. Fluorescent di Situ Hibridisasi (FISH)
Tunggal dan double-warna IKAN dan re-hibridisasi percobaan
dilakukan sebagai dipublikasikan sebelumnya [29]. Persiapan dicerna
dengan RNase A (Sigma Aldrich, St. Louis, MO, USA) dan pepsin (Sigma
Aldrich, St. Louis, MO, USA) sebelum denaturasi (70 C, 2 min). Setelah
hibridisasi semalam pada 37 C, probe berlabel biotin terdeteksi dengan
avidin fluorescein dan mouse terbiotinilasi anti-avidin antibodi (Vector,
Burlingame, CA, USA) dan orang-orang digoksigenin-label terdeteksi
dengan mouse anti-digoksigenin dan Rhodamine anti-tikus antibodi
(Sigma Aldrich, St. Louis, MO, USA). Slide counterstained dengan DAPI
(0,14 ug / mL di 2 garam natrium sitrat) dan dipasang di antifade
(Vectashield, Vector, Burlingame, CA, USA). IKAN dengan telomeric
vertebrata (C3 TA2) 3 peptida asam nukleat (PNA) Probe (Applied
Biosystems) dilakukan mengikuti protokol yang ditunjukkan oleh
pemasok.
Minimal 20 piring metafase per probe atau kombinasi probe di 10
spesimen (5 laki-laki, 5 perempuan) per spesies dicatat menggunakan
Nikon Eclipse-800 mikroskop (Tokio, Jepang) dilengkapi dengan sistem
epifluorescence. gambar terpisah untuk setiap fluorochrome diperoleh
dengan kamera DS-Qi1Mc CCD (Nikon) dikendalikan oleh perangkat
lunak NIS-Elements (Nikon). Penggabungan gambar dilakukan dengan
Adobe Photoshop CS2 (San Jose, CA, USA).
Sepuluh dari piring metafase terbaik menunjukkan sinyal IKAN
digunakan untuk membangun kariotipe untuk setiap spesies. Kromosom
dan lengan panjang dengan hati-hati diukur dan relatif panjang dan indeks
centromeric ditentukan.

3. Hasil
Nomor kromosom diploid ditentukan untuk Spisula solida, Spisula
subtruncata dan Mactra stultorum yang 2n = 38 (Angka 1-3). Spisula solida
menunjukkan kariotipe terdiri dari lima metasentrik, empat meta /
 submetasentrik, tiga submetasentrik, tiga submeta / subtelocentric dan empat
pasang kromosom subtelocentric (Gambar 1e). Kariotipe dari Spisula
subtruncata disajikan delapan metasentrik, satu meta / submetasentrik, dua
submetasentrik, tiga submeta / subtelocentric, empat subtelocentric dan satu
pasang kromosom telosentrik (Gambar 2e). Dalam Mactra stultorum, kariotipe
itu terdiri dari lima metasentrik, tiga meta / submetasentrik, empat
submetasentrik, empat submeta / subtelocentric, dan tiga pasang kromosom
subtelocentric (Gambar 3e).
Kehadiran di- dan / atau daerah kromosom yang kaya GC diperiksa
menggunakan kombinasi AT-spesifik (DAPI), GC-spesifik (CMA) atau tidak
spesifik (PI) fluorochromes. DAPI pewarnaan mengungkapkan dua wilayah
negatif DAPI, subterminal ke lengan pendek dari dua pasang kromosom di
Spisula solida (Gambar 1a); wilayah ini jelas diwarnai dengan baik CMA dan
PI (Gambar 1b, c). Sebaliknya, Spisula subtruncata menunjukkan delapan
pasang kromosom menampilkan DAPI- / CMA + daerah, tujuh dari mereka di
lokasi kabisat dan satu subterminal (Gambar 2a-c). Mactra stultorum
menunjukkan enam pasang kabisat dan dua pasang subterminal DAPI- / CMA
+ band (Gambar 3a-c). Seperti yang dideteksi oleh C-bandeng (Gambar S1),
DAPI- / CMA + daerah ini adalah heterokromatik.
percobaan IKAN menggunakan 28S rDNA probe menunjukkan bahwa
cluster rDNA utama yang terletak di subterminal DAPI- / CMA + daerah di
taksa tersebut. Kedua Spisula solida dan Mactra stultorum menunjukkan dua
sinyal utama rDNA, subterminally terletak pada lengan pendek dari pasangan
kromosom 17 dan 19 (Gambar 1d, e) dan pada lengan panjang pasangan
kromosom 3 dan 4 (Gambar 3d, e), masing-masing. Sebaliknya, utama klaster
rDNA tunggal terdeteksi di lengan panjang pasangan kromosom 18 di Spisula
subtruncata
(Gambar 2d, e).

