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G Model

EIMC-1645; No. of Pages 7 ARTICLE IN PRESS


Enferm Infecc Microbiol Clin. 2017;xxx(xx):xxxxxx

www.elsevier.es/eimc

Formacin mdica continuada: Mtodos de diagnstico rpido en Microbiologa Clnica

Mtodos rpidos para la deteccin de la resistencia bacteriana


a antibiticos
Gabriel Alberto March-Rossell
Servicio de Microbiologa e Inmunologa, Hospital Clnico Universitario de Valladolid, Valladolid, Espa
na

informacin del artculo r e s u m e n

Historia del artculo: Los mtodos ms frecuentemente utilizados en Microbiologa Clnica para la determinacin de la sensi-
Recibido el 22 de noviembre de 2016 bilidad de las bacterias a los antibiticos se basan en un estudio fenotpico, observando el crecimiento
Aceptado el 16 de diciembre de 2016 bacteriano de una cepa incubada en presencia del antibitico a estudiar. Estos mtodos requieren nor-
On-line el xxx
malmente un tiempo de unas 24 h para la obtencin de resultados. En esta revisin se exponen el
fundamento y los resultados de las principales tcnicas instrumentales que proporcionan un antibio-
Palabras clave: grama rpido. De manera pormenorizada se exponen datos relativos a tcnicas moleculares, microarrays,
Antibiograma rpido mtodos comerciales utilizados en el trabajo de rutina, tcnicas inmunocromatogrcas, mtodos colo-
Antibiograma directo rimtricos, mtodos de imagen, nefelometra, espectrometra de masas MALDI-TOF, citometra de ujo,
Sensibilidad quimioluminiscencia y bioluminiscencia, microuidos y mtodos de lisis bacteriana.
S.L.U. y Sociedad Espanola
2016 Elsevier Espana, de Enfermedades Infecciosas y Microbiologa
Clnica. Todos los derechos reservados.

Rapid methods for detection of bacterial resistance to antibiotics

a b s t r a c t

Keywords: The most widely used antibiotic susceptibility testing methods in Clinical Microbiology are based on
Rapid antibiotic susceptibility test the phenotypic detection of antibiotic resistance by measuring bacterial growth in the presence of the
Direct antibiotic susceptibility test antibiotic being tested. These conventional methods take typically 24 hours to obtain results. Here we
Susceptibility
review the main techniques for rapid determination of antibiotic susceptibility. Data obtained with dif-
ferent methods such as molecular techniques, microarrays, commercial methods used in work routine,
immunochromatographic methods, colorimetric methods, image methods, nephelometry, MALDI-TOF
mass spectrometry, ow cytometry, chemiluminescence and bioluminescence, microuids and methods
based on cell disruption are analysed in detail.
S.L.U. and Sociedad Espanola
2016 Elsevier Espana, de Enfermedades Infecciosas y Microbiologa
Clnica. All rights reserved.

Introduccin Las tcnicas rutinarias del antibiograma se basan en un estudio


fenotpico en el que se observa el crecimiento microbiano en
Para conseguir una evolucin clnica favorable de los pacien- presencia de diferentes antibiticos. Estas tcnicas incluyen la
tes que padecen infecciones, el laboratorio de Microbiologa Clnica dilucin en agar (gold standard del antibiograma), macrodilucin
debe informar lo ms rpidamente posible el agente causal de dicha y microdilucin en caldo, tiras con un gradiente de antibitico,
infeccin. Si es una bacteria que no presenta una sensibilidad homo- y requieren unas 17 h para la obtencin de resultados. Con el n
gnea a los antibiticos se debe informar, adems, el antibiograma, de acortar este tiempo, sera deseable disponer de los resultados
ya que el notable aumento de resistencias a antimicrobianos di- del antibiograma de una forma rpida y able. Para evaluar la
culta, en algunos casos, el tratamiento emprico. abilidad, de acuerdo con la Food and Drug Administration (FDA)1 ,
los resultados de un antibiograma rpido se clasican, con res-
pecto al antibiograma obtenido mediante el gold standard, como
agreements (concordancia), minor errors (resultado errneo de una
Correo electrnico: gmr810@hotmail.com

http://dx.doi.org/10.1016/j.eimc.2016.12.005
0213-005X/ 2016 Elsevier Espana, S.L.U. y Sociedad Espanola
de Enfermedades Infecciosas y Microbiologa Clnica. Todos los derechos reservados.

