Biology

General Course
Biology (BIO 100)
Course (BIO101)
Kuliah III:
Energi Selular
Cara Sel Menggunakan dan Menghasilkan Energi

Education Program for General Competences

Bogor Agricultural University
2017
Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Bogor Agricultural University
 Source Materials
Source Material

PowerPoint Lecture Presentations for Biology

8th Edition
Neil Campbell and Jane Reece

10th Edition
Neil Campbell and Jane Reece

Main content of the lecture is derived from the sources

above

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Learning Outcome

Di akhir pertemuan ketiga ini, mahasiswa

akan mempu menjelaskan prinsip-prinsip
dasar respirasi selular dan fungsi-
fungsinya

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 TOPIK

1. Energi
2. ATP merupakan energi kimiawi di dalam sel
3. Enzim berperan dalam mengkatalis reaksi
seluler
4. Protein membran dan fungsinya
5. Produksi energi oleh sel
6. Respirasi seluler dan fermentasi

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Energi : Kapasitas Melakukan Kerja
Sel-sel hidup membutuhkan dan
menghasilkan energi.
Mereka menghasilkan energi yang
mereka butuhkan.
Firefly

Kunang-kunang

Organisme menggunakan
berbagai jenis energi untuk
aktifitas mereka.
Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Bogor Agricultural University
 Ribuan Reaksi Kima Energi
Sel-sel hidup tersekat-sekat oleh membran-membran
Membran menjadi situs berlangsungnya ribuan reaksi
kimia dan dikatalisatori oleh enzim
Reaksi-reaksi tersebut menyimpan atau melepas energi

Beberapa tipe energi :

Energi Kimia (mis. molekul ATP)
Energi Potensial : energi yang
tersimpan
Energi Kinetik : energi yang
Energi ? sesungguhnya untuk melakukan kerja Energi ?

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 ATP : Energi kimia di dalam sel

Pada respirasi selular, sebagian energi disimpan

dalam bentuk molekul ATP
Pemecahan ATP mensuplai energi untuk kerja
selular

Adenin
Gugus fosfat

+ Energi
Ribosa
untuk kerja
Adenosin trifosfat Adenosin difosfat selular
(ADP)

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Hukum Termodinamika
Hukum I
Energi dabat diubah dari satu
bentuk energi ke bentuk lain,
tetapi tidak dapat diciptakan
atau dimusnahkan
Hukum II
Perubahan energi tidak 100%
efisien
Perubahan tsb meningkatkan
ketakteraturan
Sebagian energi selalu hilang
sebagai panas
Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Bogor Agricultural University
 Energi Aktifasi (EA)
Di dalam suatu reaksi, reaktan-reaktan menyerap
mengabsorbsi sejumlah energi untuk memulai reaksi tsb
(energi aktifasi = EA).
EA : tingkat energi yang harus diatasi oleh reaktan

Enzim menurunkan EA
Tingkat EA

Enzim
Reaktan Reaktan

1 Produk 2 Produk

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Enzim mengkatalisis reaksi-reaksi selular
Enzim
(sukrase) Substrat
Situs aktif (sukrosa)
Enzim : spesifik dan
selektif Glukosa Fruktosa 1
4
Enzim dengan
Produk situs aktif
dilepaskan kosong

Setelah suatu reaksi, 3

enzim tidak berubah 2
Substrat
dan dapat mengulangi diubah jadi
produk
proses katalisis Substrat terikat
pada situs aktif

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Lingkungan Seluler
dapat Mempengaruhi Aktivitas Enzim

Aktivitas enzim dipengaruhi oleh :

suhu
konsentrasi garam
pH

Beberapa enzim memerlukan molekul non-protein sebagai

ko-faktor untuk aktivitasnya
Beberapa kofaktor adalah molekul organik yang disebut
dengan koenzim

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Inhibitor Memblokir Aksi Enzim
Substrat Situs
Inhibitor mempengaruhi kerja aktif

enzim dengan cara: Enzim

Menduduki situs aktif PENGIKATAN SUBSTRAT NORMAL

enzim inhibitor Inhibitor

kompetitive
kompetitif

Mengeliminir fungsi enzim

dengan mengubah bentuk
enzim inhibitor
nonkompetitif Inhibitor
noncompetitif

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Banyak Obat, Pestisida dan Racun
sebagai Inhibitor Enzim

Pestisida tertentu bersifat racun terhadap

serangga karena menghambat kerja enzim kunci
pada sistem saraf beberapa digunakan sebagai
senjata kimia (ex. organofosfat)

Banyak antibiotik menghambat kerja enzim

penting untuk kelangsungan hidup bakteri patogen
Ex. Penicillin menghambat enzim yang
digunakan bakteri dalam membuat dinding sel
Sejumlah enzim yang berfungsi di dalam metabolisme
dapat ditemukan pada Membran Sel

