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Aula de Bioqumica II SQM04242015201

Bacharelado em Cincias Fsicas e Biomoleculares


Tema:

Bioenergtica e Metabolismo

Prof. Dr. Jlio Csar Borges


Depto. de Qumica e Fsica Molecular DQFM
Instituto de Qumica de So Carlos IQSC
Universidade de So Paulo USP
E-mail: borgesjc@iqsc.usp.br
Como a energia move a vida?
necessria para os 1) Movimento
organismos vivos 2) Transporte
executarem diversas ativo
funes biolgicas 3) Sntese

MAS, qual a fonte de energia?

Como obter energia?

Como utilizar energia?


Classificao dos organismos
Classificao dos organismos

Carboidratos
Lipdeos
Protenas

Dependncia dos organismos


autotrficos para produo
desses compostos orgnicos
Organismos

Obrigatrios: Utilizam O2 como


agente oxidante para obter energia.
AERBICOS
Facultativos: Ausncia ou
presena de oxignio Ex. Escherichia coli

Utilizam agentes oxidantes como


sulfato e nitrato. Ex.: Bactrias
nitrificantes, sufulrosas como
Acidithiobacillus ferrooxidans. ANAERBICOS

*Obrigatrios*: morrem na presena de


O2 Ex. Bacilo causador do ttano (Clostridium tetani).
Metabolismo
Uma srie de reaes qumicas intrincadas que permitem obter,
armazenar e utilizar energia para realizao das funes celulares.

As reaes cooperam para 4 funes:

Obter e energia qumica (luz solar ou nutrientes);

Converter nutrientes molculas prprias da clula


(precursores)

Polimerizar macromolculas;

Sintetizar e degradar biomolculas especializadas.


Fluxo energtico e de compostos
Vias Metablicas

Anabolismo: Catabolismo:
Via Biossinttica Via degradativa
- Utilizao de energia na - Extrao de energia
forma de Trabalho - Simplificao das
- Sntese de biomolculas molculas a compostos
- Multiplicao comuns
Endergnica Exergnica
Vias Metablicas
As vias catablicas e anablicas esto relacionadas
O ATP e o NADPH produzidos pela degradao de metablitos complexos
so fonte de energia para reaes biossintticas e outras reaes
Termodinmica e metabolismo

O fluxo de molculas e energia ocorrem


em vias

Catabolismo:
- Extrao de energia
- Simplificao das molculas a compostos
comuns

Anabolismo:
- Utilizao de energia na forma de Trabalho
- Sntese de molculas complexas
- Multiplicao
Vias Metablicas

- So interdependentes

- So coordenadas
Mapa Metablico

- Sumariza a
- Mais de 2000
interdependncia e
reaes
coordenao das
conhecidas
reaes anablicas e
catalisadas por
catablicas
enzimas
diferentes
- Mais de 1000
reaes podem
- So simples e
ocorrer ao mesmo
de tipos comuns
tempo na E. coli
Vias Anfiblicas

Conjunto de reaes que podem ser tanto Anablicas como Catablicas.


Dependem da condio energtica da clula

Biossntese e degradao so quase sempre distintas

1- Ocorrem por vias diferentes.

2- Envolvem enzimas diferentes numa mesma via.

3- Podem ser compartimentalizadas.

4 Vias irreversveis

5 Possuem etapas limitantes


As vias metablicas ocorrem em locais
especficos das clulas

Mitocndria: ciclo do cido ctrico, fosforilao oxidativa, oxidao de cidos


graxos, degradao de aminocidos
Citosol: gliclise, via das pentoses-fosfato, biossntese de cidos graxos,
gliconeognese
Lisossomo: digesto enzimtica
Ncleo: replicao e transcrio de DNA, processamento do RNA
Aparelho de Golgi: processamento ps-traducional de protenas de membranas e
protenas secretoras, formao da membrana plasmtica e vesculas
RER: sntese de protenas ligadas a membranas e protenas secretoras
REL: biossntese de lipdeos de esterides
Peroxissomos (glioxissomos): reaes de oxidao, catalisadas por aminocido-
oxidases e catalase, reaes do ciclo do glioxilato nas plantas
A vida demanda de Energia
Mesmo em repouso, a maquinaria bioqumica est permanentemente extraindo e
utilizando energia.

