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278 Revista Argentina de Microbiologa (2011) 43:0325-7541

ISSN 278-286
ARTCULO ORIGINAL Revista Argentina de Microbiologa (2011) 43: 278-286

Mtodos para la deteccin de Agrobacterium a partir de


muestras de material vegetal, suelo y agua
ADRIANA M. ALIPPI1*, ANA C. LPEZ2, PEDRO A. BALATTI1

Centro de Investigaciones de Fitopatologa (CIDEFI), Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales,


Universidad Nacional de La Plata, Calles 60 y 119 S/N, 1900, La Plata Argentina.
1
Investigadores de la Comisin de Investigaciones Cientficas de la Provincia de Buenos Aires (CIC), Argentina;
2
Investigadora de CONICET (CCT La Plata), Argentina.
*Correspondencia. E-mail: alippi@biol.unlp.edu.ar

RESUMEN
El gnero Agrobacterium incluye especies fitopatgenas que inducen la formacin de agallas en el cuello o la pro-
liferacin de races en cabellera en ms de 600 especies de dicotiledneas, y especies no patgenas cuyo hbitat
natural es el suelo. Como no es posible erradicar a las especies patgenas y habida cuenta de que ms del 80 % de
las infecciones puede provenir de viveros, es importante evitar la diseminacin de la enfermedad. Por ello, el objetivo
de este trabajo ha sido desarrollar tcnicas sensibles y precisas que, aisladamente o combinadas, permitan detectar
la presencia de especies y biovares de Agrobacterium a partir de muestras de material vegetal, suelo y agua. Se com-
prob que con la estrategia combinada de realizar aislamientos en los medios semiselectivos D1, D1-M y YEM-RCT;
PCR multiplex sobre el gen 23S ADNr; PCR especfica sobre los genes virC1 y virC2 y bioensayos en plntulas de
pimiento cv. California Wonder y en hojas cortadas de kalanchoe, se reduce la posibilidad de obtener falsos negati-
vos y/o falsos positivos. Por lo expuesto, esta combinacin de tcnicas constituye una herramienta adecuada para el
diagnstico de cepas patgenas de Agrobacterium a partir de distintos tipos de muestras.
Palabras clave: Agrobacterium, tcnicas de deteccin, suelo, agua, agalla de corona, PCR

ABSTRACT
Methods for the detection of Agrobacterium from plant, soil and water samples. The genus Agrobacterium includes
phytopathogenic bacteria that induce the development of root crown galls and/or aerial galls at the base of the stem or
hairy roots on more than 600 species of plants belonging to 90 dicotyledonous families and non-pathogenic species.
These bacteria being natural soil inhabitants are particularly difficult to eradicate, which is a problem in nurseries where
more than 80% of infections occur. Since early detection is crucial to avoid the inadvertent spread of the disease, the
aim of this work was to develop sensitive and precise identification techniques by using a set of semi-selective and
differential culture media in combination with a specific PCR to amplify a partial sequence derived from the virC operon,
as well as a multiplex PCR on the basis of 23SrDNA sequences, and biological assays to identify and differentiate
species and biovars of Agrobacterium obtained either from soil, water or plant samples. The combination of the different
assays allowed us to reduce the number of false positive and negative results from bacteria isolated from any of the
three types of samples. Therefore, the combination of multiplex PCR, specific PCR, isolations in semi-selective D1,
D1-M and YEM-RCT media combined with bioassays on cut leaves of Kalanchoe and seedlings of California Wonder
pepper cultivar constitute an accurate tool to detect species and biovars of Agrobacterium for diagnostic purposes.
Key words: Agrobacterium, soil, water, crown gall disease, detection techniques, PCR