Gen 2016, 7, 47 4 dari 10

Gambar meric

(A) 40, 6-diamshoidrtinarom-s2-opf htweonychlrinomdoosloem (eDpAairPsI () a-

rsrtoawins) e. d daerah (b) mCehrtoampohmaysceinpAla3te (CsMhAo)
wstianinginDg OAF PthIedsaumlle di singkat

? MFiegtuarpeh1a.seFlpuloartoecshhrome
sttahiantinDgAaPnIddfululloresgcieonts IWN esriteuChMybAridbirzigahtiton (ar
(FroISwHs) m (ca) pFpIiSnHg omfatpelpoimngeroicf

rms pasangan tw kromosom (panah); (B) Chromomycin A3 (CMA) pewarnaan

urutan telomeric ke piring metafase sama counterstained dengan DAPI /

propidium iodida (PI)

? Yang metaphases4ph sama ', 6ol-awdtsieasmisgihndaoinlwsoo-e2n-

dpthhetehtneayloltimnDdeorAelesP. (NIDodAteuPtIlh) l-
asrtaethigneiefodonumrseDwtaApePhrIaenseCpaMltaivtAee
rsehbgoriwoigninshgatrDe (aAstraPriIondewduslwl) ir; teh (gcPio) Dalam
(FsarIorSonHwths) saya. Menyadap dari
telomeric se (sdhq)
ouFrtIeSanHrcmmessaoptfpotinwtghooecfhs2r8aoSmrDosNomAmee
(ytapelapliorhwsa (asarerrroopwlhase) t.ae (DBCS)) o, C5uShnrrotDemNrosAmta
(yricenidneadArr3oww (CihtMehaAdD) s) AsatanPidnI / iHnp3g
hrooifspttohindeeisguaemne iodida (PI)

menunjukkan signa (mg reetae pn harsreopw lhateeadshs) OWP erodbte

hsatonDAa PMI detualpl HREA gseionc os uwn eterersCtaMinAedbwrigitht
(DaArrPowI sa) n. d (c) thFe IScHormr sebagai ppo innd ginogf

ktealroymoetyripces (EEQ) .uSecnacleesbtaorsth = e5same. piring metafase

counterstained dengan DAPI / propidium iodida (PI)

(D) msahpowpsinsiggnoalfs IKAN 2on8StherDtelNomAere (sy.

ENlolotewthaatrthroe wfouhreDaAdPsI) n, e5gSatirvDe rNegAion (sraerde
satarirnoedwwhitehaPdI s (a) rraonwds) .H3 histone

gen (hijau (da) rFrISoHwmhaepapdinsg) opf r2o8SbreDsNoAn

(yaelmlowetaarprohwahseeadcso), u5SnrtDeNrsAta (riendeadrrwowihtheadDs)
AanPdI Ha3nhdistonee cgoenreresponding kariotipe ((misalnya)
r.eeSncaarlerobwahresad = s) 5prombe.s pada metafase counterstained dengan
DAPI dan sesuai

kariotipe (e). Skala bar = 5 m.

Ara

es untuk

mit

membosankan

reg

. (B)
Gambar 2.