TERMODINMICA
rea da cincia que se dedica ao estudo da ENERGIA e seus efeitos
A vida traz desafios, mas obedece as Leis da Termodinmica

1 Lei da Termodinmica a Energia conservada, no pode ser criada ou destruda,


apenas transformada.
2 Lei da Termodinmica um processo ser espontneo se o CAOS do Universo
aumentar.

Sistema + Vizinhana = Universo


A Vida e Ordem
Como a Vida pode acontecer num sistema ordenado, considerando a 2 lei da
Termodinmica?
Como criar ordem a partir do caos???
Termodinmica:
o conjunto de princpios que regem as transformaes de energia.

A energia no pode ser criada nem destruda, a quantidade de energia no


universo constante. Pode, somente, mudar a forma ou o local em que ela se
apresenta.

Nos processos espontneos existe uma tendncia a


aumentar o grau de desordem. O universo sempre
tende para a desordem crescente: em todos os
processos naturais a entropia do universo
aumenta.
Expressa a quantidade de energia
capaz de realizar trabalho durante uma
G= H -T S
reao a temperatura e presso
constantes
Os componentes de G

Energia livre de Gibbs, G:


Quando a reao libera energia a variao na energia livre de Gibbs tem sinal negativo
G<0 (exergnica)
Quando a reao absorve energia a variao na energia livre de Gibbs tem sinal positivo
G>0 (Endergnica)
Entalpia, H:
o contedo de calor de um sistema.
Reflete o nmero e o tipo de ligaes qumicas nos reagentes e nos produtos
Quando uma ligao libera calor H tem, por conveno ,um sinal negativo.
H< 0 (Exotrmica)
Quando uma ligao absorve calor H tem, por conveno ,um sinal positivo
H>0 (Endotrmica)
Entropia, S:
uma expresso do grau de desordem de um sistema.
Quando os produtos de uma reao so menos complexos ou mais desordenados que os
reagentes a reao ocorre com ganho de entropia
S>0 (Aumento da desordem)
S<0 (Diminuio da desordem)
Entendendo os componentes de G

G: variao na energia livre


* Energia livre para realizar trabalho
* Aproxima-se de 0 assim que uma
reao atinge o equilbrio
* Prev se uma reao favorvel ou
espontnea
H: variao na entalpia S: variao na entropia
* Calor liberado ou absorvido durante a * Aumento ou diminuio do grau de
reao desordem
* NO prev se uma reao favorvel * NO prev se uma reao favorvel

Ocorre perda lquida de energia. A reao ocorre espontaneamente.


Reao exergnica
Reao em equilbrio NO OCORRE NOS ORGANISMOS VIVOS
Desequilbrio existe a custa de energia (retirada do meio)

Ocorre ganho lquido de energia. A reao NO ocorre espontaneamente.


Reao endergnica
Vida versus 2 Lei da Termodinmica

- A vida ocorre com a S < 0 local a custas da S > 0 do meio externo


- A quebra de nutrientes ajuda a reduzir localmente a entropia

Os organismos vivos so SISTEMAS ABERTOS EM EQUILBRIO ESTACIONRIO COM O


MEIO.

