ACIDOS NUCLEICOS

DEFINICION Y CLASIFICACION

Los cidos Nucleicos son las biomolculas portadoras de la informacin gentica. Son
biopolmeros, de elevado peso molecular, formados por otras subunidades estructurales o
monmeros, denominados Nucletidos. Desde el punto de vista qumico, los cidos nucleicos son
macromolculas formadas por polmeros lineales de nucletidos, unidos por enlaces ster de
fosfato, sin periodicidad aparente. De acuerdo a la composicin qumica, los cidos nucleicos se
clasifican en cidos Desoxirribonucleicos (ADN) que se encuentran residiendo en el ncleo celular
y algunos organelos, y en cidos Ribonucleicos (ARN) que actan en el citoplasma. Los cidos
nucleicos estn formados por largas cadenas de nucletidos, enlazados entre s por el grupo
fosfato. El grado de polimerizacin puede llegar a ser altsimo, siendo las molculas ms grandes
que se conocen, con molculas constitudas por centenares de millones de nucletidos en una sola
estructura covalente. De la misma manera que las protenas son polmeros lineales aperidicos de
aminocidos, los cidos nucleicos lo son de nucletidos. La aperiodicidad de la secuencia de
nucletidos implica la existencia de informacin. De hecho, sabemos que los cidos nucleicos
constituyen el depsito de informacin de todas las secuencias de aminocidos de todas las
protenas de la clula. Existe una correlacin entre ambas secuencias, lo que se expresa diciendo
que cidos nucleicos y protenas son colineares; la descripcin de esta correlacin es lo que
llamamos Cdigo Gentico, establecido de forma que a una secuencia de tres nucletidos en un
cido nucleico corresponde un aminocido en una protena.

Son las molculas que tienen la informacin gentica de los organismos y son las responsables de
su transmisin hereditaria. El conocimiento de la estructura de los cidos nucleicos permiti la
elucidacin del cdigo gentico, la determinacin del mecanismo y control de la sntesis de las
protenas y el mecanismo de transmisin de la informacin gentica de la clula madre a las
clulas hijas. Existen dos tipos de cidos nucleicos, ADN y ARN, que se diferencian por el azcar
(Pentosa) que llevan: desoxirribosa y ribosa, respectivamente. Adems se diferencian por las bases
nitrogenadas que contienen, Adenina, Guanina, Citosina y Timina, en el ADN; y Adenina, Guanina,
Citosina y Uracilo en el ARN. Una ltima diferencia est en la estructura de las cadenas, en el ADN
ser una cadena doble y en el ARN es una cadena sencilla.

BASES PRICAS Y PIRIMIDNICAS

Definicin Las Bases Nitrogenadas son las que contienen la informacin gentica. En el caso del
ADN las bases son dos Purinas y dos Pirimidinas. Las purinas son A (Adenina) y G (Guanina). Las
pirimidinas son T (Timina) y C (Citosina). En el caso del ARN tambin son cuatro bases, dos purinas
y dos pirimidinas. Las purinas son A y G y las pirimidinas son C y U (Uracilo). Como son aromticas,
tanto las bases pricas como las pirimidnicas son planas, lo cual es importante en la estructura de
los cidos nucleicos. Tambin son insolubles en agua y pueden establecer interacciones hidrfobas
entre ellas; estas interacciones sirven para estabilizar la estructura tridimensional de los cidos
nucleicos. Las bases nitrogenadas absorben luz en el rango ultravioleta (250-280 nm), propiedad
que se usa para su estudio y cuantificacin.
Bases pricas

Estn basadas en el Anillo Purnico. Puede observarse que se trata de un sistema plano de nueve
tomos, cinco carbonos y cuatro nitrgenos. En esta imagen puede observarse como se forman
Adenina y Guanina a partir de una Purina. El anillo purnico puede considerarse como la fusin de
un anillo pirimidnico con uno imidazlico. En el siguiente cuadro se muestran los nombres de las
principales purinas: Purinas Nombre comn Nombre sistemtico Adenina 6-amino purina Guanina
2-amino 6-oxo purina Las purinas que comnmente encontramos en el ADN y ARN son Adenina y
Guanina. La forma degradativa final de las purinas en los primates es el cido rico, 2,6,8-trioxo
purina.