INTRODUCCIN hortcolas (tomate, pimiento, berenjena), industriales


(girasol, olivo, soja), ornamentales (rosales, crisantemos)
Agrobacterium es un gnero polifiltico que pertenece y forestales (lamos, sauces) (13, 22).
a la subdivisin alfa de la subclase Proteobacteria, familia Las especies patgenas de Agrobacterium comparten
Rhizobiaceae. Incluye tanto especies fitopatgenas que una caracterstica: contienen un plsmido de entre 200
inducen la formacin de agallas en el cuello o la prolifera- y 800 pkb denominado plsmido Ti (tumor-inducing) o
cin de races en cabellera, segn contengan el plsmido Ri (root-inducing), segn su capacidad de inducir en el
Ti o Ri, respectivamente, como especies no patgenas hospedante la formacin de agallas en la zona del cuello
cuyo hbitat natural es el suelo (3, 13, 19, 20, 22). Agro- o la corona y/o agallas areas en la parte inferior del tallo,
bacterium infecta a ms de 600 especies ubicadas dentro o la proliferacin de races en cabellera, respectivamente.
de 90 familias de dicotiledneas, que incluyen cultivos de Esto es el resultado de un mecanismo complejo y nico
importancia econmica como frutales (ciruelos, durazne- codificado en el plsmido, por medio del cual la bacteria
ros, perales, frambuesos, nogales, cerezos, arndanos), transfiere ADN del plsmido Ti o Ri, que se expresa y por
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ello afecta a las clulas vegetales. La virulencia est deter- a la presencia en el suelo de agrobacterias no patgenas
minada por diferentes regiones presentes en estos pls- y bacterias de la familia Rhizobiaceae, que comparten
midos; estas incluyen el ADN de transferencia (T-DNA) caractersticas similares. Si se emplea una tcnica nica
y los genes de virulencia (vir) (7). Si bien los plsmidos de deteccin pueden generarse falsos positivos o falsos
Ti y Ri varan en gran medida entre las diferentes cepas negativos. En el caso de los medios semiselectivos o
bacterianas, siempre contienen genes vir similares (15). selectivos, no todos los biovares y/o especies de Agro-
Tradicionalmente, las especies del gnero se clasifica- bacterium desarrollan en ellos y, por el contrario, pueden
ban de acuerdo con su capacidad patognica; estas com- desarrollar muchas especies de rizobios presentes en
prendan A. tumefaciens, especie polfaga que induce la el suelo, superficies vegetales y agua de riego. De esta
formacin de agallas en cuello y raz; A. rubi, que induce forma, muchas especies patgenas de Agrobacterium
la formacin de agallas sobre un rango de hospedantes pueden pasar desapercibidas al dar lugar a falsos nega-
limitado, principalmente frambueso; A. vitis, especfico de tivos (8, 10, 13, 14, 16) cuando se emplean medios con
vid; A. larrymoorei, que provoca agallas areas en Ficus insuficiente o con demasiada selectividad. Por otra parte,
benjamina, y A. rhizogenes, que induce el desarrollo de si solo se emplean mtodos moleculares para su detec-
races en cabellera. Por otra parte se ubicaban las es- cin, pueden originarse resultados contradictorios, como
pecies no patognicas, como Agrobacterium radiobacter ha sucedido al emplearse los primers A-C desarrollados
(5, 9). Posteriormente, el gnero aparece dividido en 4 por Haas et al. (8), que amplifican una secuencia del gen
especies, A. tumefaciens, A. rhizogenes, A. rubi y A. vitis, virD2 presente en los plsmidos Ti y Ri. Con este sistema
las cuales, con excepcin de A. rubi, se subdividen a su se ha observado entre un 12 y un 15 % de falsos positivos
vez en biovares sobre la base de caractersticas fisiol- y un 7 % de falsos negativos (8).
gicas y bioqumicas (9, 22). Por lo expuesto, el objetivo de este trabajo ha sido de-
Este gnero almacena un considerable nivel de di- sarrollar tcnicas sensibles y precisas que, aisladamente
versidad, que tal vez sea el resultado de la transferencia o combinadas, permitan detectar la presencia de especies
horizontal de ADN que ocurre naturalmente en los suelos patgenas de Agrobacterium a partir de muestras de
(11). Por esta razn, las caractersticas tumorignicas y material vegetal, suelo y agua.
rizognicas de las especies se pueden transmitir al trans-
ferirse los plsmidos en forma separada, lo que genera
una dinmica que determina la aparicin de estirpes de MATERIALES Y MTODOS
A. tumefaciens o A. rhizogenes no patgenas, por ha-
Cepas bacterianas
ber perdido sus respectivos plsmidos. De este modo,
Para el presente estudio se seleccionaron aislamientos de
pueden coexistir cepas de A. tumefaciens que contienen diversos hospedantes herbceos y leosos que presentaron
el plsmido Ri y cepas de A. rhizogenes que contienen sntomas de agalla en la zona del cuello o corona, aislamientos
el plsmido Ti, que inducen la formacin de races o de de muestras de suelo y suelo rizosfrico en contacto directo con el
rizoplano y aislamientos obtenidos de agua de riego provenientes
agallas, respectivamente. Esta movilidad de plsmidos
de diversas regiones de la Argentina (Tabla 1). Se incluyeron
no ha sido descrita ni en A. rubi ni en A. vitis, en donde cepas de colecciones internacionales de A. tumefaciens (ATCC
solo se ha encontrado el plsmido Ti (15, 22). 15955, LBA 958), A. radiobacter (K1026) y A. vitis (K 306 y S4),
Ms all de estas denominaciones, Young et al. (23) y una cepa previamente caracterizada y secuenciada de A. rubi
(F 210) (Genbank GU580894) (2). Como controles adicionales se
propusieron incluir a Agrobacterium dentro del gnero
emplearon cepas de Rhizobium etli bv. phaseoli (CFN4), Rhizo-
Rhizobium. Sin embargo, otros autores como Farrand et bium galegae, Bradyrhizobium japonicum (E109), Synorhizobium
al. (6) discuten que Agrobacterium constituye un grupo de- melilotti (2011) y Synorhizobium freedi (1031 HH).
finido y distinto dentro de la familia Rhizobiaceae. Por su
Aislamientos de bacterias a partir de plantas con sntomas
parte, Pulawska et al. (18) desarrollaron una clasificacin
Los aislamientos a partir de plantas con sntomas de agalla
ms simple basada en las diferencias encontradas en la en el cuello o corona se obtuvieron luego de desinfectar las
secuencia del gen 23S ARNr. Esta metodologa permite agallas sin cortar (previo lavado con agua corriente para eliminar
discriminar por un sistema de PCR multiplex 4 taxones, restos de suelo) por inmersin en hipoclorito de sodio al 1 %,
durante 15 min en el caso de plantas leosas (olivo, arndano,