Cmo citar este artculo: March-Rossell GA. Mtodos rpidos para la deteccin de la resistencia bacteriana a antibiticos. Enferm Infecc
Microbiol Clin. 2017. http://dx.doi.org/10.1016/j.eimc.2016.12.005
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sensibilidad intermedia), major errors (falsa resistencia) y very diferentes ensayos. Finalmente, mediante el uorocromo LCGreen
major errors (falsa sensibilidad). Plus (BioFire Diagnostics), el instrumento evala la curva de fusin
Existe un considerable nmero de tcnicas instrumentales del ADN en cada pocillo de la matriz para determinar si aparece, en
que permiten llevar a cabo un antibiograma rpido. Entre estas dicho pocillo, un producto de la PCR. Este sistema detecta, en una
cabe destacar las tcnicas moleculares, microarrays, mtodos hora, 11 especies y 15 gneros de bacterias grampositivas y gram-
comerciales utilizados en el trabajo de rutina, tcnicas inmu- negativas, y 5 especies de levaduras. Adems detecta los genes de
nocromatogrcas, mtodos colorimtricos, mtodos de imagen, resistencia mecA, vanA/B y KPC. La sensibilidad oscila entre el 83 y
nefelometra, espectrometra de masas MALDI-TOF, citometra el 100% y la especicidad es superior al 99%, dependiendo del pat-

de ujo, quimioluminiscencia y bioluminiscencia, microuidos y geno estudiado3 . El sistema GeneXpert realiza la PCR en tiempo
mtodos de lisis bacteriana. A continuacin se expone el funda- real en cartuchos desechables de un solo uso. Existe un nmero con-
mento de cada una de estas tcnicas y los resultados obtenidos. siderable de cartuchos para llevar a cabo diferentes anlisis. Para
la deteccin de Staphylococcus aureus y su resistencia a meticilina a
partir de muestras clnicas estn disponibles 2 cartuchos, el Xpert

Tcnicas moleculares MRSA/SA BC, que se utiliza a partir de frascos de hemocultivo cre-
cidos, y el Xpert MRSA/SA SSTI, que se utiliza a partir de hisopos
Las tcnicas moleculares permiten la deteccin de material para el diagnstico de infecciones de piel y tejidos blandos. Ambas
gentico, tanto cido desoxirribonucleico (ADN) como cido ribo- pruebas requieren una hora para la obtencin de resultados y pre-
nucleico (ARN). Entre las tcnicas moleculares, la reaccin en sentan una sensibilidad y especicidad muy cercanas al 100%3,5 . El

cadena de la polimerasa (PCR) es la que ha adquirido un mayor valor cartucho Xpert MTB/RIF detecta Mycobacterium tuberculosis y su
diagnstico, ya que permite una identicacin certera del agente resistencia a rifampicina a partir del esputo y de lquidos biolgicos
infeccioso, adems de ser el mtodo de referencia para caracteri- en 2 h. En este caso tiene lugar una PCR anidada semicuantitativa.
zar sus genotipos de resistencia y virulencia. La realizacin de una Se ha observado que en el esputo y en el lavado broncoalveolar
PCR convencional requiere aproximadamente unas 12 h y consta la prueba presenta una sensibilidad y una especicidad del 86,8
de 3 etapas. La primera consiste en una extraccin del material y del 93,1%, respectivamente, mejorando los resultados de la
gentico. La segunda etapa, llevada a cabo en un termociclador, baciloscopia6 .
se corresponde con la amplicacin del ADN. El termociclador per- En la literatura se han descrito un considerable nmero de PCR,
mite alcanzar las temperaturas ptimas necesarias para que tengan tanto caseras como comerciales y automatizadas, y kits para PCR
lugar cada uno de los 3 pasos de los que consta un ciclo de ampli- que detectan, de forma certera y con una sensibilidad y especi-
cacin (desnaturalizacin del ADN que se va a usar como molde, cidad prcticamente del 100%, un gran nmero de genes que
anillamiento de cebadores sintticos o primers y extensin cata- coneren resistencia a los antibiticos7 . Es preciso senalar
que estas
lizada por la ADN polimerasa de los primers). La amplicacin se metodologas no proporcionan la identicacin microbiana y que
repite un nmero determinado de veces, generalmente de 25 a se aplican, en la mayora de los casos, a partir de colonias crecidas
35, duplicndose cada vez el nmero de molculas de producto en las placas de aislamiento.
(amplicones). De esta forma se sintetiza un elevado de ampli- Entre de las PCR comerciales automatizadas en tiempo real cabe

cones, lo que permite detectar cantidades iniciales de ADN muy destacar las siguientes. La plataforma NucliSENS EasyQ KPC (bio-
2 . Finalmente, en la tercera etapa de la PCR se lleva a
pequenas Mrieux) detecta, en 2 h, genes que codican carbapenemasas tipo

cabo la deteccin de los amplicones mediante electroforesis en KPC8 . El cartucho Xpert Carba-R de GeneXpert detecta, en una
gel de agarosa. Con el n de acortar el tiempo de diagnstico de hora, genes que codican carbapenemasas tipo KPC, NDM, VIM,

la PCR convencional se ha disenado la PCR en tiempo real, en la IMP y OXA-489 . El sistema eazyplex (Amplex Biosystems GmbH)
que paralelamente a la amplicacin tiene lugar, mediante diferen- consiste en una plataforma que realiza la amplicacin de cidos
tes mtodos, la deteccin de los amplicones sintetizados. De este nucleicos mediante la tcnica loop-mediated isothermal amplica-
modo, la PCR en tiempo real permite obtener resultados en pocas tion (LAMP). Esta tcnica se fundamenta en la amplicacin de ADN
horas2 . por desplazamiento de cadena a una temperatura constante; de
Se han comercializado varias PCR en tiempo real que permiten este modo, el sistema no precisa de termociclador. Para llevar a
obtener la identicacin de varios agentes patgenos y de los genes cabo la amplicacin, el ADN extrado es introducido en un tubo
que coneren resistencia a antibiticos directamente a partir de que contiene un liolizado con los reactivos necesarios para lle-
diferentes muestras. Estas PCR estn totalmente automatizadas, var a cabo la amplicacin de cidos nucleicos; seguidamente, este

