STUDI KERAGAMAN CIPLUKAN (Physalis angulata L.

) DI WILAYAH
EKS-KARESIDENAN SURAKARTA BERDASARKAN VARIASI CIRI
MORFOLOGI, BUKTI SERBUK SARI DAN POLA PITA ISOZIM

Skripsi
Untuk memenuhi sebagian persyaratan
guna memperoleh gelar Sarjana Sains

Oleh :
AINUN NADHIFAH
NIM. M 0408002

JURUSAN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS SEBELAS MARET
SURAKARTA
2012

 ii

 iii

 PERNYATAAN

Dengan ini saya menyatakan bahwa skripsi ini adalah hasil penelitian saya

sendiri dan tidak terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar

kesarjanaan di suatu perguruan tinggi, serta tidak terdapat karya atau pendapat

yang pernah ditulis atau diterbitkan oleh orang lain, kecuali secara tertulis diacu

dalam naskah ini dan disebutkan dalam daftar pustaka.

Apabila dikemudian hari dapat ditemukan adanya unsur penjiplakan maka

gelar kesarjanaan yang telah diperoleh dapat ditinjau dan / atau dicabut.

Surakarta, Mei 2012

Ainun Nadhifah
NIM. M0408002

iv

 STUDI KERAGAMAN CIPLUKAN (Physalis angulata L.) DI WILAYAH

EKS-KARESIDENAN SURAKARTA BERDASARKAN VARIASI CIRI
MORFOLOGI, BUKTI SERBUK SARI DAN POLA PITA ISOZIM

Ainun Nadhifah
Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam,
Universitas Sebelas Maret, Surakarta.

ABSTRAK

Ciplukan (Physalis angulata L.) merupakan salah satu tumbuhan liar yang
banyak dimanfaatkan sebagai obat tradisional. Penelitian ini bertujuan untuk
mengetahui keragaman dan hubungan kekerabatan ciplukan di wilayah eks-
karesidenan Surakarta berdasarkan variasi ciri morfologi, bukti serbuk sari dan
pola pita isozim.
Sampel diambil dengan menggunakan teknik purposive random sampling
pada 18 titik populasi dan diambil sebanyak 3 sampel pada masing-masing
populasi. Terminologi dari ciri morfologi mengacu pada Stearn (1992), analisis
serbuk sari menggunakan metode asetolisis dan analisis pola pita isozim dengan
elektroforesis daun muda (urutan 3 sampai 5 dari pucuk batang) menggunakan
dua sistem enzim, yaitu esterase dan peroksidase.
Data keragaman ciri morfologi, bukti serbuk sari, dan pola pita isozim
populasi ciplukan yang telah diperoleh dianalisis secara deskriptif. Data kualitatif
dan kuantitatif ciri mantap dari ciri morfologi dan bukti serbuk sari yang diperoleh
kemudian dibuat data multivariate sedangkan data kuantitatif dari isozim dibuat
data biner. Data biner dan multivariate kemudian digunakan untuk menghitung
besar indeks similaritas (IS) antar populasi dan dikomputasikan dalam program
Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System (NTSYSpc) versi 2.0
hingga diperoleh dendogram hubungan kekerabatan
Hasil penelitian menunjukkan ciplukan di wilayah eks-karesidenan
Surakarta memiliki keragaman baik secara kualitatif maupun kuantitatif terutama
pada warna dan ukuran batang, daun, bunga, buah dan biji; ukuran, jumlah
apertura, bentuk serbuk sari serta 5-6 pola pita isozim esterase dan 6-9 pola pita
isozim peroksidase. Berdasarkan variasi ciri morfologi, bukti serbuk sari dan pola
pita isozim menunjukkan Sukoharjo 2 dan 3 serta Klaten 1 dan 2 masing-masing
memiliki hubungan kekerabatan paling dekat dengan koefisien kemiripan 88%
sedangkan ciplukan Sukoharjo 1, Wonogiri 2 dan Sragen 2 mengelompok
tersendiri dan terpisah jauh dari kelompok lain pada koefisien kemiripan 70%.