Termodinmica clssica sistemas ISOLADOS troca ENERGIA com o MEIO


atinge, INEXORAVELMENTE, o EQUILBRIO com a vizinhana

- VIDA SISTEMA ABERTO troca MATERIA E ENERGIA com o MEIO

No atinge o EQUILBRIO com o MEIO Se atingir MORTE

Os organismos vivos preservam a sua ordem interna pela retirada de


energia do meio na forma de nutrientes ou energia solar, e devolvem
para o meio na forma de calor e entropia
Vida versus 2 Lei da Termodinmica

Os organismos vivos ingerem substncia com ALTA ENTALPIA e BAIXA ENTROPIA e os


convertem em compostos com BAIXA ENTALPIA e ALTA ENTROPIA

O contedo ENTRPICO dos alimentos to importante como o ENTLPICO.


A energia transformada (1 Lei da Termodinmica)

- Sistema organizado Baixa Entropia mantido

Estado estacionrio Fluxo constante mantido pelo gradiente de concentrao ou pelo


gasto de G;

O gasto de G ocorre de modo morro abaixo atravs do acoplamento de processos


endergnicos e exergnicos
O sistema dissipativo Rendimento baixo
Vida versus 2 Lei da Termodinmica

a) Organismos vivos extraem energia da sua vizinhana


Envolvem Reaes de xido-Reduo

b) Parte da Energia convertida em trabalho

c) Parte da Energia convertida em Calor


> S da vizinhaa

d) Liberao de produtos na forma de molculas simples


> S da vizinhaa

e) Parte da energia utilizada para sntese de molculas


complexas
< S local ordenamento

2 Lei da termodinmica: entropia do universo


aumenta durante os processos qumicos e fsicos
MAS NO REQUER que o aumento ocorra dentro
do prprio sistema reativo
Termodinmica e Acoplamento de reaes

No Metabolismo, as reaes precisam se:


1) Especficas: As enzimas cuidam disto
2) Um conjunto de reaes numa via precisam ser favorveis: Termodinmica
[Ceq ]c [ Deq ]d
K eq =
G = G 0 + RT ln K eq [ Aeq ]a [ Beq ]b
G0 = G equivalente condio de equilbrio na condio padro
Segundo a equao, a G depende da concentrao dos reagentes

Se G = 0 no equilbrio G 0 = RT ln K eq = H TS

- Reaes cujos G so muito positivos so virtualmente irreversveis, porm podem ser


revertidas por outras rotas que considerem o gasto de energia livre, ou seja, pelo
acoplamento de reaes.

A B+C G0 = + 5 kcal/mol
B D G0 = - 8 kcal/mol
A C+D G0 = - 3 kcal/mol
O Acoplamento de reaes

Uma reao termodinamicamente no-favorvel pode ser transformada em uma


favorvel atravs do acoplamento de uma reao termodinamicamente favorvel.
Ativao de reagentes
Conformao ativada da protena
Gradiente de ons
Termodinmica de algumas reaes bioqumicas

Reaes com valores de G


prximos de ZERO podem ser
facilmente revertidas pela
mudana nas concentraes de
produtos e de reagentes
Termodinmica de algumas reaes bioqumicas

Reaes com valores de G prximos de ZERO podem ser facilmente


revertidas pela mudana nas concentraes de produtos e de reagentes

Entretanto, certas enzimas que operam longe do equilbrio esto


estrategicamente localizadas nas vias metablicas:

As vias metablicas so irreversveis


Cada via metablica possui uma etapa inicial limitante
As vias catablicas e anablicas so distintas

1 A 2 G0 < 0

Y X G0 < 0

As rotas de inter-converso independentes permitem a existncia de sistemas de


controle independentes.
Adenosina Trifosfato
1 das 100 molculas essenciais - Metablitos primrios - para a Vida
Moeda universal de Energia na Bioqumica

A hidrlise de ATP Exergnica

ATP + H2O ADP + Pi G0 = - 7,3 kcal/mol

ATP + H2O AMP + PPi G0 = - 10,9 kcal/mol


Adenosina Trifosfato
A hidrlise de ATP impulsiona o Metabolismo ao deslocar o equilbrio

