Anda di halaman 1dari 5

Arah Replikasi

Dalam sintesis DNA, nukleotida baru bergabung satu per satu

ke 3? akhir untai baru disintesis. polimerase DNA,

enzim yang mensintesis DNA, dapat menambahkan

nukleotida hanya untuk 3? akhir untai tumbuh (tidak

5? end), untaian DNA sehingga baru selalu memanjang di

sama 5? -untuk-3? arah (5: 3?). Karena dua singlestranded

template DNA yang antiparalel dan untai elongasi

selalu 5: 3 ?, jika sintesis dari hasil satu template

dari, katakanlah, kanan ke kiri, maka sintesis pada template lain

harus melanjutkan ke arah yang berlawanan, dari kiri ke kanan

(GAMBAR 12.8). Seperti DNA unwinds selama replikasi,

Sifat antiparalel dari dua untai DNA berarti yang

Template terkena di 5: 3? arah dan lainnya

Template terkena dalam 3: 5? arah (lihat Gambar

12,8); jadi bagaimana bisa sintesis berlangsung secara bersamaan pada

kedua untai di pertigaan?

Sebagai DNA terurai, untai template yang terkena

dalam 3: 5? arah (untai rendah pada Gambar 12.8 dan

12,9) memungkinkan untai baru yang akan disintesis terus menerus,

di 5: 3? arah. untai baru ini, yang mengalami

replikasi terus menerus, disebut terkemuka untai.

Untai cetakan lainnya terkena di 5: 3?

arah (untai atas dalam Angka 12,8 dan 12,9). Setelah panjang pendek DNA telah dibatalkan, sintesis

harus melanjutkan 5: 3 ?; yaitu, dalam arah yang berlawanan yang

unwinding (GAMBAR 12,9). Karena hanya panjang pendek

DNA harus dibatalkan sebelum sintesis di ini

strand akan dimulai, mesin replikasi segera habis

template. Pada saat itu, lebih DNA telah membatalkan, menyediakan

template baru di 5? akhir untai baru. sintesis DNA

harus memulai lagi di garpu replikasi dan melanjutkan


arah yang berlawanan bahwa gerakan garpu

sampai berjalan ke segmen yang sebelumnya direplikasi DNA.

Proses ini diulang lagi dan lagi, sehingga sintesis ini

untai pendek, semburan terputus. Yang baru dibuat

strand yang mengalami replikasi terputus-putus disebut

untai tertinggal.

Panjang pendek DNA yang dihasilkan oleh diskontinyu

replikasi untai lagging disebut fragmen Okazaki,

setelah Reiji Okazaki, yang menemukan mereka. dalam bakteri

sel, setiap fragmen Okazaki berkisar panjang dari sekitar

1000-2000 nukleotida; dalam sel eukariotik, mereka adalah tentang

100 sampai 200 nukleotida panjang. fragmen Okazaki pada

untai tertinggal dihubungkan bersama untuk menciptakan terus menerus

molekul DNA baru.

Mari kita berhubungan arah sintesis DNA ke mode

replikasi diperiksa sebelumnya. Dalam model theta

(GAMBAR 12.10a), DNA unwinds di satu lokasi tertentu,

asal, dan gelembung replikasi terbentuk. Jika

bubble memiliki dua garpu, satu di setiap akhir, sintesis berlangsung

secara bersamaan di kedua garpu (replikasi dua arah). Di

masing-masing garpu, sintesis pada salah satu template helai hasil

dalam arah yang sama seperti yang dari unwinding; baru direplikasi

untai untai terkemuka dengan replikasi terus menerus.

Pada untai template lainnya, sintesis adalah melanjutkan

dalam arah yang berlawanan yang dari unwinding; ini baru disintesis

untai untai tertinggal dengan terputus-putus

replikasi. Fokus pada salah satu helai Template

dalam gelembung. Perhatikan bahwa sintesis pada template ini untai kontinu pada satu garpu tetapi
terputus-putus di

lain. Perbedaan ini timbul karena sintesis DNA adalah

selalu dalam arah yang sama (5:?? 3), tetapi dua garpu
bergerak dalam arah berlawanan.

Replikasi dalam model rolling-lingkaran (GAMBAR 12.10b)

agak berbeda, karena tidak ada replikasi gelembung. Replikasi dimulai pada 3? akhir nukleotida yang
rusak

untai. replikasi terus menerus berlangsung pada surat edaran

template sebagai nukleotida baru ditambahkan ke 3 ini? akhir.