de tal forma que el procesamiento de las muestras solo requiere tubo es introducido en el equipo Genie II (OptiGene) que mantiene

unos minutos. El sistema Verigene (Nanosphere) se aplica a partir el tubo a una temperatura constante y detecta, en tiempo real, los
de frascos de hemocultivo crecidos. La deteccin de los amplicones amplicones formados. Para esta plataforma se han comercializado
tiene lugar mediante hibridacin con oligonucletidos espec- varios kits que detectan, en menos de 30 min, genes que coneren

cos sintticos marcados con nanopartculas de oro. En bacterias resistencia a antibiticos. Uno a destacar es el eazyplex SuperBug
grampositivas detecta, en menos de 3 h y con una sensibilidad CRE que detecta, tanto a partir de colonias crecidas en las placas
y especicidad muy cercanas al 100%, 9 especies y 4 gneros de aislamiento como directamente a partir de muestras de orina
bacterianos, as como los genes de resistencia mecA y vanA/B3 . En y frascos de hemocultivo crecidos, genes que codican BLEE tipo
bacterias gramnegativas detecta, con el mismo tiempo de respuesta CTX-M y carbapenemasas tipo VIM, NDM, KPC y OXA-4810 . AID
y con una sensibilidad y especicidad superiores al 93%, 5 especies Autoimmun Diagnostika GmbH ha comercializado una PCR basada
y 4 gneros bacterianos, y los genes de resistencia que codican en ensayos de sondas en lnea. En este caso, una vez que se ha rea-
-lactamasas de espectro extendido (BLEE) tipo CTX-M y carba- lizado la PCR tiene lugar la hibridacin reversa de los amplicones
penemasas tipo KPC, NDM, VIM, IMP y OXA4 . El sistema FilmArray con sondas complementarias ancladas a una tira de nitrocelulosa.
Blood Culture Identication Panel (BioFire Diagnostics) tambin La hibridacin es detectada utilizando un marcador de biotina pre-
se aplica a partir del frasco de hemocultivo crecido. En este caso se sente en los primers utilizados en la PCR, obtenindose un patrn
realiza una PCR anidada en la que primero se amplica una regin de bandas que se interpreta de forma visual o con un escner. Entre
de ADN que contiene el segmento diana. Despus, este producto de los kits de resistencia a antibiticos destaca el AID ESBL que detecta
amplicacin se utiliza como molde de una segunda PCR que tiene genes que codican BLEE tipo TEM, SHV y CTX-M y carbapenemasas
lugar en una matriz con pocillos que contienen los primers de los tipo KPC en 5 h11 .

Cmo citar este artculo: March-Rossell GA. Mtodos rpidos para la deteccin de la resistencia bacteriana a antibiticos. Enferm Infecc
Microbiol Clin. 2017. http://dx.doi.org/10.1016/j.eimc.2016.12.005
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Entre los kits comercializados para la deteccin de genes que las tiras con antibitico. Las placas son incubadas durante 24 h
coneren resistencia bacteriana a los antibiticos es interesante y, una vez crecidas las colonias, se obtiene la CMI. Boyer et al.19
destacar los siguientes: LightMix (Roche Diagnostics) y Check- obtuvieron un 88,9% de agreements, un 1,5% de very major errors y
Direct CPE (Check-Points Health B.V.). El LightMix, utilizando la un 9,6% de major errors, y Bouza et al.20 un 96,44% de agreements,

plataforma LightCycler 480 Instrument II (Roche Diagnostics), un 1,98% de major errors y un 1,56% de minor errors.
detecta carbapenemasas tipo KPC, NDM, VIM, IMP y OXA-48 en Los mtodos de microdilucin en caldo semiautomatizados
una hora y media. Cabe resaltar que este kit tambin puede ser (MicroScan, VITEK2 y Phoenix) permiten obtener la identicacin
aplicado a partir de frascos de hemocultivo crecidos12 . El kit Check- bacteriana y el antibiograma directamente a partir del frasco de
Direct CPE puede utilizarse en varias plataformas de PCR en tiempo hemocultivo crecido. Para la identicacin bacteriana se requieren

