Enzimas

Propiedades

Molculas proteicas :catalizan reacciones qumicas

Muy especificas: solo actan sobre sus sustratos
Muy efectivas: se requieren peq cantidades
No se modifican permanentemente ni se consumen durante la reaccin
Actan a una t y ph optimos a presin atmosfrica y en ambiente acuoso
Su accin es regulada
Se saturan, se denaturan

Enzimas conjugadas: necesitan de la presencia de sustancias no proteicas que colaboran en la

catlisis, llamados cofactores. Algunos iones inorgnicos traza son cofactores enzimticos.

Cuando el cofactor es una molecula organica se llama coenzima. Muchas se sintetizan a partir de
vitaminas, y participan en reacciones de transferencias de grupos.

Cuando los cofatores o las coenzimas se encuentran unidos a fuertemente o covalentemente a la

enzima se llaman grupos prostticos.

La forma catalticamente activa de la enzima, la enzima unida a su grupo prosttico es holoenzima.

La parte proteica de una holoenzima se llama apoenzima y no es activa.

Isoenzimas

Multiples formas de una enzima que catalizan la misma reaccin pero difieren en su secuencia de
aa, afinidad de sustrato, Vmax y/o propiedades regulatorias. Tienen distinta estructura molecular
aunque su funcin biolgica es similar.

Tipo de tejido: la lactato deshidrogenasa presenta isoenzimas en musculo y corazn

Compartimento celular: malato deshidrogenasa del citoplasma es distinta a la de
mitocondria
Momento del desarrollo: algunas enzimas de la glicolisis son distintas en adulto y feto

Clasificacin internacional de enzimas

Oxidoreductasas Transfieren electrones desde una molcula dadora a una aceptora. Suelen requerir
de coenzimas.
Transferasas Transfieren grupos qumicos, amino, carboxilo y fosfato.
Hidrolasas Participan en reacciones de hidrolisis agregando agua
Liasas Sustitucin de enlaces dobles por grupos qumicos o a la inversa
Isomerasas Reacomodan atomos dentro de una molecula, forman ismeros
Ligasas Unin de dos molculas acoplado a hidrolisis de una molcula de ATP

Energa de activacin

Entre S y P hay una barrera energtica requerida para el alineamiento de grupos reactivos,
rearreglo de enlaces, necesarios para que la reaccin ocurra. En el estado de transicin se alcanza
este mximo de energa. La energa de activacin es la diferencia entre el nivel de energa del
estado basal y el estado de transicin.

Las enzimas aceleran la velocidad de las reacciones disminuyendo la energa de activacin. A

menor energa de activacin, mayor velocidad de reaccin. No afectan ni la direccin ni el
equilibrio de la reaccin, solo aumentan la velocidad.

La energa de unin Gb ayuda a disminuir la energa de activacin. Cuando la enzima y el sustrato

se unen ocurren muchas interacciones dbiles que liberan energa. Las interacciones del sustrato y
la enzima proveen una via alternativa para la reaccin permitiendo que ocurra mas rpido. Las
interacciones enzima sustrato se optimizan en el estado de transicin. Estas interacciones
posicionan al S en la orientacin mas favorable.

El sitio activo, es un bolsillo al interior de la enzima en el cual se encuentran los residuos de aa

cuyos grupos sustituyentes unen el S y catalizan su transformacin qumica en producto.

Etapas de la reaccin enzimtica

1. Complejo E+S
2. Encaje inducido: modificacin temporal de la enzima y el sustrato
3. Catalisis, reaccin qumica
4. Liberacin de productos: la enz puede volver a iniciar

El complejo se produce por complementariedad. El encaje compromete cambios

conformacionales para enzima y sustrato.

Hay distintos modelos de catlisis.

I. Acido-base: se estabilizan intermediarios cargados por transferencia de protones desde o

hacia el sustrato formando intermediarios que pasan a productos en su forma ms
favorable. En el sitio activo de una enzima hay muchos grupos que pueden actuar como
dadores o aceptores de protones y participar en esta catlisis.
II. Covalente: se forma un enlace covalente transiente entre la E y el S
III. Por iones metlicos: interacciones entre el S y iones metlicos unidos a la enzima o del
medio. Los metales tambien pueden participar e reacciones de oxidacin y reduccin.

La mayora de las enzimas utiliza una combinacin de diferentes mecanismos.