Agrobacterium bv. 1, Agrobacterium bv. 2, Agrobacterium
flor de cera, frambueso) y durante 5 min para las herbceas
vitis (bv. 3) y A. rubi, que se correlacionan con la primitiva (tomate, pimiento), y posterior enjuague por 3 pasajes en agua
diferenciacin en biovares manteniendo a A. larrymorei destilada estril (5 min c/u). Luego del ltimo enjuague, las
como una especie separada. Esta ltima ser la nomen- agallas se cortaron en dados de 2 2 mm en forma asptica.
Estos se colocaron en 15 ml de agua destilada estril, se
clatura que se emplear en este trabajo.
maceraron y dejaron durante 45 min, al cabo de los cuales se
Si bien las agrobacterias son comunes en la microbiota agit en un agitador tipo vrtex; con ese material se efectuaron
del suelo, tanto en forma saprobia como patgena, se estras en los siguientes medios: D1 (12); D1-M (20) y YEM
conoce muy poco sobre la estructura de estas poblacio- rojo congo (21) adicionado con telurito de potasio (Britania,
Argentina) (YEM-RCT) a una concentracin final de 60 g/ml,
nes bacterianas, principalmente debido a la dificultad de
para aumentar la selectividad (14). Las placas se incubaron a
detectar su presencia en el suelo, la rizosfera y el material 27 1 C por el trmino de 7 das como mnimo; cada 24 h se
vegetal asintomtico (16). Parte de esta dificultad se debe observaron para determinar desarrollo bacteriano.
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Aislamientos de suelo y suelo rizosfrico en contacto de iluminacin conformada por 8 tubos GRO KLUX MP100 con
directo con el rizoplano un fotoperodo de 12 h de luz y a una temperatura de 24-28 C.
Las muestras de suelo se tomaron a una profundidad de entre La presencia de agallas en la zona lesionada se evalu a partir
5 y 10 cm. Cada submuestra de 1 g de suelo se suspendi en de los 10 das de la inoculacin mediante la comparacin con
10 ml de agua destilada estril; esta suspensin se mantuvo en la muestra de kalanchoe control lacerada con escalpelo. El
agitacin constante a 10 C durante 30 min. Luego la suspensin sistema se mantuvo por espacio de 4 semanas; las muestras
se decant y se mantuvo 5 min a la misma temperatura. Poste- libres de proliferaciones se consideraron negativas. A partir de
riormente se efectuaron 6 diluciones seriadas en agua destilada las agallas desarrolladas se efectuaron aislamientos segn lo
estril, para luego sembrar en placas, alcuotas de 100l de detallado anteriormente.
cada una de las 3 ltimas diluciones, en todos los medios de
cultivo antes detallados, que se suplementaron con 50 g/ml Bioensayo semicuantitativo sobre hoja cortada de kalan-
de cicloheximida para evitar el desarrollo de especies fngicas choe a partir de cultivos bacterianos.
presentes en las muestras de suelo. Las placas se incubaron a Con el objeto de determinar la virulencia relativa de los aisla-
27 C 1 por el trmino de 7 das como mnimo; cada 24 h se mientos de Agrobacterium obtenidos en los medios semiselecti-
observaron para detectar desarrollo bacteriano. vos, se emple un bioensayo semicuantitativo en hoja cortada de
En el caso de muestras de suelo rizosfrico, se trabaj con kalanchoe, usando una modificacin de la tcnica descrita por
el suelo en contacto directo con el rizoplano. Las plantas se Minnemeyer et al. (12). Se emplearon las hojas ms jvenes de
descalzaron cuidadosamente y el suelo adherido a las races y plantas de kalanchoe desinfectadas de la forma detallada ante-
la zona del cuello se recolect dentro de bolsas plsticas, luego riormente. Estas se lesionaron empleando el extremo distal de
de separarlo del material vegetal. Se tomaron submuestras de 5 una punta de micropipeta desechable estril, sin atravesarlas. Se
g de suelo y se suspendieron en 50 ml de agua destilada estril realizaron 4 lesiones por hoja, sobre las que se colocaron 5 l de
dentro de frascos con tapa a rosca, se mantuvo en agitacin a cada suspensin bacteriana en agua destilada estril, preparada
10 C durante 30 min. Posteriormente se procedi de la misma a partir de un cultivo en YEM rojo congo (YEM-RC) desarrollado a
manera que para las muestras de suelo. 28 C durante 24-48 h; la concentracin bacteriana fue del orden
de 109 UFC/ml. Las hojas as inoculadas se colocaron dentro de
Aislamientos de agua de riego placas de Petri que contenan agar agua al 2 % y 50 g/ml de
Para el anlisis a partir de agua, se tomaron alcuotas de cicloheximida, para evitar la proliferacin de hongos, y se man-
25ml y se centrifugaron a 10 C durante 45 minutos. Se elimin tuvieron bajo un fotoperodo de 12 h de luz a una temperatura
el sobrenadante dejando el pellet formado en un volumen de que oscil entre los 24 y los 28 C. A partir de los 10-12 das se
5ml, este se homogeneiz por agitacin en agitador tipo vrtex evalu la formacin de tumores en el rea lesionada.
durante 5 min, para posteriormente efectuar diluciones seria-
das en agua destilada estril y sembrar alcuotas de 100 l por Pruebas de patogenicidad
placa en todos los medios de cultivo detallados anteriormente Adicionalmente, con el fin de evaluar la patogenicidad de todos
para suelo. Las placas se incubaron a 27 1 C por el trmino los aislamientos, se emplearon plantas de pimiento (Capsicum
de 7 das como mnimo, cada 24 h se observaron para detectar annuum) cv. California Wonder de 4 semanas, obtenidas de
desarrollo bacteriano. semillas desinfectadas superficialmente y cultivadas en mace-
tas con sustrato estril. Se realizaron 2 repeticiones por cepa y
Mantenimiento de la coleccin bacteriana controles. La inoculacin se efectu por lesin del tallo con aguja
Todas las colonias que presentaron morfologa similar a la estril, previamente sumergida en cada suspensin bacteriana
exhibida por Agrobacterium en los distintos medios se purificaron preparada como ya se describi. Luego, cada lesin se rode con
en medio YDC (13). Los aislamientos Gram negativos, oxidasa un trozo de Parafilm (Pechinary Plastic Packaging Company,
positivos, cuando eran cultivados en medios sin glucosa y que Chicago, EE.UU.). Las plantas inoculadas se mantuvieron dos
presentaron metabolismo oxidativo de glucosa (13, 22), se das en cmara hmeda y despus se llevaron a invernculo
emplearon para los estudios posteriores, para lo cual se hicie- durante un perodo de 45 das a una temperatura de 24 4 C;
ron stocks en medio YEM lquido con 20 % de glicerol v/v y se semanalmente se fueron registrando los sntomas observados.
mantuvieron a -80 C.

