Espectroscopa de Infrarrojo (IR)

y espectrometra de masas (MS)

Elucidacin Estructural de Compuestos Orgnicos
Resonancia Magntica Nuclear (RMN)
Espectrometra de Masa (MS)
Espectroscopa de Infrarojo (IR)
Espectroscopa de Ultravioleta-visible(UV-VIS).
Compuestos < 1000 uma.

1. Poseer conocimiento general de los principales grupos

funcionales.
2. Interpretar los datos espectroscpicos.
3. Aplicar un secuencia sistemtica y organizada.
4. Evitar inferir informacin apartir de ausencia o de datos
negativos.
5. Mantener una perspectiva adecuada cuando se
encuentran datos incongruentes o que crean conflicto.
 Compuesto

Formula Molecular, MS

Identificacion de Grupos Funcionales, IR

Conectividad de los carbonos, RMN

Posicin de los sustituyentes o Grupos funcionales, RMN 2D

Estereoqumica, RMN 2D, R-X

 HO OH
1305/3
HO OH OH
O OH
HO HO OH
HO O HO
HO
OH OH
Palytoxin, es el producto
natural ms txico del que se
OH tiene conocimiento (>5 mg),
(coral blando Palythoa toxica)
HO OH OH
HO OH HO
HO HO O OH
OH HO OH
OH OH MW 2706
HO OH O OH HO O OH
C129H223N3O54
OH HO
HO
OH
O
O

HO O
O

HO OH
O
O N

H2N O
N

OH
 Que es la Espectroscopa?

Los tomos y las molculas interaccionan con la

Radiacin Electromagntica (RE) en una amplio rango de variedad.

Los tomos y molculas pueden absorver y/o emitir RE.

La absorcin de RE estimula diferentes tipos de movimientos en

tomos y/o molculas.

Los patrones de absorcin y/o emisin son llamados espectros.

El campo de la Espectroscopa se concentra en la interpretacin de

los espectros en terminos de estructura atmica y molecular.
 Qu es la Radiacin Electromagntica?
Definicin: la radiacin electromagntica se compone de paquetes de
energa sin masa, asociados a campos electromagnticos y propagndose a
una velocidad constante, igual a la velocidad de la luz.

Onda electromagntica
Campo magntico
Campo elctrico

Campo elctrico

Campo magntico
Propagacin de Radiacin electromagntica
Caracterizacin de la Radiacin Electromagntica
Longitud de onda
Longitud de Onda: l Max
Max

Distancia entre dos

mximos consecutivos Min

Frecuencia: n

Nmero de picos que

atraviesen esta
superficie cada segundo
No son independientes: ln = c
y miden la energa de la radiacin: E = hn
 El espectro electromagntico
El espectro electromagntico es el intervalo de todas las frecuencias posibles, desde cero hasta el infinito.

Radio Infrarrojo Visible Ultravioleta Rayos X Rayos gamma

m

Edificios Humanos Abejas Cabezas de Organismos Molculas tomos Ncleos

alfiler unicelulares atmicos

Longitud de onda larga Longitud de onda corta

Frecuencia pequea Frecuencia alta
Baja energa Alta energa
 El espectro electromagntico
En la prctica, en el espectro se representan desde las bajas frecuencias de radio hasta las altas frecuencias
de los rayos gamma.

Radio Infrarrojo Visible Ultravioleta Rayos X Rayos gamma

m

Edificios Humanos Abejas Cabezas de Organismos Molculas tomos Ncleos

alfiler unicelulares atmicos

Ondas de Radio: Parte visible del espectro:

0.5 mm < l < 500 m 0.4 mm < l < 0.7 mm
0.5 MHz < n < 500 GHz 430 THz < n < 750 THz
6 dcadas Media dcada
 El espectro electromagntico

Electrones de valencia

Cuanto ms elevada es la frecuencia, ms corta es la longitud de onda.