Kata Kunci : Ciplukan, Surakarta, morfologi, serbuk sari, isozim

 THE DIVERSITY STUDY OF MULLACA (Physalis angulata L.) IN

SURAKARTA REGION BASED ON VARIATION OF
MORPHOLOGICAL CHARACTER, POLLEN EVIDENCE AND
ISOZYME BANDING PATTERNS

Ainun Nadhifah
Department of Biology, Faculty of Mathematics and Natural Sciences,
Sebelas Maret University, Surakarta.

ABSTRACT

The diversity and relationship among mullaca populations in Surakarta

region based on variation of morphological character, pollen evidence and
isozyme banding patterns have been determined.
The samples were taken using random purposive sampling technique,
including 18 sampling points while 3 samples from each population. The
terminology of examined morphological character was based on Stearn (1992).
The pollen grains from dehisce anther were analyzed using acetolysis method and
then examined under light microscope. Electrophoresis of esterase and peroxidase
from the young leaves (the order of 3 to 5 from the stem apex) were used for
isozymes analysis. The variation of morphological character, pollen evidence, and
isozyme banding patterns of mullaca populations were analyzed descriptively.
The multivariate data were made from qualitative and quantitative data of
morphological character and pollen evidence while binary data were created from
the data of isozymes. Multivariate and binary data were used to calculate
similarity index between populations and then computed in Numerical Taxonomy
and Multivariate Analysis System (NTSYSpc) version 2.0 to obtain relationship
dendogram.
The result showed the mullaca population in Surakarta region were
different both qualitatively and quantitatively, especially in color and size of
stems, leaves, flowers, fruits and seeds; size, number of aperture, and shape of
pollen; 5-6 esterase banding patterns and 6-9 peroxidase banding patterns. Based
on variation of morphological character, pollen evidence and isozyme banding
patterns showed that population from Sukoharjo 2, Sukoharjo 3, Klaten 1 and
Klaten 2 were the closest relationship with the similarity coefficient of 88% while
population from Sukoharjo 1, Sragen 2 and Wonogiri 2 clustered separately at
coefficient similarity of 70%.

Keywords: Mullaca, Surakarta, morphology, pollen, isozymes

vi

 MOTTO

Kerjakan segala sesuatu dengan sabar, ikhlas dan senantiasa berserah diri
pada-Nya, Insya Allah menghasilkan sebuah karya terindah

Kesulitan dan kegagalan sejatinya merupakan sebuah tantangan menuju

kesuksesan yang harus dihadapi, bukan untuk dihindari

Apa arti dari sebuah karya bila tidak mampu meyakinkan seorang pembaca,
selesaikan karyamu sebaik yang kau mampu, singkat ataupun lama semua itu
hanya masalah waktu

vii

 PERSEMBAHAN

Saya dedikasikan skripsi ini untuk :

Mas Suratman dan Mas Ari Pitoyo,

dua pribadi yang sangat inspiratif,
selalu mengajarkan untuk kritis berpikir,
tetap semangat berkarya dalam keadaan apapun

Mas Mulyanta,
Guru yang selalu mengingatkan untuk bersabar
...Ini adalah bagian dari semangat kesabaran...

Almamater, Universitas Sebelas Maret Surakarta

khususnya rekan-rekan seperjuangan (Angkatan 2008)
dan para junior

Bapak (alm) dan Ibunda Abdul Chalim tercinta,

Mbak Irma, Mas Haris, Mas Zainul, Mas Amir, Mas Niam, Mbak Ninis,
kasih sayang, kesabaran dan ketelatenan yang tiada tara dalam mendidik,
sehingga seorang ragil kini menjadi Sarjana