real, como la ABI 7500 (Applied), CFX96TM (Bio-Rad), LightCycler 3 h, con pobres resultados en bacterias grampositivas y acepta-
480 system I & II (Roche), Rotor-Gene Q (Qiagen) y BD MAXTM (Bec- bles en gramnegativas; para obtener el antibiograma se precisan
ton Dickinson). Este kit incorpora los reactivos necesarios para la 14 h, obteniendo buenos resultados en bacterias tanto grampositi-
deteccin, en 2 h, de genes que codican carbapenemasas tipo KPC, vas como gramnegativas2 .
NDM, VIM y OXA-489 . Asimismo, se han comercializado algunos
kits para la realizacin de una PCR mediada por ligacin. Resumi-
Tcnicas inmunocromatogrcas
damente, en esta PCR se utilizan 2 sondas de ADN que reconocen
una de las 2 hebras del gen que interesa detectar. En caso de pro-
Estas tcnicas requieren unos 20 min para la obtencin de
ducirse la hibridacin, las sondas quedan adyacentes y una ADN
resultados. Tienen un precio econmico y no precisan ni de instru-
ligasa se encarga de unirlas, generando un ADN de doble cadena.
mentacin ni de personal experto, por lo que pueden ser realizadas
Este paso de ligacin se realiza en el equipo MyCycler (Bio-Rad).
en cualquier laboratorio. En el caso de resistencias a antibiticos
Por ltimo, la PCR en tiempo real tiene lugar en la plataforma ABI
permiten detectar enzimas bacterianas que hidrolizan el antibi-
7500 (Applied) utilizando unos primers universales. Entre los kits
tico. El procedimiento consiste en suspender la bacteria en un
que detectan genes que codican resistencias bacterianas a antibi-
diluyente. A continuacin, unas gotas de este se depositan en un
ticos mediante PCR por ligacin cabe resaltar dos: uno para BLEE
extremo de la tira (normalmente de nitrocelulosa) y las bacterias
tipo CTX-M, TEM y SHV13 y otro para carbapenemasas tipo KPC,
se desplazan por capilaridad hacia el otro extremo de la tira. Si
NDM, IMP, VIM, y OXA-4814 . Ambos kits proporcionan resultados
en la posicin test de la tira, donde est jado un anticuerpo que
en 4 h y media.
reconoce el antgeno de la bacteria, aparece una banda coloreada
Por ltimo, cabe destacar que los mtodos moleculares comer-
signica que la prueba es positiva. Se han comercializado 2 inmu-
ciales mencionados anteriormente presentan un escaso porcentaje
nocromatografas que detectan carbapenemasas tipo OXA-48 y KPC
de falsos negativos debido a que estos mtodos no detectan todas
(Coris BioConcept) con una sensibilidad y una especicidad prcti-
las variantes allicas de los genes que coneren resistencia a los
camente del 100%21 . Para la deteccin de la resistencia de S. aureus
antibiticos15 .
a meticilina se ha comercializado el test BinaxNOW PBP2a (Alere).
Este test muestra una sensibilidad y uan especicidad prctica-
Microarrays mente del 100%; adems, tambin se aplic a partir de frascos de
hemocultivo crecidos, ofreciendo una sensibilidad del 95,4% y una
Esta metodologa se basa en la deteccin, mediante un anlisis especicidad prcticamente del 100%3 .
de imgenes, de la hibridacin de una molcula diana a una sonda
especca inmovilizada en un soporte slido. Los microarrays detec-
Mtodos colorimtricos
tan un gran nmero de genes de resistencia en un mismo ensayo
dado que estas sondas, que normalmente son oligonucletidos,
Para la deteccin de carbapenemasas se han comercializado
estn pegadas a una distancia muy corta. Se han comerciali-
varios kits, como el RAPIDEC CARBA NP (bioMrieux) y Rapid CARB
zado varios microarrays, como el Check-MDR CT102, el Check-MD
Screen (Rosco Diagnostica A/S), que proporcionan resultados en
CT103 y el Check-MDR CT103 XL (Check points Health BV), que
unas 2 h con sensibilidad y especicidad muy prximas al 100%22 .
permiten detectar un gran nmero de genes que codican dife-
En estos test, la bacteria se incuba en presencia del antibitico. Si
rentes -lactamasas (BLEE, AmpC y carbapenemasas) a partir de
la bacteria posee una carbapenemasa, el antibitico se hidroliza y
colonias crecidas en placas de aislamiento. Estos 3 microarrays pre-
se produce un cambio en el pH del medio que se detecta mediante
cisan de un primer paso de una PCR con una pareja de primers o
un cambio de color del indicador. Estos test no caracterizan el tipo
cebadores universales marcados con biotina. A continuacin, los
de carbapenemasa. Sin embargo, al realizar un estudio fenotpico,
amplicones son clasicados mediante hibridacin con las sondas
pueden detectar cualquier variante de carbapenemasa que se est
de oligonucletidos. Finalmente, el software del fabricante detecta
expresando.
la hibridacin utilizando el marcador de biotina y traduce los datos