Los rayos X provocan la ionizacin de las molculas debido a su alta energa,
mientras que las microondas afectarn al movimiento rotacional de la molcula.
Los rayos de infrarrojos provocarn vibraciones moleculares.
 RADIACION EFECTO TCNICA INFORMACIN
ESPECTROSCPICA OBTENIDA

Transiciones de spn Resonancia Magntica Grupos funcionales,

Radio Frecuencias electrnico o nuclear en Nuclear subestructuras,
los tomos de la molcula conectividades,
estereoqumica, etc a
partir de datos de
desplazamiento qumico,
reas de los picos y
constantes de
acoplamiento observadas.
Microondas Transiciones de los
momentos magnticos de ESR Resonancia de spin
los elctrones. electrnico
Movimiento rotacional
Deformacin de los Grupos funcionales a
Infrarrojo enlaces qumicos. Infrarrojo partir de las absorciones
Vibracin de los enlaces observadas.

Transiciones electrnicas Existencia de cromforos

UV-Visible entre los orbtales Ultravioleta-Visible y/o conjugacin en la
atmicos y moleculares molcula a partir de las
absorciones observadas

Ionizaciones de las Estructura total de la

Rayos X y csmicos molculas Rayos X molcula incluida la
estereoqumica de la
misma a partir de las
posiciones relativas de
los tomos.
Caractersticas de los Mtodos Espectromtricos ms Importantes
 Vibraciones moleculares
Los enlaces covalentes vibran solo a ciertas frecuencias. Si el enlace se alarga, aparece una
fuerza restauradora que hace que los dos tomos tiendan a juntarse hasta su longitud de
enlace de equilibrio. Si el enlace se comprime, la fuerza restauradora hace que los tomos se
separen. Cuando el enlace se alarga o se comprime, y a continuacin se deja en libertad, los
tomos vibran

Las vibraciones moleculares dependen de las masas de los tomos. Los tomos
pesados vibran lentamente, por lo que tendrn una frecuencia ms baja que los
tomos ms ligeros. La frecuencia de una vibracin disminuye al aumentar la masa
atmica. La frecuencia tambin aumenta con la energa de enlace, por lo que un
doble enlace C=C tendr una frecuencia ms elevada que un enlace sencillo C-C.
Frecuencias de tensin de enlace.
 Modos de vibracin
Tensin y flexin de los enlaces.
Una molcula no lineal con n tomos tiene 3n - 6 modos de vibracin fundamental.

El agua tiene 3(3) - 6 = 3 modos. Dos modos son de tensin y uno de flexin.
Movimientos de Estiramiento de un grupo CH2

Simtrico Antisimtrico
Movimientos de deformacin. CH2

En el plano En el plano
Tijeras Balanceo
Movimientos de deformacin. CH2

Fuera del plano Fuera del plano

Torsin Torsin
 Frecuencia cm-1 Zonas del espectro

4500 2500 2000 1800 1650 1500 650

DEFORMACION
Huella

Dactilar
TENSION
Mayor energa

2,5 4 5 5,5 6,1 6,6 15

l en m
 Frecuencia cm-1 2.- Zonas del espectro

4500 2500 2000 1800 1650 1500 650

O-H CC C=C=C C=O C=N C-Cl

C-O
C=C
N-H CN Comb C-N
C-H X=C=Y Ar
C-C
(C,O,N,S)

2,5 4 5 5,5 6,1 6,6 15

l en m Mayor energa
 Diagrama de un espectrofotmetro infrarrojo.
Un espectrofotmetro infrarrojo mide la frecuencia de la luz infrarroja que son
absorbidas por un compuesto
 Espectro infrarrojo de alcano.

Un alcano mostrar frecuencias de tensin y flexin solamente para C-H y C-C. La

tensin C-H es una banda ancha entre 2800 y 3000 cm-1, una banda presente en
prcticamente todos los compuestos orgnicos. En este ejemplo, la importancia
recae en lo que no se ve, es decir, la ausencia de bandas indica la presencia en
ningn otro grupo funcional.
 Frecuencias de la tensin C-H
Los alcanos, alquenos y alquinos tambin tienen frecuencias de tensin C-H
caractersticas. Los enlaces carbono-hidrgeno que tienen tomos de carbono con
hibridacin sp3 generalmente absorben a frecuencias justo por debajo de (a la
derecha de) 3000 cm-1, mientras que los que tienen tomos de carbono con
hibridacin sp2 absorben justo por encima de (a la izquierda de) 3000 cm-1.