A B G0 = + 4,0 kcal/mol

[ B ]eq G 0 ' / 298,15*1, 987*2.303


25 oC a Keq ser:
K 'eq = = 10 = 0,00115
[ A]eq

A + ATP + H2O B + ADP + Pi G0 = - 3,3 kcal/mol


G0Total= + 4,0 kcal/mol + (- 7,3 kcal/mol) = - 3,3 kcal/mol

[ B ]eq [ ADP]eq [ Pi ]eq G 0 ' / 298,15*1, 987*2.303


K 'eq = x = 10 = 262
[ A]eq [ ATP ]eq
O Acoplamento da hidrlise de ATP permite reverter um processo no-favorvel num
favorvel num fator de 105 vezes em condies padro.
Adenosina Trifosfato
A G de hidrlise de ATP dentro de uma clula de 12000 cal/mol (12 kcal/mol)

O que explica o alto potencial doador de fosforila do ATP???

ATP + H2O ADP + Pi G0 = - 7,3 kcal/mol

Glicerol 3-Fosfato + H2O Glicerol + Pi G0 = - 2,2 kcal/mol


Adenosina Trifosfato
A G de ativao da hidrlise de ATP alta e somente a hidrlise enzimtica vivel

1) Produto da hidrlise estabilizado por ressonncia

2) Repulso eletrosttica no ATP evita


as estruturas de ressonncia

3) Ionizao dos produtos da hidrlise de ATP

4) Estabilizao dos produtos de hidrlise por hidratao

A ligao fosfodister NO rica em energia!!!


Oxidao de compostos Carbonados
Um ser humano tpico (70 kg) tem aproximadamente 100 g de ATP
ATP tem um alto nmero de renovao turnover number
- Em repouso: 40 kg de ATP em 24 horas 28 g/min
- Em exerccio vigoroso 500 g/min
- Para corrida de 2 horas 60 kg de ATP

O Organismo est constantemente oxidando


combustveis para formar ATP
Quanto mais reduzido o Carbono maior a energia extrada
Potencial doador de Fosforila
O ATP no a nica molcula na clula capaz de doar fosforilas
Existem molculas com maior potencial doador de fosforila do que o ATP

So molculas
formadas a partir
da oxidao dos
combustveis:
Compostos
carbonados
Potencial doador de Fosforila
O ATP no a nica molcula na clula capaz de doar fosforilas
Existem molculas com maior potencial doador de fosforila do que ATP

So capazes de doar Pi para o ADP

Fosforilao ao nvel do
substrato

Posio intermediria permite


que o ATP funcione como
carreador de fosforilas.

Funcionam como Tampes de


fosforilas para o ATP
Potencial doador de Fosforila
Creatina-Fosfato um tampo de Pi na clula muscular
Seu alto potencial doador de Pi permite formar ATP a partir de ADP no exerccio

A quantidade de ATP
disponvel na clula
muscular suficiente para
apenas 1 segundo de
exerccio extenuante.
Sntese de ATP
Pequena parte do ATP obtido a partir da fosforilao ao nvel do substrato
- Anaerbica
Maior parte formada por uma BOMBA DE PRTONS movida por um gradiente de
concentrao
- Aerbica

Membrana
Extrao de Energia dos alimentos

Realizada em trs estgios

Estgio I: Degradao de macromolculas


- digesto

Estgio II: Simplificao a compostos


comuns - Acetil-CoA (maioria)

Estgio III: Oxidao final da Acetil-CoA


nas vias finais e extrao de Energia
Temas Recorrentes do Metabolismo
Apesar do alto nmero de reaes e enzimas: O METABOLISMO REPETITIVO
Os Carreadores Ativados: Coenzimas
Facilita a compreenso da complexidade, na execuo das tarefas e em economia
1) Existem carreadores ativados de Eltrons para reaes de Oxidantes
Nicotinamida adenina dinucleotdeo