? CMA pewarnaan dari pelat metafase yang sama menunjukkan bahwa DAPI
daerah kusam bernoda

CFiMguAre (a2r.roFwluso) r.o (ch) rFoISmHe

mstaipnpininggaonfdteFloISmHermicaspepqiunegnocef stetlootmhersiac,
mreDmNeAtaapnhdasheisptolante cgoeunnetpe rotbaeinsetdo

wmiitthotDicAcPhIr / oPmI
sohsomsesgroefenSpsiisgunlaalssuabttrtuhneceantad.s (tolol) aDllAcPhIr-
osmtaaintiedds manedtaDpAhaPsIe- / pPlIa +
teresghiowsinstgaiDneAdPiIndruedll ke mitosis c (rahergrioownmss) o (.as
(rdoro) mwFIseS) sHsuombftaepSrmppiiinnsgualola (f12)
s8auSnbdrtDrinNutnAercc (aaytleall.oyw (aa)) rtroDotwhAhePelaoIdn-sgt,
a5imSnrseDodNf eAmig (ehrtet adcpharhrormaowsoeshoepmadleasp) teainrsdsh.
H (ob3w) ing DAPI

kusam regionsCM (aArrsotawinsin) gsuofbttheermsamineaml (e1ta) pahnasde

pinlatterschaolwaerdy t (h7a) t ttohethDeAPloI ndugllarremgiosnos
fweeirgehstacinherdowmitohsome pasang; (B) CMA

? CMA (panah). (C) IKAN pemetaan urutan telomeric ke piring metafase sama
counterstained

pewarnaan dari pelat metafase yang sama menunjukkan bahwa daerah kusam
DAPI bernoda

dengan DAPI / PI menunjukkan sinyal hijau di ujung semua kromatid dan

DAPI- / PI + daerah bernoda merah

? Dengan CMA (panah (arsr) o; w (cs)). F (dI) SFHISHmmapapppiinng

ooff2t8eSlorDmNeAri (cyesleloqwuaernrocweshetaodst) h, e5SsraDmNeAm
(retaaprrhoawsheeapdlsa) taendcoHu3nterstained
dengan DAPI / PI menunjukkan sinyal hijau di ujung semua kromatid dan
DAPI- / PI + daerah bernoda merah (tanda panah); (D) IKAN pemetaan 28S
rDNA (panah kuning), 5S rDNA (panah merah) dan gen histon H3 (panah hijau)
probe pada metafase yang sama counterstained dengan DAPI dan sesuai kariotipe
(e). Skala bar = 5 m. Gen 2016, 7, 47 5 dari 10

Gen 2h0i1st6o, n7, e47gene (panah hijau) probe pada metafase yang sama
counterstained dengan DAPI dan the5 dari 10

kariotipe sesuai (e). Skala bar = 5 m.

Gambar 3.
FFlluuoorroocchhrroommeesstataininininggaannddFFISISHHmmapappinigngofot
fetleolmomereicr, ICR, DrNDANAanadnhdishtiosntoengeengenperopbreosbetos
tmoimtoittioc tcichcrohmrooms osoems eosfoMf Macatrcatrastsutlutoltrourmum.
(.a () A) DDAAPPI-Is-tsatianinededmmeetatapphhaasesepplalatete
sshhoowwiinngg DAPI daerah kusam ((arrrowss)) ssuubbtteerrmmiinnaall (2 (2))
aannddinitnetrecraclaalrayry (6 () 6t) ottohethleonlognagrmarsmosf
soefvseenvcehnrochmrosmoomseompaeirpsa. i (RBS); (CBM)
CAMsAtaisntianinginogf tohfethseamsaemme
emtaeptahpahseaspelpatleatsehsohwowededthtahtat teheDDAAPPI
Idduullllrreeggioionnss wweerree diwarnai dengan CMA (panah) ;. (C) IKAN
pemetaan urutan telomeric ke pelat metafase yang sama counterstained wiith
DAPPII // PPII sshows sinyal hijau aatt tthhee
eennddssooffaalllcchhrorommaatitdidssaannddDDAAPPI I - // PI + rred - staiined
daerah (panah) ;. (D) IKAN pemetaan 28S rrDNA ((panah kuning), 5S rDNA
(panah merah) dan gen histon H3 (panah hijau) probe di piring metafase yang
sama counterstained dengan DAPI dan sesuai karyottype ((e)) .. Skala bar = 5
m.
Dalam rangka untuk menyelidiki lokasi cluster rDNA utama dalam kaitannya
dengan 5S rDNA dan