Un porcentaje mayor del carcter s en los orbitales hbridos har que el enlace C-C
sea ms fuerte. El enlace C-H de un tomo de carbono con hibridacin sp3 ser
ligeramente ms dbil que el enlace C-H de un tomo de carbono con hibridacin
sp2 o sp.
 Espectro infrarrojo de alqueno.

Las absorciones ms importantes del espectro del 1-hexeno son los estiramientos
C=C a 1642 cm-1 y =C-H a 3080 cm-1.
 Espectro infrarrojo de alquinos.

Los alquinos terminales tienen una tensin C-H (alquinilo) caracterstica a alrededor de
3300 cm-1 y una tensin de triple enlace C-C a aproximadamente 2100 - 2200 cm-1.
Los alquinos internos no pueden mostrar la tensin C-H acetilnica. El momento
dipolar pequeo del triple enlace disustituido limita la tensin y hace que el triple
enlace C-C no sea visible
 Espectro de IR de los alcoholes.

El alcohol O-H absorbe alrededor de 3300 cm-1 y normalmente tiene una banda
ancha y fuerte. Esta banda se debe a los distintos reordenamientos del enlace de
hidrgeno que tienen lugar. La forma ancha se debe a la naturaleza diversa de las
interacciones de los enlaces de hidrgeno de las molculas de alcohol. Existe una
banda de tensin C-O centrada prxima a 1050 cm-1.
 Espectro de IR de las aminas.

Los enlaces de hidrgeno que se forman entre el nitrgeno y el hidrgeno son ms

dbiles que aquellos que se forman con el oxgeno y el hidrgeno. Las aminas, como
los alcoholes, tendrn una banda ancha centrada alrededor de 3300 cm-1, pero no
tan fuerte. Podran existir picos agudos superpuestos en la zona de absorcin de
tensin dependiendo del nmero de hidrgenos que el nitrgeno tenga; una amina
secundaria tendr un pico agudo, mientras que una amina primaria tendr dos picos
agudos. Las aminas terciarias no mostrarn picos agudos porque no hay un enlace
N-H.
 Cetonas, aldehdos y cidos.
Las vibraciones de tensin C=O de las cetonas, aldehdos y cidos carboxlicos
sencillos se producen a frecuencias de aproximadamente 1710 cm-1. Estas
frecuencias son ms altas que las de los dobles enlaces C=C, debido a que el doble
enlace C=O es ms fuerte y ms rgido.

La tensin C=O es fuerte e inconfundible. Dependiendo de qu ms est unido al

carbonilo, existen otras bandas que se pueden buscar para diferenciar entre
aldehdos, cetonas y cidos.
 IR de los compuestos cetona.

El espectro de la 2-heptanona muestra una absorcin fuerte a 1718 cm-1.

 IR de los compuestos aldehido.

El aldehdo tiene la tensin C=O a 1720 cm-1, pero tambin tiene dos bandas
de tensin distintas para el enlace C-H del aldehdo a 2720 y 2820 cm-1
 IR de los cidos carboxlicos.

Los cidos carboxlicos presentan una absorcin O-H ancha entre 2500 y 3500 cm-1.
Esta absorcin ancha ocupa por completo la regin de tensin C-H, con ms
amplitud. La tensin del doble enlace C=O ser aguda e intensa a 1711 cm-1. Los dos
picos tienen que estar presentes para identificar al compuesto como un cido
carboxlico
 Frecuencias de los compuestos carbonilo
conjugados.
La deslocalizacin de los electrones pi reduce la densidad electrnica de los dobles enlaces de
los grupos carbonilo, debilitndolos y disminuyendo la frecuencia de tensin de las cetonas,
aldehdos y cidos conjugados desde 1710 cm-1 a 1685 cm-1.