Parmetros cinticos : comparacin de act enz

a) Km (constante para cada enzima): concentracin de S a la cual Vo es la mitad de Vmax. Es una

medida de afinidad de la enzima por el S. Menos Km, mayor afinidad.
b) Vmax: velocidad que se alcanza cundo todos los centros activos estn ocupados con S. es solo
teora, nunca alcanzada en realidad. Depende de la concentracin de enzima
c) Kcat: numero de recambio. Numero de molculas de sustrato convertidas en producto por
molculas de enzimas y unidad de tiempo. Indica eficiencia. Ms kcat ms eficiente.
d) Kcat/km (especificidad): comparar la especificidad, ms kcat/km, ms especifica
Inhibicin enzimtica

Son sustancias que reducen la actividad de una enzima al unirse a ella de un modo que influencia
la unin del sustrato y/o su numero de recambio. Muchas son parecidas estructuralmente al
sustrato, pero no reaccionan o reaccionan muy lento en comparacin.

Reversible

El inhibidor se disocia rpidamente de la enzima. Puede ser del tipo competitivo, acompetitivo o
mixto.

A. Competitiva: el inhibidor se une al sitio activo de la enzima compitiendo directamente con

el S. El complejo EI no lleva a producto. Se puede desplazar al inhibidor con altas
concentraciones de S. La Km aumenta.
B. Acompetitiva: el inhibidor se une al complejo ES y no a la enzima libre, en un sitio
diferente al sitio activo. Impide formacin de producto. No se puede revertir el efecto del
inhibidor con altas concentraciones de sustrato. Vmax disminuye y Km disminuye.
C. Mixta: el inhibidor se une a la enzima libre y al complejo ES e un un sitio diferente al sitio
activo. Son efectivos a toda concentracin de sustrato. Vmas disminuye y Km aumenta.

El tipo de unin se puede diferenciar con experimentos cinticos.

Irreversible

El inhibidor se disocia muy lentamente de la enzima porque se une fuertemente a ella en forma
covalente o no covalente. Se conocen como inactivadores.

Se produce por sustancias que se combinan de forma covalente con las enzimas o destruyen un
grupo funcional esencial para su funcionamiento, inactivndolas de manera irreversible, o forman
con la enzima una asociacin no covalente estable.

Casi todos son toxicos naturales o sintticos.

Se pueden usar para identificar aa claves en el sitio activo.

Existen inactivadores suicidas que llevan a cabo las primeras etapas de la reaccin enzimtica,
pero en vez de llegar a P se convierten en un compuesto muy reactivo que se combina
irreversiblemente con la enzima.

Ejemplo: penicilinas que inhiben las transpeptidasas e impiden sntesis de pared bacteriana

Regulacin de la actividad enzimtica

Enzimas regulatorias: enzimas que en una via metabolica regulan su velocidad. Su actividad
aumenta o disminuye en respuesta a ciertas seales afectando la velocidad de la via completa.
Mecanismos de regulacin enzimtica:

Regulacin de la cantidad de enzima sintetizada por las celulas

Inhibicin reversible por producto o feedback
Interaccion con moduladores (protenas u otros)
Activacin proteoltica irreversible

Enzimas alostericas

Enzimas cuya actividad esta regulada mediante un sitio alosterico que es un sitio distinto del activo
(cataltico), al que se une un regulador llamado alosterico, de manera reversible y no covalente.

Generalmente son ms grandes y complejas y posee 2 o ms subunidades.

La regulacin puede funcionar inhibiendo o activando y provoca cambios conformacionales.

Los moduladores alostericos son generalmente metabolitos pequeos o cofactores.

La unin de los moduladores alostericos provoca cambios conformacionales de las enzimas.

Aquellas enzimas en que el S y modulador son idnticos, se denominan homotropicas, y en el caso
contrario heterotropicas.

Inhibicin por feedback

En sistemas de multiples enzimas, la enzima regulatoria puede ser inhibida por el producto final de
la via una vez que se concentracin se excede.

Modificacin covalente reversible

Enzimas que estn inactivas hasta que se unen con otras molculas o viceversa.

Ejemplo: fosforilacion, acetilacin, metilacin.

Activacin proteolitica

En algunas enzimas un precursor inactivo llamado zimgeno, proproteina o proenzima se rompe

para formar la enzima activa. Ejemplo caspasas y proteasas. Al cortar un trozo del zimgeno se
producen cambios conformacionales que exponen el sitio activo de la enzima. Es irreversible y se
requiere de otros mecanismos para inactivarlas.