- Derivada da Niacina
- Transporta on Hidreto H-
- Forma Oxidada = NAD+
- Forma reduzida = NADH
Os Carreadores: coenzimas
1) Existem carreadores ativados de Eltrons para reaes Oxidantes
Flavina Adenina Nucleotdeo
Flavina Mononucleotdeo FMN (em azul)
- Forma oxidada: FAD
- Forma reduzida: FADH2
- O2 o receptor final de eltrons

Anel iso-aloxazina
Os Carreadores: coenzimas
2) Existem carreadores ativados de Eltrons para reaes Biosinttica Redutoras
Nicotinamida adenina dinucleotdeo Fosfato: NADPH
- Derivada da Niacina
- Transporta on Hidreto H-
- Forma Oxidada = NADP+
- Forma reduzida = NADPH
- Localizado preferencialmente no citoplasma
- O Pi uma etiqueta e marca para biossntese
- NADPH formado na via das pentoses

R = H ou Pi
Os Carreadores: coenzimas
3) Existe um carreador ativado de fragmentos de 2 Carbonos
Coenzima A - CoA
- Desempenha papel central no metabolismo
- Transporta unidades de acilas
- No catabolismo: oxidao de glicose, de cidos graxos e de AA
- No Anabolismo: biossntese de cidos graxos
- Grupo funcional: Sulfidrila
- Ligao Tioster hidrlise mostra G0= -7,5 kcal/mol
- Reao lenta na ausncia de catalisador
Os Carreadores Ativados
Nmero reduzido de carreadores unifica o Metabolismo perante a temas comuns: Reaes
Principais carreadores ativados universais
As Reaes Recorrentes do Metabolismo
As reaes qumicas que ocorrem no metabolismo so repetitivas
1) Reaes de Oxido reduo (xido-redutases)
Oxidao: perda de e- doador de e- ser oxidado (agente redutor)
Reduo: ganho de e- aceptor de e- ser reduzido (agente oxidante)

Reao
NADH NAD+ + H+ + 2e- (Meia reao de oxidao)
Etanol (12 e-) Acetaldedo (10 e-) + 2H+ + 2e- (Meia reao de oxidao)
Na mistura destes reagentes, poder ocorrer transferncia de eltrons, produzindo etanol e
NAD+ devido tendncia termodinmica do processo.
As Reaes Recorrentes do Metabolismo

1) Reaes de xido reduo (xido-redutases)


- Envolve retirada (ou doao) de eltrons dos metablitos
- Participao direta dos carreadores de eltrons: NAD+, NADP+ e FAD
As Reaes Recorrentes do Metabolismo
2) Reaes de Ligao (Ligases)
- Unio de molculas custas da energia livre da clivagem de ATP

3) Reaes de Isomerizao (Isomerases)


- Reaes de rearranjo molecular Prepara a molcula para reaes subsequentes
As Reaes Recorrentes do Metabolismo
4) Reaes de transferncia (Transferases)
- Muito variveis
- Grupo fosforila transferido do ATP para outra molcula
- Ativao de substrato
As Reaes Recorrentes do Metabolismo
5) Reaes de Hidrlise (Hidrolases)
- A gua quebra uma ligao quebra de macromolculas

6) Reaes de formao ou quebra de Ligaes duplas (Liases)


- Grupos funcionais podem ser adicionados a ligaes duplas
- Grupos funcionais podem ser removidos formando ligaes duplas
Controle do fluxo metablico
1. Controle alostrico regulao por retroalimentao

A B C D

2. Modificaes covalentes inter-converso enzimtica


Controle do fluxo metablico

3. Ciclos de substrato duas reaes opostas de no-equilbrio e catalisadas por


enzimas diferentes

4. Controle Gentico Sntese de protenas em resposta s necessidades


metablicas Efeito dos Hormnios

5. Status Energtico As vias metablicas no controladas pela [ATP] e [ADP]


O Balano energtico tamponado!!!

[ ATP ] + 1 [ ADP] Inibe vias Catablicas


Carga Energtica = 2
[ ATP ] + [ ADP] + [ AMP] Estimula vias Catablicas