viii

 KATA PENGANTAR

Puji syukur penulis panjatkan ke hadirat Allah SWT yang senantiasa

melimpahkan rahmat serta hidayah-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan
penelitian dan penyusunan skripsi dengan Judul Studi Keragaman Ciplukan
(Physalis angulata L.) di Wilayah Eks-Karesidenan Surakarta Berdasarkan
Variasi Ciri Morfologi, Bukti Serbuk Sari dan Pola Pita Isozim. Penyusunan
skripsi ini merupakan salah satu syarat untuk memperoleh gelar kesarjanaan Strata
1 (S1) di Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam,
Universitas Sebelas Maret, Surakarta.
Penelitian dan penyusunan skripsi ini tidak terlepas dari saran dan
dukungan baik secara moral maupun material dari beberapa pihak yang sangat
membantu dan bermanfaat. Oleh karena itu, penulis mengucapkan terima kasih
kepada :
Yayasan Pelayanan Kasih A. & A. Rachmat yang telah memberikan
beasiswa kepada penulis hingga penyelesaian skripsi ini.
Dr. Agung Budiharjo, M. Si., selaku Ketua Jurusan Biologi, Fakultas
Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas Maret, Surakarta
yang telah memberikan izin dan dukungannya selama penelitian.
Suratman, M.Si., selaku Dosen Pembimbing I yang senantiasa
membimbing, memberikan saran, masukan dan ilmu secara detail kepada penulis,
hingga penulis benar-benar memahami materi dari awal penelitian hingga
terselesaikannya penyusunan skripsi ini.
Ari Pitoyo, M.Sc., selaku Dosen Pembimbing II yang telah sabar
memberikan bimbingan, ilmu dan metode serta dukungan baik secara moral
maupun material yang berharga bagi penulis.
Prof. Drs. Suranto, M.Sc., Ph.D., selaku Dosen Penelaah I atas segala ilmu
dan metode, masukan, kritikan serta dukungannya selama penelitian sehingga
penulis mampu mendalami dan memahami materi dengan baik.

ix

 Drs. Marsusi, M.S., Ph.D., selaku Dosen Penelaah II yang telah

memberikan saran, kritik dan dukungan hingga terselesaikannya penyusunan
skripsi ini.
Mulyanta, S.E., yang selalu mengajarkan kesabaran, menciptakan senyum
dalam kesulitan, senantiasa memahami penulis dan sekaligus menjadi rekan dalam
penelitian ini.
Widya Mudyantini, M.Si., selaku Kepala Laboratorium Jurusan Biologi
FMIPA, Universitas Sebelas Maret, Surakarta yang telah memberikan izin
penelitian beserta sarana dan prasarana selama penelitian.
Dosen-dosen di Jurusan Biologi, FMIPA, Universitas Sebelas Maret,
Surakarta yang tidak dapat disebutkan satu persatu yang telah mendidik dan
memberikan dorongan moral sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi ini.
Staf administrasi Jurusan Biologi, Sdr. Misbakhul Munir atas segala nasehatnya
kepada penulis serta laboran yang telah membantu kelancaran penelitian ini.
Septiana Kurniasari, Monarita Permatasari, Wahyu Susilowati, Endang
Werdiningsih, Putri Dian Anita, Sri Winarseh, Nita Ardita, A. Fahrurrozi H., yang
telah membantu dalam penelitian di lapangan. Yeni Indra Kumalasari yang telah
membantu dalam penyusunan laporan penelitian. Febria Eka, Angelia Arum
Prameta, Noor Endah, Tira Mayasari yang telah memberikan semangat
persahabatan, dukungan dan masukan yang sangat berarti bagi penulis.
Teman-teman Biologi khususnya angkatan 2008 yang selalu memberikan
motivasi dan dukungan kepada penulis dan semua pihak yang telah membantu
dalam penyelesaian skripsi ini yang tidak dapat disebutkan satu persatu.
Penulis menyadari sepenuhnya bahwa dalam melakukan penelitian hingga
penyusunan skripsi ini masih jauh dari sempurna. Oleh karena itu masukan yang
bersifat membangun sangat penulis harapkan. Semoga skripsi ini dapat
bermanfaat.
Surakarta, Mei 2012