La resazurina, anadida a una suspensin bacteriana resistente
automticamente, expresando los resultados en forma de presen-
al antibitico con el que es incubada, es reducida por la actividad
cia o ausencia de un gen. Estos microarrays precisan 8 h para la
metablica de la bacteria. Si la bacteria es sensible al antibitico
obtencin de los resultados y presentan una sensibilidad y una
se detiene su metabolismo, con lo que la resazurina permanece
especicidad prcticamente del 100%16-18 .
en su forma oxidada. Dado que la forma reducida de resazurina es
estable y de color rojo, y fotomtricamente distinguible de la forma
Mtodos comerciales de antibiograma oxidada, que es de color azul, la viabilidad celular puede ser moni-
torizada mediante espectrofotometra, colorimetra o uorimetra.
Diferentes mtodos comerciales de antibiograma utilizados Coban et al.23,24 determinaron en 6 h la sensibilidad de S. aureus a
en la rutina de trabajo del laboratorio de Microbiologa Clnica meticilina y vancomicina. March et al.25,26 realizaron un antibio-
se han aplicado directamente a partir de diferentes muestras grama en 2 h para estalococos, enterococos y enterobacterias. Sin
clnicas. Las tiras comerciales con un gradiente de antibitico se embargo, el inconveniente de la resazurina es que no es metaboli-
han utilizado para realizar un antibiograma directo a partir de zada por los bacilos gramnegativos no fermentadores. Otro mtodo
muestras respiratorias. Para ello, la muestra se siembra en masiva colorimtrico consiste en la medicin de la actividad de la enzima
en placas de agar Mueller Hinton y seguidamente se depositan bacteriana nitrato reductasa. Cuando la bacteria es incubada en

Cmo citar este artculo: March-Rossell GA. Mtodos rpidos para la deteccin de la resistencia bacteriana a antibiticos. Enferm Infecc
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presencia de iones NO3 y antibitico, si la bacteria es resistente al proporcionan unos picos de identicacin especcos; de esta
antibitico se van a generar iones NO2 que, con los reactivos de forma, a partir de una base de datos, normalmente elaborada
Gries, originan un compuesto de color rojo. Con este mtodo se ha en el propio laboratorio, es posible diferenciar, en unos minutos,
determinado en unas 6 h la sensibilidad de S. aureus a meticilina entre cepas de S. aureus resistentes y sensibles a meticilina a partir
y vancomicina23,24 . Estos 2 mtodos colorimtricos tambin han de colonias crecidas en las placas de aislamiento34 . De la misma
sido aplicados en micobacterias, obteniendo el antibiograma en un manera, el sistema MALDI-TOF tambin discrimina entre cepas
tiempo de 7 a 14 das27 . En todos los casos la correlacin obtenida de enterococo sensibles y resistentes a vancomicina35 . Tambin
con los mtodos de referencia ha sido cercana al 100%. es posible estudiar la sensibilidad a los antibiticos mediante la
incubacin de microorganismos en presencia de antibitico en un
Mtodos de imagen medio con molculas marcadas con istopos. Si el microorganismo
es resistente, este incorporar las molculas marcadas que podrn
A partir de frascos de hemocultivo crecidos el equipo ACCELE- ser detectadas mediante MALDI-TOF36 . Jung et al.37 desarrollaron
RATE phenoTM SYSTEM (Accelerate Diagnostics) proporciona, en un antibiograma basado en un anlisis semicuantitativo. Incubaron
una hora, la identicacin de 10 especies y 6 gneros bacterianos en un medio lquido una alcuota del frasco de hemocultivo cre-
mediante la tcnica de hibridacin in situ uorescente (FISH). Para cido, tanto en presencia como en ausencia de antibitico, siendo
llevar a cabo el antibiograma directo se monitoriza, mediante la esta ltima el grupo control. A partir de los sedimentos obtuvie-
toma de imgenes, el crecimiento bacteriano de una cepa incu- ron los espectros de masas y calcularon la intensidad relativa de los
bada en presencia de diferentes concentraciones de antibitico. De picos y el rea bajo la curva (AUC). Para la interpretacin del anti-
este modo, este equipo informa, en 5 h, la CMI y los fenotipos de biograma, consideraron que una cepa era resistente al antibitico
resistencia de alto nivel a gentamicina y estreptomicina en entero- si esta, al ser incubada con el antibitico, proporcionaba una inten-
cocos y de induccin de resistencia a clindamicina por eritromicina sidad de picos y AUC similares a los del grupo control. Por contra,
en estalococos. Dependiendo del patgeno estudiado, la sensibi- consideraron que una cepa era sensible al antibitico si esta, al ser
lidad obtenida concuerda entre un 92% y un 100% con la obtenida incubada con antibitico, proporcionaba una intensidad de picos y
mediante microdilucin en caldo28 . AUC menores que los del grupo control. De este modo obtuvieron
un antibiograma a partir del frasco de hemocultivo crecido en 4 h
con un 2% de discrepancias con respecto a la sensibilidad obtenida
Nefelometra mediante E-test.