Dalam rangka untuk menyelidiki lokasi cluster rDNA utama dalam kaitannya
dengan 5S rDNA dan

cluster gen inti histone, kami melakukan percobaan IKAN ganda dan berurutan
menggunakan 28S rDNA,

kelompok gen histone inti, kami melakukan percobaan IKAN ganda dan
berurutan menggunakan 28S rDNA,

5S rDNA dan H3 inti probe gen histon. Ketiga kerang palung menunjukkan 5S
rDNA cluster

5S rDNA dan H3 inti probe gen histon. Ketiga kerang palung menunjukkan 5S
rDNA cluster

subterminal di lengan pendek kromosom pasangan 5 di Spisula solida (Gambar

1d, e) dan pada panjang

subterminal di lengan pendek kromosom pasangan 5 di Spisula solida (Gambar

1d, e) dan pada panjang

pelukan pasangan kromosom 3 di Spisula subtruncata (Gambar 2d, e), dan kabisat
pada lengan pendek

pelukan pasangan kromosom 3 di Spisula subtruncata (Gambar 2d, e), dan kabisat
pada lengan pendek

pasangan kromosom 15 di Mactra stultorum (Gambar 3d, e). Meskipun H3

kelompok gen histon juga dipetakan

dari pasangan kromosom 15 di Mactra stultorum (Gambar 3d, e). Meskipun H3

kelompok gen histon juga
untuk lokus tunggal dalam tiga spesies dianalisis, lokasi mereka berbeda dan
kabisat ke panjang

dipetakan ke lokus tunggal dalam tiga spesies dianalisis, lokasi mereka berbeda
dan kabisat

lengan kromosom berpasangan subtelocentric 8 di Spisula solida (Gambar 1d, e)

dan 12 di Mactra stultorum

ke lengan panjang pasang kromosom subtelocentric 8 di Spisula solida (Gambar

1d, e) dan 12 di Mactra

(Gambar 3d, e) tapi subcentromeric ke lengan panjang metasentrik pasangan

kromosom 14 di Spisula

stultorum (Gambar 3d, e) tapi subcentromeric ke lengan panjang metasentrik

pasangan kromosom 14 di

subtruncata (Gambar 2d, e). Terlepas dari cluster gen histon di Mactra stultorum
pasangan kromosom

Spisula subtruncata (Gambar 2d, e). Terlepas dari cluster gen histon di Mactra
stultorum kromosom

12, tidak gen histon atau 5S rDNA cluster yang terletak di pasang kromosom yang
beruang

Pasangan 12, tidak gen histon atau 5S rDNA cluster yang terletak di pasang
kromosom yang beruang

DAPI- / CMA + band heterokromatik.

DAPI / CMA + band heterokromatik.

Dalam rangka untuk mendeteksi urutan telomeric di spesies ini, kami juga
melakukan eksperimen IKAN
Dalam rangka untuk mendeteksi urutan telomeric di spesies ini, kami juga
melakukan eksperimen IKAN

menggunakan telomeric vertebrata (C3TA2) 3 PNA sebagai probe. Seperti yang

ditunjukkan pada Gambar 1c, 2c dan 3c, sinyal telomeric

menggunakan telomeric vertebrata (C3 TA2) 3 PNA sebagai probe. Seperti yang
ditunjukkan pada Gambar 1c, 2c dan 3c, telomeric

terdeteksi secara eksklusif di ujung kromatid kakak dari setiap kromosom mitosis
tanpa

sinyal terdeteksi secara eksklusif di ujung kromatid kakak dari setiap kromosom
mitosis

indikasi sinyal kabisat.

tanpa indikasi sinyal kabisat.