Penulis

 DAFTAR ISI
Halaman
HALAMAN JUDUL...................................................................................... i
HALAMAN PERSETUJUAN PEMBIMBING ............................................ ii
HALAMAN PENGESAHAN........................................................................ iii
HALAMAN PERNYATAAN ....................................................................... iv
ABSTRAK ..................................................................................................... v
ABSTRACT ................................................................................................... vi
HALAMAN MOTTO .................................................................................... vii
HALAMAN PERSEMBAHAN..................................................................... viii
KATA PENGANTAR.................................................................................... ix
DAFTAR ISI .................................................................................................. xi
DAFTAR TABEL .......................................................................................... xiii
DAFTAR GAMBAR ..................................................................................... xiv
DAFTAR LAMPIRAN .................................................................................. xvi
DAFTAR SINGKATAN................................................................................ xvii
BAB I. PENDAHULUAN ......................................................................... 1
A. Latar Belakang Masalah.......................................................................... 1
B. Perumusan Masalah................................................................................. 4
C. Tujuan Penelitian..................................................................................... 4
D. Manfaat Penelitian................................................................................... 5
BAB II. LANDASAN TEORI .................................................................... 6
A. Tinjauan Pustaka ..................................................................................... 6
B. Ciplukan (Physalis angulata L.) ............................................................ 6
C. Ciri Morfologi ......................................................................................... 10
D. Bukti Serbuk Sar ..................................................................................... 11
E. Pola Pita Isozim....................................................................................... 16
F. Hubungan Kekerabatan ........................................................................... 18
G. Kerangka Pemikiran................................................................................ 19

xi

 BAB III. METODE PENELITIAN............................................................... 21

A. Waktu dan Tempat Penelitian ................................................................. 21
B. Alat dan Bahan ........................................................................................ 21
C. Cara Kerja ............................................................................................... 22
D. Analisis Data ........................................................................................... 30
BAB IV. HASIL DAN PEMBAHASAN ..................................................... 32
A. Morfologi Ciplukan................................................................................. 32
1. Batang ............................................................................................. 32
2. Daun................................................................................................ 35
3. Bunga .............................................................................................. 39
4. Buah dan Biji .................................................................................. 41
B. Bukti Serbuk Sari .................................................................................... 42
1. Ukuran ............................................................................................ 44
2. Polaritas dan Simetri....................................................................... 44
3. Apertura .......................................................................................... 45
4. Bentuk dan Ornamentasi................................................................. 47
C. Pola Pita Isozim....................................................................................... 48
1. Esterase ........................................................................................... 49
2. Peroksidase .................................................................................... 51
D. Hubungan Kekerabatan ........................................................................... 53
1. Hubungan Kekerabatan ciplukan berdasarkan Variasi Ciri
Morfologi ........................................................................................ 53
2. Hubungan Kekerabatan ciplukan berdasarkan Variasi Ciri
Morfologi, Bukti Serbuk Sari, dan Pola Pita Isozim ...................... 55
BAB V. PENUTUP................................................................................... 59
A. Kesimpulan.............................................................................................. 59
B. Saran........................................................................................................ 59
DAFTAR PUSTAKA .................................................................................. 61
LAMPIRAN ................................................................................................. 68
RIWAYAT HIDUP PENULIS .................................................................. 84

xii

 DAFTAR TABEL

Halaman
Tabel 1. Lokasi pengambilan sampel ciplukan .......................................... 23