La nefelometra es una tcnica que mide la intensidad de radia-


cin dispersa que se genera cuando un haz de luz atraviesa una Citometra de ujo
suspensin de partculas. Dado que la dispersin de luz es propor-
cional a la concentracin de partculas, esta tcnica instrumental La citometra de ujo es una tcnica basada en la formacin de
permite la cuanticacin de microorganismos2 . El equipo Alfred 60 un ujo de partculas (generalmente clulas) ordenadas en la con
(Alifax) lleva a cabo un cribado de muestras de orina para el diag- una intensidad de 500-4.000 partculas/segundo. Gracias a este ali-
nstico de infecciones del tracto urinario. Para ello, una alcuota neamiento, la tcnica permite medir simultneamente mltiples
de orina es inoculada en un tubo con medio lquido de enrique- caractersticas de una sola clula de tal forma que es posible carac-
cimiento y el crecimiento bacteriano es monitorizado durante 3 h terizar, separar y cuanticar las diferentes subpoblaciones celulares
mediante nefelometra. Con este equipo, monitorizando el creci- que se engloban en un conjunto. Adems, utilizando diversos
miento bacteriano en tubos comercializados que contenan medio uorocromos se pueden estudiar diversos parmetros bacteria-
lquido de enriquecimiento y antibitico junto con una alcuota de nos (potencial de membrana, tamano celular, actividad enzimtica,
la muestra, se ha realizado un antibiograma en 5 h directamente a integridad de la membrana celular y concentracin microbiana)
partir de orinas y frascos de hemocultivo29,30 . que aportan informacin acerca de la sensibilidad de los micro-
organismos a los antibiticos2 .
Espectrometra de masas MALDI-TOF Shrestha et al.38 lograron diferenciar, mediante histogramas en
los que se represent la luz dispersa en un ngulo de 90 grados (SSC)
El sistema MALDI-TOF proporciona, mediante un anlisis de pro- de uorescencia, entre cepas de S. aureus resistentes
frente a la senal
tenas, la identicacin de bacterias (incluyendo micobacterias), y sensibles a meticilina tras una incubacin de 4 h en presencia del
levaduras y hongos lamentosos en minutos2 . En cuanto al antibio- antibitico. El citmetro de ujo Sysmex UF-1000i (Sysmex Corpo-
grama rpido, el sistema MALDI-TOF predice en menos de 3 h si las ration) es un equipo empleado en los laboratorios de Microbiologa
bacterias producen enzimas que hidrolizan los antibiticos, como para llevar a cabo un cribado de orinas mediante el recuento de bac-
por ejemplo carbapenemasas y BLEE. Para ello, los microorganis- terias. Este equipo ha sido utilizado para obtener 2 antibiogramas
mos son incubados durante un tiempo con el antibitico. Se realiza mediante la comparacin de los recuentos obtenidos a partir de
una centrifugacin y el sobrenadante obtenido se analiza mediante cepas incubadas en medio lquido con antibiticos con los recuen-
MALDI-TOF. Si el microorganismo posee la enzima que degrada el tos de las mismas cepas incubadas sin antibitico (grupo control).
antibitico se observar la desaparicin del pico correspondiente Se consider que una cepa era resistente al antibitico si esta, al
al antibitico y la aparicin de nuevos picos que corresponden a ser incubada con el antibitico, proporcionaba un recuento micro-
los metabolitos resultantes de la rotura del antibitico. En caso de biano muy similar al del grupo control. Por el contrario, se consider
que la bacteria no hidrolice el antibitico nicamente se observar que una cepa era sensible al antibitico si esta, al ser incubada con
el pico correspondiente al antibitico. Esta metodologa ha pro- el antibitico, proporcionaba un recuento microbiano menor que
porcionado sensibilidades prcticamente del 100%, tanto a partir el del grupo control. Broeren et al.39 calcularon la CMI de amoxi-
de colonias crecidas en las placas de aislamiento31 , como a par- cilina, gentamicina y piperacilina en Escherichia coli, Pseudomonas
tir de frascos de hemocultivo crecidos de pacientes32 . Tambin aeruginosa y S. aureus. En 4 h obtuvieron un antibiograma que se
es posible predecir la resistencia a cloranfenicol y clindamicina correlacion en un 100% con el obtenido mediante los sistemas
mediante la deteccin de la metilacin del ARNr 16S llevada a cabo VITEK2, E-test y macrodilucin en caldo. March et al.40 realizaron
por metiltransferasas33 . Por otra parte, se ha observado que tanto un antibiograma a partir de 100 frascos de hemocultivo crecidos y
las cepas de S. aureus sensibles a meticilina como las resistentes obtuvieron, en tan solo 2 h, una concordancia del 98% con respecto a