La tensin del doble enlace C=C puede que no sea clara en el espectro IR porque es mucho
ms dbil que la absorcin C=O. La presencia del doble enlace C=C se suele deducir por su
efecto en la frecuencia del grupo C=O y por la presencia de absorciones del tipo =C-H por
encima de 3000 cm-1.
 IR de los nitrilos

Un triple enlace carbono-nitrgeno tiene una absorcin intensa y aguda centrada

alrededor de 2200 a 2300 cm-1. Los enlaces nitrilo son ms polares que los triples
enlaces carbono-carbono, por lo que los nitrilos producen absorciones ms fuertes
que los alquinos.
 Resumen de las frecuencias de tensin en el IR.
El espectro IR tiene distintas regiones. La parte izquierda del espectro muestra las
tensiones C-H, O-H y N-H. Los enlaces triples absorben alrededor de 2200 cm-1
seguidos por los enlaces dobles hacia la derecha a alrededor de 1700 cm-1. La regin
por debajo de 1400 cm-1 se denomina regin de huella dactilar.
 Diagrama de un espectrmetro de
masas.
Un flujo de electrones hace que las molculas se ionicen y se fragmenten. La mezcla
de iones es acelerada y pasa a travs de un campo magntico, donde las trayectorias
de los iones ms ligeros se desvan ms que las trayectorias de los iones ms
pesados. Variando el campo magntico, el espectrmetro permite registrar la
abundancia de iones de cada masa.

El radio de curvatura exacto de la trayectoria de un in depende de la relacin masa-

carga, simbolizada por m/z. En esta expresin, m es la masa del in (en uma:
unidades de masa atmica) y z es su carga. La mayora de los iones tiene una carga
de +1, por lo que su desviacin tendr un radio de curvatura que depender slo de
la masa.
 Espectro de masas del 2,4-
dimetilpentano
En el espectro, al pico ms alto se le denomina pico base y se le asigna una
abundancia del 100%. La abundancia de los dems picos se da como porcentaje
con relacin al pico base. El in molecular (M+) corresponde a la masa de la
primera molcula
 Cromatografa de gases: espectrmetro de masas (CG-EM).

La columna del cromatgrafo de gases separa la mezcla en sus componentes. El

espectrmetro de masas cuadrupolar explora el espectro de masas de los
componentes a medida que abandonan la columna.

A medida que la muestra pasa a travs de la columna, los componentes ms

voltiles se mueven a travs de la columna ms rpidamente que los componentes
ms voltiles. Los componentes separados dejan la columna en distintos
momentos, pasando a travs de la lnea de transferencia hacia la fuente de iones del
espectrmetro de masas, donde las molculas se ionizan y pueden fragmentarse
 Espectro de masas del 2-metilpentano
El pico base corresponde a la prdida de un radical propilo para dar lugar a un
catin isopropilo.

La fragmentacin de un alcano ramificado se produce frecuentemente en la

rama del tomo de carbono que da lugar al catin y al radical ms sustituidos
 Espectro de masas del 2-hexeno.
El catin-radical del 2-hexeno se rompe por un enlace allico para dar lugar a un
catin metil-allico estabilizado por resonancia, m/z = 55.
 Espectro de masas del 3-metil-1-butanol.
El pico intenso a m/z = 70 es el pico M - 18, correspondiente a la prdida de agua.
El in molecular no es visible porque pierde agua muy fcilmente
 Efecto isotpico del cloro
El espectro de MS del 2-cloropropano. Los elementos ms pesados no estn
formados por un solo istopo, sino que contienen istopos ms pesados en
cantidades variables. Los istopos ms pesados dan lugar a picos pequeos a
nmeros de masa superiores a los del pico del in molecular M+.

La altura de los picos M+, M + 1 y M + 2 depender de la composicin isotpica del

elemento en cuestin.
El cloro es una mezcla del 35Cl con un 75,5 % y del 37Cl con un 24,5 % . El pico del
in molecular M+ tiene 35Cl siendo tres veces ms elevado que el pico M + 2, el cual
tiene 37Cl.
 Efecto isotpico del bromo.
Observe que los picos M+ y M + 2 tienen aproximadamente la mima altura.

El bromo es una mezcla del 79Br con un 50,5 por ciento y del 81Br con un 49,5 por
ciento . El pico del in molecular M+ tiene 79Br siendo tan alto como el pico M + 2,
el cual tiene 81Br.