Lilis Eka Herdiana (150351604962/B)

Tugas 1 Biokimia
1. Definisikan istilah-istilah berikut, dengan contohnya masing-masing:
a. Biokimia adalah ilmu pengetahuan tentang dasar kimiawi kehidupan atau Sains
Biologi, yang memanfaatkan Hukum-hukum Fisika dan Kimia untuk menjelaskan
proses kehidupan.
Contoh : mempelajari struktur protein, mempelajari metabolisme karbohidrat.
b. Reaksi biokimia adalah reaksi yang dikendalikan oleh enzim dan berlangsung
baik di dalam maupun di luar tubuh organisme
Contoh : Glikolisis. Proses glikolisis merupakan upaya untuk mengubah glukosa
yang ada dalam tubuh guna menghasilkan asam piruvat, lokasinya sendiri berada
di dalam bagian sel yang bernama sitoplasma.
c. Biomolekul : merupakan senyawa-senyawa organik sederhana pembentuk
organisme hidup dan bersifat khas sebagai produk aktivitas biologis. Biomolekul
dapat dipandang sebagai turunan hidrokarbon, yaitu senyawa karbon dan hidrogen
yang mempunyai kerangka dasar yang tersusun dari atom karbon, yang disatukan
oleh ikatan kovalen.
Contoh : Karbohidrat. Karbohidrat adalah sumber energi utama dalam sebagian
besar makanan manusia. Karbohidrat adalah polihidroksil-aldehida atau
polihidroksil-keton, atau senyawa yang menghasilkan senyawa-senyawa ini bila
dihidrolisis. Karbohidrat mengandung gugus fungsi karbonil (sebagai aldehida
atau keton) dan banyak gugus hidroksil.
d. Metabolisme : metabolisme dapat diartikan sebagai proses perubahan kimiawi
yang berlangsung di dalam tubuh makhluk hidup beserta perubahan energi yang
menyertainya.
Contoh :
- Katabolisme adalah proses penguraian atau pemecahan molekul-molekul
kompleks menjadi molekul sederhana dengan tujuan untuk melepaskan
energi, proses ini disebut juga dengan proses eksergonik karena membebaskan
energi melalui perombakan nutrien atau molekul kompleks. Salah satu contoh
 proses katabolisme yang terjadi apda semua makhluk hidup adalah proses
respirasi seluler
- Anabolisme adalah proses penyusunan molekul-molekul besar atau kompleks
melalui proses sintetis molekul-molekul yang lebih kecil atau sederhana. Atau
bisa juga dikatakan dari senyawa anorganik menjadi senyawa organik yang
lebih komplek. Proses yang terjadi pada anabolisme disebut juga dengan
proses endergonik karena menggunakan energi untuk proses sintetis molekul-
molekul kecil menjadi molekul kompleks. Salah satu contoh dari anabolisme
adalah proses fotosintesis.
2. Apakah bedanya, antara:
a. Benda hidup dan benda mati menurut biokimia

Parameter Benda hidup Benda mati

Bentuk dan memiliki rupa, bentuk, dan ciri-
ukuran ciri yang sama pula. Misalnya,
manusia mempunyai bentuk dan
ukuran serta ciri-ciri fisik yang
absolut, seperti harus ada kepala
walaupun tergolong satu jenis,
bentuk dan ukuran yang
dimiliki sangat bervariasi,
misalnya kursi.Ada kursi yang
berbentuk persegi, ada kursi
bulat.

Komposisi kimia tersusun dari substansi hidup
yang terdiri molekul-molekul
organik yang majemuk, sering
dengan berat molekul besar
(lebih dari 2000).
Organisasi tersusun dari sel-sel
mikroskopik dan majemuk dan
dapat menyusun kembali unsur-
unsur kimia sesuai dengan
kebutuhannya.
terdiri dari unsur-unsur kimia
yang sama seperti unsur-unsur
yang menyusun benda hidup,
tetapi unsur-unsur tersebut
tersusun sebagai senyawa kimia
mati atau substansi mati,
dengan berat molekul kurang
dari 2000
tidak dapat menyusun unsur-
unsur kimia sesuai dengan
kebutuhannya dan
tidak dapat menyusun unsur-
unsur kimia