Bases pirimidnicas

Estn basadas en el Anillo Pirimidnico. Es un sistema plano de seis tomos, cuatro carbonos y dos
nitrgenos. En esta imagen puede observarse como derivan Citosina, Timina y Uracilo de
Pirimidina. Las distintas bases pirimidnicas se obtienen por sustitucin de este anillo con grupos
oxo (=O), grupos amino (-NH2) o grupos metilo (-CH3). - 4 - En el siguiente cuadro se muestran los
nombres de las principales pirimidinas: Pirimidinas Nombre comn Nombre sistemtico Citosina 2-
oxo 4-amino pirimidina Uracilo 2,4 dioxo pirimidina Timina 2,4 dioxo5-metil pirimidina Las
pirimidinas que encontramos en el ADN son Citosina y Timina. En el ARN encontramos Citosina y
Uracilo. Las pirimidinas son degradadas completamente a agua, anhdrido carbnico y urea.

Bases modificadas

Adems de las purinas y pirimidinas de las que hemos hablado anteriormente, es frecuente
encontrar Bases Modificadas. Entre las ms abundantes encontramos: la 5-metilcitosina, la 5-
hidroximetilcitosina y la 6-Metiladenina que se han relacionado con la regulacin de la expresin
del DNA la 7-metilguanina y el dihidrouracilo que forman parte de la estructura de los RNA
Hipoxantina y Xantina como intermediarios metablicos y productos de reaccin del DNA con
sustancias mutagnicas.

NUCLESIDOS Y NUCLETIDOS

Nuclesidos

La unin de una base nitrogenada a una pentosa da lugar a los compuestos llamados Nuclesidos.
La unin base-pentosa se efecta a travs de un enlace glicosdico, con configuracin beta ()
entre el carbono uno de ribosa o desoxirribosa, y un nitrgeno de las base, el 1 en las pirimidinas,
y el 9 en las purinas, con la prdida de una molcula de agua. Para evitar confusiones en la
nomenclatura de nuclesidos y nucletidos, los tomos de la pentosa se designan con nmeros
seguidos de un apstrofe (1', 2', 3', 4' y 5'), para distinguirlos de los de la base, por lo que los
enlaces de los nuclesidos se designan como (1-1) en las pirimidinas y (1-9) en las purinas. La
pentosa puede ser DRibosa (D-ribofuranosa), en cuyo caso hablamos de Ribonuclesidos, o bien 2-
DDesoxirribosa (Ddesoxirribofuranosa), constituyendo los Desoxirribonuclesidos. - 6 - Los
nuclesidos son ms solubles que las bases libres y los planos de la base y el azcar son
perpendiculares entre si. Como el enlace glicosdico es sencillo, las bases pueden presentar dos
conformaciones diferentes: anti cuando el plano de la base est alejada del plano de la pentosa
syn cuando las bases estn sobre el plano de la pentosa Los nuclesidos pricos pueden
presentar ambas conformaciones, aunque la anti es ms estable; los pirimidnicos slo pueden
existir en anti, porque el Oxgeno en el carbono 2 no permite que se forme la syn. Veremos en la
siguiente tabla las estructuras de los distintos Ribonuclesidos. Obsrvese la nomenclatura: se
utiliza el sufijo -osina sobre el nombre radical de la base en el caso de las Purinas, y el sufijo -idina
en el de las Pirimidinas. El Ribonuclesido de Timina recibe el nombre de Ribotimidina. Por su
parte, el Ribonuclesido de Hipoxantina recibe el nombre de Inosina. Por su parte, los
Desoxinuclesidos se denominan con el prefijo desoxidelante del nombre del nuclesido. Se
excepta el Desoxirribonuclesido de Timina, que recibe el nombre de Timidina.
RIBONUCLESIDOS Base Nuclesido Pirimidinas Citosina Citidina Uracilo Uridina Timina
Ribotimidina Purinas Adenina Adenosina Guanina Guanosina Hipoxantina Inosina
DESOXIRRIBONUCLETIDOS Base Nuclesido Pirimidinas Citosina Desoxicitidina Uracilo
Desoxiuridina Timina Timidina Purinas Adenina Desoxiadenosina Guanina Desoxiguanosina - 7

Nuclesidos modificados

En los tRNA existen en forma caracterstica, nuclesidos modificados como la Seudouridina,

formada por Uracilo y Ribosa unidos a travs de un enlace (1- 5). Tambin se encuentra un
nuclesido de Timina y Ribosa, la Ribotimidina. Otro nuclesido presente en el tRNA es la
Dihidrouridina, formado por Ribosa y Dihidrouracilo unidos por enlace (1-1). En el metabolismo
de las bases pricas se forma un nuclesido con Hipoxantina y Ribosa llamado Inosina.