Ringkasan hasil yang diperoleh dalam penelitian ini, bersama-sama dengan

sitogenetika dipublikasikan sebelumnya

Ringkasan hasil yang diperoleh dalam penelitian ini, bersama-sama dengan

sitogenetika dipublikasikan sebelumnya

Data di spesies dari keluarga Mactridae, dapat diamati pada Tabel 2.

Data di spesies dari keluarga Mactridae, dapat diamati pada Tabel 2.

IdIedoegorgarmammataictircerperperseesnetnattaiotinosnsofotfhtehetrtoruoguhgh
shsehlellkl akrayroytoytyppesesshshoowwininggththeelolocacatitoionnoof
fththeeGGCC-r-ich hertiecrhochhertoemroacthircormegaitoicnsretgoigoentshetor
gweitthher28wSitrhDN28AS, r5DSNrDAN, 5AS
arDndNHA3ahnidstoHn3ehgiesntoencelugsetneerscalurestderi s alraeyed di
dFiisgpulareye4d. pada Gambar 4.
Gambar 4. kariotipe Ideogrammatic dari kerang melalui: (a) Spisula solida; (B)
Spisula subtruncata;

anFdig (ucr) e 4M. Iadcetroagrsatmulmtoartuicmk. arDyAotPyIpeds uolflth

(eCtMroAughbrsihgehllts /: C (a) pSopissiutilva eso) libd a; n (db) s
Sapirseuladseupbitcrtuendcaitna; awndhite.

28 (Sc) rDMNacAtrasigstnualtlosr, udmra. wDnAPinI ydeullllo (WC, Marae

cboriignhcti / dCenptowsitiitvhet) hbeasnudbstearrme dineaplicDteAdPiIn w /
ChiMteA. 2 + 8 / SCr + DNbaAnds.

5SsirgDnaNlsA, dcrlauwstnerisn ayreellopwo, rtarraeyecodinicnidreendt. wiHth3

t hisstounbteergmeinnealcDluAstPeIr-s /, CMgrAee + n / C, + arbeancdosin.
c5iSderDntNwA engan

cluster digambarkan dengan warna merah. kelompok gen histon H3, hijau, yang
bertepatan dengan DAPI- / CMA + / C +

DAPI / CMA + / C + band di Mactra stultorum.

band di Mactra stultorum.

4. 4D. Disicsucussioionn

ChCrhormomosoosommee
numbeerrsshhavaevebebeneednesdcreisbcerdibinedonilny aonfelwy sapfecwies
sopf ethceiefsamofilythMeafcatrmidialye (MTaabcletr2id) ae (Ta [8b-le182]).
[T8-h1e8d] .ipTlhoeiddicphlrooidmcohsorommeonsoumebenrusmofbe2rns o = f
328n r = ec3o8rrdeecdoridnedthiins twhiosrwk oforkr
fMoracMtraactsrtaulsttourlutmor, um,
SpSispuislaulsaosliodliadanadndSSpipsiusulalassuubbttrruunnccaattaa berada di
acccoorrddaanncceewwitihthpprervevioiuosustsutduidesieosnosnevsevnemnamcta
ricdtrtiadxtaa; xa; hohwoewveevre, rt, htehyeydododdififfefrerfrforommththee
22nn == 36 reportteedd ffoorr RRaaeetata (L (Laabiboisoas) a) plpicliactaeltleall
[a8] [8a] nadndtheth2en2 = n 3 = 4 34
dedscersicbriebdedininTrTesressussucsacpaapxax (L
(Luutrtarariraiammaaxximimaa)) [[1144,, 115].

