Biostatistiques

Chapitre 3 :
Test de comparaison de
pourcentages – χ²
Docteur José LABARERE
Année universitaire 2009/2010
Université Joseph Fourier de Grenoble - Tous droits réservés.
Plan

I. Comparaison d’un pourcentage observé à un

pourcentage théorique

II. Comparaison de 2 pourcentages observés sur 2

échantillons indépendants

III. Test du χ² d’indépendance

IV. Conditions d’application

Préambule

• Comparer 2 pourcentages :
• 1 variable qualitative binaire
• 1 variable qualitative binaire

• Exemple :
• traitement (oui/non)
• décès J30 (oui/non)
• Pdécès J30 (traité) ≠ Pdécès J30 (non-traité) ?
Plan

I. Comparaison d’un pourcentage observé à un

pourcentage théorique

II. Comparaison de 2 pourcentages observés sur 2

échantillons indépendants

III. Test du χ² d’indépendance

IV. Conditions d’application

I. Comparaison d’un pourcentage observé à
un pourcentage théorique

population population de
π référence
échantillon πH0
(p ≈ π) p

H0 : π = πH0
H1 : π ≠ πH0
 Fluctuations d’échantillonnage sous H0

M+ M-

Effectifs observés O1 = n p O2 = n (1-p) n

Effectifs théoriques T1 = n πH0 T2 = n (1-πH0) n

Sous H0 :
π = πH0 2 2
O1 ≈ T1
(O1 − T1 ) +
(O 2 − T2 ) 2
→ χ 1ddl
O2 ≈ T2 T1 T2
Comparaison du χo² calculé à la valeur seuil χα² correspondant au
risque α de la loi du χ²

1–α
(non-rejet de H0)

α
(rejet de H0 )

0 χα²

χo² ≤ χα² χo² > χα²

 Table de la loi du χ²

Conditions d’application du χ² : T1 ≥ 5, T2 ≥ 5
Plan

I. Comparaison d’un pourcentage observé à un

pourcentage théorique

II. Comparaison de 2 pourcentages observés sur 2

échantillons indépendants

III. Test du χ² d’indépendance

IV. Conditions d’application

II. Comparaison de deux pourcentages observés

population population
π1 π2
échantillon échantillon
p1 p2

H0 : π1 = π2
H1 : π1 ≠ π2
 Fluctuations d’échantillonnage sous H0

Effectifs observés
E1 E2
M+ O11 O21 m1
M- O12 O22 m2
n1 n2 n

p1 = O11/ n1
Effectifs théoriques sous H0
p2 = O21/ n2 E1 E2
M+ T11 T21 m1
M- T12 T22 m2
n1 n2 n
 Effectifs théoriques attendus sous H0

E1 E2
M+ T11 T21 m1
M- T12 T22 m2
n1 n2 n

Sous H0:
• π1 = π2 = π • Txy = (nx my)/ n
• p = m1 / n
• T11 = n1 p = (n1 m1)/ n
Effectifs observés Effectifs théoriques sous H0
E1 E2 E1 E2
M+ O11 O21 m1 M+ T11 T21 m1
M- O12 O22 m2 M- T12 T22 m2
n1 n2 n n1 n2 n

(O ij − Tij )
2

∑ i, j Tij
2
→ χ 1ddl

Condition d’application du χ² : Tij ≥ 5

Comparaison du χo² calculé à la valeur seuil χα² correspondant au
risque α de la loi du χ²

1–α
(non-rejet de H0)

α
(rejet de H0 )

0 χα²

χo² ≤ χα² χo² > χα²

Plan

I. Comparaison d’un pourcentage observé à un

pourcentage théorique

II. Comparaison de 2 pourcentages observés sur 2

échantillons indépendants

III. Test du χ² d’indépendance

IV. Conditions d’application

 III. Test du χ² d’indépendance

• Comparer :
• 1 variable qualitative (polytomique)
• 1 variable qualitative (polytomique)

• Exemple : comparaison de plusieurs pourcentages :

• décès J30 (oui/non)
• traitement (placebo / faible dose / forte dose)

• H0 : πdécès J30 (placebo) = πdécès J30 (faible dose) = πdécès J30 (forte
dose)
• H1 : au moins un des pourcentages est différent des autres
 Fluctuations d’échantillonnage sous H0

Effectifs observés
E1 E2 E3
M+ O11 O21 O31 m1
M- O12 O22 O32 m2
n1 n2 n3 n

Effectifs théoriques sous H0

E1 E2 E3
M+ T11 T21 T31 m1

Tij = (ni mj)/ n M- T12 T22 T32 m2

n1 n2 n3 n
 Test du χ² d’indépendance

Sous H0 :

(Oij − Tij )
2

∑i, j Tij
2
→ χ ( L-1)(C-1)ddl

Condition d’application du χ² : Tij ≥ 5

Comparaison du χo² calculé à la valeur seuil χα² correspondant au
risque α de la loi du χ² (L-1) (C-1) ddl

1–α
(non-rejet de H0)

α
(rejet de H0 )

0 χα²

χo² ≤ χα² χo² > χα²

 Notion de degré de liberté

E1 E2
1 ddl
M+ O11 ? m1
M- ? ? m2
n1 n2 n

E1 E2 E3
M+ O11 O21 ? m1 2 ddl
M- ? ? ? m2
n1 n2 n3 n
ddl = (L-1) (C-1)
Table de la loi du χ²
Plan

I. Comparaison d’un pourcentage observé à un

pourcentage théorique

II. Comparaison de 2 pourcentages observés sur 2

échantillons indépendants

III. Test du χ² d’indépendance

IV. Conditions d’application

 IV. Conditions d’application du test du χ²

• Indépendance des observations

• Effectif théorique Tij ≥ 5 pour chaque cellule

• Tij < 5 dans une ou plusieurs cellules :

• Regroupement de lignes ou colonnes pour obtenir Tij ≥ 5
• Probabilité exacte de Fisher
 Comparaison de pourcentages

pourcentages variables test conditions

1 observé p - Χ²1ddl Effectifs théoriques

1 théorique πH0 ≥5

1 observé p1 V1 binaire Χ²1ddl Effectifs théoriques

1 observé p2 V2 binaire ≥5

plusieurs V1 binaire Χ²(L-1) (C-1) ddl Effectifs théoriques

observés V2 polytomique ≥5
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