Cmo citar este artculo: March-Rossell GA. Mtodos rpidos para la deteccin de la resistencia bacteriana a antibiticos. Enferm Infecc
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la sensibilidad obtenida mediante los mtodos comerciales E-test, intermedias y heterorresistentes a vancomicina49 . Finalmente, en
MicroScan y VITEK2. Por otra parte, Faria-Ramos et al.41 , a partir micobacterias se ha observado que es posible determinar la sensi-
de bacterias incubadas en presencia de ceftazidima y cefotaxima bilidad mediante quimioluminiscencia en 4 das51 .
con y sin cido clavulnico, y utilizando el uorocromo DiBAC4 (3), La bioluminiscencia es una forma de quimioluminiscencia
que solo penetra en las bacterias inviables, lograron discriminar, en que aparece como consecuencia de una reaccin qumica que
menos de 3 h, entre cepas productoras y no productoras de BLEE. tiene lugar en algunos organismos vivos, como por ejemplo las
Gauthier et al.42 realizaron un antibiograma mediante citometra lucirnagas2 . Los trabajos realizados sobre antibiograma se funda-
de ujo a partir de orina. Usaron 2 uorocromos, el DiBAC4 (3) y el mentan en la medida de los niveles de ATP bacteriano de origen
yoduro de propidio, que tambin penetra nicamente en bacterias intracelular, extracelular o total, comparando la senal biolumi-
no viables. Analizaron 114 muestras de orina y, realizando medi- niscente obtenida a partir de microorganismos incubados sin la
uorescente tras una incubacin de 2 h de las
ciones de la senal presencia de antibitico (grupo control) con la senal obtenida a
alcuotas de orina en presencia de diferentes antibiticos, obtuvie- partir de los mismos microorganismos incubados en presencia de
ron un 2% de discrepancias con respecto a la sensibilidad obtenida antibitico52,53 . Con respecto al grupo control, si se mide el ATP
mediante microdilucin en caldo. intracelular, las cepas sensibles al antibitico estudiado proporcio-
En levaduras, mediante el uso de yoduro de propidio, es posible narn una disminucin de la senal de bioluminiscencia54 ; si se mide
obtener un antifungigrama en 6 h43,44 . En micobacterias, Pina-Vaz el ATP extracelular las cepas sensibles producirn un aumento de
et al.45 determinaron la sensibilidad de M. tuberculosis a estrepto- 55 , y si se mide el ATP total las cepas sensibles proporcio-
la senal
micina, isoniazida, rifampicina y etambutol. Despus de 3 das de narn una disminucin de la senal de ATP52,53,56 . En cambio, si el
incubacin en presencia del antituberculoso en el sistema BACTEC microorganismo es resistente al antibitico las medidas del grupo
MGIT 960 (Becton Dickinson), los microorganismos se tineron con control sern prcticamente iguales que las obtenidas a partir de
el uorocromo SYTO 16, que solo penetra en los microorganismos las cepas incubadas con antibitico. Con esta metodologa es posi-
con alteracin de la membrana celular. Comparando la intensidad ble obtener un antibiograma able en tan solo 2 h56 . Adems, se
de uorescencia obtenida a partir de estos microorganis-
de la senal han publicado varios trabajos que hacen referencia a antibiogramas
mos con la obtenida a partir microorganismos incubados durante el obtenidos mediante bioluminiscencia a partir de muestra directa.
mismo tiempo sin la presencia del antituberculoso, pudieron dife- Ivancic et al.57 realizaron un antibiograma a partir de orina com-
renciar entre cepas sensibles, intermedias o resistentes, obteniendo parando la senal de ATP obtenida a partir de una alcuota de orina
unos resultados que mostraron una excelente concordancia con los incubada sin antibitico con la senal de ATP de otra alcuota de
obtenidos mediante una incubacin de unas 3 semanas en el sis- la misma orina incubada con antibitico. De este modo, lograron,
tema BACTEC MGIT 960. Kirk et al.46 determinaron la sensibilidad en 2 h, un 91% de concordancia con la CMI obtenida a partir de
de M. tuberculosis estudiando la capacidad de la micobacteria para la colonia. Dong y Zhao58 desarrollaron un simulador de micro-
hidrolizar, mediante esterasas, el sustrato diacetato de uorescena uidos con anticuerpos inmovilizados mediante el cual se obtiene,
que pasa a uorescena, compuesto que emite uorescencia cuando a partir de orina, la identicacin de 13 especies bacterias y el
se excita con luz de una longitud de onda adecuada. Si la micobac- antibiograma en 6 h. En el caso de levaduras y micobacterias, la bio-
teria es sensible al antituberculoso, la capacidad hidroltica de la luminiscencia proporciona un antibiograma able en 6 h y 7 das,
micobacteria disminuye y, por lo tanto, la senal de uorescencia respectivamente59,60 .
detectada tambin disminuye. Comparando la senal de uorescen-
cia y la luz dispersa a 90 grados obtenidas mediante citometra
Microuidos
de ujo a partir de micobacterias sin contacto con el antituber-

culoso con las senales obtenidas a partir de micobacterias con una
Los avances en nanotecnologa han posibilitado que el anti-
incubacin de 24 h con isonizida, etambutol y rifampicina obtu-
biograma se realice en plataformas o chips que llevan a cabo,
vieron concordancias del 95, del 92 y del 83%, respectivamente,
volmenes de trabajo, mltiples ensayos que
utilizando pequenos
con respecto al antibiograma obtenido mediante el mtodo de las
aportan informacin acerca de la sensibilidad de las bacterias a los
proporciones.
antibiticos, como por ejemplo rotura celular, cultivo bacteriano e
hibridacin y amplicacin de cidos nucleicos, entre otros. Tang
et al.61 desarrollaron una plataforma con la que, midiendo los
Quimioluminiscencia y bioluminiscencia
cambios de pH que ocurren como consecuencia de la acumulacin
de productos metablicos, es posible detectar el crecimiento bacte-
La quimioluminiscencia es un proceso de emisin de luz que
riano en 2 h. Mach et al.62 realizaron un antibiograma directamente
ocurre en ciertas reacciones qumicas cuando las molculas exci-
a partir de muestras de orina utilizando un sistema de microuidos
tadas vuelven al estado fundamental. Para la obtencin de luz solo
que incorpora un sensor electroqumico para la cuanticacin del
se requiere la adicin de menadiona al cultivo del microorganismo.
ARN ribosmico 16S. Este grupo obtuvo, en 3 h y media, un 94%
La membrana bacteriana es permeable a esta molcula. Una vez
de concordancia con respecto a la sensibilidad obtenida mediante
la menadiona se encuentra en el interior de los microorganismos,
microdilucin en caldo.
esta es reducida y se generan diversos compuestos que difunden
al medio extracelular donde, al autooxidarse, se emiten fotones de
luz2 . La viabilidad de los microorganismos se establece comparando Mtodos de lisis bacteriana
quimioluminiscente de cepas incubadas con antibiticos
la senal
con la de las mismas cepas incubadas sin antibiticos47-50 . Si la Otra metodologa para la determinacin de la sensibilidad con-
cepa es sensible al antibitico, esta proporcionar, al ser incubada siste en la deteccin de la lisis bacteriana. Para ello, la bacteria es
con antibitico, una senal mucho menor que la del cultivo sin anti- incubada en presencia del antibitico a la concentracin deseada;