Bioensayos sobre kalanchoe empleando agua del lavado Produccin de 3-cetolactosa


del material Para efectuar una diferenciacin primaria entre los biovares
A partir del agua de lavado del material vegetal y del con- 1 y 2, se evalu la produccin de 3-cetolactosa en medio agar
centrado de agua de riego, del suelo y del suelo rizosfrico en levadura-lactosa (13). Brevemente, se sembraron en placas
contacto directo con el rizoplano, se efectuaron bioensayos cultivos de 24 h y se incub a 28 C; a los 3 das las placas se
sobre hoja cortada de kalanchoe (Bryophyllum daigremontiana), cubrieron con 15 ml de reactivo de Benedict y se mantuvieron a
de acuerdo con la metodologa propuesta por Beriam et al. (4), temperatura ambiente durante 1 hora. La presencia de 3-ceto-
con las siguientes modificaciones: se seleccionaron las hojas lactosa se detect por formacin de un anillo amarillo de CuO2
ms jvenes, de por lo menos 4 cm de largo, provenientes de alrededor de las colonias bacterianas (13).
plantas de entre 10 y 20 cm de alto, las que luego del lavado en
agua corriente se desinfectaron superficialmente por inmersin Obtencin de ADN molde para las reacciones de PCR
en etanol al 70 % durante 2 min y se dejaron en una solucin Se obtuvo ADN bacteriano a partir de los siguientes tipos de
comercial de hipoclorito de sodio (5 % v/v) durante 15 min. Des- muestras: cultivo bacteriano puro, material vegetal con sntomas,
pus se realizaron 3 lavados en agua destilada estril, de 10 min agua de riego y agua de lavado de suelo y de lavado de suelo
cada uno. Las hojas se lesionaron en su parte basal mediante rizosfrico.
un corte con escalpelo estril y se colocaron con pinzas estriles En el caso de los cultivos puros, la extraccin de ADN se
en cada suspensin de lavado o concentrado (3 repeticiones efectu a partir de colonias individuales desarrolladas en medio
por muestra); como control se utiliz agua destilada estril. slido empleando una tcnica de extraccin rpida mediante
Las hojas se dejaron en contacto con la suspensin durante 45 resina de intercambio inico (1). Brevemente, se tomaron una
min, al cabo de los cuales se llevaron a tubos de Roux estriles a dos colonias bacterianas mediante un palillo estril y se sus-
previamente preparados con algodn y 10 ml de agua destilada pendieron en 300 l de NaCl 1M. Cada muestra se agit en un
estril en la parte inferior, para mantener la humedad. Los tubos agitador tipo vrtex y se centrifug a 16 000 g durante 3 minutos.
se mantuvieron en condiciones de laboratorio bajo una fuente El sobrenadante se descart y el pellet bacteriano se resuspendi
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en 150 l de una suspensin acuosa de una resina de intercam- especies/biovar-especficos: B1R para el bv. 1; B2R para el
bio inico (Chelex, SigmaAldrich, Argentina) preparada al 6 % bv. 2, AvR para A. vitis y ArR para A. rubi, respectivamente
p/v. La mezcla se incub a 56 C durante 20 min, se agit en (18). Se siguieron las especificaciones de Pulawska et al. (18),
agitador vrtex durante 30 segundos y se incub a 99 C durante pero empleando 5 l de ADN molde para un volumen final de
8 min. Los restos bacterianos junto con la resina se eliminaron reaccin de 25 l.
por centrifugacin y se emple como templado de ADN 5 l del En todos los casos, los resultados de las reacciones de PCR
sobrenadante. Para la obtencin de ADN molde a partir de mate- se visualizaron en geles de agarosa al 1,6 %; el ADN fue teido
rial vegetal con sntomas, se tomaron 100 l del agua de difusin con bromuro de etidio y observado mediante un transiluminador
luego de 45 minutos y se transvasaron a un tubo Eppendorf con UV (UVP, Instrumentacin Cientfica Tcnica, S.L., La Rioja,
900 l de agua bidestilada. Se mezcl vigorosamente (agitador Espaa). Las imgenes de los geles se digitalizaron y fotogra-
vrtex) durante 30 segundos y se transvasaron alcuotas de 50l fiaron empleando el sistema de captura digital de geles Digi
de la dilucin realizada a nuevos tubos Eppendorf. Se incub Doc-it, UVP v.1.1.25.
en un bao seco a 56 C durante 20 minutos, luego se mezcl
en agitador vrtex durante 1 min y se incub a 95 C durante 15
minutos. En el caso del agua de riego o del lavado de suelo, el RESULTADOS
molde fue el mismo que el mencionado para el material vegetal,
con la diferencia de que la segunda incubacin fue a una tem-
Aislamiento de cepas de Agrobacterium en medios
peratura de 99 C durante 8 minutos.
semiselectivos y diferenciales
Identificacin por PCR La metodologa utilizada para aislar cepas de
Se amplific por la reaccin en cadena de la polimerasa Agrobacterium result efectiva cuando se emplearon los
(PCR) un fragmento de 730 pb correspondiente a las secuencias
medios semiselectivos D1, D1-M y YEM-RCT, tanto en la
del opern virC localizado en los plsmidos Ti y Ri de las cepas
patgenas de Agrobacterium. A tal fin se sigui la metodologa evaluacin de muestras vegetales provenientes de plantas
descrita por Sawada et al. (19), pero se emplearon 5 l de ADN con sntomas de agalla de la corona como de muestras
molde (obtenido segn se detall en el apartado correspondien- de suelo, de suelo rizosfrico en contacto directo con el
te) en un volumen total de reaccin de 25 l. Previamente se
rizoplano y de agua de riego.
probaron diferentes cantidades de ADN, y se determin que la
ptima para esta premix era aquella contenida en 5 l del fluido En los medios D1 y D1-M, las colonias presentaron co-
sobrenadante de la preparacin cruda de ADN. Se emple un loracin y caractersticas tpicas del gnero Agrobacterium.
ciclador marca Eppendorf modelo Mastercycler personal. En el medio D1, las colonias observadas eran circulares y
Para la diferenciacin entre los biovares 1 y 2 y entre
convexas, de color verdoso-amarillento con centros ms
las especies A. rubi y A. vitis, se emple la tcnica de PCR
multiplex basada en las diferencias en el gen 23S ADNr. Se oscuros y bordes de color blanco cremoso; a las 48-72 h
utiliz para ello un primer universal forward UF y 4 primers de incubacin presentaron un color azul muy claro y con