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Membran Sel
Mengatur reaksi-reaksi metabolisme
Mengendalikan aliran bermacam zat keluar/masuk sel
(selective permeable)
Memiliki beberapa jenis protein
Glycoprotein Carbohydrate (of
glycoprotein)
Fibers of the
extraselular
matrix
Glycolipid

Phospholipid
Cholesterol
Microfilaments of Proteins
the cytoskeleton
CYTOPLASM
Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Bogor Agricultural University
 Protein pada Membrane dan Fungsinya

Aktifitas
enzimatik 1

2
Pengenalan
antar sel

Tautan
antar sel
Transport
Transduksi 3
4
sinyal
Pelekatan pada sitoskeleton
dan matriks ekstraselular 5
6
Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Bogor Agricultural University
 Transportasi Melintasi Membran
secara Pasif (Difusi)
Molekul
pewarna Membran
EKUILIBRIUM
Pada transport pasif , zat-zat
berdifusi melalui membran
tanpa kerja sel
Dari konsentrasi tinggi ke
konsentrasi lebih rendah
Difusi satu tipe molekul

EKUILIBRIUM

Difusi dua tipe molekul

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Osmosis : Transpor pasif air
Pada osmosis, air bergerak
LARUTAN LARUTAN
Hipotonik Hipertonik

dari cairan berkonsentrasi

rendah (larutan hipotonik) ke Molekul
Solut
cairan berkonsentrasi lebih
tinggi (larutan hipertonik) Membran
selectif
permeabel

LARUTAN HIPOTONIK LARUTAN HIPERTONIK

Molekul
air

Molekul solut dengan

kluster molekul air

Membran
selectif
permeabel

ALIRAN AIR

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Keseimbangan Air antara Sel dan Lingkungannya Krusial
bagi Organisme
Osmosis menyebabkan sel mengerut di dalam larutan hipertonik
and menggembung di dalam larutan hipotonik
LARUTAN LARUTAN LARUTAN
ISOTONIK HIPOTONIK HIPERTONIK

Sel
Hewan

Normal Lisis Mengkerut

Plasma
Sel membrane
Tumbuhan

Normal Turgid Mengkerut

Pengendalian keseimbangan air (osmoregulation) penting bagi

organisme
Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Bogor Agricultural University
 Transport aktif Melintasi Membran
(Sel Menggunakan ATP)
Cairan Protein transport
Ekstrasel Protein terfosforilasi
Transport aktif dapat transport

memindahkan solut
melintasi membran
melawan gradien Solut 1

konsentrasi 1Solut 1, di dalam sel 2 ATP mentransfer 3 Protein melepas

terikat pada protein fosfat ke protein solut 1 ke luar sel
Ex. Transportasi
Solut 2
dua solut melintasi
membran

4 Solut 2 terikat 5 Fosfat lepas dari 6 Protein melepas

pada protein protein solut 2 ke dalam
sel

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Transportasi Molekul Besar (Particles)
dengan Eksositosis and Endositosis
Eksositosis
Cairan ekstrasel

SITOPLASMA

Endositosis

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Pemanenan Energi oleh Sel

Sel Otot Pelari Maraton Vs Sprinter

Memiliki banyak serabut Memiliki lebih banyak
otot lambat (slow) serabut otot cepat

Memecah glukosa untuk Memproduksi ATP secara

produksi ATP secara aerobik anaerobik (tanpa O2)
(dengan O2)
Dapat kontraksi cepat
Dapat menahan kontraksi dan mensuplai energi
berulang-ulang dan lama untuk aktifitas yang kuat
dalam waktu singkat

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Bernafas untuk Respirasi Selular

Hampir semua sel pada kebanyakan organisme

menghasilkan ATP secara aerobik (respirasi selular)
O2 CO2

Bernafas
mensuplai O2 ke
CO2
sel dan membuang
CO2

O2
CO2

Respirasi Selular
Glukosa + 6O2 ATP + 6CO2 + 6H2O

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Efisiensi Respirasi Selular

Energi Energi Energi

dilepaskan dari glukosa dilepaskan dari glukosa dari BBM diubah menjadi gerak
(sebagai panas dan cahaya) disimpan didalam ATP

100%

About
40% 25%

Pembakaran Pembakaran glukosa Pembakaran BBM di

glukosa di lab pada respirasi selular mesin mobil

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Tubuh Manusia Menggunakan Energi
dari ATP untuk Semua aktifitasnya

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Mekanisme Dasar
Pelepasan dan Penyimpanan Energi
Energi (ATP) yang dihasilkan setelah elektron ditransfer
dari senyawa organik ke O2, digunakan oleh sel