ReRgeagradridnigngkkaarryyoottyyppee comppoossiittioionn,,
stsrtirkiiknigngdifdfeifrfeenrceenscweserwe
edreetedcteetdecatmedonagmkoanrgyoktyapryesotoyfpthees dari
thespsepcieecsibeselobnegloinnggtiontghetofamthielyfMamacitlryidMae.aWcthrii
dleaael.l chWrohmiloesoamll
ecphariorsmwoesroemteelocpeanitrrsicwineMreultienlioaclaetnertarliics di M
[u1l3in, 1i7a, 1la8t] e, rtahlies o [t1h3e, 7t 1r, h1r8e] e, tshpeecoieths einr
twhhreicehskpaercyieostyipnews whiecrhe kparervyiootuysplyesdwesecreibpedre,
vMioauctsrlaycdhiensecnrsiibsed, Ma [1c1tr, 1a6c ] h, iSnpenissuisla [1so1l,
i1d6is] s, iSmpais [u1l2a] saonliddiTssriemsuas [1ca2p] aaxn (dLuTtrreasruisa
cmapaxaxim (La) u [t1r4ar, 1ia5] m, maxoimstaly) [s1h4o, 1w5e],
dmmoesttalycesnhtoriwc ed
meatnadcesnutbrmiceatnacdensutrbicmcehtraocmenotsroimc cehproaimrso.
sTohme ekaprayiortsy. pTehseokf aMryaocttryapsetuslotofrMuma,
cStrpaissutlualtsoorliudma, aSnpdisSupliasusloalida ansdubtSrpuinscualtaa
shuebretrudnecsactraibehderaelsdo
epscrerisbeendtedalasohipgrhespernotpeodrtiaonhiogfhmpertaocpeonrttriioc
nanodf smubemtaecteancternictriacnd

pasang sucbhmroemtaocseonmtreicpcahiro.mosome.

ThTeheaapppplilcicaattiioonn
ooffddivievresresceomcobminbaitnioantisoonfsbaosfe-bsapseec-
ifsipceflcuifiorcocflhurormoecshtroomthesstatoinitnhge osftbaiivnailnvge dari

kromosom telah banyak terdeteksi daerah yang kaya GC bertepatan dengan

daerah nucleolus mengorganisir

kromosom kerang telah banyak terdeteksi daerah yang kaya GC bertepatan

dengan penyelenggaraan nucleolus
r (NOR) [7,21,22,27-31]. Hasil penelitian kami menunjukkan bahwa ini juga
berlaku untuk Spisula solida di mana di

egions (NOR) [7,21,22,27-31]. Hasil penelitian kami menunjukkan bahwa ini juga
berlaku untuk Spisula solida

dua daerah yang kaya GC terdeteksi yang bertepatan dengan dua kelompok gen
utama rRNA. Sebaliknya,

yang dua daerah yang kaya GC terdeteksi yang bertepatan dengan dua kelompok
gen utama rRNA.

kehadiran tujuh wilayah yang kaya GC kabisat, selain tunggal GC kaya NOR, di
Spisula

Sebaliknya, kehadiran tujuh wilayah yang kaya GC kabisat, selain tunggal GC-
kaya

subtruncata dan enam daerah yang kaya GC kabisat terletak di luar dua NOR di
Mactra stultorum

NOarRe, ainraSrepipsuhleansoumbternuonncaintabainvadlvthese. sInixfainct,

erthcaelsaerkyinGdCo-rfiGchCr-reigchionbasnldoscawteedreopurtesvidioeutshlye
rtewporNteOd Rs

inoMnlyacftorar tshteulwtoerdugme sahrellaDroanraex ptrhuenncuolmuse [n3o2n,

33i] nanbdivtahlve ezse.braInmfuascste, l tDheresiessekniandpoloyfmGorCph-ari
[c3h4,3b5a] n. ds

sebelumnya dilaporkan hanya untuk wedge shell Donax trunculus [32,33] dan
kerang zebra