Figura 1. A. Colonias de Agrobacterium tumefaciens bv. 1 en medio D1, luego de 6 das de incubacin. Un aislamiento de agallas
(cepa F241) dio lugar a estas colonias, que son de forma convexa, mucosas, brillantes, de color verde oliva B. Colonias de Agrobac-
terium rubi desarrolladas en medio D1-M a partir de un aislamiento de agallas (cepa F253). Las colonias tpicas se indican con una
flecha, estas aparecen circulares, convexas, mucosas, brillantes, de color verde azulado con centros ms oscuros por absorcin del
colorante verde de malaquita, a los 4 das de incubacin. C. Colonias de Agrobacterium bv. 2 desarrolladas en YEM- RCT a partir
de una muestra de agua de riego (cepa 100/09M1). Las colonias aparecen como muy mucosas, convexas y con los centros de color
negro por acumulacin de cristales de telurito metlico, a las 48 h de incubacin. Las colonias tpicas se indican con una flecha.
D. Produccin de 3-cetolactosa: 1: positivo, Agrobacterium tumefaciens bv. 1 cepa F268; 2: negativo, Agrobacterium rubi F 253.
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Figura 2. Bioensayo semicuantitativo en hoja cortada de kalanchoe (Bryophyllum daigremontiana). A. Control lesionado ms agua
destilada estril. B. Inoculada con la cepa F 241 de Agrobacterium tumefaciens bv. 1, a los 14 das.

Figura 3. Plntulas de pimiento (Capsicum annuum cv. California Wonder): A. Control. B. Plntula de pimiento inoculada artificial-
mente con la cepa F 241 de A. tumefaciens bv. 1. Las flechas indican las lesiones positivas a los 45 das de efectuada la inoculacin.

el correr del tiempo se tornaron de color verde oliva, pero En el medio D1-M, todas las cepas de Agrobacterium
siempre con bordes ms claros, estas tomaron el color identificadas como bv. 1 y bv. 2, lo mismo que A. rubi
del azul de bromotimol (Figura 1A). y A. radiobacter, mostraron un activo crecimiento, con
Por otra parte, las colonias desarrolladas en el medio excepcin de las cepas control de A. vitis K 306 y S4.
D1-M resultaron circulares, convexas, mucosas, brillantes, No obstante, estas ltimas presentaron un muy buen
de color azul verdoso, tenue al principio, pero con centros desarrollo al cultivarlas en YEM-RCT.
de color azul ms oscuro, debido a que metabolizan el
verde de malaquita, y bordes ms claros. A veces resul- Bioensayos y pruebas de patogenicidad
taron ser grisceas o blancuzcas, pero con los centros Todas las cepas de Agrobacterium bv. 1, Agrobacterium
azulados (Figura 1B). bv. 2 y A. rubi provocaron la formacin de agallas esfri-
En YEM-RCT, las colonias aparecen mucosas, con- cas y esponjosas en los puntos de inoculacin en hojas
vexas, circulares, con mrgenes enteros y de color negro cortadas de kalanchoe; estas se visualizaron entre los
ms marcado en la parte central, probablemente debido a 7 y 14 das de efectuada la inoculacin (Figura 2). Las
una acumulacin de cristales negros de telurito metlico cepas de A. vitis K 306 y S4 indujeron zonas necrticas
(Figura 1C). alrededor de los puntos de lesin, que no evolucionaron
Los medios D1, D1-M y YEM-RCT restringieron el creci- a proliferaciones celulares. La cepa de A. radiobacter K
miento de otras bacterias saprobias, con excepcin de algu- 1026 y los rizobios no produjeron sntomas, solo se ob-
nas especies de Rhizobium, Bradyrhizobium y Synorhizobium, servaron los puntos de lesin, al igual que en el testigo
lo que en el caso del medio YEM-RCT se debera a que son colocado en agua.
resistentes al telurito. Con respecto a los medios D1 y D1-M, El pimiento cv. California Wonder respondi rpida-
las clulas de Rhizobium, Bradyrhizobium y Synorhizobium mente a la inoculacin, ya que en los puntos de lesin
que pueden estar presentes en las muestras de suelo y del tallo gener a los 7 das agallas esfricas, de color
suelo rizosfrico desarrollan en estos medios, pero luego blanco-rosado a castao claro y de aspecto verrugoso
de un perodo de incubacin de ms de 7 das pueden (Figura 3). Todas las cepas probadas de Agrobacterium
presentar una coloracin diferente (de acuerdo con la bv. 1, bv. 2 y A. rubi indujeron lesiones en pimiento, las
cepa probada); asimismo, en el medio D1 pueden verse cepas de A. vitis K 306 y S4 solamente manifestaron apa-
inhibidas por el LiCl. ricin de reas necrticas en los puntos de inoculacin.
Mtodos de deteccin de Agrobacterium 283