xiii

 DAFTAR GAMBAR

Halaman
Gambar 1. Morfologi ciplukan ...................................................................... 8
Gambar 2. Polaritas dan simetri serbuk sari .................................................. 12
Gambar 3. Jenis-jenis apertura....................................................................... 13
Gambar 4. Jenis ornamentasi serbuk sari....................................................... 14
Gambar 5. Struktur dinding serbuk sari......................................................... 15
Gambar 6. Bentuk dan ukuran serbuk sari berdasarkan indeks P/E .............. 15
Gambar 7. Bagan alir kerangka pemikiran .................................................... 20
Gambar 8. Perbedaan warna batang ciplukan di wilayah eks-karesidenan
Surakarta ...................................................................................... 33
Gambar 9. Histogram rasio panjang dan lebar daun muda serta panjang
dan diameter tangkai daun muda populasi ciplukan di wilayah
eks-karesidenan Surakarta............................................................ 37
Gambar 10. Histogram rasio panjang dan lebar daun tua serta panjang dan
diameter tangkai daun tua ciplukan di wilayah eks-
karesidenan Surakarta .................................................................. 37
Gambar 11. Keragaman bunga pada populasi ciplukan di wilayah eks-
karesidenan Surakarta .................................................................. 40
Gambar 12. Keragaman buah pada populasi ciplukan di wilayah eks-
karesidenan Surakarta .................................................................. 41
Gambar 13. Bukti serbuk sari ciplukan di wilayah eks-karesidenan
Surakarta ...................................................................................... 43
Gambar 14. Ukuran serbuk sari populasi ciplukan di wilayah eks-
karesidenan Surakarta .................................................................. 44
Gambar 15. Polaritas dan simetri bukti serbuk sari ......................................... 45
Gambar 16. Tipe apertura serbuk sari ciplukan di wilayah eks karesidenan
Surakarta ...................................................................................... 45
Gambar 17. Bentuk serbuk sari ciplukan di wilayah eks karesidenan
Surakarta ...................................................................................... 48

xiv

Gambar 18. Zimogram pola pita isozim esterase ciplukan di wilayah eks-
karesidenan Surakarta .................................................................. 50
Gambar 19. Zimogram pola pita isozim peroksidase ciplukan di wilayah
eks-karesidenan Surakarta............................................................ 51
Gambar 20. Dendogram hubungan kekerabatan ciplukan di wilayah eks-
karesidenan Surakarta berdasarkan ciri morfologi....................... 54
Dendogram hubungan kekerabatan ciplukan di wilayah eks-
Gambar 21. Dendogram hubungan kekerabatan ciplukan di wilayah eks-
karesidenan Surakarta berdasarkan ciri morfologi, bukti
serbuk sari, dan pola pita isozim esterase dan peroksidase.......... 56

xv

 DAFTAR LAMPIRAN

Halaman
Lampiran 1. Morfologi ciplukan di wilayah eks karesidenan Surakarta........ 68
Lampiran 2. Ciri morfologi ciplukan di wilayah eks-karesidenan
Surakarta .................................................................................... 70
Lampiran 3. Bukti serbuk sari populasi ciplukan di wilayah eks
karesidenan Surakarta................................................................ 76
Lampiran 4. Pembobotan ciri mantap dari ciri morfologi kualitatif dan
kuantitatif ciplukan .................................................................... 77
Lampiran 5. Hasil elektroforesis isozim ciplukan di wilayah eks
karesidenan Surakarta................................................................ 78
Lampiran 6. Perbandingan kemunculan pita isozim esterase ........................ 79
Lampiran 7. Perbandingan kemunculan pita isozim peroksidase .................. 80
Lampiran 8. Data multivariate ciri morfologi dan bukti serbuk sari serta
data biner pola pita isozim esterase dan peroksidase................. 81
Lampiran 9. Matriks Indeks Similaritas (IS) ciri morfologi, dan gabungan
ciri morfologi, bukti serbuk sari dan pola pita isozim
ciplukan di wilayah eks karesidenan Surakarta ......................... 83

xvi

 DAFTAR SINGKATAN

Singkatan Kepanjangan
AAG Asam asetat glasial
APS Ammonium Persulphate
BM Berat molekul
BYL Boyolali
CCRC Cancer Chemopreventon Research Center
Dkk Dan kawan-kawan
EST Esterase
HCl Asam klorida
Hlm. Halaman
H2SO4 Asam sulfat
KL Kapasitas Lapang
KLT Klaten
KRA Karanganyar
NaH2PO4 Natrium dihidrogen-fosfat
Na2HPO4 Dinatrium hidogren-fosfat
NTSYSpc Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System
PER Peroksidase
p:d Panjang : diameter
p:l Panjang : lebar
P/E Polar/Ekuatorial
Rf Retention factor
SDS Sodium Dodecyl sulfate
SKH Sukoharjo
SLO Solo
SRG Sragen
TEMED NNNN tetramethyl-ethilenediamine
WNG Wonogiri

xvii