Replikasi molekul linear DNA, seperti

yang ditemukan dalam sel eukariotik, menghasilkan serangkaian replikasi Replikasi dimulai pada 3?
akhir nukleotida yang rusak

untai. replikasi terus menerus berlangsung pada surat edaran

template sebagai nukleotida baru ditambahkan ke 3 ini? akhir.

Replikasi molekul linear DNA, seperti

yang ditemukan dalam sel eukariotik, menghasilkan serangkaian gelembung replika-tion (GAMBAR
12.10c). sintesis DNA di ini

gelembung adalah sama seperti yang di replikasi gelembung tunggal

dari model theta; dimulai di pusat setiap replikasi

gelembung dan hasil di dua garpu, satu di setiap akhir dari

gelembung. Di kedua garpu, sintesis dari hasil untai terkemuka

dalam arah yang sama seperti yang unwinding, sedangkan

sintesis dari hasil untai tertinggal dalam arah

berlawanan dari unwinding.

Setelah DNA telah dibatalkan oleh helikase, yang singlestranded

rantai nukleotida memiliki kecenderungan untuk membentuk hidrogen

obligasi dan reanneal (tetap kembali bersama-sama). struktur sekunder,

seperti jepit rambut (lihat Gambar 8.21), juga dapat membentuk

antara nukleotida komplementer pada untai yang sama. Untuk

menstabilkan DNA untai tunggal cukup lama untuk replikasi

berlangsung, untai tunggal mengikat (SSB) protein melampirkan

erat DNA untai tunggal yang terkena (lihat Gambar 12.12).

Tidak seperti banyak protein DNA-binding, SSBs yang acuh tak acuh terhadap

urut-mereka dasar akan mengikat setiap DNA untai tunggal.


Untai tunggal mengikat protein membentuk tetramers (kelompok

empat) yang bersama-sama mencakup 35-65 nukleotida.

penting protein lain untuk proses unwinding adalah

enzim DNA girase, suatu topoisomerase. Seperti yang dibahas di

konsep

Semua sintesis DNA adalah 5: 3 ?, artinya baru

nukleotida selalu ditambahkan ke 3? akhir

tumbuh nukleotida untai. Pada setiap replikasi

garpu, sintesis dari hasil untai terkemuka

terus menerus dan yang dari untai lagging

hasil terputus-putus.

Mekanisme Replikasi

Replikasi berlangsung dalam empat tahap: inisiasi, unwinding,

elongasi, dan terminasi.

Bakteri Replikasi DNA

Berikut ini pembahasan proses replikasi akan

fokus pada sistem bakteri, di mana replikasi telah paling

diteliti secara mendalam dan dipahami. meskipun banyak

aspek replikasi dalam sel eukariotik adalah sama dengan yang

sel prokariotik, ada beberapa perbedaan penting.

Kami akan membandingkan bakteri dan replikasi eukariotik kemudian

dalam bab ini.

Inisiasi Kromosom melingkar dari E. coli memiliki satu

replikasi asal (oriC). Urutan minimal yang diperlukan

untuk oriC fungsi terdiri dari 245 bp yang berisi beberapa

situs penting. protein inisiator mengikat oriC dan penyebab

bagian pendek dari DNA untuk melepas lelah. unwinding ini memungkinkan

helikase dan lainnya untai tunggal mengikat protein untuk melampirkan

ke untai polinukleotida (GAMBAR 12,11).

Unwinding Karena sintesis DNA membutuhkan singlestranded a

Template dan DNA untai ganda harus


dibatalkan sebelum sintesis DNA dapat berlangsung, sel

bergantung pada beberapa protein dan enzim untuk mencapai

unwinding. helicases DNA mematahkan ikatan hidrogen

yang ada antara basis dua helai nukleotida

dari molekul DNA. Helicases tidak dapat memulai unwinding

DNA untai ganda; protein inisiator

DNA terpisah pertama helai di asal, menyediakan

bentangan pendek DNA untai tunggal yang satu helikase

mengikat. Helicases mengikat template lagging-strand di

masing-masing garpu replikasi dan bergerak dalam 5: 3? arah

bersama alur ini, dengan demikian juga bergerak garpu replikasi