Nucletidos

Los nucletidos son los steres fosfricos de los nuclesidos. Estn formados por la unin de un
grupo fosfato al carbono 5 de una pentosa. A su vez la pentosa lleva unida al carbono 1 una base
nitrogenada. - 8 - Se forman cuando se une cido fosfrico a un nuclesido en forma de in fosfato
(PO43-) mediante un enlace ster en alguno de los grupos -OH del monosacrido. El enlace ster
se produce entre el grupo alcohol del carbono 5 de la pentosa y el cido fosfrico. Aunque la
ribosa tiene tres posiciones en las que se puede unir el fosfato (2, 3 y 5), y en la desoxirribosa
dos (3 y 5), los nucletidos naturales ms abundantes son los que tienen fosfato en la posicin 5.
Nucletidos con fosfato en 3 aparecen en la degradacin de los cidos nucleicos. Se nombra como
el nuclesido del que proceden eliminando la a final y aadiendo la terminacin 5-fosfato, o bien
monofosfato; por ejemplo, adenosn-5-fosfato o adenosn-5-monofosfato (AMP). Los nucletidos
pueden formarse con cualquier nuclesido, con una nomenclatura idntica. Veamos a
continuacin, a modo de ejemplo, los nucletidos de Adenosina: Adenosina Monofosfatos
Nombre sistemtico Abreviatura Adenosina-5'-monofosfato 5'-AMP, AMP Adenosina-3'-
monofosfato 3'-AMP Adenosina-2'-monofosfato 2'-AMP Adenosina Polifosfatos Nombre
sistemtico Abreviatura Adenosina-5'-monofosfato AMP Adenosina-5'-difosfato ADP Adenosina-
5'-trifosfato ATP Molcula de ATP (adenosn trifosfato): Es el portador primario de energa de la
clula. La mayora de las reacciones metablicas que requieren energa estn acopladas a la
hidrlisis de ATP. El fosfato puede aparecer esterificado a dos grupos simultneamente. Tal es el
caso de los llamados Nucletidos Cclicos. Veamos como ejemplo el Adenosina-3',5'-monofosfato
cclico (cAMP), en el cual el fosfato esterifica simultneamente a los hidroxilos 3' y 5'. - 9 - En lo
que se refiere a los desoxinucletidos, la diferencia es que no pueden formarse en el carbono 2'
por razones obvias (no hay grupo -OH) por lo que slo puede haber 3' y 5'-desoxinucletidos.
Veremos a ttulo de ejemplo los nucletidos de las cuatro bases que forman parte del DNA:
Desoxinucletidos Nombre sistemtico Abreviatura Desoxiadenosina-5'-monofosfato dAMP
Desoxiguanosina-5'-monofosfato dGMP Desoxicitidina-5'-monofosfato dCMP Timidina-5'-
monofosfato TMP Adems de formar la estructura de los cidos nucleicos los nucletidos tienen
otras funciones relevantes: 1. El nuclesido Adenosina tiene funciones de neurotransmisor. 2. ATP
es la molcula universal para transferencia de energa; 3. UDP y el CDP sirven como
transportadores en el metabolismo de glcidos, lpidos y otras molculas; 4. AMPc, GMPc y el
propio ATP cumplen funciones reguladoras; 5. AMP forma parte de la estructura de coenzimas
como FAD, NAD+, NADP+ y CoA. Aparte de su carcter como monmeros de cidos nucleicos, la
estructura de nucletido est generalizada entre las biomolculas, y particularmente como
coenzimas. Entre las ms representativas podemos nombrar: Niacina adenina dinucletido
(forma reducida, NADH). Flavina Adenina dinucletido (FAD). Coenzima A (forma acetilada,
Acetil-CoA). Uridina difosfato glucosa (UDPG).