Tal cual era de esperar, las cepas de A. radiobacter K Identificacin por PCR
1026 y los rizobios no provocaron la aparicin de ningn El 100 % de los aislamientos sospechados de ser Agro-
tipo de sntoma. bacterium mostraron el producto de amplificacin espera-
En todos los casos en los que se observaron lesiones do de 730 pb mediante una PCR especfica empleando los
o sintomatologa tpica, se procedi a efectuar los reais- primers VCF/VCR, homlogos a una secuencia parcial del
lamientos de las cepas inoculadas y se cumplimentaron opern virC (genes virC1 y virC2) presente en los plsmi-
los postulados de Koch. dos Ti y Ri (Figura 4). Este resultado permiti identificar
con precisin la totalidad de los aislamientos que inducan
Produccin de 3-cetolactosa la formacin de agallas en kalanchoe y en pimiento, tanto
La habilidad de las cepas de utilizar 3-cetolactosa de aquellos recuperados del agua de lavado de lesio-
permiti efectuar una diferenciacin primaria entre los nes y/o de suelo como de los que fueron previamente
diferentes biovares y la especie A. rubi. Solo las cepas aislados en los medios semiselectivos. De acuerdo con
de Agrobacterium tumefaciens bv. 1 mostraron que su lo esperado, las cepas de Rhizobium etli bv. phaseoli
metabolismo da lugar a la formacin de un anillo amari- (CFN4), Rhizobium galegae, Bradyrhizobium japonicum
llo de xido cuproso alrededor de las colonias luego del (E109), Synorhizobium melilotti (2011) y Synorhizobium
agregado del reactivo de Benedict (reaccin positiva) freedi (1031 HH) y la cepa control de A. radiobacter no
(Figura 1D). Todas las cepas de A. rubi, Agrobacterium generaron producto de amplificacin alguno.
bv. 2, A. radiobacter, A. vitis y los rizobios dieron reaccin Los resultados obtenidos mediante el empleo de PCR
negativa (Tabla 1). multiplex basada en las diferencias del gen 23S ADNr con-

Tabla 1. Denominacin, hospedante, origen geogrfico y algunas caractersticas de las cepas de Agrobacterium y las cepas
de referencia utilizadas en este trabajo.

Cepa Gnero, especie Fuente de Regin de 3-ceto- PCR Multi-


y/o biovar aislamiento origen lactosa plex

ATCC 15955 Agrobacterium tumefaciens N/D N/D - + bv. 2


LBA 958 A. tumefaciens N/D N/D + + bv. 1
K 1026 A. radiobacter N/D N/D - - N/D
K 306 A. vitis vid Australia - + vitis
S4 A. vitis vid Hungra - + vitis
F 266 A . rubi arndano Morn, Argentina - + rubi
F 210 A. rubi arndano Pilar, Argentina - + rubi
F 236 A. tumefaciens flor de cera La Plata, Argentina + + bv. 1
F 241 A. tumefaciens frambueso Mar del Plata, Argentina + + bv. 1
F 253 A. rubi arndano Tucumn, Argentina - + rubi
F 268 A. tumefaciens arndano Concordia, Argentina + + bv. 1
F 272 A. rubi arndano cv. ONeil Entre Ros, Argentina - + rubi
F 342 A. tumefaciens tomate cv. He Man La Plata, Argentina + + bv. 1
F 350 A. tumefaciens suelo rizosfrico de cerezo La Rioja, Argentina + + bv. 1
F 351 A. tumefaciens suelo rizosfrico de cerezo La Rioja, Argentina + + bv. 1
F 352 A. tumefaciens suelo La Rioja, Argentina + + bv. 1
F 353 A. tumefaciens suelo La Rioja, Argentina + + bv. 1
F 359 A. rubi suelo La Rioja, Argentina - + rubi
F 362 Agrobacterium bv. 2 Olivo cv. Picual La Rioja, Argentina - + bv. 2
F 382 A. tumefaciens Olivo cv. Barnea La Rioja, Argentina + + bv. 1
F 400 Agrobacterium bv. 2 arndano Buenos Aires, Argentina - + bv. 2
F 448 A. tumefaciens pimiento La Rioja, Argentina + + bv. 1
F 450 A. tumefaciens suelo rizosfrico de duraznero Crdoba, Argentina + + bv. 1
100/09M1 Agrobacterium agua de riego La Rioja, Argentina - + bv. 2
100/09M2 A. tumefaciens agua de riego La Rioja, Argentina + + bv. 1
110/10 A. tumefaciens agua de riego Mendoza, Argentina + + bv. 1
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Figura 5. Productos de amplificacin obtenidos por PCR multi-