Metabolisme Terjadi metabolisme Tidak terjadi metabolism

Iritabilitas bereaksi terhadap perubahan-
(rangsangan) perubahan dalam lingkungan
sekitarnya. Aksi terhadap
rangsangan-rangsangan dari
sekitarnya itu disebut tanggapan
(respon).
mengalami perubahan jika ada
pengaruh dari luar, dan
perubahan-perubahan itu yang
disebut juga sebagai hasil
reaksi, dapat diukur secara
kuantitatif.
Reproduksi mempunyai kemampuan untuk tidak dapat berlipat ganda
menduplikasikan dirinya sendiri
Sel memiliki sel tidak memiliki sel

b. Sel prokariot dan sel eukariot

Parameter Sel Prokariot Sel Eukariot

Diameter 0,2 5 m 10 50 m
Organel Tak ada ada
DNA (kromosom) Di sitoplasma Di dalam inti sel
*)
Ploidi Haploid Diploid / poliploid
Mekanisme Sederhana: Mitosis: pd Sel Somatik
replikasi Pembelahan sel Meiosis: pada gamet (sel sperma dan sel
diikuti replikasi DNA telur)

c. Organ dan organel

- Organ adalah tingkat tertinggi dari organisasi, sedangkan organel adalah

tingkat terendah dari organisasi dalam sistem biologi.
- Organ secara kolektif membentuk sistem organ, sedangkan beberapa organel
berkontribusi untuk membentuk sel.
- Organel protozoa secara fungsional setara dengan organ (atau jaringan) pada
metazoa.
- Organ yang terletak di dalam sistem organ, sedangkan organel yang terletak di
dalam sel.
- Contoh organ termasuk jantung, hati, kandung kemih, ginjal, otak dll,
sedangkan contoh organel termasuk kloroplas, mitokondria, nukleus dll.

d. Katabolisme dan anabolisme

Anabolisme Katabolisme
penggabungan senyawa menjadi pemecahan dari senyawa komplek.
komplek
menghasilkan energi melepaskan energy
menggabungkan senyawa sederhana memecah senya komplek
memperbaiki organ memakai energy dalam organ
membuat zat lebih besar dari materi mengurai materi lebih besar menjadi
kecil zat lebih kecil
 Terjadi reaksi sintesis dehidrasi terjadi reaksi hidrolisis
reduksi Oksidasi
merombak molekul sederhana merombak molekul komplek

e. Sel hewan dan sel tumbuhan

Pembeda Sel Hewan Sel Tumbuhan

Ukuran Lebih kecil Lebih besar
Lisosom Memiliki Tidak memiliki
Plastida/Kloroplas Tidak memiliki Memiliki
Dinding sel Tidak memiliki Memiliki
Sentrosom Memiliki Tidak memiliki
Bentuk Tidak Tetap Tetap
Vakuola Tidak memiliki atau Memiliki dan
ukurannya kecil ukurannya besar

f. Mikroskop cahaya dan mikroskop elektron

Komponen Mikroskop cahaya Mikriskop electron

Sumber radiasi Cahaya (matahari/lampu) Elektron
Panjang gelombang 400-700 nm 5 x 10-4 nm pada 50 kv
Pembesaran maksimum 1000 x 100.000 x pada layar
Specimen Hidup maupun tak hidup, Tidak hidup, tebal 0,02-
tebal 4-8 m 0,1 m
Pewarnaat Zat warna untuk Mengandung logam berat
merefleksikan warna untuk merefleksikan
electron
Bayangan Berwarna Hitam putih

3. Jelaskan:

a. Mengapa Virus bisa dimasukkan sebagai benda hidup , tetapi juga benda mati ?

Virus dikatakan sebagai makhluk hidup karena:

- mampu bereplikasi di dalam sel/jaringan hidup yang menjadi inangnya;

- mampu menginfeksi dan menyebabkan penyakit pada sel inang.

Virus dikatakan sebagai benda mati karena:

 - struktur tubuh hanya tersusun atas protein dan asam nukleat, tanpa sitoplasma
sebagai substansi dasar kehidupan;
- dapat dikristalkan;
- tidak dapat hidup di alam secara bebas, melainkan harus berada di dalam sel
organisme lain.
- Tidak dapat bermetabolisme

b. Bilamana kita harus menggunakan mikroskop cahaya, mikroskop elektron atau

difraksi sinar X?