El ADN

cido Desoxirribonucleico (ADN), material gentico de todos los organismos celulares y casi todos
los virus. Es el tipo de molcula ms compleja que se conoce. Su secuencia de nucletidos
contiene la informacin necesaria para poder controlar el metabolismo un ser vivo. El ADN lleva la
informacin necesaria para dirigir la sntesis de protenas y la replicacin. En casi todos los
organismos celulares el ADN est organizado en forma de cromosomas, situados en el ncleo de la
clula. Est formado por la unin de muchos desoxirribonucletidos. La mayora de las molculas
de ADN poseen dos cadenas antiparalelas (una 5-3 y la otra 3-5) unidas entre s mediante las
bases nitrogenadas, por medio de puentes de hidrgeno. La adenina enlaza con la timina,
mediante dos puentes de hidrgeno, mientras que la citosina enlaza con la guanina, mediante tres
puentes de hidrgeno. El estudio de su estructura se puede hacer a varios niveles, apareciendo
estructuras, primaria, secundaria, terciaria, cuaternaria y niveles de empaquetamiento superiores.
- 11 - Estructura Primaria Se trata de la secuencia de desoxirribonucletidos de una de las cadenas.
La informacin gentica est contenida en el orden exacto de los nucletidos. Las bases
nitrogenadas que se hallan formando los nucletidos de ADN son Adenina, Guanina, Citosina y
Timina. Los nucletidos se unen entre s mediante el grupo fosfato del segundo nucletido, que
sirve de puente de unin entre el carbono 5' del primer nucletido y el carbono 3' de siguiente
nucletido. Como el primer nucletido tiene libre el carbono 5' y el siguiente nucletido tiene libre
el carbono 3', se dice que la secuencia de nucletidos se ordena desde 5' a 3' (5' 3'). Estructura
Secundaria Es una estructura en doble hlice. Permite explicar el almacenamiento de la
informacin gentica y el mecanismo de duplicacin del ADN. Fue postulada por James Watson y
Francis Crick. Es una cadena doble, dextrgira o levgira, segn el tipo de ADN. Ambas cadenas
son complementarias, pues la adenina de una se une a la timina de la otra, y la guanina de una a la
citosina de la otra. Estas bases enfrentadas son las que constituyen los Puentes de Hidrgeno.
Adenina forma dos puentes de hidrgeno con Timina. Guanina forma tres puentes de hidrgeno
con Citosina. Ambas cadenas son antiparalelas, pues el extremo 3 de una se enfrenta al extremo
5 de la otra. Las dos hebras estn enrolladas en torno a un eje imaginario, que gira en contra del
sentido de las agujas de un reloj. Las vueltas de estas hlices se estabilizan mediante puentes de
hidrgeno. Esta estructura permite que las hebras que se formen por duplicacin de ADN sean
copia complementaria de cada una de las hebras existentes. - 12 - Existen tres modelos de ADN:
ADN-B: ADN en disolucin, 92% de humedad relativa, se encuentra en soluciones con baja fuerza
inica se corresponde con el modelo de la Doble Hlice. Es el ms abundante y es el descubierto
por Watson y Crick. ADN-A: ADN con 75% de humedad, requiere Na, K o Cs como contraiones,
presenta 11 pares de bases por giro completo y 23 de dimetro. Es interesante por presentar
una estructura parecida a la de los hbridos ADN-ARN y a las regiones de autoapareamiento ARN-
ARN. ADN-Z: doble hlice sinistrorsa (enrollamiento a izquierdas), 12 pares de bases por giro
completo, 18 de dimetro, se observa en segmentos de ADN con secuencia alternante de bases
pricas y pirimidnicas (GCGCGC), debido a la conformacin alternante de los residuos azcar-
fosfato sigue un curso en zig-zag. Estructura terciaria El ADN presenta una estructura terciaria, que
consiste en que la fibra de 20 se halla retorcida sobre s misma, formando una especie de super-
hlice. Esta disposicin se denomina ADN Superenrollado, y se debe a la accin de enzimas
denominadas Topoisomerasas-II. Este enrollamiento da estabilidad a la molcula y reduce su
longitud. Vara segn se trate de organismos procariontes o eucariontes: a) En procariontes se
pliega como una super-hlice en forma, generalmente, circular y asociada a una pequea cantidad
de protenas. Lo mismo ocurre en la mitocondrias y en los plastos. - 13 - b) En eucariontes el
empaquetamiento ha de ser ms complejo y compacto y para esto necesita la presencia de
protenas, como son las histonas y otras de naturaleza no histona (en los espermatozoides las
protenas son las protamnas). A esta unin de ADN y protenas se conoce como Cromatina, en la
cual se distinguen diferentes niveles de organizacin: - Nucleosoma - Collar de perlas - Fibra
cromatnica - Bucles radiales - Cromosoma. El ADN es una molcula muy larga en algunas especies
y, sin embargo, en las clulas eucariotas se encuentra alojado dentro del minsculo ncleo.
Cuando el ADN se une a protenas bsicas, la estructura se compacta mucho. Las protenas bsicas
son Histonas o Protamnas. La unin con Histonas genera la estructura denominada Nucleosoma.
Cada nucleosoma est compuesto por una estructura voluminosa, denominada Core, seguida por
un eslabn o "Linker". El core est compuesto por un octmero de protenas, Histonas,
denominadas H2A, H2B, H3 y H4. Cada tipo de histona se presenta en nmero par. Esta estructura
est rodeada por un tramo de ADN que da una vuelta y 3/4 en torno al octmero. El Linker est
formado por un tramo de ADN que une un nucleosoma con otro y una histona H1. El conjunto de
la estructura se denomina Fibra de Cromatina de 100. Tiene un aspecto repetitivo en forma de
collar de perlas, donde las perlas seran los nucleosomas, unidos por los linker. Estructura
cuaternaria La cromatina en el ncleo tiene un grosor de 300. La fibra de cromatina de 100 se
empaqueta formando una fibra de cromatina de 300. El enrollamiento que sufre el conjunto de
nucleosomas recibe el nombre de Solenoide. Los solenoides se enrollan formando la cromatina del
ncleo interfsico de la clula eucariota. Cuando la clula entra en divisin, el ADN se compacta
ms, formando los cromosomas.