plex basada en las diferencias del gen 23s ADNr entre especies
y biovares de Agrobacterium, empleando el primer universal UF
(forward) y 4 primers especies/biovar-especficos (B1R para el
bv. 1; B2R para el bv. 2, AvR para A. vitis y ArR para A. rubi), con
ADN de las cepas bacterianas que se detallan a continuacin. 5A:
calle 1, Agrobacterium bv. 2 cepa F 362; calle 2, Agrobacterium
rubi cepa F 266; calle 3, Agrobacterium tumefaciens bv. 1 cepa
LBA 958; 5B: calle 1, Agrobacterium vitis cepa K306; calle 2,
Agrobacterium vitis cepa S4; calles 3 y 4, controles negativos
Figura 4. Productos de amplificacin obtenidos por PCR em- (Rhizobium galegae y Synorhizobium freedii 1031HH, respectiva-
pleando los primers VCF/VCR, homlogos a una secuencia mente). M, marcador de peso molecular ladder 100 bp Promega.
parcial del opern virC (genes virC1 y virC2) con ADN de las
siguientes cepas bacterianas: calle 1, Agrobacterium tumefaciens
bv. 1 cepa LBA958; calle 2, Agrobacterium rubi cepa F 266;
calle 3, Agrobacterium bv. 2 cepa F 362. M, marcador de peso La amplificacin por PCR con los primers VCF/VCR,
molecular ladder 100 bp Promega. al igual que la reaccin PCR multiplex, permiti identificar
con precisin la totalidad de los aislamientos que inducan
la formacin de agallas en kalanchoe y pimiento. En am-
firmaron que las cepas que pertenecan al biovar 1, que bos casos, ninguno de los rizobios ni la cepa control de
resultaron cetolactosa positivas, exhibieron un amplicn A. radiobacter dieron producto de amplificacin alguno
de 184 pb. Dentro de las cepas cetolactosa negativas, las con ninguna de las combinaciones de primers probadas.
pertenecientes al biovar 2 exhibieron un amplicn de 1066 Adicionalmente, se probaron tambin los primers A-E y
pb. En las cepas de A. rubi el amplicn caracterstico co- A-C para amplificar dos fragmentos de 338 pb y de 224
rrespondi a 1006 pb (Figura 5A), en tanto que las cepas pb, respectivamente, correspondientes a la secuencia
de A. vitis K306 y S4 exhibieron un amplicn de 478 pb parcial del gen virD2 presente en los plsmidos Ti y Ri
(Figura 5B). Como era previsible, ninguna de las cepas de de las cepas patgenas de Agrobacterium, de acuerdo
Rhizobium, Bradyrhizobium y Synorhizobium generaron con la metodologa descrita por Hass et al. (8). Se hall
productos de amplificacin con la multiplex (Figura 5B). un 30 % de falsos negativos y tres cepas de Rhizobium
arrojaron resultados positivos (datos no mostrados), por
DISCUSIN lo que esta combinacin de primers no sera til para el
diagnstico ni podra emplearse por s sola para carac-
Uno de los aspectos claves para el diagnstico y el terizar poblaciones de agrobacterias.
control de las enfermedades de origen bacteriano en Los medios semiselectivos D1, D1-M y YEM-RCT
los vegetales es disponer de metodologas precisas que resultaron efectivos para aislar cepas de Agrobacterium,
no generen falsos positivos y/o falsos negativos, para no solo cuando el material de partida fueron plantas con
una correcta identificacin de los agentes patgenos y sntomas de agalla, sino tambin al tratarse de muestras de
el anlisis de potenciales fuentes de inculo, tanto en el suelo, suelo rizosfrico y agua de riego. Tanto en el medio
suelo como en el material vegetal. D1 como en el D1-M, las colonias presentaron coloracin
Con respecto al aislamiento y la posterior identificacin y caractersticas tpicas del gnero Agrobacterium, de
de cepas de Agrobacterium, con la combinacin de las acuerdo con lo descrito por Kado y Heskett (10) y Perry y
reacciones de PCR empleadas, el aislamiento en los me- Kado (17), respectivamente. En el medio D1, las colonias
dios semiselectivos D1, D1M y YEM-RCT y los bioensayos de todas las especies y biovares de Agrobacterium pre-
en kalanchoe y pimiento cv. California Wonder se obtuvo sentaron forma convexa y coloracin verdoso-amarillenta
una efectividad mayor del 99 % en la identificacin de con centros ms oscuros, porque metabolizan el azul de
cepas patgenas provenientes de agallas, suelo, suelo bromotimol, y bordes de color blanco cremoso; con el
rizosfrico y agua. correr del tiempo las colonias se tornan de color verde
Mtodos de deteccin de Agrobacterium 285