Mikroskop cahaya Mikroskop elektron Difraksi sinar X

Digunakan dengan
cahaya lampu untuk
meneliti obyek dengan
ukuran yang lebih besar.
Digunakan dengan
elektromagnetik untuk
meneliti ultrastruktur dari
berbagai spesimen
biologi dan anorganik
termasuk
mikroorganisme, sel, dll
dan obyek pengamatan
harus setipis mungkin.
Digunakan untuk
mempelajari keteraturan
atom atau molekul dalam
suatu struktur tertentu dan
dapat memberikan
informasi tentang struktur
polimer, termasuk tentang
keadaan amorf dan
kristalin polimer.

c. Perbedaan antara keempat biomolekul berikut, dalam hal struktur, fungsi dan
keberadaan/kelimpahannya di dalam sel/ organisme?

Karbohidrat, protein, lipid dan asam nukleat

Perbedaan
Biomolekul Kelimpahan dalam
Struktur Fungsi
sel/organisme
Karbohidrat Terdiri atas karbon, hidrogen, dan Sumber Dalam darah
oksigen. energi. sebagai glukosa
Mengandung gugus fungsi karbonil Cadangan untuk keperluan
(sebagai aldehida atau keton) dan energi. energi.
banyak gugus hidroksil. Pembentuk Dalam hati dan
Struktur molekul: struktur. jaringan otot
(a) Monosakarida (satu molekul sebagai glikogen.
gula), misalnya glukosa.
 (b) Disakarida (dua molekul
monosakarida), misalnya sukrosa.

(c) Polisakarida (banyak molekul

monosakarida), misalnya
selulosa.

Protein Polimer dari asam amino. Pembentuk Molekul organik

Masing-masing protein memiliki struktur. terbanyak di dalam
jumlah dan urutan asam amino Biokatalis/ sel yang berada di
yang khas. enzim. dalam gen.

(a) Struktur primer: urutan linier

asam amino dalam satu rantai
polipeptida yang dihubungkan
melalui ikatan peptida (amida).
(b) Struktur sekunder: rangkaian
asam amino pada protein yang
distabilkan oleh ikatan hidrogen.
(c) Struktur tersier: pelipatan struktur
sekunder bersama-sama dengan
penempatan ruang gugus R-nya
membentuk struktur tiga-dimensi
(gabungan dari aneka ragam
struktur sekunder), biasanya
berupa gumpalan. Struktur tersier
distabilkan oleh beberapa
interaksi lemah (interaksi
hidrofobik, elektrostatik, ikatan
hidrogen, dan ikatan van der
waals).
(d) Struktur kuarterner: pengaturan
ruang beberapa struktur tersier
yang terjadi pada protein
multimerik (protein yang terdiri
 lebih dari satu rantai polipeptida).
Lipid Mampu membentuk struktur Penyusun 5-25% berat tubuh
seperti vesikel, liposom, atau membran mamalia adalah
membran lain dalam lingkungan sel. lipid dan 90%
basah. Penahan berupa asil gliserol
Tersusun atas gliserol dan asam panas dan atau trigliserida.
lemak benturan. Pada sel, lipid
Cadangan terdapat dalam
energi. sitosol.
Asam Tersusun atas rantai nukleotida Penyimpan Dalam nukleus/inti
nukleat (sebuah basa nitrogen heterosiklik an dan sel.
yaitu purin atau pirimidin, sebuah pembawa
gula pentosa, dan sebuah gugus informasi
fosfat) yang mengandung informasi genetik.
genetik yaitu Asam Penyusun
deoksiribonukleat (DNA) dan ribosom.
Asam ribonukleat (RNA).

4. Tiga macam cara klasifikasi makhluk hidup, dasar klasifikasi dan contoh hasil klasifikasi
masing-masing, bagi :manusia , E.coli, virus dan tanaman.

Cara Klasifikasi
Organisme Sumber energi dan
Jenis sel Kekerabatan genetik
sumber karbon
Manusia Seluler eukariot Kemotrof organotrof Eukaria
E.coli Seluler prokariot Kemotrof organotrof Eukaria
Virus Aseluler Parasit obligat -
Tanaman Seluler eukariot Fototrof autotrof Eukaria