Ter-Oksidasi
Kehilangan atom hidrogen
dan elektron

Energi
(ATP)
Glukosa
Ter-Reduksi
Mendapatkan atom
hidrogen dan elektron

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Pembawa Hidrogen (spt. NAD+ & FAD+)
Mengangkut Elektron juga
Enzim melepaskan e- dari bahan bakar (senyawa)
organik dan mentransfernya ke NAD

OKSIDASI

Dehydrogenase
dan NAD+

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
Energi Dilepaskan Seiring dengan Pengaliran Elektron dari
Pembawa Hidrogen ke O2
NADH mengirimkan elektrons ke rangkaian pembawa
elektron pada Rantai Transport Elektron
Dengan berpindahnya
elektron dari satu pembawa
ke pembawa berikutnya,
energi dilepaskan dalam
jumlah kecil

Aliran Electron

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Dua Mekanisme Pembentukan ATP
1. Fosforilasi Kemiosmotik
High H+
H+
Gradient [H+ ]
concentration
H+ (=energi potensial)
H+
digunakan untuk
H+
membuat ATP
H+
H+ secara kemiosmosis
H+
Rantai
Membrane

H+
Transport H+
Elekctron H+
H+
Low H+ H+
From
concentration H+
NADH H+
H+ H+ ATP sintase
H+
Energi yang dilepaskan oleh
elektron saat berpindah H+
H+
dipakai untuk memompa H+ H+
melintasi membran
Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Bogor Agricultural University
 Dua Mekanisme Pembentukan ATP

2. Fosforilasi Tingkat Substrat

Dengan mentransfer Enzim

gugus fosfat dari
molekul organik ke ADP Adenosine

Molekul Organik
(substrat)

Adenosine

Molekul Organik baru

(produk)

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Mitokondria : Generator utama ATP

2 6

3
4

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Tiga Tahapan Utama Respirasi Selular
NADH
NADH & FADH2 membawa elektron berenergi tinggi

NADH & FADH2

Mitokondria
1 3 3
2
GLIKOLISIS RANTAI TRANSPORT
Asam KREBS ELEKTRON
Glukosa Piruvat CYCLE DAN KEMIOSMOSIS

Cairan
Sitoplasma

Dengan fosforilasi Dengan fosforilasi

tingka substrat kemiosmosis
Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Bogor Agricultural University
 1. Glikolisis
- mengubah glukosa menjadi asam piruvat untuk
memanen energi kimia (ATP) sambil melepas e-

Glukosa Asam
Piruvat

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Glikolisis
Glucose FASE PERSIAPAN
Steps 1 3 Step (Investasi energi)
Glukosa mendapat 1
energi ATP. Glucose-6-phosphate
2
Fructose-6-phosphate
3
Step 4
Fructose-1,6-diphosphate
Senyawa intermediet 4
berkarbon-6 terurai menjadi 4
Glyceraldehyde-3-phosphate
dua molekul berkarbon-3 (G3P)
5
FASE HASILKAN
Step 5 Reaksi redoks ENERGI
5 1,3-Diphosphoglyceric acid
menghasilkan NADH.
66 (2 molecules)

3-Phosphoglyceric acid
Steps 6 9 77 (2 molecules)
ATP and asam pruvat
dihasilkan. 2-Phosphoglyceric acid
8
8
(2 molecules)

2-Phosphoglyceric acid
(2 molecules)
99
Pyruvic acid
(2 molecules
per glucose molecule)
Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Bogor Agricultural University
 Asam Piruvat dipersiapkan secara kimiawi
untuk Siklus Krebs
Pemecahan setiap molekul asam piruvat menghasilkan:
1. Asetil CoA (senyawa berkarbon 2) yang akan masuk Siklus Krebs
2. NADH (elektron berenergi tinggi yang ditangkap oleh NAD+)
3. CO2 (dekarboksilasi)

Asam Acetyl CoA

Piruvat (Asetil Koenzim A)

CO2
Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Bogor Agricultural University
 2. Siklus Krebs
- menuntaskan pemindahan elektron dari bahan organik
Acetyl CoA

Serangkaian reaksi yang

dikatalisis enzim
melepaskan elektron
dan H+ (yang ditangkap
oleh NAD+ dan FAD+) 2
NADH and FADH2. KREBS
CYCLE
CO2

Juga dihasilkan ATP dan

CO2

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 SIKLUS KREBS
2 carbons enter cycle
Oxaloacetic
acid
1
1