oliva, pero siempre mantienen los bordes ms claros. En medios de cultivo probados, con morfologa similar a las
este medio, ciertas especies de Erwinia, Pseudomonas y presentadas por las cepas patgenas, ninguna de ellas in-
Acidovorax pueden desarrollar, pero con una coloracin dujo la formacin de agallas en kalanchoe ni en pimiento.
diferente a la observada en Agrobacterium, dado que no En el caso de los rizobios, si bien desarrollaron en YEM-
metabolizan el colorante y pueden dar una coloracin RCT con las mismas caractersticas que los aislamientos
amarilla en el medio de cultivo debido a un cambio de de Agrobacterium, se diferenciaron posteriormente tanto
color del indicador, que vira al amarillo al bajar el pH del por PCR (multiplex y especfica) como por bioensayo,
medio. Al efectuar aislamientos en el medio D1, se en- dado que en ningn caso indujeron sntomas ni presen-
contr una eficiencia mayor del 90 % para la recuperacin taron los productos de amplificacin correspondientes
de Agrobacterium a partir de poblaciones mixtas; esta al gen virD2 presente en los plsmidos Ti y Ri; de esta
eficiencia mejora con el enriquecimiento previo en D1 forma, se evit la posibilidad de detectar falsos positivos,
lquido y tambin con el agregado de telurito de potasio particularmente en el caso de muestras de suelo. No
al medio, lo que aumenta la selectividad a tal punto que obstante, empleando esta metodologa sera imposible
algunas cepas de Agrobacterium bv. 2 no desarrollan o lo diferenciar entre rizobios y cepas de Agrobacterium que
hacen en forma limitada. En el medio D1-M, las colonias hubieran perdido los genes de virulencia.
de Agrobacterium presentaron color azul verdoso con Con respecto a las pruebas de patogenicidad, el pi-
centros ms oscuros y bordes ms claros, tambin hubo miento California Wonder demostr ser un hospedante
colonias grisceas o blancuzcas con centros azulados diferencial en el que es posible visualizar los sntomas en
(por su capacidad de metabolizar el verde de malaquita), menor tiempo que en otras especies herbceas usual-
circulares, convexas, mucosas y brillantes. En algunos mente empleadas como indicadoras, como por ejemplo
casos, se observaron colonias con bordes irregulares, girasol y tomate. La respuesta a la inoculacin en pimiento
probablemente debido a una excesiva produccin de mu- se gener rpidamente, a los 7 das, bajo la forma de
copolisacrido. En este medio el crecimiento de saprobios agallas esfricas en los puntos de lesin del tallo, de color
es limitado, aunque algunas especies de Pseudomonas y blanco-rosado a castao claro y aspecto verrugoso, tras
gneros afines desarrollan, pero sin las caractersticas de la inoculacin de todas las cepas de Agrobacterium bv. 1,
pigmentacin particulares observadas en Agrobacterium. Agrobacterium bv. 2 y A. rubi. En estos ensayos, las cepas
Cuando se emplea YEM-RCT, las colonias son muy de A. vitis K 306 y S4 no interactuaron con el pimiento, lo
mucosas, circulares, convexas y de color negro ms que qued en evidencia porque nicamente aparecieron
intenso en la parte central debido a la acumulacin de zonas necrticas alrededor de los puntos de inoculacin.
cristales de telurito metlico. Por lo observado, cuando No obstante, en otras plantas de la familia Solanaceae,
se realizan estudios epidemiolgicos que incluyen la dis- como tomate y tabaco, se han encontrado diferencias en
tribucin espacial del patgeno, es recomendable utilizar la produccin de agallas en inoculaciones con diferentes
los tres medios de cultivo para aumentar la eficiencia de cepas de A. vitis (15). Por ello sera interesante evaluar
recuperacin, puesto que en una misma agalla pueden el comportamiento de un mayor nmero de aislamientos
cohabitar diversas cepas pertenecientes a especies o de A. vitis, con el fin de determinar si el pimiento cv.
biovares diferentes (13). Los medios con telurito contri- California Wonder es un hospedante diferencial con
buyeron a identificar a las agrobacterias sobre la base de potencial en el diagnstico de cepas virulentas de esta
la caracterstica tpica de sus colonias. Mougel et al. (14) especie. En el caso de A. radiobacter K 1026 y de las
demostraron que la resistencia a telurito no es de carc- cepas control de Rhizobium, Bradyrhizobium, Mesorhizobium
ter plasmdico, dado que todas las especies y biovares y Synorhizobium, estas no indujeron ningn tipo de
de Agrobacterium y aquellas cepas que han perdido el sntoma en pimiento, lo cual es lgico, considerando
plsmido Ti o el Ri desarrollan en presencia de telurito que carecen de genes de virulencia. Por otra parte, el
acumulando cristales de telurito metlico en sus clulas, bioensayo cuantitativo sobre kalanchoe desarrollado en
como fue observado en cepas curadas del plsmido Ti y este trabajo result una prueba econmica, sencilla y
otros plsmidos crpticos (14). No obstante, es importante fcil de manejar en condiciones de laboratorio. Adems,
destacar que los rizobios, organismos estrechamente demanda poco espacio, por lo que es ideal para realizar
relacionados con las agrobacterias, generan colonias de screenings de un alto nmero de cepas y especies de
aspecto similar cuando se cultivan en YEM-RCT, lo que Agrobacterium.
no ocurre en los medios D1 y D1-M, en los que los rizobios En conclusin, el empleo combinado de PCR multiplex,
no desarrollan o lo hacen en forma extremadamente lenta PCR especfica, aislamientos en medios semiselectivos y
(ms de 7 das). En el medio D1 pueden ser inhibidos por bioensayos en kalanchoe y pimiento redujo significativa-
el cloruro de litio presente, que afecta el modo de unin mente la posibilidad de obtener resultados falsos negativos
del aminoacil ARN de transferencia y altera la sntesis de a partir de muestras de agallas, suelo, suelo rizosfrico y
protenas bacterianas (10). agua. Este conjunto de mtodos representa una herra-
Si bien las cepas de A. radiobacter y las cepas no mienta adecuada para la deteccin de cepas patgenas
patgenas de Agrobacterium desarrollaron en todos los de Agrobacterium en estudios fitopatolgicos y ecolgicos.
286 Revista Argentina de Microbiologa (2011) 43: 278-286

Agradecimientos: Los autores agradecen a los Dres. DH titative bioassay for relative virulence of Agrobacterium
Grasso (Instituto de Suelos, INTA Castelar, Argentina) y S Sle tumefaciens strains on Bryophyllum daigremontiana. J
(Plant Protection Institute, Hungarian Academy of Sciences, Bacteriol 2006; 173: 7723-4.
Budapest, Hungra) por facilitar las cepas de referencia LBA 956 13. Moore LW, Bouzard H, Burr T. Agrobacterium. En: Schaad
de A. tumefaciens y K 306 y S4 de A. vitis, respectivamente. Esta NW, Jones JB, Chun W, editors. Laboratory guide for the
investigacin fue parcialmente subsidiada por la CIC (Provincia identification of Plant Pathogenic Bacteria, APS Press, St.
de Buenos Aires, Argentina). Paul, Minnesota, 2001; p 17-35.
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Recibido: 15/03/11 Aceptado: 02/09/11

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