ESTRUCTURA DEL ARN

El ARN

El cido Ribonucleico se forma por la polimerizacin de ribonucletidos, los cuales se unen entre
ellos mediante enlaces fosfodister en sentido 5-3 (igual que en el ADN). Estos a su vez se forman
por la unin de un grupo fosfato, una ribosa (una aldopentosa cclica) y una base nitrogenada
unida al carbono 1 de la ribosa, que puede ser citosina, guanina, adenina y uracilo. Esta ltima es
una base similar a la timina. En general los ribonucletidos se unen entre s, formando una cadena
simple, excepto en algunos virus, donde se encuentran formando cadenas dobles. Un gen est
compuesto, como hemos visto, por una secuencia lineal de nucletidos en el ADN, dicha secuencia
determina el orden de los aminocidos en las protenas. Sin embargo el ADN no proporciona
directamente de inmediato la informacin para el ordenamiento de los aminocidos y su
polimerizacin, sino que lo hace a travs de otras molculas, los ARN. Se conocen tres tipos
principales de ARN y todos ellos participan de una u otra manera en la sntesis de las protenas.
Ellos son: El ARN mensajero (ARNm), el ARN ribosomal (ARNr) y el ARN de transferencia (ARNt).
ARN mensajero (ARNm) Consiste en una molcula lineal de nucletidos (monocatenaria), cuya
secuencia de bases es complementaria a una porcin de la secuencia de bases del ADN. El ARNm
dicta con exactitud la secuencia de aminocidos en una cadena polipeptdica en particular. Las
instrucciones residen en tripletes de bases a las que llamamos Codones. ARN ribosomal (ARNr)
Este tipo de ARN una vez trascrito, pasa al nucleolo donde se une a protenas. De esta manera se
forman las subunidades de los ribosomas. ARN de transferencia (ARNt) Este es el ms pequeo de
todos, tiene aproximadamente 75 nucletidos en su cadena, adems se pliega adquiriendo lo que
se conoce con forma de hoja de trbol plegada. El ARNt se encarga de transportar los aminocidos
libres del citoplasma al lugar de sntesis proteica. En su estructura presenta un triplete de bases
complementario de un codn determinado, lo que permitir al ARNt reconocerlo con exactitud y
dejar el aminocido en el sitio correcto. A este triplete lo llamamos Anticodn. - 15 - Estructura
primaria Al igual que el ADN, se refiere a la secuencia de las bases nitrogenadas que constituyen
sus nucletidos. La estructura primaria del ARN es similar a la del ADN, excepto por la sustitucin
de desoxirribosa por ribosa y de timina por uracilo. La molcula de ARN est formada, adems por
una sola cadena. Estructura secundaria La cadena simple de ARN puede plegarse y presentar
regiones con bases apareadas, de este modo se forman estructuras secundarias del ARN, que
tienen muchas veces importancia funcional, como por ejemplo en los ARNt (ARN de transferencia).
Aunque existan zonas apareadas, los extremos 5 y 3 que marcan el inicio y el final de la molcula
permanecern libres. Estructura terciaria Es un plegamiento complicado sobre la estructura
secundaria adquiriendo una forma tridimensional.

http://www.uv.es/tunon/pdf_doc/AcidosNucleicos_veronica.pdf