Citric acid

5 CO2 leaves cycle

SIKLUS 2
KREBS 2
Malic
acid

4 Alpha-ketoglutaric acid
3
CO2 leaves cycle
Succinic
acid

Tahap 1 Acetyl CoA Tahap 2 dan 3

menyiapkan proses Reaksi redox menghasilkan Tahap 4 dan 5
pembakaran NADH, ATP, dan CO2 Reaksi redox menghasilkan
FADH2 dan NADH.
Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Bogor Agricultural University
 3. Rantai Transport Elektron
Kompleks H+ c. Pada kemiosmosis, H+ difusi
H+ H+
Protein balik terbentuk ATP
Ruang Pembawa
Intermembran Elektron
H+
H+
H+
Membrane H+
dalam H+
mitokondria Aliran H+
Elektron H+ ATP
Matriks H+ Sintase
mitokondria
H+
H+
H+ H+ H+

a. Elektron dari NADH and b. Energi yang dilepas

elektron digunakan H+ H+
FADH2 mengalir melintasi H+
Rantai Transport Elektron untuk memompa H+ ke
ke O2 ruang intermembran
Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Bogor Agricultural University
 Membuat ATP dengan Fosforilasi Kemiosmotik
H+
Ruang intermembran
Ada gradien proton (H+)
Stator
antara ruang intermembran Rotor
dan matriks mitokondria

Batang
internal
Energi potensial karena Knob
katalitik
adanya gradien proton
digunakan untuk membuat
ATP ADP ATP
Matriks mitokondria

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Racun tertentu mengganggu proses respirasi selular
Rotenon Sianida, dan CO Oligomisin

DNP

Rotenon: insektisida,
Sianida dan CO : racun
Oligomisin: antibiotik untuk memerangi infeksi cendawan,
Dinitrophenol (DNP) : untuk menurunkan bobot badan,
tetapi berbahaya untuk kesehatan
Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Bogor Agricultural University
 Review:
Setiap molekul glukosa hingga 38 molekul ATP
Cytoplasmic fluid

Electron shuttle
across membranes

GLYCOLYSIS
KREBS ELECTRON
glukosa 2 Pyruvic 2 Acetyl CYCLE TRANSPORT CHAIN
acid CoA AND CHEMIOSMOSIS

+ 2 ATP - about 0 - 2 ATP + 2 ATP + about 34 ATP

by substrate-level used for shuttling by substrate-level by chemiosmotic
phosphorylation electrons from NADH phosphorylation phosphorylation
made in glycolysis
About
38 ATP
Maximum per 1 molecule of glukosa
Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Bogor Agricultural University
 Fermentasi: Respirasi Anaerobik
Pada kondisi anaerobik ( tanpa O2)
Sel dapat menggunakan glikolisis saja untuk
menghasilkan sejumlah kecil ATP
Tetap sel harus memiliki cara mendaur ulang NAD+

a. Fermentasi alkohol :
- asam piruvat diubah menjadi etanol and CO2

dilepaskan

GLYCOLYSIS

2 Etanol
2 Pyruvic
acid
NAD+
di daur ulang

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Fermentasi: Respirasi Anaerobik
b. Fermentasi asam laktat :
Asam piruvat diubah menjadi asam laktat
Digunakan untuk membuat keju dan yoghurt
mis. Lactobacillus

GLYCOLYSIS

2 Pyruvic 2 Lactic acid

glukosa acid
NAD+ di daur ulang
Pada hewan dan manusia, sel otot yang digunakan dengan kuat dan
cepat dapat kekurangan suplai O2 respirasi anaerobik
(menghasilkan asam laktat)
Ketika tersedia O2 lagi, asam laktat menjadi asam piruvat di hati
Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Bogor Agricultural University
 Sel menggunakan banyak macam molekul organik
sebagai bahan bakar respirasi selular

Makanan,
seperti kacang

Polisakarida Lemak Protein

Monosakarida Gliserol Asam lemak Asam amino

Gugus
mino

Glukosa G3P Asam Asetil SIKLUS RANTAI TRANSPORT

Piruvat CoA KREBS ELEKTRON
GLIKOLISIS DAN KEMIOSMOSIS

ATP

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Makanan: Bahan baku untuk biosintesis

Selain untuk energi, sel membutuhkan bahan

mentah untuk pertumbuhan dan perbaikan
Beberapa diperoleh langsung dari makanan
Lainnya dibuat dari molekul-molekul intermediet
pada glikolisis dan siklus Krebs

Biosintesis
memerlukan ATP

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
Biosintesis makromolekul dari molekul intermediate
pada respirasi selular
Biosintesis
memerlukan ATP

Sintesis glukosa
KREBS Acetyl Asam G3P Gukosa
CYCLE CoA piruvat

Amino
groups

Asam Amino Asam lemak Gliserol Monosakarida

Protein Lemak Polisakarida

Sel, Jaringan, Organisms

Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Bogor Agricultural University
 Bahan bakar respirasi berasal dari fotosintesis

All organisms have the ability to

harvest energi from organic
molecules
Plants can also make the organic
molecules from inorganic sources
by the process of photosynthesis.

Thank You
Department of Biology-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Bogor Agricultural University