bitico; si es resistente, las senales obtenidas a partir de los cultivos seguidamente la bacteria se inmoviliza en un microgel de agarosa
incubados en presencia y ausencia de antibitico sern muy simi- y es expuesta a una solucin de lisis que produce la liberacin
lares. La quimioluminiscencia proporciona, con una incubacin de del ADN. Posteriormente, la preparacin es incubada con el uo-
unas 4 h, CMI que concuerdan entre un 88% y un 100% con las CMI rocromo SYBR Gold y mediante observacin al microscopio de
obtenidas mediante macrodilucin o microdilucin en caldo47,48,50 . uorescencia es posible estudiar la integridad del ADN. Esta meto-
Tambin permite, en un tiempo de 8 h, detectar cepas de S. aureus dologa proporciona un antibiograma en menos de 2 h63 .

Cmo citar este artculo: March-Rossell GA. Mtodos rpidos para la deteccin de la resistencia bacteriana a antibiticos. Enferm Infecc
Microbiol Clin. 2017. http://dx.doi.org/10.1016/j.eimc.2016.12.005
G Model
EIMC-1645; No. of Pages 7 ARTICLE IN PRESS
6 G.A. March-Rossell / Enferm Infecc Microbiol Clin. 2017;xxx(xx):xxxxxx

A modo de conclusin podemos senalar que las metodologas ACC-1, ACT/MIR and CMY-1-like/MOX) and carbapenemases (KPC, OXA-48, VIM,
descritas en esta revisin permiten acortar, respecto a los mto- IMP and NDM). J Antimicrob Chemother. 2012;67:18659.
18. Bogaerts P, Cuzon G, Evrard S, Hoebeke M, Naas T, Glupczynski Y. Evaluation of
dos habituales, el tiempo necesario para determinar la sensibilidad a DNA microarray for rapid detection of the most prevalent extended-spectrum
de las bacterias a los antibiticos. Para la interpretacin del anti- beta-lactamases, plasmid-mediated cephalosporinases and carbapenemases in
biograma es indispensable conocer la especie bacteriana que se Enterobacteriaceae, Pseudomonas and Acinetobacter. Int J Antimicrob Agents.
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est estudiando. En este sentido, la identicacin rpida proporcio- 19. Boyer A, Medrano J, Mzali F, Balick-Weber CC, Bessde E, Picard W, et al.
nada por el sistema MALDI-TOF permite la implementacin de las Direct testing of bronchoalveolar lavages from ventilator-associated pneumonia
metodologas que realizan un antibiograma rpido. Sin embargo, patients. Diagn Microbiol Infect Dis. 2012;73:10710.
20. Bouza E, Torres MV, Radice C, Cercenado E, de Diego R, Snchez-Carrillo C, et al.
para determinar si estas tcnicas proporcionan una sensibilidad y
Direct E-test (AB Biodisk) of respiratory samples improves antimicrobial use in
una especicidad aceptables para la prctica clnica, es necesario ventilator-associated pneumonia. Clin Infect Dis. 2007;44:3827.
ampliar el nmero de cepas bacterianas y antibiticos estudiados. 21. Glupczynski Y, Evrard S, Ote I, Mertens P, Huang TD, Leclipteux T, et al. Evaluation
of two new commercial immunochromatographic assays for the rapid detec-
Dados los importantes benecios que se derivan de proporcionar
tion of OXA-48 and KPC carbapenemases from cultured bacteria. J Antimicrob
un resultado rpido de sensibilidad de las bacterias a los antibiti- Chemother. 2016;71:121722.
cos (aumento de la supervivencia, reduccin de gastos y retraso 22. Dortet L, Agathine A, Naas T, Cuzon G, Poirel L, Nordmann P. Evaluation of the

de la seleccin de cepas bacterianas resistentes), se puede ar- RAPIDEC CARBA NP, the Rapid CARB Screen and the Carba NP test for bioche-
mical detection of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae. J Antimicrob
mar que el antibiograma en Microbiologa Clnica, lejos de estar Chemother. 2015;70:301422.
denitivamente establecido, es un campo en continuo avance. 23. Coban AY. Rapid determination of methicillin resistance among Staphylo-
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Conicto de intereses 24. Coban AY, Bozdogan B, Cihan CC, Cetinkaya E, Bilgin K, Darka O, et al. Two new
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